Litteratursøgning i sundhedsvidenskab - med udgangspunkt i PubMed Metoder og rutiner til hurtige enkle søgninger og 'tunge' systematiske søgninger Bonkolab RH - 3. maj 2016

Formiddagens fokuspunkter

• PICO-metode og kliniske spørgsmål • Søgeteknik - strengsøgning og trunkering • Kombinatorik • Funktionen Seach Details i PubMed • Afgrænsning - benytte filtre • MeSH-termer • Dokumentation og opdatering - NCBI • Funktionen Clinical Queries i PubMed

PICO-metoden

• Stammer fra epidemiologi og evidensbaseret praksis

• Teknik til at indkredse og besvare et klinisk spørgsmål

• Standardmetode inden for sundhedsvidenskab til at strukturere litteratur-søgninger ▫ Anvendes bl.a. ved Cochrane reviews

PICO-metoden P = Population Befolknings- eller patientgruppe som er

genstand for studiet I = Intervention Interventionen, eksponering eller tiltag C = Comparison Alternativ handling eller intervention O = Outcome Effektmål - patientrelevante konsekvenser S = Study design Relevant type af studie - f.eks. RCT

• Wikipedia contributors. PICO process. Wikipedia, The Free Encyclopedia; 2010 - [opdateret 19. maj. 2014; citeret 29. okt. 2014]. Available from: https://en.wikipedia.org/wiki/PICO_process

• Hastings C, Fisher CA. Searching for proof: creating and using an actionable PICO question. Nurs Manage 2014;45(8):9-12. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25058529

PICO - forbehold ”It is usually unnecessary, and even undesirable, to search on every aspect of the review’s clinical question (often referred to as PICO - that is Patient (or Participant or Population), Intervention, Comparison and Outcome). Although a research question may address particular populations, settings or outcomes, these concepts may not be well described in the title or abstract of an article and are often not well indexed with controlled vocabulary terms. They generally, therefore, do not lend themselves well to searching. In general databases, such as MEDLINE, a search strategy to identify studies for a Cochrane review will typically have three sets of terms: (1) terms to search for the health condition of interest, i.e. the population; (2) terms to search for the intervention(s) evaluated; and (3) terms to search for the types of study design to be included.” (6.4.2 Structure of a search strategy)

• Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions. Version 5.1.0, last edited 20 March 2011.

http://handbook.cochrane.org/chapter_6/6_4_2_structure_of_a_search_strategy.htm

PICO - anbefalinger

• Bemærk at ikke alle det kliniske spørgsmåls delelementer nødvendigvis skal udtrykkes i søgeprofilen (Cochrane håndbogens forbehold)

• Identificer de mest essentielle elementer i emnet, typisk dem der relaterer sig til P og I

• Anvendes som en hjælp til at udforme en søgeprofil,

mere end som en absolut skabelon for en søgeprofil

PICO – kliniske spørgsmål

• Bredt formuleret klinisk spørgsmål ▫ Hvilken betydning har motion for patienter med

diabetes, sammenlignet med fysisk inaktivitet/ingen motion?

Helle Skovbakke. Formulering af det gode kliniske spørgsmål. UC Syddanmark, 2011.

• Eksakt formuleret klinisk spørgsmål ▫ Hvilken evidens er der for, at målrettet information om

delirium i forhold til ingen information reducerer følelsesmæssig belastning hos pårørende til palliative kræftpatienter?

Maiken Bang Hansen. Hvad vil det sige at udarbejde en klinisk retningslinje? Bispebjerg Hospital, 2012.

PICO i praksis Vil kræftpatienter i kemoterapi (P) som gennemgår et fysisk træningsprogram (I) opleve en forbedring af livskvalitet (O) sammenlignet med ingen intervention (C) Hovedelementerne identificeres: I Kræftpatienter P II Under behandling III Fysisk træning I - - C IV Livskvalitet O

Øvelse 1

• Opstil en PICO ud fra spørgsmålet:

Er der evidens for, at målrettet information om

delirium i forhold til ingen information reducerer følelsesmæssig belastning hos pårørende til palliative kræftpatienter?

