Upload
dangthu
View
242
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 1
Biokemija - Syllabus
Studij: Prediplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje lijekova
Broj predmeta: BIL 202
Web stranica predmeta: http://www.biotech.uniri.hr
ECTS bodovi: 12
Nastavno opterećenje/sati: 120 sati (40 P + 40 S + 40 V)
Nositelj predmeta:
Dr.sc. Roberto Antolović, red.prof.
Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci
Radmile Matejčić 2
Konzultacije:
Telefon:
e-mail: [email protected]
Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/
Asistent:
Dr.sc. Sandra Kraljević Pavelić, izv.prof.
Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci
Radmile Matejčić 2
Telefon:
e-mail: [email protected]
Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/
Asistent:
Dr.sc. Ivana Ratkaj, viši asistent
Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci
Radmile Matejčić 2
Telefon:
e-mail: [email protected]
Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/
Asistent:
Dr.sc. Mirela Sedić, docent
Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci
Radmile Matejčić 2
Telefon:
e-mail: [email protected]
Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/
Asistent:
Dr.sc. Marko Jovanović, docent
Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci
Radmile Matejčić 2
Konzultacije:
Telefon:
e-mail: [email protected]
Web stranica: http://www.biotech.uniri.hr/
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 2
Osnovne informacije o kolegiju:
Predavanja, seminari i vježbe se održavaju od 02.02.2015. do 27.03.2015.
Literatura za pomoć pri svladavanju nastavnog gradiva iz biokemije, praćenje
predavanja i seminara te za pripremu provjere znanja na kolokvijima i
završnom ispitu je:
Peter Karlson: Biokemija za studente kemije i medicine, Školska
knjiga, Zagreb, 1988.
Lehninger A.L., Nelson D.L., CoxM.M., Prinzipien der Biochemie,
Spektrum Akademischer Verlag Heidelberg-Berlin-Oxford,
Heidelberg, 1994.
Robert K. Murray, David A. Bender, Kathleen M. Botham, Peter J.
Kennelly,Victor W. Rodwell, P. Anthony Weil: Harperova ilustrirana
biokemija, Medicinska naklada, Zagreb, 2011ž
Jeremy M.Berg, John L.Tymoczko, Lubert Stryer: BIOKEMIJA,
Školska knjiga, Zagreb, 2013.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 3
OPIS PREDMETA
Kolegij u planu nastave obrađuje temelje biokemijskih procesa u stanici na molekularnoj
osnovi. Kolegij biokemije pruža mogućnost studentima da steknu teoretska i praktična znanja
koja su im potrebna za praćenje drugih nastavnih kolegija te praktično izvođenje
biokemijskih eksperimenta na vježbama iz biokemije. Na kolegiju biokemije studente se
podučava osnovnoj kemijskoj građi i svojstvima biološki važnih molekula. Na taj način
studente se uvodi u osnove najvažnijih biokemijskih puteva u stanici, načinu prijenosa signala
u stanici te regulacije biokemijskih i patobiokemijskih staničnih procesa. Studentima se na
zanimljiv i prihvatljiv način objašnjava način prijetvorbe, korištenja i utroška energije u
stanici kao i važnost regulacije prijenosa signala u stanicama te međusobne komunikacije
stanica živog organizma.
Osnovna znanja koja student dobiva na kolegiju biokemije prijeko su potrebna za
razumjevanje drugih kolegija kao primjerice fiziologije, patofiziologije, farmakologije,
molekularne medicine, itd.. Studentima će se uz gore navedeno prikazati i objasniti promjene
biokemijskih procesa koje dovode do nastanka patoloških stanja i metaboličkih bolesti uz
prikaz molekularnog principa liječenja metaboličkih bolesti.
Ukratko kolegij biokemije nudi studentima mogućnost stjecanja prijeko potrebnog znanja iz
područja biokemije i upoznavanje biološki važnih molekula, međusobno povezanih u sustavu
stanice, organa i organizma, te razumjevanje biokemijskih promjena koje dovode do bolesti
stanice i organizma.
Uvijet za upis kolegija Biokemija:
Da bi student redovno mogao pohađati nastavu iz kolegija biokemije student/ica mora
dobro vladati gradivom organske kemije i biologije te prilikom upisa na kolegij
biokemije mora imati odslušane kolegije iz predmeta biologija i organska kemija. ZA
PRISTUPANJE ZAVRŠNOM ISPITU IZ PREDMETA BIOKEMIJA STUDENT/ICA
MORA IMATI POLOŽENI ISPIT IZ OPĆE I ORGANSKE KEMIJE!!!
Ciljevi i očekivani ishodi predmeta (razvijanje općih i specifičnih kompetencija)
Opće kompetencije koje će se razvijati na predmetu: A1, A2, A3, A5, A8, B1, B3, B4; B5;
C1, C2, C3, C4.
Specifične kompetencije koje će se razvijati na predmetu:
Nakon uspješno završenog programa iz ovog predmeta studenti će biti sposobni:
a) Prepoznati i objasniti značenje važnih molekula uključenih u biokemijske procese
stanice te objansiti važnost tih biokemijskih procesa i reakcija za stanicu i organizam
u kojima te molekule sudjeluju
b) Naučiti, shvatiti i vladati molekularnim osnovama biokemijskih procesa
c) Sigurno i učinkovito rukovati uzorcima, provesti biokemijsku analizu prema unaprijed
danom protokolu, razumljivo prikazati rezultate te izvesti potreban zaključak iz
dobivenih rezultata izvršenog testa (proceduralno znanje).
