Upload
bari-muwardi
View
245
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 1/15
I. PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang
OPT khususnya penyakit disebabkan oleh mikroba patogen, dan bersifat sangat dinamis.
Secara umum proses terjadinya penyakit melibatkan tiga faktor yang saling berinteraksi yaitu :
faktor penyebab penyakit (agen), faktor manusia atau pejamu (host), dan faktor lingkungan.
(Sudrajat, !!!). Penyakit tanaman merupakan sesuatu keadaan yang menyimpang dari
keadaan normal, cukup jelas menimbulkan gejala yang dapat dilihat, menurunkan kualitas atau
nilai ekonomis, dan merupakan akibat interaksi yang cukup lama. ("ukmana, !!#)
Salah satu penyakit yang menyebabkan pathogen adalah jamur. $ebih dari %!.!!!
spesies jamur yang dapat menyebabkan penyakit pada tanaman (&grios, !!#). 'anyakanya
spesies jamur yang menyebabkan kerugian bagi tanaman budidaya sehingga sangat diperlukan
pengendalalian yang preentif untuk menanggulangi jamur pathogen tersebut. Salah satunya
adalah dengan penggunaan jamur endofit. amur yang tumbuh pada sekitar organ tanaman
yang dapat mela*an jamur pathogen atau disebut jamur endofit.
Penggunaan jamur endofit sebagai pengendalian bagi jamur pathogen merupakan salah
satu pengendalian yang ramah lingkungan. amur endofit dapat dengan mudah ditemukan
karena jumlahnya yang melimpah. Tulisan ini akan menjelaskan tentang jamur endofit yang
berada pada bagian tanaman tomat.
1.2 Tujuan Penulisan
Penulisan ini bertujuan untuk mengetahui tahapan identifikasi jamur endofit dari tanaman
tomat.
1.3 Manfaat Penulisan
+iharapkan penulisan ini dapat memberikan *a*asan bagi pembaca tentang tahapan
isolasi,purifikasi dan identifikasi jamur endofit.
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 2/15
II. TINJAUAN PUTA!A
2.1 Pengertian Ja"ur En#$fit
&n endophyte is an endosymbiont, that lies *ithin a plant for at least part of its life cycle
such as leaes, flo*ers, branches or roots of plants *ithout causing apparent disease.
ndophyte are ubi-uitous and hae been found in all species. (Smith, !!)
ndophytic fungi can be defense occurs *hen endphytic fungi *hich lie symbiotically
*ith the majorityof plants by entering their cells, are utili/ed asan indirect defense against
herbiores. (Strobel, !!0)
1enda*an yang hidup pada bagian dalam jaringan tanaman sehat tanpa menimbulkan
gejala penyakit pada tanaman inang dikenal dengan istilah cenda*an endofit (1arrol,
%22!) dalam &badi (!%0), sebaliknya yang menimbulkan gejala penyakit disebut dengan
pathogen (&grios, %223) dalam &badi (!%0).
amur endofit merupakan mikroorganisme yang hidup didalam jaringan tanaman tanpa
menyebabkan kerusakan bagi inang. amur endofit memiliki peran memberi ketahanan
tanaman dari cekaman lingkungan biotik dan abiotic. (4hairy, !%)
2.2 !isaran Inang Ja"ur En#$fit
5nang jamur endophyte sangatlah luas lebih dari #!! spesies tanaman dapat menjadi
kisaran inang jamur endofit tersebut. 'eberapa genus cenda*an yang tergolong endofit antara
lain Acremonium, Aspergillus, Trichoderma, Gliocladium, Beauveria, Penicillium, dan
Phyllosticta. (Amin et al., 1997; Bayman et al., 1997dalam Aadi, !"1#$. %etiap masing&masing
tanaman mengandung satu atau leih mi'roa endoit ()ad*i, !""+$.
2.3 Manfaat Ja"ur En#$fit
%. Sebagai agens hayati
4elompok jamur endofit berperan sebagai agens hayati yaitu Fusarium solani ,
Acremonium zeae, Verticillium sp., Phomopis cassiae, Muscodor albus, Periconia sp.
