Upload
others
View
2
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
OBSAH 1. ÚVOD.................................................................................................................................... 5 2. SEPARAČNÍ TECHNIKY BIOMAKROMOLEKUL .................................................... 8 2.1 FÁZOVÉ SEPARACE................................................................................................................ 8
2.1.1 Klasické separační techniky .......................................................................................... 8 2.1.2 Extrakce do dvoufázových vodných systémů ............................................................. 15
2.2 MEMBRÁNOVÉ PROCESY ..................................................................................................... 21 2.3 CHROMATOGRAFICKÉ METODY ........................................................................................... 37
2.3.1 Teorie chromatografie ................................................................................................. 39 2.3.2 Plynová chromatografie............................................................................................... 47 2.3.3 Kapalinová chromatografie ......................................................................................... 49 2.3.4 Vysokoúčinná kapalinová kolonová chromatografie .................................................. 56 2.3.5 Instrumentace sloupcových chromatografických metod ............................................. 57 2.3.6 Detekce separovaných látek ........................................................................................ 63 2.3.7 Aplikace HPLC............................................................................................................ 66 2.3.8 Iontová chromatografie ............................................................................................... 67 2.3.9 Gelová permeační chromatografie............................................................................... 70 2.3.10 Chromatografie na měničích iontů ............................................................................ 83 2.3.11 Chromatofokusace ..................................................................................................... 95 2.3.12 Chromatografie s reversní fází .................................................................................. 99
2.4 METODY ZALOŽENÉ NA MOLEKULOVÉM ROZPOZNÁVÁNÍ.................................................. 102 2.4.1 Bioafinitní chromatografie ........................................................................................ 103 2.4.2 Nespecifická afinitní chromatografie ........................................................................ 118 2.4.3 Další separační techniky založené na molekulovém rozpoznávání .......................... 133
2.5 ELEKTROMIGRAČNÍ (ELEKTROFORETICKÉ) METODY ......................................................... 139 2.5.1 Volná elektroforéza ................................................................................................... 140 2.5.2 Zonová elektroforéza................................................................................................. 141 2.5.3 Izoelektrická fokusace (IEF) ..................................................................................... 150 2.5.4 Afinitní elektroforéza ................................................................................................ 152 2.5.5 Dvojrozměrná elektroforéza ...................................................................................... 153 2.5.6 Izolace separovaných látek z gelové matrice ............................................................ 154 2.5.7 Vizualizace separovaných látek ................................................................................ 156 2.5.8 Imunoelektroforéza.................................................................................................... 159 2.5.9 Kapilární elektroforéza.............................................................................................. 161 2.5.10 Způsoby provedení kapilární elektroforézy............................................................. 166 2.5.11 Aplikace elektroforézy v biochemii, biotechnologii a dalších oblastech................ 173 2.5.12 Analytické aplikace elektroforetických metod........................................................ 175
3. IZOLACE BIOMAKROMOLEKUL ............................................................................ 179 3.1 ÚVOD ................................................................................................................................ 179 3.2 ZÁKLADNÍ IZOLAČNÍ KROKY ............................................................................................. 180 3.3 HOMOGENIZACE A SOLUBILIZACE MATERIÁLU.................................................................. 181 3.4 SEPARACE BUNĚK Z KULTIVAČNÍHO MEDIA....................................................................... 181 3.5 DEZINTEGRACE BUNĚK ..................................................................................................... 182
3.5.1 Fyzikální způsoby dezintegrace ................................................................................ 183 3.5.2 Chemické způsoby dezintegrace ............................................................................... 186 3.5.3 Enzymové způsoby dezintegrace .............................................................................. 188
3.6 KONCENTRACE A OBOHACOVÁNÍ ROZTOKŮ ...................................................................... 189 3.7 ZAJIŠTĚNÍ STERILITY SUROVÝCH PREPARÁTŮ.................................................................... 191
3
3.8 PURIFIKACE BIOMAKROMOLEKUL ..................................................................................... 191 3.8.1 Strategie a taktika purifikace ..................................................................................... 192 3.8.2 Odsolování................................................................................................................. 196 3.8.3 Požadavky na čistotu preparátů ................................................................................. 198 3.8.4 Hodnocení účinnosti purifikace................................................................................. 199
3.9 KONCENTRACE IZOLOVANÝCH PREPARÁTŮ A JEJICH KONEČNÁ ÚPRAVA........................... 200 3.10 KRITERIA ČISTOTY PREPARÁTŮ ....................................................................................... 201
4
1. ÚVOD
Izolace chemických individuí ze směsi látek různého původu je jedním ze základních
úkolů chemie. V přírodě, ale i po syntézách a chemických reakcích, se látky většinou
vyskytují ve směsích. Pro studium vlastností je však třeba získat látky v čisté formě. Proto se
chemik a biochemik velmi často setkává s nutností vyizolovat čistou látku ze složité směsi
ev. rozdělit směs na jednotlivé složky. K tomu slouží různé separační techniky a izolační
metody.
Některé separační metody jsou známy již velmi dlouho. Je to např. sedimentace,
čeření, extrakce, filtrace a krystalizace. Tyto klasické metody však zřídka postačí k dělení
složitých směsí, v nichž se často vyskytují látky velmi podobných vlastností. Byly proto
hledány nové směry v rozvíjení separačních metod, které se zaměřily zejména na
- různé adsorpční vlastnosti produktů
- nestejnou rozpustnost složek směsi ve dvou vzájemně nemísitelných kapalinách
- rozdíly v rozpustnosti plynů v kapalině
- rozdílnou iontovou pohyblivost
- rozdílný elektrický náboj
Vývoj biochemických separačních technik v posledních patnácti až dvaceti letech byl
velmi rychlý. Nejvýraznější krok vpřed byl zaznamenán využitím přirozené biologické
aktivity mezi biomakromolekulami a jejich komplementárními ligandy, jako jsou substráty,
imuno-ligandy, hormony, nukleové kyseliny apod.
Vysoce selektivní separační techniky umožnily nejen dosáhnout rychlejší a
jednodušší purifikace, ale i zvolit takovou separační metodu, aby bylo dosaženo i dalších
cílů. K takovým cílům může patřit snížení nákladnosti dělení, zvýšení výtěžnosti, snížená
tvorba artefaktů jako jsou oligomery, agregáty s jinými bílkovinami a bílkoviny, které
pozbyly terciární struktury. Jiný takový cíl může být získání látky dostatečně koncentrované
a v roztoku takového složení, aby se dalo použít mrazové sublimace.
Techniky separace makromolekul biologického původu se velmi liší od technik dělení
nízkomolekulárních látek. Důvodů je několik:
*Makromolekuly mají malou schopnost difuze, neodpařují se, ani snadno nekrystalují. Jejich
dělení je proto obtížnější než dělení nízkomolekulárních látek.
5
*Použití adsorpčních materiálů pro jejich rozdělení je méně účinné, protože mají na svém
povrchu mnoho vazebných míst. Jsou tedy obvykle adsorbovány velmi pevně a nepříliš
specificky. Adsorpce bývá velmi často ireverzibilní, kromě velmi slabých adsorbentů.
*Rozdělování mezi dvě fáze, vzhledem ke značné velikosti molekul a následkem toho k
velkému počtu exponovaných skupin, bývá značně jednostranné, pokud obě fáze nemají
velmi podobné fyzikálně-chemické vlastnosti.
*U makromolekulárních látek s biologickou aktivitou je třeba počítat s jejich nestálostí, proto
jsou předem vyloučeny metody, při nichž jsou látky vystaveny vysokým teplotám,
organickým rozpouštědlům nebo silně lipofilním a silně adsorbujícím materiálům, které by
mohly porušit terciární nebo kvarterní strukturu biomakromolekul.
Metody, používané pro separaci biomakromolekul, můžeme rozdělit do dvou
základních skupin. Jsou to:
a) klasické metody, které většinou závisejí na fázové separaci
b) moderní metody, ve většině případů využívající rozdílných rychlostí migrace látek v
prostředí
Intenzivní výzkum v oblasti přírodních látek, zejména v biochemických aplikacích,
vyžaduje nejen dokonalou separaci, ale i identifikaci a stanovení jednotlivých optických
izomerů. Ukazuje se totiž, že biologická aktivita, toxicita nebo např. terapeutické účinky
jednotlivých optických izomerů se značně liší a jejich aplikace je proto závislá na možnosti
jejich separace.
V současné době máme k dispozici řadu účinných metod, které značně usnadňují
přístup k purifikaci biomakromolekul. To ovšem neznamená, že metody, které můžeme
označit jako klasické, jsou zastaralé a málo používané. Řada těchto metod je dosud velice
často používaná, a to buď v kombinaci s moderními metodami, nebo jako levné a účinné
metody při provozních izolacích, resp. při přípravě technických preparátů.
Vlastní separační techniky ovšem nejsou jedinými metodami, se kterými se setkáme
při izolaci biologicky aktivních látek z přírodního materiálu. Většina biomakromolekul jsou
intracelulární látky, které je při izolaci nutno uvolnit z buňky. V tom případě je nezbytné
zvětšit propustnost buněčné stěny, nebo membránu zcela rozbít, vyextrahovat buněčný obsah
a oddělit extrakt od buněčných zbytků. Pokud jsou biomolekuly produkovány buňkami do
mezibuněčných prostor, ev. v případě mikrobiálních buněk do kultivačního media,
dezintegrace buněčné membrány sice odpadá, ale izolované látky zase je potřeba
6
zkoncentrovat. Po provedené separaci a purifikaci je obvykle nutno získaný preparát převést
do vhodné formy a charakterizovat ho.
Izolační a separační techniky se velice rychle vyvíjejí, objevují se stále nové účinnější
metody, nebo metody, které při separaci využívají zcela nových principů. Proto předkládané
skriptum nemůže zahrnovat všechny historické i dosud používané metody a zaměřuje se
pouze na ty, které se v současné době používají nejčastěji. Ani ty však nemohou být probrány
do všech podrobností. Doporučujeme všem, kteří se v budoucnu budou izolacemi zabývat,
aby pro každou techniku vyhledali příslušnou literaturu. Mohou se setkat i s metodami, které
v současné době ještě nejsou známy nebo nejsou dostatečně prostudovány. Toto skriptum
slouží jako jakýsi úvod do separačních a izolačních technik a má být i určitým strategickým
návodem, jak k izolacím přistupovat.
7
2. SEPARAČNÍ TECHNIKY BIOMAKROMOLEKUL
2.1 Fázové separace
2.1.1 Klasické separační techniky
Klasické separační techniky jsou metody, které již po dlouhou dobu účinně pomáhají
při dělení směsí biomakromolekul, zejména bílkovinných směsí a nukleových kyselin, a svůj
význam mají dodnes. Při provozních purifikacích a při přípravě technických preparátů
enzymů a bílkovin obecně se často používají jako jediné izolační metody. Při přípravě vysoce
purifikovaných preparátů se obvykle uplatní v počátcích purifikace.
Směsi biomakromolekul jsou vždy separovány postupně. V jednotlivých krocích se
využívá různých fyzikálně-chemických vlastností separovaných molekul s cílem odstranit v
průběhu izolace vybrané biomakromolekuly co nejvíce kontaminujících sloučenin, aby byla
izolovaná látka získána v co nejčistším stavu.
Charakteristickými vlastnostmi, které se využívají při izolaci biologicky aktivních
látek, jsou rozpustnost, disociace, molekulová hmotnost, adsorpční vlastnosti a vazebná
afinita k jiným biomolekulám.
Frakcionace biomakromolekul na základě rozdílů v rozpustnosti
Známe čtyři hlavní faktory, které ovlivňují rozpustnost proteinů, ale i dalších
biomolekul, a které proto mohou být použity pro frakcionaci. Je to obsah solí, obsah
organických rozpouštědel, vliv pH a vliv teploty. Závislost rozpustnosti bílkovin na těchto
faktorech je způsobena přítomností četných acidobazických skupin v molekule proteinu.
Obsah solí. Rozpustnost všech bílkovin, ale i dalších biomolekul ve vodných
roztocích je závislá na koncentraci rozpuštěných solí, která se vyjadřuje jako iontová síla I:
I = 0,5Σ ci zi2 (1)
8
ci = látková koncentrace iontu i zi = náboj iontu i
Při nízkých koncentracích elektrolytu se zvyšováním koncentrace solí roste i rozpustnost
bílkoviny až do určitého maxima. Po jeho překročení s rostoucí koncentrací solí rozpustnost
bílkoviny klesá. Vzestup rozpustnosti bílkoviny při zvyšování koncentrace soli v oblasti
nízkých koncentrací se nazývá vsolování. Různé bílkoviny se navzájem liší odezvou na
přídavek soli. Vsolování se velice často používá pro frakcionaci globulinů, které jsou ve vodě
prakticky nerozpustné a mohou tudíž být frakcionovaně rozpuštěny zvyšováním iontové síly
roztoku.
Snižování rozpustnosti většiny bílkovin při vysoké koncentraci solí v roztoku se
běžně používá pro tzv. vysolování. Hlavní efekt při vysolování má anion přidané soli,
přičemž bylo zjištěno, že polyvalentní anionty (fosforečnany, sírany) prokazují vyšší
vysolovací účinek než monovalentní anionty (např. chloridy) (obr.2.1). Frakcionace síranem
amonným je jednou z nejběžněji užívaných procedur v prvních fázích izolace, zejména
pracujeme-li s velkými objemy. Sůl se přidává buď jako nasycený roztok nebo jako pevná
látka. Přídavek soli v pevné fázi je výhodnější, neboť nedochází k výrazným objemovým
změnám. Frakcionace se pak provádí za účinného míchání a přednostně v chlazených
prostorách. Precipitovaná bílkovina se odstraňuje vždy při dosažení určitého stupně
koncentrace dané soli, přičemž je zvykem vyjadřovat koncentraci soli jako procenta
nasycení. Precipitované bílkovinné frakce jsou pak znovu rozpuštěny a musí být obvykle pro
další purifikační procesy zbaveny solí (dialýza, ultrafiltrace apod.). V jednotlivých frakcích
se pak zjišťuje přítomnost požadované bílkoviny či aktivita žádaného enzymu a frakce, které
tuto aktivitu či bílkovinu obsahují, se spojí.
Při experimentálním vsolování i vysolování je třeba věnovat péči tomu, aby sůl byla
přidávána zvolna, neboť lokální nadměrné zvýšení koncentrace soli by mohlo vyvolat
nežádoucí nevratnou precipitaci. Dále je třeba ponechat dostatek času k tomu, aby došlo k
úplné precipitaci. Obvykle postačuje 20 - 30 min. za míchání, lepší však je ponechat
precipitaci vyvíjet přes noc při teplotě 4 oC.
Vysolování jistě nelze považovat za metodu, při níž by došlo k ostrému rozdělení
separovaných biomolekul, nicméně je vhodná, jak již bylo řečeno, při práci s velkými objemy
roztoků a její výhodou je, že většinou nemá nepříznivý vliv na biologickou aktivitu
izolovaných biomolekul.
9
Přítomnost organických rozpouštědel. Proteiny i nukleové kyseliny mohou být
separovány frakcionací s nepolárními vodou mísitelnými rozpouštědly jako je methanol,
propanol a ethanol, používá se však i aceton a diethylether. Principem frakcionace je to, že
změny dielektrické konstanty, způsobené organickým rozpouštědlem, mají různý efekt na
rozpustnost různých biomakromolekul. Vzhledem k tomu, že bílkoviny mají v přítomnosti
organických rozpouštědel tendenci denaturovat, je třeba omezit možnost denaturace na
minimum prací při teplotách pod nulou (-5 oC). To je možné, protože přítomnost organického
rozpouštědla snižuje bod tuhnutí roztoků. Při izolaci nukleových kyselin je nebezpečí
denaturace organickými rozpouštědly minimální.
Při precipitaci bílkovin organickými rozpouštědly je třeba počítat i s tím, že
přítomnost solí ve vodném roztoku organického rozpouštědla zvyšuje rozpustnost bílkovin.
Precipitace bílkovin a nukleových kyselin organickými rozpouštědly se obvykle
provádí v rozmezí koncentrace rozpouštědla 0 - 80 %, po oddělení precipitátu je však nutno
odstranit zbytky rozpouštědla, a to buď vakuovým sušením nebo dialýzou. Protože při mísení
organického rozpouštědla s vodou není konečný objem aditivní, je třeba po odstranění
precipitátu vždy změřit objem zbývající frakce.
Obr.2.1 Rozpustnost hemoglobinu v roztocích různých solí při proměnné iontové síle. Vzestupná část křivek odpovídá oblasti vsolování, sestupná vysolování
Metoda frakcionace s organickými rozpouštědly byla úspěšně použita např. při
frakcionaci enzymů ze svalů, při izolaci α-amylasy ze slin a při frakcionaci bílkovin krevního
sera.
10
Vliv pH. Rozpustnost bílkovin značně závisí na pH media; nejnižší je v
izoelektrickém bodě. V některých případech dojde v izoelektrickém bodě ke spontánní
precipitaci bílkoviny (např. kasein), častěji však je nutné po úpravě pH do izoelektrického
bodu změnit ještě další faktor, např. koncentraci solí, teplotu, přidat organické rozpouštědlo
apod., aby došlo k selektivnímu srážení bílkoviny. Malá změna pH může často
mnohonásobně změnit poměr rozpustnosti přítomných bílkovin např. při vysolování (viz
obr.2.2).
Je třeba počítat i s tím, že některé bílkoviny jsou v izoelektrickém bodě nevratně
denaturovány. Toho je možno využít při odstraňování nežádoucích bílkovin.
Skutečnost, že bílkoviny se liší navzájem svými izoelektrickými body, se využívá při
tzv. izoelektrickém srážení. Při něm se pH roztoku upraví na hodnotu izoelektrického bodu té
bílkoviny, kterou chceme z roztoku izolovat. Její rozpustnost se tím podstatně sníží a její
precipitace pak už není nesnadná. Postupnou úpravou pH se mohou z roztoku postupně
vyloučit bílkoviny podle svých izoelektrických bodů.
Vliv teploty. Jako pro většinu látek i pro biomakromolekuly platí, že jejich
rozpustnost závisí na teplotě. Je proto třeba počítat s tím, že pro zajištění reprodukovatelnosti
frakcionace je třeba dodržovat určitý teplotní režim.
Metody frakcionace založené na rozdílné stabilitě biomakromolekul
Při frakcionaci biomakromolekul se dá využít i jejich rozdílné stability v určitém
prostředí. Nejvýznamnějšími faktory, které ovlivňují stabilitu jsou teplota, pH a přítomnost
iontů.
Bílkoviny se navzájem značně liší tepelnou stabilitou. Zatímco některé bílkoviny
denaturují již při teplotách okolo 25 oC, jiné snesou i var, aniž by došlo k jejich inaktivaci.
Při purifikaci tepelně stabilní bílkoviny může být této vlastnosti využito k tepelné denaturaci
kontaminujících proteinů. Nejčastěji se tepelná denaturace provádí v rozmezí 50-80 oC,
někdy i za vyšších teplot. Vždy se však doporučuje pracovat za přítomnosti stabilizátoru
izolované bílkoviny. Koagulované kontaminující bílkoviny je nutné co nejdříve odstranit,
neboť je nebezpečí - i když málo pravděpodobné - jejich renaturace. Příkladem využití
11
denaturace pro odstranění kontaminantů může být purifikace α-amylasy z rostlinných a
mikrobiálních zdrojů, kdy při teplotě 70 - 75 oC za přítomnosti Ca2+ jsou inaktivovány β-
amylasa a proteasy, zatímco aktivita α-amylasy zůstane nedotčena. Obdobně
alkoholdehydrogenasu z kvasinek je možno částečně purifikovat zahřátím na 55 oC,
mikrobiální glukosaisomerasu zahřátím na 60 oC a ribonukleasa dokonce snese bez
inaktivace teplotu 90 oC.
Obr.2.2 Rozpustnost β-laktglobulinu jako funkce pH při různých koncentracích NaCl
Je třeba si uvědomit, že při tepelné denaturaci kontaminujících biomakromolekul
nelze laboratorně získané výsledky převádět beze zbytku do většího měřítka. Jestliže budeme
ve vodní lázni např. 70 oC teplé zahřívat 5 ml vzorku, požadované teploty bude dosaženo
12
rychle; 2 l vzorku se budou zahřívat pomaleji a požadované teploty nemusí být dosaženo ani
při skončení zahřívání.
Druhým typem diferencované inaktivace bílkovin je využití extrémního pH.
Základním předpokladem i v tomto případě zůstává odolnost požadované bílkoviny vůči
použitému pH, takže opět dojde k vysrážení méně stabilních kontaminujících
biomakromolekul. Ani v těchto případech nelze vyloučit renaturaci.
Jako příklad lze i zde uvést izolaci ribonukleasy, kterou je možno extrahovat z
pankreatu kyselinou sírovou v koncentraci 0,1 mol/l, aniž dojde k její inaktivaci.
Při izolaci bílkovin nebo nukleových kyselin z přírodního materiálu se velice často
setkáme s nutností odstranit nežádoucí bílkoviny z roztoku nukleových kyselin nebo naopak
nežádoucí nukleové kyseliny z roztoku bílkovin. I při tom se využívá rozdílné stability
jednotlivých biomakromolekul. Nukleové kyseliny se obvykle odstraňují z roztoku bílkovin
vysrážením s kationaktivními detergenty. V posledních letech se též nukleové kyseliny
odstraňují působením nukleas, což je metoda levná, efektivní a nenese sebou nebezpečí
koprecipitace přítomných bílkovin. Bílkoviny se z roztoku nukleových kyselin odstraňují
srážením fenolem nebo směsí trichlormethanu a isopentylalkoholu, dále srážením s
guanidiniumchloridem nebo vysokou koncentrací solí. Bílkoviny je též možno rozložit
peptidhydrolasami.
Purifikace biomakromolekul interakcí se specifickými srážedly
Metody, které využívají interakce iontů těžkých kovů se specifickými skupinami
bílkovinné molekuly, se používají v chemii bílkovin již dlouhou dobu. Např. je známo, že
rtuťnaté ionty reagují specificky s merkapto skupinami, zinečnaté s imidazolem. Ionty železa,
vápníku a barya jsou příkladem dalších ke srážení běžně používaných iontů kovů. Výsledkem
interakcí proteinu s iontem kovu je změna v rozpustnosti bílkoviny a tu je pak možno využít
při frakcionaci bílkoviny, zejména ve spojení s dalšími faktory jako je iontová síla, pH,
organické rozpouštědlo.
Tyto metody mají naději na úspěch zejména tehdy, pracuje-li se při pH vyšším než je
izoelektrický bod požadované bílkoviny. Přesto je třeba pamatovat na to, že ionty těžkých
kovů jsou enzymovými inhibitory, a je tedy nutno se vyvarovat práce s přebytkem těchto
iontů v roztoku a po oddělení bílkoviny je co nejdříve odstranit.
13
Při frakcionaci bílkovin se používají i další srážecí činidla, např. trichloroctová
kyselina a sulfosalicylová kyselina. Ty reagují pouze s proteiny, které jsou ve formě kationtu
(tj. při pH nižším než je izoelektrický bod). Některé konjugované proteiny, zejména
glykoproteiny, se srážejí těmito činidly velice obtížně, čehož se dá při frakcionaci vhodně
využít.
Z dalších specifických srážedel jmenujme alespoň kyselinu tannovou, která se užívá
při purifikaci glukosaoxidasy, dále nukleové kyseliny, které mohou tvořit nerozpustné
komplexy zejména s bazickými proteiny a řada dalších.
Precipitace bílkovin vysokomolekulárními polymery
K frakcionaci bílkovin lze použít i vysokomolekulární ve vodě rozpustné polymery.
Nejčastěji se používá polyethylenglykol o vyšší molekulové hmotnosti. Je netoxický,
nehořlavý a nezpůsobuje denaturaci bílkovin, což ho předurčuje i k širokému průmyslovému
využití.
Precipitace nukleových kyselin kationaktivními sloučeninami
Nukleové kyseliny mohou být frakcionovány ev. odstraněny ze směsi bílkovin
srážením s různými kationaktivními sloučeninami, jako je cetyltrimethylamoniumbromid,
síran streptomycinu, síran protaminu, polyethylenimin, polylysin nebo chlorid manganatý.
Purifikace biomakromolekul pomocí adsorbentů
Jednou z metod purifikace biomakromolekul je jejich adsorpce na povrch pevných
látek, tj. diferencovaná schopnost biomakromolekul vázat se různě pevnými vazbami na
povrch adsorbentu (tzv. afinita molekuly k adsorbentu). Nejčastěji používanými adsorbenty
jsou oxid hlinitý (gel), fosforečnan vápenatý (gel), silikagel, aktivní uhlí apod.
Adsorpční metoda se používala vsádkově již dávno před zavedením kolonových
metod. Vsádková metoda má ovšem vedle výhod (jednoduchost provedení) i své nevýhody.
14
Hlavní nevýhodou je malá specifita většiny molekul k adsorbentu. Je proto třeba při izolaci
určité biomolekuly přidat pouze takové množství adsorbentu, aby se navázala pouze
biomolekula s největší afinitou (což by měla být požadovaná biomolekula) a ostatní látky
zůstaly v roztoku. Naopak, má-li žádaná biomolekula nízkou afinitu k adsorbentu, přidá se
adsorbentu takové množství, aby se adsorbovaly všechny sloučeniny až na požadovanou,
která tudíž zůstane v roztoku.
Mezi chováním biomakromolekul k jednotlivým adsorbentům jsou výrazné rozdíly a
dosud se nepodařilo stanovit zásady, podle nichž se chování biomakromolekul vůči
adsorbentu řídí. Výběr vhodného adsorbentu je proto vždy záležitostí empirickou.
Afinita biomakromolekul k adsorbentu je ovlivňována různými faktory z prostředí,
jako je pH, iontová síla a teplota. Obvykle není jednoduché předpovědět, v jakém směru se
změna některého faktoru projeví. Např. zvýšení iontové síly v některých případech zvyšuje, v
jiných snižuje schopnost biomakromolekuly vázat se na adsorbent. Eluce biomakromolekul z
adsorbentu se nejčastěji uskutečňuje změnou pH nebo iontové síly, ev. specifickými
adsorpčními činidly.
Výraznou změnu v adsorpční technice znamenalo zavedení adsorpční chromatografie.
Pro tuto techniku se nehodily dříve používané adsorpční materiály, které mají ve většině
případu špatné průtokové vlastnosti a bylo proto nutno zavést jiné adsorpční materiály
(Al2O3, bauxit apod.). Princip adsorpční chromatografie je velmi jednoduchý: směs látek se
aplikuje na vrchol kolony adsorbentu a jednotlivé látky jsou postupně vymývány elučními
činidly podle jejich afinity k adsorbentu. Tato technika tvoří jakýsi spojovací článek mezi
klasickými a moderními purifikačními metodami.
Afinitní precipitace
Afinitní precipitace, t.j. případ, kdy k dokonalé precipitaci biomakromolekul určitého
typu přispívá vazba biomakromolekuly na afinitní ligand, bude popsána v kap.2.4.3.
2.1.2 Extrakce do dvoufázových vodných systémů
Extrakce organickými rozpouštědly je dlouho známá a dobře propracovaná technika
izolace molekul, hojně používaná v chemickém a farmaceutickém průmyslu. Většina
15
biomakromolekul je však v běžně používaných organických rozpouštědlech nerozpustná a
často velice nestabilní, proto je nelze těmito činidly extrahovat. Dvoufázové systémy, které
by bylo možno využít pro extrakci biomakromolekul, je však možno připravit i přídavkem
dvou hydrofilních polymerů do vodného roztoku, nebo přídavkem jednoho polymeru do
vodného roztoku vhodné soli. Při zachování vhodných koncentrací se vytvoří dvě nemísitelné
fáze, v nichž voda bude podstatnou složkou, takže vzniklé prostředí bude příznivé pro
biologicky aktivní makromolekuly nebo i buněčné organely.
Nejčastěji používaným hydrofilním polymerem je polyethylenglykol o různé
molekulové hmotnosti (asi od 1400 po 6000), druhým polymerem bývá dextran. Pokud druhý
polymer nahradí soli, jsou to obvykle sodné nebo draselné fosforečnany, a to
dihydrogenfosforečnan, hydrogenfosforečnan i fosforečnan.
Fyzikálně-chemické vlastnosti vodných dvoufázových systémů vyjadřují fázové
diagramy (viz obr.2.3). Jestliže se koncentrace jedné nebo obou složek přítomných ve
vodném rozpouštědle budou pohybovat pod hranicí danou binodalou, vznikne homogenní
roztok. Jestliže však koncentrace obou složek překročí tuto mezní hodnotu (danou
binodálou), vytvoří se spontánně dvoufázový systém. Složení horní fáze bohaté
polyethylenglykolem (bod T na diagramu) koresponduje se spodní fází určitého složení.
Obr.2.3 Fázový diagram systému polyethylengkykol - K2HPO4 při pH 7 a 20 oC Rovnovážná koncentrace polyethylenglykolu (PEG) a soli ve spodní fázi je dána bodem B
diagramu. Každá dvojice komponent dvoufázového systému, která leží na spojnici T a B, dá
identický fázový systém, který se bude lišit pouze poměrem objemů horní a dolní fáze.
Jestliže se pro vytvoření dvoufázového systému použije PEG o vyšší molekulové hmotnosti,
binodala se posune směrem k počátku. Obdobný efekt bude mít i zvýšení teploty.
16
Příklad: 10% PEG o molekulové hmotnosti 4000, 13% KH2PO4 (pH7,7) a 77% vody vytvoří spontánně dvoufázový systém, jehož horní fáze obsahuje 24% PEG, 6% KH2PO4 a 70% vody, dolní fáze 17% KH2PO4, 1,3% PEG a 81% vody. Poměr objemu horní a dolní fáze je 0,8.
Rozdělovací koeficient K udává váhový poměr extrahovaného biopolymeru v horní a
dolní fázi.
K = ch / cd (2)
ch = koncentrace biopolymeru v horní fázi cd = koncentrace biopolymeru v dolní fázi
Separace ve dvoufázovém systému je funkcí rozdělovacího koeficientu, ale též
poměru objemů obou fází. Tuto skutečnost vyjadřuje tzv. separační faktor G.
G = K (Vh /Vd ) (3)
V = objem horní a dolní fáze
Hodnota rozdělovacího koeficientu je výsledkem nejrůznějších nevazebných interakcí
separovaných molekul s prostředím. Proto je možné jeho hodnotu do jisté míry ovlivňovat.
Protože se při rozdělování mezi dvě fáze uplatní zejména hydrofobní interakce a vodíkové
nebo iontové vazby, je hodnota rozdělovacího koeficientu silně závislá především na
hydrofilicitě a na náboji separovaných systémů. Proto ho nejvíce ovlivní faktory, které
rozhodují o těchto vlastnostech. Jsou to především:
- typ použitého polymeru
- molekulová hmotnost a distribuce polymeru
- vzdálenost bodů T a B na fázovém diagramu, neboli koncentrace jednotlivých komponent
dvoufázového systému
- typ použité soli
- pH
- teplota
17
Prvé dva uvedené faktory ovlivňují hydrofilicitu systému, ostatní náboj a elektrostatický
potenciál.
Z výše uvedeného plyne, že látky, které obsahují jak polární tak nepolární skupiny,
např. proteiny, se mohou podle podmínek extrahovat jak do horní PEG fáze, tak do výrazně
hydrofilní dolní fáze, zatímco hydrofilní sloučeniny, např. nukleové kyseliny, přecházejí
častěji do fáze dolní.
Vhodné podmínky pro tvorbu příznivého rozdělovacího koeficientu pro každou
separovanou sloučeninu se musí nalézt experimentálně. Obvykle se postupuje tak, že z výše
uvedených faktorů se mění relativní molekulová hmotnost polymeru, typ soli, pH a
koncentrace jednotlivých složek směsi. Pro hledání vhodných experimentálních podmínek
však neexistuje žádný pevný vzor.
Cílem extrakce biomolekul do dvoufázového systému je shromáždit každou ze
separovaných látek pouze do jedné fáze (což prakticky nelze stoprocentně splnit) a
separované látky od sebe oddělit tak, aby v jedné z fází byl pouze jediný typ biomolekul. To
znamená, že separujeme-li dvě látky, snažíme se dostat každou do jiné fáze. Separujeme-li
látek více, snažíme se ze směsi oddělit jednu do jedné z fází a v dalších krocích pak
pokračujeme se separací fáze, ve které se shromáždilo více typů biomolekul.
Rozdělovací koeficient lze velice výrazně ovlivnit připojením specifického ligandu na
polymerní část dvoufázového systému. Molekuly, které mají afinitu k ligandu se pak hromadí
ve fázi obsahující ligand. Použití specifického ligandu je podrobněji popsáno v kapitole 2.4.1.
Aplikace dvoufázových systémů při izolaci biomolekul z biomasy
Dvoufázové systémy je možno použít při extrakci buněčného obsahu z
dezintegrovaných buněk ev. k extrakci biomolekul z libovolné biomasy. Úkolem prvého
kroku extrakce do dvoufázového systému je kvantitativní oddělení buněčných zbytků (ev.
jiných nerozpustných zbytků) od požadované biomolekuly. Výsledek záleží jednak na
18
rozdělovacím koeficientu, jednak na poměru horní a dolní fáze. K oddělení buněčných
zbytků od separované biomolekuly je třeba podmínky upravit tak, aby buněčné zbytky přešly
kvantitativně do opačné fáze než biomolekuly. Při izolaci bílkovin se buněčné zbytky
převedou do dolní solné fáze a bílkoviny do horní PEG fáze. V případě nukleových kyselin
by tomu bylo naopak, ovšem převést buněčné zbytky do horní fáze je v případě provozního
měřítka méně příznivé. Proto se v provozní praxi využívá těchto systémů zejména pro izolace
bílkovin. K převedení buněčných zbytků do dolní solné fáze se doporučuje použít
dvoufázový systém, jehož složení odpovídá levé horní části příslušného fázového diagramu.
Jestliže se do dvoufázového systému přidá větší podíl dezintegrované biomasy, což je
samozřejmě z ekonomického hlediska výhodné, je nutné počítat při tvorbě dvoufázového
systému s určitými změnami. Binodála bude posunuta směrem k počátku, poměr fázových
objemů se posune směrem k hodnotě jedna a pravděpodobně se změní rozdělovací koeficient.
Posun binodály směrem k počátku je vítaná změna, neboť umožňuje vytvářet
dvoufázové systémy z méně koncentrovaných roztoků, které za normálních okolností leží
pod binodálou a neumožňují proto vznik dvou fází.
Ke změně rozdělovacího koeficientu dochází až tehdy, je-li přidáno do systému
nejméně 20% biomasy. Maximum biomasy, které je možné do systému přidat je 50 - 60%. S
rostoucím přídavkem biomasy stoupá viskozita systému a mění se rheologické vlastnosti
disperse.
Zkušenosti z extrakce bílkovin z dezintegrovaných buněk pomocí dvoufázových
systémů lze shrnout do následujících bodů:
- výtěžnost bílkoviny bývá vyšší než 90%
- rozdělovací koeficient se pohybuje od 1 do 20 s průměrem vyšším než 3
- optimální přídavek biomasy na 1 kg systému je 200 - 350 g
- současně s buněčnými zbytky se odstraní i část kontaminujících bílkovin či dalších látek
- systém PEG-sůl vykazuje větší specifitu než systém PEG-dextran, zejména je-li použit
nepurifikovaný dextran (což je v provozním měřítku běžné)
Bílkovina, která se při první extrakci dostala do horní fáze, může být dále
purifikována tzv. sekundární extrakcí. V tom případě je nutno obě fáze od sebe oddělit a k
horní PEG fázi přidat vhodné množství soli, takže se vytvoří další dvoufázový systém.
Celkové složení dvoufázového systému je vhodné při sekundární extrakci změnit, a to
změnou koncentrace ev. typu přidané soli, změnou pH a někdy též přídavkem menšího
množství polyethylenglykolu o jiné molekulové hmotnosti. Výsledkem sekundární extrakce
19
by mělo být odstranění kontaminujících bílkovin, ale též nukleových kyselin, polysacharidů,
barevných látek apod. Nukleové kyseliny a polysacharidy vzhledem k svému hydrofilnímu
charakteru přecházejí ochotně do dolní solné fáze, naproti tomu většina barevných látek má
hydrofobní charakter a přejde proto do horní polyethylenglykolové fáze. Záleží proto hlavně
na charakteru kontaminujících příměsí, které chceme odstranit, převedeme-li separovanou
bílkovinu při sekundární extrakci do horní či dolní fáze. Jestliže upravíme podmínky tak, aby
bílkovina znovu přešla do horní fáze, musíme zařadit ještě terciální extrakci, při níž je nutné
uspořádat systém tak, aby izolovaná bílkovina přešla do dolní fáze. Po skončení extrakce je
nutné z extraktu bílkoviny odstranit přítomné kontaminující sloučeniny, tedy i soli ev. PEG.
Z provozního hlediska je odsolení podstatně jednodušší než odstraňování PEG.
Terciární extrakce znamená vždy vyšší stupeň purifikace izolované bílkoviny, ale též
snížení výtěžku a zvýšení celkových nákladů. Je proto, zejména v provozním měřítku, nutno
uvážit, je-li výhodnější použít dva či tři extrakční stupně.
Jak již bylo řečeno výše, bílkoviny, které byly v závěrečné fázi převedeny do dolní
solné fáze, je nutno odsolit. Je možno použít libovolný způsob odsolení jak o tom pojednává
podrobněji kapitola 3.8.2.
Extrakci do dvoufázového systému lze s výhodou zařadit jako krok následující po
srážení polyethylenglykolem (viz kap. 2.1.1). K odseparované polyethylenglykolové
sraženině se přidá příslušné množství vody a soli tak, aby se vytvořil dvoufázový systém.
Tím se odseparuje PEG od izolované bílkoviny.
Některé bílkoviny se pevně váží na PEG. Tyto bílkoviny nelze uvedeným způsobem
purifikovat.
Závěrem lze říci, že extrakce dvoufázovým vodným systémem se ukázala být velice
šetrnou, pružnou a efektivní metodou pro izolaci biologicky aktivních látek. V případě
bílkovin je pak velice snadno převeditelná i do provozního měřítka.
20
2.2 Membránové procesy
Membránové procesy jsou separační techniky, které využívají k separacím
polopropustné membrány. Polopropustné membrány umožní průchod malých molekul,
zatímco velké molekuly zůstanou nad membránou.
Mezi membránové procesy řadíme dialýzu a elektrodialýzu, reverzní osmózu
(hyperfiltraci), ultrafiltraci a mikrofiltraci.
Membránové filtry
Polopropustné membrány jsou nejdůležitější složkou membránových procesů.
Membrány se používají pro speciální případy filtrací již dlouhou dobu (např. pro klarifikace
nebo sterilizace ve farmaceutickém průmyslu). Pro tyto účely se používají mikroporézní
membrány; jsou to membrány s malými póry, u nichž je definována nejmenší velikost pórů.
Průměr pórů se pohybuje od 0,025 μm až po několik mikrometrů. Jsou to obvykle rigidní
filtry, tvořené různými polymerními materiály. Zadržují bakterie, koloidy a částice s
průměrem větším než 0,1μm. Separace je založena výhradně na velikosti částic s tím, že k
zadržení dojde buď na povrchu membrány nebo zachycením uvnitř pórů.
V šedesátých letech se na trhu objevil nový typ membrán, tzv. ultrafiltrační
membrány (obr.2.4 a obr.2.5). Tyto membrány mají póry řádově menší než mikroporézní
membrány a většina z nich se skládá ze dvou odlišných vrstev: z velmi úzké horní vrstvy (0,1
- 1,5 μm silné) s póry o přesně definovaném průměru (0.4 - 40 nm), která je vlastní
ultrafiltrační membránou, a z mnohem širší (asi 150 μm) spodní vrstvy s otevřenou
houbovitou strukturou, která má převážně podpůrnou funkci. Každá částice, která projde
horní vrstvou membrány, prochází pak spodní vrstvou volně a bez zadržení. Takto
konstruované membrány se označují jako anizotropní membrány. Mají dvě hlavní výhody:
*křehká ultrafiltrační vrstva je posílena silnou spodní podpůrnou vrstvou
*vzhledem k tomu, že ultrafiltrační vrstva je velice úzká, nemohou se v ní zachycovat ev.
krystalizovat procházející částice a velmi malé póry nedovolí procházet větším částicím,
které by pak mohly zanášet spodní vrstvu; tím se vylučuje nebo alespoň omezuje zanášení
pórů membrány malými částicemi, které způsobuje výrazné snížení průtočnosti membrány
(tzv. fouling).
21
Mikroporézní membránový filtr Anizotropní ultrafiltrační membrána Obr.2.4 Schematické znázornění mikroporézní a anizotropní membrány Mikroporézní membrána Anizotropní membrána Částice se zachytí na povrchu nebo Vlastní membrána je téměř ve struktuře membrány nepostřehnutelná vrstva na horním okraji
Obr.2.5 Mikroporézní a anizotropní ultrafiltrační membrána na snímku z elektronového mikroskopu
Prostup separované částice ultrafiltrační membránou je dán velikostí její molekuly
resp. hodnotou její molekulové hmotnosti. Jsou konstruovány membrány umožňující průchod
molekul v rozmezí molekulových hmotností 100 Daltonů (reverzní osmóza) až 1 000 000
Daltonů (ultrafiltrace). Membrány jsou kategorizovány podle molekulové hmotnosti molekul,
které již neprojdou membránou. Taková molekulová hmotnost se označuje jako dělicí rozsah
(častěji se používá anglický výraz cut off). Výrobci garantují, že 90 % molekul o molekulové
hmotnosti rovnající
se dělicímu rozsahu neprojde membránou. Průchod membránou může totiž být ovlivněn též
tvarem a nábojem molekuly. Přesné určení dělicího rozsahu je komplikováno i tím, že
22
tisícinásobná změna molekulové hmotnosti znamená jen asi desetinásobnou změnu v
průměru molekuly (bráno z hlediska ideálního, t.j. kulovitého tvaru molekuly), což v praxi
znamená, že změní-li se dělicí rozsah membrány tisíckrát, změní se velikost pórů v
membráně pouze desetkrát.
Dělicí rozsah pro polynukleotidy (DNA, RNA) je definován odlišně, protože
polynukleotidy mají při stejné molekulové hmotnosti ve srovnání s bílkovinami otevřenější
terciární strukturu. Retence proto závisí především na počtu nukleotidů v polynukleotidovém
řetězci. Dělicí rozsah pro nukleové kyseliny je minimální počet nukleotidů, které musí
obsahovat jedno- nebo dvouvláknový řetězec, aby byl membránou zadržen z 90 %.
Až donedávna byl převládajícím materiálem k výrobě ultrafiltračních membrán acetát
celulózy. Ultrafiltrační membrány z acetátu celulózy sice vykazují dobré separační vlastnosti
i průtokové charakteristiky, jejich nevýhodou však je nízká tepelná stabilita (jen 15 - 30 oC) a
malá stabilita vůči pH (pH 3 - 6), což omezuje jejich čištění a sanitaci. Dnes jsou vedle
celulosy k disposici polymerní materiály s výhodnějšími provozními vlastnostmi. Vyrábějí se
membrány polysulfonové, polyvinylidendifluoridové a polyamidové. Nejčastěji se používají
polysulfonové materiály, které mají výbornou chemickou kompatibilitu a jsou stálé v široké
oblasti pH.
Charakteristika membrán zahrnuje tyto údaje:
a) Dělicí rozsah - pro ultrafiltraci udává nejmenší molekulovou hmotnost, kterou je
membrána schopna zadržet (označuje se NMWL - nominal molecular weight limit - nebo též
MWCO -molecular weight cut off). Pro nukleové kyseliny je to počet nukleotidů, který musí
obsahovat fragment nukleové kyseliny, aby byl zadržen membránou (označuje se NCO). V
případě reverzní osmózy udává dělicí rozsah procenta zadržení NaCl.
b) Průtočnost membrány na vodu - objem vody procházející membránou při definované
teplotě a tlaku za časovou jednotku.
c) Rozsah povolených pracovních teplot, tlaků a pH.
d) Odolnost membrán proti sanitárním prostředkům jako je peroxid vodíku, chlornan sodný,
formaldehyd. Doporučený čisticí a sanitární postup.
e) Odolnost membrán vůči organickým rozpouštědlům, uhlovodíkům, fenolům apod.
f) Specifický výkon při zpracování definovaného produktu při určitém stupni zahuštění -
udává se jako specifický průtok permeátu při konstantní teplotě, tlaku a průtokové rychlosti
na straně koncentrátu.
g) Životnost membrán v trvalém provozu - bývá 1 - 2 roky.
23
Dialýza
Dialýza je difuzní proces, při němž molekuly z roztoku na jedné straně membrány
přecházejí do roztoku, který je na opačné straně membrány (tzv. dialyzát). Složky roztoku
jsou navzájem separovány podle schopnosti prostoupit membránou, tedy podle velikosti
molekuly. Hnací silou tohoto procesu je rozdíl koncentrací malých molekul na vnitřní a
vnější straně membrány. Rychlost průchodu molekul membránou, tj. z původního roztoku do
dialyzátu, je přímo úměrná koncentraci a nepřímo úměrná molekulové hmotnosti
procházejících molekul. V okamžiku, kdy se koncentrace procházejících molekul na obou
stranách membrány vyrovná, průchod membránou se zastaví.
Dialýza slouží zejména k odstraňování malých molekul z roztoků makromolekul
(např. k odsolování), proto póry v membráně musí být menší než jsou rozměry
makromolekul. K dosažení co nejlepšího výsledku je vhodné uspořádat dialýzu tak, aby
kapalina na vnější straně membrány proudila. Pak nemůže dojít k ustavení rovnováhy mezi
vzorkem a dialyzátem, protože malé molekuly prošlé membránou jsou okamžitě odplavovány
a odstraňování molekul z původního roztoku může pokračovat. Je však třeba mít na zřeteli,
že některé biomolekuly, např. bílkoviny, jsou při velmi nízkých iontových silách málo
stabilní, proto se doporučuje jako dialyzát použít místo pouhé vody tlumivý roztok o nízké
iontové síle, jehož výhodou je i definované pH.
