http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/

Kierownik:prof. dr hab. Adam Patkowskipatkowsk@amu.edu.pl

Web”master”dr Jacek Gapiński gapinski@amu.edu.pl

Zakład Biofizyki Molekularnej

Badanie aparatu fotosyntetycznego 2 prace magisterskie

dr Krzysztof Gibasiewicz (krzyszgi@amu.edu.pl)promotor: prof. Andrzej DobekZakład Biofizyki Molekularnej

Przedmiot badań

TEMAT 1: Modelowanie widm absorpcji i fluorescencji fotosyntetycznych kompleksów białkowo-barwnikowych

(Środowisko Lab-View)

PSI-200

T = 1.6 K

TEMAT 2: Badanie rozmiarów i dynamiki białek fotosyntetycznych w roztworach wodnych i błonach (spektroskopia korelacji fluorescencji, dynamiczne

rozpraszanie światła)

Fotosystem I

-Optyczny efekt Kerra w roztworach tRNA-Magnetooptyczne badania polisacharydów i białek

Metody nieliniowe w badaniach biomakromolekuł

2 prace magisterskie

promotor: prof. Andrzej Dobek

Badanie cytokinin

dr hab. Genowefa ŚlósarekZakład Biofizyki Molekularnej

Cytokininy

N N

NN

NH R hormony roślinne

w postaci nukleotydów

wbudowane w cząsteczki

tRNA

związki o znaczeniu

farmaceutycznym

Struktura krystaliczna kinetyny

kinetyna

Tematy prac magisterskich

Oddziaływanie cytokinin z metalami

krystalizacja cytokinin z metalami, głównie Cu2+; badanie własności fizycznych kryształów analiza dynamiki molekularnej cytokinin w obecności metali – EPR, NMR, spektroskopia oscylacyjna Dynamika molekularna w kryształach cytokinin i innych cząsteczek

krystalizacja cytokinin z innymi zasadami nukleinowymi oraz poliaminami; badanie wiązań wodorowych; analiza warunków krystalizacji analiza dynamiki molekularnej metodami spektroskopii oscylacyjnej poszukiwanie przemian fazowych;

Bioinformatyka

• Przewidywanie i analiza struktur białek metodami obliczeniowymi

• Metody obliczeniowe racjonalnego projektowania leków

http://bioinfo.phys.amu.edu.pl/Pokój 46, parter, przy sekretariacie Instytutu Fizyki

dr Leszek Rychlewski (leszek@bioinfo.pl )dr Ewa Banachowicz (ewas@amu.edu.pl )Zakład Biofizyki Molekularnej

Więcej informacji o projektach Bioinformatycznych

można uzyskać na stronach:

http://bioinfo.phys.amu.edu.pl/

http://bioinfo.pl/

Kontakt: dr Leszek Rychlewskileszek@bioinfo.pl

Struktura i dynamika polimerów/biopolimerów/koloidów w

roztworach

prof. dr hab. Adam Patkowski Zakład Biofizyki Molekularnej

Spektroskopia korelacji fluorescencji,Dynamiczne rozpraszanie światła

FCS mierzy czas dyfuzji sondy przez ognisko mikroskopu konfokalnego –Zalety:Oświetlona objętość: ~0.15 fl (femtolitr),Objętość próbki: >20 l (parowanie),Stężenie próbki: ~10 nM,Wysoka selektywność (sonda fluorescencyjna).

Zakład Biofizyki Molekularnej

http://bio5.fizyka.amu.edu.pl

struktura i dynamika polimerów/biopolimerów/koloidów w roztworach

Prof. dr hab. Adam Patkowski

Określenie wpływu struktury ośrodka na dyfuzję

1. Dyfuzja własna i kolektywna w złożonych mieszaninach koloidów i biopolimerów – wpływ oddziaływań elektrostatycznych (spektroskopia korelacji fluorescencji i dynamiczne rozpraszanie światła).

(Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr A. Wilk, drJ.Gapiński)

2. Struktura i dynamika koloidów w roztworze – oddziaływania elektrostatyczne i hydrodynamiczne (dynamiczne rozpraszanie światła).

(Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński

W tym zakresie mamy rozwiniętą współpracę krajową (ICHF PAN prof. R. Hołyst) międzynarodową (USA, Niemcy, Francja), obecnie również w ramach VI Programu Europejskiego.

Zakład Biofizyki Molekularnej

Pomiar mikroskopowej lepkości cieczy (pod wysokim ciśnieniem) przy pomocy dynamicznego rozpraszania światła i spektroskopii korelacji fluorescencji (Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński)

Badania rozmiarów, kształtu i dynamiki miceli: (spektroskopia korelacji fluorescencji i dynamiczne rozpraszanie światła). (Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński).

Zakład Biofizyki Molekularnej

http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/

Kierownik:prof. dr hab. Adam Patkowskipatkowsk@amu.edu.pl

Web”master”dr Jacek Gapiński gapinski@amu.edu.pl