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LAURA ARANGO BEDOYA LAURA BERMEO TERCER SEMESTRE MEDICINA UPB 2012 SEMINARIO BIOLOGIA MOLECULAR Characterization of a Vancomycin- resistant Enterococcus faecium Outbreak Caused by 2 Genetically Different Clones at a Neonatal Intensive Care Unit .

Final seminario

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LAURA ARANGO BEDOYALAURA BERMEO

TERCER SEMESTREMEDICINA

UPB2012

SEMINARIO BIOLOGIA MOLECULAR

Characterization of a Vancomycin-resistant Enterococcus faecium Outbreak Caused by 2

Genetically Different Clones at a Neonatal Intensive Care Unit .

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INTRODUCTION.

ENTEROCOCCUS:

Enterococcus are facultative anaerobic organisms and Gram positives.

They are organized in chains or pairs.

Catalase  –

Subdivided into groups by antibodies that recognize surface antigens.

The most important groups  are A, B, and D

The hemolysis reaction is important for the classification.

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INTRODUCTION. 

GENDER FAECIUM:

It  can  be  commensal  (innocuous)  in the human intestine.

It  may  also  be  pathogenic,  causing diseases such as: 

• neonatal meningitis.•urinary tract infection•bacteremia •endocarditis •diverticulitis

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INTRODUCTION.

Vancomycin  is  used  to  treat  colitis  (inflammation of the intestine).

Is  in  a  class  of  medications  called  glycopeptide antibiotics

It works by killling bacteria in the intestines. (will not function in any other part of the)

.

VANCOMYCIN

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INTRODUCTION.

Vancomycin-resistant Enterococcus

Vancomycin-sensitive  enterococci  typically  obtain  new  DNA  in  the  form  of plasmids or transposons which encode genes that confer vancomycin resistance. 

High-level vancomycin-resistant E. faecalis and E. faecium 

Six different types of vancomycin resistance are shown by enterococcus : Van-A, Van-B, Van-C, Van-D, Van-E and Van-F. Of these, only Van-A, Van-B and Van-C have been seen in general clinical practice.

The mechanism of resistance to vancomycin found in enterococcus involves the alteration  to  the  terminal amino acid  residues of  the NAM/NAG-peptide subunits, under normal conditions, D-alanyl-D-alanine, to which vancomycin binds. 

This loss of just one point of interaction results in a 1000-fold decrease in affinity

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GENERAL OBJETIVE

 The main aim of the study was determined from two cases,  the ways in which the streptococcus can become resistant to vancomycin, the risk factors to suffer the infection, the main causes of transmission and 

measures for controlling the spread of VRE.

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MATERIALES Y METODOSDATOS GENERALES

Este  estudio  se  llevó  a  cabo  en  un  hospital  universitario  de  1.000 camas 

La sala NICU tiene 2 habitaciones con 26 camas.

Compuesto por un pediatra, 5 residentes y 29 enfermeras que prestan atención a los pacientes críticamente enfermos de edad inferior o igual a 6 meses.

Todos  los  trabajadores  de  la  salud  práctican  las  precauciones estándar.

 En  julio de 2010, VRE  fue aislado de una muestra de esputo de un recién nacido prematuro (caso índice 1). Posteriormente, el ERV se aisló de un cultivo de orina de otro neonato (caso índice 2).

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CASE 1Un bebé de 780 g (primero en nacer  de una pareja de gemelos).

Parto normal vaginal espontáneo (NSVD), madre de 21 años de edad, semana 25  de gestación.

Puntuaciones  de  Apgar  fueron  de  2  y  3  a  los  1  y  5  minutos, respectivamente.

Recibió  tratamiento  con  surfactante  (complicaciones  de  la prematuridad):

•  Dificultad  respiratoria  que  requería  ventilación  mecánica  y  la oxigenoterapia  (ampicilina-sulbactam ).

El  día  5  en  la  UCIN,  íleon  mostraba  signos  enterocolitis necrotizante (NEC).  (rayos x)

En el día 8, se sometió a una resección del intestino delgado.

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CASE 1

Día 15, desarrolló hemorragia pulmonar y hemorragia intraventricular.

