Masz licencjat.

I co dalej?

Różnorodność szansą na właściwy wybór

Instytut Zoologii UJ

ul. Gronostajowa 9

30-387 Kraków

Instytut Zoologii

• Zakład Anatomii Porównawczej

• Zakład Antropologii

• Zakład Biologii i Obrazowania Komórki

• Zakład Biologii Rozwoju i Morfologii Bezkręgowców

• Zakład Entomologii

• Zakład Immunologii Ewolucyjnej

• Pracownia Malakologii

• Zakład Neuroanatomii

• Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu

Katedra Fizjologii Zwierząt

• Zakład Biochemii Glikokoniugatów

• Zakład Endokrynologii

• Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu

• Zakład Hematologii Eksperymentalnej

• Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii

Muzeum Zoologiczne (Centrum Edukacji Przyrodniczej UJ)

www.iz.binoz.uj.edu.pl

Zakład Anatomii Porównawczej

• bardzo zróżnicowana tematyka

• współautorstwo publikacji

• badania w laboratorium i/lub w terenie

• możliwość uczestniczenia w grantach

• filogeografia płazów • czynniki warunkujące rozród niższych

kręgowców • komunikacja feromonalna u płazów ogoniastych • budowa układów rozrodczych i gametogeneza

(TEM, SEM) u kręgowców i bezkręgowców • struktura (TEM, SEM) narządów zmysłowych u

ryb i płazów • zróżnicowanie molekularne płazów w Europie

• magistranci mogą być włączani w granty (NCN i inne) prowadzone w ZAP (wsparcie finansowe)

• badania molekularne – pracownia DNA • badania cyto- i histologiczne – pracownia technik histologicznych • badania ultrastrukturalne – mikroskopia elektronowa transmisyjna i skaningowa (w Zakładzie Biologii i Obrazowania

Komórki) • badania immunofluorescencyjne – mikroskop fluorescencyjny (ZAP) i mikroskop konfokalny (ZBiOK) • badania terenowe – faunistyka i inwentaryzacja (kręgowce i wybrane grupy bezkręgowców) na terenach chronionych

• istotne wyniki uzyskane podczas wykonywania pracy magisterskiej są zawsze publikowane (współautorstwo)

Zakład Anatomii Porównawczej

Zakład Antropologii

Kierownik: prof. dr hab. Krzysztof Szostek

Specjalizacja - Biologia człowieka

Zakład Antropologii

ZAKRES SPECJALIZACJI •antropometria i antroposkopia,

•wykonywanie odbitek i analiza wzorów dermatoglificznych,

•badania paleodemograficzne,

•badanie i interpretacja obserwacji osteologicznych, odontologicznych i

paleopatologicznych,

•badania fizykochemiczne ludzkich populacji pradziejowych i historycznych.

CELE SPECJALIZACJI •ocena poziomu rozwoju fizycznego człowieka w powiązaniu z naukami

medycznymi i naukami o kulturze fizycznej,

•wykonywanie ekspertyz sądowych,

•wykonywanie ekspertyz anatomo- antropologicznych populacji

pradziejowych i historycznych.

REALIZACJA SPECJALIZACJI zaliczenie kursów specjalistycznych (35 ECTS)

zaliczenie kursów uzupełniających (min.10 ECTS)

zaliczenie seminarium i wykonanie pracy magisterskiej

Zakład Antropologii

TEMATYKA PRAC MAGISTERSKICH (przykłady):

• Rekonstrukcja stanu biologicznego i parametrów morfologicznych populacji pradziejowych.

• Analizy występowania zmian patologicznych w historycznych populacjach ludzkich

• Badania histomorfometryczne kości i zębów człowieka.

• Rekonstrukcja diety oraz migracji historycznych i przedhistorycznych grup ludzkich.

• Dziedziczenie wzorów dermatoglificznych.

• Symetria i asymetria cech morfologicznych człowieka.

