Upload
lythien
View
233
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Historie
Koichi Tanaka vyvinul MALDI
techniku
Tanaka K., Waki H., Ido Y., Akita S., Yoshida
T.: Rapid Commun. Mass Spectrom. 1988. 2,
151
JB Fenn vyvinul ionizaci
elektrosprejem
Fenn JB., Mann M., Meng CK., Wong SF.,
Whitehouse CM.: Science 1989, 246, 64
Oba získali Nobelovu cenu v
roce 2002 v oboru chemie
Tanaka K.
Fenn J.B.
► Hmotnostní spektrometrie (MS) je fyzikálně-chemická metoda, která určuje hmotnosti atomů, molekul a molekulových fragmentů po jejich převedení na ionty
► Přístroj se nazývá hmotnostní spektrometr ► Výsledkem je hmotnostní spektrum, které graficky znázorňuje závislost četnosti iontů na hodnotě m/z
(efektivní hmotnost, m hmotnost iontu,
z náboj iontu)
Princip hmotnostní spektrometrie
Princip hmotnostní spektrometrie
MS vypovídá o primární struktuře analyzované látky (určuje aminokyselinovou sekvenci)
Fragmentace iontů umožňuje získat podrobnější informace o struktuře látek
Odhaluje post-translační a chemické modifikace proteinů (fosforylace, glykosylace, oxidace….) a může určit i místo modifikace
Může určit izotopový poměr prvků ve vzorku např. 13C/12C, 34S/32S, 18O/16O - kvantifikace
Umožňuje analýzu komplexních směsí
Změření molekulové hmotnosti, kontrola kvality
Identifikaci proteinů
Odhaluje mutace a DNA sekvenační chyby
Možnost analýzy nekovalentních komplexů
Princip hmotnostní spektrometrie
První český hmotnostní spektrometr
Byl sestaven v roce 1953 českými vědci: V. Čermák, V. Hanuš a J. Cabicar
MALDI-TOF hmotnostní spektrometry
Ultraflex III MALDI TOF/TOF
(Bruker)
4800 MALDI TOF/TOF
(Applied Biosystems)
Vacuum System
Sample Inlet
Detector Data
System Mass
Analyser Ionisation Method
Atmosphere
Součásti MS systému
Typy ionizace 1.Měkké techniky ionizace
Energetický přebytek dodaný molekule je malý a
fragmentace primárně vzniklého iontu je malá.
2. Tvrdé techniky ionizace
Dodaná energie postačuje k rozsáhlejší fragmentaci
primárně vzniklého iontu.
Typy ionizace
- nárazem elektronů (EI)
- působením elektrostatického pole (FI, FD)
- chemickou ionizací (CI)
- nárazem rychlými atomy nebo ionty (FAB)
- ionizací fotony
- ionizací 252Cf
- elektrosprejem, termosprejem (ESI)
Desorpčně ionizační techniky
- ionizace laserem za přítomnosti matrice (MALDI)
- desorpční elektrosprej (DESI)
- hmotnostní spektrometrie sekundárních iontů
(SIMS)
- Desorpce a ionizace laserem za účasti nanopovrchu
(NALDI)
Hmotnostní analyzátory Umožňují rozdělit v čase nebo prostoru směs iontů o různých hmotnostech.
Typy analyzátorů
− Průletový analyzátor (TOF)
− Kvadrupólový analyzátor (jednoduché, trojnásobné)
− Iontová past
− Hybridní (Q-TOF, Q-trap, trap-TOF, trap-ICR, …)
− Tandemové (TOF-TOF, QQQ)
− FT- ICR MS, ORBITRAP
Detektor
Poskytuje analogový signál úměrný počtu dopadajících iontů.
Dělí se do dvou skupin
1. Detektory pro přímá měření detekují el. proud vznikající přímým dopadem stanovovaných iontů (měření izotopového zastoupení prvků při zjišťování stáří hornin)
2. Násobičové detektory využívají efekt násobení elektronů uvolněných z první konverzní dynody po dopadu iontů (nejčastěji používané detektory v MS, poskytují měřitelný signál pro jednotlivé ionty)
Možnosti měření na MS
MS mód Lineární mód – umožňuje např. měření proteinů a proteinových
směsí bez předchozího štěpení enzymem
Reflektronový mód – umožňuje měření peptidových směsí (PMF)
MS/MS mód
MALDI Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Metoda využívá ionizace laserem
pulsní technika -------- UV (N2) IR (CO2)
−zkoumaná látka je kokrystalyzována v pevné matrici, která je ozářena krátkým laserovým pulsem (3 ns)
−dojde ke vzniku iontů (kladně i záporně nabitých) a neutrálních molekul
−jejich proud je usměrněn do analyzátoru z doby letu (TOF)
MALDI-TOF MS - ionizace
1.Vzorek (A) je smíchán s matricí (M) a usušen (vykrystalizován) na MALDI destičce