V laboratorním měřítku se dialýza často provádí v membránových trubicích, které se
po naplnění dialyzovaným roztokem na obou stranách uzavřou a vloží do nádoby s
promývacím roztokem (dialyzátem) (viz obr.2.6). Promývacím roztokem je třeba míchat, aby
nedocházelo ke zpomalování procesu v důsledku místního zvýšení koncentrace malých
molekul v dialyzátu. Odstranění malých molekul z roztoku trvá několik hodin; v laboratořích
se dialýza provádí obvykle přes noc. Protože molekuly rozpouštědla mají schopnost
prostupovat membránu i v opačném směru, tj. z vnější strany na vnitřní, je při dialýze vždy
třeba počítat s naředěním.
V laboratoři může dialýza sloužit i k zvýšení koncentrace makromolekul v roztoku.
Dialyzační trubice se obalí vhodným vysoušedlem, které nemůže proniknout přes membránu
dovnitř. Voda difunduje z trubice ven a je absorbována vysoušedlem, takže dochází ke
zvýšení koncentrace makromolekul uvnitř dialyzační trubice (viz kap.3.6).
24
Obr.2.6 Oddělení malých molekul pomocí dialýzy v dialyzační trubici
Elektrodialýza
Při elektrodialýze je hnací silou procesu pohyb nabitých iontů v elektrickém poli.
Účinkem stejnosměrného proudu jsou z roztoku odděleny molekuly nesoucí náboj, pouze
však ty, které jsou schopny projít membránou. Molekuly, které nenesou náboj, se nepohybují,
proto neprocházejí membránou i kdyby jim to jejich velikost dovolovala. Elektrody, v jejichž
směru se nabité ionty pohybují, jsou umístěny na vnější straně membrány, takže ion musí při
elektrokinetickém pohybu membránu překonat.
Zařízení pro elektrodialýzu se skládá z dvou typů membrán s rozdílnou selektivitou
vzhledem k propustnosti pro kationty a anionty. Kationaktivní iontově selektivní membrána
je membrána, propustná pouze pro kationty, anionaktivní iontově selektivní membrána pouze
pro anionty. V elektrodialyzéru, kde se elektrodialýza provádí, jsou oba typy membrán
řazeny střídavě. Z hlediska hydrodynamického průtoku je uspořádání membránových dvojic
paralelní, zatímco elektrické zapojení membránových dvojic je seriové. Membrány jsou
odděleny membránovými separátory opatřenými tenkými průtokovými kanálky, které
zajišťují turbulentní tok v prostoru mezi membránami, takže dialyzovaný roztok je intenzívně
promícháván. Tím je zajištěno, že rychlost elektrodialýzy není omezována difuzí. Sestava
25
membrán je konstrukčně uspořádána v nosném rámu. Celkové uspořádání připomíná svým
průtokovým systémem kalolis.
Obr.2.7 Schéma uspořádání anionaktivních a kationaktivních membrán při elektrodialýze
V zařízení pro elektrodialýzu rozlišujeme dva typy prostorů: koncentrační a
zřeďovací (viz obr.2.7). V koncentračním prostoru se shromažďují ionty s opačným nábojem.
Jejich vstup do tohoto prostoru ve směru migrace iontů ve stejnosměrném elektrickém poli
souhlasí s propustností iontově selektivního páru membrán, tj. dvojice kationaktivní -
anionaktivní membrána. Další pohyb iontů z koncentračního prostoru je omezen toutéž
dvojicí membrán. Kation pohybující se směrem ke katodě prošel kationaktivní membránou,
jeho další pohyb je zastaven anionaktivní membránou nepropustnou pro kationty. Anion
pohybující se směrem k anodě vstoupil do koncentračního prostoru přes anionaktivní
membránu, ale jeho další pohyb ve směru stejnosměrného elektrického pole je zastaven
kationaktivní membránou, propustnou pouze pro kationty. V koncentračním prostoru proto
vzrůstá koncentrace iontů, které tam přicházejí ze sousedních zřeďovacích prostorů.
Koncentrovaný roztok solí nebo jiných nízkomolekulárních látek nesoucích náboj se z
koncentračních prostorů kontinuálně vymývá vodou. Likvidace roztoku z koncentračních
prostorů může činit problémy z hlediska solnosti odpadních vod.
Elektrodialýza se nejčastěji používá pro odsolování a deacidofikaci (odstraňování
kyselin) roztoků. Jedním cyklem lze při elektrodialýze dosáhnout odsolení z 10 - 35 %. Pro
vyšší stupeň odsolení musí odsolovaný roztok v elektrodialyzéru recirkulovat, a to pomocí
čerpadla napojeného na recirkulační tank. Prakticky lze při použití elektrodialýzy dosáhnout
odsolení až z 99 %. Spotřeba elektrické energie na odstranění 1 kg soli činí obvykle
26
0,8 - 1 kWh. Z hlediska spotřeby elektrické energie je výhodné roztoky před elektrodialýzou
koncentrovat, aby se snížil jejich ohmický odpor.
Zajímavé je srovnání energetických nákladů při odsolení do různého stupně, které
jsou uvedeny v následující tabulce:
Odsolení % Náklady 50 0,5 75 1,0 90 2,0
Znamená to, že vezmeme-li jako základ náklady na 75 % odsolení, náklady na 50 % odsolení
jsou poloviční, náklady na 90 % odsolení dvojnásobné.
Elektrodialýza má poměrně široké využití v praxi. Používá se např. k odsolování
mořské vody, k purifikaci aminokyselin, při izolaci enzymů a v nedávné době se začala ve
velkém měřítku aplikovat pro odsolování syrovátky pro účely kojenecké a dětské výživy.
Reverzní osmóza
Reverzní osmóza (hyperfiltrace, RO) a ultrafiltrace (UF) jsou membránové procesy,
které používají ultrafiltrační anizotropní membrány. Hnací silou obou těchto procesů je
tlakový rozdíl na opačných stranách membrány. Roztok, který při reverzní osmóze a
ultrafiltraci zůstane nad membránou, se nazývá retentát (též koncentrát); roztok, který projde
na opačnou stranu membrány je permeát (nebo hyperfiltrát pro RO a ultrafiltrát pro UF).
Při reverzní osmóze se používají membrány s velice malými póry (maximálně 0,4
nm), kterými procházejí pouze molekuly rozpouštědla. K průchodu rozpouštědla takto
malými póry je ovšem třeba relativně vysokých tlaků (2,7 - 10,4 MPa), které jsou zajišťovány
vysokotlakými čerpadly. Vysoký pracovní tlak vyplývá z nutnosti překonat osmotický tlak
rozpuštěných složek v roztoku. Jestliže pro osmotický tlak uvažujeme v nejjednodušším
případě platnost van't Hoffova zákona
π = (RT / Mr) c (4)
27
pak osmotický tlak π je přímo úměrný koncentraci rozpuštěné složky c a nepřímo úměrný
molekulové hmotnosti Mr této složky.
Při reverzní osmóze se od molekul rozpouštědla odseparují i malé molekuly a ionty,
např. soli. Membrány pro reverzní osmózu jsou schopny zachytit 90 - 99 % rozpuštěných
látek. Procento zadržení NaCl určuje dělicí rozsah membrány.
Účinek reverzní osmózy je blízký odstraňování rozpouštědla odpařováním. Oba
procesy bývají často srovnávány z hlediska ekonomiky: reverzní osmóza je ekonomičtější
než odpařování jestliže má být dosaženo maximálně 20 - 30 % koncentrace sušiny. Při
požadavku na vyšší zakoncentrování je ekonomičtější používat odparky. Reverzní osmóza
však má oproti odpařování velkou výhodu v tom, že odstranění rozpouštědla probíhá při
nízkých teplotách, které mohou být voleny tak, aby nepřesáhly hranici termostability
izolovaných složek s biologickou aktivitou. Protože při vysokých tlacích dochází ke
zvyšování teploty, doporučuje se zařadit do výrobní linky průtokový chladič.
Reverzní osmóza může být za určitých okolností použita i k odsolení resp. odstranění
nízkomolekulárních látek, a to tehdy, chceme-li připravit čisté rozpouštědlo. Např.
odstraňování solí z mořské vody s cílem získat pitnou vodu může být uskutečněno reverzní
osmózou. V tomto případě můžeme reverzní osmózu srovnávat s elektrodialýzou nebo s
chromatografií na měničích iontů.
Ultrafiltrace
Ultrafiltrace je další membránová metoda, která pracuje na obdobném principu jako
reverzní osmóza. Hnací silou procesu, jak jsme již uvedli, je tlakový rozdíl na opačných
stranách membrány. Na rozdíl od reverzní osmózy pracují ultrafiltrační zařízení při nižšm
provozním tlaku (0,1 - 1 MPa), který je nižší než osmotický tlak. Velikost pórů v
ultrafiltrační membráně se pohybuje od 1 do 40 nm, takže tyto membrány jsou propustné i
pro nízkomolekulární látky, resp. pro látky s nižší molekulovou hmotností. Ultrafiltraci lze
proto použít pro odstranění malých molekul (solí), ale i k částečné separaci ostatních molekul
na základě jejich velikosti. Membrány pro ultrafiltraci se vyrábějí s různě velikými póry
(vždy přesně definovanými), takže jsou propustné pro různě velké molekuly. Zadržení
(retence) ultrafiltrační membránou závisí na poměru molekul, které prostoupí membránou a
které jsou membránou zadrženy. Můžeme ji vyjádřit vztahem:
28
R = 1 - cp / cr (5)
R = retenční koeficient cp = koncentrace molekul v roztoku, který prošel membránou (tzv. permeát) cr = koncentrace roztoku nad membránou (tzv. retentát)
Protože membránou procházejí molekuly rozpouštědla, snižuje se objem roztoku nad
membránou a koncentrace molekul, které nemohou membránou projít, se zvyšuje. U
molekul, jejichž reteční koeficient je roven 1, tj. takových, které membránou vůbec
neprocházejí, je koncentrační proces přímo úměrný snižování objemu nad membránou. Tzn.
sníží-li se objem nad membránou na 50 % původního objemu, koncentrace zadržených
molekul stoupne dvakrát. Jestliže však bude retence určité složky pouze 40 % (R = 0.4), pak
dvojnásobné zvýšení koncentrace této složky bude vyžadovat snížení objemu o 82 %. Jestliže
se R = 0 (volně průchozí materiál), pak koncentrace tohoto materiálu v permeátu i retentátu
bude stejná.
cf / c0 = R (V0 / Vf) (6)
cf = konečná koncentrace složky nad membránou c0 = počáteční koncentrace složky V0 = počáteční objem vzorku Vf = konečný objem retentátu
Je třeba upozornit, že vztah (6) platí jen v ideálním případě. Protože v praxi je třeba
počítat s některými nepříznivými vlivy, o nichž bude pojednáno později, je situace v praxi
vždy komplikovanější.
Z výše uvedeného vztahu je zřejmé, že malé molekuly, které volně procházejí
membránou, nemohou být z roztoku úplně odstraněny, ale jejich skutečný obsah se snižuje v
poměru ke snížení objemu. Znamená to, že se snížením objemu např. o 90 % projde
membránou i 90 % malých molekul, avšak jejich koncentrace v permeátu a retentátu bude
stejná. Chceme-li provést další odsolení, musíme retentát naředit, čímž se sníží koncentrace v
něm přítomných látek, ale současně se zvětší objem. Následným snížením objemu
průchodem membránou pak opustí retentát další malé molekuly. Takto můžeme pokračovat
až do požadované koncentrace malých molekul (solí) v retentátu. Tento opakovaný postup se
označuje jako diafiltrace.
29
Diafiltrace je vzhledem k efektu procesu kombinací ultrafiltrace a dialýzy. Jde o
zvláštní uspořádání ultrafiltrace, kdy při určitém stupni koncentrace se k retentátu přidá voda
a pokračuje se v další koncentraci. Přídavek vody k retentátu s následnou ultrafiltrací
umožňuje snížit koncentraci těch nízkomolekulárních složek roztoku, které procházejí
membránou. Dosáhne se tím podobného efektu jako při dialýze s tím rozdílem, že se
současně zvýší koncentrace vysokomolekulárních složek.
Použití ultrafiltrace ev. diafiltrace umožňuje provádět více operací při izolaci
biologicky aktivních látek. Jde především o odstraňování malých molekul z roztoku
makromolekul (zejména odsolování), o odstraňování detergentů a kyselin, dále o výměnu
pufrů. Pomocí ultrafiltrace je možno provádět částečnou separaci biomakromolekul, pokud se
od sebe liší molekulovou hmotností, a je možno zvyšovat koncentraci makromolekul v
roztoku (zahušťování). Ultrafiltrace se tak stává užitečným pomocníkem při izolaci bílkovin,
enzymů, nukleových kyselin a při pochodech s těmito biomakromolekulami svázanými (např.
PCR - polymerasová řetězová reakce).
Obr.2.8 Schema enzymového ultrafiltračního reaktoru 1 - cirkulační tank s náplní substrátu a enzymu 2 - ultrafiltrační zařízení
Ultrafiltrace se používá i k racionalizaci enzymově katalyzovaných reakcí. K tomu
slouží tzv. ultrafiltrační enzymové reaktory (obr.2.8). Základem těchto reaktorů je vsádkově
pracující ultrafiltrační zařízení, které je napojené na cirkulační tank. Do prostoru nad
membránou se z cirkulačního tanku přetahuje roztok enzymu a substrátu, takže během
ultrafiltrace probíhá též enzymová reakce. Produkty této reakce kontinuálně přecházejí do
permeátu, čímž se současně posunuje reakční rovnováha ve prospěch tvorby produktů
enzymové reakce. Retentát se po určité době vrací do cirkulačního tanku, kde se smísí s
novou dávkou enzymu a substrátu a ultrafiltrace může pokračovat. Předpokladem použití
30
tohoto reaktoru však je, aby molekulová hmotnost substrátu byla nad dělicím rozsahem
membrány a molekulová hmotnost produktu pod ním.
Mikrofiltrace
Jako mikrofiltrace se označuje skupina poměrně nových technik, které pracují jak s
mikroporézními membránami tak s membránami anizotropními a jsou upraveny na
zpracování malých objemů. Mohou se používat k odsolování, zahušťování, částečné
frakcionaci roztoků biomolekul, ale i k odstraňování mikroorganismů s cílem sterilace
roztoků a k odstraňování buněčných fragmentů po dezintegraci buněk.
Membrány obvykle tvoří dno plastových nádobek či kolonek, které jsou uzpůsobeny
buď tak, aby se mohly vložit do odstředivky, nebo aby je bylo možno napojit na injekční
stříkačku (obr.2.9 a obr.2.10). Do nádobky se umístí roztok určený k mikrofiltraci a částice,
jejichž molekulová hmotnost leží pod dělicím rozsahem membrány, projdou membránou. V
prvém případě dochází k průchodu membránou pod vlivem odstředivé síly, v druhém případě
se tlak zvyšuje stlačováním pístu injekční stříkačky.
Mikrofiltrace našla velkou oblibu a značné použití mezi pracovníky laboratoří, neboť
umožňuje pracovat s minimálními objemy a s velmi malými ztrátami. Na trhu je značný
výběr pomůcek s různými typy membrán, takže je možno vybrat typ, který vyhovuje cíli,
jehož chceme mikrofiltrací dosáhnout.
Faktory limitující použití membránových procesů
Membránové technologie se v posledních letech dočkaly zásadních pokroků, které
umožnily jejich značné rozšíření, a to i do výrobní sféry. Přesto se dosud nepodařilo úplně
odstranit některé jevy, které jejich použití omezují. Jsou to především koncentrační
polarizace a již dříve zmíněné zanášení vnitřních pórů (fouling). Oba tyto jevy jsou závislé na
povaze separovaných molekul, na charakteru použitých membrán a jejich umístění, na
dynamice průtočného systému a na použitém tlaku.
31
Obr.2.9 Mikrofiltrační kolonka pro práci v centrifuze
Obr.2.10 Mikrofiltr spojený s injekční stříkačkou
Při ultrafiltraci je roztok pod tlakem nucen procházet membránou. Velké molekuly,
které jsou při ultrafiltraci membránou zadrženy, se nad membránou koncentrují a mohou se
na membráně usazovat a vytvářet gelovitou vrstvu. Tato vrstva pak působí jako druhý filtr,
ovšem bez řízeného dělicího rozsahu. Tento jev je znám jako koncentrační polarizace
(obr.2.11). V jeho důsledku klesá průtočnost membrány a mění se i dělicí rozsah v tom
smyslu, že menší molekuly, které by podle původního dělicího rozsahu bez problémů prošly
membránou, jsou zadrženy. Dělicí rozsah tedy rovněž nekontrolovatelně klesá. Protože se
koncentrační polarizace do jisté míry projevuje u všech ultrafiltrací, nemůže separace
ultrafiltrací zcela nahradit gelovou permeační chromatografii, která je rovněž založena na
32
separaci molekul na základě jejich velikosti. Ke spolehlivému oddělení dvou různě velkých
molekul ultrafiltrací je nutné, aby molekulová hmotnost jedné byla pěti- až desetinásobkem
druhé.
Efekt koncentrační polarizace je možné minimalizovat zpětnou difuzí zadržených
molekul z povrchu membrány. Nejčastěji se v laboratorních ultrafiltračních celách rozrušuje
gelovitá vrstva nad membránou mícháním. Ultrafiltrační cela musí být konstruována tak, aby
se míchadlo při svém pohybu lehce dotýkalo povrchu membrány avšak membránu
neporušilo. Míchání mívá při snižování koncentrační polarizace v laboratorních
ultrafiltračních celách dobré výsledky, avšak v provozním měřítku je naprosto nedostačující.
Proto se zavádí jiný způsob rozrušování usazené vrstvy, a to filtrace za tangenciálního toku
(TFF - tangencial flow filtration) (obr.2.12). Čerpadla ženou roztok do zařízení ve směru
rovnoběžném s membránou a tlak nad membránou umožňuje průtok membránou v kolmém
směru.
Obr.2.11 Koncentrační gradient během polarizace CB = koncentrace makromolekul v roztoku B
CG = koncentrace makromolekul v gelovité vrstvě Zatímco při koncentrační polarizaci se velké molekuly pouze hromadí na povrchu
membrány a mohou být setřeny, při dalším jevu, kterým je zanášení membrány (fouling), se
separované částice váží na membránu nebo jsou fyzikálně zachyceny v její porézní struktuře
a nelze je pouhým průtokem odstranit. Zabránit tomuto zanášení lze pouze nastavením
vhodných parametrů celého procesu ev. vyloučením takových systémů, které membránu
nevratně znečišťují.
33
tvorba gelovité vrstvy tangenciální tok umožňuje zpětnou difuzi usazené vrstvy
Obr.2.12 Koncentrační polarizace a její rozrušení tangenciálním tokem
Membránové procesy, které užívají anizotropní membrány, zejména reverzní osmóza
a ultrafiltrace, jsou citlivé na přítomnost mechanických nečistot, které by filtry mechanicky
zanášely a současně by znečišťovaly retentát. Zpracovávané roztoky proto nesmějí obsahovat
částice větší než 200 μm. I voda, která se používá při diafiltraci, musí odpovídat těmto
požadavkům. Proto je často nutné před ultrafiltraci nebo reverzní osmózu zařadit
odstřeďování či filtraci.
Filtrační systémy pro membránové filtrace
Membránové procesy se provádějí v různých zařízeních, která se liší podle typu
membránového procesu, ale též podle toho, bude-li proces prováděn v laboratorním,
poloprovozním či provozním měřítku.
Nejjednodušší jsou laboratorní dialýzy, kdy se obvykle vystačí s dialyzační
membránovou trubicí, vhodnou nádobou a míchadlem. Elektrodialyzéry, jak bylo uvedeno v
části o elektrodialýze, jsou již zařízení komplikovanější. Využívají převážně plošné
dialyzační membrány, v provozním měřítku obvykle uspořádaných do rámů.
Klasické zařízení pro laboratorní ultrafiltraci, skládající se z míchané ultrafiltrační
cely, míchadla a zařízení umožňující nastavit tlakové rozdíly na vnitřní a vnější straně
membrány (obvykle napojení horní části cely - části nad membránou - na tlakovou lahev s
dusíkem), rovněž používá plošné membrány, převážně však membrány anizotropní
(viz obr.2.16a). Použití těchto membrán ve větším měřítku vyžaduje čerpadla umožňující
tangenciální tok, aby se zmenšilo nebezpečí koncentrační polarizace.
34
Obr.2.13 Membrána ve formě dutého vlákna. Vlastní ultrafiltrační membrána je na vnitřním povrchu. Snímek z elektronové mikroskopie.
Novějším přístupem k ultrafiltracím, a to laboratorním, ale zejména poloprovozním a
provozním, je použití membrán ve tvaru dutých vláken (hollow fibres). Jsou to cylindrická
vlákna s vnitřním průměrem obvykle 0,5 - 1 mm, tvořená anizotropní nejčastěji
polysulfonovou membránou, která je na vnitřní straně vlákna (obr.2.13). Při ultrafiltraci
protéká roztok dutým vláknem, molekuly s hmotností pod dělicím rozsahem membrány
projdou vláknem současně s permeátem a retentát s koncentrujícími se makromolekulami
proudí dále vláknem.
35
Obr.2.14 Patrony s dutými vlákny v paralelním uspořádání
Dutá vlákna se umísťují do polymerních obvykle průhledných trubic a distribuují se
ve formě "patron", které obsahují velké množství dutých vláken. Vlákna jsou v patronách
umístěna buď rovnoběžně, nebo stočená do spirály (obr.2.14, 2.15 a 2.16b). Roztok se čerpá
do patron pod tlakem, čímž je zajištěn tlakový rozdíl po opačných stranách membrány.
Permeát se odvádí z mezivláknových prostor a retentát vytéká z patrony na konci dutých
vláken.
Ultrafiltrace v dutých vláknech má řadu výhod, hlavní však je ta, že tok retentátu
membránovým vláknem minimalizuje usazování makromolekul a tedy i koncentrační
polarizaci.
Obr.2.15 Konstrukce patron se spirálovitě uspořádanými dutými vlákny
36
Obr.2.16 Zařízení pro ultrafiltraci a) s plošnými filtry (laboratorní měřítko) b) s patronou s dutými vlákny 2.3 Chromatografické metody
Chromatografické metody zaujímají jedno z nejvýznamnějších míst mezi moderními
separačními technikami. Spolu s elektromigračními metodami totiž umožňují separaci velice
složitých směsí a získávání jednotlivých složek směsi ve velice čistém až homogenním
stavu.
Některé separační metody byly známy již v dávných dobách, např. sedimentace,
extrakce, srážení, krystalizace apod. Tyto klasické metody však nejsou dostačující k dělení
složitých směsí látek značně podobných s jakými se setkáváme např. v přírodním materiálu
(směsi biopolymerů, aminokyselin, peptidů, nukleotidů apod.). Na rozdíl od těchto
klasických separačních technik, založených zejména na fázových separacích, je frakcionace
látek při chromatografii dána rozdílnou pohyblivostí jednotlivých složek směsi.
37
Moderní chromatografické techniky slouží nejen k preparativním účelům, ale i k
účelům analytickým. Prostřednictvím chromatografických technik je možno získat
kvalitativní i kvantitativní informace, tzn. kromě určení složení směsi lze stanovit i
koncentraci jednotlivých složek. Pro úplnou identifikaci je však nezbytné propojení s dalšími
metodami analytické chemie např. hmotnostní spektrometrií, UV-VIS spektrometrií apod.
Základním obecným principem všech chromatografických technik je nestejnoměrné
rozdělování složek směsi mezi stacionární a mobilní fázi. Výsledkem je rozdílná rychlost
migrace rozpuštěných látek.
Chromatografické metody se liší podle principů, na jejichž základě k dělení látek
dochází. Nejčastěji se setkáváme s dělením chromatografických technik podle charakteru
fází na plynovou chromatografii (GC) a kapalinovou chromatografii (LC). Zatímco plynová
chromatografie pracuje v systému plyn-pevná látka nebo častěji plyn-kapalina, kapalinová
chromatografie pak v systému kapalina-kapalina (LLC) nebo pevná látka-kapalina (LSC).
Přesné rozdělení chromatografických metod není vždy jednotné, neboť někdy se při
separaci uplatňuje více mechanismů, jindy zase není podstata separačního procesu zcela
objasněna. V tab.1 je uvedeno základní rozdělení chromatografických technik podle
skupenství mobilní fáze a dále podle separačního mechanismu.
Rozsah působnosti chromatografických metod je velmi široký a spolu s metodami
elektroforetickými a dalšími separačními technikami prakticky pokrývají celou škálu
velikosti částic od plynů až po živé buňky (viz Schema 1).
Schema 1 Přehled využití separačních technik
38
GC - plynová chromatografie, HPLC - vysokoúčinná kapalinová chromatografie, GPC - gelová chromatografie, IC - iontová chromatografie, ITP - izotachoforesa, EP - elektroforesa, FFF - frakcionace průtokem silového pole Tabulka 1 Přehled nejdůležitějších chromatografických metod
mobilní fáze separační mechanismus metoda užívaná zkratka síťový efekt plynová chromatografie na
molekulových sítech GSC
plyn
adsorpce plynová adsorpční chromatografie
rozdělování plynová rozdělovací chromatografie
GLC
síťový efekt gelová permeační chromatografie
GPC
adsorpce kapalinová adsorpční chromatografie
LSC
kapalina rozdělování kapalinová rozdělovací chromatografie
LLC
chemisorpce iontová výměnná chromatografie
IEC
specifické interakce biomolekul
afinitní chromatografie
2.3.1 Teorie chromatografie
Podstatou chromatografického procesu je distribuce složek mezi dvěma fázemi, z
nichž jedna je označována jako mobilní a druhá jako stacionární. Zatímco fáze pohyblivá
(plyn nebo kapalina) je označována jako mobilní fáze bez ohledu na skupenství, fáze
nepohyblivá - stacionární - může mít v různých typech chromatografií velmi rozdílnou formu
(např. částečky tuhé fáze, tenká vrstva kapaliny na pevných částicích, film kapaliny na vnitřní
straně kapiláry). Proto byl zaveden pojem sorbent a to pro jakoukoli formu stacionární fáze.
Během chromatografického dělení dochází k opakovanému transportu složek do
stacionární fáze a zpět do fáze mobilní. Přitom se chromatografický systém natolik přiblíží
rovnováze, že distribuci složky mezi dvě fáze lze popsat distribuční (rozdělovací) konstantou
K, která vyjadřuje poměr koncentrace složky ve stacionární fázi (cs) ku koncentraci složky ve
fázi mobilní (cm).
K = cs / cm (7)
39
Rychlost s jakou se daná složka pohybuje kolonou je dána právě rozdělovacím
koeficientem K. Obr. 2.17 ukazuje, jakým mechanismem dochází k separaci směsi o třech
složkách během LC chromatografie.
Obr. 2.17 Průběh separace třísložkové směsi při kapalinové chromatografii
Na kolonu je nanesena směs, obsahující tři složky. V důsledku průtoku rozpouštědla
(mobilní fáze) kolonou se molekuly pohybují a jsou-li podmínky separace optimální budou se
složky od sebe dělit, protože rychlost migrace složek je odlišná. Různý pohyb vyplývá z
rovnovážného rozdělení molekul mezi stacionární a mobilní fázi. Doba, kterou molekula
dané složky setrvá na povrchu sorbentu závisí na velikosti interakce mezi složkou a
sorbentem a určuje pořadí v jakém složka vychází z kolony. Čím je interakce větší, tím
složka později vychází - má větší retenční čas. Na výstupu z kolony pak složky vycházejí
odděleně. Má-li mít složka dostatečný retenční čas, je třeba aby byla rozpustnost dané složky
ve stacionární fázi podstatně vyšší než ve fázi mobilní.
Přístroje na nichž se chromatografické separace provádějí se nazývají chromatografy
(obr.2.18). Jejich důležitou součástí je detektor, který danou složku vycházející z kolony
deteguje a signál přenáší na zapisovač. Jako výsledek pak získáme záznam chromatografie-
40
chromatogram (obr.2.19). Křivkám, znázorňujícím separované složky, říkáme
chromatografické vlny, eluční pásy nebo slangově píky.
Obr.2.18 Základní vybavení pro kapalinovou chromatografii firmy LKB Vzorek: Hydrolyzát aminokyselin Kolona: Pico-Tag (reverzní fáze) Průtok: 1 ml/min Teplota: 38°C Detekce: 254 nm
41
Obr.2.19 Ukázka chromatogramu. Dělení směsi aminokyselin chromatografií na reverzní fázi
V chromatografii jsou definovány určité pojmy a parametry, které je třeba znát.
Základem chromatografického dělení je různá velikost interakce analyzovaných látek
se stacionární fází v koloně. Látka, která za daných podmínek nemá ke stacionární fázi
žádnou afinitu, je po celou dobu separace rozpuštěna v mobilní fázi a z kolony vyjde v čase
tm - mrtvý retenční čas - od okamžiku nástřiku. Mrtvý retenční čas je tedy retenční čas
složky, která není v koloně zadržována. Ostatní látky vycházejí z kolony s retenčními časy tr,
delšími než je tm. Každému retenčnímu času přísluší i retenční (eluční) objem Vr. Mrtvému
retenčnímu času odpovídá mrtvý retenční objem Vm, který je ve většině případů totožný s
objemem mobilní fáze v koloně VM.
Jako míra zpoždění látek - retence - zadržovaných stacionární fází kolony se používá
faktor k, definovaný vztahy
k = ns / nm (8a)
k = (tr-tm) / tm (8b)
tr = retenční čas složky tm = mrtvý retenční čas ns = látkové množství složky ve stacionární fázi nm = látkové množství složky v mobilní fázi
Tato veličina se označuje jako kapacitní faktor (kapacitní poměr), což je poměr
látkového množství dané složky ve stacionární (ns) a mobilní fázi (nm). Kapacitní poměr lze
rovněž spočítat z chromatogramu a znamená poměr doby, kterou průměrná molekula
separované látky stráví ve stacionární fázi, k době strávené ve fázi mobilní. Hodnotu
kapacitního poměru lze ovlivnit výběrem mobilní fáze, případně i teplotou. Pro danou
42
kolonu, danou složku a za konstantních podmínek by však měl být kapacitní poměr
konstantní.
Kapacitní faktor lze definovat pomocí základních termodynamických parametrů
chromatografie jako
k = K (VS / VM) (9)
K = rozdělovací koeficient dané složky VM = objem mobilní fáze v koloně VS = objem stacionární fáze v koloně
Z této rovnice je patrné, že kapacitní faktor pro danou látku závisí především na
povaze stacionární a mobilní fáze a jejich vzájemném poměru. Na rozdíl od tr nezávisí
kapacitní faktor na průtokové rychlosti eluentu ani na rozměrech kolony. Je to tedy
nejvhodnější veličina pro kvalitativní identifikaci elučních pásů v chromatografii.
Chromatografické dělení probíhá na základě proudění kapaliny v koloně a proto i
hydrodynamické parametry ovlivňují úspěšnost procesu. Z přímého stanovení resp. měření
může být stanoven objemový průtok mobilní fáze. Tato veličina však není dostatečná jako
charakteristika proudění a proto je určující veličinou lineární rychlost mobilní fáze. Ta je
však místně proměnlivá. Průměrnou lineární rychlost mobilní fáze (u) v celé koloně o délce L
je nejvýhodnější definovat pomocí tm jako:
u = L / tm (10)
L = délka kolony tm = mrtvý retenční čas
Libovolná složka A, která je v koloně zadržována, postupuje kolonou lineární
rychlostí uA
uA = L / trA (11)
L = délka kolony trA = retenční čas složky A
43
Poměr lineárních rychlostí uA / u je označován jako retardační faktor RF a vyjadřuje
pravděpodobnost, že molekula složky A se nachází v mobilní fázi.
RF = uA /u = 1/(1+k) (12)
Pokud bude molekula trvale v mobilní fázi bude RF→1, naopak jestliže molekula
setrvá ve stacionární fázi RF→0.
Při průchodu kolonou se separované látky nejen vzájemně oddělují, což je účelem, ale
zárověň se i zřeďují, což je méně žádoucí. Rozšiřování (rozmývání) elučních pásů látek v
koloně je způsobeno třemi vlivy - podélnou molekulární difúzí, rozdíly v místních
průtokových rychlostech a odporem vůči převodu hmoty mezi mobilní a stacionární fází.
Parametr, označovaný jako účinnost kolony, má vztah k velikosti tohoto rozšiřování; účinná
kolona dává užší eluční pásy, tedy pásy s vyšší koncentrací dělené látky, než kolona
neúčinná.
Eluční křivka (pík), vyjadřující závislost koncentrace analyzované složky na délce migrační
dráhy od začátku kolony a analogicky závislost na čase v určitém místě má v ideálním
případě tvar Gaussovy křivky a proto se parametry Gaussova rozptýlení hodnot staly
základem pro číselné vyjadřování účinnosti kolony. Kvantitativní míra účinnosti je pak
vyjádřena jako
H = (σt / tr )2 L = (w / tr)2 (L / 16)= (w1/2 / tr)2 (L / 5.54) (13)
H = výškový ekvivalent teoretického patra σt = rozptyl tr = retenční čas w = šířka píku u základny (w = 4σ) L = délka kolony w1/2 = šířka píku v polovině výšky (w1/2 = 2.35σ)
Tradičně se tato veličina označuje jako výškový ekvivalent teoretického patra (čím je
H menší, tím je kolona účinnější).
Celé koloně se pak připisuje účinnost pomocí tzv. počtu teoretických pater N,
definovaného
44
N = L / H neboli N = 16 (tr / w)2 = 5.54 (tr / w1/2)2 (14)
Protože v chromatografické koloně ve skutečnosti žádná patra nejsou, je třeba
veličiny N a H chápat jako konvencí dohodnutá kriteria pro rozšiřování píků.
Veličiny, které byly zatím uvedeny, charakterizují pouze eluční pás jednotlivé látky.
Aby bylo možno kvantitativně posuzovat dělení složek ze směsí, je třeba zavést další pojmy.
Pro dvojici látek je to rozlišení Rs, což je vzdálenost středů elučních pásů, dělená průměrem
šířek obou. Rozlišení je veličina bezrozměrná, větší hodnota Rs znamená lepší separaci a
naopak.
Rs = (tr2 - tr1 ) / 0.5 (w2 + w1) (15)
tr2, tr1 = retenční časy složek 1 a 2 w2, w1 = šířky píku u základny
Hodnota Rs = 1.5 znamená dokonalé rozlišení obou látek až k nulové linii, Rs = 1.0 je
překrytí asi 2%.
Obr.2.20 ukazuje separaci dvousložkové směsi jako funkci rozlišení.
Obr.2.20 Separace dvousložkové směsi vzhledem k hodnotě Rs
Pro dvojici látek se dále definuje tzv. selektivita neboli retenční poměr
45
α = k2 / k1 (16)
k1, k2 = kapacitní faktory pro složku 1 a 2
Rozlišení lze pak definovat pomocí základních chromatografických parametrů
Rs = 1/4 [(α-1)/α] [K/(1+K)] √N (17)
↓ ↓ ↓ selektivita retence účinnost kolony
kde K = (k1 + k2) / 2 N = počet teoretických pater α = selektivita
Tato rovnice je důležitá, protože vyjadřuje rozlišení jako funkci tří činitelů, z nichž
každý lze po dosažení optimálního výsledku ovlivnit celkem nezávisle na dalších dvou.
Následující obrázek poskytuje shrnutí vzájemných vztahů všech důležitých veličin, se
kterými se setkáváme v kapalinové chromatografii.
kapacitní faktor pro složku 1 k1 = (tr1-tm)/tm
separační faktor složek 1 a 2 α1/2 = (tr2-tm)/(tr1-tm) = k2/k1
46
účinnost (počet teoretických pater) N = (tr3/σ)2 = 16(tr3/4σ)2 = 5.54(tr3/√5.54σ)2 = 4(tr3/2σ)2
rozlišení složek 1 a 2 Rs = (tr2-tr1)/0.5(w2+w1) = 1/4 [(α1/2-1)/α1/2] [K/(1+K)] √N Obr.2.21 Parametry kapalinové chromatografie a jejich vztah k základním veličinám
2.3.2 Plynová chromatografie
Plynová chromatografie (GC) byla poprvé popsána okolo roku 1950. Stejně jako
ostatní typy chromatografií, je i GC metodou separační, při níž se analyzovaná látka
rozděluje mezi stacionární a mobilní fázi. Zatímco mobilní fází je vždy plyn, stacionární fázi
tvoří nejčastěji kapalina, zakotvená na inertním nosiči. Analyzovaný vzorek je separován
vždy v plynné fázi, tzn. všechny složky vzorku musí být definovaným způsobem vypařeny.
GC je proto vhodná zejména pro separaci organických látek s bodem varu do 400 °C. GC lze
použít i pro analýzu anorganických látek, které však musí splňovat podmínky těkavosti. Pro
separaci biomakromolekul není tato metoda vhodná, proto se jí nebudeme podrobněji zabývat
a uvedeme pouze základní údaje.
Každý plynový chromatograf se skládá v podstatě ze šesti částí:
zdroje nosného plynu a zařízení pro jeho regulaci, měření tlaku a zpracování dat
zařízení pro dávkování vzorku
separační kolony
detektoru
termostatu
zařízení pro registraci signálu z detektoru a zpracování dat
Zařízení pro plynovou chromatografii - plynový chromatograf - je znázorněno na
obr.2.22.
47
Obr.2.22 Schematické znázornění zařízení pro plynovou chromatografii
Po aplikaci vzorku na kolonu se analyzovaná směs (složky nacházející se jako pára
nebo plyn v mobilní fázi) zčásti rozpustí ve stacionární fázi. V ideálním případě jsou její
složky eluovány mobilní fází (nosným plynem) s rozdílným retenčním časem. Signál z
detektoru je pak po zesílení zaznamenáván registračním zařízením a vyhodnocován.
Úkolem mobilní fáze v GC označované jako nosný plyn je transportovat složky
vzorku kolonou. Jako mobilní fáze se využívají plyny, které jsou inertní jak k
chromatografické náplni kolony, tak i k analyzovanému vzorku. Jedná se zejména o dusík,
vodík a helium, při použití ionizačních detektorů s radioaktivním zářičem se jako mobilní
fáze používá argon.
Nezbytnou součástí každého plynového chromatografu je tzv. dávkovač. Je umístěn
těsně u vstupu do kolony, protože musí splňovat následující podmínku: vzorek, zplyněný v
malém prostoru, má být okamžitě převeden na kolonu. Aby bylo dosaženo účinné separace,
musí být objem dávkovaného vzorku co nejmenší (pro plynné vzorky 0.001 - 1 ml, pro
kapalné 0.1-1 µl). Teplota nástřikové komůrky by měla být vyšší, než je bod varu nejméně
těkavé složky vzorku. Páry vzorku jsou pak dále nosným plynem přeneseny na kolonu.
Podle způsobu konstrukce se dělí kolony na náplňové a kapilární. Kolony jsou
vyráběny z různých materiálů (sklo, nerez, ocel), tvar kolony se volí podle typu
chromatografu. Kolony mohou být rovné, ve tvaru U nebo šroubovice. V současné době se
dává vzhledem k vyšší účinnosti přednost kolonám kapilárním (průměr 0.1 - 0.5 mm, délka
50-100 m).
Rychlost pohybu dělených složek v koloně a tím i účinnost separace je závislá na
teplotě analýzy, která je volena podle povahy separovaných látek a konstrukčních možností
přístroje. Pro konstantní průběh analýzy je třeba zvolenou teplotu udržovat se značnou
přesností (±0.1°C), což bývá u většiny moderních komerčních chromatografů zajištěno
vhodným materiálem a konstrukcí přístroje.
Výstup z kolony je napojen na detektor - zařízení, které převádí signál, vycházející z
kolony na registrovatelnou formu (elektrickou veličinu). U plynové chromatografie se
48
používají např. plamenový ionizační detektor (FID), tepelně vodivostní detektor (TCD),
detektor elektronového záchytu (ECD) a další.
Koncovou jednotkou chromatografu je zařízení, které výstupní signál z detektoru
zaznamenává (zapisovač) a vyhodnocuje. Vyhodnocení výsledků se v současné době
většinou uskutečňuje pomocí počítačů s příslušným programovým vybavením.
Plynová chromatografie je využívána v kvalitativní i kvantitativní analýze. Velmi
používané je spojení plynové chromatografie s některou ze spektrálních metod či s
hmotnostním spektrometrem, což rozšiřuje možnosti aplikace GC. Při studiu biologicky
aktivních látek se GC neuplatňuje jako separační technika, ale při analýze a identifikaci
produktů, vznikajících činností biomakromolekul (např. produkty enzymových reakcí apod.).
2.3.3 Kapalinová chromatografie
Kapalinová chromatografie je jednou z těch separačních metod, které zaznamenaly
největší rozvoj. Kolonová kapalinová chromatografie je současně nejstarší ze všech
chromatografických technik (byla objevena již v roce 1906).
Metodám kapalinové chromatografie je společné to, že mobilní fázi tvoří kapalina.
Stacionární fází je sorbent, který je umístěn buď ve vrstvě (TLC a papírová chromatografie)
anebo ve sloupci (kolonové uspořádání).
Podle principu separace látek při kapalinové chromatografii rozlišujeme
adsorpční chromatografii
rozdělovací chromatografii
chromatografii na měničích iontů (ionexová chromatografie)
Adsorpční chromatografie je založena na různé schopnosti látek v roztoku adsorbovat se na
povrch pevné fáze - adsorbentu. V důsledku rozdílné adsorpční afinity složek směsi k
adsorbentu dochází k jejich rozdělení mezi stacionární a mobilní fázi a tím k
chromatografické separaci. Je to tedy chromatografie v systému pevná látka - kapalina
(LSC).
49
Při chromatografii na polárních adsorbentech je sorpce látek důsledkem rozdílných
polárních sil, působících mezi povrchem adsorbentu a separovanou látkou a polárních sil,
působících mezi povrchem adsorbentu a mobilní fází. Proti systému kapalina-kapalina s
polární stacionární fází je hlavní rozdíl v tom, že interakcí se účastní povrch adsorbentu.
Protože rozmístění adsorpčních center na povrchu adsorbentu je neměnné, závisejí interakce
separovaných látek na geometrickém rozmístění jejich funkčních skupin. Proto je
chromatografie v systému pevná látka-kapalina vhodnější pro separaci např. izomerů než
systém kapalina-kapalina.
Adsorpční chromatografie probíhá ve dvou stupních; v prvním stupni dochází k
adsorpci látek na adsorbent podle jejich afinity k adsorbentu (látky s větší afinitou se zachytí
dříve), ve druhém stupni je třeba látky z adsorbentu uvolnit - desorbovat - což se provádí buď
pouze elucí (vymytím) nebo vytěsněním pomocí roztoku látky, která k danému adsorbentu
vykazuje vyšší afinitu než látka navázaná.
Z polárních adsorbentů se používají nejčastěji oxid hlinitý a silikagel, což je xerogel
kyseliny křemičité, který má amorfní strukturu a pórovité částice. Na povrchu silikagelu se
po aktivaci vyskytují 4 druhy aktivních center, na nichž dochází k adsorpci a desorpci.
Strukturu povrchu silikagelu znázorňuje schematicky obr.2.23. Obr.2.23 Struktura povrchu silikagelu a) volné hydroxylové (silanolové) skupiny b) vicinální hydroxylové (silanolové) skupiny c) hydroxylové (silanolové) skupiny, poutající vodu vodíkovými vazbami d) siloxanové skupiny vznikající při vysokých teplotách
50
Povrch silikagelu je slabě kyselý, proto více zadržuje bazické látky než kyselé a
neutrální a může tak působit jejich chvostování. Tomu lze zabránit přídavkem slabé báze k
mobilní fázi.
Mezi metody adsorpční chromatografie bývá zařazována i afinitní chromatografie, o
které vzhledem k jejímu mimořádnému významu bude pojednáno podrobněji ve zvláštní
kapitole (kap.2.4).
Rozdělovací chromatografie probíhá v systému 2 nemísitelných nebo omezeně
mísitelných kapalných fází (LLC). Distribuce složek mezi tyto dvě fáze je určována
rozdělovacími koeficienty jednotlivých separovaných složek. Vzhledem k tomu, že v
průběhu rozdělovací chromatografie nedochází k vazbě rozpuštěných látek na některou z
fází, jde o proces jednostupňový (odpadá nutnost eluce).
Rozdělovací chromatografie je uspořádána tak, že jedna z kapalných fází je zakotvena
na inertní pevný nosič a stává se tak fází stacionární, zatímco druhá fáze - mobilní - přes tuto
přetéká. Látky ze separované směsi se rozpouštějí mezi obě fáze. Na pevný nosič se
zakotvuje fáze, která má k nosiči vyšší afinitu (na hydrofilní nosič vodná fáze, na hydrofobní
nosič nevodná fáze = chromatografie s reverzní fází). Nosič stacionární fáze nemá ovlivňovat
rozdělovací rovnováhu, tzn., že nesmí mít adsorpční vlastnosti. Ve skutečnosti však není
znám zcela inertní nosič a musí se počítat s konkurenčním vlivem adsorpce. Jako nosič
stacionární fáze se nejčastěji volí silikagel nebo křemelina a jejich chemicky modifikované
formy.
Chromatografie v systému kapalina-kapalina má řadu praktických nevýhod a proto je
tato technika vytlačena používáním kolon s různě chemicky vázanými stacionárními fázemi.
Mezi rozdělovací chromatografie můžeme zařadit i tzv. chromatografii s vázanou
fází. Na rozdíl od klasické chromatografie, kdy je stacionární fáze zakotvena na inertním
nosiči prostřednictvím krátkodosažných sil, při chromatografii s vázanou fází se stacionární
fáze na nosič naváže kovalentně. K tomu se používají specielně upravené nosiče (např.
chemicky modifikovaný silikagel).
Zvláštním případem rozdělovací chromatografie je i gelová chromatografie
(kap. 2.3.9).
Chromatografie na měničích iontů je chromatografie v systému kapalina-pevná látka
(LSC), jejíž pevnou fází je iontoměnič. Principem chromatografie na měničích iontů je dělení
51
směsí na základě odlišnosti elektrostatických sil, jimiž se látka váže na ionex. Stejně jako u
adsorpční chromatografie se jedná o dvoustupňový proces, neboť v první fázi se látky podle
velikosti náboje zachytí na ionex a ve druhé fázi musí být z ionexu vytěsněny.
Metody kapalinové chromatografie lze dále dělit na základě umístění pevné fáze na
chromatografii sloupcovou a chromatografii v plošném uspořádání (na tenké vrstvě-TLC a
papírová - PC).