• Wpływ czynników genetycznych, paragenetycznych i środowiskowych na stan

biologiczny noworodków.

• Wpływ czynników społeczno-ekonomicznych na wysokość i

masę ciała człowieka.

• Trendy sekularne w zakresie dojrzewania płciowego i parametrów

morfologicznych ciała

• Badania strategii życiowych naczelnych

w warunkach sztucznych i w środowisku naturalnym.

Zakład Antropologii

Aktywność naukowa i organizacyjna

Konferencja Naukowa Studentów Antropologii

Konferencja Polskiego Towarzystwa Antropologicznego

Naukowe Koło Antropologów UJ

Wykopaliska archeologiczne

Zakład Biologii i Obrazowania

Komórki

Zakład Biologii i Obrazowania Komórki Instytut Zoologii, II p., segment C http://www.biologia.studies.uj.edu.pl/binoz/iz/STRONY/20/index.html Dzień otwarty – Zapraszamy studentów do odwiedzenia

Zakładu 1 czerwca, 2015 w godz. 11.00-13.00.

Zakład Biologii i Obrazowania

Komórki

Tematyka badań:

Prof. dr hab. Elżbieta Pyza (kierownik Zakładu), dr Jolanta Górska-Andrzejak – biologia komórek nerwowych, mechanizmy neuroplastyczności, zegar biologiczny i rytmika okołodobowa Granty: FP7-PEOPLE-2012-ITN nr 316790, europejski (2013-2017) “INsectTIME – Insect Timing” NCN, nr NZ3/02908 (2013-2016) „Rola oksygenazy hemowej w regulacji zegara dobowego Drosophila melanogaster” NCN, nr NN 301 038 (2011- 2014: „Rola białka Bruchpilot (BRP) w plastyczności synaptycznej w układzie wzrokowym Drosophila melanogaster”, NCN 2011/03/N/NZ3/01250 (2012-2014) "Molekularny mechanizm okołodobowej plastyczności interneuronów L2 w układzie wzrokowym Drosophila melanogaster"

Dr hab. Anna M. Osyczka – komórki macierzyste, osteogeneza

Grant: NCN nr 2011/01B/NZ4/00664 (2011-2014) „Inżynieria tkanki kostnej z wykorzystaniem ludzkich mezenchymalnych komórek macierzystych, białek morfogenetycznych kości, bioaktywnych rusztowań i dynamicznych warunków hodowli”

Dr hab. Grzegorz Tylko – mikroanaliza, cytotoksykologia, biologia komórki - autofagia

Dr hab. Marek Romek – rozwój zarodkowy

Grant: NCN „Czynniki modyfikujące hodowane zarodki świni: implikacje cytologiczne i biotechnologiczne”

Dr hab. Janusz Karasiński – komórki macierzyste, układ mięśniowy

Grant: NCN nr N N303 804240 (2011-2014) „Rola komórek macierzystych w przebudowie endometrium w modelu macicy świni”

Zakład Biologii i Obrazowania

Komórki

Metody stosowane w badaniach:

mikroskopia konfokalna i elektronowa

analiza RNA (qPCR) i białek (Western blot,

immunoprecypitacja)