2. Laserový výstřel ionizuje molekuly matrice.
3. Molekuly vzorku jsou ionizovány přenosem protonu z matrice:
MH+ + A M + AH+
+
MALDI destička
Laser
AH+
+20 kV Ground Variable Grid Grid
MALDI ionizace
− měkká ionizace
− malá nebo žádná fragmentace
− jednou nabité ionty [M+H]+; [M-H]-
− lze měřit proteiny, peptidy, oligosacharidy, nukleotidy,
syntetické polymery …
− analýza komplexních sloučenin
− rychlá příprava vzorku & analýza
− tolerantní k detergentům a solím
− jednoduchá interpretace dat
− spojený s TOF analyzátorem
ESI - ionizace elektrosprejem
− měkká ionizace
− technika pro disperzi kapalin a aerosolů
− on-line spojení HPLC a hmotnostního spektrometru
− vznik vícenásobně nabitých iontů [M+zH]z+, [M-zH]z-
− pro jeden analyt se ve spektru objevují série píků, které odpovídají
iontům téže látky, o stejné molekulové hmotnosti m, s rozdílným
počtem nábojů z.
- výskyt iontů - aduktů analytu se sodnými ionty [M+zNa]z+ a
draselnými ionty [M+zK]z+ (pokud je vzorek zasolený)
− není tolerantní k detergentům a solím (před analýzou je nutné
přečištění a odsolení vzorku)
− spojení s různými typy analyzátorů
Výhody Díky přítomnosti analytu ve více iontech
s různým nábojem lze snadno určit hmotnost iontů
Nevýhody Snížení citlivosti díky rozdělení signálu
mezi více píků a menší přehlednost spekter složitějších směsí
ESI - ionizace elektrosprejem
Při ionizaci elektrosprejem probíhají čtyři základní procesy
1) vznik nabitých kapek na konci sprejovací kapiláry
2) zmenšování nabitých kapek v důsledku odpařování rozpouštědla a jejich opakovaný rozpad (Coulombické štěpení)
3) uvolnění iontů do plynné fáze z malých, vysoce nabitých kapek
4) sekundární děje, kterých se účastní ionty v plynné fázi
- měkká ionizační technika (Zoltán Kakáts)
- jednoduchá, rychlá analýza za atmosférického tlaku
- tvorba jemného spreje nabitých kapek rozpouštědla
- dopad kapek na povrch pevného (tkáně) nebo kapalného vzorku
- molekuly na povrchu vzorku jsou extrahovány do rozpouštědla
- sekundární kapky rozpouštědla společně s ionty povrchu jsou
desorbovány a transportovány do MS
(mechanismus „droplet pick-up“)
- pomocný plyn dusík proudící kolem sprejovací kapiláry napomáhá
fokusovat sprej kapek a transportovat sekundární kapky do MS
DESI - desorpce elektrosprejem
DESI - desorpce elektrosprejem
- DESI umožňuje analyzovat malé a středně velké polární látky
- Uplatnění má v analýze peptidů, proteinů, farmaceutik, polymerů,
výbušnin atd.