Ampelomyces sp., Neotyphodium lolii dan lain6 lain (7ao et al., !%!). amur endofit
Lecanicillium lecanii diisolasi dari tanaman kapas dalam kondisi menguntungkan mampu
mengurangi serangan kutu putih (8erma*ati, !!3), jamur endofit Colletotrichum
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 3/15
trunctatum diisolasi dari tanaman jarak mengendalikan pertumbuhan patogen Fusarium
oxysporum ( 8anada et al ., !%!9 4umar dan 4aushik, !%0).
. enghasilkan /at pengatur tumbuh
;at pengatur tumbuh yang dihasilkan jamur endofit yaitu hormon 5&&, sitokinin, etilen
dan giberelin berperan dalam menginduksi ketahanan tanaman (Obura, !%!).
0. emberikan ketahanan tanaman terhadap cekaman lingkungan
amur endofit memberikan ketahanan tanaman terhadap kekeringan, cekaman logam
berat, p8 rendah, salinitas dan cekaman suhu tinggi (Obura, !%!).
2.% Ja"ur En#$fit se&agai Agens Antag$nis Pat$gen Tana"ana. Aspergillus niger enurut &le<opoulus and ims (%232) :
4lasifikasi Aspergillus niger 4ingdom : =ungi+iisi : &scomycota4elas : urotiomycetesOrdo : urotiales=amili : Trichocomaceae7enus : &spergillusSpesies : Aspergillus niger
+alam metabolismenya A. niger dapat menghasilkan asam sitrat sehingga fungi ini
banyak digunakan sebagai model fermentasi karena fungi ini tidak menghasilkan mikotoksin
sehingga tidak membahayakan. A. niger dapat tumbuh dengan cepat, oleh karena itu A. niger
banyak digunakan secara komersial dalam produksi asam sitrat, asam glukonat, dan
pembuatan berapa en/im seperti amilase, pektinase, amiloglukosidase, dan selulase. Selain itu,
A. niger juga menghasilkan gallic acid yang merupakan senya*a fenolik yang biasa digunakan
dalam industri farmasi dan juga dapat menjadi substrat untuk memproduksi senya*a antioksi
dan dalam industri makanan.(unif, !!0) A. niger dalam pertumbuhannya berhubungan langsung dengan /at makanan yang
terdapat dalam substrat, molekul sederhana yang terdapat disekeliling hifa dapat langsungdiserap sedangkan molekul yang lebih kompleks harus dipecah dahulu sebelum diserap ke
dalam sel, dengan menghasilkan beberapa en/im ekstra seluler seperti protease, amilase,
mananase, dan >6glaktosidase. 'ahan organik dari substrat digunakan oleh Aspergillus niger
untuk aktiitas transport molekul, pemeliharaan struktur sel, dan mobilitas sel. (unif, !!0)
b. richoderma sp.
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 4/15
4lasifikasi richoderma sp. enurut &le<opoulus and ims (%232) :
4ingdom : =ungi
+iisi : &scomycota
4elas : Sordariomycetes
Ordo : 8yporcreales
=amili : 8ypocreaceae
7enus : richoderma
Spesies : richoderma sp.
richoderma sp. erupakan sejenis cenda*an?fungi yang termasuk kelas ascomycetes.
richoderma sp. emiliki aktifitas antifungal. +alam, richoderma banyak ditemukan di tanah
hutan maupun tanah pertanian atau pada substrat berkayu. Suhu optimum untuk tumbuhnya
richoderma berbeda6beda setiap spesiesnya. &da beberapa spesies yang dapat tumbuh pada
temperatur rendah adapula yang tumbuh pada temperatur yang cukup tinggi, kisarannya sekitar
3o16@%o1. Trichoderma yang dikultur dapat bertumbuh cepat pada suhu #60!o1 namun pada
suhu 0#o1 cenda*an ini tidak dapat tumbuh. Perbedaan suhu mempengaruhi produksi
beberapa en/im seperti karboksimetilselulose dan <ilanase.(&badi, !%0)etabolit yang dihasilkan richoderma dapat berdifusi melalui membran dialisis yang
kemudian dapat menghambat pertumbuhan beberapa pathogen. Salah satu contoh metabolit
tersebut adalah monooksigenase yang muncul saat adanya kontak antar jenis richoderma,
dan semakin optimal pada p8 @. 4etiadaan metabolit ini tidak akan mengubah morfologi dari
richoderma namun hanya akan menurunkan kemampuan penghambat pathogen.