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 4
Ishodi nakon izvršavanja svih programom predviđenih obveza:
A. Predavanja:
1. Uvod u biokemiju:
- uvod u kolegij biokemija
- čime se bavi biokemija
- povijest biokemije
2. Stanica i stanične strukture:
- stanična membrana kao zaštitna barijera;
- uloga stanične membrane u komunikaciji s okolinom;
- stanične organele
- transport tvari kroz staničnu membranu
3. Aminokiseline:
- struktura i podjele aminokiselina;
- svojstva i uloge aminokiselina
4. Peptidi, proteini:
- nomneklatura i određivanje peptida;
- prirodni peptidi
- resorpcija
5. Strukture proteina:
- proteinske strukture, njihovo nastajanje i određivanje;
- denaturacija i renaturacija proteina;
- enzimi koji sudjeluju u razgradnji proteina;
6. Razgradnja proteina, proteolitički enzimi: - razgradnja proteina in vivo i in vitro
7. Metode proteinske kemije:
- kromatografske metode
- izoelektrična točka i izoelektrično fokusiranje;
- elektroforeza;
- Western blot analiza;
- imunoprecipitacija
- ciljana proteoliza proteina i detekcija peptidnih fragmenata
8. Vitamini: - podjela vitamina
- svojstva vitamina
- važnost vitamina u biokemijskim reakcijama
- 9. Koenzimi:
- koenzimi i prostetske skupine;
- prijenos grupa i njihov potencijal;
- koenzimi C1- i C2-metabolizma;
10. Enzimi i enzimska kataliza:
- energija aktivacije;
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 5
- enzimi kao čimbenici ubrzavanja kemijskih reakcija;
- supstrati i inhibitori enzima s primjerima
11. Enzimska kinetika:
- Enzimi, supstrati, inhibitori;
- Michaelis-Mentenova konstanta;
12. Inhibicija enzima: - specifičnost enzimske katalize;
- inhibicije enzima,
13. Ugljikohidrati - nomenklatura i struktura jednostavnih šećera:
- monosaharidi i oligosaharidi;
14. Razgradnja šećera u probavnom traktu;
- razgradnja i resorpcija ugljikohidrata u probavnom traktu;
- simport glukoze i Na+;
- glukoza u stanici
15. Glikoliza: - aerobna razgradnja glukoze;
- anaerobna razgradnja glukoze
- alkoholno vrenje (laktat, etanol, propionat, butirat)
16. Glukogeneza:
- sinteza glukoze u organizmu;
- hormonska kontrola glukoneogeneze;
- Cori ciklus;
17. Glikogen i metabolizam glikogena: - metabolizam glikogena;
- bolesti vezane za spremanje glikogena;
- hormonska kontrola metabolizma glikogena
18. Aktivirani šećeri: - UDP glukoza kao račvište metabolizma;
- sinteza laktoze;
- stvaranje i uloga glukuronske kiseline;
- glikoproteini;
- hijaluronska kiselina
19. Ciklus pentoza fosfata: - biološki značaj pentozafosfatnog ciklusa
20. Ciklus limunske kiseline: - oksidativna dekarboksilacija piruvata;
- citratini ciklus i njegova energetska bilanca;
- biološki značaj citratnog ciklusa;
21. Masti i lipidi - struktura masnih kiselina
- sastav masti
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 6
- razgradnja masti u probavnom traktu;
- hilomikroni i lipoproteini;
- uloga lipoproteina i transport lipida;
22. -oksidacija masnih kiselina:
- -oksidacija masnih kiselina;
- karnitin i transport masnih kiselina;
- ketogeneza;
23. Sinteza masnih kiselina:
- biosinteza masnih kiselina;
- biosinteza kolesterola i njena regulacija;
- metabolizam kolesterola
24. Žučne kiseline:
- sinteza žušnih kiselina;
- enterohepatična cirkulacija;
25. Eikozanoidi i pristaglandini: - leukotrieni i prostaglandini;
- fosfolipidi;
- sfingomielini i cerebrozidi - gradivni elementi stanične membrane;
26. Steroidi i steroidni hormoni;
- struktura steroida;
- metabolizam steroidnih hormona;
- djelovanje steroidnih hormona na stanicu;
27. Razgradnja aminokiselina i transport dušika u tijelu sisavaca:
- transaminaze i piridoksalfosfat;
- dezaminacija serina i treonina;
- transport dušika do jetre;
- izlučivanje amonijaka;
28. Ciklusu mokraćne kiseline:
- štetnost amonijaka za organizam
- ciklus mokraćne kiseline;
29. Oksidacijska fosforilacija:
- redoks reakcije: FAD i NAD;
- veza između reakcija koje proizvode i onih koje troše energiju;
- energijom bogati spojevi;
30. Dobivanje ATP-a:
- disanje i sinteza ATP-a;
- mehanizam ATP sinteze;
- respiratorni lanac i termogeneza
31. Biosineteza purina i pirimidina:
- biosinteza purina i pirimidina;
- regulacija purin i pirimidin biosinteze;
- djelovanje antimetabolita;
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 7
32. Nukleinske kiseline:
- gradivni elementi;
- primarna struktura;
- vodikove veze;
- dvostruka uzvojnica;
33. Tetrahidrofolna kiselina:
- uloga folne kiseline u mijeni tvari, inhibitori sinteze folne kiseline;
- razgradnja purinskih i pirimidinskih nukleotida i izlučivanje metabolita;
34. DNA i RNA
- DNA biosinteza i uloga
- replikacija DNA;
- RNA biosinteza;
- RNA i njena uloga;
35. Regulacija izražavanja gena:
- regulacija ekspresije gena u pro i eukariota;
- DANN kloniranje u pro i eukariota;
- transgenične životinje;
36. Molekularno biološke metode u biokemiji:
- izolacija DNA i RNA;
- PCR, RT PCR, RFLP, osnove i njihove primjene;
- ELISA
37. Metode velikog probira u farmaceutskoj industriji:
- HTS, HCS
B. Seminari:
1. Uvod u biokemiju, ponavljanje i inicijalna provjera stečenog znanja iz organske
kemije i biologije
2. Aminokiseline, peptidi, proteini – struktura, metabolizam, izolacija a) odjeljivanje aminokiselina;
b) aminokiseline kao zwiter ioni;
c) određivanje izoelektrične točke aminokiselina;
d) određivanje koncentracije proteina, SDS-PAGE, Western blot,
e) princip izgradnje, nomenklatura i određivanje peptida, prirodni peptidi;
struktura i reverzibilna denaturacija proteina amonij sulfatom;
f) termička obrada seruma i izolacija imunoglobulina klase G;
g) kromatografske metode;
h) obilježavanje proteina ubikvitinacijom;
i) razgradnja proteina u lizosomu i proteasomu;
3.Vitamini i koenzimi:
a) podjela vitamina
b) biologija i važnost vitamina
c) važnost vitamina kao koenzima;
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 8
4. Enzimi i enzimska kinetika
a) vrste enzimskih inhibicija;
b) karakterizacija aktivnog centra enzima;
c) kristalizacija enzima i SAR.
5. Ugljikohidrati a) monosaharidi, disaharidi, polisaharidi,
b) metabolizam glikogena;
c) hormonska kontrola metabolizam glukoze i glikogena,
d) bolesti vezane za spremanje glikogena u jetrima
e) G-protein povezani receptori i adrenalin;
f) sinteza i uloga adrenalina;
6. Metabolizam masti
a) probava masti i hilomikroni;
b) uloga lipoproteina i transport lipida
c) leukotrieni i prostaglandini, nastanak i veza s upalnim procesima;
d) upala;
7. Energijom bogati spojevi:
a) ATP sinteza;
b) ATP kao supstrat;
c) pirofopsfat
d) kiselinski anhidridi
8. Respiratorni lanac i termogeneza, oksidacijski stres i antioksidansi
9. Metode molekularne biologije:
a) izolacija DNA i RNA;
b) genomska DNA;
c) primjena metoda PCR, RT PCR, RFLP;
10. Metode proteinske kemije
a) kromatografija
b) izoelektrično fokusiranje
c) elektroforeza
d) westernblot
11. Prijenos signala u stanici i stanični ciklus
a) stanična signalizacija;
b) translacija;
c) posttranslacijske modifikacije;
d) MAP kinazni put;
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 9
12. Apoptoza:
a) programirana stanična smrt;
b) signalizacija za početak apoptoze i povezanost s malignim bolestima;
13. Hormoni i receptori:
a) endokrine žlijezde sisavaca;
b) receptori – proteini koji prepoznaju hormone;
14. Steroidni hormoni i hormonska regulacija:
a) steroidni hormoni – struktura, zadaća;
b) receptori steroidnih hormona;
c) transporteri steroidnih hormona;
d) gemomski i ne genomiski učinci;
e) hormonska regulacija razine glukoze u krvi inzulinom i glukagonom;
f) diabetes tip I i diabetes tip II
C. Vježbe:
1. Analitičke metode
Osnove fotometriranja; fotometrijsko određivanje anorganskog fosfata; određivanje
kiselinski labilnog i anorganskog fosfata;
2. Metabolizam aminokiselina; – obojene reakcije aminokiselina i proteina, taložne
reakcija aminokiselina i proteina
3. Proteini;
Obaranje proteina u nativnom stanju; obaranje kazeina u izoelektričnoj točci;
Taloženje bjelančevina uz istovremenu ireverzibilnu denaturaciju; Određivanje ukupne
količine proteina u uzorku metodom po Lowry-u. Izračunavanje koncentracije proteina
nepoznatog uzorka.
