Upload
annisa-ica
View
78
Download
12
Embed Size (px)
DESCRIPTION
biokimia
Citation preview
Pengantar Biokimia
Tujuan Mata Kuliah:
Memberikan pengetahuan dan pemahaman tentang prinsip-prinsip serta proses-proses biokimia yang berhubungan dengan struktur dan fungsi pada makhluk hidup, serta kemampuan menggunakan pemahamannya tentang substansi dan proses biokimia yang terdapat pada mahluk hidup.
Materi perkuliahan:
1. Pendahuluan 2. Susunan Kimia Sel 3. Karbohidrat 4. Lipid5. Protein6. Asam nukleat7. Enzim dan koenzim
Materi perkuliahan:
8. Metabolisme karbohidrat
9. Metabolisme lipid
10. Metabolisme asam amino dan protein
11. Hormon
12. Darah
Segel, IH., Biochemical Calculations, New YorkMurray, RK, et.al, Biokimia Harper ed. 25, EGC JakartaHorton, H.R., et.al, Principles of Biochemistry, 3rd ed. Prentice Hall. 2002Day, RA dan Underwood AL., Analisis Kimia Kuantitatif, ed. 6. Erlangga, Jakarta, 2002Murray, RK., et.al, Harper’s Illustrated Biochemistry, 26th ed. McGraw Hill, 2003Conn, EE., et.al, Outline of Biochemistry, John Wiley and Sons, 1997Greenspan, FS. And Gardner, DG., Basic and Clinical Endocrinology, 7th ed. McGraw Hill, 2004Montgomery, R., Conway, TW. And Spector, AA., Biokimia. Berorientasi pada Kasus Klinik. Ed. 5. Jilid 1. Binarupa Aksara, 1993Holme, DJ and Peck, H., Analytical Biochemistry, 2nd ed. Longman, New York, 1993Kresno, SB., Imunologi Diagnosis dan Prosedur Laboratorium, FKUI, 2001Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar A, FKUI, 2002Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar B, FKUI, 2002Achmad, H., Kimia Larutan, Citra Aditya Bakti, 2001Bodansky, M., Kimia Peptida, ITB, 1998Bellaart, AC., Ikhtisar ringkas Vitamin dan Hormon penting, Djambatan, 1983
DAFTAR PUSTAKA
DAFTAR PUSTAKA
Achmad, H dan Tupamahu, Struktur Atom, Struktur Molekul dan Sistem Periodik, Citra Aditya Bakti, 2001Koolman, J., dan Rohm, KH., Atlas Berwarna dan Teks Biokimia, Hipokrates, 2001Wirahadikusumah, M., Biokimia, metabolisme energi, karbohidrat dan lipid, ITB, 1985Toha, AHA., Biokimia, Metabolisme Biomolekul, Alfabeta, 2005Sadikin, M., Biokimia Darah, Widya Medika, 2001Wahab, AS., dan Julia, M., Sistem Imun, imunisasi dan penyakit imun, Widya Medika, 2002Jusuf, M., Genétika I, Sagung Seto, 2001Sadikin, M., Biokimia Enzim, Widya Medika, 2002Wirahadikusumah, M., biokimia protein, enzim dan asam nukleat, ITB, 2001Gropper, SS., Smith, JL. And Groff, JL., Advanced Nutrition and Human Metabolism, 4th ed, Wadsworth, 2005Linder, MC, Biokimia Nutrisi dan Metabolisme, UI-Press, 1992Schumm, DE., Intisari Biokimia, Binarupa Aksara, 1992Rastogi, SC., Biochemistry, 2nd ed, McGraw Hill, 2003Brody, T., Nutritional Biochemistry, Academic Press, 1994
PENILAIAN
Kehadiran 5% (10%)
UTS 35% (25%)
UAS 40% (50%)
TUGAS/LAP. PR. 20% (15%)
Pendahuluan
Pada makhluk hidup senantiasa terjadi aktivitas dan perubahan-perubahan.
Proses-proses yang terjadi pada makhluk hidup berhubungan dengan reaksi-reaksi kimia dalam sel
Proses-proses serta seluruh aktivitas dalam makhluk hiudp bisa dipelajari dari aspek biokimia
Definisi the science concerned with the chemical basis of life.
The science concerned with the chemical constituentof living cells and with the reactions and process they undergo.