lumino-, fluoro- i spektrometria

cytometria

hodowla komórek

immunocytochemia

badania z wykorzystaniem zwierząt transgenicznych

Przykłady publikacji, których współautorami są studenci: Borowska J., E. Pyza (2011) Effects of heavy metals on insect immunocompetent cells. Journal of Insect Physiology, 57:760-770. Damulewicz M., E. Pyza (2011) The clock input to the first optic neuropil of Drosophila melanogaster expressing neuronal circadian plasticity. PLoS ONE, 6: 21258. Pamula E., J. Kokoszka, K. Cholewa-Kowalska, M. Laczka, L. Kantor, L. Niedzwiedzki, G. C. Reilly, J. Filipowska, W. Madej, M. Kolodziejczyk, G. Tylko, A. M. Osyczka (2011) Degradation, bioreactivity, and osteogenic potential of composites made of PLGA and two different sol-gel bioactive glasses. Annals of Biomedical Engineering, 39(8): 2114-2129. Skarżyńska J., M. Damulewicz, J. Filipowska, W. Madej, P. S. Leboy, A. M. Osyczka (2011) Modification of smad1 linker modulates BMP- mediated osteogenesis of adult human MSC. Connective Tissue Research, 52(5): 408-414. Plewa A., W. Niemiec, J. Filipowska, A. M. Osyczka, R. Lach, K. Szczubialka, M. Nowakowska A.(2011) Photocrosslinkable diazoresin/pectin films – synthesis and application as cell culture supports. European Polymer Journal, 47: 1503-1513. Filipiak M., G. Tylko, W. Kilarski (2012) Flow cytometric determination of genome size in European sunebleak Leucaspius delineates (Heckel, 1843). Fish Physiol Biochem, 38 (2): 355-362. Górska-Andrzejak J., R. Makuch, J. Stefan, A. Görlich, D. Semik, E. Pyza (2013): Circadian expression of the presynaptic active zone protein Bruchpilot in the lamina of Drosophila melanogaster. Developmental Neurobiology, 73:14-26. Filipiak M., G. Tylko, E. Pyza (2012): Zinc induces caspase-dependent mitochondrial pathway of the programmed cel death in haemocytes of Drosophila melanogaster. Biomaterials 25: 507-516.

50 µm BMP

anti-pSmad1,5,8

anti-Smad1

adeno-Smad1control empty wtmutated

- + - + - + - +

0.9 1.2 3.2 2.5fold change pSmad/Smad

BMP vs. untreated

BMP

anti-pSmad1,5,8

anti-Smad1

adeno-Smad1control empty wtmutated

- + - + - + - +

0.9 1.2 3.2 2.5fold change pSmad/Smad

BMP vs. untreated TCP matrix

polymer insulin

TCP matrix

polymer insulin

Zakład Biologii Rozwoju

i Morfologii Bezkręgowców

Zróżnicowana tematyka badawcza

Obecnie realizowane prace magisterskie (wybrane):

Przebieg oogenezy u skorka Chaetospania borneensis (Eudermaptera, Spongiphoridae):

różnicowanie komórek odżywczych i geneza oosomu

Ultrastruktura, rozmieszczenie oraz transowarialny przekaz endosymbiotycznych mikroorganizmów

u czerwców z rodziny Ortheziidae (Hemiptera, Coccinea)

Organizacja jajnika rozwielitki wielkiej, Daphnia magna (Crustacea, Branchiopoda)

Organizacja jądra oocytu jesiotra rosyjskiego, Acipenser gueldenstaedtii (Chondrostei)

Pracownicy: Prof. dr hab. Teresa Szklarzewicz (Kierownik Zakładu)

Prof. dr hab. Szczepan Biliński

Dr hab. Mariusz Jaglarz

Dr Monika Żelazowska

Dr Anna Jabłońska

Dr Anna Michalik

Dr Wacław Tworzydło

Zakład Biologii Rozwoju

i Morfologii Bezkręgowców

Współautorstwo publikacji:

Szklarzewicz T., Michalik A., Czaja A., Szydłowska S. (2010). Germ cell cluster

formation and ovariole structure in Puto albicans and Crypticerya morrilli (Insecta, Hemiptera,

Coccinea). Phylogenetic mplications. European Journal of Entomology, 107: 589- 596.