4. Priprema i određivanje proteina SDS elektorforezom
Priprema SDS gelova i uzoraka za razdvajanje proteina u denaturirajućem obliku u
poliakrilamidnom gelu, Coomasie bojanje i odrečivanje molekulske mase proteina na
osnovi dužine migracije vrpce uzorka u samom gelu.
5. Enzimi i njihova svojstva;
specifičnost djelovanja amilaze, specifičnost djelovanja ureaze, utjecaj temperature na
enzimsku aktivnost, ovisnost enzimske reakcije o pH vrijednosti, aktivacija i inhibicija
enzima.
6. Aktivacija i inhibicija enzima. Enzimska kinetika
7. Metabolizam uljikohidrata; – Identifikacija monosaharida obojenim reakcijama,
dokazivanje glukozę i fruktoze, identifikacija disaharida dokazivanje saharoze i laktozę
8. Metabolizam škroba, razgradnja škroba i njegovo dokazivanje.
.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 10
9. Metabolizam masti; – razgradnja triglicerida lipazom, određivanje nastanka
masnihkiselina. Tankoslojna kromatografija. Određivanje ketonskih tijela
10. PCR; Izvođenje lančane reakcije polimerazom i dokaz nastalog PCR produkta agar
elektroforezom i/ili kvantitativnim PCR-om
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 11
Korelativnost i korespondentnost predmeta:
Program je korespondentan s programima referentnih sveučilišta:
Program kolegija Biokemija je korespondentan sa sličnim programima u području prirodnih
znanosti i biomedicine.
BIOKEMIJA BIL202 – Sadržaj Kolegija
Vrsta TEMA Broj sati
nastve
P1 Uvod u biokemiju 2
P2 Stanica, stanične strukture 1
P3 Aminokiseline 1
P4 Peptidi, proteini, proteolitički enzimi 1
P5 Struktura proteina 2
P6 Razgradnja proteina 1
P7 Metode proteinske kemije 1
P8 Vitamini 1
P9 Koenzimi. 1
P10 Enzimska kataliza 1
P11 Enzimska kinetika 1
P12 Inhibicija enzima 1
P13 Ugljikohidrati. 2
Kolokvij 1
P14 Razgradnja i resorpcija šećera u organizmu 1
P15 Glikoliza 1
P16 Glukoneogeneza 1
P17 Metabolizam glikogena 1
P18 Aktivirani šećeri 1
P19 Ciklus pentoza fosfata 1
P20 Oksidacijska dekarboksilacija i ciklus limunske
kiseline
1
P21 Masti i lipidi 1
P22 Beta oksidacija masnih kiselina, karnitin,
ketogeneza
1
P23 Sinteza masnih kiselina, biosinteza kolesterola i
njena ragulacija, metabolizam kolesterola
1
P24 Sinteza žučnih kiselina 1
P25 Fosfolipidi, eikozanoidi, leukotrieni,
prostaglandini
1
Kolokvij 2
P26 Steroidi i steroidni hormoni 1
P27 Transaminaze i piridoksalfosfat, dezaminacija
serina i treonina, transport dušika do jetre
1
P28 Ciklus mokraćne kiseline 1
P29 Oksidacijska fosforilacija 1
Kolokvij 3
P30 Dobivanje ATP-a 1
P31 Biosinteza purina i pirimidina 1
P32 Nukleinske kiseline; gradivni elementi, primarna 1
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 12
struktura, vodikove veze, dvostruka zavojnica
P33 Tetrahidrofolna kiselina, razgradnja purinskih i
pirimidinskih nukleotida i izlučivanje metabolita
1
P34 DNA i RNA 1
P35 Regulacija izražavanja gena 1
P36 Molekularnobiološke metode u biokemiji 1
P37 Metode probira aktivnih molekula u farmaceutskoj
industriji
1
Kolokvij 4
Vrsta TEMA Broj sati
nastave
S1 Uvod u biokemiju i inicijalni test provjere
stečenog znanja iz biologije i organske kemije
3
S2 Aminokiseline, peptidi, proteini - struktura,
Aminokiseline, peptidi, proteini - metabolizam
2
2
S3 Vitamini i koenzimi 2
S4
S4
S4
Enzimi i enzimska kinetika
enzimska kinetika
enzimska kinetika
2
1
1
S5
S5
S5
Ugljikohidrati nomenklatura i svojstva
Monosaharidi, disaharidi i polisaharidi
Metabolizam ugljikohidrata
1
1
2
S6 Oksidacijska dekarboksilacija i Krebsov ciklus 2
S7
S7
Lipidi, transport masti,
Metabolizam masti,
2
2
S8 Energijom bogati spojevi 2
S9
S9
Respiratorni lanac i termogeneza,
Oksidacijski stres i antioksidansi
2
1
S10 Metode molekularne biologije 1
S11 Metode proteinske kemije 2
S12 Prijenos signala u stanici i stanični ciklus 3
S13 Programirana stanična smrt - Apoptoza 2
S14 Hormoni i receptori 2
S15 Steroidni hormoni i hormonska regulacija 2
Vrsta TEMA Broj sati
nastave
VE1 Analitičke metode: fotometriranje određivanje
anorganskog fosfata. Određivanje labilnog fosfata
i anorganskog fosfata
3
VE2 Metabolizam aminokiselina; – obojene reakcije
aminokiselina i proteina, taložne reakcija
aminokiselina i proteina
3
VE3 Određivanje proteina metodom po Lowry-u,
obaranje kazeina u izoelektričnoj točci,
preparativno odvajanje kazeina, laktalbumina i
laktglobulina iz kravljeg mlijeka.
4
VE4 Priprema SDS gelova i uzoraka za razdvajanje
proteina u denaturirajućem obliku u
poliakrilamidnom gelu, Coomasie bojanje,
određivanje molekulske mase proteina na osnovi
dužine migracije vrpce uzorka u gelu.
