Beispiel 7:

DNA/RNA Strukturen

Die Doppelhelix als spezialisierter Legobaustein

nm-Abmessungen, Sequenzspezifität,Persistenzlänge ~50nm

regelmäßige Strukturen: DNAFeldkamp & Niemeyer, Angew. Chem. Int. Ed. 45: 1856 (2006)

SchleifeninduzierenBiegung

regelmäßige Strukturen: RNAChworos et al., Science 306: 2068 (2004)

RNA-Doppelhairpin-Quadrant als Puzzleteil

Verschmelzen durch langsames Abkühlen

30°C, 30min 50°C 4°C, 16h

3-dimensionale Strukturen

Goodman et al., Science 310: 1661 (2005)Shih et al., Nature 427: 618 (2004)

Aldaye & Sleiman, JACS 129: 13376 (2007)

beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami

7 kb lange virale Einzelstrang DNA + viele kurze (30 b) Helferstränge eindeutige Struktur

Rothemund, Nature 440: 297 (2006)

beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami

- hohe Flexibilität- hohe Ausbeute- kurze Abkühlzeit (75min)

Rothemund, Nature 440: 297 (2006)

beliebige Strukturen in 2D: DNA-Origami

Funktionalisierungenan Helfersträngen

Rothemund, Nature 440: 297 (2006)

zur RNA Detektion Probe

Ke et al., Science 319: 180 (2008)

zur Positionierung von - Quantendots- Goldpartikeln- Proteinen

weiterführende Infos

Synthetische Biologie Übersichtsartikel- Brenner & Sismour, Nat. Rev. Gen. 6: 533 (2005) - Drubin et al., Genes Dev. 21: 242 (2007)

Internationales SB Meetinghttp://www.syntheticbiology3.ethz.ch/index.htm

Wettbewerb iGEM 2006http://www.igem2006.com/

Ribosome EngineeringPeter Schultz Lab, http://schultz.scripps.edu/

Logische Biochemische NetzwerkeFritz Simmel Lab, TUMDieter Braun Lab, LMU

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