Upload
bastien-baudry
View
105
Download
2
Embed Size (px)
Citation preview
24 octobre 200324 octobre 2003 11
Travail de paracliniqueTravail de paracliniqueen hygiène, génétique et en hygiène, génétique et
biostatistiquebiostatistique
MARX GregoryMARX GregoryMASCETTI ChristopheMASCETTI Christophe
22
A dynamic simulation model for A dynamic simulation model for evaluating effects of removal and evaluating effects of removal and
contraception on genetic variation and contraception on genetic variation and demography of Pryor Mountain wild demography of Pryor Mountain wild
horses.horses.
John E. Gross, Biological Conservation 96 (2000) 319-330John E. Gross, Biological Conservation 96 (2000) 319-330
33
44
IntroductionIntroduction
• Nombreuses populations de CV sauvages aux E-U.
• Notamment, les « CV Pryor » très étudiés.• Problématique :
– Petite population disparition de la variabilité génétique– Fort potentiel reproducteur taille de la population augmente
dégâts à l’environnement et nuisances aux ô espèces.
55
IntroductionIntroduction
• Solution : Plan de management (réglementé)
• MS Conflit entre :– ↓ taille population pour minimiser la
dégradation ET– ↑ pour maximiser la probabilité de la rétention
à long terme de la variabilité génétique.
66
PropositionProposition
• 2 techniques pour contrôler 1 population :
– Removal-Gather
– Contraception
• 3 questions :– A combien d’ax doit-on aboutir ?– Quelles catégories de sexe et d’âge ?– A quelle fréquence ?
77
Modèle…Modèle…
• …mis en place par l’auteur pour évaluer les ≠ alternatives
• « Individual-based population model »
• Tient compte de : reproduction, retrait, contraception, mortalité naturelle, âge...
• Chaque individu suivi toute sa vie
• Situation de départ des simulations correspond à la situation réelle.
88
ModèleModèle
• Le plan de management prévoit 1 AML (Appropriate Management Level) ç-à-d le nombre optimum de CV à atteindre (dans la réalité, passer de 147 à 95)
• Population catégorisée en– Grande → R + C– Normale → R ts les 3 ans
→ R ts les 5 ans + C– Petite → rien
99
ModèleModèle
• 3 types de removal :– Appliqué aux jeunes– Appliqué aux vieux– Appliqué au hasardRem : S’arranger pour garder 1 sex ratio en faveur des femelles
• 3 types de contraception :– IdemRem : d’1 niveau tel que la taille se situe |e| 85 et 110% de AML
…
1010
ModèleModèle
…
• Removal + Contraception :– Tx fixé (ex : 50 CV ts les 5 ans)
• Le plan légal ne prévoit pas d’objectif concernant la variation génétique fixation arbitraire :
« 90% de probabilité de conserver 90% de variation génétique pdt 200 ans »
1111
RésultatsRésultats
• FONDAMENTALEMENT ≠ !• >Si R : ↑ rapide taille puis ↓ brutale
>Si C : population reste stable (et proche de l’objectif)
>Si R+C : résultats intermédiaires
1212
RésultatsRésultats
1313
RésultatsRésultats
• R : 35% des CV ts les 3 ans
Si jeune tx + bas / Si random tx + haut
R+C : ts les 5-6 ans
1414
RésultatsRésultats
1515
RésultatsRésultats
• Temps de génération : – raccourci si retrait des vieilles juments– faible ≠ |e| les 2 sexes par rapport aux
objectifs en comparaison avec les traitements appliqués à des âges ≠.
1616
RésultatsRésultats
1717
RésultatsRésultats
• Taux d’hétérozygotes :– Ho (hétérozygotie de départ) = 0,433– A baissé dans toutes les simulations,
davantage ds la stratégie de retrait des vieux.– Si on considère Ho comme mesure de la
variabilité génétique, alors échec !
1818
RésultatsRésultats
• Coefficient de consanguinité :– Fis atteint 0,092 après 200 ans de simulation– Tend à être moindre ds les populations de
petite taille (car résulte d’1 perte + grande d’allèles rares)
1919
RésultatsRésultats
• Fréquence allélique :– >25% de perte des allèles qqsoit la stratégie– + de persistance si C ou C+R des jeunes– bcp de perte si R chez les vieuxRem : le taux de perte allélique est fortement lié à la fréquence
allélique mais pas de manière linéaire.
2020
ConclusionConclusion
• Les simulations sont utiles !• Contraste |e| les ≠ stratégies :
Contraception Removal
Avantages-Peu de Δ de taille de la pop.
-Opinion publique favorable
-Moins cher
- ↓ rapide possible de la population vers l’objectif
Inconvé-nients
-Pas de contrôle du sex ratio
-Courte durée d’action administrations répétées
-Coûteux et devient impossible
2121
ConclusionsConclusions
• DONC, préférer 1 combinaison des avantages :– de C pour diminuer le taux de croissance– de R pour atteindre rapidement l’AML et
contrôler le sex ratio.
2222
ConclusionsConclusions
• De toute façon, quelle que soit la stratégie choisie, un investissement important en temps et en argent sera nécessaire pour contrôler la taille des populations avec un haut potentiel de croissance.
2323
ConclusionsConclusions
• L’auteur a montré l’importance de l’âge dans les processus qui gouvernent le tx de perte de Δ allélique.Ce qui augmente l’intervalle de génération peut avoir 1 effet identique à celui de doubler la population.
• Résultat ! car il est + facile de modifier la structure d’âge que la taille de la population.
2424
ConclusionsConclusions
• Il faut ↑ l’intervalle de génération et retarder l’âge de la reproduction
Focaliser les traitements sur les jeunes individus.
• Simulations ne sont pas la réalité ! Mais juste un guide.
2525
BibliographieBibliographie
• JOHN E. GROSS, A dynamic simulation model for evaluating effects of removal and contraception on genetic variation and demography of Pryor Mountain wild horses, Biological Conservation 96 (2000) 319-330
• http://www.kbrhorse.net/wclo/blmdak02.html
• http://www.wind-dancer.org/server/home/gallerystart/gallerymain/
gallerydetails/gallery5.html