Chromatografie v plošném uspořádání spočívá v tom, že sorbent má podobu tenké
vrstvy. V případě papírové chromatografie je sorbentem chromatografický papír, při TLC je
sorbent rozprostřen v tenké vrstvě.
Při TLC se chromatografický materiál rozestře v tenké vrstvě na desku z inertního
materiálu (sklo, aluminiová folie atd.), na desku se nanese vzorek (obvykle spolu se
standardy), deska se napojí na mobilní fázi, která pak přetéká přes fázi stacionární. Látka
nanesená na nosič je rozpuštěna ve stacionární fázi. Jakmile se mobilní fáze při průtoku
papírem či tenkou vrstvou dostane ke startu, část látky se rozpustí, ustaví se rovnováha a
přenese se na nosiči o kousek dále, kde se opět ustaví rovnováha mezi stacionární a mobilní
fází. Vlivem různě velkých distribučních konstant pro různé látky dojde i k jejich různé
migraci na nosiči a tudíž k jejich rozdělení. Látky více rozpustné ve stacionární fázi se budou
pohybovat pomaleji (menší RF), naopak látky s vyšší rozpustností ve fázi mobilní budou blíže
čelu (vyšší RF). Budou-li mít látky v daném rozpouštědlovém systému stejnou distribuční
konstantu, nerozdělí se a je třeba hledat jiný rozpouštědlový systém. V okamžiku, kdy čelo
mobilní fáze dojde na okraj desky, deska se vyjme, vysuší a separované látky se na desce
detegují. Nejčastěji se k tomu používá barevná reakce, specifická pro separované látky. Obr.2.24 Schema uspořádání tenkovrstvé chromatografie
52
Složité směsi, které se během jedné chromatografie nerozdělí, je možné rozdělit
dvojrozměrnou chromatografií (obr.2.26). Po proběhnutí chromatografie v jednom směru se
vysušený chromatogram otočí o 90o a chromatografie se nechá opět proběhnout s použitím
jiné soustavy rozpouštědel. Protože každá látka putuje v daném rozpouštědlovém systému
jinak, dojde při použití různých soustav k výraznějšímu oddělení jednotlivých složek směsi.
Chromatografie v plošném uspořádání se dnes již používá spíše jako prostředek
kvalitativního stanovení, tzn. k identifikaci látek ve směsi.
Obr.2.25 Tenkovrstvá chromatografie rostlinných lipidů. Neutrální lipidy (A), monogalaktosyldiacylglycerol (B), sterolglykosid (C), fosfatidylethanolamin (D), digalaktosyldiacylglycerol + fosfatidylglycerol (E), fosfatidylcholin (F), sulfoguinovosyldiacylglycerol (G), fosfatidylinositol (H)
53
Obr. 2.26 Schematické znázornění dvojrozměrné chromatografie
Běžnějším uspořádáním při chromatografických separacích je uspořádání kolonové
(sloupcové). Při tomto uspořádání je třeba mít vhodnou kolonu s náplní, zařízení pro regulaci
toku, detekční zařízení a popř. jímač frakcí. Při chromatografii v kolonovém uspořádání má
sorbent podobu sloupce. Po aplikaci vzorku na jeho horní část dochází vlivem toku mobilní
fáze k pohybu jednotlivých složek kolonou a k jejich separaci. Na výstupu by pak měly
jednotlivé složky z kolony vycházet již odděleně.
Z hlediska provozního můžeme chromatografické metody dělit podle pracovního
tlaku na chromatografii nízkotlakou, středotlakou (FPLC, asi do 3 MPa) a vysokotlakou
(HPLC, 7-20 MPa).
Podle použití lze rozdělit chromatografii na analytickou a preparativní. Liší se v
požadavcích na instrumentaci, kvalitu a výběr stacionární i mobilní fáze. Také cíl se liší. Při
preparaci směsi látek je obvykle snaha získat alespoň jednu z nich ve vysoké čistotě, při
analýze jde spíše o dobrou separaci a kvantifikaci jednotlivých složek směsi. V obou
případech však platí, že použití pouze jedné techniky může vést k nepravdivým výsledkům.
Proto je nutné kombinovat více postupů. Je-li smyslem práce analýza mohou se zvolit
ekonomicky náročnější podmínky, zejména kvalitnější stacionární a mobilní fáze. Při
preparaci je nutno vzít v úvahu, že látky je nutno izolovat v rozumném výtěžku a složky
mobilní fáze by měly být snadno odstranitelné.
Preparativní kolony mají vyšší kapacitu, čímž je umožněno aplikovat větší objemy
vzorku než na kolony analytické. Jestliže známe kapacitu pro analytickou kolonu, lze
odhadnout kapacitu kolony preparativní.
LC prep. = LC anal. . (ID prep. / ID anal.)2 . (Lprep./ Lanal.) (18)
LC = kapacita kolony ID = vnitřní průměr kolony L = délka kolony
Při převádění chromatografických postupů z laboratorního měřítka do preparativní
provozní formy (tzv. scaling - up) je třeba brát v úvahu řadu faktorů, které úspěšnost a
54
aplikovatelnost daného postupu ve výrobním procesu mohou ovlivnit. Zatímco v případě
laboratorních postupů jsou rozhodujícími kriterii výtěžek postupu a stupeň čistoty produktu,
při rozšiřování pro výrobní účely nelze opomenout i další hlediska jako např. ekonomiku
procesu, hygienu postupů, kontrolu prostředí apod.
Převádění purifikačních postupů, vypracovaných v laboratoři do provozních
podmínek však neznamená, že úměrně rozšíření dojde i ke zvýšení výtěžku procesu. Při práci
ve velkém měřítku se začnou objevovat i další faktory, jejichž vliv je možno v laboratorních
podmínkách zanedbat. Charakteristickým příkladem je snižování průtoku mobilní fáze v
důsledku stlačování chromatografické náplně. Proto jsou kladeny speciální nároky zejména
na výběr matrice resp. náplně kolony. Tradičně využívané náplně v laboratořích (agarosa,
dextrany, celulosa) nemají dostatečnou rigiditu a proto při velkých průtocích mobilní fáze
může docházet k porušení jejich struktury. Proto byly připraveny makroporezní prokřížené
nosiče
(Sepharose-CL, Sepharose Fast Flow atd.), určené pro práci ve větším měřítku, které jsou
vzhledem k lepším hydrodynamickým vlastnostem vhodné pro vyšší průtoky a tím i pro práci
v provozním měřítku. Náplň kolony musí být rovněž odolná vůči čistícím a sanitárním
postupům, které jsou nezbytné pro zajištění bezpečnosti a hygieny provozu např. ve
farmaceutickém průmyslu.
Výše zmíněným nežádoucím účinkům se alespoň částečně předchází vhodně
zvoleným uspořádáním kolon. V případě ionexové a afinitní chromatografie se uplatňují
kolony krátké a široké, které jsou většinou řazeny nad sebou (tzv. patrové uspořádání).
Naopak u gelové chromatografie, kde je pro úspěšnou separaci požadován dlouhý sloupec
chromatografické náplně, se kolony řadí vedle sebe.
Rovněž posloupnost purifikačních kroků se pro jednotlivá uspořádání liší. Např. při
práci v laboratoři, kde se pracuje s malými objemy vzorků je běžnou praxí provést úvodní
frakcionaci surového extraktu gelovou chromatografií. Jestliže se však pracuje s desítkami až
stovkami litrů extraktu, je vhodnější začít proces ionexovou chromatografií, během které
kromě částečné purifikace preparátu dochází i k redukci objemu vzorku.
Převádění purifikačního postupu do provozu je určováno konečným využitím
izolované látky. Ne vždy je třeba připravit absolutně homogenní preparát. V řadě případů
(např. u diagnostických činidel) je dostačující pouhé odstranění interferujících aktivit.
Naopak např. proteiny pro terapeutické účely musí být absolutně homogenní a nesmí
obsahovat žádné nebílkovinné kontaminanty (např. polysacharidové povahy).
55
2.3.4 Vysokoúčinná kapalinová kolonová chromatografie
I přes to, že kapalinová chromatografie je známa již od počátku tohoto století, teprve
koncem šedesátých let došlo k značnému rozvoji této techniky v moderní, vysokoúčinné
formě. Tak vznikly nové techniky: HPLC - vysokoúčinná (vysokotlaká) kapalinová
chromatografie a FPLC - středotlaká kapalinová chromatografie. Vysoké účinnosti a rychlosti
se dosahuje u těchto metod použitím kolon plněných náplněmi s velmi jemnými částicemi
(3-15 μm) a poměrně vysokých průtoků mobilní fáze. Vypracování těchto metod bylo
podmíněno vývojem nové vhodné přístrojové techniky, odolávající pracovním tlakům až
30-60 MPa. Toho bylo docíleno zejména použitím vysokotlakých čerpadel, kontinuálních
detektorů, dávkovacích systémů, umožňujících dávkování vzorku bez přerušení toku mobilní
fáze a dalších. Rovněž chromatografické materiály doznaly poměrně velkých změn. V
současné době jsou analýzy již zcela nebo alespoň částečně automatizovány, k čemuž
přispívá i použití integrátorů a počítačových systémů pro zpracování dat a vybavení
chromatografů řídícími mikroprocesory, které umožňují předem zvolit pracovní podmínky a
jejich změny během separačního procesu.
Nemalou měrou se na vývoji vysokoúčinné kapalinové chromatografie podílelo
zavedení chromatografického materiálu s chemicky vázanými fázemi, které umožňují vysoce
selektivní separace.
HPLC je typ kapalinové chromatografie, který umožňuje rychle a reprodukovatelně
detegovat nepatrné množství látek za současného kvalitativního vyhodnocení. Zahrnuje
soubor metod, založených na různých mechanismech separace. Společné všem těmto
metodám je však použití kapalné mobilní fáze (proto kapalinová) a vysokotlaké techniky
(proto vysokotlaká). Rovněž tyto metody lze dělit podle charakteru fází na chromatografii v
systému kapalina- kapalina a kapalina- tuhá látka.
Oproti klasickému provedení má HPLC řadu výhod: je rychlejší, účinnější, snadněji
se automatizuje, výsledky lze snadno kvantifikovat, lze provádět seriové analýzy apod.
Jednou z nejvýraznějších předností těchto technik je však zrychlení procesu.
56
2.3.5 Instrumentace sloupcových chromatografických metod
Nejčastějším uspořádáním při chromatografických separacích je uspořádání kolonové
(sloupcové). Vybavení pro tento typ chromatografie se velice liší podle typu chromatografie,
kterou budeme provádět.
Nejmenší nároky na vybavení klade nízkotlaká (gravitační) chromatografie (obr.2.27),
naopak vždy nákladné je zařízení pro HPLC (obr.2.28.). V dnešní době každá průměrně
vybavená laboratoř má k dispozici automatizovaná zařízení, která umožňují práci bez
neustálé přítomnosti obsluhy. Nejmodernější přístroje tohoto typu jsou již plně řízeny
počítačem a zaručují přesnou a rychlou práci.
Zařízení pro chromatografii obsahuje:
rezervoár mobilní fáze
dávkovač vzorku
kolony s chromatografickým materiálem
čerpadla popř. gradientový mixer
detektor
jímač frakcí
výstup analyzovaných dat
Kromě základních částí kapalinového chromatografu je možno použít řady
doplňkových zařízení, jako jsou ochranné filtry a předkolony, zařízení pro odplynění mobilní
fáze, dále je možno použít více detektorů apod.
57
Obr.2.27 Schema uspořádání kapalinové sloupcové chromatografie
Obr.2.28 Kapalinový chromatograf. (a) schema, (b) HPLC firmy Hewlett Packard 1- zásobník mobilní fáze, 2- vysokotlaké čerpadlo, 3- čidlo pro měření pracovního tlaku, 4- filtr, 5- průtočný tlumič pulsů, 6- zařízení pro nástřik vzorku, 7- chromatografická kolona, 8- termostat, 9- detektor, 10- zapisovač, 11- zařízení pro zpracování dat
Kapalinové chromatografy jsou koncipovány buď jako stavebnicové systémy, kde lze
velice snadno jednotlivé části vyměňovat, nebo jako kompaktní jednotky. Stavebnicové
58
chromatografy se používají zejména ve výzkumné oblasti, pro vývoj nových metod; zařízení
druhého typu se lépe hodí pro analýzy velkého množství vzorků, protože jsou méně náročné
na obsluhu.
V následující části budou podrobněji popsány jednotlivé části chromatografu.
Jako zásobník mobilní fáze většinou postačí skleněná láhev, kde dochází k odplynění,
filtraci a případné temperaci mobilní fáze. Před započetím chromatografie je nezbytné z
mobilní fáze odstranit vzduch, který by rušil jak vlastní separaci tak i detekci. Existují v
podstatě čtyři základní způsoby odplynění mobilní fáze: probublávání málo rozpustným
plynem (N2, He), zahřátí, sonikace a vakuové odplynění. V krajním případě (zejména u
nízkotlaké chromatografie) postačí několikaminutové odsávání vzduchu vývěvou.
U nízkotlaké chromatografie se tok mobilní fáze uskutečňuje buď samospádem na
základě rozdílu hydrostatického tlaku (pouze u gravitační chromatografie) nebo čerpadly.
Jako čerpadla pro nízkotlakou chromatografii se používají čerpadla peristaltická, neboť
tlakové pulsy, způsobené pístovým čerpadlem, by zhoršovaly průtočnost poměrně měkkých
chromatografických materiálů. Náročnější jsou čerpadla pro středotlakou a vysokotlakou
chromatografii, která musí především zajišťovat požadovaný konstantní tlak.
Čerpadla mobilní fáze pro HPLC musí splňovat poměrně náročné požadavky. V
první řadě musí být konstruována z materiálů odolných vůči korozi i při použití agresivních
mobilních fází (např. pufry, organická rozpouštědla). Jsou proto zhotovována zejména z
titanu a nerezové oceli. Použitelnost čerpadel, vyrobených pouze ze skla a teflonu je omezena
tlakem
3-10 MPa. Čerpadla musí být schopna dodávat v podstatě libovolnou mobilní fázi v rozmezí
tlaků cca 0-40 MPa při průtocích 0.1-10 ml/min. Vnitřní objem čerpadla musí být co
nejmenší, aby bylo možno rychle vyměnit mobilní fázi.
Vysokotlaká čerpadla lze dělit do dvou skupin na čerpadla pracující při konstantním
tlaku nebo konstantním průtoku. V současné době se téměř výhradně používají čerpadla
druhého typu. Z nich se pak nejvíce používají pístová čerpadla, v nichž se kapalina z malé
pístní komory (20 - 400 μl) vytlačuje a nasává přes dva zpětné ventily, z nichž sací je spojen
ze zásobníkem mobilní fáze a výtlačný s kolonou. Výhodou těchto čerpadel je možnost
čerpání mobilní fáze bez přerušení. Nevýhodou je pak zejména vznik tlakových pulsů. Ty
jsou alespoň částečně eliminovány buď zařazením tlumiče pulsů nebo zařazením většího
počtu čerpacích bloků, pracujících v opačné fázi. Pístová čerpadla se dvěma či třemi hlavami
se v současné době používají nejčastěji.
59
Ze zajištěním toku mobilní fáze souvisí i vytvoření vhodného gradientu. V nejjednodušším
případě (lineární gradient pro nízkotlakou chromatografii) si lze gradientový mixer (obr.2.29)
připravit i v laboratoři ze dvou navzájem propojených nádob stejného tvaru, z nichž jedna je
naplněna startovním eluentem a druhá eluentem finálním. Z nádobky ze startovním eluentem
se vede roztok na kolonu a jak roztok v této nádobce ubývá, doplňuje se podle zásady
spojených nádob roztokem z nádobky druhé. Tak se plynule mění složení eluentu.
V komerčně dodávaných systémech pro HPLC a FPLC je tvorba gradientu
realizována prostřednictvím čerpadel. Zařízení pro tvorbu gradientu u HPLC lze rozdělit do
dvou skupin. Buď dochází ke smíšení složek mobilní fáze před vstupem do vysokotlakého
čerpadla. Druhou skupinu tvoří čerpadla, kdy každá složka mobilní fáze je dávkována
vlastním čerpadlem do malé směšovací komůrky před kolonou. Tohoto způsobu se však
vzhledem k ceně čerpadel využívá pouze pro tvorbu dvousložkového gradientu. K
programování složení gradientu se dnes používá řídící jednotka, která je součástí většiny
moderních kapalinových chromatografů.
Obr.2.29 Gradientový mixer
Zařízení pro dávkování a nástřik vzorku je nejjednodušší opět pro nízkotlakou
chromatografii, kde se obvykle vystačí s injekční stříkačkou. Někdy se před kolonu zařazuje
trojcestný kohout, který usnadní aplikaci vzorku. U středotlakých a vysokotlakých systémů
se používá automatických dávkovačů, jimiž jsou přístroje vybaveny. Zejména u HPLC může
zařízení pro dávkování vzorků na kolonu velice výrazně ovlivnit účinnost separačního
procesu. Existují tři odlišné způsoby dávkování vzorku na kolonu:
- Přímý nástřik vzorku na kolonu injekční stříkačkou přes septum bez přerušení toku
mobilní fáze nebo bez použití septa, kdy je třeba průtok kolonou zastavit. Oba tyto způsoby
však nepříznivě ovlivňují reprodukovatelnost nástřiku a proto se používají žřídka.
60
- Nástřik vzorku prostřednictvím ventilu se smyčkou bez přerušení toku mobilní fáze.
Podle konstrukce dávkovačů lze dávkovat na kolonu buď pouze objem, který je dán vnitřním
objemem smyčky dávkovače nebo je možno naplnit jenom část smyčky a tím měnit
dávkovaný objem.
- Dávkování vzorku pomocí automatických dávkovačů je vhodné zejména tam, kde se
provádí seriové analýzy velkého množství vzorků. Dávkovač se skládá ze zásobníku s
malými nádobkami se vzorky, které se před každým nástřikem posunou pod injekční
stříkačku dávkovače. Obvykle lze naprogramovat počet nástřiků každého vzorku, objem
nástřiku, dobu analýzy apod.
U dávkovaných vzorků je třeba dbát na to, aby byly dokonale rozpuštěny, nejlépe v
rozpouštědle stejného složení jako používaná mobilní fáze.
Kolona s chromatografickým materiálem je jednou z nejdůležitějších částí zařízení.
Kolony musí splňovat určité požadavky, důležitá je nejen náplň kolony a velikost částic
chromatografického materiálu, ale i její rozměry. Kolony, používané při biochemických
separacích jsou konstruovány ze skla nebo plastu tak, aby separované látky nepřicházely do
styku s kovem. Spodní konec kolony je opatřen fritou, aby náplň kolony nevytékala ven.
Kolona je ukončena připojením hadiček, kterými se eluát odvádí přes detektor do jímače
frakcí (obr.2.30).
Rozměry kolon pro nízkotlakou chromatografii se pohybují v rozmezích 0.6-6 cm
vnitřního průměru a 50-200 cm délky. Zrnění sorbentů je poměrně hrubé 120-200 μm a to
zejména proto, aby bylo dosaženo optimální rychlosti průtoku mobilní fáze. Rozměry kolon
jsou voleny podle množství vzorku, jež má být podroben separaci. Větší rozměry kolony a
hrubší zrnění sorbentu způsobují horší rozlišení a nižší účinnost.
Chromatografické kolony pro účely HPLC se podle použití dělí na analytické,
preparativní a mikrokolony. Analytické kolony jsou většinou vyrobeny z nerezavějící oceli a
mají obvykle průměr okolo 4 mm při délkách 30, 100 a 250 mm, Tyto kolony jsou plněny
porovitými náplněmi s částečkami o průměru 3-10 μm. Po mechanické stránce musí být
kolony odolné vůči používaným tlakům, musí být inertní a mít hladký vnitřní povrch.
Delších kolon s průměrem řádově v cm se používá v preparativní chromatografii, kde
je cílem izolace rozdělených látek po předchozí separaci. Preparativní chromatografii lze
provozovat, i když s jistými obtížemi, i na běžném analytickém zařízení.
Mikrokolony (vnitřní průměr menší než 1 mm) mají rovněž své výhody jako např.
malá spotřeba vzorku, mobilní fáze, sorbentu atd. Přesto se jejich použití příliš nerozšířilo, a
61
to zejména proto, že vyžadují specielní konstrukci celého zařízení a tím se ztrácí
univerzálnost HPLC.
Materiály pro plnění kolon jsou většinou založeny na anorganické matrici (silikagel)
na níž mohou být chemicky vázané nebo zakotvené různé stacionární fáze.
Speciální analytické kolony, tzv. sekcionované, jsou určeny pro analýzu složitých
směsí látek. Je to systém kolon naplněných různými sorbenty, což umožňuje separaci na
základě různých principů. Za zmínku stojí i použití tzv. radiálně popř. axiálně
komprimovaných kolon v preparativní chromatografii. Jde o kolony, u nichž účinkem
radiální resp. axiální komprese dochází k minimalizaci mrtvého prostoru mezi jednotlivými
částicemi a tím i ke zvýšení účinnosti separace.
62
Obr.2.30 Chromatografické kolony a) schematické znázornění b) komerčně dodávané firmami
Eluát vytékající z kolony je veden přes detektor, který monitoruje jeho složení na
zapisovač. Získaný signál z detektoru je po příslušné úpravě (zesílení nebo zeslabení)
zaznamenán graficky. Tím se získá chromatografický záznam, který umožňuje kvalitativní a
kvantitativní zhodnocení analyzované směsi. Do nedávna byl nejběžnějším záznamovým
zařízením obyčejný zapisovač. Je-li záznam konečným výstupem, provádí se vyhodnocení
chromatogramu manuálně. Pro přesnější a rychlejší vyhodnocení se používá integrátorů,
které bývají spojeny s počítačem. Nevýhodou jednoúčelového integrátoru je, že není možno
data uchovávat a porovnávat. Proto se pro sběr a vyhodnocování dat stále častěji využívá
osobních počítačů s odpovídajícím programovým vybavením.
V případě, že je třeba se vzorky dále pracovat, ať již z důvodů analytických nebo
preparativních, je třeba jako koncovou jednotku zařadit jímač frakcí, který jímá odděleně
jednotlivé frakce podle zadaných požadavků (např. objem frakce vyjádřený počtem kapek,
čas apod). Získané frakce je většinou třeba podrobit dalším analýzám a proto mohou být
napojovány on-line další analyzátory např. enzymové.
Mezi další přídavná resp. pomocná zařízení, používaná ve většině přístrojů patří např.
termostatovaný plášť, umožňující pracovat při předem zvolené konstantní teplotě. Další
běžně používanou součástí systémů jsou malé ochranné předkolonky, plněné sorbentem
stejného nebo podobného typu jako je náplň kolony. Úkolem je zachycovat nečistoty, které
by mohly analytickou kolonu ucpávat nebo jinak znehodnocovat.
2.3.6 Detekce separovaných látek
Detekční zařízení používaná v kapalinové chromatografii jsou nejrůznějšího druhu a
jejich volba závisí na druhu separovaných látek. Detektory v chromatografii mají za úkol
zaznamenat rozdíl mezi průchodem čisté mobilní fáze a mobilní fáze obsahující eluovanou
složku.
63
Detektory se klasifikují podle časové závislosti odezvy na integrální a diferenciální.
Integrální detektory poskytují odezvu úměrnou celkovému množství nebo koncentraci látky
prošlé detektorem od začátku až do daného okamžiku (obr.2.31a), kdežto diferenciální
detektory dávají odezvu odpovídající okamžité koncentraci nebo množství detegované složky
v detektoru (obr.2.31b). Obr.2.31 Chromatogram (a) integrální, (b) diferenciální
Další dělení detektorů na destruktivní a nedestruktivní bere v úvahu případnou změnu
detegované látky během detekce.
Třetí způsob klasifikace rozeznává detektory koncentrační a hmotnostní.
Koncentrační detektory reagují na změnu hmotnostní koncentrace složky dc/dV nezávisle na
přívodu složky do detektoru. Hmotnostní detektory naproti tomu reagují na změnu rychlosti
přívodu detegované látky dm/dV do detektoru. V biochemických separacích se nejčastěji
používají ty, které jsou založeny na měření absorpce v UV oblasti, refraktometrický detektor
apod.
Detektory používané dnes v HPLC jsou téměř výhradně detektory koncentrační. Je
možno říci, že neexistuje universální detektor pro HPLC a různé typy detektorů se
jednotlivým požadavkům pouze přibližují.
V současné době je nejvíce využíván UV detektor ať už s pevnou nebo proměnnou
vlnovou délkou. Jeho dalším vývojem vznikl detektor s diodovým polem (DAD), který
každých 10 ms snímá celé UV spektrum. Výsledkem je tedy trojdimensionální chromatogram
64
(čas, absorbance, vlnová délka). Takto získaná data již umožňují identifikaci látek, k
dispozici je jak retenční čas tak i UV spektrum.
Refraktometrický (RI) detektor sice umožňuje detekci prakticky všech látek,
vyznačuje se však nižší citlivostí a vyššími mezemi detekce než detektory
spektrofotometrické, fluorescenční či elektrochemické. RI detektor poskytuje odezvu
úměrnou rozdílu indexů lomu eluátu v měrné cele a srovnávací kapaliny (čistá mobilní fáze)
v cele referenční. Odezva detektoru je značně závislá na teplotě.
Vodivostní detektor je po RI detektoru dalším nejčastěji používaným detektorem.
Měří elektrickou vodivost eluátu vytékajícího z kolony mezi dvěma elektrodami v průtokové
cele.
Fluorescenční detektor je vysoce selektivní a citlivý a poskytuje odezvu pro látky
vykazující fluorescenci. Detegovaná látka absorbuje ultrafialové excitační záření, jehož
pohlcená energie se zčásti vyzáří ve formě fluorescenčního záření o vyšší vlnové délce než
má záření excitační. Emitované záření dopadá na fotonásobič, který poskytuje proud úměrný
toku emitovaného záření a koncentraci detegované látky.
Ostatní typy detektorů jako např. elektrochemické a radiometrické se používají pro
speciální aplikace.
Velice významné je použití HPLC ve spojení s tzv. post-kolonovými detektory např.
enzymovými, které jsou schopny ve složitých směsích bílkovin najít pouze požadovaný druh
enzymu.
V současné době je velice prosazováno, a pro moderní výzkum je nezbytné, spojení
chromatografických technik s některou ze spektrálních metod. Důvodem je značné množství
informací pro identifikaci složek, které poskytují právě spektrální metody. Jedná se např. o
spojení kapalinové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (LC/MS). Hmotnostní
spektrometry napojené přímo na výstup z kolony umožňují snímat hmotnostní spektra
separovaných látek během eluce, což je důležité pro strukturní analýzu a identifikaci látek ve
složitých směsích. Přímé spojení LC/MS však naráží na značné technické potíže (mnohem
větší než v případě GC/MS) a proto není tato technika dosud příliš rozšířena. Hlavním
problémem je odstranění kapalného eluentu při zavádění do hmotnostního spektrometru,
který pracuje za vysokého vakua (10-2-10-5 Pa). I přes to, že řada chromatografických firem
se s touto překážkou již alespoň částečně vypořádala, většímu rozšíření této techniky v praxi
brání poměrně vysoká cena zařízení.
65
Další systémy využívající spojení kapalinové chromatografie s jinými analytickými
metodami jsou např. LC/NMR, LC/FTIR (infračervená spektroskopie), LC/UV-VIS. Každá z
těchto metod má jistě své výhody i nevýhody, ale s rozvojem techniky i poznatků budou jistě
odstraněny i problémy, zatím bránící jejich širšímu využití.
2.3.7 Aplikace HPLC
Intenzivní výzkum v oblasti přírodních látek, zejména v biochemických aplikacích,
vyžaduje nejen dokonalou separaci, ale i např. identifikaci a stanovení jednotlivých optických
izomerů. Ukazuje se totiž, že biologická aktivita, toxicita nebo terapeutické účinky
jednotlivých optických izomerů se značně liší a jejich aplikace je proto závislá na možnosti
jejich separace.
Na běžných stacionárních fázích používaných v HPLC je separace těchto látek
nedokonalá nebo v krajním případě k rozdělení vůbec nedochází. Dříve bylo nutno racemát
rozdělit chirálním činidlem, což bylo spojeno s řadou nevýhod. Proto byla zavedena
chromatografická technika s využitím tzv. chirálních fází. Přítomností opticky aktivní látky
ve stacionární nebo mobilní fázi dojde k interakci daného optického izomeru obsaženého ve
vzorku a tím i ke zvýšení retence na koloně. Např. pro separaci D- a L-aminokyselin se
přidává do nevodné mobilní fáze N-acetyl-L-valin. Chirální fáze se nejčastěji používají v
analýze cukrů, aminokyselin, peptidů, řady léčiv přírodního i syntetického původu apod.
HPLC nachází široké uplatnění také např. v analýze peptidů a bílkovin. Rozvoj
metod HPLC analýzy umožnil i další rozvoj postupů sekvenčního odbourávání bílkovin a
peptidů. Díky této metodě je možno snížit množství potřebného polypeptidového materiálu
až pod hranici 10 pmol a automatizovat nejen odbourávací postupy, ale i jejich analytické
vyhodnocování.
HPLC a FPLC bílkovin má velký význam v potravinářské kontrole a výrobě.
Především umožňuje rychlé analytické odlišení různých bílkovin. Tak jako se mohou lišit
chromatografické profily sérových bílkovin u různě postižených pacientů, tak je možné také
činit závěry o různých potravinářských bílkovinných produktech a procesech. Otevírá se
např. možnost odlišit suroviny, meziprodukty a produkty podle původu, odhadnout jejich
stáří, postihnout různé kontaminace apod. Velikou výhodou je o jeden až dva řády větší
rychlost těchto analýz ve srovnání s klasickou kapalinovou chromatografií. Tato rychlost
66
umožňuje průběžnou kontrolu nejrůznějších fermentačních procesů při výrobě potravin. To
dříve nebylo možné, protože se analyzovaly pouze hotové produkty.
Spojení separace pomocí HPLC s post-kolonovými enzymovými detektory je
výhodné při analýze izoenzymů pro lékařskou diagnostiku, neboť změny ve vzájemných
poměrech izoenzymů indikují chorobné stavy.
Možnost rychlé specifické detekce násobných forem enzymů má velký význam pro
kontrolu kvality výrobních procesů a skladování. Je známo, že počáteční limitovanou
proteolýzou řada enzymů neztrácí svou aktivitu, ale mění svou elektroforetickou nebo
chromatografickou mobilitu.
Další aplikace jsou umožněny spojením chromatografických technik se spektrálními
metodami, které jsou popsány v kap.2.3.6.
2.3.8 Iontová chromatografie
Využití kapalinové chromatografie pro dělení a stanovení anorganických iontů je
známé již několik desítek let. Klasické metody dělení na měničích iontů však jsou pracné a
časově náročné a proto se v analytické praxi příliš nerozšířily. Zlom ve využívání kapalinové
chromatografie nastal, když se iontově výměnnou chromatografii podařilo převést do
moderní instrumentální podoby. Jde tedy o iontově výměnnou chromatografii pomocí HPLC
instrumentace.
Pojem iontová chromatografie (Ion Chromatography, IC) v současné době zahrnuje
techniky separace organických a anorganických iontů jako je chromatografie aniontů
(obr.2.32a), chromatografie kationtů (obr.2.32b), chromatografie iontových párů,
chromatografie chelátů apod.
Pro tuto metodu lze použít libovolného kapalinového chromatografu, potřebná je
pouze specielní kolona pro iontovou chromatografii. Nutná je vhodná volba typu a
koncentrace elučního činidla tak, aby při dané kapacitě kolony nebyla překročena hranice
možné kompenzace nulové linie u použitého detektoru.
Detekce
67
Pro široké uplatnění kapalinové chromatografie byla nezbytná metoda kontinuální
detekce rozdělených iontů za kolonou. Problémem v chromatografii iontů je, že je nutné
detegovat ionty nikoliv samotné, ale ve směsi s ionty elučního činidla, které mají obvykle
podobné vlastnosti.
V současné době se používají specielní vodivostní detektory, které dodává řada firem
buď samostatně nebo jako součást jednoúčelového iontového chromatografu. Kromě této
metody, která je více méně neselektivní a tím použitelná pro většinu aniontů, lze v řadě
případů s výhodou použít selektivních metod, které umožňují detekci pouze určité skupiny.
Patří sem např. přímá fotometrická detekce v oblasti 210 nm, kdy lze stanovit např. bromidy,
dusitany, dusičnany v přítomnosti rušivých přebytků ostatních iontů (chloridů, síranů,
fosforečnanů). Dále je možno využít elektrochemickou detekci, případně metody specifické
pro určité prvky (fosfor, síru apod.).
Sorbenty
Kolony určené pro iontovou chromatografii, zejména pro chromatografii aniontů, jsou
dodávány řadou firem.
Jako matrice se používá buď silikagel nebo polymerní gely na bazi polystyrenu,
případně akrylátů. Sorbenty na silikagelové matrici mají většinou vynikající účinnost,
nevýhodou je však jejich omezená použitelnost při vyšším pH, nelze je tedy použít pro
analýzu aniontů velmi slabých kyselin.
Obecným problémem všech kolon pro iontovou chromatografii je jejich nízká
životnost, kde zvláště u polymerních kolon může dojít k jejich rychlému znehodnocení.
Jednou z častých příčin je zanesení kolony mikroorganismy. Je tedy nezbytně nutné používat
pouze čerstvě filtrované roztoky, vhodné je rovněž používání předkolon, případně občasná
sterilizace systému promytím zředěnou kyselinou dusičnou.
Aplikace
68
Mezi nejčastější aplikace patří stanovení anorganických iontů ve vodách a jiných
materiálech. Zajímavou aplikací je stanovení stopových koncentrací chloridů v napájecích
vodách parních okruhů elektráren. Důležité je i stanovení dusičnanů v poživatinách.
69
Obr.2.32 Iontová chromatografie. Stanovení některých (a) aniontů, (b) kationtů 2.3.9 Gelová permeační chromatografie
Gelová permeační chromatografie, též gelová chromatografie, gelová filtrace nebo
chromatografie na principu molekulového síta, je metoda při které se separují molekuly podle
velikosti a tvaru. Pomocí gelové chromatografie je možno separovat jakékoliv molekuly,
lišící s svými rozměry, pokud se dobře rozpouštějí v některém rozpouštědle. Největší využití
tato metodika nachází v analýze makromolekulárních látek a v biochemii.
Jde o typ rozdělovací chromatografie v systému kapalina - kapalina, kde stacionární
fází je kapalina, zakotvená v gelu (inertní polymerní nosič), čímž je zajištěna nemísitelnost s
mobilní fází. Stejná kapalina pak tvoří mobilní fázi, tzn. kapalinu, protékající mezi částicemi.
Částice gelu mají kulovitý tvar a obsahují póry o známé velikosti. Gel by neměl obsahovat
žádné specificky ani nespecificky adsorbující skupiny nebo skupiny nesoucí náboj a měl by
prokazovat různý stupeň prostupnosti k jednotlivým složkám mobilní fáze. Prostupnost
částice gelem je závislá na velikosti prostupující molekuly, ale také na vnitřní architektuře
gelu.
Princip gelové chromatografie (obr.2.34)
Jestliže je nanesena na sloupec gelu směs látek o různé velikosti molekul, její pohyb
gelem závisí na průtoku mobilní fáze a na Brownově pohybu, který vykonávají molekuly
směsi a který odpovídá za jejich difuzi dovnitř a ven ze stacionární fáze. Separace složek
směsi je tedy dána schopností separovaných molekul procházet póry stacionární fáze.
Jednotlivé molekuly jsou zpomalovány úměrně své schopnosti prostupovat částicemi gelu.
Současné představy předpokládají, že póry jsou poměrně nepravidelné a rozhodujícím
kriteriem není objem pórů, ale dostupnost částí jednotlivých pórů (obr.2.33).
70
Obr.2.33 Omezená přístupnost nepravidelného póru
Molekuly, které jsou tak veliké, že neprojdou póry gelu, zůstávají v intersticiální
kapalině a eluují se z gelu současně s touto kapalinou (tedy nejrychleji). Malé molekuly
mohou difundovat do gelových částic. Uvnitř gelových částic neprobíhá výsledný průtok
vůbec a pokud jsou molekuly uvnitř částic gelu, nejsou proudem kapaliny unášeny. Jakmile
však difuzí proniknou vně, jsou opět neseny proudem kapaliny do jiné gelové částice. Difuzí
do gelových částic a naopak pak molekuly postupují chromatografickou náplní, avšak nižší
rychlostí než velké molekuly. Malé molekuly jsou tedy zpomalovány více než velké a
jednotlivé složky směsi se uvolňují ze sloupce v pořadí klesající velikosti molekuly (nebo
klesající relativní molekulové hmotnosti).
Obr.2.34 Schematické znázornění gelové filtrace. (a) Kulička gelu obsahuje gelovou matrici (silné vlnovky), která obklopuje vnitřní objem kapaliny. Malé molekuly (malé body) mohou volně procházet do vnitřního objemu kuliček, zatímco větší molekuly (větší plné body)
71
jsou příliš velké na to, aby pronikaly do pórů gelu.(b) Vzorek směsi dělených látek proniká do sloupce gelu. (c) Menší molekuly pronikají do gelu a pohybují se tak sloupcem nosiče pomaleji než molekuly větší, které se do gelu nedostanou. (d) Větší a menší molekuly vycházejí z kolony a jsou jímány odděleně. (e) Diagram úplného chromatografického rozdělení dvou látek, z nichž ta větší je eluována jako první.
Gelová chromatografie se nejčastěji provádí v systému voda - voda. K tomu se
používají hydrofilní gely, obvykle hydratovaný prokřížený dextran nebo polyakrylamid
(obr.2.35).
Obr.2.35 (a) Prokřížený polyakrylamid (Bio Gel P), (b) prokřížený dextran (Sephadex)
Na hydrofilních gelech se frakcionují peptidy, oligosacharidy, nukleotidy, bílkoviny,
enzymy, nukleové kyseliny a viry. Byly však připraveny i gely, které umožňují provádět
gelovou chromatografii v systémech organických rozpouštědel. Jsou to lipofilní materiály
typu prokříženého polystyrenu, na nichž se separují zejména syntetické organické polymery.
V současné době se vyrábějí i materiály, které tvoří gely ve vodném i nevodném prostředí a
je tedy je možno použít pro oba výše uvedené typy gelové chromatografie. Jde obvykle o
72
hydrofilní matrice s hydrofobními řetězci, jako např. hydroxypropylether prokříženého
dextranu apod.
Materiály
Pro gelovou chromatografii se používají tři typy gelů (obr.2.36).
Obr.2.36 Architektura gelů. (a) xerogel, (b) aerogel (silikagel), (c) aerogel (porezní sklo), (d) hybrid (agarosový gel), (e) hybrid (makroretikulární polystyren)
Xerogely jsou klasické gely, skládající se z lineárních řetězců, které jsou propojeny
křížovými vazbami nebo fyzikálními interakcemi. Gel má tedy trojrozměrnou strukturu
solvatovaných polymerních řetězců. K tvorbě gelu však dochází pouze v některých
rozpouštědlech.
Typickými představiteli jsou dextranové gely (Sephadexy), polyakrylamidové gely
(Bio-Gel P), polystyreny (Bio-Beads S) a polyakrylomorfolinový gel (Enzacryl Gel).
Aerogely vlastně nejsou gely v pravém slova smyslu. Skládají se z pevné (rigidní)
matrice, obsahující póry, které jsou v suchém stavu naplněny vzduchem. Při naplnění kolony
rozpouštědlo vytěsní vzduch z pórů gelu, přičemž vlastní matrice nebotná. Tento typ gelu je
tvořen v libovolném rozpouštědle. Přestaviteli jsou např. porézní silica nebo porézní sklo.
73
Xerogely- aerogely jsou hybridy obou předchozích forem a mají tedy rysy obou
skupin. Jejich polymerní matrice mívá semirigidní strukturu, která se pouze minimálně
rozpouští při tvorbě gelu. Do této skupiny patří především agarosové gely (Sepharose,
Gelarose), polystyreny s křížovými vazbami (Styragel).
Xerogely tvořící polymery mají schopnost botnat až na mnohonásobek svého
původního objemu. Jsou velmi měkké a stlačitelné a mohou se používat jen při malých
průtokových rychlostech. Pro rychlé separace se lépe hodí aerogely s hybridy, které nejsou
stlačitelné. Nevýhodou xerogelů je též jejich neprostupnost pro značně velké molekuly. To je
dáno vzdáleností řetězců v solvatované matrici. U aerogelů a hybridů závisí prostupnost
pouze na velikosti pórů.Výhodou xerogelů oproti druhé skupině je vysoký kapacitní poměr
(poměr eluentu uvnitř gelových částic ku eluentu vně gelu), 2:1. U aerogelů a hybridů bývá
tento poměr 1:1. V praxi znamená vyšší kapacitní poměr též vyšší účinnost kolony. Při
zdvojení kapacitního poměru se pro danou separaci zkracuje délka sloupce 4x.
Některé materiály pro gelovou chromatografii jsou uvedeny v tab.2
Tabulka 2 Materiály pro gelovou chromatografii
74
Charakteristické veličiny
V gelové chromatografii se užívají pojmy odlišné od elučních charakteristik
uváděných v teorii LC, a to proto, že pojem stacionární fáze může být chápán dvojím
způsobem. Buď je jím myšlena pouze kapalina, zakotvená v gelových částicích, objem
stacionární fáze je pak označován jako Vi, nebo je myšlen celý objem gelu označovaný jako
Vs (obr.2.37).
Obr.2.37 Definice Vo, Vt a Vt -Vo
Gelová chromatografie je zvláštní typ rozdělovací chromatografie. Pro každou
rozdělovací chromatografii, která se provádí bez eluce gradientem platí, že:
K = (Ve - Vo) / Vs (19)
K = rozdělovací koeficient látky vůči stacionární fázi Ve = eluční objem Vo = objem kapaliny v intersticiálním prostoru mezi částicemi gelu Vs = objem stacionární fáze
Jestliže pokládáme za stacionární fázi celou gelovou fázi (gel plus zakotvená
kapalina) pak platí vztah
Vs = Vt - Vo (20)
Vt = celkový objem chromatografické kolony Vo = objem kapaliny v intersticiálním prostoru mezi částicemi gelu
75
Při gelové chromatografii je rozdělovací koeficient K určován především stérickými
zábranami. Malé molekuly, které mohou pronikat do gelu, mají hodnoty K blízké 1, zatímco
velké molekuly, které nemohou pronikat do gelových částic mají K=0. Tyto extrémní
hodnoty odpovídají elučním objemům Vt, což je celkový objem chromatografické kolony a
Vo. Větší eluční objemy než Vt pak naznačují přímou interakci mezi rozpuštěnou látkou a
gelovou matricí. Takovou interakci lze pozorovat např. u aromatických sloučenin na
dextranových gelech ve vhodných rozpouštědlech.
K charakterizaci chování rozpuštěné látky se užívá těchto parametrů:
Eluční objem - Ve - je primární proměnná veličina, která se dá vypočítat z elučního
diagramu. Je to tedy objem mobilní fáze, který je třeba k přenesení určité molekuly
chromatografickou náplní. Eluční objem je definován jako
Ve = Vo + KD. Vi (21)
kde KD je konstanta určité látky pro daný typ gelu a je nezávislá na délce gelového sloupce,
závisí však na velikosti a tvaru gelu. Protože pro velké molekuly, které nemohou pronikat do
gelu, je KD=1 platí tedy, že Ve = Vo + Vi .
Pro srovnáváná různých chromatografických experimentů se užívá dvou relativních
vyjádření elučního objemu, a to Ve/Vo a Ve/Vt . Tyto hodnoty nejsou závislé na objemu
chromatografické kolony, avšak kolísají podle poměru plnidla. Převrácená hodnota výrazu
Ve/Vo se nazývá retenční konstanta R.
Pro vzorky o malých a středních objemech, které nedávají eluční křivku s prodlevou,
je eluční objem roven objemu, který je eluován od okamžiku, kdy byla nanesena polovina
vzorku, k maximu elučního vrcholu. Pro velké objemy nanášených vzorků, kdy se tvoří
prodleva v eluční křivce, je eluční objem roven objemu mezi počátkem nanášení vzorku a
inflexním bodem elučního vrcholu (obr.2.38).
76
Obr.2.38 Měření elučního objemu Ve
Protože eluční objem závisí na objemu chromatografické náplně a na poměru plnidla,
není vhodným parametrem pro srovnání výsledků z různých chromatografických kolon.
Rozdělovací koeficient - K. Podle toho jak definujeme stacionární fázi je pak K
definován jako
Kav = (Ve-Vo) / (Vt-Vo) (22)
v případě, že za stacionární fázi pokládáme celkový objem gelové fáze
nebo jako
KD = (Ve-Vo) / Vi (23)
kdy jako stacionární fáze je považována pouze kapalná složka gelové fáze o objemu Vi
Hodnota rozdělovacího koeficientu se pohybuje od nuly (pro molekuly tak velké, že
neprojdou do částic gelu) do jedné (pro molekuly schopné pronikat do gelu stejně snadno
jako molekuly rozpouštědla). KD je přesnější pro malé molekuly (tj. s velkým Ve). V případě
rozdělovacího koeficientu Kav závisí jeho maximální hodnota na typu gelu a ani pro velmi
malé molekuly se nedosahuje hodnoty 1. Malé molekuly jsou proto hůře identifikovatelné. V
případě, že hodnoty rozdělovacího koeficientu leží mimo interval 0-1, pak došlo k odchylkám
od ideálního chování při gelové chromatografii. Znamená to, že separace byla ovlivněna
jinými faktory než tvarem a velikostí molekuly. K odchylce od standartního chování může
dojít i tehdy, jestliže je tvar molekul velmi odlišný od standardu.
77
Pro dobrou separační práci je třeba vybrat takový chromatografický materiál, na němž
se hodnoty rozdělovacích koeficientů pro jednotlivé komponenty budou od sebe co nejvíce
lišit.