- desorpce a ionizace laserem za účasti nanopovrchu
- k ionizaci molekul se používá komerčně vyráběný NALDI
povrch
- NALDI povrch je složený
z křemíkových nanovláken,
které absorbují energii laserem
a desorbují a ionizují molekuly
analytu
NALDI
- NALDI povrch je určen k analýze
nízkomolekulárních polárních látek (např. lipidů)
v kladném módu
- NALDI lze také použít k analýze nepolárních
organokových sloučenin nebo pro desorpci
elektrosprejem
NALDI
SIMS
- hmotnostní spektrometrie sekundárních iontů
- ionizace je založena na bombardování analyzovaného povrchu
směrovaným proudem primárních nabitých částic atomů (Cs+,
Bi3+, fulerenový ion C60+)
- metoda nevyžaduje přítomnost matrice
- detekované jsou sekundární ionty uvolněné z povrchu
- v tomto procesu se mohou emitovat elektrony, záření, kladně a
záporně nabité ionty, neutrální molekuly
SIMS
- uplatnění SIMS v
oblasti uměmí,
geologie, hutnictví
- je jedinou
zobrazovací MS
technikou, která
dosahuje prostorového
rozlišení pod 1 m a
umožňuje analýzu na
sub-buněčné úrovni
Ionty o stejné energii nebo o stejném impulsu mají
rychlosti závislé na hodnotách efektivní hmotnosti m/z
Ionty jsou vypuštěny do urychlovacího pole a se
získanou energií postupují analyzátorem rychlostí v,
takže dráhu d proletí za dobu t
Mezi dvěma ionty rozdílných hmotností je tedy diference
v dobách letu
t = k ( m1/z - m2/z)
TOF analyzátor
TOF analyzátor
Umožňuje měřit v lineárním, reflektronovém a PSD módu
Lineární mód – měření proteinů (přímá dráha letu, cca 1m)
Reflektronový mód – měření peptidů (dráha letu
je prodloužena pomocí reflektronového iontového zrcadla, cca
2-3m)
Post-Source Decay (PSD) – kombinace reflektronového módu
s fragmentací mateřských iontů (informace o sekvenci peptidů –
strukturní analýza)
Letová trubice
Detektor
Zdroj iontů
Lehčí ionty doletí k detektoru rychleji než ionty těžší.
15-25 kV
Průletový analyzátor (TOF)
Charakteristika – reflektronový mód
Vysoké rozlišení (až 30 000) a přesnost (10-100 ppm)
Vysoká citlivost (fmol = 10-15 mol) Nejrychlejší skenování
Teoreticky neomezené rozmezí m/z < 1 000 000
Téměř současná detekce všech iontů: zisk úplného spektra v jednom ionizačním pulsu
Tandemový hmotnostní spektrometr
tandemová hmotnostní spektrometrie (MS/MS),
případně hmotnostní spektrometrie n-tého stupně (MSn),
slouží k bližší charakterizaci analyzované látky, např.
určení aminokyselinové sekvence nebo lokalizace a
charakterizace post-translačních modifikací
obsahují dva hmotností analyzátory sériově spojené
kolizní celou
v prvním analyzátoru dojde k rozlišení prekurzorových
(mateřských) iontů a k výběru jednoho z nich
tento prekurzor je podroben fragmentaci v kolizní cele
a vzniklé produktové (dceřinné) ionty jsou rozlišeny
v druhém analyzátoru
Tandemový hmotnostní spektrometr
TOF-TOF
obsahují dva hmotností analyzátory sériově spojené kolizní
celou
v prvním analyzátoru dojde k rozlišení prekurzorových
(mateřských) iontů a k výběru jednoho z nich
tento prekurzor je podroben fragmentaci v kolizní cele a vzniklé
produktové (dceřinné) ionty jsou rozlišeny v druhém analyzátoru
Příprava vzorků pro MS Předseparační techniky rozdělení analyzované látky (1D, 2D ELFO,HPLC, capLC, MudPIT HPLC ….) Dělení jak proteinových tak i peptidových směsí
Separovaný
Protein
Proteolytické
peptidy
MALDI-TOF MS spektrum
proteolyt. peptidů
Proteasa
Postup přípravy vzorků
2D-PAGE a MALDI-TOF
Peptidové mapování
Štěpení proteinů Enzymové
proteolýza, nejpoužívanější enzym je trypsin
Chemické
nejsou běžné, používají se jako doplňkové
např. BrCN - bromkyan se používá pro štěpení ve vodě nerozpustných nebo membránových proteinů
Molekulová hmotnost vzniklých peptidů se pak měří na hmotnostním spektrometru
Proteolytické enzymy - proteázy
Katalyzují exotermní hydrolýzu peptidových vazeb v proteinech a peptidech
Výhody jejich použití
vysoká specifita
minimalizované vedlejší reakce
dobrá účinnost štěpení
Podmínky použití, důležité je dodržení: pH reakčního pufru
poměru enzym/substrát
teploty
doby inkubace
pokud je to nutné provádí se: redukce disulfidových vazeb (např. DTT)
alkylace reaktivních cysteinů (např. jodacetamid)
Klasifikace