6
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 13
P-
predavanja
S-seminari
VE -Eksperimentalne vježbe
Sadržaj predmeta:
A. Predavanja:
Uvod u biokemiju
Stanica i stanične strukture
Aminokiseline
Proteini
Strukture proteina
Razgradnja proteina, proteolitički enzimi
Metode proteinske kemije
Vitamini
Koenzimi
Enzimi i enzimska kataliza
Enzimska kinetika, inhibicija enzimskog djelovanja
Ugljikohidrati,
Glikoliza i glukoneogeneza,
Metabolizam glikogena
Aktivirani šećeri
Ciklus pentozafosfata
Oksidacijska dekarboksilacija
Ciklus limunske kiseline
Masti, beta oksidacija masnih kiselina,
Sinteza masnih kiselina
Žućne kiseline
Eikozanoidi i prostaglandini
Steroidi i steroidni hormoni
Razgradnja aminokiselina i promet dušika u organizmu
Ciklus mokraćne kiseline, transaminacija i oksidativna fosforilacija
Dobivanje ATP-a
Nukleinske kiseline, biosinteza purina i pirimidina, tetrahidrofolna kiselina
DNA i RNA, ribosomi, regulacija ekspresije gena
VE5 specifičnost djelovanja amilaze, specifičnost
djelovanja ureaze, utjecaj temperature na
enzimsku aktivnost, ovisnost enzimske reakcije o
pH vrijednosti,
4
VE6 Aktivacija i inhibicija enzima. Enzimska kinetika
4
VE7 Identifikacija mono i disaharida. Odrađivanje
glukoze, fruktoze, saharoze i laktoze
4
VE8 Metabolizam škroba, razgradnja škroba i njegovo
dokazivanje.
4
VE9 Razgradnja triglicerida lipazom, određivanje
nastanka masnih kiselina, tankoslojna
kromatografija.
4
VE10 Izolacija DNA i lančana reakcija polimerazom
(PCR)
4
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 14
Molekularno biološke metode u biokemiji
Metode probira aktivnih molekula u farmaceutskoj industriji
B. Seminari - auditorne vježbe
Uvod u biokemiju provjera stečenog znanja iz biologije i organske kemije
Aminokiseline, peptidi, proteinske strukture, izolacija AK
Vitamini i koenzimi,
Enzimi i enzimska kinetika
Ugljikohidrati
Metabolizam masti
Energijom bogati spojevi,
Respiratorni lanac i termogeneza, antioksidansi
Metode molekularne biologie
Metode proteinske kemije
Prijenos signala u stanici i stanični ciklus
Programirana stanična smrt - Apoptoza
Hormoni i receptori
Steroidni hormoni i hormonska regulacija metabolizma.
C. Vježbe-eksperimentalne vježbe
Analitičke metode
Osnove fotometriranja; fotometrijsko određivanje anorganskog fosfata; određivanje kiselinski
labilnog i anorganskog fosfata; Enzimska kataliza dobivanjekreatinin fosfata iz kreatinina i
ATP-a.
Proteini;
Obaranje proteina u nativnom stanju; obaranje kazeina u izoelektričnoj točci; Taloženje
bjelančevina uz istovremenu ireverzibilnu denaturaciju; kvantitativno određivanje proteina
putem određivanja prisutnosti peptidne veze. Razdvajanje proteina na osnovi njihovog
različitog naboja. Određivanje izoelektrične točke proteina.
Enzimi i njihova svojstva;
ovisnost enzimske reakcije o pH vrijednosti, ovisnost enzimske reakcije o temperaturi,
ireverzibilna denaturacija proteina.
Proteinska biosinteza i nukleinske kiseline; –izolacija nukleinskih kiselina, kvantitativno
određivanje nukleinskih kiselina.
Metabolizam uljikohidrata; – model djelovanja dehidrogenaza; kromatografsko određivanje
aktivnosti heksokinaze.
Metabolizam masti; –Enzimska razgradnja triglicerida lipazom; određivanja nastanka
masnih kiselina nakon hidrolize triglicerida inkubiranih s lipazom, kvalitativno i
kvantitativno određivanje ketonskih tijela kao produkt oksidacije masnih kiselina u
mitohondriju.
Pristup učenju i poučavanju u predmetu:
1. Znanje
Studenti trebaju savladati i znati osnovnu biokemijsku terminologiju, strukturu osnovnih
kemijskih spojeva i molekula važnih za život i opstanak stanice. Studenti moraju naučiti,
shvatiti, znati objasniti osnovne biokemijske procese koji se zbivaju u stanici. Studenti
moraju znati objasniti međusobnu povezanost pojednih ciklusa i njihov energetski učinak
te značenje za metabolizam i zdravlje stanice. Studenti moraju zanti principe osnovnih
biokemijskih metoda.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 15
2. Razumijevanje
Studenti trebaju razumijeti biokemijske zakonitosti stanice, principe i važnost
biokemijskih ciklusa te ulogu pojedinih biokemijskih procesa u životu stanice i samog
organizma kao što je to opisano u predhodnom članku.
3. Vještine
Studenti moraju biti sposobni pratiti postupke u pripremljenom obliku, sigurno i
kooperabilno provesti eksperimente, rukovati aparaturom za provođenje eksperimenata,
uočiti i registrirati promjene, izvesti mjerenja, interpretirati eksperimentalne podatke i
procijeniti točnost eksperimentalnih rezultata uz objašnjenje njihovog značenja.
4. Sposobnost
Studenti trebaju moći prevesti dobivene informacije u govorni, grafički i matematički
oblik, jasno napisati koncept i teoriju izrađenog pokusa, izvjestiti o eksperimentalnim
postupcima i rezultatima na sažet, točan i razumljiv način. U tu svrhu studenti trebaju
koristiti stečena znanja iz biokemije.
5. Stavovi Student treba prepoznati molekularnu biokemijsku osnovu života, njenu važnost i
napredak u biokemiji kao znanstvenoj grani. Studenti trebaju prepoznati utjecaj
biokemijskih procesa na život, razvoj bolesti ili zdravlja. Razumjeti važnost biokemije u
razvoju zdravstva i farmaceutske industrije te raspon biokemijske stručnosti i način rada
biokemičara.
Način izvođenja nastave
Nastava se odvija u turnusu od 02.02.2015 - 27.03.2015. u obliku predavanja, seminara i
eksperimentalnih vježbi. Predviđeno vrijeme trajanja nastave je ukupno 8 tjedana.
Obaveze studenata/studentica
Studenti su dužni redovito izvršavati obveze koje se odnose na pohađanje nastave,
laboratorijski rad i kontinuiranu provjeru znanja.
Vrednovanje obveza studenata/studentica
Tijekom kolegija biokemija student/studentica može ukupno prikupiti 100 bodova prema
tablici 1.
Laboratorijski rad, kontinuirana provjera znanja i seminari pridonose 70 od maksimalnih 100
bodova. Student/ica bodove stjeće uspješnim polaganjem kolokvija u sklopu kontinuirane
provjere znanja, pripremom seminarskog rada u pisanom obliku i njegove prezentacije.
Redovito pohađanje nastave. Nastava iz kolegija biokemije sastoji se od 40 sati predavanja,
40 sati laboratorijskih vježbi, 40 sati seminara. Student može samo iz opravdanih razloga
izostati najviše do 30% ukupne nastave (predavanja, laboratorijske vježbe, seminari).