(uhibuddin, !%%)
c. !liocladium spp.
4lasifikasi !liocladium spp. enurut &le<opoulus and ims (%232) :4ingdom : fungi+iisio : &mastigomycotaSub +iisi: +euteromycotina
1lass : +euteromycetesOrdo : 8ypocreales=amili : 8ypocreaceae7enus : 7liocladium
Species : !liocladium spp!liocladium "irens merupakan jamur tanah yang umum dan tersebar di berbagai jenis
tanah, misalnya tanah hutan, dan pada beragam ri/osfer tanaman. Pertumbuhan optimum
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 5/15
jamur antagonis terjadi pada suhu #60A1. amur parasit nekrotof ini mampu tumbuh baik
sebagai pesaing saprotof dari jamur lainnya (uhibuddin, !%%).amur sangat toleran terhadap 1O. Pada medium yang mengandung Ba1l #C, jamur
tampak mengalami penurunan pertumbuhan dan pensporaan. 4ebutuhan nutrisi dari jamur
antagonis nekrotof tidak berbeda dengan jamur saprotof. Pada stadium a*al infeksimikoparasit, tampak terjadi perubahan kelenturan plasmalema haustorium inang, yang
memampukan glukosa dan nutrisi lain diserap dari sitoplasma inang. amur antagonis
!liocladium "irens tidak berpengaruh antagonisme terhadap jamur mikori/a asbuskular
(uhibuddin, !%%).
!liocladium spp. mudah ditemukan di dalam tanah, namun demikian jumlahnya sangat
sedikit sehingga tidak menimbulkan efek yang diharapkan. Pada pengendalian hayati,
perkecambahan konidia atau klamidospora akan memudahkan agensia hayati seperti
!liocladium "irens dapat menghambat penyebab penyakit seperti #hizoctonia spp., Phytiumspp., $clerotium rols%ii penyebab damping offdan penyebab penyakit akar, diduga en/imnya
beta glucanase. (uhibuddin, !%%).
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 6/15
III. MET'D'L'(I
3.1 Alat #an Ba)an
0.%.% 5solasi amur ndofit
• &latPenggaris : engukur panjang tanaman yang akan diambil7unting : enggunting bagian tanaman1a*an Petri : edia isolasi'unsen : Dntuk menciptakan kondisi aseptisPinset : memindahkan bagian sampel yang bergejalaErapping : Dntuk mengcoer hasil isolasi di ca*an petriTissue steril: Dntuk meletakkan sampelScalpel : Dntuk mengambil sampel tanaman4amera : &lat dokumentasi
• 'ahan
&kar tomat : Sebagai spesimen praktikum+aun muda tomat : Sebagai spesimen praktikum+aun tua tomat : Sebagai spesimen praktikum'atang tomat : Sebagai spesimen praktikum
&-uades : Dntuk mensterilkan &lkohol : Dntuk mensterilkanBaO1l : Dntuk mensterilkan
0.%. Purifikasi
• &lat
arum Ose : Dntuk mengambil koloni jamur endofit'unsen : Dntuk mensterilkan alat
Erapping : engcoer media atau ca*an petri4amera : &lat dokumentasi
• 'ahan
&lkohol : Dntuk sterilisasiedia P+& : Sebagai biakkan murni untuk purifikasi
0.%.0 5dentifikasi
• &lat
ikroskop : Dntuk mengidentifikasi kenampakan mikroskopis
Objek glass : Tempat spesimen untuk diamati
1oer glass : Tempat spesimen untuk diamatiarum Ose : Dntuk mengambil koloni yang diinginkan
'unsen : Dntuk mensterilkan alat dengan dipanaskan
4amera : &lat untuk dokumentasi
• 'ahan
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 7/15
'iakkan murni : Spesimen yang diamati &lkohol : Dntuk mensterilkan alat
3.2 Analisa Perlakuan0..% 5solasi
Sampel tanaman tomat diambil dari tanaman yang sehat yaitu daun muda, daun tua,akar dan batang. asing6masing bagian tersebut dibersihkan di air yang mengalir hingga