proteinázy - působí na proteiny (nevyžadují přítomnost volných konců susbstrátů)
peptidázy - působí na malé oligopeptidy (vyžadují alespoň jeden konec substrátu volný a to v blízkosti místa štěpení)
endopeptidázy - katalyzují hydrolýzu peptidových vazeb uvnitř řetězce a tvoří peptidy o různé délce
exopeptidázy - katalyzují hydrolytické odštěpení koncové aminokyseliny
N-koncové (aminopeptidázy)
C-koncové (karboxypeptidázy)
Proteolytické enzymy - proteázy
Peptidázy
Endopeptidázy se získávají:
z orgánů trávicího traktu obratlovců (pankreas - chymotrypsin, trypsin,
žaludek - pepsin)
krve (thrombin)
sleziny (kathepsiny)
rostlinného materiálu (papain, ficain, bromelain)
mikroorganismů (Glu-C, pronase, thermolysin)
Exopeptidázy se získávají:
pankreatu
rostlin
mikroorganismů
Trypsin
v proteomice nejpoužívanější serinová endopeptidáza
štěpí v mírně alkalickém prostředí (pH 7.8)
štěpí specificky peptidové vazby na C-konci kladně nabitých zbytků argininu a lysinu, pokud nenásleduje prolin
doba štěpení 4 - 24 hodin
teplota při štěpení 37 °C
methylovaný trypsin štěpí 30 minut při 58 °C
poskytuje definované peptidové fragmenty
dobře se ionizují
výhodná velikost pro MS analýzu
jeden z možných typů trypsinu je hovězí trypsin
má Mw 24 kDa, pH 9.4
trypsin je výhodný pro štěpení v polyakrylamidovém gelu, je schopný difundovat
póry gelu k proteinu
větší molekuly peptidáz nejsou schopny do gelu difundovat ze stérických důvodů
vzhledem k vysoké specifitě štěpení jsou tvořeny databáze obsahující proteiny s
teoretickými trypsinovými peptidy včetně jejich m/z hmotností
využití k identifikaci proteinů metodou peptide mass fingerprinting (peptidové
mapování)
Nevýhody
malá termostabilita (při vyšší teplotě klesá aktivita)
autolýza (autolytické peptidy trypsinu ruší MS analýzu)
štěpí pouze v optimálním pH
Modifikace trypsinu (methylace, acylace) zabraňují jeho autolýze a termolabilitě.
Trypsin
Chymotrypsin
serinová endopeptidáza
někdy nahrazuje nebo doplňuje trypsin
vhodný pro štěpení proteinů v roztoku i gelu
specifita štěpení je na rozdíl od trypsinu nízká
peptidovou vazbu štěpí na C-konci v místě:
F (phenylalanin), Y (tyrosin), W (tryptophan),
L (leucin), I (isoleucin), V (valin), M (methionin)
pokud nenásleduje prolin
Glu-C
serinová endopeptidáza
produkt bakterie Staphylococcus aureus
štěpí peptidové vazby na C-konci kyseliny glutamové případně kyseliny asparagové (3000x pomaleji)
Lys-C serinová endopeptidáza
produkt bakterie Lysobacter enzymogenes
štěpí peptidové vazby na C-konci lysinu
Enzymatické štěpení vzorku
Trávicí enzym trypsin umožňuje specifické štěpení peptidové
vazby u kladně nabitých zbytků.
Trypsin štěpí peptidové vazby od C-konce v místě argininu a
lysinu, není-li následující zbytek prolin.
- Phe - Trp - Met - Gly - Ala - Lys - Leu - Pro - Met - Asp - Gly - Arg -- Cys -
Trypsin
Matrice
Matrice slouží jako rozpouštědlo analytu, takže jeho molekuly jsou dostatečně zájemně separovány a jejich intermolekulární působení je redukováno na minimum
Matrice musí absorbovat v UV oblasti (pokud používáme N2 laser) a musí být málo těkavá (to souvisí s čerpací rychlostí vakuového systému)
Matrice musí vytvořit co nejjemnější směsné krystaly
U matric je důležitá přítomnost -OH skupin, které zajišťují ionizaci analytů. Pokud jsou -OH skupiny nahrazeny za CH3CO- skupiny, matrice ztrácí svou funkci
MALDI-TOF MS Výběr matrice
Název matrice Analyzovaná látka
-kyano-4-hydroxyskořicová kys. (CHC) Peptidy, proteiny < 10 kDa, karbohydráty, lipidy
3,5-dimetoxy-4-hydroxyskořicová kys. (SA) Proteiny, peptidy > 10 kDa, glykoproteiny
2,5-dihydroxybenzoová kyselina (DHB) Neutrální karbohydráty, syntetické polymery,
peptidy, proteiny, glykopeptidy, lipidy, glykoproteiny
3-hydroxypikolinová kyselina (3-HPA) Oligonukleotidy, glykoproteiny
3,4-dihydroxyskořicová kyselina (CA) Proteiny, oligonukleotidy
Interpretace spekter
700 1260 1820 2380 2940 3500
Mass (m/z)
0
4.0E+4
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
% In
ten
sit
y
Voyager Spec #1 MC[BP = 1112.6, 39593]
1112.57
1508.83
1337.66
1806.97
721.40
1032.59
1718.911278.70
2299.222007.11874.52 1204.64
1381.70 1851.911530.83 2310.251095.54
Jaké hmotnosti můžeme změřit?