Udział w Konferencjach Naukowych:

Tworzydło W., Kisiel E., Pituch B. (2011) Structure of the germarium in the ovary of Thermobia

domestica (Hexapoda, Zygentoma). XX International Symposium of Polish network of molecular

and cellular biology: Molecular and Physiological Aspects of Processes in the Organism. Kraków

Tworzydlo W., Drozdz J., Kisiel E. (2013) The Balbiani body in the female germline cells of

Thermobia domestica (Insecta, Zygentoma). 2nd Global Conference on Entomology, Kuching,

Malezja (Borneo)

Zakład Entomologii

lokalizacja:

Instytut Zoologii UJ, III p. Sektor D

lokalizacja:

Gorce: Ochotnica Górna-Jaszcze

Zakład Entomologii

Zakład Entomologii – oferta dla studentów 1. Udział w realizowanych projektach badawczych Zakładu;

badania prowadzone są na: chrząszczach, niesporczakach i roztoczach w zakresie: bioróżnorodności, faunistyki (fauna Polski, w szczególności obszary górskie, monitoring faunistyczny); ekologii, biogeografii, ochrona przyrody, taksonomii, filogenezy, filogeografii, ewolucji, kariologii i analiz molekularnych.

2. Wykonywanie własnych projektów w ramach dostępnych

w laboratorium modeli zwierzęcych i sprzętu badawczego.

Pracownia Malakologii

Tematy prac magisterskich: Makro- i mikroewolucja na poziomie

morfologicznym i molekularnym, morfologia i filogeneza ślimaków i

małży; możliwe też tematy z zakresu faunistyki i ekologii mięczaków.

Seminaria: Malakologia ewolucyjna, metody numeryczne w taksonomii

filogenetycznej i fenetycznej, taksonomia molekularna.

Zakład Immunologii Ewolucyjnej

PRACOWNICY Prof. dr hab. Barbara Płytycz, barbara.plytycz@uj.edu.pl Dr hab. Magdalena Chadzińska (kierownik Zakładu), magdalena.chadzinska@uj.edu.pl Dr hab. Elżbieta Kołaczkowska, ela.kolaczkowska@uj.edu.pl Dr Joanna Homa, joanna.homa@uj.edu.pl

Tylko w ostatnich 5 latach magistranci ZIE: •Obronili z sukcesem 40 prac magisterskich •Byli wykonawcami w 4 projektach badawczych NCN, EU •Byli współautorami 16 oryginalnych prac naukowo-badawczych opublikowanych w czasopismach z tzw. Listy Filadelfijskiej, 6 prac popularno-naukowych i 45 doniesień konferencyjnych

Nasi magistranci badali między innymi: •Proces aktywacji układu profenoloksydazy u dżdżownic

•Wpływ chemokin CXC i interferonu gamma na aktywność granulocytów karpia

•Wpływ RAGE i stabiliny-1 na produkcję MMP-9 i MMP-2 podczas zapalenia jamy otrzewnej myszy

Zakład Immunologii Ewolucyjnej

PATO G EN Y

•EWOLUCJA ODPORNOŚCI •ODPORNOŚĆ WRODZONA/ZAPALENIE/SEPSA

•POWIĄZANIA MIĘDZY UKŁADEM NEUROENDOKRYNNYM A

ODPORNOŚCIOWYM

BADANIA IN VITRO

BADANIA IN VIVO

Zakład Genetyki i Ewolucjonizmu

1. Genetyczna kontrola jakości gamet, a szczególnie rola chromosomu Y

w spermatogenezie i płodności samców ssaków

2. Analiza zwierzęcych modeli chorób metabolicznych

u człowieka

3. Kontrola cyklu komórkowego oraz epigenetyczne

modyfikacje chromatyny w oocytach myszy

Zakład Neuroanatomii

Zakład Neuroanatomii

Zakład Neuroanatomii

Zakład Endokrynologii

PRACOWNICY Prof. dr hab. Barbara Bilińska (kierownik Zakładu), barbara.bilinska@uj.edu.pl