Pohađanje nastave je obavezno. Ako student/ica izostane s više od 30% ukupne nastave
bilo OPRAVDANO ILI NEOPRAVDANO isti/a ne može dalje nastaviti praćenje
kolegija Biokemija, odnosno gubi mogućnost izlaska na završni ispit. Time je skupio/la
nula bodova i ocijenjen/a ocjenom FX. Izostanak s praktične nastave (vježbe) student/ica ne
može nadoknađivati ponavljanjem pokusa u praktikumu. Ako je izostanak opravdan i
potvrđen valjanom dokumentacijom student/ica može u dogovoru s nastavnikom nadoknaditi
propuštene vježbe dodatnim seminarskim radom. Temu seminarskog rada dogovara s
nastavnikom kod slijedećeg dolaska na nastavu nakon izostanka. Na ovaj način mogu se
nadoknaditi maksimalno dvije vežbe iz programa ovog kolegija.
Laboratorijski rad - laboratorijske vježbe pridonose na kolegiju biokemija najviše 10
bodova, u to ulazi, način i izrada same vježbe, točnost rezultata i objašnjenje dobivenih
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 16
rezultata. Za svaku vježbu, student/ica je dužan/a pripremiti se za izvođenje praktične nastave
iz preporučene i pripremljene literature. Ocjena pripremljenosti za praktične vježbe koja će se
provesti kratkom pismenom provjerom studentu/ici pridonosi maksimalno 10 bodova. U
slučaju da student ili studentica pokažu na testu da nisu dovoljno pripremljeni za izvođenje
predviđenih praktičnih vježbi neće im biti dozvoljeno izvođenje istih, te će ne prisustvovanje
vježbama morati nadoknaditi seminarskim radom i kolokvijem kod voditelja nastave iz
kolegija biokemija. Izostanak s eksperimentalnih vježbi neće se tolerirati, odnosno, neće biti
mogućnosti nadoknade eksperimentalnih vježbi naknadnim ponavljanjem pokusa u
laboratoriju studentskog praktikuma. Izostanak s vježbi može se nadoknaditi seminarskim
radom kako je navedenu u gornjem odlomku ovoga teksta. Ukupan broj bodova koji
student/ica može ostvariti na praktičnom radu u laboratoriju je 20 bodova.
Tijekom održavanja predavanja i seminara provoditi će se i kontinuirana provjera znanja
provedene nastave ukupno četiri kolokvija. Svaki kolokvij donosi 10 bodova. Svaki student
će moći na kontinuiranoj provjeri znanja prikupiti najviše 40 bodova.
Ukoliko student ne prikupi bodove tijekom provođenja kontinuirane provjere znanja, imati će
mogućnost popravka nakon obavljene ukupne nastave kolegija testovima za seminarsko
gradivo koje student/ica nije uspješno apsolvirala – popravak uključuje prethodno
ocjenjene testove ocjenom F i Fx i ne mogu se pisati popravci testova ako su predhodni
testovi kontinuirane provjere znanja bili pozitivno ocijenjeni.
Ukoliko student ni tada ne prikupi dovoljan broj bodova, popravak će se održati u rujnu.
Aktivno sudjelovanje koja uključuje obradu i pripremu seminara u obliku pismenog
seminarskog rada i "power point" prezentacije te izlaganjem obrađene teme studentu/ici
pridonosi maksimalno 10 bodova.
Kriterij ocjenjivanja na kolegiju biokemija sukladan je kriterijima ocjenjivanja
diplomskog studija: A (5) – 80-100%, B (4) – 70-79,99%, C (3) – 60-69,99%, D (2) – 50 -
59,99%, E (2) – 40-49,99%, F i FX – (1) ispod 49,99% bodova.
Završni ispit pridonosi najviše 30 bodova. Završni ispit polaže se usmeno. Usmeni završni
ispit sastoji se od 6 pitanja koja se pojedinačno boduju svaki s pet (5) bodova.
Kriterij bodovanja završnog ispita:
- 15,00 - 17,97 bodova - odgovor koji zadovoljava najniži kriterij poznavanja ispitne
materije;
- 17,98 - 20,97 bodova – ispodprosječno poznavanje ispitne materije;
- 20,98 - 23,97 bodova – prosječno poznavanje ispitne materije;
- 23,98 - 26,97 bodova – iznadprosječno poznavanje ispitne materije s malim
pogreškama;
- 26,98 - 30,00 – iznadprosječno poznavanje ispitne materije
Jedno od pitanja odnositi će se na eksperimentalnu vježbu izrađenu u okviru kolegija.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 17
Tablica 1. Potrebne aktivnosti bodovanja kolegija BIL202 Biokemija
Vrsta
aktivnosti
Ishodi učenja Specifična
aktivnost
studenta
Metoda
procjenjivanja
Bodovanje
(maksimalni
broj bodova) Seminarski
radovi
stjecanje vještine
pisanja i izlaganja
znanstvenog rada
usmeno izlaganje,
interaktivno učenje
pripremljenost
seminara i vještina
izlaganja
10 BODOVA
Kontinuirana
provjera
pripremljenosti
za vježbe
Pismena provjera
pripremljenosti
studenta/ice za
izvođenje vježbi
prethodna
pripremljenost za
izvođenje vježbi,
10 BODOVA
Laboratorijski
rad sigurno i djelotvorno
rukovati uzorcima,
provesti analizu prema
protokolu,
prikazati rezultate
analize,
analizirati rezultate
Izvođenje
eksperimenata
prema zadanom
protokolu
samostalnost
izvođenja,
točnost rezultata,
završetak vježbe i
predaja izvješća u
zadanom
vremenu
10 BODOVA
Prema složenosti
vježbe moguće je
po vježbi i
provjeri
pripremljenosti za
vježbe skupiti
maksimalno 3
boda
Kontinuirana
provjera znanja
objektivno mjerenje
znanja provodi se
zadacima
ispravljanja
4 Kolokvija:
1. P1-P12; S1-S4
2. P13-P19; S5-S6
3. P20-P30; S7-S10
4. P31-P37;S10-S15
40 BODOVA
Svaki test donosi
maksimalno 10
bodova i sadrži do
50 pitanja ili
zadataka.
Potrebno je riješiti
minimalno 50%
testa ili skupiti 5
bodova po testu.
Završni ispit Usmeno
uključuje sadržaj
predavanja,
seminara i vježbi
6 pitanja svaki
točan i potpun
odgovor donosi 5
bodova
Završni ispit 30 BODOVA
Ukupno 100 BODOVA
DODATNE INFORMACIJE O PREDMETU
Pohađanje nastave:
Nastava iz kolegija biokemije će se održati u turnusu od 02.02. - 27.3.2015. prema
navedenom rasporedu.
KAŠNJENJA STUDENTA, KAO I ULASCI ILI IZLASCI TIJEKOM NASTAVE SE
NE TOLERIRAJU I NE DOPUŠTAJU! STUDENTI MORAJU IMATI ISKLJUČENE
MOBITELE U VRIJEME ODVIJANJA NASTAVE!
Na laboratorijskim vježbama studenti trebaju nositi zaštitnu odjeću (bijela kuta), a sa sobom
donijeti flomaster za pisanje po staklu, krpu, špatulu, kalkulator i obavezno Upute za
vježbe.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 18
Tjedan Datum Predavanja Seminari Laboratorijske
vježbe
Testovi i
međuispiti
Nastavnik/suradnik
/Predavaonica 1
.
