31
NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMA

NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMA

Page 2: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

PROKARIOTI EUKARIOTI

Page 3: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

REGULACIJA GENSKE AKTIVNOSTI KOD EUKARIOTA

Page 4: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Eksperimenti koji potvrđuju totipotentnost jedra(potencijal da se razviju svi tipovi ćelija adultnog organizma)

Page 5: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase
Page 6: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

TRANSPLANTACIJA JEDRA

Page 7: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

KLONIRANJE KRAVE

Page 8: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Postupak transplantacije jedra

ANIMACIJAhttps://www.youtube.com/watch?v=bbZiOiPVG6c

Page 9: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

U jajnu ćeliju sisara naslonjenu na tupu pipetu (levo) unosi se genetički materijal (jedro) diploidne ćelije tankom pipetom (desno)

jedro

Page 10: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Dolly, prva klonirana ovca

Page 11: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase uzrasta dve godine. Dobile su zdrave potomke – muškog i ženskog pola na privatnoj farmi Infigen u SAD. To je farma sa najvećim brojem (165) kloniranih krava i ovaca.

Page 12: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Osnovni nivoi kontrole ekspresije gena kod eukariota

Page 13: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase
Page 14: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

METILACIJA CITOZINA UMANJUJE EKSPRESIJU GENA

Page 15: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Metilacija citozina uCG sekvencama molekula DNK

Page 16: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Inaktivacija gena metilacijom citozina

Page 17: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Lokalne promene strukture hromatina

Page 18: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Shematski prikaz pozitivne (a) i negativne (b) regulacije genske aktivnosti na nivou transkripcije

KONTROLA TRANSKRIPCIJE

Page 19: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Kontrolni regioni tipičnog eukariotskog gena

Page 20: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Vezivanje dva proteina za različita mesta na molekulu DNK može u velikoj meri da poveća verovatnoću njihove interakcije

Page 21: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Aktivacija transkripcije kod eukariota

enhenser

Page 22: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Stimulatorski nizovi nukleotida u DNK (enhenseri, engl. to enhance – pojačati) predstavljaju DNK sekvence koje nakon vezivanja regulatornih proteina dovode do naglog porasta aktivnosti gena. Ovi nizovi nukleotida mogu se nalaziti na hiljade baznih parova (do 50 000) uzvodno ili nizvodno od gena čiju aktivnost povećavaju.

Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao sajlenseri (engl. scilence – tišina).

Page 23: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Alternativna obrada primarnog transkripta

humanog gena za kalcitonin rezultuje stvaranjem tkivno-specifičnih produkata. U tkivu paratireoidnih žlezda stvara se

polipeptidini hormon kalcitonin,a u nervnim ćelijama CGRP protein

(od engl. calcitonin gene-related peptide)

Page 24: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Kontrola transporta iRNK predstavlja regulaciju prelaženja transkripata iz jedra u citoplazmu. Od veomaheterogene grupe primarnih transkripata gena za kodiranje proteina (tzv. hnRNK, heterogena nuklearna RNK) najmanje 50% nikadane napusti jedro već se u njemu razgrađuje.

Page 25: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Kontrola translacije ostvaruje tako što ribozomi odabiraju iRNKkoja će se prevesti u protein. Mehanizmi čuvanja iRNK nisu sasvimjasni, ali ima indicija da su iRNK najčešće u asocijaciji sa proteinima koji ih štite od razlaganja i istovremeno sprečavaju da translacija otpočne. Pored toga, zna se da poli-A rep promoviše translaciju.

Page 26: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Kontrola razlaganja iRNK odnosi se na stepen degradacije iRNKu citoplazmi. Poznato je da su tRNK i rRNK veoma stabilne, što je sasvim logično kada se ima u vidu da mogu da učestvuju u translaciji bilo kog proteina. Nasuprot tome, molekuli iRNK imajurazličit opseg stabilnosti – neke ostaju u citoplazmi mesecima, a druge se razlože posle svega nekoliko minuta.

Page 27: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Posttranslacioni mehanizmi kontrole genske aktivnosti obuhvatajumodifikacije i kontrolu razlaganja proteina. Degradacija proteina kod eukariota kontrolisana je široko rasprostranjenim proteinskim faktorom (ubikvitin). Vezivanje za ubikvitin predstavlja signal za enzimsko razlaganje proteina.

Page 28: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Embrion mišau kome je pokazanaekspresija gena za noginu mozgu i skeletu

Page 29: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

HIBRIDIZACIJA NUKLEINSKIH KISELINA

Page 30: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Fluorescentna in situ hibridizacija (FISH)

Page 31: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAkatedre.vet.bg.ac.rs/~biolog/images/stories/ZOOLOGIJA...jedro Dolly, prva klonirana ovca Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

Ćelija HeLa u deobi: mikrotubule su obojene ljubičasto, DNK belo, a zelenom bojom prestavljen je proteinski produkt GFP gena