• 10 min. - grupper

Simpel emnesøgning

I Cancer P II Undergoing chemoterapy III Exercise I IV Quality of life O

Udbygget emnesøgning

I Cancer P Oncology II During treatment Undergoing chemoterapy III Exercise I Physical activity program IV Quality of life O Life quality

Strengsøgning i PubMed …. finde ord i kontekst

• Angiver at to eller flere ord skal bindes sammen således at

søgningen kun giver træf hvis ordene står i kontekst. I PubMed anvendes anførselstegn

• Eksempel: "Undergoing chemotherapy"

▫ Uden anførselstegn = 52.275 ▫ Med anførselstegn = 2.215 (02-05-2016)

Trunkering - søgning på ordstamme

• Finder alle ord som begynder eller ender med de tegn, der står før/efter trunkeringstegnet (i PubMed: *) ▫ Søgning på Oncolog* finder: Oncologic Oncological

Oncology Bruges typisk til at søge både entals- og flertalsformer

Ved brug i sætninger bør feltkode anvendes Eksempel: Patients perspective*[all]

Emnesøgning gjort mere operationel

I Cancer P Oncolog* II "During treatment" "Undergoing chemotherapy" III Exercise I Physical activity program*[all] IV "Quality of life" O "Life Quality"

Kombinatorik – boolske operatorer

Operatoren OR

• Anvendes til at kombinere synonymer og beslægtede termer (inden for en emneblok)

• Gør bredere / udvider søgningen • Finder referencer med enhver af de anvendte

søgetermer

Eksempel: glucosamine OR 2-amino-2-deoxyglucose

Kombinatorik – boolske operatorer

Operatoren AND

• Anvendes til at kombinere søgeaspekterne (emneblokke)

• Indsnævner / fokuserer søgningen • Finder referencer med alle de anvendte

søgetermer

Eksempel: glucosamine AND osteoarthritis

Kombinatorik – boolske operatorer

Operatoren NOT

• Anvendes til at ekskludere irelevante aspekter • Afgrænser søgningen • Fravælger netop de referencer der indeholder

uønskede søgetermer

Eksempel: (glucosamine AND osteoarthritis) NOT hip

Søgeprofil i matrix-form

P I O

I II III IV

Cancer Oncolog*

"During treatment" "Undergoing chemotherapy"

Exercise Physical activity program*[all]

"Quality of life" “Life quality"

OR

OR

OR

AND AND AND

• Øges antallet af synonymer og nært beslægtede termer inden for hver emneblok, øges også størrelsen af søgesættet • Øges antallet af emneblokke, falder størrelsen af søgesættet

Færdigt søgeudtryk

(Cancer OR Oncolog*) AND ("During treatment" OR "Undergoing chemotherapy") AND (Exercise OR Physical activity program*[all]) AND ("Quality of life" OR "Life Quality")

Træf af søgeord - eksempel Cancer Nurs. 2014 Mar-Apr;37(2):E21-9. doi: 10.1097/NCC.0b013e3182791097. Comparison of the effects of a supervised exercise program and usual care in patients with colorectal cancer undergoing chemotherapy. Lin KY1, Shun SC, Lai YH, Liang JT, Tsauo JY. Abstract BACKGROUND: Although exercise has been addressed as a promising therapy for cancer adverse effects, few studies have evaluated the beneficial effects of exercise for colorectal cancer (CRC) patients during chemotherapy. OBJECTIVE: The purpose of this study was to compare the effects of supervised-exercise intervention with those of usual care on cardiorespiratory fitness, muscle strength, fatigue, emotional distress, sleep quality, and quality of life (QoL) in patients with CRC undergoing chemotherapy. METHODS: Patients with stage II or III CRC admitted for adjuvant chemotherapy were allocated to either a supervised-exercise group that received a combined aerobic and resistance exercise program or a "usual care" control group for 12 weeks. The outcomes, QoL, muscle strength, cardiorespiratory fitness, emotional distress, physical activity, fatigue, and sleep quality, were assessed at baseline and after intervention. RESULTS: Significant interactions between intervention and time were observed for the role functioning and pain subscales of QoL and physical activity level. The time main effects were significant for the secondary outcomes: hand-grip strength, cardiorespiratory fitness, physical activity level, and physical functioning, role functioning, social functioning, fatigue, and pain subscales of QoL. CONCLUSION: Compared with usual care, the supervised exercise demonstrated larger effects than usual care on physical activity level and role functioning and pain subscales of QoL. IMPLICATIONS FOR PRACTICE: Supervised-exercise program is suggested to be incorporated as part of supportive care to promote the cardiorespiratory fitness, muscle strength, physical activity level, and QoL of patients with CRC undergoing chemotherapy.

