Click here to load reader

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG

  • View
    93

  • Download
    3

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG. Tujuan Perkuliahan. - PowerPoint PPT Presentation

Text of Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG

  • Pengantar Biokimia

    MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd

    JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPAIKIP PGRI SEMARANG

  • Tujuan PerkuliahanMemperkenalkan bahasa biokimia: Kosakata (istilah dan struktur), tatabahasa (reaksi-reaksi), struktur kalimat (jalur-jalur metabolisme), dan pengertian (hubungan-hubungan metabolisme)Mengajarkan cara mengambil intisari proses kehidupanMenyarikan kesatuan konsep yang mendasari proses kehidupanMenularkan hasrat mencari tahu atas hal yang akan dipelajari dan hal yang perlu diketahui

  • Filosofi PembelajaranMenjelaskan, bukan mengindoktrinasiMenunjukkan hal yang perlu diketahui dan yang tidak perlu diketahuiMenghargai pertanyaan tentang hal yang belum diketahuiMempelajari semua hal adalah tidak mungkin, tetapi yang lebih penting adalah mengorganisir hal yang kita ketahui agar dapat digunakan

  • Tentang StrukturStruktur biokimia yang rumit tidak akan pernah dapat ditiru, akan tetapi hal yang perlu dipikirkan tentang struktur tersebut adalah:

    Bagaimana konsentrasinya berubah sebagai tanggapan atas kondisi metabolisme tertentuBagaimana struktur tersebut berperan terhadap aktifitas biologisnyaDalam jalur metabolisme mana senyawa dengan struktur tersebut ditemukan (dari apa/mana asal senyawa tersebut dan menjadi apa selanjutnya?)

  • Ciri-Ciri Kehidupan Keragaman biologis: mikroba, ganggang, lumut, tanaman, serangga, burung, monyet, kamu

    Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik tidak ada aturan khusus

  • 3 Kebutuhan Kehidupan:(1) ENERGI, perlu diketahui bagaimana:

    Memperolehnya Mengubahnya MenggunakannyaFig. 1-28

  • (2) MOLEKUL SEDERHANA, perlu diketahui bagaimana: Mengubahnya Mempolimerasinya Menghancurkannya

  • (3) MEKANISME KiMIA, untuk:Memperoleh energiMengendalikan reaksi kimia yang berurutanMensintesis & mendegradasi makromolekulMempertahankan kesetimbangan yang dinamisSwa-susun struktur yang kompleksMengganda secara akurat & efisienMempertahankan keteraturan proses biokimia dalam lingkungan yang berubah-ubah

  • Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadiFig. 1-26b

  • Strategi 2: Mahluk hidup menggunakan enzim untuk memacu reaksi yang biasanya lambat

  • Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan termodinamikanya?Fig. 1-11

  • Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan mekanismenya??Fig. 1-22

  • Biomolekul - Komposisi

    99% dari sel tersusun dari unsurH, O, N, and CUnsurElektron tanpa pasanganJumlah relatifH12/3O21/4N31/70C41/10

  • Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung KehidupanFig. 1-14*

  • Isomer Kimia Rumus kimia sama, bentuk berbedaFig. 1-18a

  • Molekul Khiralbentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan Fig. 1-19a

  • Stereoisomer Rumus dan bentuk kimia sama fungsi biologisFig. 1-23a

  • Perubahan Biokimia Dapat Dikelompokkan dalam 5 kategori Reaksi pemindahan gugus Reaksi oksidasi-reduksi Penataan kembali (isomerisasi) Reaksi pemotongan Reaksi kondensasi*

  • Struktur Biomolekul Senyawa penyusun Gula sederhana Asam amino Nukleotida Asam lemak Makromolekul Polisakarida Protein (peptida) RNA atau DNA Lipida

  • Biosintesis Membutuhkan Molekul Sederhana untuk Digabung secara Kovalen melalui Berbagai Cara 3eFig. 3-25

  • Kekuatan ikatan kimia tergantung pada 1. Kelektronegativan relatif dari dua atom yang berikatan Keelectronegativan tinggi = Afinitas elektron tinggi O3.5 Cl3.0 N3.0 C2.5 P2.1 H2.1 Na0.9 K0.8 From 3eTable 3-4

  • 2. Jumlah elektron pengikatSee Fig. 1-13*

  • Kekuatan ikatan yang umumApprox. Avg.Triple: 820 kJ/mole

    Double: 610 kJ/mole

    Single: 350 kJ/mole

  • Gugus Fungsional yang UmumFig. 1-15*

  • Nukleofil Biologis yang Penting:

    gugus fungsional kaya elektron* 3eTable 3-4

  • RingkasanAtom karbon tetrahedral memiliki sifat ikatan yang fleksibelSenyawa-senyawa beratom banyak dapat memiliki beberapa bentuk isomerik Pengubahan bentuk membutuhkan pemutusan ikatan-ikatan kimiaMolekul-molekul besar disusun dari molekul-molekul kecil melalui pembentukan ikatan kimia baru

    *

Search related