Průměrná Vážený průměr všech izotopů daného prvku podle % zastoupení
CH3Br = 12.01115 + 3*1.00797 + 79.90400 = 94.93906
Monoizotopická Součet přesných hmotností „nejlehčích“ izotopů prvků
CH3Br = 12.000000 + 3*1.007825 + 78.918336 = 93.941011
Jaké hmotnosti můžeme změřit?
Průměrná Vážený průměr všech izotopů daného prvku podle % zastoupení
CH3Br = 12.01115 + 3*1.00797 + 79.90400 = 94.93906
Monoizotopická Součet přesných hmotností „nejlehčích“ izotopů prvků
CH3Br = 12.000000 + 3*1.007825 + 78.918336 = 93.941011
Monoizotopická vs. Průměrná Mh
Mmono < Mavg
Jaké hmotnosti můžeme změřit?
Průměrná Vážený průměr všech izotopů daného prvku podle % zastoupení
CH3Br = 12.01115 + 3*1.00797 + 79.90400 = 94.93906
Monoizotopická Součet přesných hmotností „nejlehčích“ izotopů prvků
CH3Br = 12.000000 + 3*1.007825 + 78.918336 = 93.941011
Monoizotopická vs. Průměrná Mh
Mmono < Mavg
Glukosa C6H12O6 Peptid: HLKTEAEMK
Mmono = 180.0633 Mmono = 1085.55 Mavg = 180.1576 Mavg = 1086.28
Peptid: HLKTEAEMK
Mmono = 1085.55 Mavg = 1086.28
Pro peptidy a proteiny je rozdíl mezi průměrnou a monoizotopickou hmotností kolem 0.06%
Rozlišení hmotnostního spektrometru bylo 5 000.
Pro malé peptidy je obvykle první pík izotopické obálky nejvyšší.
Izotopická obálka proteinu inzulin Izotopická obálka proteinu BSA
Mmono = 5803.64 Mmono = 66 384
Mavg = 5807.66 Mavg = 66 427
Izotopická obálka proteinu inzulin Izotopická obálka proteinu BSA
Mmono = 5803.64 Mmono = 66 384
Mavg = 5807.66 Mavg = 66 427
U velkých proteinů má izotopická obálka jiný tvar než u malých peptidů,
nejintenzivnější píky jsou uprostřed. Monoizotopická hmotnost se určuje
obtížně, je nutné použít přístroje s vysokým rozlišením.
