1 Reconstrução filogenética: Inferência Bayesiana 1. Inferência filogenética baseada no princípio de verossimilhança 2. Inferência filogenética Bayesiana 3. Prática: MrBayes Objetivos: Compreender os princípios de inferência Bayesiana e a sua ênfase na probabilidade dos parâmetros e não na probabilidade da amostra como no caso clássico (verossimilhança).
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Text of Reconstrução filogenética: Inferência Bayesiana
Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica
baseada no princpio de verossimilhanaInferncia filogentica
BayesianaPrtica: MrBayesObjetivos: Compreender os princpios de
inferncia Bayesiana e a sua nfase na probabilidade dos parmetros e
no na probabilidade da amostra como no caso clssico
(verossimilhana).
Inferncia baseada no conceito de verossimilhana (L)
Sequncia 1 A A T C G A G C C A T A G C GSequncia 2 A A C A G A C
A C A G T C C GProbabilidades de transio segundo o modelo de Jukes
& Cantor
Qual a funo de verossimilhana, L(t), para todos os stios?
Qual o parmetro desconhecido na funo de verossimilhana?O
parmetro desconhecido na funo de verossimilhana t
ln L = 1589,77447 e t = 0,03091825Importante: Estima-se um nico
valor para o parmetro.
O parmetro desconhecido na funo de verossimilhana tQuem
t?Produto da taxa de substituio pelo tempoNmero total, por stio, de
substituies em entre duas linhagens t = comprimento do ramo =
0,03091825
Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica
baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica
BayesianaPrtica: MrBayes
Inferncia Bayesiana
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Reconstruo filogentica: Inferncia BayesianaInferncia filogentica
baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica
Bayesiana Prtica: MrBayes
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baseada no princpio de verossimilhana Inferncia filogentica
Bayesiana Prtica: MrBayes