Na úspěšnost separace má vliv i volba vhodného gelu, kdy je třeba brát v úvahu tzv.
frakcionační rozsah gelu. Je to rozmezí molekulových hmotností nebo velikosti molekul, v
němž změna molekulové hmotnosti nebo změna velikosti molekul způsobuje změnu v
elučním objemu. Pod frakcionačním rozmezím molekuly penetrují do gelu bez zábrany. To
odpovídá elučnímu objemu blízkému Vt. Nad frakcionačním rozmezím jsou molekuly zcela
vyloučeny v závislosti na elučním objemu Vo. Frakcionační rozsah gelu závisí na hustotě
gelové matrice. Nejhustší gely mají frakcionační rozsah dosahující molekulové hmotnosti až
asi 1000, kdežto gely pro frakcionaci při velmi vysokých molekulových hmotnostech (s
velkými póry) mají frakcionační rozsahy blížící se molekulové hmotnosti několika milionů.
Horní mez frakcionačního rozsahu se označuje jako mez vyloučení.
Gely s úzkým frakcionačním rozsahem se hodí pro separace méně složitých směsí.
Pro složitější směsi je třeba použít gely s širokým frakcionačním rozsahem. Zvláště v
případě separace látek s blízkými hodnotami relativní molekulové hmotnosti je třeba pečlivě
volit gel podle frakcionačního rozsahu. Volba nevhodného typu gelu vede k tomu, že se
požadované látky eluují s elučními objemy blízkými vnějšímu objemu Vo nebo elučnímu
objemu solí. V těchto oblastech je pak selektivita dělení obvykle neuspokojivá.
Vzhledem k tomu, že se frakcionační rozsahy gelů vzájemně překrývají, může být
obvykle pro separaci určité látky použito více typů gelů. V tom případě se doporučuje použít
gel s nižší vylučovací mezí, protože požadované látky budou eluovány z kolony dříve. Kromě
toho z gelů stejného chemického složení budou gely s nižší vylučovací mezí rigidnější, což
umožní větší volnost při volbě průtokové rychlosti.
Hlavním úkolem gelové chromatografie je dosáhnout dokonalé separace látek ze
směsi. Dobrého rozlišení lze pak dosáhnout volbou vhodných experimentálních podmínek, tj.
typem gelu, velikostí částic, rozměry sloupce gelu, objemem vzorku a průtokovou rychlostí.
Stupeň rozlišení se posuzuje z velikosti rozlišovacího koeficientu Rs.
Rs = vzdálenost mezi separovanými zonami / šířka zon
78
Obr.2.39 (a) Vztah rozdělovacího koeficientu a relativní molekulové hmotnosti globulárních bílkovin na různých typech Sephadexu. (b) Výběr gelu pro gelovou chromatografii podle frakcionačního rozsahu. Jde o dělení katalasy (Mr= 2,3.105) a fosfoglyceromutasy (Mr=6,4.104). Mr těchto enzymů leží mimo frakcionační rozsah gelů C a D, ale mohou být separovány na gelech A a B.
Maximálního rozlišení je dosahováno na dlouhých kolonách s nízkým průtokem,
ovšem tento požadavek je v rozporu s požadavkem na krátké doby trvání pokusu. Mezi
těmito požadavky je třeba volit určitý kompromis. Je třeba počítat i s tím, že při vyšším
průtoku roste pracovní tlak, při němž se málo rigidní gely stlačují a průtoková rychlost začne
klesat.
Při gelové chromatografii tedy závisí oddělení látek jednak na rozdílu elučních
objemů jednotlivých vrcholů na elučním diagramu, jednak na šířce jednotlivých vrcholů. Jak
oddělení jednotlivých vrcholů navzájem, tak jejich šířka jsou úměrné délce sloupce gelu.
Vzdálenost mezi jednotlivými vrcholy vzrůstá úměrně s délkou sloupce a šířka zon vzrůstá
přibližně úměrně s druhou odmocninou délky sloupce. Proto rozlišovací schopnost vzrůstá
přibližně úměrně s druhou odmocninou délky sloupce. Efektivní délku sloupce je možno
79
zvýšit recyklováním vzorku na téže koloně nebo užitím serie kolon. Pro dokonalé rozlišení je
třeba použít delší kolony s menším průměrem. Pro analytické účely obvykle postačí objem
náplně
50 ml nebo méně. Jestliže je však průměr sloupce velmi malý, je třeba počítat se vzlínáním
kolem stěny kolony. Naopak při velkých průměrech dochází k velkému naředění
separovaných látek.
Šířku zon ovlivňuje velikost částic chromatografické náplně (obr.2.40).
Obr.2.40 Frakcionace směsi na různě zrněném materiálu. Dělení směsi cytidylová kyselina, cytidin a cytosin na Sephadexu G-25
Čím se použije jemněji zrněný gel, tím se dosáhne užších zon a tím i lepšího
rozdělení. Je proto vhodné při chromatografii na jemně zrněných materiálech zkracovat délku
sloupce. Limitujícím faktorem na těchto gelech však většinou bývá průtoková rychlost, která
klesá s klesající velikostí zrna. Šířka zon klesá s klesající rychlostí průtoku, ovšem na úkor
delší doby trvání pokusu.
Při gelové chromatografii je rozhodující i objem aplikovaného vzorku. Pro zajištění
dobré separace se doporučuje aplikovat objem vzorku, který činí asi 1-5% objemu
chromatografické náplně. V některých případech je možno dávat vzorku více, aby se
zabránilo přílišnému naředění separovaných komponent.
80
Obr.2.41 Eluční křivky pro různé objemy vzorku. Nejvýše umístěný diagram odpovídá aplikaci malého objemu vzorku, spodní největšímu možnému objemu vzorku, kdy ještě dojde k separaci. Střední diagram znázorňuje případ, kdy se objem vzorku rovná separačnímu objemu a k separaci již nedojde.
Jestliže se použije gelová chromatografie k odsolení nebo výměně pufrů, je možno
aplikovat až 30% objemu náplně kolony. Jestliže vzorek zahustíme, aby stoupla koncentrace
separovaných látek v aplikovaném objemu, limitujícím faktorem se stává viskozita
(obr.2.42).
Obr.2.42 Vliv viskozity vzorku na separaci. S rostoucí viskozitou (eluční diagramy shora dolů) se výrazně zhoršuje separace
81
Složení eluentu při ideálním chování látek pro gelovou chromatografii nehraje roli.
Dobrého chromatografického rozdělení se dosáhne i tehdy, použije-li se jako eluent i
destilovaná voda. Eluce pufry o určitém pH a iontové síle se používá hlavně proto, aby
separované látky byly eluovány v optimálním prostředí vzhledem k jejich stabilitě.
Aplikace gelové chromatografie
Gelová chromatografie nachází uplatnění zejména jako separační metoda pro dělení
látek ze směsi a při purifikacích. Kromě toho se využívá při odsolování roztoků
biomakromolekul. Odsolování je třeba relizovat na hustých gelech, aby do gelu difundovaly
pouze nízkomolekulární látky. Vzhledem ke schopnosti gelů frakcionovat látky podle
velikosti molekul, je možno využít této techniky i pro orientační stanovení relativní
molekulové hmotnosti, ovšem za předpokladu, že se současně chromatografují i látky o
známé relativní molekulové hmotnosti nebo se za stejných podmínek připraví předem
kalibrační křivka (obr.2.43).
Obr.2.43 Vynesení relativních elučních objemů proti logaritmu molekulových hmotností různých proteinů. Chromatografie byla provedena na Sephadexu G-200 při pH 7.5.
82
Gelová chromatografie se vžila jako standardní metoda v biochemii a analýze
biomakromolekulárních látek. Příčiny toho, jsou:
1. Látky se dělí podle velikosti molekul nebo relativní molekulové hmotnosti. Je to jediná
chromatografická metoda, která dělí podle této proměnné veličiny.
2. Gelová chromatografie se velmi dobře hodí pro separaci biomakromolekul, protože gely
jsou fyzikálně-chemicky natolik podobné eluentu, že i velké molekuly mohou dosáhnout
střední hodnoty distribučního koeficientu navzdory svému velkému povrchu a dají se tudíž
chromatografovat bez použití gradientů.
3. Gelová chromatografie je šetrná separační metoda a dají se separovat i labilní látky, neboť
interakce mezi gely a rozpuštěnými látkami jsou, ve většině případů tak malé, že se nedají ani
postřehnout, což ovšem neplatí pro sterické zábrany.
4. Gelová chromatografie je téměř nezávislá na složení eluentu, teplotě atd., takže
experimentální podmínky lze volit tak, aby byly přizpůsobeny spíše zkoumané látce než
separační metodě.
5. Rozdělovací izothermy jsou lineární, takže dělení je nezávislé na koncentraci rozpuštěné
látky a lze proto užít i vysokých koncentrací. Limitujícím faktorem je viskozita.
6. Chromatografické rozlišení látek, jehož lze dosáhnout, se mění podle pokusného
uspořádání, avšak podobně jako u většiny chromatografických metod počet látek, které lze
rozlišit, se pohybuje v rozmezí jednoho řádu.
7. Gelová chromatografie je snadno proveditelná a vyžaduje minimální přístrojové vybavení
a pozornost pracovníka.
2.3.10 Chromatografie na měničích iontů
Chromatografie na měničích iontů - ionexová chromatografie - je určena pro separaci
látek nesoucích náboj. Základem je separace na základě nábojů, které nesou molekuly látek
ve směsi. Vzhledem k tomu, že ionexové náplně jsou schopny separovat molekuly, které
nesou jen nepatrně odlišné náboje, je ionexová chromatografie technika s vysokou
rozlišovací schopností.
Princip ionexové chromatografie
83
Separace látek při ionexové chromatografii závisí na reversibilní adsorpci látky na
ionex. Jednotlivé látky se váží na ionex pouze tehdy, jestliže nesou náboj opačný než je náboj
ionexu. Proto se pro separaci různých směsí látek nehodí stejný ionex.
Ionty se váží na ionex převážně elektrostatickými silami; van der Waalsovy síly a
polární interakce, které se při vazbě iontu na ionex rovněž uplatní, bývají mnohem slabší,
takže charakter procesu nezmění. Dělení látek při ionexové chromatografii proto probíhá
hlavně podle nábojových vlastností separovaných látek.
K separaci látek ze směsi dochází proto, že jednotlivé látky mají různou afinitu k
ionexu, způsobenou rozdíly v nábojích. Rozdíly v nábojových vlastnostech jsou u
biologických látek značné, proto je ionexová chromatografie schopna oddělit i dvě látky
velmi podobných vlastností (např. dvě bílkoviny lišící se pouze v jedné aminokyselině).
Látky se stejným nábojem jako je náboj ionexu a látky bez náboje procházejí kolonou bez
zadržení (pokud se neuplatní jiné separační mechanismy), naopak látky nesoucí náboj opačný
než je náboj funkčních skupin použitého ionexu se na náplň kolony váží. Síla vazby přitom
závisí na velikosti rozdílu v nábojích mezi ionexem a danou látkou. Pevnost vazby
sloučeniny na ionex může být regulována různými podmínkami (pH, iontová síla, kapacita
ionexu).
Výběr ionexu pro separaci
Ionex se skládá z nerozpustné matrice, na níž jsou kovalentně navázány skupiny
nesoucí náboj. Tyto skupiny jsou ve spojení s pohyblivými ionty s opačným nábojem tzv.
protiionty. Protiionty mohou být reversibilně zaměňovány za jiné stejně nabité ionty, aniž by
došlo ke změně matrice.
Ionexy se vyrábějí jak s kladně tak i se záporně nabitými skupinami. Kladně nabité
ionexy mají negativní protiionty (anionty) schopné výměny, nazývají se proto anexy.
Negativně nabité ionexy mají jako protiionty kationty a nazývají se katexy (viz obr.2.44).
Základní charakter dodávají ionexu kovalentně vázané nabité skupiny. Druh tzv.
funkční skupiny udává typ a sílu ionexu, jejich celkové množství a využitelnost určuje
kapacitu ionexu. Tab.3 uvádí skupiny, které se nejčastěji používají k vazbě na matrici.
Sulfoskupiny a kvarterní aminoskupiny se používají pro přípravu silných ionexů;
fosfoskupina tvoří ionex střední síly, ostatní uvedené skupiny dávají slabé ionexy. Označení
84
slabé, střední a silné ionexy vyjadřuje stupeň disociace skupin v závislosti na pH. Zatímco
silné ionexy jsou úplně disociovány v širokém rozmezí pH, disociace slabých ionexů je
naopak na pH silně závislá. Slabé ionexy ztrácejí náboj při pH pod 6 resp. nad 9.
Obr.2.44 Schema anexu a katexu s výměnnými opačně nabitými ionty
Tabulka 3 Funkční skupiny užívané pro ionexy
anexy funkční skupiny aminoethyl (AE-) - OCH2CH2NH3
+
diethylaminoethyl (DEAE-) - OCH2CH2N+H(CH2CH3)2kvarterní aminoethyl (QAE-) -OCH2CH2N+(C2H5)2CH(OH)CH3
katexy karboxymethyl (CM-) - OCH2COO-
fosfo - PO4H2-
sulfopropyl (SP-) - CH2CH2CH2SO3-
Důležitý je i typ nerozpustné matrice, který se pro ionex použije. V současné době
jsou nejčastěji používány následující typy:
Ionexové pryskyřice (obr.2.45a) jsou tvořeny hustou sítí matric hydrofobních
polymerů, které jsou do značné míry substituovány ionizovanými skupinami. Mají velkou
kapacitu pro malé ionty. Vzhledem k vysokému stupni zesítění jsou "oka" v síti matrice malá,
takže kapacita ionexových pryskyřic pro bílkoviny je nízká. Značně vysoká hustota náboje
způsobuje velmi silnou vazbu. Hydrofobní matrice často bílkoviny denaturuje, proto výtěžky
bývají nízké. Částice ionexu jsou tuhé a mají tvar kuliček, což umožňuje dobrý průtok
ionexem.
Ionexy, odvozené od celulosy (obr.2.45b) jsou tvořeny celulosou nebo modifikovanou
celulosou, která je substituována nabitými skupinami. Jejich kapacita pro malé ionty je malá,
protože stupeň substituce je nízký (jinak by se stala celulosa rozpustnou ve vodě). Přednost
85
celulosových ionexů před ionexovými pryskyřicemi spočívá v jejich hydrofilní matrici, která
jen velmi zřídka bílkoviny denaturuje. Průtok celulosovými ionexy je zpravidla špatný,
protože částice jsou nepravidelného tvaru a jsou měkké nebo fragilní. Na celulosových
materiálech nelze separovat bílkoviny s celulolytickou aktivitou.
Sephadexové ionexy jsou tvořeny dextranovými gely, které jsou substituovány
nabitými skupinami. Tyto ionexy mají střední kapacitu pro malé ionty, protože zesítění
polysacharidových řetězců umožnilo užít vyššího stupně substituce. Struktura ionexové
matrice je otevřená. Hydrofilní sacharidová matrice většinou nedenaturuje labilní látky, jako
např. proteiny a interakce jiného než iontového typu jsou velmi malé. Sephadexové ionexy
mají střední průtokové vlastnosti, protože částice jsou sice měkké, mají však tvar kuliček.
Vlastnosti některých dextranových iontoměničů uvádí tab.4.
Obr.2.45 Struktura některých ionexů (a) polystyrenová pryskyřice zesítěná divinylbenzenem, (b) celulosový nosič
86
87
Tabulka 5 Některé druhy ionexů
Žádný z uvedených ionexových materiálů však není universální a nehodí se pro
všechny typy separací. Výběr vhodného ionexu závisí zejména na :
stabilitě separovaných látek
velikosti molekul separovaných látek
specifických požadavcích pro jednotlivé aplikace
Protože některé biologicky aktivní látky jsou amfolyty (nesou kladně i záporně nabité
skupiny), mohou se za určitých okolností vázat na katex i anex. Vazba je reversibilní a je
založena na elektrostatických interakcích. Náboj, který tyto látky např. bílkoviny nesou, je
závislý na pH. V izoelektrickém bodě (pI) je celkový náboj látky nulový a proto se neváže
ani na katex ani na anex. Při pH nižším než je izoelektrický bod nese látka kladný náboj a
váže se na katex, při pH nad izoelektrickým bodem má záporný náboj a váže se tedy na anex
(obr.2.46).
Při práci s bílkovinnými roztoky je limitujícím faktorem stabilita separovaných látek
za daných podmínek. Neznáme-li izoelektrický bod bílkovin, vycházíme z předpokladu, že
většina bílkovin má pI v rozmezí pH 5-6 a je stabilní obvykle v rozmezí pH 6-9. Spolehlivější
je samozřejmě, známe-li hodnotu pI pro danou bílkovinu. V současné době již není problém
toto s pomocí některých technik (např. izolelektrická fokusace) zjistit. K tomu, aby se
bílkovina na daný ionex navázala je třeba, aby rozdíl mezi pI bílkoviny a pH pufru, ve kterém
je chromatografie prováděna, byl minimálně jedna jednotka pH.
88
Obr.2.46 Náboj bílkoviny jako funkce pH Tzn. je-li izoelektrický bod bílkoviny např. 5,6, k vazbě na anex bude docházet při pH nad
6,6, zatímco při pH nižším než 4,6 se bílkovina bude vázat na katex. Při vlastním
experimentu je třeba zvolit takové pH, při němž se naváže veškerá látka ze vzorku, které však
není příliš vzdálené od pH, kdy ještě k vazbě nedochází. Jestliže se totiž zvolí pH příliš
vzdálené, velice se znesnadní desorpce látky z ionexu.
Výběr ionexu závisí i na velikosti separovaných molekul. Zatímco pro separaci
malých molekul se dobře hodí ionexy na bázi pryskyřice, pro velké molekuly jsou vhodnější
celulosové ionexy. Dextranové ionexy, které se vyrábějí různě zesítěné, je možno použít pro
většinu typů molekul. Výběr ionexu se samozřejmě může řídit i jinými požadavky jako je
např. průtoková rychlost, možnost opakovaného použití, ekonomické hledisko apod.
Faktory ovlivňující vazbu na ionex
Pevnost vazby separované látky na ionex lze ovlivnit zejména volbou vhodných
chromatografických podmínek. Nejvýznamnějšími faktory jsou náboj dělených látek (ten
závisí na pH), iontová síla a kapacita ionexu.
Vliv pH na velikost náboje byl již diskutován v části o výběru vhodného ionexu.
Látky, separované pomocí ionexové chromatografie, mají charakter amfolytů. Jejich náboj se
tedy mění s pH; při nízkém pH jsou nabity pozitivně, při vysokém pH negativně. Při určitém
středním pH je výsledný náboj nulový (pro bílkoviny izolelektrický bod).
89
Vliv iontové síly je významný z hlediska volby startovního i elučního pufru. Jestliže
množství iontů v roztoku vzrůstá, každý jednotlivý ion bude vázán méně pevně. To se dá
vysvětlit jako následek zvýšené kompetice mezi různými ionty v roztoku, které se váží na
nabité skupiny ionexu. Podrobnější analýza s využitím jiného fyzikálně-chemického modelu
ukázala, že určujícím činitelem vazby je iontová síla.
Iontová síla je dána vztahem
I = 1/2 i ∑ ci zi2 (24)
kde se do součtu berou všechny druhy iontů v roztoku, ci jsou látkové koncentrace těchto
různých iontů a zi jsou jejich náboje. Koncentrace, představují aktuální koncentrace, takže v
roztocích tlumivých roztoků (pufrů) stupeň ionizace slabých elektrolytů je třeba vypočítat
(vychází se jak ze změřených hodnot pH tak i z pKa nebo pKb). Pufry o předem zvolené
iontové síle se však dají připravit na základě úvahy, že dva roztoky o téže iontové síle po
vzájemném smíchání pořád dávají roztok o dané iontové síle za předpokladu, že při mísení
roztoku neprobíhá žádná reakce.
Třetím důležitým ukazatelem je kapacita ionexu. Ionexy mají určitou kapacitu a
jestliže je látka v množství překračujícím kapacitu ionexu, její nadbytek se na ionex neváže.
Kapacita ionexu je pro různé látky rozdílná: objemné molekuly nemohou dosáhnout všech
nabitých skupin uvnitř ionexu, což vede ke snížení kapacity ionexu pro tyto molekuly.
Kapacitu ionexu mohou ovlivnit i jiné typy vazby než jsou elektrostatické interakce.
Hlavní fáze ionexové chromatografie (viz obr.2.47)
- ekvilibrace ionexu
- navázání látek ze vzorku a vymytí nenavázaných složek
- změna podmínek, která vede k selektivní desorpci
- regenerace ionexu
90
Obr.2.47 Průběh ionexové chromatografie 1 ionex v rovnováze s protiionty 2 náhrada protiiontů nabitými skupinami ze separované směsi 3 ionty s malou afinitou k ionexu jsou desorbovány a nahrazeny protiionty z pufru 4 desorpce zbývajících iontů a jejich náhrada gradientovými ionty 5 náhrada gradientových iontů protiionty startovního pufru
Ekvilibrace ionexu
Ekvilibrace ionexu se provádí startovním pufrem před tím, než je na kolonu aplikován
vzorek. Výběru druhu pufru i pH je třeba věnovat značnou pozornost. Zdaleka ne všechny
pufry jsou pro ionexovou chromatografii vhodné a to i v případě, že je splněna podmínka
vhodného pH. Např. pufr, obsahující citrátové ionty se pro tento typ chromatografie nehodí,
protože dochází ke snižování kapacity ionexu v důsledku vazby iontů na ionex. Iontová síla
startovního tlumivého roztoku, který používáme při prvním stupni chromatografie by neměla
být příliš nízká, protože ekvilibrace ionexu je obtížnější a zdlouhavá, zpomaluje se výměnná
kinetika, čímž se zhoršuje chromatografické rozlišení. Dochází rovněž ke smršťování ionexu
a tím se mění průtok kolonou. Obvykle se doporučuje iontová síla 0.05 - 0.1 mol/l.
Sorpce a desorpce
Vlastní separační proces probíhá ve dvou oddělených fázích. V prvním kroku dochází
k navázání látky, určené k separaci na ionex. Ve druhé fázi pak musí být navázané látky z
kolony desorbovány. Ionexová chromatografie se obvykle provádí v kolonách. Je třeba vzít v
úvahu, že rozměry kolony resp. rozměry chromatografického materiálu v koloně umístěného
mají zásadní význam pro úspěšnost separačního procesu. Výšku kolony je třeba zvolit
91
takovou, aby látky ze směsi byly absorbovány v horní části kolony, nejméně však 1-2 cm od
dolního okraje. Velice složité směsi je nutno dělit na delších sloupcích, pro laboratorní
měřítko se však většinou vystačí se sloupci do 20 cm. Průměr sloupce závisí na tom, kolik
ionexu je nutno do sloupce umístit (při předem zvolené výšce). Průměr sloupce tedy závisí na
požadované kapacitě ionexové náplně. Kolony pro ionexovou chromatografii mají obvykle
větší průměr a jsou krátké.
Na kolonu aplikujeme vzorek, který by měl být rozpuštěn v ekvilibračním pufru, nebo
alespoň by měl mít pH odpovídající zvolené hodnotě a nízkou iontovou sílu. Při ionexové
chromatografii nezáleží na objemu aplikovaného vzorku, pouze na koncentraci separovaných
látek ve vzorku. Jestliže totiž aplikujeme takové množství, že je přesažena kapacita kolony,
část separovaných látek se nenaváže a vymyje se z kolony bez separace. Ideální je, obsahuje-
li vzorek takové množství dělených látek, které odpovídá asi 80-90% kapacity ionexu.
Desorpce látek vázaných na ionexu se zpravidla provádí změnou složení eluentu.
Mění se buď pH nebo iontová síla roztoku, výjimečně i oba tyto faktory. Tyto změny mohou
být kontinuální nebo diskontinuální (obr.2.48). Diskontinuální změny často uvolňují několik
látek najednou a ty jsou pak eluovány v ostrém vrcholu. Ostré vrcholy však ještě
neznamenají vysoké chromatografické rozlišení. Tytéž látky mohou být eluovány v ostrých
vrcholech, přičemž jeden široký vrchol má začátek před provedenou změnou složení eluentu
a jeden vrchol se objeví po provedené změně. Kontinuální změna ve složení eluentu
zpravidla dává lepší chromatografické rozlišení. V předběžných pokusech by se proto mělo
používat kontinuálních gradientů.
Gradienty pH (obr.2.49) mají tu výhodu, že nezpůsobují změnu objemu
chromatografické náplně u silných ionexů.
Gradienty iontové síly se naproti tomu dají snáze ovládat; se změnou poměru tlumičů
se úměrně mění iontová síla, kdežto pH se nemění lineárně se změnou vzájemného poměru
tlumivých roztoků. Aby se dosáhlo uvolnění látek z ionexu, iontová síla má být vždy volena
ve vzestupném směru. pH gradienty by měly směřovat k izoelektrickým bodům látek,
vázaných na ionexy. Pro anexy to znamená gradient směrem k nižším hodnotám pH, pro
katexy směrem k vyššímu pH.
92
Obr.2.48 Kontinuální a diskontinuální gradientová eluce (gradient iontové síly) hovězího sera na QAE-Sephadexu A-50 1. vrchol v obou diagramech představuje IgG (imunoglobulin G), 4. vrchol na grafu A je serový albumin. Při diskontinuální eluci se eluuje albumin ve dvou vrcholech (4 a 5).
Obr.2.49 Eluce nelineárním gradientem (gradient pH) hemocyaninu na DEAE- Sepharose CL-6B
Jestliže se složení eluentu rychle mění (příkré gradienty), látky se budou vymývat s
mnohem menším objemem eluentu, budou se však vymývat vzájemně blíže, takže rozlišení
může být nižší.
Jsou-li vlastnosti separovaných látek známy, lze gradienty utvářet tak, aby bylo
dosaženo maximálního rozlišení a přitom rovnoměrného rozložení chromatografických
vrcholů. V oblasti, kde se eluuje najednou několik látek, by měl být gradient mírný, kdežto
93
strmých gradientů by se mělo užít tam, kde se od sebe chromatografické vrcholy příliš
vzdalují.
Kontinuální gradienty tedy mohou mít tvar nejen lineární, ale i konkávní a konvexní
(obr.2.50). Účelem je, aby při iontových silách, kdy se eluuje více látek, byl gradient méně
strmý než v oblastech, kde je eluována jen jedna látka. Konvexní gradienty tedy zlepšují
chromatografické rozlišení v konečných fázích gradientu, konkávní gradienty naopak v
počátečních fázích.
Obr.2.50 Různé typy gradientů (a) lineární, (b) konkávní, (c) konvexní
Ve výjimečných případech lze provádět eluci startovním pufrem. Tento typ se nazývá
izokratická eluce a je použitelný tehdy, jsou-li látky na kolonu vázány nepříliš pevně. Eluce
však pak bývá dosti zdlouhavá.
Chromatografické dělení je také ovlivňováno průtokovou rychlostí mobilní fáze.
Nejčastěji se používá průtokových rychlostí okolo 5 cm/hod. Protože ionexy, používané při
separaci biomolekul, mají částice poměrně měkké, dochází při příliš vysokém pracovním
tlaku nad náplní ke zhušťování náplně a tím i ke snižování průtoku kolonou. Průtokovou
rychlost je proto třeba udržovat tak nízkou, aby pracovní tlak byl mírně pod hranicí optima.
V průběhu pokusu může rovněž gradient způsobit, že se ionexové částice svraští, přičemž se
mění jejich vlastnosti. Jestliže přítok ke koloně je udržován pouze vlivem váhy sloupce
přitékající mobilní fáze, bude se tedy průtok měnit. K udržení stálé průtokové rychlosti se
proto používají ve většině případů pumpy.
94
Regenerace ionexu
Po skončené eluci se obvykle provádí regenerace ionexu. V malých analytických
pokusech je regenerace někdy neekonomická, protože množství ionexu v koloně je tak malé,
že práce spojená s regenerací je nákladnější. Pracujeme-li však ve větším měřítku, je třeba
regeneraci provést. Jestliže byly eluovány všechny látky, o něž máme zájem i ty které
nepotřebujeme, provedeme regeneraci promytím startovním pufrem. Zda-li došlo k
ekvilibraci již použitého ionexu zkontrolujeme tak, že změříme pH a vodivost ve vytékající
kapalině. Jestliže však některé látky zůstanou zadrženy v koloně, je třeba je vymýt. Chceme-
li tak učinit u látek navázaných silami iontové povahy, zvýšíme iontovou sílu. K odstranění
látek, které na koloně vyprecipitovaly nebo jsou velmi pevně vázány, se dá použít 0.1 M
NaOH, detergentů, které se na ionex neváží, nebo organických rozpouštědel, jako je např.
ethanol.
Regenerujeme-li tímto postupem, je třeba se přesvědčit, že ionexy byly upraveny do
výchozího stavu. Všechny promývací postupy, uvedené výše, vyžadují, aby byl ionex z
kolony předem vyprázdněn a po promytí ionexu kolona znovu naplněna.
2.3.11 Chromatofokusace
Chromatofokusace je metoda separace bílkovin založená na rozdílném izoelektrickém
bodě (IEP, pI) separovaných bílkovin. Jde o zvláštní typ ionexové chromatografie.
Zásadní odlišnost chromatofokusace od ostatních ionexových metod spočívá v tom,
že gradient pH je vytvářen přímo na koloně (obr.2.51). Jestliže tlumivý roztok o určitém pH
protéká ionexovou kolonou, nastavenou na odlišné pH, vytváří se na koloně pH gradient.
Jestliže se takový pH gradient užije k eluci proteinů, navázaných na ionex, proteiny se eluují
v pořadí podle svých IEP. Během eluce se uplatní tzv. fokusační efekt, jehož výsledkem je
zaostřování zon na koloně, koncentrace vzorku a v důsledku toho i vysoká rozlišovací
schopnost. Obvykle se udává, že je možno oddělit bílkoviny, jejiž IEP se liší o více než 0.05
jednotek pH.
95
Náboj bílkoviny závisí na jejím izoelektrickém bodě a na pH prostředí (obr.2.52).
Jestliže pH prostředí je nižší než IEP, bílkovina nese kladný náboj, nebude se vázat na
sloupci anexu a bude se pohybovat v elučním tlumiči směrem dolů. Směrem dolů však na
koloně roste pH. Proto se bílkovina bude pohybovat ve směru rostoucího pH. Jakmile se
dostane do míst, kde okolní pH bude vyšší než její IEP, změní se její náboj a bílkovina se
naváže na anex. Molekula zůstane navázaná do té doby, než klesající pH gradient postoupí na
koloně tak daleko, že okolí navázané bílkoviny bude mít pH nižší než IEP. V tom okamžiku
se vazba na anex zruší a bílkovina bude putovat kolonou opět až do míst s pH vyšším než je
její IEP, kde se znovu naváže. Tento proces se opakuje tak dlouho, až bílkovina v
izoelektrickém stavu vyteče z kolony (obr.2.53).
Obr.2.51 Tvorba gradientu (A) při ionexové chromatografii, (B) při chromatofokusaci
96
Obr.2.52 Chování bílkovinných molekul při chromatofokusaci pH roste na koloně směrem dolů (na obrázku zleva doprava). Při pH nad pI jsou bílkoviny záporně nabité a váží se na ionex, při pH pod pI jsou nabité kladně a na anex se neváží. Protein 1 má pI=7, protein 2 pI=8
Protože v izoelektrickém bodě nenese bílkovina žádný náboj, neváže se na ionex a
postupuje kolonou bez zadržení. Jakmile dojde ke změně pH, bílkovina získá náboj, naváže
se na ionex a přestane se pohybovat. Bílkoviny s různými izoelektrickými body než se naváží
urazí na koloně s gradientem pH různé vzdálenosti. Tím dojde k jejich separaci a vytékají z
kolony odděleně.
Obr.2.53 Tvorba pH gradientu (pH 9-6) na sloupci PBE 94 při eluci amfolytem Polybuffer 96
Během chromatografického procesu se vlivem vnitřního pH gradientu vytváří tzv.
fokusační (zaostřovací efekt) efekt (obr.2.54).
97
Obr.2.54 Fokusační (zaostřovací) efekt chromatofokusace Molekuly v levé části obrázku se neváží na gel (pH < pI), proto se pohybují rychle až do okamžiku, kdy se dostanou do oblasti, kde pH > pI. Tam dostihnou ostatní ionty.
Molekuly, které by se zrychlily při svém postupu kolonou, by se dostaly do oblasti s
vyšším pH, kde by zůstaly do okamžiku, kdy v jejich okolí klesne pH pod IEP, a tam by byly
dostiženy ostatními molekulami se stejným IEP. Proto zony látek se stejným IEP jsou úzké a
velmi ostré.
Jestliže je na kolonu aplikován vzorek, pohybují se jeho jednotlivé složky směrem
dolů s eluentem, až dosáhnou oblasti s pH vyšším než je jejich IEP. Poté se pohybují
pomaleji až se eluují. Jestliže se před tím, než se začne první vzorek eluovat z kolony, přidá
na kolonu druhý podíl vzorku, bude se pohybovat směrem dolů stejnou rychlostí jako eluent,
až se setká s pomaleji se pohybujícím prvním podílem vzorku. Dále se pohybují oba podíly
současně. V případě, že v druhém podílu je obsažena složka s nižším IEP než mají složky
prvého podílu, druhý podíl může dokonce prvý předejít.
Při separaci bílkovin chromatofokusací musíme rozhodnout, v jakém intervalu pH
budeme pracovat. IEP bílkovin, které nás zajímají, by měly ležet přibližně ve středu tohoto
intervalu. Ionex, na kterém budeme pracovat, ekvilibrujeme startovním tlumivým roztokem,
jehož pH bude o něco vyšší než je horní hranice intervalu pH (asi o 0.4 pH jednotky). Eluční
tlumivý roztok bude mít pH rovné spodnímu limitu pH gradientu.
Vzorek se ekvilibruje elučním tlumičem (o nízkém pH) a nanese se na kolonu, která
je pak promývána elučním tlumičem. Vzhledem k tomu, že kolona je ekvilibrována na vyšší
pH než má eluční tlumič, automaticky se vytvoří sestupný pH gradient. V tom případě je
třeba užít ionex, který má bazické skupiny, tedy anex. Jak prochází eluční tlumič kolonou,
kyselé skupiny se zachycují na bazických skupinách anexu, takže pH roztoku, který opouští
kolonu v počátečních fázích chromatografie, se blíží pH startovního tlumiče (horní hranice
pH gradientu). Jak eluce pokračuje, pH na koloně se postupně snižuje, až v závěrečných
fázích eluce je na celé koloně dosaženo rovnováhy s elučním tlumičem a pH vytékajícího
roztoku je velmi blízké pH roztoku nad kolonou.
V praxi se obvykle pracuje v intervalu maximálně tří jednotek pH. Jestliže je znám
IEP vzorku, volíme interval pH tak, aby IEP požadované složky ležel v 1/3 -1/2 gradientu
pH. Jestliže pracujeme s neznámým vzorkem, je nutno IEP zjistit experimentálně.
Důležité je rovněž zvolit odpovídající množství ionexu pro separaci. Obvykle
postačuje 20-30 ml ionexové fáze na separaci 1-200 mg bílkoviny na jednotku pH gradientu.
98
Ionex, stejně jako u každé ionexové chromatografie, musí být ekvilibrován startovním
tlumičem
(10-15ti násobek objemu kolony).
Úspěšnost separace bílkovin u všech kolonových chromatografických technik závisí
na šířce eluovaných zon a na jejich vzdálenosti. Šířka pásu bílkoviny při chromatofokusaci
závisí na následujících faktorech:
Náplň kolony. Je třeba používat ionex s vysokou tlumivou kapacitou, která se nemění
v širokém rozmezí pH a rovněž tlumič se stálou pufrovací schopností v širokém rozmezí pH.
Plnění kolony. Vzhledem k tomu, že při chromatofokusaci se vytvářejí velmi úzké
zony separovaných bílkovin, každá nepravidelnost v plnění kolony má za následek výrazné
zhoršení separace.
Strmost pH gradientu. Pro optimální dělení bílkovin chromatofokusací se doporučuje
pozvolný pH gradient. Toho lze dosáhnout použitím pufrů o nízké koncentraci, které dávají
pouze jemné změny pH. Pak dojde k dobré separaci jednotlivých vrcholů. Pozvolný gradient
má též za následek užší zony vzhledem k jednotkám pH. Nesmí se však zvolit příliš pozvolný
gradient, neboť pak by šíře zon vzhledem k objemu byla značná a vzorek by se při eluci
velmi ředil. Doporučuje se volit strmost gradientu takovou, aby objem eluentu byl asi 10-15ti
násobkem objemu, který zaujímá ionex.
Náboj ionexu. Rozdíl nábojů mezi ionexem a okolním mediem má za následek
vytváření ostrých zon při chromatofokusaci. Proto je třeba udržovat iontovou sílu eluentu a
jeho koncentraci na nízkých hodnotách.
2.3.12 Chromatografie s reversní fází
Jak již bylo řečeno v úvodu, základem všech chromatografických metod je systém
dvou nemísitelných fází, z nichž jedna je stacionární a druhá mobilní. Zatímco mobilní fází je
vždy kapalina, stacionární fází může být buď kapalina zakotvená na inertním nosiči nebo
tuhá látka. Většina chromatografických metod používá polární stacionární fázi, mobilní fáze
může a nemusí být nepolární. V LLC systému je možno jako stacionární fázi zakotvit i
nepolární kapalinu a mobilní fází je pak kapalina polární. Toto uspořádání se označuje jako
chromatografie s reversní fází (RPC), vyžaduje však specielní nosiče, do nichž je možno
99
nepolární fázi zakotvit. V LSC systému se po dlouhou dobu toto uspořádání neuplatnilo,
neboť nebyly k dispozici hydrofobní adsorbenty.
Ke značnému rozvoji RPC došlo, když se začly používat chemicky vázané stacionární
fáze a to polární i nepolární. Tento typ chromatografie se pak nazývá chromatografie s
vázanou fází.
Stacionární fáze chemicky vázané na nosiči mají výhody ve srovnání s kapalnými
fyzikálně zakotvenými fázemi (nedochází k vymývání z kolony ani vlivem rozpouštění v
mobilní fázi ani vlivem koroze při velkém průtoku atd.). Zatímco při běžné LLC se
setkáváme s řadou omezení, chromatografie s vázanou fází většinu z nich odstraňuje. Jde
především o to, že při LLC je stacionární fáze zakotvena na nosiči pouze slabými
mechanickými silami a při vyšším průtoku mobilní fáze je nebezpečí, že bude strhávána s
eluentem. Použití vyšších průtoků je proto vyloučeno. V systému kapalina-kapalina by se
dále měly používat dvě zcela nemísitelné kapaliny, což je v praxi nereálné. Mobilní fáze musí
být proto předem sycena stacionární fází, a to znamená zařazení dalšího kroku. Dále se musí
pracovat v poměrně úzkém rozmezí rozdělovacích koeficientů a pokud se nepracuje s
ternárními systémy, není možno zvyšovat eluční sílu mobilní fáze ani používat gradientovou
eluci. Chromatografie s vázanou fází naproti tomu umožňuje jak použití vysokých průtoků,
tak použití mobilní fáze s vysokou eluční silou, gradientovou eluci a dosti široké rozmezí
rozdělovacích koeficientů. Příprava sorbentů s vázanými nepolárními stacionárními fázemi
umožnila vznik kvalitativně nového chromatografického způsobu, a to chromatografie s
vázanou reversní fází, která teprve umožnila dokonalé využití reversní chromatografie, což v
podstatě znamená využití LLC pro separaci nepolárních látek.
Hlavní výhodou chromatografie s vázanou reversní fází je však nesmírně jednoduché
provedení; není třeba provádět dlouhou ekvilibraci stacionární fáze mobilní fází, gradienty se
velmi snadno realizují a reprodukují a kolony dávají reprodukovatelné výsledky po dlouhou
dobu bez zvláštních požadavků na skladování. Systémy s obrácenými fázemi se v současné
době používají zejména v HPLC.
Mechanismus separace
Mechanismus separace při použití nepolární chemicky vázané fáze není dosud zcela
jasný. Jednou možností je dělení mezi dvě kapalné fáze (stacionární a mobilní), pak by se
100
jednalo o klasickou rozdělovací chromatografii. Druhou možností je vazba na nepolární
adsorbent, takže RPC by byla klasickou adsorpční chromatografií, založenou na
hydrofobních interakcích. Byla navržena ještě třetí možnost mechanismu separace: organický
modifikátor mobilní fáze je přednostně adsorbován a vytváří se adsorbovaná vrstva na
stacionární fázi, jejíž složení se liší od fáze mobilní. Dělení látek z roztoku se pak
uskutečňuje mezi mobilní fází a novou "směsnou" stacionární fází. Modifikovaný silikagel
(vázaná fáze) pak poskytne pouze povrch, který se obalí novou stacionární fází.
Je však otázka, zda bude někdy vytvořena jednotná teorie na mechanismus
chromatografie s reversní fází. Je totiž velice pravděpodobné, že mechanismus jednotný není,
neboť vázané stacionární fáze jsou velice různorodé a pravděpodobně ovlivní mechanismus
separace. Předpokládá se, že např. použijí-li se jako stacionární fáze polymerní fáze, pak se
pravděpodobně uplatní rozdělování mezi dvě kapalné fáze. Při použití silikagelu
modifikovaného vrstvou uhlíku půjde asi spíše o adsorpci na pevný povrch.
Stacionární fáze
Jako chemicky vázané nepolární stacionární fáze se dnes nejčastěji používají
grafitové nebo uhlíkem potažené silikagely, eventuálně též kopolymery styrenu a
divinylbenzenu.
Nejslabším rysem komerčně vyráběných stacionárních fází je jejich malá pH stabilita.
Proto se začínají používat nové typy, např. bifunkční silany, které obsahují jedno vazebné
místo na každém ze dvou atomů křemíku, nebo silany obsahující isopropylové skupiny na
křemíkovém atomu silanů. Tyto skupiny pravděpodobně zajišťují stérickou ochranu Si-O-Si
skupin před kyselou hydrolýzou a umožňují proto používání mobilní fáze s nízkým pH.
Mobilní fáze
V systému s obrácenými fázemi se zvětšuje retence látek s rostoucí nepolární částí v
jejich molekulách. Rovněž počet aromatických jader v molekulách zvyšuje jejich retenci,
naopak přítomnost silně polárních skupin retenci snižuje (-NH2, -OH, -COOH ). Pokud je v
molekule přítomno více polárních skupin a uhlovodíková část molekuly je malá (cukry,
101
nukleosidy, některé baze nukleových kyselin) může převažovat afinita těchto látek k H2O
jako mobilní fázi nad hydrofobními interakcemi působícími vylučování organických látek z
vodné fáze. Tyto látky mají eluční objem blízký nebo menší než VM (objem mobilní fáze v
koloně). Uvedený jev lze někdy kompenzovat a tím zvýšit retenci silně polárních látek
potlačením jejich disociace (úprava pH) nebo zvýšením iontové síly mobilní fáze.
Selektivitu při RPC lze ovlivňovat volbou organické složky mobilní fáze a využitím
jejich selektivních interakcí s chromatografovanými látkami. Ve většině případů aplikací
chromatografie s vázanou reversní fází slouží jako mobilní fáze směs vody a organického
rozpouštědla, nejčastěji methanolu, ethanolu, acetonitrilu nebo dioxanu. Eluční síla mobilní
fáze roste s klesající polaritou organického rozpouštědla, tedy v obráceném pořadí než při
chromatografii na polárních adsorbentech. Nejslabším eluentem je voda, zatímco již
methanol je schopen uvolnit z vazby na sorbent všechny navázané molekuly. Nejčastěji se
eluce provádí gradientem od vody směrem k methanolu, neboli gradientem koncentrace
methanolu. Za silnější eluenty než methanol se považují (v pořadí stoupající síly) ethanol,
acetonitril, dioxan a isopropanol.
Chromatografie s reversní fází se nejčastěji uplatňuje pro analytické účely a to v
uspořádání HPLC.
2.4 Metody založené na molekulovém rozpoznávání
Příroda ovládla během evoluce nejen schopnost vytvářet a štěpit kovalentní vazby, ale
dokázala využít k realizaci svých záměrů i vzájemnou interakci některých molekul. Řada
látek v přírodě má schopnost specificky rozpoznat molekuly, s nimiž vytváří funkční dvojice.
Říkáme, že tyto látky mají k sobě afinitu. Vzhledem k tomu, že alespoň jednou z
interagujících molekul je biopolymer, označujeme tyto interakce jako biospecifické. Tak
např. enzymové reakce jsou umožněny afinitou mezi enzymem a substrátem, ev. mezi
enzymem a kofaktorem; imunitní system je založen na schopnosti rozpoznat antigen
specifickou protilátkou; nukleové kyseliny se váží navzájem (párování bazí - základ
genetického kódu) nebo s proteiny; řada malých molekul (mastné kyseliny, vitaminy a další)
102
jsou specificky transportovány proteiny. Vysoký stupeň specifity byl pozorován mezi
hormonem a jeho receptorem.
Biospecifických interakcí při rozpoznávání molekul ("biorecognition") se v nedávné
minulosti začalo využívat v analytické chemii, ale i k izolaci biopolymerů z biologického
materiálu. Později se pro výše zmíněné účely začaly studovat i některé syntetické sloučeniny,
které mohou za určitých okolností nahradit jeden člen ve specifické dvojici. Vyvinuly se
speciální metody, mezi nimiž nejvýznamnější roli hraje bioafinitní chromatografie. Jí a
dalšími metodami, založenými na molekulovém rozpoznávání, se budeme v této kapitole
zabývat.
2.4.1 Bioafinitní chromatografie
Bioafinitní chromatografie, někdy též zvaná bioselektivní adsorpce, je
chromatografická metoda založená na specifických a reversibilních interakcích mezi dvěma
biologicky aktivními substancemi.
Podstata bioafinitní chromatografie je celkem jednoduchá: využívá se výše
naznačených tendencí dvou samostatných molekul vytvářet páry ev. jiným způsobem spolu
interagovat. Každá biomolekula (enzym, nukleová kyselina apod.), kterou chceme separovat,
má specifickou schopnost rozpoznat jinou, obvykle menší, molekulu, která se označuje jako
bioligand nebo obecně ligand. Jestliže je bioligand imobilizován na inertním nosiči (obr.2.55)
a protéká-li látka, kterou chceme separovat, kolonou, v níž je imobilizovaný bioligand
umístěn, bude separovaná látka na koloně zadržována, neboť se vytvoří komplex
biomolekula-bioligand (obr.2.56). Látky, které afinitu k bioligandu nemají, projdou kolonou
bez zadržení. Imobilizovaný ligand tedy působí jako adsorbent se specifickou afinitou k látce
v roztoku a afinitní chromatografii proto můžeme zařadit mezi adsorpční chromatografii.