Rozlišení Parametr hmotnostního
analyzátoru
Může mít hodnoty 1/R = 103 – 106
Vyjadřuje schopnost
hmotnostního analyzátoru rozlišit
blízké hodnoty m/z
a) pro dva ionty: RP (resolving
power) – píky m1 a m2 mají 10%
překryv při stejné výšce
RP = m1/(m1-m2)
kdy z1 a z2 se rovnají jedné
b) pro jeden ion: m/∆m nebo t/2∆t
(u TOF) FWHM (full width at half
maximum)
R = 1 000 (modrá)
R = 3 000 (červená)
R = 10 000 (zelená)
R = 30 000 (černá)
Iontová past < TOF < FT-ICR analyzátor
Přesnost určení hmoty
Parametr hmotnostního analyzátoru
Absolutní – udává se v Daltonech (Da), hodnoty 0.1 – 0.0001
Relativní (mění se podle m/z) – udává se v % nebo ppm (parts per million),
hodnoty 100 – 0.1 ppm
Vyjadřuje shodu mezi naměřenou m/změřená a vypočtenou m/zteoretická hodnotou
Výpočet:
(m/zteoretická - m/změřená)/m/zteoretická x 106
Přesnost určení hmoty
Parametr hmotnostního analyzátoru
Absolutní – udává se v Daltonech (Da), hodnoty 0.1 – 0.0001
Relativní (mění se podle m/z) – udává se v % nebo ppm (parts per million),
hodnoty 100 – 0.1 ppm
Vyjadřuje shodu mezi naměřenou m/změřená a vypočtenou m/zteoretická hodnotou
Výpočet:
(m/zteoretická - m/změřená)/m/zteoretická x 106
Příklad
Naměřená hmotnost: 545.4200
Teoretická hmotnost: 545.3234
Relativní chyba:
(545.3234-545.4200)/545.3234 =
-0,00017714
Relativní přesnost = 177 ppm
- ve skenovacím módu je povrch vzorku analyzován postupně s definovaným prostorovým rozlišením a z každého bodu analýzy je získáno hmotnostní spektrum
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie
Zobrazovací hmotnostní spektrometrie
(MSI)
-vybraná hodnota m/z je následně zobrazena v analyzované oblasti
povrchu
- výsledky z MSI jsou porovnávány s mikroskopickým obrazem
histologicky obarvené tkáně
MALDI zobrazovací MS
MALDI MS Image of a Phospholipid
in Rat Brain, Reprinted with permission Dr Josephine Bunch
MALDI MS Image of a mouse kidney, Reprinted
with permission of of Walch et al.
REIMS metoda
-Rapid Evaporative Ionization Mass Spectrometry
-publikovaná v roce 2010 (Zoltan Takats et al. Identification of
Biological Tissues by Rapid Evaporative Ionization Mass Spectrometry. Anal.
Chem., 2010, 82 (17), pp 7343–7350)
-možnost analýzy vzorku tkáně in vivo, in situ pomocí
hmotnostního spektrometru umístěného přímo na
operačním sále
- analýza je založena na různém rozložení fosfolipidů v řezu tkáně, naměřená
MS spektra jsou hodnocena pomocí spektrální databáze a statistických
programů
- přesnost identifikace byla vyšší než 97%
- metoda je vhodná pro histologickou analýzu během chirurgické operace
nebo endoskopie, lze použít v patologii
Histology-based MALDI-
Imaging of a tumorous
tissue section.
Top-down proteomika
je postup používaný pro identifikaci intaktních proteinů bez použití
enzymatického štěpení proteinu na peptidy. Daná bílkovina je nejprve
izolována ze směsi a potom charakterizována (celá molekula je
fragmentována v hmotnostním spektrometru)
Shotgun proteomika
neseparovaná směs bílkovin je nejprve enzymaticky rozštěpena na
směs peptidů, které jsou následně separovány vhodnou metodou
(nejčastěji HPLC) a potom sekvenovány tandemovou hmotnostní
spektrometrii
High-throughput proteomika
je určena pro rychlé získávání velkého množství dat o bílkovinách,
postupu se např. využívá ve zdravotnictví pro screeningové účely,
v zemědělství nebo ke kontrole potravin
MudPIT – (multidimensional protein identification technology)
vícerozměrná technologie identifikace bílkovin (MD HPLC a MS/MS)
Diferenční proteomika
je srovnávací metoda založená na analýze složitých směsí bílkovin,
která sleduje změny složení bílkovin při různých stavech biologického
celku, např. organismu, s cílem nalézt a identifikovat rozdílně se
vyskytující bílkoviny
Analytická proteomika
je založena na kombinaci separace bílkovin ze složitých biologických
směsí, jejich charakterizaci hmotnostní spektrometrii (identifikace,
stanovení přesné molekulové hmotnosti, určení pořadí aminokyselin
a post-translačních modifikací) a na bioinformatickém zpracování
získaných údajů
Strukturní proteomika
se zabývá studiem struktury bílkovin s použitím krystalografie, NMR,
MS a dalších technik s cílem pochopit strukturní chování bílkovin a
využít tyto poznatky pro specifické účely
Česká společnost pro hmotnostní
spektrometrii
- společnost vznikla v roce 2010 pro zájemce
o hmotnostní spektrometrii
- bude pořádat 2. výroční konferenci
17.-19. 10. 2012 na Fakultě vojenského
zdravotnictví v Hradci Králové
- další informace na stránkách www.cshs.cz