bersih. Setelah itu, bagian6bagian tersebut dipotong masing6masing # cm yang sebelumnya
telah diukur dengan penggaris dan dilakukan sebanyak 0 kali dimana dipotong dengan
gunting. Potongan6potongan tersebut direndam dalam BaO1l %C selama % menit, kemudia
direndam kembali di alkohol 3!C selama % menit dan direndam kembali di a-uades steril
sebanyak kali masing6masing selama % menit. Selanjutnya, potongan sampel tanaman
tomat tersebut dikeringkan diatas tissue steril. +an setelah kering, sampel diambil dengan
scalpel lalu ditanam di dalam media P+&. Saat peletakkan spesimen, ca*an petri terus didekatkan ke bunsen agar tetap steril dan setelah itu di *rapping agar tidak terkontaminasi
dari lingkungan luar. +iamati setiap hari selama % minggu dan di dokumentasi hasil
kenampakan makroskopis nya.
0.. Purifikasi
Setelah alat dan bahan disterilkan, Setelah alat dan bahan disterilkan, diambil bagian
dari jamur endofit yang dianggap berbeda dalam morfologi makroskopis nya yang dilihat
dari kenampakan *arna, bentuk dan persebaran koloni nya lalu di tumbuhkan kembali ke
media P+& yang baru dengan jarum ose untuk memudahkan pengambilan. +alam
pengambilan nya, mulut dari ca*an petri dibuka sedikit dan di dekatkan dengan bunsen
untuk meminimalisir adanya kontaminasi dari luar dan bagian tersebut langsung diletakkan
di P+& yang baru dan seluruh bagian mulut dari ca*an petri tersebut di dekatkan kepada
bunsen sebelum di *rapping untuk mensterilkan. Setelah itu diamati dan difoto hasilnya
selama % minggu.
0.%.@ 5dentifikasi+iambil bagian miselium yang dapat dikatakan berhasil untuk diamati di ba*ah
mikroskop yang tumbuh di P+&. ika di ca*an petri ditemukan lebih dari % jenis jamur
endofit, dipilih salah satu untuk di identifikaasi diba*ah mikroskop. Pengambilan bagian
tersebut, menggunakan jarum ose agar yang terambil tidak terlalu banyak. Setelah itu
diletakkan di kaca preparat sebagai tempat untuk memudahkan pengamatan saat di
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 8/15
mikroskop dan diamati dengan perbesaran hingga terlihat hifa6hifa, ada tidaknya septa,
*arna hifa dan konidia nya. Setelah berhasil ditemukan, di dokumentasi.
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 9/15
I*. HAIL DAN PEMBAHAAN%.1 Hasil #an Pe"&a)asan is$lasi@.%.% 8asil
Bo 'agian Tanaman +okumentasi 8asil 5solasi 4enampakan akroskopis
%. +aun uda
Salah satu bagian tumbuh koloni jamur
ber*arna hijau lumut dengan dikelilingi
miselium ber*arna putih yang tipis
. +aun Tua
Terdapat pola penyebaran yang melingkar
banyak koloni ber*arna hijau dengan
miselium ber*arna putih tebal dan
panjang
0. 'atang
Salah satu bagian tumbuh koloni jamur
ber*arna hijau lumut dengan dikelilingi
miselium ber*arna putih yang tipis
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 10/15
@. &kar
tumbuh koloni jamur ber*arna hijau lumut
dengan dikelilingi miselium ber*arna
putih yang tipis dan terjadi kontaminasi
yang cukup banyak ber*arna putih halus
@.%. Pembahasan
Pada bagian tanaman tomat dari akar, batang, daun tua dan daun muda memiliki persamaan kenampakan yaitu memiliki koloni
yang ber*arna hijau lumut atau hijau tua dengan dikelilingi miselium ber*arna putih yang tipis maupun tebal. Pada bagian akar
terdapat kontaminasi.
