nukleinske kiseline,pps

Preview:

Citation preview

Nukleinske kiseline

Nukleinske kiseline su heteropolimeri velike molekulske mase, kojihidrolizom daju heterocikličnu bazu, pentozu i fosfornu kiselinu.

RNK – ribonukleinska kiselinaDNK – deoksiribonukleinska kiselina

1869 - izolovana DNK (Friedrich Miescher) 1943 - sve nasledne informacije sadrži DNK (Oswald Avery). 1953 - struktura DNK (James Watson, Francis Crick)1962 - Nobel-ova nagrada (James Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins)

VS_S1_08_03_2005

RNK – ribonukleinska kiselina

U izgradnji molekula RNK učestvuju:U izgradnji molekula RNK učestvuju:- Pentozni šećer ribozaPentozni šećer riboza- Purinska baza adenin i guaninPurinska baza adenin i guanin- Pirimidinske baze citozin i uracilPirimidinske baze citozin i uracil   RNK su jednočlani molekuli koji nastaju tako što se RNK su jednočlani molekuli koji nastaju tako što se

nukleotidi povezuju fosfodiestarskim vezama čineći tako nukleotidi povezuju fosfodiestarskim vezama čineći tako primarnu strukturu RNK. Unutar jednočlanih molekula primarnu strukturu RNK. Unutar jednočlanih molekula komplementarne baze grade kraće ili duže dvolančane komplementarne baze grade kraće ili duže dvolančane spiralizovane delove, spajajući se vodoničnim vezama.spiralizovane delove, spajajući se vodoničnim vezama.

Ti dvolančani delovi čine sekundarnu strukturu RNKTi dvolančani delovi čine sekundarnu strukturu RNK

VS_S1_08_03_2005

DNK – deoksiribonukleinska kiselina

U izgradnji molekula DNK učestvuju:U izgradnji molekula DNK učestvuju:- Pentozni šećer DeoksiribozaPentozni šećer Deoksiriboza- Purinska baza Adenin i GuaninPurinska baza Adenin i Guanin- Pirimidinske baze Citozin i UracilPirimidinske baze Citozin i Uracil

Šećeri su međusobno povezani fosfatnim grupama kojeŠećeri su međusobno povezani fosfatnim grupama koje stvarajustvaraju fosfodiestarsku vezuu fosfodiestarsku vezuu   između trećeg i petog   između trećeg i petog ugljenikovog atoma šećernog prstena. Ove asimetrične ugljenikovog atoma šećernog prstena. Ove asimetrične veze znače da oba polinukleotidna lanca koja čine DNK veze znače da oba polinukleotidna lanca koja čine DNK molekul imaju svojmolekul imaju svojee pravac pravace, koji su suprotnie, koji su suprotni

Nukleinske kiseline

Delimičnom hidrolizom daju nukleotide, koji daljom hidrolizom daju nukleozide i fosfornu kiselinu

NUKLEOTID NUKLEOZID + FOSFORNA KISELINA

PENTOZA + HETEROCIKLICNA BAZA

Heterociklične baze

Derivati pirimidina

NH

N

NH2

O NH

NH

O

O NH

NH

O

O

citozin (C) timin (T) uracil (U)

N

N

12

34

5

6

pirimidin

DNK/RNK DNK RNK

aromatičanslabo bazan (pH 1.23)

Heterociklične baze

NH

N

NH2

O NH

N

NH2

O

H

NH

N

NH

O

H

+

+

citozin (C)

pH 4.61

H+

Baznost

NH

NH

O

O

uracil (U)

pH – 3.38

Kiselost

NH

NH

O

O N

NH

O

O N

NH

O

O_

_

pH 9.5

Heterociklične baze

TautomerijaIzomerija gde se dva oblika razlikuju po položaju vodonikovog atoma i dvogube veze

NH

NH

O

O N

N

OH

OH

NH

NH

O

O N

N

OH

OH

NH

N

NH2

O N

N

NH2

OH

Mogući su i drugi tautomerni oblici

- Derivati pirimidina

Heterociklične baze

Derivati purina

NH

NN

N

1

2

34

56 7

8

9

NH

NN

N

NH2

NH

NNH

N

O

NH2

purin

adenin (A) guanin (G)

Heterociklične baze

Baznost

NH

NN

N

NH2

NH

NNH

N

O

NH2

NH

NN

N

NH2

H

NH

NNH

N

O

NH2

H

++

adenin (A) guanin (G)

pH 4.25 pH 3.0

NH

NN

N N

NN

N _

Kiselost

pH 8.96

Heterociklične baze

Tautomerija-derivati purina

N

NN

NH

N

NN

N

H

N

NN

N

NH2

H

N

NNH

N

O

NH2H

N

NN

N

NH2 H

N

NNH

N

O

NH2

H

Sinteza nukleozida

reakcija monosaharida i heterociklične baze

transformacija N-glikozida u nukleozid

modifikacije nukleozida

OAcO

O OAc

BrN

N

OEt

OEt

N

N

OEt

OEtO

AcO

O OAc

NH

N

O

OO

AcO

O OAc

NH

N

O

OO

OH

OH OH

Ac Ac

++

H2O

Ac

OH

H2O

_

Reakcija monosaharida i heterociklične baze

Transformacija N-glikozida u nukleozid

O

O

BzO

OBz

NH2

EtO

ONH

OOEt N

NH

O

O

BzO

OBz

O

O

N

NH

O

OH

OH

OH

O

O

Bz Bz

OH_

Modifikacije nukleozida

N

NH

O

OH

OH

OH

O

O

CH2O N

NH

O

OH

OH

OH

O

O

OH

Pt

N

NH

O

OH

OH

OH

O

O

H2

Sinteza nukleotida

NO

OH

OH

OH

NO

O

OH

O

O P

O

Cl

OEt

EtON

O

O

O

O

P

O

OEtEtO

NO

OH

O

OH

P

O

OHOH

a. H+

b. H2/Pd

Neophodno je zaštititi sekundarne alkoholne grupe

P

O

Cl

OEt

EtO

Jedan od reagenasa za uvođenje fosfatne grupe

Nomenklatura nukleozida

Baza Riboza Deoksiriboza

adenin adenozin deoksiadenozinguanin guanozin deoksiguanozinuracil uridincitozin citidin deoksicitidintimin timidin

Struktura nukleinskih kiselina

Primarna

Sekundarna

Tercijarna

Struktura RNK

N

NH

O

N

N

N

N

O

O

O

OH

NH2

P

O

O

O OH

O

O

O

_

Struktura RNK je manje pravilna od DNK i sadrži samo jedan polinukleotidni lanac, kod kojeg samo delimično postoje vodonične veze.

5,

3,

Informaciona RNK

Ribozomalna RNK

Transportna RNK

Struktura DNK

Dvostruki heliks je stabilizovan vodoničnim vezama Količina adenina jednaka je količini timina, a količina guanina količini citozina Kičmu spirale čine molekuli šećera

Struktura DNK

NN

O

H

O

N

N

NN

NHH

NN

N

O

HH

N

N

NN

O

H

NHH

timin adenin citozin guanin

Vodonične veze

Recommended