(27
. -3
1 .0
1. 20
14
.)
Ponedjeljak
02.02. P1
(08:15-09:00)
P-O-30
S1 GI -GII
(09:15-13:00)
S1 GIII
P-O-268
(13:15-15:00)
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr. sc.
M. Jovanović
Utorak
03.02 P2, P3,
(08:15-10:00)
Prof.dr.sc.R.Antolović
Srijeda
04.02. P4, P5
(08:15-10:00)
P-O-30
S1 GI -GII
(10:15-11:00)
S1 GIII
(11:15-12:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr. sc.
M. Jovanović
Četvrtak
05.02. P6, P7
(08:15-10:00)
P-O-30
S2 GI - GII
(10:15-14:00)
P-O-30
S2 GIII - GIV
(12:15-14:00)
O-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
Petak
06.02. P8, P9
(08:15-10:00)
P-O-30
S2 GI - GII
(10:15-12:00)
P-O-30
S2 GIII
(12:15-14:00)
P-O-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc. M.Jovanović
Azemina Ilijazi
2.
(03
. -0
7. 0
2. 20
14
.)
Ponedjeljak
09.02 P10, P11, P12
(08:15-11:00)
P-O-30
S3 GI - GII
(12:15-14:00)
P-O-268
S3 GIII
(14:15-16:00)
P-O-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
Utorak
10.02. P13
(08:15-09:00)
P-O-30
S4 GI - GII
(09:15-13:00)
P-O-30
S4 GIII
(11:15-13:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr. sc. M.
Jovanović
Srijeda
11.02. P14, P15
(8:15-10:00)
P-O-30
S4 GI - GII
(10:15-11:00)
S4 GIII
(11:15-12:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Dr.sc.M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Četvrtak
12.02.
S5 GI - GII
(08:15-12:00)
P-O-30
S5 GII I
(13:00-16:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Petak
13.02. P16, P17
(08:15-10:00)
P-O-30
P18
(10:15-11:00)
P-O-30
P19
(11:15-12:00)
P-O-30
S5 GI - GII
(13:15-17:00)
P-O-30
S5 GIII
(13:15-15:00)
0-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
3.
(10
. -1
4 .0
2. 20
14
.) Ponedjeljak
16.02.
VE1, VE2/
GI -III
(10:15-18:00)
Praktikum
O-264, O-265
Kolokvij I
(08:15-
09:30)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc. M.Jovanović
Utorak
17.02.
VE3/ GI-II
(08:15-12:00)
O-264, O-265
VE3/ GIII
Prof.dr.sc.R.Antolović
Dr.sc.M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 19
(13:00-17:00)
O-265
Srijeda
18.02.
VE4/ I-III
(10:15 -18:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc. M.Jovanović
Četvrtak
19.02.
VE5/ GI-III
(09:15 -18:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Dr.sc.M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Petak
20.02. P20
(08:15-09:00)
P-O-30
P21
(09:15-10:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc. M.Jovanović
4.
(17
.-.2
1. 0
2. 20
14
.)
Ponedjeljak
23.02.
S6 GI -GII
(08:15-12:00)
P-O-30
S6 GIII -
(12:15-14:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc.
M.Jovanović
Utorak
24.02.
VE6/ I-IV
(08:15-17:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc.M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Srijeda
25.02. P22, P23
(10:15-12:00)
P-O-30
S7 GI - GII
(11:15 -15:00)
P-O-30
S7 GIII
(13:15 -15:00
P-O-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
Četvrtak
26.02. P24, P25
(10:15-12:00)
P-O-30
S7 GI - GII
(12:15-16:00)
P-O-30
S7 GIII
(14:15 -16:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc.M.Jovanović
Petak
27.02. Kolokvij II
(08:30-
10:00)
P-O-30
5.
(24
-28
. 02
. 2
01
4.)
Ponedjeljak
02.03. P26, P27,
(09:15-11:00)
P-O-30
S7 GI - GII
(12:15-14:00)
P-O-268
S7 GIII
(14:15-16:00)
P-O-268
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc.M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Utorak
03.03.
VE7/
G I-III
(08:15-17:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc.M.Jovanović
Srijeda
04.03.
VE8/ GI-III
(08:15-17:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc. M. Jovanović
Azemina Ilijazi
Četvrtak
05.03. P28
(09:15-10:00)
P29
(10:15-11:00)
P30,
(11:15-12:00)
P31
(12:15-13:00)
P-O-30
Prof.dr.sc. R. Antolović
Doc.dr. M. Jovanović
Dr.sc. Ivana Ratkaj
Doc.dr.sc. Mirela Sedić
Petak
06.03.
S8 GI - GII
(10:30-14:00)
P-O-30
S8 GIII
Doc.dr.sc.Sandra
Kraljević-Pavelić/
Dr.sc. Mirela
Sedić/Dr.sc. Ivana
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 20
a)
Predavanja i seminari se održavaju u predavaoni Odjela za biotehnologiju
Sveučilišta u Rijeci (prizemlje) P-O-30, prema rasporedu danom u tablici iznad.
(12:15-14:00)
O-268
Ratkaj /
6.
(03
. -
07
. 0
3.
20
14
.)
Ponedjeljak
09.03.
VE 9 / GI-III
(09:45-17:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr.sc M.Jovanović
Azemina Ilijazi
Utorak
10.03. Kolokvij III
(08:00- 09:30)
P-O-30
S9 GI - GII
(12:15-14:00)
P-O-30
S9 GIII
(14:15-16:00)
P-O-30
Prof.dr.sc. R.Antolović
Doc.dr.sc. M.Jovanović
Srijeda
11.03. P32
(10:15-11:00)
P-O-30
P33
(11:15-12:00)
P-O-30
Prof.dr. sc. Sandra
Kraljević Pavelić
Dr.sc. Mirela Sedić
Četvrtak
12.03. P34
(10:15 -11:00)
P-O-30
S10 GI - GIII
(13:15-15:00)
prof.dr.sc.Sandra
Kraljević-Pavelić
Dr.sc Ivana Ratkaj
Petak
13.03.
S11 GI
(09:15-11:00)
S11 GII
(11:15-13:00)
S11 GIII
(14:15-16:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
7.
(10
. -
14
. 0
3.
20
13
.)
Ponedjeljak
16.03 P 35,36
(13:15-15:00)
P-O-30
S12 GI - GII
(10:15-12:00)
S12 GIII
(12:15-14:00)
P-O-30
Dr.sc. Ivana Ratkaj
Utorak
17.03.
VE10 / GI-III
(08:15-17:00)
O-264, O-265
Prof.dr.sc.R.Antolović
Azemina Ilijazi
Srijeda
18.03. P 37
(13:15-14:00)
P-O-30
S13 GI - GII
(09:15-12:00)
P-O-30
S13 GIII
(12:15-14:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Doc.dr. Mirela Sedić
Četvrtak
19.03.
S14,S15 GI - GII
(08:15-12:00)
P-O-30
S14,S15 GIII -
(13:15-17:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
Petak
20.03.