Biokimia merupakan studi tentang susunan kimia sel, senyawa-senyawa yang menunjang aktivitas makhluk hidup serta energi yang diperlukan atau dihasilkan
Jadi kajian biokimia mencakup: struktur kimia serta reaksi-reaksi kimia yang terjadi pada organisme hidup
Ruang lingkup kajian Biokimia
1. Struktur kimia komponen-komponen sel makhluk hidup
2. Hubungan antara fungsi biologi dengan struktur kimia
3. Metabolisme, totalitas reaksi kimia yang terjadi pada makhluk hidup
4. Proses-proses dan substansi kimia yang berhubungan dengan informasi penurunan sifat biologi
Sejarah Istilah biokimia diperkenalkan oleh Neuberg ahli kimia Jerman pada tahun 1903
Para ahli biokimia harus membuktikan bahwa komponen kimia makhlukhidup dan makhluk tak hidup sangat berbeda
Th 1500 – 1800 ; merupakan tahun dimana perkembangan biokimia prinsip dasar kimia seperti reaksi kinetika dan komposisi molekul
Pada abad ke-18 ahli kimia Swedia Karl Wilhelm Scheele :analisis kimia jaringan tumbuhan dan hewan
PadaAkhir abad 19 : 1828 Friedrich Wohler sintesis urea1897 Eduard Buchner ekstrak ragi (enzim)
Pada abad ke-20 J.B. Sumner membuktikan enzim urease dapat dikristalkan1950 s/d 1960 : John C. Kendrew dan Max Perutz ; struktur protein1944 : Oswald Avery, Colin MacLeod, Maclyn McCarty ; DNA1953 : James D Watson dan Francis H.C. Crick struktur 3D DNA
Pembentukan Urea
O
NH4NCO H2N - C - NH2 amonium sianat Urea
Hierarki organisasi molekul dlm selsel
Inti sel, mitokondria,kloroplas
Enzim, ribosom, sistemkontraktil
Asam nukleat protein polisakarida lipid
As aminomononukleotida
monosakarida
As lemak, gliserol
Ribosa, karbamoilfosfat
As alfa keto
Piruvat, malat Asetat, malonat
CO2, H2O, N2
organelSupramolekul
BM 106-109
Makromolekul
BM 103-109
Building block (BM 100-350
Senyawa antara (BM 50-250)
Seny kimia di sktr (BM 18-44)
TINGKATAN ORGANISASI MAKHLUK HIDUP DAN UKURANNYA
STRUKTUR ATOM YANG PENTING PADA MATERI HIDUP
CONTOH STRUKTUR PROTEIN
STRUKTUR LIPID
Perkembangan biokimia
Perkembangan kimia tak lepas dari penemuan alat bantu berupa mikroskop elektron, yang mengungkap tabir reaksi-reaksi kimia dalam selDitunjang pula oleh genetika : penemuan konsep gen ---kromosom yang terdiri dari senyawa protein dan asam nukleatPada tahun 1953 James Watson dan Francis Crick menjelaskan struktur double helix DNASelanjutnya berkembang dengan penemuan vitamin, enzim sebagai biokatalis serta struktur kimia senyawa organik lain
Metode dan persiapan yang dilakukan di laboratorium biokimia
Metode pemisahan dan pemurnian biomolekuler
fraksinasi garam (salt fraksinasi)
kromatografi (kertas, pertukaran ion, afinitas, lapis tipis, gas-cair, cair dg tekanan tinggi, gel filtration
elektroforesis
ultrasentrifugasi
Metode penentuan struktur biomolekuler
analisis elemental
spektrofotometri
sekuensing
Persiapan proses biokimia hewan coba; isolasi organ
Jaringan; sel homogenat
organel sel; isolasi gen
Contoh : Penyebab utama beberapa penyakit (mekanisme biokimia dlm sel atau dlm tubuh)
agen fisik : trauma (mekanisme), suhu yang ekstrim, perubahan tekanan atmosfir, radiasi dan kejutan listrikagen kimia : obat, senyawa racunagen biologi : virus, bakteria, jamur, parasitkekurangan O2 : kehilangan darah, deplesi kapasitas darah mengangkut O2, keracunan pada enzim oksidatifgangguan genetik : kongenital, molekulerreaksi imunologi : anafilaksis, penyakit autoimunketidakseimbangan gizi : defisiensi, kelebihanketidakseimbangan endokrin : defisiensi hormon, kelebihan
Manfaat Biokimia
Penerapan biokimia dalam bidang pertanian dan kedokteran
Memecahkan masalah-masalah gizi
Penyakit akibat kekurangan gizi
Berperan dalam farmakologi obat
beberapa kegunaan investigasi biokimia dan uji laboratorium yg berhubungan penyakit :
manfaat Contoh
penyebab dan mekanisme penyakit
Gangguan genetik sep cystic fibrosis
pengobatan Diet rendah fenialaninutk PKU
membantu diagnosis penyakit tertentu
Plasma enzim kreatin kinase utk diagnosa myokard infark
skrining (diagnosa dini) Pengukuran tiroksin (darah) atau TSH pada neonatal (hipotiroid congenital)
membantu monitoring kemajuan suatu penyakit
Plasma ALT utk melihat infeksi hati
membantu menilai respon terapi suatu penyakit
Pengukuran CEA/carcinoembryonic antigen darah (kanker kolon)