En el dia 31: esputo (VRE +). (Ampicillina-sulbactam  ceftriaxona y linezolid. )

En el  dia 36:    en el  cultivo de esputo se detuvo el  crecimiento de VRE  : VRE + muestras de  rectales.

 En el dia 77:  Empieza entrenamiento alimienticio •Se observa regurgitación•Pequeña reseccion del intestino.

En el dia 135::• Estudio por imagenes muestra que NEC empeoro.• Acidosis metabolica y neumonia. 

En el dia 142: muere (fallo multisistemico y sepsis).

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.CASE 2

2300 gr.

 G1P0 de 27 años de edad, a las 36 semanas de gestación por NSVD..

  La   Puntuación  de  Apgar  fue  8  y  9  a  1  y  5  minutos, respectivamente. . 

Su  condicion  de  salud  durante  la  primera  semana  no  tuvo complicaciones

En  el  7  º  día:  letargo,  ingesta  oral  deficiente  (meningitis aséptica,  coagulación  intravascular  diseminada,  e  ictericia neonatal) 

Fue admitido en la UCIN: vancomicina y ceftriaxona (7 días).

En el dia 6(interno): bradicardia  y aumento de los niveles de las enzimas cardiacas= 19% (miocarditis)

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CASE 2

Dia18 Dia 23

La paciente recibió inicialmente vancomicina y ceftriaxona ampicillina-sulbactam. 

Los  hemocultivos  y  cultivos  de  orina  fueron  negativos después  de  1  semana  de  tratamiento  y  durante  1  semana después de la interrupción

Condición  clínica  del  paciente mejoró,  y  no  se  observaron complicaciones. 

 Dia 28: El paciente fue dado de alta, y la ecocardiografía a los 2 meses reveló una fracción de eyección normal (61%).

Muestras de orina y rectales    (VRE +)

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MATERIALES Y METODO

INTERVENCIÓN.

Equipo especial  creado para coordinar la gestión de la crisis. 

Vigilancia  activa  de  las  muestras  de    los  26  pacientes  de  NICU,  42 trabajadores de la salud y sus entornos. 

Todos  los  pacientes  que  fueron  identificados  con  VRE  se  pusieron  en cohortes estrictas. 

 Medidas de control  de  infecciones  reforzadas y áreas de  los pacientes se limpiaron a fondo. 

La  selección  se  repite  cada  semana  hasta  que  se  presenten  pacientes   VRE+.

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MATERIALES Y METODO

Termociclador

1. PCR: Reacción en cadena de la polimerasa

Objetivo:  obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular, partiendo de un mínimo. (ampliar)

Utilidad: amplificación resulta mucho más fácil identificar : • virus• Bacterias• cadáveres• Hacer investigación científica sobre el ADN amplificado.

Fundamento:  la propiedad natural de los ADN polimerasas para replicar hebras de ADN:

• Ciclos de altas y bajas temperaturas alternadas para separar las hebras de ADN recién formadas entre sí tras cada fase de replicación.

• Dejar que vuelvan a unirse las polimerasas para que vuelvan a duplicarlas. 

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MATERIALES Y METODO

2. PFGE

Electroforesis en gel de campo pulsado.

Separación  de  las  moléculas  de  ADN  la  aplicación de un campo  eléctrico que cambia  periódicamente la dirección de una matriz de gel.

 UTILIDAD: • huella genética.• Estudios epidemiológicos de los organismos patógenos.•Vincular el medioambiente o alimentos con infecciones clínicas

FUNDAMENTO:  •Los  trozos más grandes de ADN serán más  lentos para    alinear su  carga cuando  la  dirección  del campo    cambia,  mientras que piezas más pequeñas serán más rápidas. •En  el  transcurso del  tiempo con el  cambio constante de direcciones, cada  banda se empieza  a  separar más  y  más . 

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MATERIALES Y METODO

3. MLST

Multilocus sequence typing

Es una técnica  para la tipificación de múltiples loci.

El  procedimiento   caracteriza aislamientos  de especies bacterianas usando las secuencias  de  ADN  de fragmentos internos de múltiples genes de limpieza

FUNDAMENTO:    amplificación  de  PCR  seguida  de la secuenciación del ADN . 

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Results

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Pulsed-field gel electrophoresis of vancomycin-resistant

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Discussion

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Discussion

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Personal conclusions

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