Kolokvij IV
(11:30 -
13:00)
P-O-30
Prof.dr.sc.R.Antolović
8.
(17
. -
22
. 0
3.
20
13
) Utorak
24. 03. 2015.
09:00-11:00
Ispravak kolokvija I-IV
P-O-30
Doc.dr.sc. M.Jovanović
Četvrtak
26.03.2015.
9.00-15,00
1. ISPITNI ROK – USMENI/PISMENI ISPIT
P-O-268
Prof.dr.sc. R. Antolović
Petak
24.04.2015. 2. ISPITNI ROK – USMENI ISPIT
P-O-268
Prof.dr.sc. R. Antolović
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 21
b) Praktične vježbe se održavaju u laboratorijama i praktikumima Odjela za
biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci, drugi kat O-264 i O-265.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 22
Pismeni radovi
UPUTE ZA PISANJE SEMINARSKOG RADA
Seminarski rad predaje se u elektronskom i tiskanom obliku, a piše se u obliku ESEJA prema niže
navedenim uputama i rad se ne može predati kao prijevod orginalnog rada ili radova koji se obrađuju. NASLOV rada treba biti kratak i jasan, iz njega mora biti vidljiva problematika rada. Treba
izbjegavati kratice i strane riječi ako postoje hrvatske istoznačnice. Imena vrsta pisati korektno
kosim slovima (italic), a uz ime vrste navesti i ime autora koji je tu vrstu prvi odredio.
Format: A4 (210x297 mm).
Korice: ispisuje se naziv sveučilišta, fakulteta i odsjeka, ime i prezime studenta, smjer, naslov
rada, vrsta rada (Seminarski rad), mjesto i godina (Prilog 1).
SADRŽAJ je kazalo pojedinih naslova s navođenjem stranica. Preporučuje se decimalna
numeracija poglavlja i odlomaka u poglavljima (npr. 1.1 1.2 …).
Numeracija stranica započinje na stranici UVODA rada; numeriraju se sve stranice, tj. kako
stranice s tekstom, tako i stranice sa slikama (grafikoni, sheme, fotografije) i tablicama, ukoliko
već nisu uklopljeni u tekst.
UVOD ukratko sadrži osnovne podatke o tematici seminarskog rada.
RAZRADA tematike seminarskog rada – sadrži definicije, kemijske strukture, sheme
metaboličkih puteva, slike, grafikone potrebne za razradu tematike.
ZAKLJUČAK – ukratko se navodi na osnovu obrađene tematike.
LITERATURA – sadrži popis svih izvornika koji se spominju u radu. Svaki citat u tekstu mora
biti zastupljen u popisu literature i obratno. Literaturni podaci moraju sadržavati: imena autora,
godinu objavljivanja rada, naslov rada, naziv časopisa, broj volumena i stranice koje rad
obuhvaća. Bibliografske reference se navode abecednim redom uzevši u obzir početno slovo
prezimena prvoga autora. Interpunkcija u popisu literature mora biti ujednačena. Po "Harwardskome" sustavu u tekstu rada navodi se prezime autora te godina u kojoj je rad objavljen,
na primjer: (Stearns 1992). Kada su dva autora, treba navesti oba, npr.: (Cerny i Herbert 1999), a ako
je više autora, navodi se prvi autor te dopisuje i suradnici (Boreri sur. 1989). Ako su imena autora dio
rečenice, u zagradu se piše samo godina npr. Gaines i Elbrächter (1987) su utvrdili da ...
PRIMJERI CITIRANJA
Rad u časopisu (odabrani način citiranja mora se sustavno koristiti kroz cijelo poglavlje):
BorerR.A., LehnerC.F., EppenbergerH.M., NiggE.A. (1989): Major nucleolar proteinsshuttle between
nucleus and cytoplasm. Cell56: 379-390. ili
BorerR.A., LehnerC.F., EppenbergerH.M., NiggE.A. 1989. Major nucleolar proteins shuttle between
nucleus and cytoplasm. Cell 56, 379-390. Cerny, M., Herbert, P.D.N. (1999): Intercontinental allozyme differentiation among four holartik
Daphnia species. Limnol. Oceanogr. 44: 1381-1387. Knjiga:
Stearns S.C. (1992): The evolution of life histories. Oxford University Press, Oxford. Poglavlje u knjizi:
Gaines G., Elbrächter M. (1987): Heterotrophic nutrition. U: Taylor, F.J.R. (ur.) The biology of the
dinoflagellates. Oxford, Blackwell Scientific Publications, str. 224-268.
Ukoliko su u radu uporabljene kratice, na posebnoj stranici treba navesti njihov popis i objašnjenje.
Takva stranica treba biti smještena prije Uvoda na početku rada.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 23
Prilog 1.
Sveučilište u Rijeci
Odjel za biotehnologiju
Ime i prezime, studij
Naslov rada
Seminarski rad
Rijeka, 20xx-. godina
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 24
Akademska čestitost
Podrazumjeva se da će nastavnik poštivati Etički kodeks Sveučilišta u Rijeci, a studenti Etički
kodeks za studente/studentice Sveučilišta u Rijeci.
Kontaktiranje s nastavnicima
Nastavnik je svakodnevno dostupan putem e-mail ([email protected]) za sva
pitanja koja se tiču nastave.
Informiranje o predmetu
Informiranje o predmetu studenti dobivaju putem sustava učenja na daljinu (e-learning) i
direktnom kontaktu s predmetnim nastavnikom.
Očekivane opće kompetencije pri upisu studenata/studentica pri upisu predmeta
Smatra se da se studenti koriste računalnim programima (Word, Excel). Također se smatra da
studenti razumiju i mogu se služiti u svom radu s barem jednim svjetskim jezikom
(engleski/njemački/talijanski/francuski/španjolski/ruski).
Težište je na engleskom i njemačkom jeziku zbog dostupne literature.
Obzirom na položeni razredbeni ispit, smatra se da studenti mogu pratiti nastavu
predmeta biokemija.
UPUTE STUDENTIMA
Studentima se na početku predavanja daje lozinka kolegija.
Kada se studenti budu "spojili" na sustav trebaju pronaći kolegij i kliknuti na njega.
Sustav će ih tražiti lozinku za upis na kolegij (lozinku koju je postavio nastavnik i koju su
studenti dobili na predavanju)
Nakon toga nastavnik će vidjeti popis studenata na kolegiju.
Ukoliko se studenti nisu nikada spajali na MudRi, njihovi podaci nisu zabilježeni u sustavu te
ih nije moguće vidjeti sve dok se ne prijave u sustav.
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 25
Prilog. Tjedni raspored BIOTEHNOLOGIJA I ISTRAŽIVANJE LIJEKOVA – 4. SEMESTAR
Tjedan 1. 02. - 06. veljače 2015.
Vrijeme Ponedjeljak
02.02.
Utorak
03.02.
Srijeda
04.02.
Četvrtak
05.02.
Petak
06.02.
Subota
07.02.