Obr.2.55 Schema přípravy afinitního sorbentu
103
Obr.2.56 Adsorpce molekuly na imobilizovaný ligand Obr.2.57 Eluce purifikovaných molekul
Navázaná biomolekula se pak uvolní z kolony specifickou či nespecifickou elucí
(specificky např. volným ligandem nebo kompetující molekulou, nespecificky změnou
podmínek - pH, iontové síly, teploty - tzv. deformujícími pufry), při níž komplex
biomolekula-bioligand přestává být stabilní a biomolekula se desorbuje z kolony (viz
obr.2.57).
Tato metoda je velice efektivní, dochází k značnému přečištění separované molekuly.
Interakce použité v adsorpčním procesu však musí být stejné nebo alespoň obdobné jako
interakce probíhající v přírodě.
Na tvorbě biospecifických komplexů se podílejí běžné molekulární síly a interakce,
tzv. nekovalentní interakce, jako jsou iontové vazby, hydrofobní interakce, vodíkové můstky,
van der Waalsovy síly, Londonovy dispersní síly, dipol-dipol interakce apod. Současné
uplatnění několika těchto interakcí v komplementárním vazebném místě je základem vysoké
specifity a účinnosti biospecifické vazby. Afinitní vztahy mezi biologickými molekulami jsou
104
regulovány různorodostí typů interakcí, které mezi molekulami existují a které jsou dány
jejich prostorovým uspořádáním, nábojem, hydrofobicitou apod.
Činnost biologických makromolekul in vivo je řízena malými změnami v jejich okolí.
Proto je tvorba biospecifických komplexů velice citlivá na podmínky prostředí, a to nejen na
pH a iontovou sílu, ale i na přítomnost kovových iontů, kofaktorů a dalších látek.
Hlavní podmínkou bioafinitní chromatografie je tvorba specifického komplexu mezi
biomolekulou, která má být separována (A), a bioligandem kovalentně vázaným na inertní
nosič (L).
k1
A + L ←→ AL
k-1
KL = k-1/k1 = [A].[L]/[AL] (25)
k1 a k -1 jsou asociační a disociační konstanty výše uvedené rovnice, KL je rovnovážná
konstanta. Rovnovážná konstanta charakterizuje sílu afinity mezi ligandem (L) a molekulou
(A).
Ligand může být vazbou na pevný nosič modifikován, takže rovnovážná konstanta
mezi vázaným bioligandem a biomolekulou nemusí být stejná jako v případě volného
komplexu, kdy je rovnovážná konstanta stanovena v roztoku. Úspěch bioafinitní
chromatografie spočívá do značné míry v tom, jak se podaří vytvořit pro tvorbu specifického
komplexu podmínky analogické těm, které existují v přírodě. Důležitými faktory přitom jsou,
vedle výběru vhodného ligandu, volba inertního nosiče a způsob imobilizace bioligandu,
jinými slovy volba a příprava vhodného sorbentu pro bioafinitní chromatografii.
Inertní nosič
Ideální inertní nosič pro bioafinitní chromatografii by měl splňovat řadu požadavků:
- nerozpustnost
- nulová adsorpční kapacita
- dostatečná permeabilita a velký specifický povrch
105
- vysoká pevnost a vhodná forma částic
- chemická reaktivita umožňující vazbu ligandu
- chemická stabilita za podmínek požadovaných pro vazbu, desorpci a regeneraci
- resistence k enzymovému a mikrobiálnímu napadení
- hydrofilní charakter
- ekonomicky únosná cena
Nosič, splňující všechny tyto vlastnosti neexistuje, proto musíme vždy vycházet z
kompromisu a volit takový nosič, který nejlépe vyhovuje podmínkám jednotlivého
konkrétního případu.
Požadavek nerozpustnosti nosiče je zásadní proto, aby se zabránilo ztrátám
bioafinitního sorbentu, ale též proto, aby nedošlo ke kontaminaci izolované látky
rozpuštěným nosičem. S čistotou separované látky souvisí i požadavek minimálních
nespecifických sorpcí, které mohou způsobit, že na sorbent se váží i látky, které nemají
afinitu k ligandu. Tyto nespecifické sopce mohou kromě toho též zvyšovat pevnost
specifických vazeb, čímž se velice znesnadní eluce.
Velikost specifického povrchu je hlavní faktor ovlivňující kapacitu biospecifického
sorbentu. Proto je vhodné volit nosič s co největším povrchem a s dostatečnou porozitou.
Pevnost a vhodný tvar částic jsou důležité pro dobrý průtok, zejména používáme-li při
chromatografii vyšších tlaků.
Chemická reaktivita, t.j. dostatečný počet reaktivních skupin, má zajistit možnost
navázání ligandu na nosič. Vazba musí probíhat za podmínek, při nichž nedochází ke změně
struktury nosiče ani ligandu. Pro vazbu ligandu nesmí být využity skupiny, které se účastní
při tvorbě specifického komplexu biomolekula-bioligand. Naproti tomu, pro opakované
použití biosorbentu je nezbytná jeho chemická a mechanická stabilita.
Hydrofilní charakter nosiče je vyžadován kvůli zamezení nespecifických sorpcí, ale
též pro snížení nebezpečí inaktivace separovaných biologicky aktivních molekul. Hydrofobní
charakter nosiče zvyšuje nebezpečí hydrofobních interakcí, které mohou vést nejen k
nespecifickým sorpcím, ale i k denaturaci separovaných makromolekul.
Nejčastěji se jako nosiče pro bioafinitní chromatografii používají agarosa, speciálně
upravené porézní sklo, dextranové gely, polyakrylamid a celulosa.V literatuře však můžeme
najít celou řadu přírodních i syntetických materiálů, které byly použity jako afinitní nosiče.
Každý z těchto nosičů má své výhody i nevýhody, žádný z nich není, jak jsme již uvedli,
ideální.
106
Výhodou agarosy je otevřená struktura, která umožňuje průnik biopolymerů s
vysokou molekulovou hmotností, nevýhodou je náchylnost k bakteriální kontaminaci.
Nevýhodou celulosy je vláknitý a nesourodý charakter celulosy, který brání pronikání
velkých molekul. Tato nevýhoda byla odstraněna u perlové celulosy, která má vysokou
porozitu, ale i dostatečnou pevnost a dobré průtokové vlastnosti. Výhodou
polyakrylamidových gelů je odolnost proti chemickému i mikrobiálnímu působení a obsah
mnoha skupin pro připojení ligandu, nevýhodou však je malá porozita částic a zmenšování
objemu při chemické modifikaci.
Ligandy
Jako ligandy pro bioafinitní chromatografii jsou vhodné sloučeniny, které se
separovanou molekulou tvoří biospecifické, pevné a reversibilní komplexy. Po chemické
stránce to mohou být nejrůznější sloučeniny, kromě tří výše uvedených požadavků však musí
splňovat další podmínku: musí obsahovat skupinu, kterou lze využít pro kovalentní vazbu na
pevný nosič, aniž by tím bylo ovlivněno komplementární vazebné místo pro tvorbu
specifického komplexu.
Pro izolaci biomolekul jsou nejvhodnější ligandy, které s biomolekulou dávají
komplexy s rovnovážnou konstantou ležící v oblasti 10-4 až 10-8 mol.dm-3. Takové komplexy
jsou dostatečně pevné, avšak je možné je poměrně snadno desorbovat. Příliš labilní komplexy
nezajistí dokonalou separaci, příliš pevné komplexy komplikují desorpci.
Ligandy mohou být jak nízkomolekulární tak vysokomolekulární látky.
Nízkomolekulární ligandy se vyznačují vyšší stabilitou a jednoznačně definovaným
způsobem vazby pomocí definovaných funkčních skupin. Protože se jedná o malé molekuly,
bývají často pro velké biomolekuly stéricky nedosažitelné, proto se mezi ně a nerozpustný
nosič musí vložit oddalovací rameno (bude o něm pojednáno později), které však může být
zdrojem nespecifických sorpcí.
Vysokomolekulární ligandy (nejčastěji bílkoviny nebo nukleové kyseliny) mají rovněž
některé nevýhody. V chromatografickém procesu může docházet k jejich denaturaci a tím i
ke ztrátě jejich biologické aktivity. Na jejich vazbě na nerozpustný nosič se podílí více jejich
funkčních skupin a proto způsob vazby lze jen obtížně přesně definovat.
107
Obecné ligandy
Kromě specifických ligandů se při bioafinitní chromatografii uplatňují i tzv. obecné
ligandy. Tyto ligandy interagují selektivně a reverzibilně s celou skupinou komplementárních
biomolekul (například s nukloeproteiny, glykoproteiny, dehydrogenasami). Mají sice menší
selektivitu než ligandy specifické, ale širší využitelnost. Široký rozsah hodnot rovnovážných
konstant skupiny separovaných biomolekul (každá ze separovaných molekul má k ligandu
jinou afinitu) umožňuje jejich oddělenou eluci s využitím gradientu iontové síly, pH, teploty,
organických rozpouštědel, kompetitivních ligandů, alosterických efektorů, kofaktorů,
stejným způsobem jako se provádí eluce u jiných typů LSC.
Oficiální klasifikace obecných ligandů nebyla dosud provedena, ale řada autorů se
pokouší o zařazení obecných ligandů do skupin podle toho, které biomolekuly s nimi
interagují.
Obecnými ligandy mohou být:
- kofaktory enzymů: NAD, biotin, koenzym A a další kofaktory, které selektivně interagují s
enzymy
- lektiny (proteiny), které interagují specificky se sacharidy a s cukernou složkou
glykoproteinů
- receptorové proteiny, které specificky rozpoznají určité hormony: receptory steroidních
hormonů, cAMP receptory, insulinové receptory, protilátkové receptory
- proteiny, které rozpoznají nukleotidy nebo nukleové kyseliny, (ATP, AMP nebo DNA,
RNA apod.)
- substráty enzymových reakcí, které se mohou vázat s různou afinitou k celé řadě enzymů
- inhibitory enzymových reakcí, které se rovněž váží s příslušnými enzymy
Toto samozřejmě není úplný výčet možných obecných ligandů, kromě toho si ligand a
separovaná molekula mohou v případě potřeby vyměnit role.
Vezměme si jako příklad obecného ligandu kofaktory NAD a NADP. Jsou to
kofaktory velkého počtu dehydrogenas, t.j. enzymů ze třídy oxidoreduktas. Většina
dehydrogenas interaguje s NAD(P) prostřednictvím specielní oblasti na apoenzymu, která
rozpozná adeninovou skupinu. Stejná oblast je u apoenzymů enzymů, které mají jako
kofaktor ATP či AMP. NAD(P) může tedy v řadě případů interagovat s oběma typy enzymů.
Každý z enzymů však má k vázanému kofaktoru jinou afinitu, takže je možné
108
prostřednictvím bioselektivní eluce je dokonale oddělit. Selektivní eluce se nejčastěji provádí
roztokem NAD, často gradientem NAD. Bioselektivní eluci dehydrogenas z vázaného
ligandu umožňuje tvorba pevných ternárních komplexů enzym-NAD-substrát, v nichž je
NAD vázán pevněji než v binárních komplexech enzym-NAD (povinný mechanismus vazby
v ternárním komplexu je v pořadí enzym, NAD, substrát). Binární komplex enzym-NADH,
který vzniká v průběhu reakce, je pevnější než komplex enzym-NAD.
Oddalující rameno (spacer)
V některých případech může být ligand navázán na nosič přímo. Velice často však,
zejména je-li ligand nízkomolekulární látka s molekulovou hmotností nižší než 5000 a
biomolekula látka vysokomolekulární, mohou vazbě biomolekuly na ligand bránit stérické
překážky. V tom případě je nezbytné ligand oddálit od povrchu nosiče, aby se stal pro
biomolekulu dosažitelný. To se děje prostřednictvím oddalujícího ramene (spaceru) (obr.2.58
a 2.59).
Délka oddalujícího ramene a způsob jeho připojení na nosič jsou velice důležité
faktory, které významně přispívají k úspěšnosti separace.
Obr.2.58 Význam distančního ramene (spaceru) a) bez spaceru b) se spacerem
Jako spacer slouží nejčastěji kratší lineární uhlíkaté řetězce. Na jednom konci musí
mít spacer chemickou skupinu, kterou se váže k nosiči (např. primární amin), na druhém
konci musí být skupina schopná vázat ligand. Skupina, na níž se váže ligand, se označuje
jako terminální a je to buď karboxyl nebo primární amin. Spacer tedy bude sloučenina s
pravděpodobným obecným vzorcem typu
109
H2N-(CH2 )n-X
kde X je -COOH nebo -NH2
Obr.2.59 Bioafinitní chromatografie chymotrypsinu ma koloně Sepharosy A) ligand s distančním ramenem B) ligand bez ramene C) sorbent bez ligandu Krátké rameno nemusí vždy úspěšně plnit funkce na něj kladené. Příliš dlouhé rameno může
obsahovat hydrofobní zony, které mohou interagovat navzájem a tak způsobit ohnutí ramene
a zkrácení jeho efektivní délky (obr.2.60 a 2.61).
Obr.2.60 Příliš krátké distanční rameno a distanční rameno správné délky
110
Obr.2.61 Příliš dlouhé distanční rameno, dochází k interakci uvnitř řetězce a) hydrofobní interakce b) tvorba vodíkových můstků
Hydrofobní zony mohou také způsobit vlivem hydrofobních interakcí nespecifické sorpce.
Ještě větším nebezpečím u spacerů s velkými hydrofobními oblastmi je možnost jejich
interakce s hydrofobními oblastmi proteinu tak, že hydrofobní aminokyselinové zbytky, které
jsou uvnitř proteinu, se dostávají na povrch. Tím ovšem dojde k destabilizaci proteinu a v
krajním případě až k jeho denaturaci. Dlouhá ramena mohou kromě toho obsahovat i
sekvence, které mají schopnost působit jako iontoměniče a tak opět způsobovat nespecifické
sorpce. Oba uvedené případy nespecifických sorpcí jsou obvykle silnější než biospecifické
interakce, takže jsou bioafinitní vztahy zcela potlačeny. Proto se někdy používají distanční
ramena, která mají hydrofilní charakter (obr. 2.62).
Obr.2.62 NAD jako ligand vázaný na nosič pomocí distančního ramene a) hydrofobního b) hydrofilního
Vazba ligandu na nosič
Základní podmínkou pro tvorbu biospecifického komplexu je dobrá stérická
přístupnost bioligandu. Dostatečná prostorová volnost závisí na porozitě použitého nosiče a
na vzdálenosti ligandu od povrchu nosiče, aby stérické interference byly minimální. Stérické
zábrany mohou rušit bioselektivní adsorpci zejména při použití nízkomolekulárních ligandů.
Roli pak hraje nejen délka spaceru, ale též tvar povrchu nosiče. Vlivem nerovného povrchu
111
nosiče mohou být některé ligandy velmi dobře přístupné a jiné, připevněné na nosič stejným
způsobem, stéricky nedostupné. Stérickými zábranami můžeme v mnoha případech vysvětlit
nízkou saturaci molekul imobilizovaného ligandu izolovanou látkou i heterogenitu v afinitě
imobilizovaných ligandů (obr.2.63).
Obr.2.63 Sterická nepřístupnost přebytečných ligandů
Pro přípravu homogenního bioafinitního sorbentu je proto nutné volit takové
podmínky vazby ligandu na nosič, aby hustota navázaného ligandu byla dostatečně nízká a
aby byl ligand vázán na dobře přístupných místech. Nízká hustota ligandu je žádoucí z
důvodu zamezení nespecifických vazeb. Vysoká hustota vázaného ligandu totiž umožňuje
vytvoření nespecifických vazeb mezi biomolekulami (zejména jde-li o makromolekuly) a
sorbentem viz obr.2.65). Nespecifické vazby mohou být, stejně jako vazby specifické v
komplementárním vazebném místě, typu elektrostatických nebo hydrofobních interakcí nebo
jejich kombinací. Látky přítomné v mobilní fázi se mohou pomocí těchto nespecifických
interakcí vázat k molekulám bioafinitního ligandu, ke spaceru i na povrch nosiče. Tyto
nespecifické a často mnohonásobné vazby mohou být silnější než komplementární vazba
mezi ligandem a biomolekulou. Jestliže se tyto nespecifické vazby uplatňují navíc ke
specifické komplementární vazbě, zvyšují sílu vazby ve specifickém komplexu nebo mohou
způsobit navázání biomolekuly na imobilizovaný bioligand v nesprávné orientaci. To má za
následek desorpci téže biomolekuly v několika frakcích nebo potíže s desorpcí biomolekuly
vůbec. Dobré výsledky může tudíž poskytnout pouze sorbent s nízkou koncentrací
navázaného bioligandu. Za těchto podmínek je totiž pravděpodobné, že se biomolekula bude
vázat na sorbent pouze prostřednictvím biospecifické vazby na imobilizovaný ligand, a to v
poměru 1:1. Nebezpečí výskytu nespecifických vazeb je v tomto případě velmi malé.
112
Obr.2.64 Porovnání ideálního a nevhodného bioafinitního sorbentu a) ideální sorbent - může dojít pouze k biospecifické vazbě b) nevhodný sorbent - možnost řady dalších interakcí
Důležitou složkou bioafinitního sorbentu je i nosič, který by měl být inertní, aby
nebyl zdrojem nespecifických sorpcí (obr.2.64). Ideální nosič však v praxi neexistuje.
113
Obr.2.65 Specifická a nespecifická sorpce molekul na sorbentu s nerovným povrchem
Adsorpční kapacita sorbentu
Adsorpční kapacita sorbentu je mírou schopnosti vázat separované biomolekuly.
Udává se v mg separované látky navázané na 1 ml afinitního sorbentu. Závisí především na
tzv. stupni substituce nosiče ligandem, t.j. na množství ligandu imobilizovaného na nosiči a
na jeho dostupnosti pro biomolekulu. Stupeň substituce se udává u nízkomolekulárních
ligandů v μmol na 1 ml nosiče, u vysokomolekulárních ligandů v mg na 1 ml nosiče.
Dostupnost ligandu pro separovanou molekulu je silně závislá na porozitě nosiče.
Jsou-li jak ligand tak separované látka makromolekuly (mol. hmotnost ≥ 10 000), je porozita
rozhodujícím faktorem, neboť látka, která má být separována, musí mít možnost volně
procházet póry nosiče. Jestliže je separovanou molekulou nízkomolekulární sloučenina a
pouze ligand je makromolekula, pak porozita nosiče musí být taková, aby byla umožněna
imobilizace ligandu. V obou uvedených případech však zpravidla není pro imobilizaci nutno
použít spacer. V případě, že ligandem je nízkomolekulární sloučenina (mol. hmotnost ≤ 5
000) a separovanou molekulou je makromolekula, porozita nosiče nemá zásadní důležitost,
ale ligand musí být umístěn na spaceru, aby byl pro separovanou molekulu dostupný.
Vzhledem k tomu, že v afinitních vztazích platí, že 1 molekula separované látky se
váže na 1 molekulu imobilizovaného ligandu, má na adsorpční kapacitu sorbentu vliv i poměr
molekulových hmotností separované molekuly a ligandu. Proto je třeba při posuzování
žádoucího stupně substituce mít na zřeteli velikost ligandu, jeho specifitu a dále porozitu a
povrch nosiče. Jestliže je ligand nízkomolekulární látka a separovaná látka je
makromolekula, pak může být stupeň substituce velice nízký a přesto se dosáhne vysoké
kapacity, a to díky poměru molekulových hmotností obou zúčastněných látek.
Sorpce a desorpce
114
Bioafinitní chromatografie jako jeden z typů adsorpční chromatografie je relativně
jednoduchý dvoustupňový proces, sestávající z biospecifické adsorpce separované látky na
bioafinitní sorbent a - po vymytí všech nespecificky vázaných látek - z desorpce (eluce)
separované sloučeniny ze specifického komplexu.
Podmínky sorpce jsou totožné s podmínkami optimálními pro tvorbu biospecifického
komplexu: optimální pH, iontová síla, teplota, v případě potřeby i přítomnost kovových
iontů, kofaktorů ev. dalších složek ve správné koncentraci. Jestliže vyšší iontová síla nebrání
tvorbě komplexu, doporučuje se sorpci provádět při vyšší iontové síle, neboť se tím potlačí
nespecifické elektrostatické interakce. Nespecifickým sorpcím může zabránit i přítomnost
detergentů.
Desorpce (uvolnění) separované látky z vazby na sorbent se provádí elucí, a to
specificky nebo nespecificky.
Při specifické eluci je separovaná látka desorbována z vazby na ligand roztokem jiné
látky, která má afinitu k separované molekule nebo k ligandu. Je to kompetitivní proces,
přičemž o vazbu na separované molekule může s imobilizovaným ligandem soutěžit
například ligand volný, který však, aby měl možnost se prosadit, musí být ve vyšší
koncentraci. To je také základní nedostatek jinak velmi efektivní a specifické eluce. Ligand,
zejména jde-li o bioligand, je obvykle látka vzácná a tudíž drahá. Proto eluce roztoky o vyšší
koncentraci těchto látek může být dosti nákladná a tak méně vhodná zejména pro provozní
účely.
115
Obr.2.66 Schema zařízení na elektroeluci b-místo pro pufr, n.s.- nylonová síťka, a.g.-sorbent, e.c.-eluční komůrka, d.m.-dialyzační membána
Při nespecifické eluci je vazba mezi ligandem a separovanou látkou rozrušena tzv.
deformujícími pufry, které mění strukturu ligandu nebo separované molekuly, takže vazebná
centra již nejsou komplementární a komplex se rozpadne. Tohoto efektu je možno dosáhnout
změnami pH, iontové síly nebo odstraněním iontů, které jsou nezbytné pro biologickou
aktivitu. Podobný efekt docílíme i použitím chaotropních nebo disociačních látek (KSCN,
močovina, guanin), které způsobí porušení rovnováhy mezi hydrofilními a hydrofobními
složkami. Při tomto způsobu desorpce je však nutno mít na paměti, že sterická modifikace
izolované látky nebo ligandu může vést ke ztrátě biologické aktivity způsobené jejich
denaturací.
Nespecifická eluce se provádí spojitým gradientem pouze tehdy, jestliže je ligand
nespecifický a váže více než jednu separovanou látku. V případě, že je ligand specifický, je
možno s výhodou eluovat nespojitým gradientem.
Dalším možným způsobem desorpce je elektroeluce. Při elektroeluci se vloží na
kolonu se separovanou směsí elektrické pole (v horní a dolní části kolony se umístí
elektrody), a to tak aby látky z kolony putovaly shora dolů (viz obr.2.66). Znamená to, že v
případě kladně nabitých látek na koloně bude v dolní čísti kolony katoda, v případě záporně
nabitých látek (což je u bílkovin běžnější případ, neboť jsou stabilnější v mírně alkalickém
prostředí) bude dole anoda. Eluce probíhá tak dlouho, až látky kolonu opustí a odděleně se
jímají. V praxi se elektroeluce provádí v různě konstruovaných zařízeních, z nichž jedno je
uvedeno na
obr. 2.66.
Některé praktické aspekty bioafinitní chromatografie
Množství použitého sorbentu a dimenze kolony jsou faktory, které při separaci
bioafinitní chromatogtafií hrají významnou roli.
Množství použitého sorbentu závisí na jeho adsorpční kapacitě. V laboratorních
pokusech obvykle potřebujeme separovat, resp. navázat na kolonu 10-100 mg látek. K tomu
je potřeba 10 - 200 ml sorbentu s navázaným nízkomolekulárním ligandem a 50 - 100 ml
116
sorbentu s vysokomolekulárním ligandem. O adsorpční kapacitě gelu pro každý konkrétní
případ je nutno se přesvědčit experimentálně. Objem gelu by pak měl být stanoven tak, aby
během separace bylo využito pouze 15 - 25 % jeho adsorpční kapacity. Požadovaná látka je
pak eluována minimálním objemem eluentu. Jestliže je adsorpční kapacita gelu využita nad
tuto hodnotu, stoupne sice produktivita, ale separovaná látka bude při eluci více naředěna.
Při afinitní chromatografii dochází ke značné koncentraci separované látky, proto je
možno vycházet i z velmi zředěných vzorků. Koncentraci vzorků však je nutno přizpůsobit
průtokovou rychlost. Koncentrovanější vzorky se lépe adsorbují, proto je možné použít
vyšších průtokových rychlostí. Limitujícím faktorem u koncentrovaných vzorků je viskozita
roztoku, který je aplikován na kolonu, neboť vysoká viskozita velmi výrazně snižuje
průchodnost kolony. Naopak při aplikaci velice zředěného vzorku se doporučuje nejen snížit
průtokovou rychlost, ale průtok na několik minut úpně zastavit. V praxi se nejlepších
výsledků dosáhne, jestliže koncenntrace separované látky je nižší než 20 mg/ml a průtoková
rychlost
1 - 20 ml/hod.cm3.
Při použití čerstvě připraveného afinitního sorbentu bývá někdy pozorováno, že s
opakováním cyklů vzrůstají výtěžky separovaných látek. Příčinou je zřejmě jejich
ireverzibilní vazba na sorbent v prvních cyklech. Pokud je sorbent chemicky i mechanicky
stálý platí téměř obecné pravidlo, že čím více byl použit, tím lepší výsledky dává.
Imunoafinitní chromatografie
Jedním z případů specifické bioafinitní chromatografie je chromatografie založená na
interakci antigen - protilátka. Tento typ bioafinitní chromatografie dosáhl značného rozšíření
a bývá označován jako imunoafinitní chromatografie, někdy též chromatografie na
imunosorbentech. Imunosorbenty jsou nosiče (obvykle celulosa), na nichž je jako ligand
imobilizována protilátka, tedy imunoglobulin. Protilátka tvoří velice pevné a specifické
komplexy s antigeny, které mají být separovány.
Metoda je velice specifická, při její realizaci však můžeme narazit na řadu potíží.
Především imunosorbent, má-li být specifický, musí obsahovat ligand (protilátku), který bude
homogenní (tedy naprosto čistá) bílkovina. Toho lze obvykle dosáhnout přečištěním
protilátky bioafinitní chromatografií, tentokrát však je na nosič jako ligand umístěn antigen a
117
jeho pomocí se purifikuje protilátka. Komplex protilátka-antigen je však tak pevný, že eluce,
při níž nedojde k denaturaci purifikované protilátky, je obtížná. Nicméně v posledních
desetiletích byla vypracována řada metod, která tuto eluci umožňuje. Eluce bude diskutována
ještě později.
Imunoafinitní chromatografii je možno použít i pro separaci nízkomolekulárních
látek, které nemají imunogenní vlastnosti, ale specificky reagují s protilátkami (tzv. hapteny).
Mezi tuto skupinu patří látky jako mono- a oligosacharidy, hormony, různé alergeny.
Protilátky proti haptenům se vytvářejí tehdy, jsou-li hapteny vázány na proteiny, avšak velmi
často bývají znečištěny imunoglobuliny specifickými pro další hapteny či proteiny. Proto
před imobilizací takovýchto ligandů je jejich purifikace bioafinitní chromatografií s
haptenem jako ligandem naprosto nezbytná.
Jak jsme se zmínili již výše, komplex antigen-protilátka je velice pevný a proto
desorpce antigenu z imobilizované protilátky je možná jen za drastických podmínek. Protože
protilátka je relativně stabilní, není uvolnění protilátky z vazby na imobilizovaný antigen
takovým problémem. Lze ji desorbovat deformujícími pufry nebo roztokem s vysokým
obsahem antigenu jako kompetujícího ligandu. Obtížnější bývá uvolnění antigenu z vazby na
imobilizovanou protilátku. Pak se jako nejvhodnější metoda ukázala být elektroeluce, o níž
jsme již informovali dříve.
Jestliže separovanou látkou je hapten, nedělá eluce obvykle žádné obtíže, protože
hapten je obvykle bez prostorového uspořádání a často i bez biologické aktivity, takže ani
drastická eluce nemůže tuto látku znehodnotit.
2.4.2 Nespecifická afinitní chromatografie
Za nespecifickou afinitní chromatografii lze považovat všechny případy, kdy
použijeme obecný ligand. Jestliže však použitým obecným ligandem je látka, vyskytující se v
organismech, např. některá z těch, o nichž bylo výše pojednáno, stále jde o bioafinitní
chromatografii. Ukázalo se však, že partnerem při chromatografické separaci nemusí být
nutně sloučeniny interagující navzájem v organismu, ale že jím mohou být i sloučeniny, které
se v organismech vůbec nevyskytují a přesto mají určitou skupinovou specifitu vůči
separovaným látkám, nebo dokonce mohou být považovány za obecné ligandy. Pak mluvíme
118
obecně o afinitní chromatografii a vzhledem k tomu, že specifita takových ligandů není nikdy
absolutní, o nespecifické afinitní chromatografii.
Syntetické ligandy, které je možno při afinitní chromatografii použít, mají schopnost
jednoduchých nebo komplexních interakcí se separovanými látkami, které však nemají
biospecifický charakter. Vesměs jde o látky organismu zcela cizí. Příčinou afinity může být
stérická podobnost s některou v organismu se vyskytující látkou, ale řada případů má
charakter fyzikálně-chemických interakcí.
Podle typu interakcí, které se při nespecifické afinitní chromatografii uplatní, řadíme
metody do několika skupin. Patří sem:
Chromatografie na sorbentech s vázanými barvivy (dye-binding)
Chromatografie na sorbentech s kovy (metal-chelate)
Chromatografie s přenosem náboje (charge-transfer)
Chromatografie s kovalentní vazbou (kovalentní chromatografie)
Chromatografie s heterobifunkčními afinitními ligandy
Chromatografie s hydrofobní interakcí (hydrofobní chromatografie)
Chromatografie na sorbentech s vázanými barvivy
Mezi látky, které mohou v určitém smyslu simulovat konformaci přirozených látek,
patří různá barviva, zejména barviva triazinová, která simulují strukturu nukleotidů
(obr.2.67). Tato barviva tedy mohou sloužit jako nespecifické obecné ligandy pro řadu
enzymů, které mají nukleotidové kofaktory: pro dehydrogenasy s kofaktorem NAD a NADP
a kinasy s ATP. Vzhledem k tomu, že v řadě případů je možné eluovat navázanou molekulu
specificky s použitím příslušného volného kofaktoru, lze předpokládat, že barvivo působí
jako kompetitivní efektor, který se váže do centra pro vazbu kofaktoru.
119
Obr.2.67 Struktura modrého antrachinonového barviva R = -SO3
- Cibakron Blue F3G-A R = m,p -SO3
- Procion Blue H-B
V některých případech však byly sorbovány i molekuly, které neměly vztak k
nukleotidům a také je nebylo možno pomocí specifické eluce s nukleotidy desorbovat
(např. sérové albuminy). V těch případech zřejmě dochází k vazbě na základě hydrofobních
interakcí a takové typy vlastně patří do jiné skupiny nespecifické chromatografie, kterou je
chromatografie s hydrofobní interakcí.
Chromatografie s vázanými barvivy je výhodná z ekonomického hlediska. Syntetická
barviva, která se používají jako ligandy, jsou resistentní vůči chemickým činidlům a
enzymům, a dají se poměrně snadno imobilizovat za vzniku definované pevné vazby. Kromě
toho jsou snadno dostupná, levná a dobře skladovatelná v suchém stavu, takže jsou stále k
dispozici. Poskytují sorbenty s vysokou kapacitou, je možné opakované použití a umožňují
práci s vysokými průtokovými rychlostmi. Toto vše je předurčuje jako ligandy výhodné pro
použití ve velkém měřítku.
Barevné ligandy
Jako afinitní barviva se nejčastěji používají triazinová barviva. Skládají se z vlastní
barevné složky, tzv. chromoforu (obr.2.68) a triazinového kruhu napojeného na chromofor
přes -NH- skupinu. Na triazinovém kruhu je vázán jeden či více atomů chloru, z nichž
některé jsou substituované (amino-, arylamino-, sulfoanilino-, alkoxyskupinou). Jako
chromofory jsou nejčastěji v barvivech zastoupeny azoskupiny, antrachinon a ftalocyanin.
120
Obr.2.68 Struktura hlavních chromoforů v reaktivních barvivech
Nejčastěji jsou jako afinitní ligandy používána barviva Cibacron Blue F3GA, Blue
Dextran (vlastně dextran s navázaným barvivem Cibacron Blue), Procion Blue H-B a Procion
Red HE3B (obr.2.67). To ovšem zdaleka nejsou všechna barviva, která byla pro
chromatografické účely testována.
Podmínky sorpce a desorpce
Úspěšnost interakce mezi imobilizovaným barvivem a separovanou molekulou je
značně závislá na experimentálních podmínkách. Mezi ně, kromě podmínek pro sorpci a
desorpci , jako jsou pH, iontová síla, teplota, průtoková rychlost, velikost a tvar kolony, patří
i výběr vhodného nosiče, volba délky distančního raménka a stupeň substituce nosiče
ligandem.
Z různých nosičů (dextrany, celulosa, sklo, kopolymery agarosy a polyakrylamidu) se
nejvíce osvědčila agarosa. Barevný ligand se na nosič váže substitucí atomu chloru v
triazinovém kruhu za hydroxyskupinu nosiče. Stupeň substituce lze ovlivnit použitou
teplotou a dobou reakce. Vhodný stupeň substituce musí být stanoven experimentálně. V
žádném případě neznamená vysoký stupen substituce nosiče ligandem optimální kapacitu
afinitního sorbentu.
Experimentálně je nutno zjistit i pH vhodné pro sorpci a desorpci a iontovou sílu
používaných roztoků.
Nutnost použití distančního raménka závisí na charakteru separované látky, avšak v
případě barevného ligandu musíme s distančním raménkem téměř vždy počítat. Jde spíše o to
zvolit jeho optimální délku.
Vazba biomolekuly na barevný ligand je ovlivněna jak objemem aplikovaného vzorku
tak i jeho koncentrací. Větší objem vzorku obvykle zhoršuje vazbu, vysoká koncentrace
separované látky snižuje purifikační efekt.
Vazba enzymů na barevný ligand je také ovlivněna přítomností substrátů a kofaktorů,
které mohou soutěžit ve vazbě s imobilizovaným ligandem. Tato okolnost však může být
příznivá, protože některé barevné ligandy se mohou pevně vázat v aktivních centrech pro
vazbu substrátu nebo kofaktoru separovaných enzymů (zejména dehydrogenas a kinas) a
121
mohou způsobit ztrátu biologické aktivity. Přítomnost kofaktoru ev. substrátu pevné vazbě
ligandu zabrání.
Afinita enzymů k barevnému ligandu bývá někdy podpořena přítomností bivalentních
iontů.
K desorpci navázané molekuly se používá gradient iontové síly nebo (méně často)
pH, dále specifická eluce (obvykle nukleotidy) a elektroeluce. Při eluci gradientem solí je
třeba mít na paměti, že vyšší koncentrace solí mohou vzhledem k posílení hydrofobních
interakcí podpořit vazbu separované molekuly na imobilizovaný barevný ligand. K dosažení
dobrých výsledků separace se doporučuje používat nízké průtokové rychlosti a vyšší kolony s
malým poloměrem.
Při separaci se na sorbentu nespecificky váží lipidy, lipoproteiny a další sloučeniny s
hydrofobním charakterem přítomné ve vzorcích, které se však jen velice nesnadno desorbují
a proto neznečišťují separované látky. Před dalším použitím kolony je však nutné je
desorbovat. Toho se dosáhne promytím kolony 8M močovinou v 0,05 M NaOH před další
ekvilibrací pufrem.
Chromatografie na sorbentech s kovy
Přechodné kovy Fe, Cu, Co, Ni a další mohou koordinovat sloučeniny obsahující O,
N a S, tedy též biomolekuly. Tyto sloučeniny mohou být separovány na sorbentech, které
obsahují některý z přechodných kovů, neboť se budou s kovovým ligandem vázat.
Chromatografický sorbent se připraví zabudováním kovu do matrice gelu či jiného
nosiče přes spacer, kterým bývá iminooctová kyselina (obr.2.69), aminosalicylová kyselina,
8-hydroxychinolin, EDTA a další. Ten se naváže na nosič a na něj je koordinován kovový
ion. Tím se zajistí, že nebude potlačena schopnost kovového iontu tvořit komplex se
separovanou sloučeninou.
122
Obr.2.69 Sorbent pro chromatografii s vázaným kovem. Chelatační složkou je kyselina iminooctová
Navázané kovové ionty pak reverzibilně interagují s řadou bílkovin, a to
prostřednictvím některých aminokyselin v nich obsažených, cysteinu, histidinu, tryptofanu,
fenylalaninu.
Chromatografie s kovovými ligandy se používá zejména pro separaci bílkovin. Na
sorbentu s Cu jsou úspěšně separovány např. interferon, ribonukleasa, lysozym a albuminy,
na sorbentu s Ni se separují opět interferon a ribonukleasa, na sorbentu s Co interferon.
Případů popsaných v literatuře je ovšem mnohem více.
Chromatografie s přenosem náboje
Některé aromatické sloučeniny spolu interagují za vzniku různě stabilních komplexů.
Mechanismus interakce spočívá v přenosu nábojů resp. elektronů z donorové sloučeniny na
sloučeninu akceptorovou (viz obr.2.70). Jestliže se donorová nebo akceptorová sloučenina
naváže jako ligand na nosič, pak vzniklý sorbent je schopen separovat aromatické sloučeniny
podle jejich schopnosti přijímat nebo odevzdávat elektrony. Při eluci pak je třeba brát v
úvahu to, že se mezi molekulami budou uplatňovat i jiné interakce (hydrofobní, van der
Waalsovy).
Obr.2.70 Interakce při chromatografii s přenosem náboje
123
Tohoto typu chromatografie se opět nejčastěji používá pro separaci bílkovin, přičemž
se při vazbě uplatňují především boční řetězce bílkovin ochotné poskytovat elektrony. Jsou to
řetězce, které obsahují indolové, imidazolové, p-hydroxyfenylové a guanidylové skupiny.
Jako ligandy byly popsány: akriflavin, dinitrochlorbenzen, pentachlorfenol,
dikyanochlor-p-benzochinon.
Kovalentní chromatografie
Kovalentní chromatografie je speciálním typem afinitní chromatografie, při níž se
separovaná molekula kovalentně váže na afinitní sorbent. Vzniklá kovalentní vazba je snadno
štěpitelná i za mírných podmínek, takže při desorpci biomolekul nedochází ke ztrátám nativní
konformace a tedy ani ke ztrátám biologické aktivity. Afinitní sorbent se připraví imobilizací
ligandu, který obsahuje thiolovou skupinu nebo rtuťnatý ion, takže při navázání separované
molekuly vznikají disulfidové vazby nebo Hg-S vazby.
Řada imobilizovaných thiolů byla testována jako sorbenty pro kovalentní
chromatografii, ale pouze 3 z nich se běžně používají. Jsou to glutathion-agarosa,
homocystein-aminoalkyl-agarosa a thiopropyl-agarosa (viz.obr.2.71). Agarosa zde
samozřejmě hraje roli nosiče, thiolové sloučeniny jsou ligandy.
124
Obr.2.71 Agarosové nosiče s thiolovými ligandy
Glutathion obsahuje ionogenní skupiny, takže při jeho použití nelze vyloučit ani
elektrochemické interakce, tedy efekt ionexu. Glutathion se kromě toho velice snadno
uvolňuje z vazby na nosiči, zejména je-li eluce provedena merkaptoethanolem. To má dva
důsledky: sorbent nelze opakovaně použít a uvolněný glutathion kontaminuje separované
látky.
Thiopropyl naproti tomu je neutrální molekula, více méně hydrofilní, takže je
ideálném ligandem v případech, kdy by elektrostatické interakce nepříznivě interferovaly s
chromatografickým procesem.
Bez ohledu na použitý ligand je thiolový sorbent nutno vždy před vazbou separované
molekuly aktivovat. Děje se tak navázáním 2-thiopyridinu nebo nitrothiobenzoové kyseliny
za vzniku nesymetrického disulfidu. Smyslem této aktivace je připojit na ligand skupinu,
která se ochotně odpojí a přenechá místo na ligandu thiolové skupině separované látky (obr.
2.73).
Jako ligandy se používají i merkury-deriváty: p-amino-fenylmerkuryacetát,
p-chlormerkurybenzoát, p-hydroxymerkurybenzoát a p-merkuryfenylamin (viz obr.2.74).
125
Obr.2.72 Schema přípravy aktivovaného sorbentu pro kovalentní chromatografii Obr.2.73 Schema kovalentní chromatografie na sorbentu s thiolovým ligandem
Obr.2.74 Schema kovalentní chromatografie s rtuťnatým ligandem
Kovalentně vázaná molekula se eluuje buď redukcí disulfidové vazby nebo
vytěsněním pufrem s jinou thiolovou molekulou (merkaptoethanolem, dithiothreitolem,
cysteinem). Před elucí se však nejprve vymyjí všechny nespecificky navázané molekuly, to
jest ty, které neobsahují sulfhydrylové skupiny.
Kovalentní chromatografie byla popsána pro řadu proteinů a dalších molekul, které
obsahují sulfhydrylové skupiny.
126
Chromatografie s heterobifunkčními afinitními ligandy
Využití heterobifunkčních ligandů v afinitní chromatografii je jedna z novějších
metod afinitní purifikace. Heterobifunkční ligand, tj. ligand, který obsahuje 2 vazebné
skupiny, se v rozpustné formě přidá ke vzorku látek určených pro separaci. Po navázání
specifické biomolekuly na ligand, při čemž se využije jedna z vazebných skupin, se vzniklý
komplex separuje na koloně s nosičem, na který se naváže druhou vazebnou skupinou
heterobifunkčního ligandu. Komplex ligand-biomolekula tedy bude vázán na nosiči, zatímco
ostatní složky původního roztoku se vymyjí z kolony. Stupňovitou elucí se pak uvolní
nejprve separovaná biomolekula a v druhé fázi pak ligand z vazby na nosič. Ligand je poté
možno opakovaně použít.
Chromatografie s hydrofobní interakcí
Chromatografie s hydrofobní interakci, "hydrofobní chromatografie", je dalším typem
nespecifické afinitní chromatografie. Hydrofobní interakce nebyly původně při afinitní
chromatografii vítaným jevem, neboť způsobovaly problémy (nespecifické sorpce). Teprve
později byly rozpoznány možnosti, které tyto interakce při selektivní chromatografii
poskytují. Molekuly, mezi nimi i makromolekuly, které mají hydrofobní skupiny buď na
povrchu nebo zanořené v jakýchsi „kapsách“, se totiž mohou separovat na základě různě
silných hydrofobních interakcí s chromatografickým sorbentem prostým nábojů a nesoucím
hydrofobní skupiny.
Povaha a původ hydrofobních interakcí byly po dlouhou dobu předmětem názorových
rozdílů vědců, kteří se jejich podstatou zabývali. Je zřejmé, že hydrofobní interakce jsou silné
pouze ve vodném prostředí. Předpokládá se, že hybnou silou při vytváření těchto nepolárních
interakcí je především pozitivní změna entropie při uvolňování molekul rozpouštědla
organizovaných kolem hydrofobních skupin, jakmile se tyto skupiny setkají s hydrofobním
prostředím (viz obr. 2.75).
127
Obr.2.75 Schematické znázornění hydrofobní interakce
Z teoretického hlediska lze rozlišit „pravou“ a „nepravou“ hydrofobní chromatografii.
Do prvé kategorie patří ty chromatografické separace, kdy sorbent obsahuje pouze
hydrofobní ligandy a nenese žádný náboj (obr. 2.77). Nepravá hydrofobní chromatografie,
zvaná též detergentová nebo amfifilní chromatografie, se provádí na sorbentech, na nichž
jsou imobilizovány jak hydrofobní tak hydrofilní (nejčastěji ionogenní) skupiny (obr.2.79).
Demonstrujme si využití hydrofobních interakcí při separaci makromolekul na
bílkovinách. Globulární bílkoviny mají, jak známo, hydrofobní jádro, které zaručuje
minimalizaci entropie v systému, a hydrofilní obal. V hydrofobním jádře však není zcela
vyloučena přítomnost hydrofilních skupin, stejně tak se můžeme na povrchu setkat s
hydrofobními oblastmi. Kromě toho existují na globuli určité trhliny či štěrbiny (např. aktivní
centra na enzymech), které zasahují z povrchu až do hydrofobního jádra (obr. 2.76).
Obr.2.76 Schema struktuty proteinu
128
Obr.2.77 "Pravé" hydrofobní interakce Obr.2.78 Vazba bílkoviny na hydrofobní povrch
Molekuly bílkoviny se tedy mohou vázat reverzibilně na hydrofobní ligandy. Zcela
hydrofobní materiály, jakým je např. polystyren, však váží molekuly bílkoviny ireverzibilně a
mohou způsobit i nevratnou denaturaci, neboť ve snaze minimalizovat entropii systému může
dojít k úplnému odhalení hydrofobního jádra a tedy ke ztrátě nativní konformace bílkoviny
(obr.2.78). Proto se jako hydrofobní sorbenty hodí spíše ty, které nemají zcela hydrofobní
povrch, ale pouze hydrofobní zóny, které jsou navzájem odděleny zonami hydrofilními.
Příklad takového sorbentu je na obr.2.79. Jde o epoxy-propyl-agarosu. Jestliže je na takový
sorbent přivedena molekula, která nemá přístupné hydrofobní zony, na sorbent se nenaváže.
129
Obr.2.79 Amfifilní chromatografie na aminopropylagarose
Molekula s hydrofobními zonami se naváže, avšak díky slabým hydrofobním silám se nebude
vázat příliš pevně. V některých případech půjde spíše jen o určité zpomalení hydrofobní
molekuly. Sílu hydrofobních interakcí však je možno ovlivnit teplotou a iontovou silou. V
případě amfifilní chromatografie sehraje roli náboj v okolí hydrofobních zon, neboť
hydrofilní části sorbentu nesou nabité skupiny, které interagují s nábojem molekuly. Podle
iontové síly roztoků pak můžeme volit, zda mají vyniknout hydrofobní či iontové interakce.
Sorbenty pro hydrofobní chromatografii
Sorbenty pro hydrofobní chromatografii se skládají z nosiče obvykle gelového
charakteru a z ligandu, kterým je obvykle hydrofobní skupina (fenyl, oktyl, ale i další).