@. 8asil dan Pembahasan Purifikasi@..% 8asil
Bo 'agian Tanaman +okumentasi 8asil 5solasi 4enampakan akroskopis
%. +aun uda
Terdapat dua koloni jamur yang berbeda
spesies. 'er*arna hijau dan ber*arna
hitam, persamaannya bertekstur kasar
dan rapat dengan pola penyebaran
menyamping
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 11/15
. +aun Tua
Earna koloni jamur hijau tua, bertekstur
kasar, memiliki jumlah koloni sebanyak %%
dan pola penyebaran tidak rata?berspot.
0. 'atang
Earna koloni jamur hijau tua, bertekstur
kasar dan pola penyebaran tidak
rata?berspot.
@. &kar
Earna koloni putih, hijau dan hitam,
miselium menyebar keseluruh permukaan
media tidak merata, dan tekstur halus
seperti kapas.
@.. PembahasanPada bagian tanaman tomat dari akar, batang, daun tua dan daun muda memiliki persamaan kenampakan yaitu *arna koloni
hijau, pola penyebaran berspot6spot, memiliki tekstur yang kasar dan tidak merata pada media tumbuh. Sedangkan pada bagian daun
muda memiliki dua koloni yang berbeda *arna dalam satu media, koloninya ber*arna hijau tua dan hitam, pola penyebarannya yang
berspot6spot, dan memiliki teksturyang kasar dan tidak merata.
@.0 8asil dan Pembahasan 5dentifikasi
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 12/15
@.0.% 8asil
Bo 'agian Tanaman +okumentasi 8asil 5solasi 4enampakan ikroskopis $iteratur
%. +aun uda
Terdapat konidiofor yang
berbentuk bulat dan unisel,
memiliki dinding yang kasar.
iselia tidak bersekat.
. +aun Tua
4onidia berbentuk bulat,
unisel ber*arna gelap dan
tidak bersepta
0. 'atang
Terdapat konidiofor yang
berbentuk bulat dan tumbuh
dari miselium, memiliki
dinding yang kasar..
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 13/15
@. &kar
4onidia berbentuk bulat,
unisel ber*arna gelap dan
tidak bersepta
@.0. Pembahasan'agian tanaman daun tua, batang dan akar memiliki konidia yang ber*arna gelap, Terdapat konidiofor yang berbentuk bulat dan
tumbuh dari miselium, memiliki dinding yang kasar. 1iri tersebut masuk kedalam cenda*an Aspergillus %la"us menurut "odri-ue/
(!!2) 4onidia A. %la"us dapat berariasi mulai dari bentuk kolom, radial dan bulat atau menyerupai bola dan unisel. Earna konidianya
hijau, coklat dan hitam. 1iri tersebut pada pengamatan menunjukan konidia yang ber*arna hijau. 4onidiofor muncul dari kaki sel,
sterigmata sederhana atau kompleks dan ber*arna atau tidak ber*arna. Sedangkan pada bagian daun muda tanaman memiliki ciri
mikroskopis yang dapat dilihat yaitu Terdapat konidiofor yang berbentuk bulat dan unisel, memiliki dinding yang kasar, miselia tidak
bersekat. 1iri6ciri tersebut menurut "odri-ue/ (!!2) hampir mirip dengan Aspergillus %la"us yaitu konidia berbentuk bulat dan unisel,
konidiofor muncul dari kaki sel, sterigmata sederhana atau kompleks dan ber*arna atau tidak ber*arna. Fang membedakan adalah
*arna konidia, pasa Aspergillus niger memiliki *arna hitam pada konidianya.