Prof. dr hab. Maria Słomczyńska, maria.slomczynska@uj.edu.pl

Dr hab. Jerzy Galas, jerzy.galas@uj.edu.pl

Dr hab. Małgorzata Duda, maja.duda@uj.edu.pl

Dr hab. Małgorzata Kotula-Balak, malgorzata.kotula-balak@uj.edu.pl

Dr Anna Hejmej, anna.hejmej@uj.edu.pl

Dr Katarzyna Knapczyk-Stwora, katarzyna.knapczyk@uj.edu.pl

Zakład Endokrynologii

Rola androgenów w regulacji ekspresji genów budujących połączenia

międzykomórkowe w gonadzie męskiej, najądrzu i prostacie knura i szczura

Molekularne podstawy rozwoju jajnika świni po zastosowaniu

anty-androgenów (także środowiskowych) w okresie życia płodowego

(model in vivo i in vitro);

Opracowanie nowego systemu izolacji i hodowli pęcherzyków

jajnikowych pierwotnych i pierwszorzędowych pozwalającego uzyskiwać oocyty

wysokiej jakości;

Regulacja czynności pęcherzyka jajnikowego i funkcją wzgórka

jajonośnego szczurów;

Rola fotoperiodu w regulacji funkcjonowania komórek jajnikowych

nornicy rudej;

Molekularne podłoże zaburzeń męskiego układu rozrodczego w wyniku

działania czynników estrogennych i anty-androgennych;

Rola estrogenów w regulacji spermatogenezy.

Zakład Endokrynologii

Tylko w ostatnich 5 latach nasi magistranci Zakładu: •Obronili z sukcesem 47 prac magisterskich •Byli uczestnikami programu ERASMUS •Byli wykonawcami w 2 projektach badawczych NCN •Byli współautorami 11 oryginalnych prac naukowo-badawczych i 20 doniesień konferencyjnych

Zakład Hematologii Eksperymentalnej

Funkcjonowanie komórek hematopoetycznych w warunkach fizjologicznych, patologicznych

i pod wpływem działania czynników cytotoksycznych

Badania in vitro Badania in vivo

Zakład Hematologii Eksperymentalnej

- Kompleksowa analiza programowanej śmierci komórki - autofagii, apoptozy, nekrozy,

starzenia się komórki, różnicowania, katastrofy mitotycznej i cyklu komórkowego w warunkach

in vitro i in vivo

- Określenie zależności pomiędzy procesami zachodzącymi na poziomie komórkowym,

biochemicznym i molekularnym pod wpływem działania związków o potencjalnych

właściwościach przeciwnowotworowych

- Analiza ekspresji genów zaangażowanych w odpowiedź patologicznych i prawidłowych

komórek hematopoetycznych na testowane związki o potencjalnej aktywności

przeciwnowotworowej

- Określenie strategii unicestwiania komórek patologicznych poprzez indukowanie określonego

typu śmierci komórkowej, katastrofy mitotycznej, różnicowania czy starzenia się komórki

- Określenie odpowiedzi prawidłowych komórek hematopoetycznych na działanie testowanych

czynników cytotoksycznych

- Selekcjonowanie testowanych związków wykazujących wysoką aktywność

przeciwleukemiczną i ograniczone do minimum niepożadane działanie na prawidłowe komórki

hematopoetyczne

Tematyka badań realizowanych w Zakładzie Hematologii Eksperymentalnej:

Zakład Biochemii Glikokoniugatów

Zespół : dr hab. Małgorzata Przybyło

dr hab. Dorota Hoja-Łukowicz

dr Ewa Pocheć

dr Marcelina Janik

dr Monika Bubka

kierownik Zakładu: prof. dr hab. Anna Lityńska

Tematyka badawcza:

• Badanie struktury i zmienności glikoprotein

• Badanie funkcja glikanów w komórkach prawidłowych

i zmienionych patologicznie

• Znaczenie glikozylacji adhezyjnych białek w progresji

nowotworowej badanej poprzez zdolności adhezyjne, migracyjne

i inwazyjne.