Sorbenty musí mít:
- dobré průtokové vlastnosti, nutné pro práci v kolonách
- stálé vazby mezi ligandem a nosičem, aby nedocházelo k uvolňování ligandu
- vysokou tepelnou stabilitu
- vysokou chemickou stabilitu
- pro pravou hydrofobní chromatografii nesmí nést žádné nabité skupiny
Sorpce molekul na hydrofobní nosiče
Síla interakce mezi separovanou molekulou a nosičem závisí jak na hydrofobicitě
separované látky, tak na hydrofobicitě sorbentu, dále na interakcích s molekulami vody a
mezi těmito molekulami navzájem. Při interakcích se uplatňuje jak dříve zmíněná exkluze
vody z hydrofobních oblastí, tak van der Waalsovy síly a za přítomnosti aromatických
sloučenin též π-π interakce. Lze tedy říci, že separace látek ve směsi záleží na dynamických
rovnováhách mezi všemi hlavními složkami systému. Všechny další molekuly, které mohou
vytvářet interakce stejnými mechanismy jako síly působící při separaci, budou nutně
separovaný system ovlivňovat.
Síla hydrofobních interakcí se zvyšuje s rostoucí iontovou silou. Je proto vhodné při
vazbě molekuly na sorbent pracovat s roztoky o vysoké iontové síle (např. 4M NaCl). Je
důležitá též chemická podstata iontů přítomných v roztoku. Ionty s vysokou vysolovací
schopností (fosfáty, amonné ionty) jsou při zesilování hydrofobních interakcí zvlášť účinné.
130
Naopak chaotropní ionty, t.j. ty, které mají tendenci rozrušovat strukturu vody (thiokyanát,
barnaté ionty), hydrofobní interakce zeslabují.
S rostoucí teplotou roste síla hydrofobních interakcí. To vyplývá z rovnice pro
Gibbsovu volnou energii:
ΔG = ΔH - TΔS (26)
Čím je vyšší teplotní koeficient, tím má výraz pro změnu enthropie větší hodnotu a tím menší
je výsledná hodnota změny volné energie.
Nejsilnějších hydrofobních interakcí lze dosáhnout při pH, které se rovná
izoelektrickému bodu separované molekuly, neboť při tomto pH nenese náboj. S rostoucí
vzdáleností od pI se hydrofobní interakce zmenšují.
S rostoucím počtem molekul s hydrofobním charakterem v roztoku klesá síla
hydrofobních interakcí vzhledem k jednotlivé molekule. Jde o kompetici mezi hydrofobními
molekulami o vazbu na hydrofobní sorbent. O vazbu na sorbentu tak mohou se separovanými
molekulami soutěžit např. detergenty.
Snížením polarity použitého rozpouštědla klesne i síla hydrofobních interakcí. Přidání
alifatických alkoholů k vodnému rozpouštědlu tedy způsobí oslabení hydrofobních vazeb.
Sorpce separovaných molekul na sorbenty by tedy měla probíhat v prostředí s
vysokou iontovou silou, při pH, které je blízké izoelektrickému bodu a při laboratorní teplotě
(k zajištění stabilního teplotního režimu se doporučuje pracovat na termostatovaných
kolonách). Tyto podmínky jsou ideální pro techniku, která má následovat např. po frakčním
vysolování nebo po ionexové chromatografii, kde eluce byla provedena gradientem iontové
síly, aniž by bylo nutné předřadit odsolení roztoků.
Jedním z rozhodujících faktorů úspěšné sorpce je volba vhodného sorbentu, neboť
molekuly se mohou chovat zcela rozdílně na různých nosičích, ale zejména za použití
různých imobilizovaných ligandů (alifatické x aromatické apod.). Je nutné upozornit na to, že
častěji než příliš slabá vazba dělá v případě hydrofobní chromatografie problémy vazba příliš
silná, která může výrazně znesnadnit eluci a může vést až ke ztrátě biologické aktivity
separovaného materiálu, resp. k jeho denaturaci.
131
Desorpce
Při desorpci molekul z hydrofobního sorbentu musíme změnit podmínky tak, aby
klesla síla hydrofobních interakcí. Tyto změny se dějí obvykle postupně, takže pracujeme s
gradientovou elucí.
Změny, které použijeme pro desorpci (které vedou k oslabení hydrofobních vazeb)
jsou:
- výměna iontu s vyšším vysolovacím efektem za iont s nižším vysolovacím efektem
- snížení iontové síly elučního roztoku
- snížení polarity eluentu přidáním alkoholu nebo ethylenglykolu
- přidání detergentu do elučního roztoku
- změnou pH elučního roztoku ve směru od izoelektrického bodu. (Tento způsob je méně
obvyklý a zřídka se používá jako jediná změna.)
- snížení teploty. Nelze použít jako jedinou změnu.
Jestliže se k desorpci použijí detergenty, ty se budou adsorbovat na sorbent a před
novým použitím bude kolonu nutno regenerovat. Při regeneraci se doporučuje promývat
kolonu ethanolem a poté butanolem, které sníží polaritu systému a umožní odstranění
detergentů. Pak je ovšem třeba kolonu dokonale promýt destilovanou vodou a ekvilibrovat
startovním pufrem.
132
2.4.3 Další separační techniky založené na molekulovém rozpoznávání
Specifických interakcí mezi ligandem a molekulou lze využít i při dalších separačních
technikách, z nichž s mnohými jsme se již seznámili.
Afinitní dělení mezi dvě fáze
Techniku rozdělování látek ze směsi mezi dvě navzájem nemísitelné fáze
dvoufázového systému jsme si popsali v kapitole 2.2. Pro separaci biomolekul se používá
systém dvou vodných fází, z nichž jedna je tvořena vysokomolekulárním
polyethylenglykolem (PEG) a má spíše hydrofobní charakter, druhá je tvořena dextranem
nebo solemi a má charakter hydrofilní. V těchto dvou fázích se jednotlivé biomolekuly
extrahují podle rozdělovacího koeficientu K:
K = ch / cd (27)
c - koncentrace v horní a dolní fázi
Jestliže se na jeden z použitých polymerů (polyethylenglykol nebo dextran)
kovalentně naváže afinitní ligand, pak veškeré molekuly, které mají k tomuto ligandu afinitu,
budou strženy do fáze, v níž se ligand nachází, takže se výrazně změní rozdělovací koeficient
K příslušné molekuly. Jde-li o separaci bílkovin, je možno podmínky upravit tak, aby většina
molekul měla tendenci přejít do hydrofilní fáze (dolní, solné) či naopak do hydrofobnější
(horní s PEG) fáze. Ligand je pak navázán v opačné fázi, takže molekuly, které mají k
ligandu afinitu, budou mnohonásobně purifikovány.
Jako ligandy se v těchto případech používají zejména barviva, která jsou velmi levná
a vždy k dispozici. Technika afinitního dělení mezi dvě fáze je pak ideální pro operace ve
velkém měřítku. Může být vyvinuta v rychlou a efektivní metodu pro čištění enzymů, ale i
dalších bílkovin. Proti afinitní chromatografii je tato metoda rychlejší, méně závisí na difuzi,
vazebná kapacita na jednotku objemu je mnohem vyšší a může být použita v kontinuálním
provedení. Nevýhodou bývá složitější regenerace modifikovaného rozpustného polymeru.
Hlavní výhodou afinitního dělení mezi dvě fáze je fakt, že může být použito i pro
separaci celých buněk a buněčných částic.
133
Afinitní ultrafiltrace
Afinitní ultrafiltrace je technika, která zachovává výhody separace v homogenním
systému, ale obchází problém návratu modifikovaného rozpustného polymeru.
Afinitní sorbent přijde nad ultrafiltrační membránou do styku s roztokem látek, které
mají být purifikovány a naváže ty, které k němu mají afinitu. Balastní látky, které se nenaváží
na sorbent, projdou póry membrány, látka ve specifickém komplexu zůstává nad membránou.
Po dokonalém vymytí a oddělení balastních látek se provede disociace afinitního komplexu a
purifikovaná látka po uvolnění rovněž projde membránou.
Tato metoda se provádí i ve velkokapacitních ultrafiltračních zařízeních, kde
membrány tvoří stěny dutých vláken, jimiž recirkuluje roztok, obsahující afinitní sorbent
smíchaný se separovanou směsí. Balastní látky, které projdou póry membrány, vstoupí do
mezimembránových prostor, odkud jsou odtaženy. Po dokonalém oddělení zůstane v
recirkulujícím proudu uvnitř vlákna pouze afinitní komplex. Ten je poté disociován na
původní složky a žádaná látka rovněž projde membránou do mezimembránového prostoru,
odkud je odtažena.
Jediným omezením této metody je velký průměr pórů dosud používaných membrán,
takže afinitní ligandy musí být navázány buď na vysokomolekulární látky (dextran) nebo na
buňky.
Afinitní precipitace
Tato metoda využívá afinitních interakcí molekuly s ligandem v roztoku a následné
precipitace vzniklého komplexu. Jako srážecí prostředky se používají bifunkční ligandy,
např. nukleotidy spojené distančním raménkem (hlavně bis-AMP a bis-NAD) a barevné
ligandy, které se váží do aktivního místa enzymů a jiných biologicky aktivních bílkovin a tak
nekovalentně prokříží molekuly bílkovin a způsobí jejich vysrážení.
Obměnou srážecích metod je postup, při němž některé bílkoviny zůstanou v roztoku i
za podmínek, kdy je již většina bílkovin precipitována, t.j. za vysoké koncentrace
vysolovacího činidla. Jde zejména o případy, kdy se precipitace uskutečňuje syntetickými
polymery, např. PEG (polyethylenglykol), na němž je navázán ligand, nejčastěji barvivo.
Molekula a ligand spolu interagují a PEG, na němž je ligand navázán, obalí separovanou
134
molekulu a tak ji udrží v roztoku. Současně ji separuje od bílkovin, které s ligandem
neinteragují a za daných podmínek tudíž precipitují.
Bílkovinná molekula obalená „atmosférou“ PEG zůstává v roztoku i při koncentraci
PEG 12,5%, a to i tehdy, pracujeme-li při nízkém pH, kdy většina bílkovin ztrácí náboj a je
náchylnější k precipitaci. Při nízkém pH však roste i síla hydrofobních interakcí (bílkoviny
nemají náboj), takže obecně roste nebezpečí nespecifických interakcí a klesá tedy selektivita
metody.
Afinitní srážení má velký význam pro čištění enzymů a dalších bílkovin v
poloprovozním a provozním měřítku. Je to afinitní metoda a jako taková je vysoce selektivní.
Dá se proto použít pro purifikaci určité bílkoviny i v surových směsích. Kromě toho je to
rychlá metoda a PEG s navázaným ligandem se dá snadno regenerovat a znovu použít.
Bioselektivní (afinitní) eluce
O bioselektivní eluci jsme se již zmiňovali, když jsme diskutovali desorpci
separované molekuly z afinitního sorbentu. Afinitní eluce však nemusí být omezena pouze na
použití afinitních sorbentů, ale je možno ji využívat i při jiných typech chromatografie.
Volný ligand, který je v afinitním eluentu přítomen, vytvoří komplex s molekulou navázanou
na sorbentu a vzniklý komplex se již na sorbent není schopen vázat. Dojde tedy k eluci
separované molekuly. Jako příklad si můžeme uvést desorpci enzymu z ionexového sorbentu
pomocí substrátu příslušného enzymu. Vzhledem k tomu, že pro tento účel se biospecifická
eluce velice často využívá, bývá též nazývána substrátová eluce (obr. 2.81). Podobně je
ovšem možno použít antigen pro eluci protilátky nebo protilátku pro afinitní eluci antigenu.
Princip afinitní eluce z ionexového sorbentu pravděpodobně spočívá v tom, že
komplex biomolekula-ligand má změněný náboj oproti původní sorbované molekule a
nemůže se proto již na ionex vázat (obr. 2.80). V tom případě schopnost ligandu eluovat
molekulu z vazby na sorbent bude záležet na dvou faktorech, a to na disociační konstantě
komplexu biomolekula-ligand a na náboji ligandu.
Dalším důvodem desorpce molekuly po vytvoření komplexu biomolekula-ligand, je
konformační změna, která neumožní další vazbu na sorbent, a to i při vazbě na jiný než
ionexový sorbent.
135
Zvláštním případem afinitní eluce je eluce při hydrofobní resp. amfifilní
chromatografii. Jde zejména o chromatografii na sorbentech, kde ligand je vázán přes
distanční rameno, které má jak hydrofobní oblasti, tak oblasti s ionizovanými skupinami (obr.
2.82). Takové sorbenty jsou někdy nazývány imfilyty (ionex + amfilyt). Při afinitní eluci
volným ligandem se vytvoří komplex, který má v naprosté většině případů změněnou
schopnost vazby na výše popsaný sorbent.
Obr.2.80 Bioselektivní eluce z ionexového sorbentu - změna náboje Překvapivě však změny mohou být pro jednotlivé komplexy zcela opačného charakteru. V
některých případech síla vazby vytvořením komplexu roste, v jiných naopak klesá. Jen velmi
zřídka však zůstane síla vazby vytvořením komplexu nezměněna.
136
Bioselektivní eluce se může stát základem kvantitativního stanovení, jak je tomu v
případě AMP (viz obr.2.83).
Obr.2.81 Bioselektivní eluce z ionexového sorbentu - substrátová eluce Obr.2.82 Bioselektivní eluce při amfifilní chromatografii
137
Obr.2.83 Bioselektivní eluce jako základ stanovení AMP
Afinitní elektroforéza
Afinitních vztahů, t.j. interakce mezi molekulou a ligandem, lze využít i při
elektroforéze v gelu. Jestliže se ligand zachytí do struktury gelu, pak molekula, která se
pohybuje v elektrickém poli a má afinitu k ligandu, se bude na ligand vázat a její pohyb se
buď zcela zastaví nebo velmi výrazně zpomalí. O elektroforéze bude pojednáno v kapitole
2.5.
138
2.5 Elektromigrační (elektroforetické) metody
Elektromigračními či elektroforetickými metodami nazýváme soubor technik, které
využívají pohybu ionizovaných částic v elektrickém poli. Elektroforéza jako separační
technika byla prvně použita Tiseliem, který s ní v r. 1937 rozdělil směs bílkovin. Později za
tento objev obdržel Nobelovu cenu.
Jestliže jsou látky nesoucí náboj rozpuštěny v elektrolytu a umístěny v elektrickém
poli, začnou se pohybovat konstantní rychlostí úměrnou velikosti jejich nábojů, anionty k
anodě a kationty ke katodě. Rychlost, kterou se ion v elektrickém poli pohybuje může být
vyjádřena vztahem
v = μeE (28)
v = rychlost iontu μe = elektroforetická pohyblivost E = elektrické pole
Částice jsou při průchodu okolním mediem vystaveny odporu sil vnitřního tření.
Jejich mobilita je tedy výsledkem rovnováhy mezi silou, působící na ionty v elektrickém poli
a silou vnitřního tření.
μe = síla elektrického pole FE / síla vnitřního tření FF
FE = qE
FF = -6πηrv (29)
q = náboj iontu η = viskozita roztoku r = poloměr iontu v = rychlost iontu
Ze vztahu (29) vyplývá, že síla vnitřního tření se mění s viskozitou prostředí. Proto se
změnou teploty dojde ke změně této síly a tudíž i ke změně rychlosti pohybu částice.
V průběhu elektroforézy dojde k ustavení rovnováhy, která je definována
rovnováhou mezi silou elektrického pole a silou vnitřního tření. Při rovnováze budou mít obě
síly stejnou hodnotu, ale opačného směru.
139
qE = 6πηrv (30) Mobilitu je pak možno pomocí fyzikálních parametrů definovat následovně μe = q / 6πηr (31)
Z této rovnice je jasné, že malé částice s velikým nábojem mají velkou mobilitu
(pohyblivost), zatímco velké částice s malým nábojem mají mobilitu malou. Efektivní
mobilita, t.j. mobilita, kterou skutečně při elektroforéze naměříme, bývá obvykla nižší než
teoretická elektroforetická mobilita a je závislá na pH a použitém pufru. Úspěch separace
látek ze směsi lze předpokládat jen tehdy, budou-li mít separované látky dostatečně odlišné
efektivní elektroforetické pohyblivosti.
Snaha po dosažení co nejlepší separace vedla k vypracování značného množství
různých technik a jejich modifikací, které můžeme shrnout do 4 základních skupin:
- elektroforéza s pohyblivým rozhraním neboli volná elektroforéza
- elektroforéza na nosičích neboli zonová elektroforéza
- rovnovážná elektroforéza reprezentovaná izoelektrickou fokusací
- kapilární elektroforéza
2.5.1 Volná elektroforéza
V klasické „volné“ technice se elektroforéza provádí ve vodných roztocích pufrů a
částice putují směrem k elektrodě s opačnou polaritou rychlostmi, které jsou úměrné velikosti
jejich náboje. Velikost náboje a použitý gradient napětí tedy určují rychlost migrace a
vzájemnou separaci jednotlivých částic.
Účinnost separace při volné elektroforéze je limitována tepelnou difuzí a
konvekčními proudy v kapalině, které vznikají vlivem tepla, jež se vyvíjí při průchodu
elektrického proudu. Vlivem difuze se snižuje ostrost zon a tím se snižuje výrazně i účinnost
separace. Proto se elektroforéza často provádí v antikonvekčních mediích, jakými jsou např.
polyakrylamidové nebo agarosové gely. Takové provedení elektroforézy označujeme jako
elektroforézu na nosičích nebo zonovou elektroforézu.
140
2.5.2 Zonová elektroforéza
Zonová elektroforéza je metoda, již je možno použít pro analytické i preparativní
účely. Provádí se na nosičích, které jsou uspořádány do sloupce nebo rozprostřeny na ploše
(sklo, hliníkové folie apod.). K preparativním účelům se nejčastěji používá uspořádání nosiče
do sloupce, pak mluvíme o sloupcové elektroforéze, zatímco pro analytické účely je v
současné době běžnější uspořádání plošné.
Prvními použitými nosiči byly chromatografický (neklížený) papír, acetát celulosy,
škrob, celulosa. V současné době se používají zejména gelové materiály, a to agarosový gel,
škrobový gel a polyakrylamidový gel (obr.2.84). Elektroforetické nosiče musí být hydrofilní,
nerozpustné ve vodě a měly by mít co nejméně adsorpčních schopností.
Při použití gelových materiálů se při separaci látek ze směsi vedle elektroforetické
pohyblivosti uplatňuje i separace na principu molekulárního síta. Molekuly jsou ve svém
pohybu omezovány přítomným gelem a záleží na velikostí pórů v gelu jaká bude rychlost
pohybu. Velké molekuly jsou zpomalovány více než molekuly malé. Proto se separace děje
nejen na základě velikosti náboje, ale i na základě velikosti molekuly.
Obr.2.84 Struktura polyakrylamidového gelu
Elektroforéza v polyakrylamidovém gelu
141
Pravděpodobně nejčastěji používanou metodou je elektroforéza v polyakrylamidovém
gelu (PAGE). Ta se provádí, stejně jako elektroforéza na dalších gelech, ve speciálních
aparátech, v nichž se nosič se vzorkem k separaci umístí mezi 2 elektrody, mezi nimiž
prochází stejnosměrný proud. Tato celkem jednoduchá zařízení vyrábí řada světových firem.
Experimentální uspořádání elektroforézy v polyakrylamidovém gelu je dvojího typu:
- elektroforéza v trubičkách, vlastně sloupcové uspořádání, avšak ve velmi malých trubičkách
(obr.2.85)
- elektroforéza v plošném uspořádání, na destičkách s tenkou vrstvou gelu (obr.2.86).
Elektroforéza v trubičkách je staršího data a dnes se používá již méně. Je však vhodná
pro méně zkušené pracovníky, gely je možno bez problémů připravit v laboratoři bez
speciálního vybavení a zařízení, v němž se provádí, je jednodušší a proto i levnější. Z těchto
důvodů je stále ještě používána.
Plošné uspořádání má oproti uspořádání v trubičkách několik výhod:
- je citlivější
- lze ho snadno densitometricky kvantifikovat
- na jednu desku je možno nanést více vzorků, takže eventuální porovnání je snažší
- po usušení je možno elektroforeogram skladovat
Obr.2.85 Schema přístroje pro sloupcovou elektroforézu
Na druhé straně však dosažení uspokojivých výsledků vyžaduje určitou zkušenost,
příprava gelů je náročná a proto se často používají gely komerční, což ovšem znamená
142
finanční zátěž, přístroje pro tento typ provedení jsou dražší. V současné době se vyrábějí
přístroje, které jsou upraveny na použití velmi malých destiček a tak zkracují dobu trvání
pokusu, ale i výrazně šetří gelový materiál. Tyto přístroje ovšem musí být konstruovány tak,
aby i na krátké vzdálenosti, která je k disposici, došlo k dokonalé separaci. Ušetřený gelový
materiál však zvýšenou cenu těchto malých přístrojů více než kompenzuje.
Plošná elektroforéza se provádí buď horizontálně, kdy je gelová deska umístěna v
přístroji ve vodorovné poloze (obr.2.86), nebo vertikálně (deska je kolmo na podložku)
(obr.2.87 a 2.88). Oba tyto způsoby mají své speciální použití.
Obr.2.86 Přístroj pro horizontální elektroforézu Obr.2.87 Schema přístroje pro vertikální elektroforézu
143
Obr.2.88 Přístroj pro vertikální elektroforézu
Horizontální elektroforéza se používá zejména pro elektroforézu v
polyakrylamidovém a agarosovém gelu, pro SDS-techniky, pro analytickou i preparativní
elektrofokusaci, pro imunoelektroforézu, dvojrozměrné techniky, elektroblotting a stanovení
titračních křivek. Všechny tyto techniky budou popsány v dalším textu.
Vertikální elektroforéza se používá pro kontinuální a diskontinuální PAGE, pro
elektroforézu v gradientovém gelu, elektroforézu ve velmi tenkých gelech určených pro
autoradiografii, elektroforézu v agarosovém gelu a při dalších technikách.
Jak jsme se zmínili již dříve, sloupcovou metodu je možno použít i pro preparativní
účely. Přístroje, které jsou pro tyto účely vyráběny, jsou větší a ve většině případů mají
možnost chlazení. Na sloupec či spíše prstenec gelu se nanese vzorek a elektroforéza se
uspořádá tak, aby vzorek putoval shora dolů (t.j. u kladně nabitých látek bude dole katoda, u
záporně nabitých anoda). Dolní část gelu zasahuje do žlábku, jimž kontinuálně protéká velice
malou rychlostí eluent, nejčastěji pufr. Ten odvádí látky, které postoupily až na konec
gelového prstence, do zkumavek na automatickém jímači frakcí. Tak se od sebe oddělí látky
separované v oddělených zonách. Dobrých výsledků při tomto preparativním procesu však je
možné dosáhnout pouze za podmínek, při nichž se v analytickém provedení na trubičkách od
sebe zony vzdálí alespoň o 1 cm. Eluce zon se separovanou látkou je totiž problematická,
144
neboť při ní dochází vždy k určitému zdržení a nedostatečně vzdálené zony se tedy mohou v
elučním žlábku opět smísit (obr. 2.89).
Obr.2.89 Přístroj pro preparativní gelovou elektroforézu s kontinuální elucí 1 a 2 jsou platinové elektrody, 3 a 4 horní a dolní elektrodový prostor, 5 sloupec gelu, 6 a 7 chladicí prostory, 8 skleněná membrána, 9 eluční komůrka A vlastní přístroj, B půdorys eluční komůrky
Své problémy však má i analytické provedení PAGE. Užití jednoduchých
kontinuálních pufrovacích systémů s sebou nese nevýhodu v podobě vyššího stupně difuze a
tento vliv je výrazný u menších, rychle putujících molekul. Aby se dosáhlo přiměřeného
elektroforetického rozlišení těchto rychleji se pohybujících zon je nezbytné nanést velmi
malý objem koncentrovaného vzorku na start jako velmi ostrý, úzký pruh. To není vždy
jednoduché a vyžaduje to, vedle dostatečně koncentrovaného vzorku, i určitou zručnost.
145
K překonání tohoto problému byla zavedena technika diskontinuální elektroforézy v
polyakrylamidovém gelu, která používá 2 gely s různě velikými póry a několik pufrů s
odlišným pH. Tzv. startovní nebo zaostřovací gel, který je v horní části a tedy přijde jako
první do styku s dělenou směsí, má velké póry; separační gel, který je umístěn pod ním, je
běžný gel používaný při zonové elektroforéze. V separačním gelu a ve spodní elektrodové
nádobce se použije obvyklý pufr, zatímco pro přípravu startovního gelu a pro rozpuštění
vzorku se použije pufr, jehož pH je asi o 2 jednotky nižší. Pufr umístěný v horní elektrodové
nádobce obsahuje obvykle glycin, ev. jinou slabou kyselinu a jeho pH se upraví na pH blízké
pufru v dolní nádobce. Při zapnutí proudu ionty z horní nádobky putují do startovního gelu,
kde se setkají s pH, které je nižší než je jejich pK, proto ztratí náboj a nebudou se v
elektrickém poli pohybovat. Aby byl udržen za těchto okolností v okruhu konstantní proud,
dojde (podle Ohmova zákona) k místnímu zvýšení intenzity elektrického pole, což vede ke
zrychlení pohybu makromolekul ve formě aniontů. V okamžiku, kdy anionty vstoupí do
separačního gelu, jejich pohyb se zpomalí, neboť přijdou do prostředí, kde jsou i další ionty z
pufru. Tento jev způsobí, že ionty makromolekul vstupují do separačního gelu v podobě
velmi úzkých zón, které jsou seřazeny podle svých pohyblivostí mezi pohybující se ionty ze
startovního gelu a ionty z horní nádržky. Takto získaná hustota zón při vstupu do separačního
gelu značně zvyšuje stupeň rozlišení jednotlivých molekul. V separačním gelu se vedle
elektroforetické pohyblivosti uplatní i princip molekulárního síta, což vede ještě k
dokonalejší separaci. Diskontinuální (disková) elektroforéza se provádí jak v trubičkovém tak
plošném uspořádání v přístrojích, které se používají pro ostatní typy zonové elektroforézy
(obr.2.88).
Elektroforéza v gradientovém gelu
Dalšího zlepšení separace lze dosáhnout použitím tzv. gradientových gelů. Tím se
rozumějí gely, u nichž se s rostoucí vzdáleností od startu používá rostoucí koncentrace
polyakrylamidu, takže u vytvořeného gelu se směrem od startu zmenšuje velikost pórů. Při
postupu v gradientovém gelu se molekuly setkávají se stále větším odporem vůči svému
pohybu až se jejich pohyb prakticky zastaví, neboť již nejsou schopny dále prostupovat
gelem. Vzdálenost od startu, kterou může molekula urazit, závisí na její velikosti. Malé
molekuly mohou houstnoucím gelem prostupovat déle než molekuly velké. Tímto způsobem
146
se dosáhne vyššího zaostření jednotlivých zón, obsahujících molekuly stejné velikosti.
Hlavním separačním faktorem je tedy velikost molekuly a elektroforetický pohyb jen
zprostředkuje pohyb molekul v elektrickém poli.
Elektroforézu v gradientovém gelu je možno provádět jak v trubičkách, tak plošně.
Protože příprava gradientových gelů není jednoduchá záležitost, dává se přednost komerčně
připraveným gelům. Vzhledem k tomu, že komerčně jsou gradientové gely vyráběny pouze v
plošném uspořádání (na destičkách), provádí se tento způsob elektroforézy ve většině případů
plošně.
Obr.2.90 Elektroforeogram lidského sera získaný diskovou elektroforézou
Pulzní gelová elektroforéza
Jestliže máme separovat směs nukleových kyselin, není často PAGE vhodnou
metodou. Na polyakrylamidovém gelu je možno separovat jen malé nukleové kyseliny.
147
Nukleové kyseliny obsahující několik tisíc párů nukleotidů jsou již pro pohyb v
polyakrylamidovém gelu příliš velké a musí se proto použít agarosový gel, a to takový, který
obsahuje jen málo agarosy. Takové gely jsou velmi křehké. Avšak i gel s obsahem 0,1%
agarosy, který je nejnižší možnou použitelnou koncentrací, je schopen separovat pouze
molekuly neobsahující více než 100 000 párů bazí. Teprve nedávno vyvinutá pulzní gelová
elektroforéza umožňuje separovat molekuly obsahující až 12 milionů párů bazí.
Pulzní elektroforéza je založena na použití dvou (nebo i více) elektrických polí, která
jsou alternativně aplikována v různých úhlech po přesně stanovené časové úseky. Při aktivaci
prvního elektrického pole se separované molekuly srovnají do správného směru a začnou se
pohybovat gelem. Přerušení tohoto elektrického pole a zařazení elektrického pole druhého
přinutí molekuly změnit směr svého pohybu. Na náhlou změnu elektrického pole reagují
dlouhé molekuly nukleových kyselin tak, že nejprve zorientují svůj dlouhý řetězec podél
nového směru elektrického pole a pak teprve mohou putovat gelem od katody k anodě. Čas
potřebný k přeorientování molekul nukleových kyselin stoupá s délkou jejich řetězce, proto
kratší molekuly mohou putovat gelem výrazně rychleji než molekuly velké. Tím se dosáhne
vyšší účinnosti dělení. Separace se děje převážně podle velikosti molekul.
Používaný elektroforetický přístroj má dva nebo více párů elektrod rozmístěných
okolo desky s agarosovým gelem. Na jednotlivé elektrodové páry jsou postupně přiváděny
napěťové pulsy (0,1 - 1000s podle velikosti dělených molekul) (viz obr.2.91).
Elektroforéza v polyakrylamidovém gelu s dodecylsulfátem sodným (SDS-PAGE)
Při separaci bílkovin se PAGE dočkala velkého rozšíření v kombinaci s užitím
anionaktivního detergentu dodecylsulfátu sodného (SDS). SDS nese poměrně vysoký náboj a
proto ve vazbě na bílkovinu vyrovnává nábojové rozdíly bílkovinných molekul a ty se pak
pohybují v gelu jen podle velikosti. Všechny bílkoviny váží asi 1,4g SDS na 1 g bílkoviny a
při tom unifikují i svou konformaci. Výsledné komplexy SDS - bílkovina pak mají stejnou
hustotu povrchového náboje a zároveň se jejich konformace do té míry unifikuje, že relativní
molekulová hmotnost bílkoviny odpovídá velikosti jejího komplexu s SDS. Mobilita
komplexu SDS - bílkovina v polyakrylamidovém gelu je přímo úměrná logaritmu
molekulové hmotnosti příslušné bílkoviny. Takto stanovené hodnoty relativní molekulové
hmotnosti bílkoviny jsou všeobecně uznávány pro účely charakterizace bílkovinného
148
preparátu. Nevýhodou je, že vazbou SDS na bílkovinu ve většině případů dochází ke ztrátě
biologické aktivity bílkoviny, takže např. enzymy již po proběhnutí elektroforézy není možné
na základě aktivity prokázat.
Obr.2.91 Přístroj na pulsní gelovou elektroforézu Hannigova kontinuální elektroforéza Jde o kontinuální beznosičovou průtokovou zonovou elektroforézu. Principem této
metody je separace molekul v pohybujícím se elektrolytu, jehož směr pohybu je kolmý na
směr elektrického pole. Výsledkem je pohyb molekul (nebo částic) vychylující se od směru
toku nosného elektrolytu v závislosti na velikosti náboje, který nese (viz obr. 2.92). Pro
pohyb částic při tomto typu elektroforézy platí jednoduchý vztah
tg α = v / u (32)
α = úhel vychýlení postupující zony od směru toku nosného elektrolytu v = rychlost elektroforetického pohybu u = rychlost toku nosného elektrolytu
Elektroforéza probíhá ve speciálním přístroji s elektroforetickou komorou, která má
tvar ploché čtvercové nebo obdélníkové štěrbiny o rozměrech stran v desítkách centimetrů a
výškou vrstvy 0,25 - 0,60 mm. Stabilizace zon je zajištěna laminárním prouděním a
dostatečně tenkou vrstvou elektrolytu. Pro zachování konstatntní hodnoty úhlu α je třeba
udržet konstantní podmínky separace v dlouhodobém režimu. Přístroj proto musí být
149
vybaven stabilizovaným zdrojem napětí nebo proudu, účinným thermoregulačním systémem
a přesně pracujícími čerpadly pro kontinuální přívod vzorku a odvod separovaných složek do
jímače frakcí.
Metoda byla původně použita pro separaci nízkomolekulárních a vysokomolekulárních
rozpustných látek, později se však ukázalo, že je velmi výhodná i pro separaci koloidů,
subcelulárních částic a buněk, pokud ovšem nesou náboj. V tom případě však musí být
elektroforetický přístroj konstruován tak, aby nedocházelo k rychlé sedimentaci částic na
stěnách komory. Vyrábějí se proto dva typy přístrojů pro kontinuální beznosičovou
elektroforézu, a to přístroje horizontální, které jsou vhodné pro separaci rozpustných látek a
přístroje vertikální, určené pro separaci sedimentujících látek. Oba typy přístrojů jsou na
výstupu z elektroforetické komory opatřeny vývody a čerpadly pro odběr frakcí.
Hannigova elektroforéza má četné aplikace zejména v oblasti separace buněk a
subcelulárních částic, ale používá se též pro separace biologických extraktů, peptidů a
bílkovin.
Obr.2.92 Schema komory přístroje pro Hannigovu kontinuální elektroforézu. Šipky naznačují směr toku nosného elektrolytu E, S je místo nástřiku vzorku. F1 až F4 složky vzorku 2.5.3 Izoelektrická fokusace (IEF)
Izoelektrická fokusace je další z elektromigračních metod. Patří do kategorie
rovnovážné elektroforézy. Od zonální elektroforézy, která se provádí za konstantního pH, se
liší tím, že v mediu mezi elektrodami se díky přítomnosti nízkomolekulárních amfolytů
vytváří gradient pH. Amfoterní molekula nesoucí náboj se pohybuje vlivem elektrického
150
proudu v gradientu pH až do okamžiku, kdy se dostane do oblasti pH shodné s jejím
izoelektrickým bodem a její pohyb se zastaví. Pokud molekula z tohoto místa difunduje pryč,
změní se vstupem do oblasti s jiným pH její výsledný náboj a elektroforetický pohyb ji vrátí
zpět do místa jejího izoelektrického bodu. Každá molekula je tedy fokusována (zaostřena) do
úzké zóny kolem svého izoelektrického bodu. Tímto způsobem je možno od sebe oddělit
molekuly, jejichž izoelektrický bod se liší o 0,001 jednotky pH.
Vznik gradientu pH je založen na elektrochemických reakcích, k nímž dochází na
elektrodách:
na anodě 6H2O → 4H3O+ + 4e-
na katodě 4H2O+ 4e- → 2H2 + 4OH-
Pro tvorbu stabilních gradientů pH se používá směs nízkomolekulárních oligomerů
obsahujících disociovatelné skupiny, zejména karboxylové skupiny a aminoskupiny, jejichž
izoelektrické body se pohybují ve zvoleném rozmezí. V antikonvekčním mediu, jakým je
polyakrylamidový nebo dextranový gel, se pod vlivem elektrického pole směs těchto
polyamfolytů seřadí podle svých izoelektrických bodů tak, že nejkyselejší se shromáždí u
anody a směrem ke katodě se rozmisťují amfolyty se stoupající bazicitou. Elektrolytické
pochody probíhající u elektrod poskytují amfolytům vodíkové a hydroxylové protiionty.
Výsledkem tohoto pochodu je vytvoření gradientu pH, v němž proběhne izoelektrická
fokusace. pH gradient se často vytváří v denzitním gradientu sacharosy, který stabilizuje
fokusované elektrolyty proti míchání s okolím.
Interval pH, tvar vzniklého gradientu a vlastnosti gradientu jsou určeny počtem a
vlastnostmi jednotlivých amfolytů. Protože se gradient vytváří fokusací složek amfolytů při
jejich pI, musí mít amfolyty dostatečnou pufrovací kapacitu v oblasti svých pI, aby byl
gradient jednoznačně určen i v přítomnosti amfoterních látek ze vzorku. Pufrovací kapacita
amfiiontu však způsobí, že při dosažení jeho pI se vytvoří malá prodleva pH. Existuje-li v
roztoku více amfoterních substancí s pufrovací kapacitou, které se od sebe budou lišit svými
pI, vytvoří se gradient pH. Bude-li v roztoku amfolytických substancí s vhodně rozmístěnými
izoelektrickými body a s tlumivými kapacitami dostatečné množství, vytvoří se kontinuální
pH gradient bez prodlev, neboť jednotlivé prodlevy se budou navzájem překrývat. Úplné
oddělení nízkomolekulárních látek, které se používají pro tvorbu amfolytových pufrovacích
systemů(nazývaných amfolytové nosiče), v elektrickém poli není možné, neboť velice rychle
difundují a zony jejich působení se překrývají. Tím se výrazně liší od vysokomolekulárních
látek, které se nejčastěji izoelektrickou fokusací separují.
151
Izoelektrická fokusace se využívá převážně pro analytické účely, a to pro stanovení
izoelektrického bodu separovaných látek, stanovení titračních křivek a k identifikaci
jednotlivých složek separovaných směsí. Jsou však známa i jeho preparativní použití.
Efektivní je i technika elektroforetické desorpce, která se uplatní zejména při práci s
afinitními komplexy. K rozdělení těchto komplexů je často nutné používat poměrně drastické
eluční metody, které mohou častečně zlikvidovat biologickou aktivitu separované sloučeniny.
S podobným problémem se můžeme setkat i při uvolňování některých bílkovin z
polyakrylamidového gelu po skončení elektroforézy. Elektroforetická desorpce, založená na
IEF, uvolňuje velmi šetrně separované látky z pevných komplexů a odvádí je do míst jejich
izoelektrického bodu.
IEF je možno provádět dvojím způsobem: v trubičkách nebo plošně. Provedením IEF
připomíná PAGE, liší se však principem dělení a použitými materiály. Obvykle však je
možné pro PAGE i IEF používat stejná zařízení. IEF je možno provádět i volně, t.j. bez
nosičů, např. v trubici, na jejichž obou koncích jsou umístěny elektrody. Po ustavení
rovnováhy však je nutno separované látky od sebe rychle oddělit, aby po průchodu proudu
nedošlo ke zpětnému promíchávání.
2.5.4 Afinitní elektroforéza
Afinitní elektroforéza se provádí v gelu, do něhož byl zapolymerován nebo na nějž
byl navázán afinitní ligand (barevný ligand, inhibitor enzymu apod.). Jestliže se v takovémto
gelu provede elektroféza směsi, jejímž členem je molekula se specifitou vůči ligandu, tato
molekula se buď úplně zastaví (v případě, že je dostatečné množství ligandu), nebo bude
alespoň výrazně zpožděna a tak se spolehlivě oddělí od ostatních složek směsi. Porovnáním s
kontrolním gelem bez imobilizovaného ligandu lze určit, který protein v analyzované směsi
má pro daný ligand afinitu a zda čištěný preparát obsahuje vazebně inaktivní příměsi. Navíc
ze stupně retardace (zpoždění) a koncentrace imobilizovaného ligandu lze stanovit disociační
konstantu komplexu biomolekula-ligand.
Pro kvalitativní účely lze vedle afinitní PAGE použít i afinitní IEF (izoelektrickou
fokusaci).
152
Obr.2.93 Elektroforeogram DNA získaný pulsní gelovou elektroforézou 2.5.5 Dvojrozměrná elektroforéza
Při separaci či analýze komplikovaných vzorků často nevystačíme pro dokonalou
separaci s jednou z výše uvedených elektroforetických metod. Ke zlepšení separace je možno
provádět prakticky libovolnou z popsaných elektroforetických metod postupně ve dvou
navzájem kolmých směrech. Výhodné je, kombinují-li se při tom dvě principielně odlišné
elektroforetické metody, např. v jednom směru izoelektrická fokusace, ve druhém směru
SDS-elektroforéza. Ačkoliv existuje celá řada možností kombinace dvou metod či dvakrát
153
stejné metody v kolmých směrech, dvojrozměrná elektroforéza se nejčastěji provádí
některým z dále uvedených způsobů:
1. PAGE v trubičce se kombinuje s PAGE na desce. Nejprve se nechá proběhnout PAGE v
trubičce. Gel z trubičky se pak podélně připolymeruje k připravené desce
polyakrylamidového gelu a nechá se proběhnout elektroforéza v druhém směru po desce.
2. Kombinace PAGE a SDS-PAGE. Provádí se na desce. Po proběhnutí PAGE v jednom
směru se deska otočí o 90o a v druhém směru se nechá proběhnout jako SDS-PAGE. Jde o
kombinaci dvou principů: v jednom směru se látky separují podle náboje, ve druhém podle
velikosti molekuly.
3.Kombinace IEF a SDS-PAGE. IEF se provede v trubičce, která se pak připolymeruje k
připravené polyakrylamidové desce a nechá se proběhnout elektroforéza s SDS v kolmém
směru. Jde tedy o kombinaci separace podle izoelektrického bodu a podle velikosti molekuly.
2.5.6 Izolace separovaných látek z gelové matrice
Provádíme-li elektroforézu preparativně, tj. s cílem vyizolovat separované látky,
musíme po rozdělení na gelové desce nebo sloupci látky z gelu uvolnit. Požadavek na
uvolnění separované látky z gelu se může vyskytnout i při analytickém provedení gelové
elektroforézy, má-li být separovaná látka dále analyzována. Desorpce z gelu je obdobný
proces jako uvolňování látky z komplexu, např. při rozrušení vazby mezi ligandem a
biomolekulou při afinitní chromatografii. Proto se používají i obdobné techniky.
Pro eluci je možno využít difuze. Část gelu, na níž se vyskytuje požadovaná látka po
separaci, se vyřízne a vloží do nádobky s vhodným pufrem. Za intenzivního míchání se látka
desorbuje z gelu a uvolňuje do roztoku, roztok se separovanou látkou se pak oddělí
centrifugací a zahustí. Tato metoda je sice jednoduchá, ale nezaručuje úplnou desorpci
separované látky, resp. její výtěžky jsou velice nízké. Pro některé gely, např. pro PAG, se
nehodí vůbec.
Nejčastěji používanými technikami pro eluci separovaných látek z gelu jsou
elektromigrační techniky. Je to zejména tzv. elektroeluce, popsaná v kapitole 2.4.1 (viz též
obr.2.66) nebo elektroforetická desorpce, popsaná v kapitole 2.5.3. Elektroforetická desorpce
154
je založena na principu izoelektrické fokusace a oproti elektroeluci, která využívá prostý
elektroforetický pohyb, má výhodu koncentrace látky v ostrých zonách (desorbované složky
putují do míst svého izoelektrického bodu, tam se koncentrují a fokusují), které pak opouštějí
sloupec či desku.
Obě elektromigrační techniky lze použít pro eluci z gelu při plošném i sloupcovém
uspořádání. V některých případech jsou konstruována zařízení, která umožňují spojení eluce
s vlastní elektroforézou, takže eluční proces je kontinuální. Ty se používají zejména při
preparativním sloupcovém uspořádání (kap.2.5.2 a obr. 2.89).
Při plošných technikách je běžná diskontinuální eluce. Ta se provádí v nádobách s
oddělenými elektrodovými prostory (obvykle ve vertikálním uspořádání), které jsou
propojeny jednou nebo více trubičkami, jejichž dno tvoří frita. Na dolní části trubičky je
pevně nasazen nástavec s membránou (nazývaný též dialyzační nástavec). Do trubičky nad
fritu se umístí výřez gelu obsahující složku, která má být desorbována, a zalije se vhodným
pufrem. Po aplikaci elektrického pole dojde k desorpci složky z gelu a k jejímu
elektroforetickému pohybu v pufru. Elektrody je třeba zapojit tak, aby se eluovaná složka
pohybovala směrem dolů (závisí na náboji složky). Frita brání průchodu gelu, ale umožní
průchod eluovaných složek
(i makromolekul), které se hromadí v prostoru mezi fritou a membránou. Membrána musí
být volena tak, aby požadovaná složka zůstala nad membránou. V popsaném zařízení je
možno současně eluovat několik odseparovaných látek, podle počtu trubiček, které se mezi
elektrodové prostory umístí.
155
Obr. 2.94 Přístroj na preparativní gelovou elektroforézu s diskontinuální elucí 1 gelový sloupec, 2 dialyzační nástavec, 3 a 4 kapiláry, 5 a 6 elektrody, 7 čerpadlo, 8 UVmonitor
Zařízení uvedené na obr. 2.94 je pouze obměnou výše popsaného diskontinuálního
zařízení. Je konstruováno tak, že mezi elektrodovými prostorami je pouze jediná trubička a
do ní se vloží celý gel po separaci. Jednotlivé zony jsou pak podle výše uvedeného principu
postupně eluovány.
2.5.7 Vizualizace separovaných látek
Vzhledem k tomu, že většina látek, které separujeme, je bezbarvá, po proběhnutí
elektroforetické metody musíme zařadit tzv. vizualizaci neboli zviditelnění příslušných
složek směsi. Konečné rozlišení separovaných látek je na tomto kroku značně závislé.
Nejčastěji jde o využití barevných reakcí. Technikám vizualizace pro jednotlivé látky byla
věnována značná pozornost, nejpropracovanější jsou však pravděpodobně techniky
vizualizace bílkovin.
Pro vizualizaci bílkovin se nejčastěji používá adsorpce barviva - amidočerni,
methylenové modři, Coomassie blue - na povrch bílkoviny. Gel se po skončené elektroforéze
ponoří na několik minut do roztoku příslušného barviva a pak se několik hodin vypírá ve
zředěné kys.octové (7 %). V místech, kde je barvivo pevně adsorbováno na bílkovinu, k
odbarvení nedojde, z ostatních částí gelu je barvivo vymyto. Zony bílkovin budou tedy
barevné na bezbarvém pozadí.
Až 50x jsou citlivější metody vizualizace bílkovin založené na vyredukování stříbra z
amoniakálního roztoku v těch místech na gelu, kde jsou fixovány bílkoviny.
156
Dalším prostředkem pro detekci bílkovin je barvivo fluoreskamin. Je to
nefluoreskující molekula, která po reakci s primárními aminy (např. lysinem) dává produkt s
vysokou fluorescencí v UV-světle.