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 14/15
*. PENUTUP
+.1 !esi",ulan
+ari hasil praktikum yang didapatkan jamur endofit merupakan jamur yang
dapat menjadi agens hayati, dimana jamur endofit dapat berkompetisi pada jamur
pathogen didalam tanaman inang.
'agian tanaman tomat berupa akar, batang, daun tua dan daun muda tumbuh
jamur endofit mulai dari isolasi dan purifikasi pada bagian akar, batang, daun tua
tumbuh jamur Aspergillus %la"us sedangkan untuk daun muda tumbuh dua spesies
jamur endofit yaitu Aspergillus %la"us dan Aspergillus niger.
+.2 aran
Aspergillus %la"us maupun Aspergilus niger merupakan jamur yang memiliki
konidia yang mudah terbang keudara bebas dan sangat merugikan bagi manusia jika
terhirup dan berkembang diparu6paru manusia, sebaiknya saat dilakukan penelitian
gunakanlah pelindung tubuh untuk menghindari atau meminimalisir dampak dari
penelitian tersebut.
8/16/2019 laporan mikologi endofit
http://slidepdf.com/reader/full/laporan-mikologi-endofit 15/15
DA-TA PUTA!A
&badi, &bdul $atief. !%0. 5dentifikasi amur ndofit +an ekanisme &ntagonismenya
Terhadap amur Fusarium &xysporum =. Sp. Ganillae Pada Tanaman Ganili. =PD'.
alang
&ryanto, ko =amuji. !%0. 4eanekaragaman amur ndofit Pada +aun Tanaman Padi
(&ryza $ati"a $.) +engan Sistem Pengelolaan 8ama Terpadu (Pht) +an 4onensional
+i +esa 'ayem, 4ecamatan 4asembon, 4abupaten alan7. =PD'. alang
7ao et al., !%!. echanisms of fungal endophytes inplant protection against pathogens.
&frican ournal of icrobiology "esearch @:%0@H6%0#%.
8anada ", Pomella &EG, 1osta 8S, 'e/erra $, $oguercio $$, Pereira O. !%!.
ndophytic fungal diersity in Thebroma cacao (cacao) and Theobroma grandiflorum
(cupuacu) trees and their potential for gro*th promotion and biocontrol of black6pod
disease. =ungal 'iol %%@:2!%62%!.
4hairy, !%. Pengaruh 1enda*an ndofit Terhadap 8ama +an Pertumbuhan Tanaman
Padi +i $apangan. +epartemen Proteksi Tanaman =akultas Pertanian 5nstitut
Pertanian 'ogor.
uhibuddin, &., $. &ddina., &. $. &badi., dan &. &hmad. !%%. 'iodiersity of Soil =ungi on
%% 5ntegrated Pest anagement =arming System. &griita Gol. 00, Bo. : %%%6%%.
unif &. !!0. Peranan ikroba ndofit Sebagai &gens 8ayati +alam endukung
Pembangunan Pertanian 'rkelanjutan. +epartemen Proteksi Tanaman, =akultas
pertanian 5P'.
Obura, !%!. "oot endophytic fungi of tomato and their role as biocontrol agents of root6knot
nematodes Meloidogyne incognita (4ofoid and Ehite) 1hit*ood and gro*th promotion
in tomato plants (Lycopersicon esculentum ill) IthesisJ. 'ogor: 7raduate School,
'ogor &gricultural Dniersity.
"adji, . !!#. Peranan 'ioteknologi dan ikroba ndofit dalam Pengembangan Obat
8erbal. ajalah 5lmu 4efarmasian. 55(0). %%06%H
"odri-ue/, ".. !!2. =ungal ndophyte: diersity and functional roles. Tansley "eie*.
$ondon
Smith, S. &., isenman. !!. 'ioactie ndophytes Earrant 5ntensified <ploration and
1onseration. Plos Ones. Gol. 0
Strobel, 7. &. !!0. 'ioprospecting for icrobial ndophytesand TheirBatural Products.
&mericanSociety for icrobiology. H3. @2%6#!