Afgrænsninger - filtre

• Mulighed i PubMed for at sætte filtre på en

søgning

• Typiske afgrænsninger ▫ Article types - f.eks. Review ▫ Publication dates - f.eks. 10 years ▫ Ages - Adult: 19+ years

Øvelse 2 • Afgræns søgning: "Bed rest" AND (Consequence* OR Complication*)

▫ Artikeltypen Review ▫ Tidsrummet 2000-2015 ▫ Sproget engelsk ▫ Aldersgruppen 65 og ældre

• 10 min. - grupper

MeSH = Medical Subject Headings

• MeSH er emneord som føjes til de fleste af PubMed’s referencer (knapt 90%)

• Artikler som indekseres, forsynes med typisk 10-20 emneord som beskriver indholdet

• Helt nye PubMed-referencer er typisk ikke færdigindekserede med MeSH-termer

• MeSH er ikke det samme som ’Keywords’, der er forfatternes egne emneord (søges som ’Other terms’)

Hvorfor anvende MeSH?

• Titel, strukturede abstracts og forfatternes

keywords er ikke altid tilstrækkeligt til at beskrive en artikels emne(r) udtømmende

• MeSH-termer kan: ▫ Sikre præcision ved emnesøgninger ▫ Give automatisk dækning af underaspekter i kraft

af træstrukturen

Øvelse 3

• Find egnede MH-termer til søgning på emnet:

Rehabiltering af sportsskader hos midaldrende • 10 min. - grupper

Maksimal genfinding vs præscision • Maksimal genfinding ▫ en søgeprofils evne til at finde mest muligt af den

relevante litteratur

• Præcision ▫ en søgeprofils evne til at fravælge mest muligt af den

irrelevante litteratur

• Optimering af maksimal genfinding vil typisk ske på bekostning af præcisionen - og omvendt

Maksimal genfinding - PubMed • Prioritering af maksimal genfinding

▫ 2-3 emneblokke

▫ Ikke feltspecifik søgnings (fritekst) " " ▫ Søgning i alle metadata [all] ▫ Søgning i alle metadata med tekst [tw]

Præcision - PubMed

• Prioritering af præcision ▫ 3-5 emneblokke

▫ MeSH termer [mh] ▫ Forfatternes egne keywords [ot] ▫ Titelsøgning [ti]

Dokumentation og opdatering

• Brugerkonto i PubMed ▫ NCBI

• Søgeprotokol ▫ Dato ▫ Databaser ▫ Søgeord (søgeprofil) ▫ Afgrænsninger ▫ Antal fundne referencer

Øvelse 4

• Opret en NCBI-konto og gem en søgning

…. har du allerede en NCBI, så hjælp en

medkursist som ikke har NB: Adgang med Google-login kan benyttes • 10 min. - grupper

PubMed Clinical Queries

• Clinical Study Categories ▫ Værktøj til filtrering af søgeprofil efter type

af klinisk spørgsmål ▫ Kan evt. bruges som en point-of-care

ressource

Typer af kliniske spørgsmål

• Therapy: Questions of treatment in order to achieve some outcome. May include drugs, surgical intervention, change in diet, counseling, etc.

• Diagnosis: Questions of identification of a disorder in a patient presenting with specific symptoms

• Prognosis: Questions of progression of a disease or likelihood of a disease occurring

• Etiology/Harm: Questions of negative impact from an intervention or other exposure

Type of Clinical Question and Study Design

http://guides.dml.georgetown.edu/ebm/ebmclinicalquestions Fineout-Overholt E, Johnston L. Teaching EBP: asking searchable, answerable clinical questions. Worldviews Evid Based Nurs. 2005;2(3):157-60.

Arbejdsgangen i litteratursøgning

• Formulering af klinisk spørgsmål • Valg af relevante databaser • Strukturering med PICO - Aspektanalyse • Opslag i emneordsfortegnelser (thesauri) - f.eks. MeSH • Analyser af simple brede søgninger - høst af emneord • Opbygning af en dækkende søgeprofil • Udføre søgningen • Overveje afgrænsninger (filtre) - sprog, tid,

litteraturtype, etc. • Revision af søgeprofil • Dokumentation - søgningen skal kunne reproduceres,

f.eks. med senere opdatering for øje

Alternativ til PICO: SPIDER

Sample Phenomenon of Interest Design Evaluation Research type • Anvendes ved søgning på kvalitativ litteratur

SPIDER – alternativ til PICO

Cooke A, Smith D, Booth A. Beyond PICO: the SPIDER tool for qualitative evidence synthesis. Qual Health Res 2012;22(10):1435-43.

Andre søgeressourcer end PubMed

• Sundhedsvidenskabelige bibliografiske

databaser der supplerer PubMed

• Overblik: KUB Nord: Sundhedsvidenskab - fagsider: http://kub.kb.dk/kubnord/sundhed

PubMed som app

• PubMed via smartphone / tablet - Android / iOS

PubMed4Hh https://itunes.apple.com/us/app/pubmed4hh/i

d544354407