Jsou-li separovány radioaktivně značené bílkoviny, používá se k detekci metody
autoradiografické, která umožňuje detegovat i mikrokvanta bílkoviny. Autoradiografické
obrazy vznikají účinkem záření radionuklidů na vrstvu fotografické emulze.
Glykoproteiny, stejně jako další cukerné sloučeniny (i nebílkovinné) jsou obvykle
detegovány tak, že cukerná složka je oxidována jodistanem a vzniklé aldehydické skupiny
reagují s vhodným činidlem za vzniku zbarvení. K barvení cukerných složek se používají i
další reakce známé z kvalitativního průkazu cukrů, např. fuchsinové činidlo, tetrazoliové soli
apod.
Zvláštním případem je vizualizace látek, které prokazují biologickou aktivitu.
Bílkoviny s enzymovou aktivitou mohou být detegovány na základě enzymových reakcí za
vzniku barevných produktů (rekce glukosy s glukosaoxidasou a peroxidasou), nebo naopak
produktů, které ztrácejí schopnost dávat barevné reakce (škrob rozložený pomocí amylas
ztrácí schopnost dávat barevnou jodoškrobovou reakci - zony obsahující amylasy jsou
bezbarvé na temně modrém pozadí). Po skončené elektroforetické separaci se gel ponoří do
roztoku, obsahujícího substrát reakce a další složky, které dávají s produktem barevné
sloučeniny. V místech, kde je přítomna bílkovina s enzymovou aktivitou dojde k barevné
reakci (nebo k odbarvení - amylasa). Vizualizaci na základě biologické aktivity nelze použít
po SDS-PAGE, neboť dojde ke konformačním změnám bílkovin a ke ztrátě jejich biologické
aktivity.
DNA lze detegovat selektivním barvením tzv. interkalačními činidly. Jsou to
sloučeniny obsahující aromatické kationty, např. ethidiumbromid, proflavin, akridinová oranž
(obr.2.95). Tato barviva se váží interlakací (vmezeřením mezi páry bazí) na šroubovici DNA,
kde pak v UV-světle intenzivně fluoreskují, respektive výrazně zvyšují existující
157
fluorescenci. Jednovláknové DNA a RNA také zvyšují fluorescenci ethidia, ne však tak silně
jako dvouvláknová DNA.
Obr.2.95 Interkalační činidla pro vizualizaci DNA
Většina nukleových kyselin, ale i některé proteiny, jsou po skončené elektroforéze
uzavřeny uvnitř gelové matrice a jejich přímé barvení je proto obtížné. Aby byly dosažitelné
pro barviva nebo jiné specifické způsoby detekce, je výhodné je přemístit na membrány
různých typů (nitrocelulosové, nylonové apod.), které nukleové kyseliny, eventuálně
proteiny, váží, ale současně je zpřístupňují. Tyto techniky se označují jako přenosy, častěji se
však používá anglického výrazu blotting.
Southernův přenos (Southern blotting) slouží k identifikaci DNA se specifickým
pořadím bazí. Po skončené elektroforéze se gel ponoří do roztoku NaOH, tím se DNA
převede na jednovláknovou formu. Na gel se pak přiloží nitrocelulosová membrána a na ní
dostatečné množství neklíženého papíru, který nasává vodu skrz nitrocelulosovou membránu.
Tím se dostane membrána do styku s jednovláknovou DNA, již je schopna poměrně pevně
vázat. DNA je pak umístěna na nitrocelulosové membráně v místech, kde se nacházela na
gelu. Přenos na nitrocelulosovou membránu se efektivněji provádí elektroforeticky, tak, že
gelová deska a membrána se umístí do elektrického pole. Pak jde o elektropřenos neboli
elektroblotting. Po skončeném přenosu se membrána navlhčí tzv. nukleotidovou sondou, což
je DNA či RNA komplementární k hledané DNA, která však musí být nějakým způsobem
označena, a nechá se nějakou dobu hybridizovat. Značení je možné provést použitím
radionuklidu s 32P (musí se vyvolat přiložením k fotografické desce), nebo připojením sondy
158
k enzymu, který vytvoří na povrchu určité DNA barevný nebo fluorescenční povlak. Takto
může být identifikována DNA s požadovaným pořadím bazí. 1Northern blotting (přenos) slouží k detekci specifické RNA. Využívá vazby RNA na
nitrocelulosovou membránu a její hybridizaci s radioaktivně značenými sondami v podobě
komplementárních DNA nebo RNA.
Western blotting, zvaný též imunoblotting, je používán pro detekci bílkovin. Směs
proteinů je přenesena z gelu na nitrocelulosovou mebránu a jednotlivé proteiny se identifikují
podle toho, jak se váží s příslušnými protilátkami. Na bílkovinu, kterou chceme identifikovat,
se naváže značená protilátka. Protilátky mohou být značeny 125I nebo enzymy.
Nejpoužívanější enzymy pro značení jsou alkalická fosfatasa a křenová peroxidasa.
Identifikace příslušné bílkoviny je umožněna finální enzymovou reakcí, při které se z
chromogenního substrátu uvolňuje barevná látka.
V některých případech, kdy je vazba proteinu na nitrocelulosovou membránu příliš
pevná, doporučuje se použít papír s (diazobenzyloxy)methoxylovými skupinami, reagujícími
s koncovými aminoskupinami proteinů za vzniku kovalentní vazby.
2.5.8 Imunoelektroforéza
Imunoelektroforéza je elektroforetická metoda, která využívá imunochemického
principu, tedy specifické interakce antigenu s protilátkou za vzniku nerozpustného komplexu,
k detekci separovaných látek. V prvé etapě se rozdělí směs antigenů elektroforeticky v
agarovém gelu na jednotlivé frakce. Po skončení elektroforézy se nanese do žlábku podél
rozdělených antigenů antisérum (polyvalentní protilátka) a nechá se proběhnout dvojitá
imunodifuze. Obě složky, antigen i protilátka, při tom difundují do gelu a v místě, kde se
setkají, vytvoří precipitační linii, která je konvexní směrem ke žlábku s protilátkou
(viz obr. 2.96). Vzniklá precipitační linie se obarví některou z metod na detekci bílkovin,
např. amidočerní.
Pro imunoelektroforézu bylo vypracováno několik dalších technik, které využívají
imunoelektroforetického principu. Jednou z nich je protisměrná imunoelektroforéza. Do gelu
se vykrojí dvě rovnoběžné řady jamek o průměru 2-3 mm. Vzdálenost jamek v jedné řadě je
4-5 mm, vzdálenost obou řad je 6-10 mm. Do jedné řady se pipetují roztoky antigenu, do
159
druhé protilátka. Při elektroforéze migrují obě složky proti sobě a v zoně ekvivalence vytvoří
precipitační linii. Protože elektroforéza probíhá v pufru při pH 8,6, pohybuje se protilátka
směrem ke katodě. Metodu lze proto použít pouze pro průkaz antigenů s anodickou
pohyblivostí a roztok antigenu je nutno umístit blíže ke katodě než protilátky.
Elektroimunodifuze bývá nazývána též elektroimunoprecipitace nebo častěji
„raketová technika“, neboť vzniklá precipitační linie má tvar rakety. Při této metodě se
antisérum (protilátka) přimíchá při 50oC přímo do nosného gelu (agar nebo agarosa), ten se
pravidelně rozestře na skleněnou destičku a nechá ztuhnout. Antigen se nanese do jamek
vyhloubených v gelu. Po vložení desky do elektrického pole se antigen začne pohybovat.
Podstatou metody je neustálé rozpouštění komplexu antigen-protilátka přebytkem putujícího
antigenu, a to až do okamžiku, než je veškerý antigen vyvázán specifickou protilátkou v gelu.
Precipitační linie tak dostane tvar rakety, jejíž plocha je úměrná koncentraci přítomného
antigenu. Vzhledem k tomu, že rakety jsou obvykle úzké a dlouhé, lze jejich plochu
aproximovat výškou, t.j. vzdáleností vrcholu od startu. Tuto metodu lze tedy využít i pro
kvantitativní stanovení antigenu.
Dvojrozměrná imunoelektroforéza je kombinací elektroforézy a elektroimunodifuze.
Směs antigenů se nejprve rozdělí elektroforeticky v agarosovém nebo polyakrylamidovém
gelu a vyřízne se pruh gelu tak, aby obsahoval separované antigeny. Tento pruh se položí na
okraj čisté skleněné destičky, která se doplní agarosovým gelem obsahujícím protilátky. Pak
se ve směru kolmém ke směru původnímu uskuteční druhá elektroforéza. Antigeny migrují
do gelu s protilátkami a v zonách precipitace vytvářejí široké precipitační rakety nebo
vrcholy
(obr. 2.97).
1 Přenos sloužící k identifikaci DNA navrhl pan Southern (v překladu "Jižní"). K pojmenování dalších přenosů pak bylo využito slovní hříčky a byly nazvány "Nothern" (severní) a "Western" (západní).
160
Obr.2.96 Elektroforeogram imunoelektroforézy Obr.2.97 Dvojrozměrná imunoelektroforéza
2.5.9 Kapilární elektroforéza
Kapilární elektroforéza, častěji nazývaná vysokoúčinná kapilární elektroforéza
(HPCE), je elektroforetická metoda, která se provádí v kapiláře s vnitřním průměrem
25 - 75 μm a délkou 100 - 1000 mm. Oba konce kapiláry jsou ponořeny do elektrodových
nádobek naplněných, stejně jako kapilára, nosným elektrolytem. Do nich jsou ponořeny
platinové elektrody. Poblíž katodového konce kapiláry je umístěn detektor (obvykle UV).
Vzdálenost od anodového konce kapiláry k detektoru se nazývá efektivní délka kapiláry.
Vzorek pro separaci se aplikuje na anodovém konci kapiláry (viz obr.2.98).
Vedle elektroforetických principů elektroforézy, t.j. pohyb molekul nesoucích náboj v
elektrickém poli, se při separaci látek kapilární elektroforézou uplatní i elektroosmotický tok
(EOF). Je to spontánní tok kapaliny v kapiláře v důsledku náboje na vnitřní straně kapiláry.
161
Obr.2.98 Kapilární elektroforéza
Ve vodném prostředí nese většina pevných povrchů záporné náboje. Je to výsledek
ionizace povrchu, eventuálně adsorpce některých nabitých iontů na povrchu. Křemenné sklo
obsahuje silanové skupiny (SiOH), které mohou v prostředí s pH vyšším než 4 existovat ve
formě iontu (SiO-), takže v křemenných kapilárách pochází záporný náboj především z těchto
skupin. Naopak u kapilár z inertního materiálu, např. z teflonu, jsou zdrojem povrchového
náboje především adsorbované ionty.
Protiionty (nejčastěji kationty) se shromažďují u povrchu kapiláry a vytvářejí
dvojvrstvu. Potenciální rozdíl, který vzniká, se označuje jako zeta potenciál. Jestliže je
kapilára umístěna v elektrickém poli, kationty, které tvoří dvojvrstvu, se začnou pohybovat
směrem ke katodě. Protože jsou solvatované, strhnou s sebou veškerou kapalinu v kapiláře.
Tak dojde v kapiláře k toku směrem ke katodě. Je to tak zvaný elektroosmotický tok
(obr.2.99).
Při opačném náboji na stěně kapiláry, který může být získán použitím odlišných
materiálů ev. modifikacemi stěny kapiláry, o čemž bude pojednáno později, se EOF bude
pohybovat opačně, tedy k anodě.
Velikost elektroosmotického toku se vyjadřuje jako rychlost nebo jako mobilita
(pohyblivost). Zatímco rychlost je závislá na velikosti elektrického pole, mobilita na něm
nezávisí. Závisí však přímo na zeta potenciálu, který je dán velikostí náboje na stěně
kapiláry. Vzhledem k tomu, že tento náboj je silně závislý na pH (jde v podstatě o disociaci
silanových skupin), závisí na pH i elektroosmotický tok. Při vysokém pH jsou silanové
skupiny převážně disociované, proto je elektroosmotický tok v tomto případě výrazně vyšší
než při nízkém pH, kdy je většina silanových skupin protonována a nenese náboj. Rozdíly v
mobilitě při změnách pH mohou být až řádové.
v= μE μ = (εξ/η) (33) v = rychlost elektroosmotického toku μ = mobilita ξ = zeta potenciál ε = dielektrická konstanta η = viskosita elektrolytu E = elektrické pole
162
EOF závisí i na iontové síle elektrolytu. Zvyšováním iontové síly elektrolytu dochází
ke stlačování dvojvrstvy a klesá zeta potenciál. Redukuje se tudíž i elektroosmotický tok.
Účinkem elektroosmotického toku dochází k pohybu prakticky všech iontů ev.
molekul - bez ohledu na jejich náboj - ve stejném směru. Za normálních okolností, t.j. při
negativním náboji na stěně kapiláry, se všechny molekuly a ionty při kapilární elektroforéze
pohybují směrem ke katodě. To platí i o aniontech, neboť mobilita způsobená
elektroosmotickým tokem značně převyšuje (až o řád) elektroforetickou mobilitu. Nejrychleji
se pohybují kationty, neboť mobilita vlivem elektroosmotického toku i mobilita
elektroforetická působí ve stejném směru. Neutrální molekuly se pohybují pouze účinkem
elektroosmotického toku, takže nebudou separovány navzájem. U aniontů je pohyb ke katodě
dán rozdílem obou mobilit, proto se v kapiláře pohybují nejpomaleji (obr.2.100).
V některých případech je žádoucí elektroosmotický tok regulovat, neboť při příliš
velké rychlosti EOF by mohlo dojít k eluci látek v roztoku ještě dříve, než dojde k jejich
separaci. Regulace se dosahuje změnou náboje stěny kapiláry či změnou použitého pufru.
Tyto zásahy však často mění vedle EOF též vlastnosti dělených látek, na nichž závisí jejich
mobilita (např.disociace iontů). Optimální separace lze docílit pouze tehdy, jestliže zvolené
podmínky jsou optimální jak pro velikost EOF tak pro mobilitu látek v dělené směsi.
Způsobů jak regulovat velikost EOF je několik, např. už výše zmíněná změna pH či
iontové síly použitého pufru, změna elektrického pole (jak vyplývá z výše uvedené rovnice).
Náboj stěny kapiláry může být změněn použitím surfaktantů (viz obr. 2.101), které se
prostřednictvím hydrofobních interakcí a iontových vazeb adsorbují na stěnu kapiláry.
Neutrální hydrofilní polymery se mohou rovněž zachytit na stěnu kapiláry pomocí
hydrofobních interakcí, její náboj však nemění, pouze ho "stíní" a tím dosáhnou snížení EOF.
V současné době jsou činěny pokusy měnit EOF pomocí změn elektrického potenciálu na
vnější stěně kapiláry. Toho se dosahuje vytvořením vrstvy na povrchu kapiláry, která může
zcela změnit náboj na vnitřní stěně kapiláry a tím ovlivnit EOF.
163
Obr.2.99 Vznik elektroosmotického toku negativně nabitá stěna kapiláry hydratované kationty se shlukují v blízkosti povrchu kapiláry spontánní tok ve směru katody po zavedení elektrického pole
Obr.2.100 Separace různě nabitých iontů při kapilární elektroforéze
164
Čas, který potřebuje ion aby prošel od startu k detektoru, se nazývá migrační čas a je
dán efektivní délkou kapiláry a rychlostí pohybu. Rychlost pohybu závisí na elektroforetické
pohyblivosti jednotlivých molekul, na použitém elektrolytu a na použitém napětí, je však
ovlivněna i tvarem a velikostí částic, koncentrací elektrolytu a jeho pH. Rychlost pohybu
iontů v kapiláře je možno vypočítat z následující rovnice:
μa = 1/tE =IL/ tV (34)
μa = μe + μEOF (mobilita) V = napětí I = efektivní délka kapiláry L = celková délka kapiláry t = migrační čas E = elektrické pole
Účinnost separace jednotlivých molekul vzorku se vyjadřuje jako celkový počet
teoretických pater (N), který je v ideálním případě možno vypočíst ze vzorce
N = V/2D (I/L [μa + μEOT] ) = μe EI/2D (35)
D = difusní koeficient I = efektivní délka kapiláry L = celková délka kapiláry ostatní symboly stejné jako u dříve uvedených vztahů
Ze vztahu (35) je patrné, že aplikace vyššího napětí vede k vyšší separační účinnosti.
Vyšší napětí však současně zvyšuje elektrický proud a tedy i teplotu, což může způsobit
konvekční promíchávání či jiné nežádoucí procesy. Na velikost proudu má vliv i koncentrace
elektrolytu a rozměry kapiláry. Například při prodlužování kapiláry nebo snížení jejího
vnitřního průměru vzrůstá odolnost proti zvyšování napětí, takže velikost proudu i teplota se
snižují.
Účelem separačních technik je rozlišení jednotlivých látek ve směsi. Stupeň rozlišení
je proto jedním z nejdůležitějších ukazatelů účinnosti dané separační techniky. Při HPCE je
stupeň rozlišení určen účinností, nikoliv selektivitou, jak je tomu u většiny
chromatografických technik. Vzhledem k tomu, že zony, které se při HPCE vytvářejí, jsou
165
velice ostré, stačí k dokonalému rozlišení dvou látek již velice malý rozdíl v jejich mobilitě
(menší než 0.05 %). Proti dokonalému rozlišení působí disperse.
Stupeň rozlišení může být definován následovně:
R = 2 (t2 - t1)/(w1 + w2) = (t2 - t1)/4σ
w = 4σ (36)
R = stupeň rozlišení t = migrační čas w = šířka nulové linie (baseline) σ = standardní odchylka
Se zřetelem k účinnosti procesu může být stupeň rozlišení definován i takto
R = 1/4 (N1/2) (Δμ/μ) (37)
Δμ = μ2 - μ1
μ = (μ1 + μ2)/2
Ideálního rozlišení by bylo dosaženo tehdy, kdyby mobilita μ a mobilita EOF si byly
rovné v absolutní hodnotě, ale měly opačná znaménka. To znamená že by se ion pohyboval
stejnou rychlostí jakou má EOF, ale opačným směrem. V tomto případě by se ovšem doba
analýzy blížila nekonečnu. Z toho plyne, že se musí volit parametry procesu kompromisně
tak, aby mezi stupněm rozlišení a dobou potřebnou k separaci existovala rovnováha.
2.5.10 Způsoby provedení kapilární elektroforézy
Vzhledem k tomu, že kapiláry, v nichž se HPCE provádí, jsou antikonvekční, není
nutno bránit tvorbě konvekčních proudů přítomností gelů, jako je tomu při běžné
elektroforéze. Proto se velice často HPCE provádí jako volná elektroforéza. Nicméně
kapilární elektroforézu je možno provádět i jinými způsoby, a to této metodě dodává značnou
versatilitu, neboť separační mechanismy jednotlivých způsobů provedení se od sebe značně
liší. V současné době nabízí HPCE tyto způsoby provedení:
166
- kapilární zonální elektroforéza (CZE)
- micelární elektrokinetická chromatografie (MEKC)
- kapilární gelová elektroforéza (CGE)
- kapilární izoelektrická fokusace (CIF)
- kapilární izotachoforéza (CITP)
Kapilární zonální elektroforéza
Je to vlastně volná elektroforéza, t.j. nejjednodušší způsob kapilární elektroforézy.
Provádí se v kapiláře naplněné pouze pufrem. Jak jsme uvedli již výše, je to nejčastěji
používaný způsob kapilární elektroforézy. K separaci molekul dochází v zonách, které se
pohybují různou rychlostí. Touto technikou je možno separovat anionty i kationty, pouze
neutrální molekuly se všechny pohybují současně s EOF a nedojde proto k jejich rozdělení.
Separační princip CZE je patrný z obr. 2.100 a 2.104.
Selektivita CZE závisí na vlastnostech pufru, především na jeho pH a na aditivech,
která se do pufru přidávají. Pracujeme-li s amfolyty, jako jsou např. peptidy, bílkoviny a
aminokyseliny, pak pH pufru má zásadní význam pro průběh elektroforézy. Při pH pod
izoelektrickým bodem bude mít molekula kladný náboj a bude se pohybovat směrem ke
katodě rychleji než EOF. Nad izoelektrickým bodem bude mít náboj záporný a její
elektroforetický pohyb bude proti směru EOF, výsledná mobilita proto bude za EOF.
Vzhledem k chemické stabilitě křemenné kapiláry je možno pracovat v širokém rozmezí pH
(2 - 12), limitujícím faktorem bývá spíše stabilita analytu.
Z aditiv se nejčastěji používají surfaktanty, a to kationaktivní, anionaktivní i
neionogenní. Jsou-li použity v koncentracích pod kritickou micelární koncentrací (t.j. při
koncentraci, kdy surfaktanty netvoří micely) zvyšují rozpustnost málo rozpustných
separovaných látek, ale modifikují též EOF. Adsorbují se totiž na stěnu kapiláry a podle
svého náboje mohou zvyšovat, snižovat nebo úplně zlikvidovat EOF (viz obr.2.101). Použití
koncentrací vyšších než je kritická micelární koncentrace, vede k výrazné změně
mechanismu separace. Jde pak o způsob, který označujeme jako micelární elektrokinetickou
chromatografii.
167
Obr.2.101 Eliminace a obrácení EOF prostřednictvím kationaktivních surfaktantů
Ke změně EOF mohou vést i modifikace kapilární stěny vázanými nebo
adherovanými fázemi, jako jsou např. polyakrylamid nebo arylpentafluoridové skupiny.
Deaktivace, k níž u takto potažených kapilár dochází, vede ke změně směru EOF nebo k jeho
úplné likvidaci. Tak např. deaktivace polyakrylamidem nebo polyetylenglykolem způsobí
likvidaci EOF, neboť dojde jak ke snížení efektivního náboje stěny kapiláry, tak ke zvýšení
viskosity v okolí stěny. Deaktivace pomocí kationogenních skupin EOF obrací do protisměru.
Deaktivace pomocí amfoterních molekul, jako jsou aminokyseliny nebo proteiny, má za
následek reversibilitu EOF, podle toho, zda pH při elektroforéze je nad či pod jejich
izoelektrickým bodem.
Ze záznamu časového průběhu CZE, tzv. elektroforeogramu, může být získána
kvalitativní i kvantitativní informace o složení separované směsi. Kvalita dané složky analytu
je dána migračním časem odpovídajícího vrcholu, kvantita analytu je přímo úměrná ploše
vrcholu.
Micelární elektrokinetická chromatografie
Dalším častým způsobem provedení kapilární elektroforézy je micelární
elektrokinetická chromatografie. Kombinuje v sobě principy jak elektroforézy, tak
chromatografie. Je to metoda, která může být použita pro separaci látek nesoucích náboj, ale i
látek elektroneutrálních.
Základem procesu je použití surfaktantů jako aditiv do pufru, a to v koncentracích
převyšujících kritickou micelární koncentraci (pro SDS asi 9 mmol/l). Při těchto
168
koncentracích začnou molekuly surfaktantu agregovat a vytváří se micely (obr.2.102).
Micely mají sférický tvar: hydrofobní části molekuly surfaktantu směřují do centra, aby se
vyhnuly kontaktu s hydrofilním pufrem, nabité části jsou naopak orientovány směrem k
pufru. Podle náboje, který micely nesou, pohybují se buď ve směru nebo proti směru EOF.
Jelikož však je EOF obvykle rychlejší než elektroforetický pohyb částic, výsledný pohyb
bude vždy ve směru EOF. Micely při pohybu interagují s analyty rozpuštěnými v pufru, a to
prostřednictvím hydrofobních a elektrostatických interakcí.
Neutrální analyty, t.j. analyty, které nenesou náboj, jsou neseny pouze EOF. Jestliže
se však dostanou do kontaktu s micelou, interagují s ní a jsou spolu s ní neseny kapilárou
(obr.2.103). Čím je interakce silnější, tím déle zůstává analyt ve spojení s micelou a tím déle
putuje současně s ní. Síla interakce analytu s micelou roste s hydrofobicitou molekuly
analytu. Znamená to, že čím je molekula hydrofobnější, tím déle je její pohyb svázán s
micelou a tím více se odlišuje její pohyb od EOF. Podle náboje micely dochází ke zvětšení či
zmenšení její mobility. Princip separace neutrálních molekul při MEKC je tedy v podstatě
chromatografický.
Selektivita MEKC může být velice snadno změněna použitím odlišného surfaktantu
pro tvorbu micel. Surfaktant totiž rozhoduje o velikosti micely, jejím náboji a tvaru. Kromě
toho ovlivní selektivitu i iontová síla pufru, pH, teplota aditiva apod. Tyto otázky již byly
podrobně rozebrány dříve.
Obr.2.102 Schema micel s kationty a s anionty
169
Obr.2.103 Separace při micelární elektrokinetické chromatografii
Kapilární gelová elektroforéza
Naplnění kapiláry polymerem, který se uplatní jako molekulární síto, vede k separaci
molekul na základě jejich velikosti. Je to princip, který již dobře známe z PAGE
(elektroforéza v polyakrylamidovém gelu). Jak nabité molekuly procházejí zesíťovaným
polymerem, jsou postupně zpomalovány, velké molekuly více než malé. Takto mohou být od
sebe odlišeny i makromolekuly, které se liší velikostí, ale mají uniformní náboj (bílkoviny ve
vazbě s SDS, DNA apod.).
Gely, které se používají při kapilární gelové elektroforéze, jsou několika typů a
nesplňují vždy představu o tuhém gelu. Jsou to spíše jakási polymerní síta. Jsou buď
prokřížené (bis-polyakrylamid), vázané vodíkovými vazbami (agarosa) nebo jde o lineární
polymerní roztoky (polyakrylamid, methylcelulosa). Ačkoliv se tyto polymery radikálně liší
svou strukturou, mechanismus separace je identický. Výhodou málo viskozních lineárních
polymerů oproti prokříženým gelům je možnost používat je v širokém rozmezí koncentrací v
souladu s velikostí molekuly analytu, ale též možnost jejich opakovaného použití (je možno
jimi znovu naplnit kapiláru). Rovněž nebezpečí tvorby bublin je menší.
V naprosté většině případů jsou používané gely libovolného typu plněny do kapilár s
potaženými stěnami, aby se vyloučil EOF. Separace složek směsi pak nezávisí na EOF, ale
pouze na elektroforetickém pohybu nabitých molekul gelovou matricí směrem k elektrodě s
výše zmíněnými omezeními danými velikostí částic. Účinnost separace tedy ovlivní vedle
elektroforetického pohybu též porosita použitého gelu, velikost separovaných molekul,
poměr velikosti molekul a jejich náboje a fyzikální dimenze roztoku. Svou roli při separaci
170
hrají i faktory, které ovlivňují průběh CZE, jako je velikost napětí, délka a průměr kapiláry,
pH a iontová síla elektrolytu.
Jestliže mají separované molekuly velice blízkou molekulovou hmotnost,
rozlišitelnost na základě velikosti molekuly je malá, ale je možno ji zvýšit přídavkem
organických rozpouštědel, chaotropních sloučenin nebo micel do elektrolytu. Tato činidla
totiž mění tvar, velikost a náboj separovaných molekul, takže mohou výrazně změnit i
účinnost separace.
Kapilární izoelektrická fokusace
Kapilární izoelektrická fokusace je technika, která k dělení využívá gradientu pH,
ustaveného přímo v kapiláře a látky se pak dělí podle svých izoelektrických bodů. Jde tedy o
princip, který jsme popisovali již při výkladu izoelektrické fokusace v gelu, zde se ještě
připojuje provedení v kapiláře.
Gradient v kapiláře se vytváří pomocí pufrů obsahujících amfolyty. Jsou to molekuly,
které obsahují kyselé i bazické skupiny, které se v elektrickém poli budou pohybovat podle
svého náboje. Bazické skupiny se budou hromadit u katody, kyselé u anody, mezi nimi budou
migrovat ostatní nabité skupiny tak dlouho, až se dostanou do oblasti, kde pH se rovná jejich
izoelektrickému bodu. Tam tyto molekuly ztratí náboj a přestanou se pohybovat. Kdyby se
vlivem difuze dostaly do některé z okolních zon, získají opačný náboj, který je donutí putovat
zpět do oblasti svého pI. Stejně nabité molekuly se proto hromadí v kapiláře v ostré zoně.
Proto říkáme, že v průběhu CIEF dochází zaostřování, fokusaci.
Po fokusační fázi se vytvoří rovnováha a kapilárou přestane procházet proud. To je
známkou, že fokusace je ukončena. Vytvořené zony je však třeba uvést do pohybu, aby
prošly detektorem ev. vytekly z kapiláry. Mobilizace se realizuje buď zvýšením tlaku v
kapiláře nebo přídavkem soli do jednoho z rezervoárů.
Při CIEF je třeba potlačit EOF, neboť ten by mohl zrychlit pohyb amfolytu kapilárou
a eliminovat ho dříve, než by došlo k dovršení fokusačního efektu. K potlačení EOF je
možno použít kovalentní modifikaci (potažení) stěny kapiláry. Tím se snižuje i eventuální
adsorpce separovaných látek na stěnu kapiláry.
171
CIEF je vysoce účinná elektromigrační technika. Mohou se při ní separovat molekuly
lišící se svými izoelektrickými body o 0,005 jednotek. Lze ji využít jak k separaci, tak k
měření pI molekul přítomných ve směsi.
Kapilární izotachoforéza
CIT je elektromigrační metoda, která umožňuje dělení podle efektivní pohyblivosti
alternativně aniontů nebo kationtů. Nazývá se někdy metodou s pohyblivou hranicí (moving
boundary). Mezi dvěma elektrolyty, vedoucím (leading) a koncovým (terminating) jsou
seřazeny zony separovaných látek, které se všechny pohybují stejnou rychlostí (odtud název
izotachoforéza).
Chceme-li analyzovat anion, musíme pufr volit tak, aby vedoucí elektrolyt obsahoval
anion s efektivní pohyblivostí vyšší než je pohyblivost kteréhokoliv aniontu ve směsi.
Koncový anion (někdy zvaný též vlečkovací) naopak musí mít nejnižší efektivní pohyblivost
ze všech přítomných iontů. Jakmile se vytvoří elektrické pole, anionty se začnou pohybovat k
anodě. Protože vedoucí ion má největší mobilitu, pohybuje se nejrychleji a je v čele řady. Za
ním se začnou řadit anionty s klesající mobilitou. Po dosažení rovnováhy se všechny anionty
pohybují v oddělených zonách, ale všechny stejnou rychlostí. Rychlost pohybu je dána
rychlostí vedoucího aniontu.
K ustavení rovnovážného stavu může dojít tehdy, má-li elektrické pole v jednotlivých
zonách různé hodnoty. Jelikož rychlost je součinem mobility a elektrického pole (v = μE), k
udržení stejné rychlosti (při dané mobilitě) musí system v zonách s odlišnou mobilitou měnit
hodnotu elektrického pole. To se děje automaticky. Zona s největší mobilitou má tedy
nejmenší elektrické pole. Tento fakt způsobuje, že se mezi jednotlivými zonami vytváří
velice ostré hranice, neboť ionty, které by se v důsledku difuze dostali do některé z okolních
zon, změní okamžitě svou rychlost a vrátí se do své domovské zony. Tedy např. ion by
předběhl svou vlastní zonu, dostal by se do zony s menším elektrickým polem, tím by se
snížila jeho rychlost oproti ostatním iontům v dosažené zoně (má menší mobilitu) a ion by se
vrátil zpět. Je to tak zvaný samozaostřovací efekt.
Zostření zon při CIT můžeme dosáhnout ostrým zvýšením koncentrace vedoucího
nebo koncového elektrolytu, jinými slovy přídavkem solí. Při CIT je totiž ve všech zonách
stejná koncentrace iontů, určovaná vedoucím elektrolytem. Zony, které jsou méně (nebo
172
naopak více) koncentrované než je vedoucí elektrolyt, musí být zúženy (ev. rozšířeny), aby
dosáhly požadované koncentrace. Jde o koncentrační efekt. Zvýšení koncentrace vedoucího
elektrolytu tedy musí nutně vést k zakoncentrování ostatních zon a tedy k jejich zúžení. Z
tohoto důvodu se někdy CIT využívá pro zkoncentrování roztoků před jejich separací pomocí
CZE, MEKC nebo CGE.
2.5.11 Aplikace elektroforézy v biochemii, biotechnologii a dalších oblastech
Aplikační možnosti elektroforetických metod jsou velmi široké. Zasahují od oblastí
vysloveně teoretických až po technologické aplikace.
V biochemii a biotechnologii je hlavní těžiště elektroforetických metod jak v
analytických tak preparativních separacích bílkovin, enzymů a nukleových kyselin. O
jejich použití při stanovení molekulové hmotnosti různých látek (zejména bílkovin), při
stanovení izoelektrického bodu a sestrojení titračních křivek jsme se již zmínili dříve.
Elektroforetické metody jsou uznávány jako jedno z kriterií hodnocení čistoty bílkovinných
preparátů.
173
Obr.2.104 Principy různých způsobů provedení kapilární elektroforézy
Významné místo zaujímají elektroforetické metody při izolacích bílkovin, enzymů a
nukleových kyselin, a to nejen pro vlastní separaci ale i jako prostředek eluce
(tzv. elektroeluce).
Naprosto nepostradatelné jsou tyto metody při genových manipulacích.
V potravinářském výzkumu i praxi se setkáváme s řadou problémů, které je možné
úspěšně řešit pomocí elektroforetických metod. Tak například lze pomocí separace spektra
bílkovin ev. izoforem vybraného enzymu a porovnáním získaných výsledků s mapami
standardů charakterizovat jednotlivé odrůdy a kultivary potravinářských surovin
rostlinného původu (brambory, obiloviny apod.).
Obdobným způsobem lze charakterizovat i suroviny živočišného původu, zde je
však situace poněkud komplikovanější, protože jde většinou o velice složité směsi bílkovin.
Tam, kde je morfologická taxonomie nepřístupná, je však možno tohoto způsobu
(tzv. chemotaxonometrie) často velmi úspěšně využít. Takto se např. daří identifikovat různé
typy filetizovaných ryb, ale lze rozlišit i druhy masa.
Elektroforetické metody jsou velkým pomocníkem při určování vlivu technologie na
vlastnosti bílkovin. Při technologických procesech může docházet k denaturacím, ale i ke
štěpení peptidových řetězců. Tyto změny, které mohou mít zásadní význam pro kvalitu
produktu, lze většinou elektroforeticky postihnout. Výsledky jsou zdrojem důležitých
poznatků pro úpravu zpracovatelských postupů.
Moderní elektroforetické postupy, zejména izotachoforéza a kapilární elektroforéza,
umožňují stanovit různé nízkomolekulární sloučeniny, jako jsou cukry, organické kyseliny,
různá barviva, ionty, peptidy, nukleotidy, antibiotika a další. To umožňuje sledovat složení
potravin v průběhu technologického postupu a skladování, zejména osud biologicky
174
významných látek, ale též prokázat přídavek cizorodých proteinů nebo dalších látek do
potravin.
Dalším důležitým polem, kde se uplatní elektroforéza, je průkaz enzymů a isoenzymů
v potravinářských surovinách a v potravinách po technologické úpravě.
Pomocí elektroforetických metod však je možné určit i mikrobiální kontaminaci, a
to na základě přítomnosti různých mikrobiálních produktů, které se činností mikroorganismů
dostanou do potravin nebo do potravinářských surovin a které je možné pomocí elektroforézy
identifikovat.
2.5.12 Analytické aplikace elektroforetických metod
Elektroforéza jako kriterium čistoty preparátu
Při stanovení čistoty preparátu biologicky aktivních látek se důkaz homogenity
provádí hromaděním negativních výsledků při snaze o detekci příměsí různými metodami.
Elektroforéza na nosičích, zejména na polyakrylamidovém gelu, je jednou z obecně
uznávaných metod, která nám může poskytnou informaci o čistotě preparátu. Je však třeba
pamatovat na to, že za určitých podmínek mohou mít některé látky stejnou nebo velmi
blízkou mobilitu a nepodaří se je proto od sebe rozlišit. Proto je vhodné vzorek podrobit
různým elektroforetickým metodám, které od sebe separují látky podle rozdílných principů
(izoelektrický bod, velikost molekuly, velikost náboje, imunoelektroforéza, dvojrozměrná
elektroforéza). Musíme vzít v úvahu i to, že některé příměsi mohou být ve výrazně nižší
koncentraci a nepodaří se je detegovat. Doporučuje se proto použít i různé metody
vizualizace, neboť některé se výrazně liší citlivostí.
I když elektroforetické metody jsou velice běžné a často používané pro ověření
čistoty preparátu, v žádném případě nemohou být jediným kriteriem čistoty. Slouží však k
zjištění homogenity preparátu na různých stupních izolačního postupu, k částečné fyzikálně-
chemické charakterizaci sloučenin (zejména bílkovin) a při srovnávacích studiích též k
posouzení vlivu určitých experimentálních podmínek na studovaný systém.
175
Stanovení molekulové hmotnosti makromolekul
Jak jsme již několikrát uvedli, velikost molekuly je jedním z faktorů, které ovlivňují
mobilitu při elektroforéze. Je proto možno za určitých okolností použít elektroforetickou
metodu pro stanovení relativní molekulové hmotnosti.
Nejběžnějším způsobem stanovení relativní molekulové hmotnosti bílkovin je
SDS-elektroforéza. Její princip jsme uvedli již dříve. Dodecylsulfát sodný unifikuje jak
náboj tak tvar bílkovinné molekuly a mobilita bílkovin je za těchto okolností přímo úměrná
molekulové hmotnosti. Přídavkem dithiotreitolu (merkaptoethanolu) je pak možno redukovat
disulfidové můstky a stanovit molekulovou hmotnost bílkovinných podjednotek. Mobilitu
bílkovinné molekuly ev. podjednotek je pak třeba porovnat s mobilitou molekul o známé
molekulové hmotnosti, t.j. je třeba proměřit kalibrační křivku. Závislost molekulové
hmotnosti na mobilitě je logaritmická, je proto třeba vynášet do grafu proti mobilitě (osa x)
logaritmus molekulové hmotnosti (osa y).
Molekulovou hmotnost bílkovin je však možno stanovit i pomocí elektroforézy
v polyakrylamidových gelech různé koncentrace. Vycházíme z toho, že pohyblivost molekul
při elektroforéze je závislá též na koncentraci použitého gelu (T). "Koncentraci gelu"
můžeme
vyjádřit vztahem
T = 100 (a+b)/p (38)
a,b = gramy akrylamidu resp. BIS-akrylamidu p = ml pufru (s ostatními komponentami netvořícími gel)
Pohyblivost makroiontu je nepřímo úměrná střední velikosti pórů, jež je dána celkovou
koncentrací gelu T. Pro tuto závislost navrhl Fergusson empirický vztah
log UT = log UO - KR .T (39)
UT = relativní pohyblivost iontu v gelu o koncentraci T UO = "volná" pohyblivost (při nulové koncentraci gelu) KR = retardační koeficient T = celková koncentrace gelu
176
Retardační koeficient makroiontu lze stanovit na základě měření jeho relativní pohyblivosti v
serii gelů o různé koncentraci T (viz obr.2.105). Relativní molekulovou hmotnost bílkoviny
pak vypočteme z empirického vztahu
KR = 2,43.10-2 + 5,53.10 -7x Mr (40)
Číselné koeficienty v tomto vztahu byly určeny stanovením retardačního koeficientu KR pro
serii makroiontů bílkovin o známé molekulové hmotnosti Mr .
Pro stanovení molekulové hmotnosti touto metodou je třeba připravit sadu gelů o
různé koncentraci, na všechny aplikovat měřený vzorek a po skončené elektroforéze změřit
relativní pohyblivost vzorku v různě koncentrovaných gelech. Logaritmus relativní
pohyblivosti se pak vynese do grafu proti koncentraci gelu T a koeficienty KR a log UO se
vypočtou metodou lineární regrese. Molekulová hmotnost se pak vypočte z výše uvedeného
empirického vztahu pro retardační koeficient.
Obr. 2.105 Závislost log UT na koncentraci gelu T
177
Stanovení izoelektrického bodu
Izoelektrický bod je jednou z velice významných charakteristik amfoterních molekul.
Separace molekul na základě odlišnosti izoelektrických bodů je možná buď
chromatograficky, tzv. chromatofokusací, nebo izoelektrickou fokusací, což je
elektromigrační metoda. Pro stanovení izoelektrického bodu se však používá převážně
izoektrická fokusace. Již dříve jsme vysvětlili, že při izoelektrické fokusaci se molekula
pohybuje v gradientu pH mezi dvěma elektrodami až do okamžiku, kdy se dostane do oblasti
pH rovné jejímu izoelektrickému bodu. V tomto bodě ztratí náboj a není již schopna se dále v
elektrickém poli pohybovat. Identifikací pH, které je v místě skvrny bílkoviny, se současně
zjistí hledané pI.
178
3. IZOLACE BIOMAKROMOLEKUL
3.1 Úvod
Při biochemickém výzkumu se studují buňky, jejich složení a procesy, které v nich
probíhají. Proto vždy část biochemického výzkumu tvoří izolace experimentálního materiálu.
Izolace biomakromolekul (proteiny, nukleové kyseliny) z přirozených materiálů je
záležitost velice různorodá, vzhledem k různému původu a odlišnému charakteru
jednotlivých makromolekul. Aby mohla být látka charakterizována, musí být v relativně
čistém stavu a bez příměsí, které by mohly charakterizaci rušit či zkreslovat. Toto je však
velice často nelehký úkol, protože normální buňka obsahuje tisíce různých látek, z nichž jsou
si mnohé svými fyzikálními a chemickými vlastnostmi podobné. Velice častým úskalím při
izolaci biolátek je skutečnost, že látka, která nás zajímá, může být také značně nestabilní a
její množství v buňce je nepatrné.
Převážnou část hmoty organismu tvoří proteiny, proto zejména jim bude věnována v
této kapitole pozornost.
Z hlediska izolace biomakromolekul je důležité, zda složka, která má být izolována je
součástí buňky nebo zda je vylučována mimo buňku. V případě enzymů většinou platí, že
enzymy, jejichž substráty jsou nízkomolekulární látky, bývají intracelulární, zatímco
enzymy, katalyzující reakce biomakromolekul jsou obvykle extracelulární. Buněčná
membrána je totiž pro makromolekuly nepropustná a proto makromolekulární substráty
nemohou pronikat do buňky. Aby se tedy enzym dostal do styku se substrátem, musí se
enzym vyskytovat v prostorách mimo buňku.
Dalším důležitým faktorem je, z jakého materiálu má být biomolekula izolována: zda
z živočišných tkání, rostlinných pletiv nebo mikrobiálních buněk. Protože použití rostlinného
a živočišného materiálu k jakékoliv izolaci je většinou poměrně nákladné, v průmyslu se
upřednostňuje příprava biomolekul z mikrobiálních zdrojů. I zde jsou typickým příkladem
enzymy.
Pro izolaci a částečně i charakterizaci nukleových kyselin se používají metody
obdobné (byť často modifikované) jako při práci s proteiny. V praxi se velmi často setkáme s
nutností oddělit od sebe proteiny a nukleové kyseliny, neboť se v buňce vyskytují společně.
179
Tato kapitola poskytuje základní strategii a přehled nejužívanějších technik pro
izolaci, purifikaci a do jisté míry i charakterizaci bílkovinných preparátů a dalších druhů
biologických molekul.
3.2 Základní izolační kroky
Postup izolace biomakromolekul se skládá z několika víceméně samostatných na sebe
navazujících kroků. Základní kroky při přípravě preparátů jsou:
1. Homogenizace a solubilizace materiálu. Při izolaci biomakromolekul z některých zdrojů
(rostliny, živočišný materiál) je třeba experimentální materiál nejdříve homogenizovat. K
tomu se používají zejména mechanické prostředky. Dále následuje solubilizace materiálu.
2. Separace buněk. Tento krok je společný při izolaci biomakromolekul z jakéhokoliv
zdroje. Aby bylo možno dále požadovanou látku izolovat, je třeba oddělit buňky od ostatního
media bez ohledu na to, se kterou složkou budeme dále pracovat.
3. Dezintegrace buněk. Při izolaci látky, obsažené v buňce (např. DNA, intracelulární
enzymy) je nezbytné rozrušit (dezintegrovat) buněčnou stěnu buňky a získat tak
vnitrobuněčný obsah pro další práci.
4. Odstranění buněčných zbytků. Po rozbití buněk se pro odstranění jejich zbytků nebo pro
izolaci některých organel používá postupná centrifugace. Během tohoto kroku tedy dochází k
odseparování buněčných zbytků (např. membrány), které by mohly další purifikační kroky
znesnadňovat. Jakmile jsou proteiny i jiné makromolekuly uvolněny z ochranného prostředí
buňky, musí se s nimi zacházet tak, aby nebyly novými podmínkami zničeny.
5. Koncentrace ev. snížení objemu. Použití moderních purifikačních postupů
- chromatografií - ve většině případů předcházejí kroky vedoucí ke snížení objemu ev.
koncentraci experimentálního materiálu. Tyto kroky jsou nezbytné zejména v případech,
následuje-li purifikační postup, kdy záleží na množství aplikovaného vzorku (gelová, afinitní
chromatografie). Rovněž např. při přípravě průmyslových enzymů, kdy výchozím materiálem
je až několik litrů media, nelze tuto fázi izolačního postupu opomenout.
6. Purifikace. Vlastní purifikační postup se většinou skládá z několika na sebe navazujících
chromatografických technik, během kterých dochází k odstranění balastních látek ať již
nízkomolekulárních (cukry, lipidy) či vysokomolekulárních (bílkoviny, polysacharidy,
nukleové kyseliny).
180
7. Konečné úpravy purifikovaného preparátu. Tato fáze zahrnuje např. metody
koncentrační (ultrafiltrace, mrazová sublimace), které jsou prováděny z důvodu zvýšení
koncentrace vyizolované látky v preparátu nebo s ohledem na její další skladování. Jsou
známy případy, kdy např. enzym v lyofilizovaném stavu je stabilnější než při uchovávání v
roztoku.
8. Charakterizace preparátu. V závěru každého izolačního a purifikačního postupu je třeba
si ověřit, zda je vyizolovaná látka v požadovaném stupni čistoty, k čemuž slouží metody
elektroforetické, analytické i chromatografické.
Potřebný stupeň čistoty výsledných preparátů musí být posuzován komplexně. Vedle
hlediska funkčního je třeba brát v úvahu i hledisko ekonomické.