Zakład Biochemii Glikokoniugatów

Stosowane metody:

• hodowle komórkowe

• izolacja białek

• rozdział elektroforetyczny, Western blot, identyfikacja

białek

• qRT-PCR, wyciszanie i nadekspresja genów

• testy funkcjonalne (adhezja, migracja, inwazja, transmigracja)

• analiza struktur oligosacharydowych przy użyciu lektyn i metodą

spektroskopii mas

• badanie ekspresji antygenów powierzchniowych metoda cytometrii

przepływowej

• badanie apoptozy metoda cytometrii przepływowej

• badanie aktywności metaloproteinaz (zymografia)

• immunohistochemia

Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu

PRACOWNICY Kierownik: Prof. dr hab. E. Gregoraszczuk Dr hab. A. Ptak Dr A. Rak-Mardyła Dr P. Kwiecińska

WSPÓŁPRACA:

Zakład Chemii Analitycznej, Politechnika Krakowska

Klinika Endokrynologii Ginekologicznej , Collegium Medicum UJ

Zakład Patomorfologii, Centrum Onkologii im M Skłodowskiej Curie

Instytut Ochrony Środowiska i Zdrowia Publicznego,

Uniwersytet Gdański

Zakład Neurologii, Szpital Uniwersytecki, Oslo, Norwegia

DOKTORANCI Mgr A. Karpeta Mgr J. Barć Mgr A. Wróbel Mgr E. Fiedor

http://www.zftr.binoz.uj.edu.pl/

Zakład Fizjologii i Toksykologii Rozrodu

http://www.zftr.binoz.uj.edu.pl/

Tematyka badań:

działaniem hormonów metabolicznych: leptyna, grelina, rezystyna ,

adiponektyna, visfatyna ,apelina, chimeryna.

potencjalne leki anty-nowotorowe

toksykologii rozrodu – wpływu polibromowane dibenzoetery ( PBDE),

bisphenol A (BPA), polichlorowane naftaleny (PCN), benzopiren (BaP) ,

parabeny , benzopiren jako czynników zaburzających funkcje endokrynne

Stosowane metody badawcze: • oznaczanie proliferacji komórek (test Alamar Blue, wbudowanie

bromodezoksyurydyny - BrdU)

• określenie stopnia żywotności komórek (błękit trypanu, test LDH, XTT, PAC)

• badanie procesu apoptozy (fluorometryczne oznaczanie aktywności kaspaz: 3, 8 i 9; fragmentacja DNA, barwienie komórek apoptotycznych – TUNEL)

• fluorometryczne oznaczanie aktywności enzymów detoksykacyjnych (CYP1A1 - EROD, CYP1A2 - MROD, CYP2B - PROD)

• Western Blot

• ELISA

• real-time PCR

Zakład Neurofizjologii Chronobiologii

W Zakładzie prowadzone są badania na temat mechanizmu działania zegara

biologicznego, komórkowych mechanizmów modyfikacji przekaźnictwa

synaptycznego oraz badania behawioralne nad lękiem, depresją i mechanizmami

pamięci

Zakład Neurofizjologii Chronobiologii

Tematyka prac magisterskich:

Instytut Zoologii

Podsumowanie:

Warsztaty Biologii Ewolucyjnej

Zjazdy

Ornitologów

10th Congress of European Society for Evolutionary Biology

Rok dla ekologii i zdrowego stylu zycia

Projekt MacMan

Projekt SCALES

• Badania naukowe na światowym poziomie o

różnorodnej tematyce

• międzynarodowe projekty badawcze w ramach

programów wymiany SOCRATES - ERASMUS,

CEEPUS

• projekty badawcze (krajowe i międzynarodowe)

• zjazdy, konferencje i warsztaty naukowe

• współautorstwo w publikacjach naukowych

• Festiwal Nauki, Noc Biologów, Noc Naukowców