Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

  • Upload
    milica

  • View
    236

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    1/53

    PREGLED METABOLIZMA AMINOKISELINA

    STRUKTURA I FUNKCIJA DNK I RNK

    BIOSINTEZA PROTEINA

    Predavanje 24.12.2012. godine; odseci Hortikultura I Vocarstvo

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    2/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    3/53

    VEI DEON IZ AMINO GRUPA AMINOKISELINA SE U VIDU AMONIJAKA PREVODI

    U UREU (Ornitinov cuklus)

    OSTATAK UGLJOVODONICNOG NIZA SE

    PREVODI UACETIL-CoA, ACETOACETIL-CoA, PIRUVATILI NEKE OD PRODUKATACIKLUSA LIMUNSKE KISELINE.

    Tako iz amino kiselna mogu nastati masnekiseline, ketonska tela i glukoza

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    4/53

    U jetri se odvija razgradnja

    amino kiselina kod sisara1. Reakcijama bonnog ugljovodoninog

    lanca uz zadravanje amino-grupe

    2. Dekarboksilacijom

    3. Transaminacijom

    4. Dezaminacijom

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    5/53

    Dekarboksilacija

    Nastaje CO2 i odgovarajui biogeni amin

    Biogeni amini imaju farmakoloko znaenje, aneki su vani kao prekusori hormona i sirovine zakoenzime i ostale bioloke vane supstance

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    6/53

    Nastanak histamina i tiramina uprocesu derkarboksilacije

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    7/53

    Transaminacija

    Prenos amino-grupe sa amino kiselinena -keto kiselinu pod dejstvom enzimatransaminaza.

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    8/53

    Transaminacijom organizam mo e izgraditi nekeamino kiseline: alanin iz piruvata , serin izhidroksipiruvata , kao dikarboksilne amino kiseline

    glutamat i aspartat .Primeri:

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    9/53

    -Amonijak je snaan elijski otrov pa se mora ukloniti

    (detoksikacija)-Konano uklanjanje amonijaka deava se u procesu sintezeuree.-Ona je najprikladnija za izluivanje jer je nenaelektrisana,

    nije otrovna i lako difunduje kroz bioloke membrane, pa sepreko bubrega moe lako odstraniti -Urea se stvara u ciklusu uree, u jetri, koji se jednim delomodigrava u mitohondrijama, a drugim delom u citosolu

    Dezaminacija- oslobaanje N iz -

    amino grupe amino kiselina u oblikuamonijaka .

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    10/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    11/53

    Primer oksidativne dezaminacije

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    12/53

    Neoksidativne dezaminacije

    To je enzimska eliminacija amonijaka uzstvaranje dvostruke veze. Enzimi kojikatalizuju ovaj proces su amino kiselinskeamonijak liaze.Primer kod sisara je histidin amonijak liaza.

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    13/53

    Primer ne oksidativne dezaminacije

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    14/53

    Ciklus uree

    Viak amonijaka se kod veine kopnenihkimenjaka pretvara u ureu (ureotelne ivotinje) Ptice i kopneni gmizavci amonijak pretvarajuu mokranu kiselinu (urikotelne ivotinje) Mnoge vodene ivotinje amonijak direktnoizbacuju u spoljanju okolinu (amonotelne ivotinje)

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    15/53

    Ciklus uree prredloili Hans Krebsi Kurst Henseleit, 1932.

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    16/53

    Ciklus uree

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    17/53

    STRUKTURA I FUNKICAJA NUKLEINSKIH KISELINA (DNK I RNK)

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    18/53

    Molekuleera povezan je N-glikozidnom vezom saheterociklinom bazom , a na sam eer vezan je

    jo i fosfatni ostatak .

    NUKLEOTID = EER + HETEROCIKLINA B

    FOSFATNI OSTATAK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    19/53

    STRUKTURA HETEROCIKLINIH BAZA

    DVE VRSTE:

    - PURINSKI

    - PIRIMIDINSKE

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    20/53

    PURINSKE- DERIVATI PURINA

    ADENIN

    GUANIN

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    21/53

    PIRIMIDINSKE-DERIVATI PIRIMIDINA

    CITOZIN

    URACIL

    TIMIN

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    22/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    23/53

    eeri riboza i dezoksiriboza

    Kod DNK dezoksiroboza

    Kod RNK riboza

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    24/53

    NUKLEOZID-EER+HETEROCIKLINA BAZA

    PRIMER:

    URACIL+RIBOZA = URIDIN

    ADENIN+RIBOZA=ADENOZIN (RNK)

    KOD DNK DEZOKSIADENOZINADENOZIN + DEZOKSIRIBOZA

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    25/53

    ADENOZIN (A) KOD RNK IDEZOKSIADENOZIN (dA) KOD DNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    26/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    27/53

    KOD DNK CITIDIN I TIMIDIN !

    KOD RNK CITIDIN I URIDIN !