3.3 Homogenizace a solubilizace materiálu
Prvním krokem v izolaci bílkovin či jiných biologických molekul je nutnost převést
tyto látky do roztoku. Ve výjimečných případech tento krok odpadá, protože izolované látky
jsou již v roztoku obsaženy (např. proteiny krevního sera). Homogenizace experimentálního
materiálu je nezbytná v případě izolace biomakromolekul z rostlinných a živočišných zdrojů.
Zde se uplatňují zejména mechanické způsoby např. mixování, mletí, krájení apod. V
nejjednodušších případech lze použít tření zmraženého materiálu v třecí misce. Volba
postupu závisí na mechanických vlastnostech výchozího materiálu a na místě, kde je
požadovaná látka uložena v buňce.
Během tohoto kroku tedy dochází k převedení experimentálního materiálu do
vhodného prostředí (např. pufr o daném pH apod.)
3.4 Separace buněk z kultivačního media
Řada biomolekul, např. mikrobiální enzymy, se připravují kultivací
vysokoprodukčních mikrobiálních kmenů. Po skončené kultivaci je třeba odseparovat
mikrobiální buňky od kultivačního media. To je možno provést v zásadě dvěma způsoby:
odstřeďováním nebo filtrací. Odstřeďování je běžnější při laboratorní práci, ovšem za
předpokladu, že kultivační medium není příliš viskozní. Při použití rychloběžných centrifug
181
je třeba, aby se pracovalo v chlazeném prostoru, protože při vyšších otáčkách se uvolňuje
teplo, které by mohlo částečně inaktivovat biologickou aktivitu separované látky a tím
značně snížit výtěžnost procesu.
Pro separaci mikroorganismů je rozhodující velikost buněk.
V poloprovozním, čtvrtprovozním i průmyslovém měřítku, se častěji používá k
separaci buněk od kultivačního media filtrace, kterou je možno provádět buď na tlakových
nebo na vakuových filtrech. Filtrace je rovněž běžnější v případě, je-li zdrojem biomolekul
plíseň.
K separaci buněk se užívá též tzv. flokulace. Flokulace ať již přirozená nebo
chemicky ovlivněná, je závislá na fyziologickém stavu buněk, na přítomnosti adsorpčních
činidel a na pH. Chemicky se flokulace ovlivňuje přídavkem tzv. flokulačních činidel (látky
na bázi polyethylenu, bentonity apod.) Flokulační činidla proces sedimentace značně
zrychlují. Flokulace se může využít i pro odstranění zbývajících mikrobiálních buněk z
buněčných extraktů, pak vlastně slouží jako náhrada sterilačního procesu.
3.5 Dezintegrace buněk
Po odseparování buněk od media záleží další izolační postup na tom, má-li být
izolována složka intracelulární nebo extracelulární. V případě intracelulární látky je třeba
zařadit dezintegraci buňky.
Dezintegrační metody dělíme na fyzikální, chemické a enzymové. Každý typ má své
výhody i nevýhody; neexistuje universální metoda pro dokonalou dezintegraci všech typů
buněk. Účinnost dezintegračního procesu závisí na mnoha faktorech např. na druhu
dezintegrovaného materiálu, na podmínkách kultivace mikrobiálních buněk, na fázi růstu, na
pH, na teplotě a na iontové síle suspendujícího prostředí a v neposlední řadě na době
dezintegrace.
Protože nejvíce problémů nastává při dezintegraci mikrobiálních buněk, bude
následující kapitola věnována především této problematice.
Při hledání nejvhodnějšího způsobu dezintegrace je nutno vzít v úvahu několik kriterií:
snadnost dezintegrace buněk různými metodami
stabilitu izolované látky (enzym, nukleové kyseliny) během každé metody
snadnost separace izolované látky od zbytků buněčných stěn
182
dobu potřebnou k dezintegraci buněk a oddělení žádané složky
ekonomiku procesu, včetně spolehlivosti zařízení a snadnosti operace
Před vlastní dezintegrací se mikrobiální buňky po nakultivování a po úpravě
kultivační kapaliny (zahřátí, úprava pH) odstředí nebo odfiltrují, promyjí vodou nebo
tlumivým roztokem, aby se odstranily zbytky kultivačního media a po novém odstředění
nebo filtraci je buněčná pasta připravena k dezintegraci.
3.5.1 Fyzikální způsoby dezintegrace
Mechanické drcení a mletí buněk s použitím abraziv
Nejjednodušší provedení této techniky je tření buněk s vhodným abrazivním
materiálem v třecí misce. Jako abrazivum lze použít křemenný písek, skelný prach, skleněné
balotiny, oxid hlinitý apod. Byla rovněž vyvinuta celá řada mechanických zařízení, v nichž
mezi rotorem a statorem, kde je vytvořena úzká mezera, dochází k dezintegraci mikrobiálních
buněk za přítomnosti abraziv.
Dezintegrace buněk mícháním s malými částicemi
Příkladem zařízení této kategorie je přístroj Dynomill. V podstatě se jedná o nádobu
po okraj naplněnou směsí suspenze mikrobiálních buněk a balotin. Do nádoby je zasunuto
diskové míchadlo, které se při dezintegraci otáčí. Dezintegrace je pak způsobena kombinací
střižných sil, které vznikají jako následek gradientu rychlosti mezi jednotlivými proudnicemi,
nárazy a valivou činností skleněných kuliček, které jsou uváděny do pohybu míchadlem.
V jednoduchém zařízení pro dezintegraci malých množství mikrobiálních buněk
(max 15 ml) je směs buněčné suspenze a balotin míchána v centrifugační skleněné kyvetě
upraveným míchadlem.
Jestliže jsou k mikrobiální suspenzi přidány balotiny, je možno v některých případech
pro dezintegraci použít i vysokoobrátkový mixer.
183
Kromě výše zmíněných příkladů existuje celá řada dalších dezintegračních zařízení,
jejichž volba záleží na typu dezintegrovaného materiálu.
Dezintegrace střižnými silami v tuhém stavu
Nejstarším, avšak stále používaným zařízením v této kategorii je Hughesův lis.
Mikrobiální pasta smíchaná s vhodným abrazivem nebo zmražená na teplotu -20 °C (v tomto
případě působí jako abrazivum vzniklé ledové krystalky) je umístěna do válcové dutiny v
předem vychlazeném ocelovém bloku. Do dutiny je nasazen přesně opracovaný kovový píst a
hydraulickým lisem je aplikován tlak 150-230 MPa. Rozdrcené buňky jsou protlačovány
úzkou obvodovou štěrbinou do zásobníku vyvrtaného v bloku.
Dalším zařízením je X-lis. Zmražené buňky jsou dezintegrovány při průchodu malým
otvorem ve dnu tlakové nádoby při tlaku až 600 MPa. Rozbití buněk je způsobeno střižnými
silami, které jsou vyvolány průchodem zmrzlé buněčné pasty malým otvorem. Dezintegraci
přitom napomáhají vytvořené ledové krystalky. Při nízkých teplotách a vysokých tlacích
dochází rovněž k fázovým změnám ve struktuře ledu, které jsou doprovázeny změnou
objemu, což rovněž napomáhá dezintegraci.
Modifikací klasického X-lisu je zařízení pro dezintegraci živočišných tkání při izolaci
subcelulárních částic. Aplikuje se nezmražený materiál, který je za tlaku 1.5-6 MPa
protlačován obvodovou štěrbinou o proměnné velikosti.
Dezintegrace střižnými silami v kapalině
Pro dezintegraci touto metodou je používáno zařízení, jehož základem je čerpadlo s
nastavitelným ventilem a zúženým otvorem. Buňky v kapalném prostředí procházejí
homogenizačním zařízením při tlaku až 56 MPa. Rozbití buněk je způsobeno třemi
mechanismy, z nichž rozhodující úlohu má rychlé snížení operačního tlaku na hodnotu
atmosférického tlaku. Toto zařízení může být využito třemi způsoby. Buněčná suspenze
může být dezintegrována při jediném průchodu zařízením, nebo je možné produkt z odtoku
vracet zpět k další dezintegraci tak dlouho, dokud není dosaženo žádaného stupně
184
dezintegrace, nebo se z odtoku vrací pouze část produktu jako recykl a druhá část stále
odtéká k dalšímu zpracování.
Dezintegrace osmotickým šokem
Dezintegrace tímto způsobem je vhodná především pro bakteriální buňky. Prakticky
se postupuje tak, že buňky, zbavené kultivačního media se suspendují v tlumivém roztoku,
obsahujícím dvacetiprocentní sacharosu a ponechají se v něm až do ustavení chemické
rovnováhy, která se projeví ztrátou vnitrobuněčné vody. Po odstředění se buněčná pasta
rychle rozmíchá ve vodě (4 °C). Náhlý vzrůst osmotického tlaku uvnitř buněk způsobí, že se
poruší buněčný obal a dojde k uvolnění složek do roztoku.
Jinou možností je smíšení centrifugovaných buněk se stejným objemem glycerolu o
koncentraci 3 mol/l. Po pěti minutách je suspenze pipetou odkapávána do desetinásobného
objemu tlumivého roztoku, který je mechanicky promícháván.
Dezintegrace ultrazvukem
Působením ultrazvukových vln na kapaliny vzniká jev, známý jako kavitace. V
kapalině se tvoří oblasti stlačení a zředění. V místech zředění vznikají dutiny určitých
velikostí, které v oblasti stlačení opět zaniknou. Zánik dutin je pak doprovázen tlakovou
vlnou, která se považuje za destrukční prvek využívaný u této metody.
Některé bakterie (např. stafylokoky) jsou k působení ultrazvukových vln velmi
rezistentní. Naproti tomu poměrně snadno rozrušitelné jsou např. gramnegativní bakterie.
Dezintegrace změnou tlaku plynu
Metoda je založena na faktu, že v rovnováze je tlak plynu v roztoku totožný s vnějším
tlakem. Pokud je na buněčnou suspenzi působeno plynem za vysokého tlaku, jeho značné
množství se rozpustí v suspendujícím mediu a difunduje do buňky, dokud se neustaví
rovnováha. Při náhlém poklesu vnějšího tlaku způsobuje vnitřní tlak destrukci buněk.
185
Dezintegrace střídavým zmražením a rozmražením
Ochladí-li se buněčná suspenze pod teplotu tuhnutí kapalné fáze, uvolní se po
následujícím roztátí dezintegrovaného materiálu určitý podíl buněčných bílkovin jako
následek částečné dezintegrace buněk. Značnou roli zde hrají i intracelulární a extracelulární
ledové krystalky, které buňku rozrušují.
Vzhledem k mechanismu procesu je účinnost této metody omezená, často se používá
zejména jako pomocná metoda při ostatních způsobech dezintegrace, pokud se však buněčná
pasta určená k dezintegraci skladuje v zmraženém stavu.
Dezintegrace metodou prudkého ochlazení
Prudké ochlazení z normální růstové teploty na teplotu asi 0 °C způsobuje ztrátu
důležitých funkcí mikroorganismů, přičemž se uvolní do media některé látky např. ATP,
aminokyseliny apod. Tato metoda nemá v praxi širší uplatnění.
Dezintegrace zahříváním
Účinnost tohoto postupu není velká a proto ani její použití v praxi není příliš
rozšířené. Mírného zvýšení teploty lze využít k indukci autolýzy buněk, zejména u
psychrofilních bakterií. Nevýhodou této metody je možnost inaktivace izolovaných
biologicky aktivních látek v důsledku denaturace účinkem zvýšené teploty.
3.5.2 Chemické způsoby dezintegrace
Dezintegrace v kyselém a zásaditém prostředí
Tato metoda se s úspěchem používá pro dezintegraci mikrobiálních buněk. Např.
použitím různě koncentrovaných roztoků NaOH byly extrahovány bílkoviny z nativních
186
buněk mikroorganismů. Kromě bílkovin však dochází i k extrakci značného množství
nebílkovinných dusíkatých látek a různých barviv.
Použitelnost tohoto dezintegračního postupu je dána stabilitou izolovaného materiálu
právě v oblasti extrémních hodnot pH.
Dezintegrace použitím povrchově aktivních látek
Interakce detergentů s buněčnou membránou nebyla dosud zcela přesně popsána.
Předpokládá se však, že v důsleku vazby detergentu na membránu dochází k lýzi. Tenzidy, ať
již anionaktivní, kationaktivní nebo neionogenní se při malé iontové síle tlumivého roztoku a
vhodném pH spojují s lipoproteiny za vzniku micel. Lipoproteinové složky biologických
membrán tak mohou být solubilizovány a membrány se stávají permeabilními.
Ionogenní tenzidy (např. SDS) jsou reaktivnější a mohou způsobit disociaci
lipoproteinů. Jejich účinek se může projevit denaturací a vysrážením bílkovin a v některých
případech i hydrolýzou peptidových vazeb. Proto se ionogenní tenzidy příliš nehodí např. k
extrakci enzymů.
Pro extrakci membránově vázaných proteinů jsou široce používány neionogenní
detergenty (Triton X-100, Tween) a zwitteriontové detergenty (CHAPS).
Dezintegrace použitím organických rozpouštědel
Organická rozpouštědla mohou v mnoha případech účinně napomoci při dezintegraci
mikrobiálních buněk a při izolaci složek, které jsou lokalizovány na membránách.
Mezi nejvíce používané organické látky patří aceton, který se používá pro přípravu
tzv. acetonové sušiny (acetonového prášku). Tento postup se dobře uplatňuje v případě, jsou-
li izolované bílkoviny (např. enzymy) lokalizovány právě na subcelulárních částicích
(např. membrány). Při většině dezintegračních metod dojde k permeabilizaci buněčné
membrány, avšak bílkoviny vázané na subcelulárních částicích se z této vazby neuvolní,
neextrahují se do roztoku a tudíž bývají odstraněny z roztoku spolu s rozpustnými zbytky
buněk. Použití acetonu však často vede k rozrušení vazby bílkoviny na částice a ta se pak
může uvolnit do roztoku.
187
Dezintegrace acetonem a jinými nevodnými rozpouštědly je třeba provádět při velmi
nízkých teplotách, aby se pokud možno zabránilo inaktivaci enzymu ev. jeho denaturaci.
Přídavek organických rozpouštědel (toluen, diethyleter, chloroform) se používá často
i při autolýze buněk. Výše uvedené látky způsobují nejen rozrušení cytoplasmatické
membrány, ale zároveň i zabraňují kontaminaci lyzující kultury nežádoucími
mikroorganismy.
Dezintegrace použitím antibiotik
Antibiotika používaná pro dezintegraci mikroorganismů mohou buď ovlivňovat
permeabilitu cytoplasmatické membrány (tyrocidin, polymyxiny, nystatin) nebo mohou
interferovat při biosyntéze buněčné stěny (penicilin). Oba tyto jevy pak mohou vést k
destrukci buněk.
Dezintegrace použitím aminokyselin
Řada gramnegativních bakterií může být působením např. glycinu konvertována na
sferoplasty. Tento proces je silně ovlivňován teplotou, pH, koncentrací glycinu a samozřejmě
životností buněk.
3.5.3 Enzymové způsoby dezintegrace
Dezintegrace lytickými enzymy
Pro bakteriolýzu se běžně používá lysozym, který se komerčně vyrábí z vaječných
bílků. Tento enzym specificky katalyzuje hydrolýzu β-1,4 glykosidické vazby
mukopeptidových jednotek bakteriálních buněčných stěn. Konečné prasknutí buněčného
188
obalu závisí na osmotickém tlaku okolního media. Grampozitivní bakterie jsou vzhledem k
vyššímu obsahu mukopeptidů k účinku lysozymu citlivější než gramnegativní buňky. V
prostředí o vhodném osmotickém tlaku pak vznikají sferoplasty resp. protoplasty.
Kromě lysozymu způsobuje bakteriolýzu celá řada dalších enzymů, převážně
mikrobiálního původu. Např. při přípravě kvasinkových protoplastů se nejčastěji používá
komplex enzymů ze žaludeční šťávy hlemýždě.
Za pozornost stojí i zmínka o uplatnění imobilizovaných enzymů při dezintegraci
mikrobiálních buněk. Je popsána např. imobilizace komplexu lytických enzymů na
kolagenovou membránu.
Autolýza
Autolýza je definována jako buněčná lýze, která není vyvolána zásahem exogenních
činitelů. Opakem je pak heterolýza, která vyžaduje indukci fyzikálními, chemickými nebo
biologickými činiteli. Protože však autolytické a heterolytické procesy nemohou být někdy
přesně rozlišeny, je lépe definovat autolýzu buněk jako lýzi, způsobenou vlastními
buněčnými enzymy.
Je známo mnoho podmínek a faktorů, které indukují vznik autolytického procesu.
Autolýza se většinou vyskytne, je-li náhle přerušen normální metabolismus buňky, autolýza
může být indukována náhlým snížením teploty apod.
Pouze malý počet dezintegračních metod, které zde byly popsány, lze použít pro
dezintegraci v průmyslovém měřítku. Při výběru vhodného způsobu je nutno řídit se určitými
kriterii. Obecně je možno říci, že přednost bude mít zařízení schopné kontinuálního provozu.
Z výše popsaných metod jsou to zejména dezintegrace účinkem střižných sil v kapalině,
dezintegrace změnou tlaku plynu, mícháním s malými částicemi a dezintegrace ultrazvukem.
3.6 Koncentrace a obohacování roztoků
Extrakt, který byl získán po dezintegraci buněk (v případě intracelulárních enzymů,
DNA apod.) nebo kultivační medium s extracelulárními enzymy musí být zahuštěny nebo
189
jiným způsobem zakoncentrovány. Zahušťování se provádí zejména vakuovým odpařováním
anebo ultrafiltrací či hyperfiltrací. Při ultrafiltraci se kromě rozpouštědla částečně odstraní i
nízkomolekulární látky. Hyperfiltrace (reverzní osmoza) se provádí na hustých membránách,
které propouštějí pouze molekuly rozpouštědla. Proto při hyperfiltraci dojde pouze k
zahuštění vzorku. Membránové procesy jsou dnes hojně využívány jak v průmyslu tak i v
laboratorní praxi. Podrobně je o nich pojednáno v kap.2.2.
Pro zahušťování vzorků, ovšem bez odsolení, jsou i další možnosti. Laboratorně se
někdy voda ze vzorku odtahuje přes hustou membránu látkami, které vodu ochotně přijímají
(např. dehydratované gely a řada komerčních preparátů na bázi polyethylenglykolu,
bezvodého oxidu fosforečného, silikagelu aj.). Dáme-li roztok do dialyzační trubice, kterou
obalíme některou z výše zmíněných bezvodých látek, bude ze vzorku přes membránu
odtahována voda. Membrána zajistí, že z vnitřního prostoru je odtaženo pouze rozpouštědlo.
Tento proces se dá pouze obtížně řídit, proto nelze na počátku zcela přesně odhadnout, do
jakého stupně bude roztok zahuštěn a průběh odtahování vody se tedy musí kontrolovat.
Voda se dá z roztoku částečně odstranit i vsádkovým přidáním dehydratovaného
chromatografického gelu, který pro botnání využije rozpouštědlo z roztoku. Musí se použít
gel s velice malými póry, aby nebyly zachyceny i látky s vyšší molekulovou hmotností.
Volba vhodného gelu umožní současné odsolení. Zůstává však nebezpečí nespecifických
sorpcí separovaných molekul na gel a možné ztráty při oddělování gelu.
Známým a často používaným způsobem zahušťování je odpařování. V případě
biologicky aktivních makromolekul se doporučuje odpařovat za sníženého tlaku, aby příliš
vysokou teplotou nedošlo ke ztrátě biologické aktivity nebo k nevratné denaturaci
makromolekuly. Je třeba počítat s tím, že odpařování je metoda energeticky náročná, proto se
v provozních podmínkách musí hodnotit i z ekonomického hlediska.
Pro odstranění vody se používá i lyofilizace (mrazová sublimace). Tato metoda, kdy
se odstraní z roztoku veškeré rozpouštědlo, je k biomakromolekulám velice šetrná, ale též
energeticky náročná. Proto vstupuje do izolačního procesu častěji až při finální úpravě
vzorku.
Další způsoby zvyšování koncentrace izolovaného materiálu jsou: srážení
anorganickými solemi (tzv. vysolování) např. síranem amonným, srážení organickými
rozpouštědly např. acetonem, ethanolem nebo úpravou pH do izoelektrického bodu (tzv.
izoelektrické srážení) (viz kap.2.1.1). Některé adsorpční metody prováděné vsádkově a
190
vytřepávání do dvoufázového systému (viz kap.2.1.2) se aplikují spíše ve větším měřítku
(průmysl).
3.7 Zajištění sterility surových preparátů
Při volbě dalšího postupu zpracování enzymových preparátů je třeba uvážit k jakému
účelu budou sloužit a tomu je třeba přizpůsobit i další kroky.
Protože při jednoduchých izolačních postupech není zajištěno úplné odstranění
zbytků mikrobiálních buněk, z nichž byla separovaná látka extrahována, je třeba provádět
sterilaci, při níž se zbytky mikrobiálních buněk odstraní a tím je zabráněno nežádoucí
kontaminaci připravovaného preparátu. Požadavky na čistotu technických preparátů stále
stoupají, avšak i zde je třeba brát v úvahu ekonomické hledisko a pracovat se zřetelem na
další aplikaci preparátu. Zatímco např. pro účely potravinářského průmyslu nesmí preparáty
obsahovat žádné zbytky buněk, u enzymových preparátů pro přípravu pracích prostředků
nejsou kriteria tak přísná.
Příprava vysoce purifikovaných popř. čistých enzymů používaných např. v medicině
či klinickém výzkumu je mnohem složitější a samozřejmě i ekonomicky náročnější. Při
přípravě těchto preparátů je třeba o to více dbát na podmínky zajišťující resp. vylučující
možnost jakékoliv kontaminace nežádoucími organismy.
Sterilace se provádí ještě před započetím vlastního purifikačního procesu. Protože
většinou není možno provést sterilaci vysokými teplotami (nebezpečí denaturace enzymů),
používají se obvykle různá flokulační činidla. V některých případech se sterilace provádí
ultrafiltrací tak, že se použijí membrány s póry, které zadrží bakteriální buňky a získaný
preparát je tudíž sterilní (kap.2.2).
3.8 Purifikace biomakromolekul
První dostatečně definovaný protein (rostlinná ureasa) byl popsán již v roce 1926.
S rozvojem vědy a výzkumu však purifikační postupy používané v 1. pol. 20 st. značně
zastaraly. Moderní separační techniky dnes dokáží odlišit celou řadu látek podobných
vlastností ve vzorku, který by ještě před několika lety byl považován za čistý.
191
Postupy purifikace biomakromolekul se značně liší a získání velmi čistých preparátů
obvykle vyžaduje složité a nákladné purifikační postupy.
Jednotlivé separační (purifikační) kroky jsou založeny na využití fyzikálních a
chemických vlastností biomakromolekul. Rozhodujícím faktorem v případě proteinů je jejich
primární struktura. Pořadí aminokyselin v řetězci totiž určuje funkci a vlastnosti proteinu.
Sekundární struktura t.j. spontánní vytvoření prostorové struktury určitých částí řetězce
stejně tak jako terciární struktura (celkové prostorové uspořádání bílkovinné molekuly),
odpovědná za biologickou aktivitu proteinu, hrají rovněž roli při volbě a úspěšnosti
chromatografického kroku. V tab.6 je uveden vztah mezi vlastností purifikované
biomakromolekuly a typem použité metody.
Tabulka 6 Vztah mezi mechanismem separace a použitou metodou
separace na základě metoda velikost gelová chromatografie, SDS-elektroforeza,
gradientová elektroforeza náboj chromatografie na měničích iontů,
elektroforeza rozpustnost chromatografie s reverzní fází biologická aktivita bioafinitní chromatografie izoelektrický bod chromatofokusace, izoelektrická fokusace
3.8.1 Strategie a taktika purifikace
Základní strategií purifikačního postupu je postupná separace jednotlivých složek
směsi. K oddělení izolované látky od ostatních tzv. balastních látek dochází postupně
kombinací řady nezávislých kroků, založených na různých principech. Za tímto účelem se
využívají zejména chromatografické techniky, jimiž jsme se podrobněji zabývali v
předchozích kapitolách (kap.2.3). Příklad izolačního postupu intracelulárních enzymů
ukazuje Schema 2.
Jak již bylo několikrát zdůrazněno, existuje značná variabilita biomakromolekul a
proto nelze přesně definovat purifikační postup, který by měl obecnou platnost. Ani v případě
purifikace stejné látky např. stejného enzymu pocházejících z různých zdrojů nelze zvolit
universální postup.
192
Teoreticky pořadí separačních kroků neovlivňuje stupeň purifikace. Jestliže některá
metoda odstraňuje určitou kontaminantu, děje se tak bez ohledu na to, zda se použije této
separační techniky na počátku nebo až na konci purifikačního postupu. V praxi je však pořadí
separačních kroků velmi důležité. Metoda, která má velmi vysokou kapacitu, avšak nízkou
výtěžnost, se musí použít v separačním pochodu na počátku, kdy množství materiálu, které se
má zpracovat je velké, ale jeho cena je nízká. Má-li se naopak pracovat s malým množstvím
materiálu, který je drahý, stávají se důležitými charakteristikami separačního procesu vysoká
výtěžnost a schopnost rozlišení.
Volíme-li pořadí separačních kroků, je rovněž důležité uvážit, zda jsou jednotlivé
metody navzájem slučitelné. Např. iontová síla ve vzorku, získaného srážením síranem
amonným, je vysoká a nedá se proto bezprostředně použít ionexová chromatografie nebo
elektroforeza.
Izolační a purifikační postup lze rozdělit do následujících fází:
- použití klasických separačních technik pro přípravu hrubě přečištěných surových preparátů
(srážení, dialýza)
- použití tradičních chromatografických metod (ionexová chromatografie, gelová
chromatografie)
- použití vysoce specifických chromatografických technik (afinitní, imunoafinitní
chromatografie, HPLC apod.)
193
194
Úkolem první fáze purifikačního postupu (někdy bývá označována jako fáze izolační)
je příprava surového preparátu. K tomu se obvykle využívají postupy, založené na fázových
separacích (viz. kap.2.1 a kap.2.2). Během těchto kroků dochází k velice malému přečištění
preparátů, spíše se jedná o počáteční úpravy vzorku do vhodné formy (např. odseparování
určité skupiny biomolekul, zmenšení objemu apod.)
Během dalšího purifikačního postupu, kdy máme již k dispozici surový preparát, u
kterého však lze předpokládat přítomnost velkého množství balastních látek, se aplikují
chromatografické techniky, pracující na obecnějších principech. Příkladem je např. ionexová
chromatografie, kdy rozhodujícím faktorem pro separaci je rozdíl nábojů mezi požadovanou
složkou a náplní kolony. Výhodou tohoto postupu je i možnost aplikovat velké objemy
vzorku, což má význam např. při izolaci extracelulárních enzymů, kdy výchozím materiálem
může být i několik litrů media. Zejména v této fázi purifikace je třeba dbát na návaznost
jednotlivých kroků. Existují určitá pravidla, vycházející ze zkušeností a principů jednotlivých
metod, která se musí respektovat. Např. použití ionexové chromatografie předchází většinou
odsolení vzorku, protože vysoká koncentrace solí znemožňuje vazbu izolované látky na
ionex. Jiný případ nastává při aplikaci chromatografie s hydrofobní interakcí, kde naopak
vyšší iontová síla zvyšuje pevnost vazby a je proto žádoucí.
Jako další většinou následuje gelová chromatografie na vhodně zvolených gelech.
Protože u tohoto typu chromatografie je jedním z limitujících faktorů objem aplikovaného
vzorku, musí tomuto kroku předcházet koncentrační fáze např. ultrafiltrace, jejímž cílem je
zmenšit objem vzorku na minimum.
V závěrečných fázích purifikačního postupu se uplatňují již specifické typy
chromatografií např. afinitní. Jelikož zde bývá většina kontaminujících složek ze vzorku již
odstraněna, je možno využít i elektroforetické metody, prováděné v preparativním měřítku.
Poté se používá opět gelová chromatografie, a to ze dvou důvodů. Složení vzorku musí být
přizpůsobeno často tak, aby se získaných látek dalo dále využít. Soli, denaturační činidla a
elektrolyty musí být odstraněny. Kromě toho gelová chromatografie odstraňuje artefakty
vzniklé při purifikaci, jako jsou polymery bílkovin, denaturované látky apod.
Pro purifikaci nukleových kyselin se většinou používají postupy stejné jako v případě
proteinů např. gelová chromatografie, chromatografie na měničích iontů apod.. Obecně je
možno říci, že s nukleovými kyselinami se zachází snadněji než s proteiny, protože jsou
poměrně odolné vůči drsným podmínkám. Kromě univerzálních technik existuje však také
mnoho postupů využitelných lépe pro nukleové kyseliny než pro proteiny nebo pouze pro ně.
195
Např. při chromatografickém čištění DNA se s úspěchem uplatňuje hydroxyapatit.
Dvouvláknová DNA se totiž váže mnohem pevněji než jednovláknová DNA a ostatní
molekuly. Při izolaci specifických nukleových kyselin (mRNA) je užitečná afinitní
chromatografie s kovalentně navázanými úseky poly(U). V tomto případě dochází ke
specifické interakci mezi sekvencí poly(A), kterou má na svém 3`-konci většina
eukaryontních mRNA a již zmíněnou poly(U). Pro dělení DNA se nejčastěji využívá
ultracentrifugace v rovnovážném hustotním gradientu v CsCl. Elektroforeza v PAA nebo
agarosovém gelu rozdělí DNA hlavně podle velikosti.
Výsledkem celého purifikačního postupu biomakromolekul by měl být preparát, jehož
čistota odpovídá dalšímu využití. Při volbě purifikačního postupu je třeba brát v úvahu i řadu
dalších faktorů jako např. ekonomiku procesu, možnost automatizace, dobu trvání apod.
Výše uvedené pořadí technik by se nemělo brát jako doporučení, nýbrž spíše jako příklad, jak
lze o pořadí separačních technik uvažovat.
3.8.2 Odsolování
K odstranění nízkomolekulárních látek je možno využívat membránové procesy, a to
dialýzu, elektrodialýzu a ultrafiltraci. Hyperfiltrace (reverzní osmóza) se pro odsolení použít
nedá.
Dialýza se velice často používá při laboratorní práci. Její výhodou je, že je velmi
nenáročná pokud jde o potřebné vybavení. K laboratorní dialýze se dnes většinou používají
dialyzační trubice, t.j. membrány ve tvaru trubice (střeva), které se vyrábějí z různých
materiálů a o různém průměru. Jejich nevýhodou je, že nebývá vždy výrobcem deklarována
velikost pórů, takže ne vždy je možno podle tohoto hlediska volit materiál. Membrány, které
trubice tvoří, jsou určeny pro odstraňování nízkomolekulárních látek, především solí, a tomu
odpovídá hustota membrány. Trubice se po naplnění vzorkem na obou stranách pevně
zaváže, vloží se do nádoby s pufrem o nízké iontové síle, ev. do destilované vody a nechá se
za míchání v chladu dialyzovat asi 24 hod. Není-li zařízena kontinuální výměna pufru, je
třeba tento během dialýzy několikrát vyměnit, neboť celý proces je hnán koncentračním
rozdílem na obou stranách membrány a jakmile dojde k ustavení rovnováhy, proces se
zastaví.
196
Dialýza v žádném případě neslouží k zahuštění roztoku, ale naopak je třeba počítat s
naředěním roztoku v dialyzační trubici.
V poloprovozním nebo provozním měřítku se častěji využívá elektrodialýza, kdy se
nepracuje v membránových trubicích, ale membrány jsou umístěny v rámech a řazeny do
serií, jak je popsáno v kapitole o membránových procesech (kap.2.2).
Ultrafiltrací dosáhneme jak odsolení tak zahuštění roztoků a při volbě vhodné
membrány můžeme současně odstranit část balastních látek. Ultrafiltrační membrány se totiž
vyrábějí s přesně definovanými póry různých velikostí, takže kromě nízkomolekulárních
látek lze současně odstranit i vysokomolekulární látky, ovšem za předpokladu, že mají nižší
molekulovou hmotnost než požadované látky, které se ze směsi izolují.
Při ultrafiltraci procházejí nízkomolekulární látky, resp. látky, které jsou schopné
projít póry v membráně (velikost pórů záleží na naší volbě) na opačnou stranu membrány,
ovšem látková koncentrace procházejících látek v roztoku na obou stranách membrány
zůstává nezměněna. Proto chceme-li snížit látkovou koncentraci solí v zahuštěném roztoku,
musíme sáhnout k tzv. diafiltraci. Znamená to, že po snížení objemu roztoku nad membránou
doplníme objem destilovanou vodou na původní hodnotu, čímž značně klesne látková
koncentrace dosud přítomných látek s nižší molekulovou hmotností. Po opakovaném snížení
objemu roztoku nad membránou můžeme celý proces opakovat, až odstraníme značné
procento původně přítomných menších molekul. Jejich úplné odstranění ovšem není možné.
Při ultrafiltraci tedy dojde k mnohonásobnému (až desetinásobnému) snížení objemu
roztoku nad membránou, přičemž veškeré vysokomolekulární látky zůstávají nad
membránou, takže jejich koncentrace se značně zvyšuje. Diafiltrací ovlivníme pouze snížení
obsahu látek, které procházejí membránou, koncentrace vysokomolekulárních látek se
opakovaným naředěním oproti prvnímu kroku nemění (je-li konečný objem nad membránou
vždy stejný jako po prvním kroku).
Pro laboratorní i poloprovozní či provozní ultrafiltraci je nezbytné speciální zařízení a
vhodné filtry. Protože se pracuje s tlakovými rozdíly, musí být zajištěna odolnost materiálu
vůči tlakovým změnám a nepropustnost, proto jsou tato zařízení obvykle dosti nákladná.
K odsolení roztoků se může použít i gelová chromatografie na gelech s velice nízkou
vylučovací mezí (Sephadex G-10, G-25), takže všechny molekuly s vyšší molekulovou
hmotností budou procházet kolonou bez zdržení a zpomalí se pouze nízkomolekulární látky,
které se od větších molekul dobře oddělí. K odsolování na gelech je možno použít kolony o
velkém průměru a vysoké průtokové rychlosti. Jako eluent se obvykle používají pufry s
197
nízkou iontovou silou. Odstraňování solí ze vzorku gelovou chromatografií je úplnější než
membránovými procesy. Dochází ale k mírnému naředění vzorku.
Gelová chromatografie na gelech s nízkou vylučovací mezí se dobře hodí i pro
výměnu pufrů, ve kterých jsou separované molekuly rozpuštěny.
3.8.3 Požadavky na čistotu preparátů
Volba purifikačního postupu je určována dalším využitím konečného produktu.
Požadovaný stupeň čistoty preparátu využívaného v průmyslu je většinou odlišný od stupně
čistoty ultračistých laboratorních preparátů.
Úkolem purifikačního postupu není zamezit ztrátám v průběhu izolace a purifikace,
ale odstranit co nejvíce kontaminujících látek, aby výsledkem byl protein v co nejčistším
stavu.
Z hlediska čistoty lze rozlišit preparáty technické, purifikované a vysoce purifikované
popř. čisté.
Příprava technických preparátů je poměrně jednoduchá a obvykle vystačíme s
nejběžnějšími izolačními postupy, jako je srážení organickými rozpouštědly nebo solemi,
dialýza a izoelektrické srážení. Při přípravě technických enzymových preparátů bývá
většinou cílem získat enzymový preparát v práškové formě. Toho lze dosáhnout použitím
klasických izolačních postupů (např. metody fázové separace viz kap.2.1), kterými lze
připravit preparáty omezené čistoty, ale s poměrně malými náklady. Protože tyto preparáty
jsou využívány zejména v průmyslovém měřítku, kde jsou třeba poměrně velká množství, je
ekonomické hledisko procesu velmi důležité. Je třeba tedy najít určitý kompromis mezi
požadovanou čistotou preparátu a náklady na jeho přípravu.
Příprava purifikovaných preparátů je mnohem složitější a kromě klasických
izolačních technik je nutno použít specifické metody, založené na různé migraci. V této fázi
postupu se používají purifikační postupy podle zásad, které byly probrány v kapitole o
separačních technikách. Purifikované preparáty by měly být zbaveny většiny nežádoucích
příměsí a proto i izolační postup bývá náročnější než je tomu u technických preparátů.
Vysoce purifikované až homogenní preparáty se vyrábějí jen vzácně a jsou obvykle
velice drahé. Tyto preparáty nacházejí uplatnění ve výzkumných oblastech, zejména v
198
klinické chemii, medicině apod. Pokud jde o enzymy, jsou to většinou enzymy intracelulární
a jsou připravovány ve velmi malých množstvích.
Při aplikaci jakékoliv nové purifikační metody je třeba průběžně kontrolovat čistotu
získaného preparátu. K tomu se používá metoda tzv. postupné eliminace, což je proces,
během kterého je všemi dostupnými metodami dokazováno, že daný vzorek obsahuje pouze
jedinou látku. Zkušenost ukazuje, že v látce, která byla považována za čistou se použitím
nové metody často prokáže přítomnost dalších příměsí.
3.8.4 Hodnocení účinnosti purifikace
V praxi je třeba pro každý izolovaný preparát vyvinout speciální izolační a purifikační
postup. Purifikace je vždy složitý proces, který vyžaduje vhodné technické zařízení, ale
kromě toho i určité zkušenosti s prací s daným materiálem i s metodami vhodnými pro
separaci biomakromolekul.
Úspěšnost každého izolačního resp. purifikačního kroku je třeba nějakým způsobem
hodnotit. V zásadě k tomu slouží 2 hlediska:
výtěžnost ev. návratnost požadované sloučeniny v izolačním kroku
stupeň přečištění
V prvém případě se posuzuje k jakým ztrátám požadovaného materiálu došlo, ve
druhém případě se sleduje, kolik se podařilo odstranit balastních látek. Celkem jednoduše se
obě hlediska sledují, jedná-li se o látku s měřitelnou biologickou aktivitou, např. enzymovou.
Výtěžnost enzymové aktivity se vypočítá z poklesu celkové enzymové aktivity v
průběhu izolačního postupu nebo jednotlivých purifikačních kroků. Stupeň přečištění je
poměr specifických enzymových aktivit po izolačním kroku a před ním.
Zatímco celková enzymová aktivita v průběhu izolace klesá, specifická aktivita
enzymového preparátu se zvyšuje. Aby bylo možno počítat bilanci procesu, je tedy třeba před
i po každém purifikačním kroku znát enzymovou aktivitu, objem preparátu a obsah bílkovin.
199
3.9 Koncentrace izolovaných preparátů a jejich konečná úprava
Při většině metod frakcionace, resp. purifikace biomakromolekul, dojde k značnému
naředění roztoku separované látky. Proto po purifikaci velice často následuje zahuštění
roztoků. Zřídka se k tomu účelu dá použít odpařování, při němž je nebezpečí inaktivace
biologicky aktivní látky. Pokud je biomolekula dostatečně teplotně odolná, pak se může
použít sušení ve sprayových sušárnách, kde styk izolovaného preparátu s horkým vzduchem
je velmi krátký, proto ztráty biologické aktivity jsou malé a výtěžek se pohybuje okolo 90 %.
Tímto způsobem se někdy upravují technické enzymové preparáty.
Zcela běžným způsobem koncentrace s finální úpravou enzymových a jiných
bílkovinných preparátů je mrazová sublimace (tzv. lyofilizace). Roztok enzymu je zmražen v
tenké vrstvě a pak vystaven hlubokému vakuu. Přitom dojde k sublimaci vody a protein
obvykle zůstává ve formě hygroskopického prášku. Před zmražením je nutno roztok
bílkoviny zbavit zbytků organických rozpouštědel a většího množství solí. Většina bílkovin
snáší mrazovou sublimaci velmi dobře. Jestliže přeci dojde k denaturaci, je to často vlivem
změny pH, která může při lyofilizaci nastat.
Koncentrace roztoků bílkovin a nukleových kyselin se může realizovat vysrážením
vhodnou solí nebo organickým rozpouštědlem. Precipitovaná biomolekula je odseparována
(např. centrifugací) a po resolubilizaci v malém objemu roztoku zbavena solí ev. organického
rozpouštědla dialýzou. Tato metoda je vhodná proto, že nevyžaduje žádná speciální zařízení.
Ke koncentraci roztoků purifikovaných biomolekul se dále používají metody již dříve
popsané: ultrafiltrace, odvodnění a odsolení pomocí suchých gelotvorných materiálů
(Sephadex, Biogel) s hustým prokřížením, zahuštěním vsádkovou adsorpcí na adsorpční nebo
ionexový materiál. Z těchto metod se pouze ultrafiltrace dá použít ve větším měřítku. Ostatní
způsoby mají význam pouze pro velmi malé objemy.
Někdy jsou bílkoviny připravovány v krystalické formě. Různé proteiny se značně liší
schopností krystalizace; některé krystalizují velmi snadno, jiné vůbec ne. Např. aldolasa z
králičího svalu krystalizuje již z hrubého extraktu. Obvykle však je krystalizace až posledním
krokem několikastupňového purifikačního procesu.
Krystalizace bílkoviny se obvykle provádí z roztoku síranu amonného nasyceného
těsně pod stupeň, při němž dochází k vysolení. Vlastní proces trvá několik dní až týdnů a
roztok musí být udržován v chladu. Obdobně je možné provádět krystalizaci z roztoku
organického rozpouštědla. Metody krystalizace jsou zcela empirické a musí být brány v
200
úvahu podmínky jako pH, teplota, koncentrace solí apod. Krystalizační procesy jsou
zdlouhavé a vždy při nich dochází ke ztrátám biologické aktivity. Proto krystalizace izolační
postup vždy velmi prodraží.
Krystalická forma není zárukou čistoty bílkovinného preparátu. Některé amorfní
preparáty mohou být čistší než preparáty krystalické. Např. myogen A, ačkoliv tvoří krásné
bipyramidální krystaly, je značně znečištěn řadou dalších proteinů, z nichž některé mají jiné
enzymové aktivity.
3.10 Kriteria čistoty preparátů
U každého purifikovaného preparátu bychom měli znát stupeň čistoty. Již jsme si
objasnili, že např. krystalická forma enzymového preparátu neznamená jeho úplnou
homogenitu. Stejně tak zárukou homogenity není zisk jediného elučního vrcholu při užití
libovolného způsobu chromatografie, včetně vysokoúčinné kapalinové chromatografie,
protože v jediném vrcholu mohou být další bílkoviny se stejnými vlastnostmi.
Všechny metody pro průkaz homogenity preparátu biomolekul jsou založeny na
negativních výsledcích při snaze o detekci příměsí. Takže: čím více metodami neprokážeme
žádné příměsi, tím si můžeme být jistější, že získaný preparát je homogenní. Negativní
výsledky jedné jediné metody nám tuto jistotu nikdy neposkytnou.
U enzymových preparátů testujeme vždy přítomnost kontaminujících enzymových
aktivit. U mikrobiálních enzymů se velmi často vyskytují jako kontaminanty proteinasy, ale
může být přítomna i řada dalších enzymů, které se během purifikačního procesu nepodařilo
odstranit. Např. flavinové enzymy (glukosaoxidasa) mají jako běžný kontaminující enzym
přítomnu katalasu, askorbátoxidasa peroxidasu apod. Jestliže se neprokáže žádná
kontaminující enzymová aktivita, neznamená to, že preparát je zcela čistý, protože mohou
být přítomny bílkoviny bez enzymových aktivit.
Zatímco krystalizace sama není průkazem čistoty bílkoviny, nezměněná specifická
aktivita při několikanásobné rekrystalizaci enzymového preparátu již jako průkaz obstojí.
Dříve se k průkazu homogenity používalo měření rozpustnosti bílkoviny. Bylo
sledováno množství rozpuštěné bílkoviny v závislosti na přídavku bílkoviny k roztoku.
Jestliže se na grafu projeví ostrý přechod v místě, kde dojde k nasycení roztoku bílkovinou,
201
pak je přítomna pouze jedna bílkovina. Jestliže je přechod vzestupné fáze do nasyceného
stavu pozvolný, svědčí to o přítomnosti více bílkovin (obr.2.106)
Obr.2.106 Závislost rozpustnosti bílkovin na přídavku k roztoku a) homogenní bílkovina, b) nehomogenní bílkovina
Jedním z kriterií čistoty enzymového preparátu je analytická ultracentrifugace, která
se provádí při 60 tis. otáčkách za minutu. Protein se usazuje a vytváří ostrou hranici mezi
roztokem a rozpouštědlem. Jedné zóně (hranici) odpovídá vždy jediná komponenta. Výsledek
se posuzuje fotometricky.
Na obdobném principu je založena metoda centrifugace v gradientu hustoty. Gradient
se vytváří sacharosou (5-20 %) v centrifugační zkumavce. Vzorek se umístí nad gradientem
a odstřeďuje se při 40 tis. otáčkách za minutu asi 24 hodin. V průběhu centrifugace proteiny s
odlišnou relativní molekulovou hmotností putují gradientem sacharosy odlišnou rychlostí;
nejrychleji se pohybují nejtěžší bílkoviny. Po určité době se ustaví rovnováha a bílkoviny
vytvoří frakce. Počet frakcí odpovídá počtu komponent směsi.
Nejčastěji používanou metodou pro posouzení čistoty preparátu je elektroforéza na
nosičích, dnes zejména elektroforéza na polyakrylamidovém gelu. Počet zón, které se
vytvořily při průchodu stejnosměrného elektrického proudu na gelu, odpovídá počtu
přítomných bílkovin nebo nukleových kyselin. Většina bílkovin je bezbarvá a je proto nutno
zóny po proběhlé elektroforéze vizualizovat. Nejběžnější způsob je barvení amidočerní nebo
Comassie-modří. Některé enzymy dávají barevné reakce, a to pak umožní specifickou detekci
zóny enzymu přímo na nosiči.
Pro zjištění čistoty enzymových preparátů se používají ještě další metody, z nichž
můžeme jmenovat alespoň imunometody.
202
Zatímco při purifikaci bílkovinných preparátů zjišťujeme přítomnost kontaminujících
proteinů, u nukleových kyselin je třeba odlišit DNA od RNA. K tomu slouží
spektrofotometrické metody resp. stanovení poměru absorbancí při 260 nm a 230 nm. Při
posuzování čistoty preparátů nukleových kyselin se rovněž uplatňují metody elektroforetické.
203
204