8 P1
(08,15-09,00)
P-O-30
P2, P3
(08,15-10,00)
P-O-30
P4, P5
(08,15-10,00)
P-O-30
P6-P7
(8,15-10,00)
P-O-30
P8, P9
(8,15-10,00)
P-O-30
9 S1 GI - GII
(09,15-13,00)
P-O-30
10 S1 GI - GII
(10,15-11,00)
P-O-30
S2 GI - GII
(10,15-14,00)
P-O-30
S2 GI - GII
(10,15-14,00)
P-O-30
11 S1 GIII
(13,15-15,00)
O-268
S1 GIII
(11,15-12,00)
O-268
S2 GIII
(12,15-14,00)
O-268
12 S2 GII
(12,15-14,00)
O-268
13
14
15
16
17
Tjedan 2. 09.- 13. veljače 2015.
Vrijeme Ponedjeljak
09.02.
Utorak
10.02.
Srijeda
11.02.
Četvrtak
12.02.
Petak
13.02.
Subota
14.02.
8 P10, P11, P12
(08:15-11:00)
P-O-30
P13
(08:15-09,00)
P-O-30
P14, P15
(8:15-10:00)
P-O-30
P16 – P17
(08:15-10:00)
P-O-30
9 S4 GI - GII
(09:15-13:00)
P-O-30
10 S4 GI - GII
(10:15-14:00)
P-O-30
P18 - P19
(10:15-12:00)
P-O-30
11 S4 GIII
(11:15-13:00)
O-268
S4 GIII - GIV
(10:15-12:00)
O-268
S5 GI - GII
(11:15 - 15:00)
P-O-30
12 S3 GI - GII
(12:15-14:00)
P-O-30 S3 GIII
(12:15-14:00)
P-O-268
S5 GI - GII
(12:15 - 16:00)
P-O-30 S5 GIII
(14:15 - 16:00)
O-268
13 S5 GIII
(13:15 - 16:00)
O-268
14
15
16
17
18
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 26
Tjedan 3. 16.- 20. veljače 2015.
Vrijeme Ponedjeljak
16.02.
Utorak
17.02.
Srijeda
18.02.
Četvrtak
19.02.
Petak
20.02.
Subota
21.02.
8 KOLOKVIJ - I
(8,15-09,30)
P-O-30
VE3
(08:15-17:00)
G I-III
O-264, O-265
P20
(08:15-09:00)
P-O-30
9 VE5 GI-III
(10:15-18:00)
O-264, O-265
P21
(09:15-11:00)
P-O-30
10 VE1-2
G I-III
O-264, O-265
(10:15-18:00)
VE4 GI-III
(10:15-18:00)
O-264, O-265
11
12
13
14
15
16
17
18
Tjedan 4. 23.-27. veljače 2015.
Vrijeme Ponedjeljak
23.02.
Utorak
24.02.
Srijeda
25.02.
Četvrtak
26.02.
Petak
27.02.
Subota
28.02.
8 S6 GI - GII
(08:15-12:00)
P-O-30
VE6
(08:15 – 17:00)
GI - III
O-264, O-265
KOLOKVIJ -
II
(08:30-10:00)
P-O-30
9
10 P22, P23
(10:15-12:00)
P-O-30
P24, P25
(10:15-12:00)
P-O-30
11
12 S6 GIII
(12:15-14:00)
P-O-30
S7 GI - GII
(11:15-16:00)
P-O-30
S7 GIII
(13:15-15:00)
P-O-268
S7 GI - GII
(12:15-16:00)
P-O-30 S7 GIII - GIV
(14:15-16:00)
P-O-268
13
14
15
16
17
18
Tjedan 5. 02.-06. ožujka 2015.
Tjedan 6. 09.-13. ožujka 2015.
Vrijeme Ponedjeljak Utorak Srijeda Četvrtak Petak Subota
Vrijeme Ponedjeljak
02.03.
Utorak
03.03.
Srijeda
04.03.
Četvrtak
05.03.
Petak
06.03.
Subota
07.03.
8 VE7
(10:15-18:00)
GI - III
O-264, O-265
VE8
(08:15-17:00)
GI - III
O-264, O-265
P28, P29
(08:15-10:00)
P-O-30
9 P26, P27,
(09:15-11:00)
P-O-30
10 P30, P31
(10:15-12:00)
P-O-30
S8 GI - GII
(10:30-14:00)
P-O-30 S8 GIII - GIV
(12:15-14:00)
O-268
11
12
13
14
15
16
17
Odjel za biotehnologiju Sveučilište u Rijeci
Detaljni izvedbeni nastavni program kolegija Biokemija Prof.dr.sc. Roberto Antolović, 2014/15. 27
09.03. 10.03 11.03. 12.03. 13.03. 14.03.
8 KOLOKVIJ -
III
(08:00 - 09:30
S11 GI
(09:15 - 11:00)
P-O-30
S11 G II
(11:15 - 13:00)
P-O-30
S11 GIII
(14:15 - 16:00)
P-O-30
9
10 VE9
(09:45 – 15:00)
GI - III
O-264, O-265
P32, P33
(10:15 – 12:00)
P-O-30
P34,
(10:15 –11:00)
P-O-30
11
12 S9 GI - GII
(12:15-14:00)
P-O-30
13 S10 GI - GII
(13:15 -15:00)
P-O-30 S10 GIII - GIV
(14:15 -15:00)
O-268
14 S9 GIII
(14:15-16:00)
O-268
15
16
17
18
Tjedan 7. 16. - 20. ožujka 2015.
Vrijeme Ponedjeljak
16. 03.
Utorak
17.03
Srijeda
18.03
Četvrtak
19.03.
Petak
20.03.
8
P35
(08:15-09:00)
P-O-30
VE10
(08:15 - 14:00)
GI-III
O-264, O-265
P37
(13:15-14:00)
P-O-30
S14 GI - GII
(08:15-12:00)
P-O-30
KOLOKVIJ - IV
(11:30 - 13:00)
P-O-30
9 P36
(09:15-10,00)
P-O-30
S13 GI - GII
(09:15-12:00)
P-O-30
10 S12 GI - GII
(10:15-12,00)
P-O-30
S14 GIII - GIV
(13:15-15:00)
P-O-30
11
12 S12 GIII
(12:15-14,00)
P-O-30
S13 GIII - GIV
(12:15-14:00)
P-O-30
13
14
15
16
17
18
Tjedan 8. 23. - 27. ožujka 2015.
24. ožujka 2015. UTORAK- popravak kolokvija I-IV od 09:00 do 1:00 P-O-30
26. ožujka 2015. ČETVRTAK - 1. Ispitni rok –USMENI ISPIT od 09:00 do 17:00 P-O-268
2.ispitni rok – USMENI ISPIT 24. TRANJA. 2015.
Legenda: P – predavanja
S – seminari
VE – eksperimentalne laboratorijske vježbe
Predavanja i seminari se održavaju u predavaonici Odjela biotehnologije na Kampusu u Rijeci (P-030)
.
Laboratorijske vježbe se održavaju u laboratorijima Odjela za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci. Prve vježbe
počinju u petak 07.02.2014. u 08:15 sati i održavati će se u 4 grupe, nastava iz vježbi nastavlja se u
mjesecu veljači i ožujku prema danom rasporedu nastave iz biokemije za akademsku godinu 2013/2014.