    RAZLIKA U STRUKTURI PIRIMIDINSKIH

    NUKLEOZIDA KOD DNK I RNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    28/53

    CITIDIN (RNK) I

    DEZOKSICITIDIN (DNK)

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    29/53

    TIMIDIN

    URIDIN

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    30/53

    FOSFATNI ESTRI NUKLEOZIDAPRIMER : AMP, ADP I ATPKOD DNK: AMP, GMP, CMP, TMP

    NUKLEOZIDI

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    31/53

    Primarna struktura tj. Sekvenca nukleozida. Utoj sekvenci je pohranjena informacija kojunosi molekulSekundarna struktura, koja se definie kaonain sparivanja baza Tercijarna struktura tj. Potpuna prostornastruktura

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    32/53

    PRIMARNASTRUKTURADNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    33/53

    SEKUNDARNASTRUKTURADNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    34/53

    TERECIJARNA

    STRUKTURADNK

    ULOGA :

    NOSILACGENETSKIHINFORMACIJA

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    35/53

    GENETSKA INFORMACIJA DETERMINIEREDOSLED AMINOKISELINA U PROTEINIMA.

    Ona je ifrirana u kodu, kod kojeg niz od 3baze odreuje jednu amino kiselinu

    Posrednik izmeu DNK i proteina je RNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    36/53

    RNK RIBONUKLEINSKE KISELINE

    POSTOJE TRI VRSTE

    TRANSPORTNA (tRNK)

    RIBOZOMALNA (rRNK)

    INFORMACIONA ili MESSENGER (iRNK ili mRNK)

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    37/53

    TRANSPORTNA tRNK-najmanji molekuli,sastoje se od 75 do 85 nukleotida

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    38/53

    RIBOZOMALNA rRNKU RIBOZOMIMA VIIH ORGANIZAMANALAZI SE 4 RIBOZOMALNE RNK (5S-RNK, 5.8S-RNK, 16S-RNK I 28S-RNK)

    primer sekundarna struktura 16S RNK

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    39/53

    INFORMACIONA iRNK, mogu imati molekulske mase od nekoliko hiljada do nekoliko miliona

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    40/53

    Biosinteza proteina

    Biosinteza proteina se naziva i translacija(lat.translatio=prevo enje).Ovaj proces se odigrava uribozomima i jedan je od najsloenijih biosintetikihputeva. I pored svoje sloenosti, biosinteza jeveoma brza i efikasna, jer se odigrava u tokunekoliko sekundi i izuzetno precizno je

    kontrolisana.U elijama se sintetie u svakommomentu na stotine i hiljade proteina.

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    41/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    42/53

    Sinteza proteina na ribozomima

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    43/53

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    44/53

    Proces biosinteze proteinaobuhvata etiri osnovne faze:

    Aktivacija aminokiselina Inicijacija polipeptidnog lanca

    Elongacija(produavanje) polipeptidnoglanca Terminacija(zavravanje)polip.lanca

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    45/53

    Aktivacija aminokiselina

    Aktivacija aminokiselina se sastoji u vezivanjuaminokiselina estarskom vezom za jednu odOH grupa riboze nukletidnog ostatka koji senalazi na 3 kraju odgovarajue t-RNK(popravilu je to adenilna kiselina) .Proces jekatalizovan enzimima iji je opti naziv

    Amino-acil tRNK-sintetaze

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza1.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    46/53

    Aktivacija amino kiselina

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    47/53

    Inicijacija polipeptidnog

    lanca Inicijacija polipeptidnog lanca obuhvata prvodisocijaciju ribozoma na podjedinice.Zatim sena malu podjedinicu smeta i informacionaRNK, za koju se,naspram tzv. inicijacionogkodona vezuje aktivirana inicijacionaaminokiselina.Najzad,na nastali kompleks se vezuje velikapodjedinica ribozoma i time dobijafunkcinalni ribozom ,u kome se odvijajunaredne faze biosinteze polipeptida.

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    48/53

    Inicijacija polipeptidnog

    lanca

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza2.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    49/53

    Elongacija( produavanje )

    polipeptidnog lanca Oitava sekvenca kodona u molekulu iRNK injihovo prevodjenje u sekvencuaminokiselina datog polipeptidnog lanca.

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    50/53

    Elongacija polipeptidnog lanca

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza3.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    51/53

    Terminacija( zavravanje )polipept

    idnog lanca Oitavanje sekvence kodona u molekulu iRNK I jihovo prevodjenje u sekvencu aminokiselina trajae sve dotle dok ribozom u svom kretanju ne dodje do

    jednog od terminacionih( zavrnih) kodona(koji neodgovaraju nijednoj aminokiselini tj.za njih nepostoji odgovarajui antikodon ),a to su UAA,UGA iUAG. Pomenuti kodoni predstavljaju signal zatrerminaciju( zavravanje ) polipeptidnog lanca.Polipeptidni lanac se odvaja od posljednje(n-te)tRNK, naputa ribozom i u citoplazmi moe dapodlegne dodatnim transformacijama,

    http://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htmhttp://www.znanje.org/i/i25/05iv05/05iv05091018fll/faza4.htm
  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    52/53

    Terminacija

  • 8/10/2019 Metabolizam Amino Kiselina, Dnk i Rnk, Biosinteza Proteina 1

    53/53