42
Laboratoriediagnostik av svampinfektioner Erja Chryssanthou

Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Laboratoriediagnostik av svampinfektioner

Erja Chryssanthou

Page 2: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

JästUnicellulära

Knoppande jästceller (blastosporer)

Foto Dan Eshel

Page 3: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Pseudohyf, förlängda jästceller som bildar kedjor, förökning genom unipolar knoppning

Page 4: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Candida albicans äkta hyfer•

Bildas i närvaro av

serum• Växer apikalt• Liknar mögelhyfer:

•Aspergillus och Penicillium•

Hjälper C. albicans att

fästa och penetrera värdceller

Page 5: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Trådsvampar (mögel, dermatofyter)Multicellulära

Septerade hyferSepta med porerAspergillus, Fusarium, dermatofytarter

Osepterade hyferzygomyceter: Absidia, Rhizomucor, Rhizopus, Mucor arter

Page 6: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Svampar•

Karakteristisk livscykel

Olika morfologiska former•

Växling mellan sexuell och asexuell förökning

Den sexuellt förökande svampen kallas teleomorf•

Den asexuella anamorf

En del har flera olika typer av anamorfer (=synamorf)•

T.ex Pseudoallescheria boydii (teleomorf)

Synanamorf Scedosporium apiospermum och Graphium eumorphum

Page 7: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Taxonomi•

Minst 100 000 olika svampar

397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog)

Heterotrofiska eukaryota

Nomenklatur•

Hierarkisk indelning

Division :-mycota•

Klass

:-mycetes

Order :-ales

Familj :-acea

Genus•

Species

Page 8: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Kliniskt viktiga grupper•

Fungi (svamp) Eumycota

Äkta svampar•

Division

Zygomycota (släkten Rhizopus, Mucor, Rhizomucor, Absidia)

Ascomycota (släkten Aspergillus, Fusarium, Candida, dimorfa svampar, dermatofyter)

Basidiomycota (släkten Cryptococcus, Trichosporon, Malassezia)

Page 9: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Laboratoriediagnostik

Mikroskopi •Direktpåvisning av svampstrukturer i provmaterial

• Fluorescensmikroskopi känsligare än vanlig ljus•

Fluorescerande färg binder till β-glucan i cellväggen

Blankofor, calcofluor white

Page 10: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Foto D. Denning

Page 11: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Nyttan med mikroskopi

• Snabb metod, invasiv infektion

• Skilja jästsvamp från Aspergillus och zygomyceter•

Jästceller + pseudohyfer

Septerade hyfer med dikotoma (45 gr) förgreningar•

Aspergillus, Fusarium och Scedosporium liknar varandra

Breda osepterade ”bandliknande”

hyfer hos zygomyceter

Kan vara svårt• Odling för zygomyceter kan vara negativ

Page 12: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Jästceller

Page 13: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Aspergillus hyfer

Page 14: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Zygomycet

hyfer

Page 15: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

MikroskopiDiagnostisk för vissa dimorfa (endemiska) svampar

Coccidioides immitis sferula•

Små

Histoplasma capsulatum jästceller i

magrofager

Page 16: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Histologisk undersökning

Påvisande av svampstrukturer i vävnadsnitt

• Periodic acid schiff

(PAS)•Bakgrundens cellstruktur (t. ex hyfer i blodådra)

Silverfärgning (Grocott’s Methenamine

Silver)

•Känsligare

Jäst

Aspergillus

Page 17: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Immunohistokemi

Henrik Jensen (Avd för Veterinär

Patobiologi, Köpenhamns Universitet)

Specifika antikroppar mot

Candida, Aspergillus, Fusarium och

Rhizopus

Page 18: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

© H.E. Jensen

Page 19: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

© H.E. Jensen

Aspergillus

Page 20: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Odling

Page 21: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Odling

Blododling•

Okänslig markör för

invasiv

svampinfektion•

Bättre system idag

BacT/Alert System (bioMérieux)

Bactec

System (BD)–

Mycosis

IC/F medium för svamp

Likvärdiga system men Mycosis

flaskan upptäcker flera fall av blandinfektion med jäst+bakterier

Page 22: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Odling

• 401 svenska

candidemifall

05-0660.6 % C. albicans20.2 % C. glabrata9.0 % C. parapsilosis3.7 % C. dubliniensis2.0 % C. tropicalis2.0 % C. lusitaniae1.2 % C. krusei1.0 % andra arter

Page 23: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Fördelning efter klinik på 304 candidemier 1997- juni 2009 vid Karolinska, Solna

122; 41%

82; 27%

43; 14% 18; 6%16; 5%

8; 3%7; 2%

7; 2%1; 0%

IVA

Barn+neonatal+neoiva

Kirurgi

Infektion

Medicin

Urologi

Hematologi+onkologi

Geriatri

Öron

Page 24: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Övervakningsodlingar

Koloniseringsindex•

Antal koloniserade områden/

provtagna

områden

>0.5•

Vilka patienter ska

provtas?

ECMO, brännskade-, hematologiska patienter

Page 25: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Isolering och

artidentifiering

viktigt

Olika svampar olikakänslighet för

antimykotika

C. albicans känsligC. glabrata nedsatt känslighetför

flukonazol,

itrakonazol

och ofta

för

vorikonazol

Zygomyceter

naturligt resistenta motvorikonazol

och

echinocandiner

Cryptococcus, Fusarium,Trichosporon naturligt resistentamot

echinocandiner

Page 26: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Serologisk diagnostikImmunoelektroosmofores

(IEOP)

Page 27: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Antikroppsbestämning

Aspergillus IgG•

Aspergilloma

CF-patienter

Page 28: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Antikroppsbestämning

Endemiska svampar•

Histoplasma,

Coccidioides,

Blastomyces,

Paracoccidioides•

IgG

2-6 v

Känslighet ca 80%•

Korsreaktioner

Antigentest

för

Histoplasma,

Coccidioides,

Blastomyces (www.miravistalabs.com)

Serum/plasma, BAL,

likvor, urin

Page 29: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Galactofuranos-antigenerSvampens cellvägg

Galactomannan•

Utsöndras vid

hyfväxt

Polysackarid•

Platelia Aspergillus

ELISA (Bio-Rad)

FDA godkänd•

EORTC/MSG

fungal

definitions consensus

guidelines:

sannolik IFI diagnos•

1,3-β-D-glucan

4 kommersiella

testkit•

Fungitell

test (Cape

Cod)

EORTC sannolik IFI diagnos–

FDA godkänd 2003

Page 30: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Aspergillus

cellvägg

Galactomannan

Page 31: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Galactomannan

antigen

Aspergillus

Double

sandwich enzym

immunoassay

Ett indexvärde•

Provets optisk densitet delas med

kitberoende

”tröskel”

serum•

Serum och

likvor

(gräns för positivt resultat ≥

0,5),

bal (≥

1,0)

Page 32: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Aspergillus

antigen ELISA

Neg kontroll

Positivt prov

Tröskel kontroll

Poskontroll

Page 33: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Galactomannan

Falskt positiva test•

GM eller molekyler som reagerar med EIA antikroppen

Vissa andra svampar I mat, mjölk, Plasmalyte för Bal•

Bifidobacterium spp. korsreaktiva

epitoper

Mukosit

i mag-tarmkanalen•

B-lactam

antibiotika

Piperacillin-tazobactam,

amoxicillin-clavulansyra–

Semisyntetiska från

Penicillium

Falskt negativa test•

Anti-aspergillus

antikroppar

Profylax eller empirisk behandling med

antimykotika

Page 34: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Galactomannan

Högt negativt prediktivt värde (98,5%) (Maertens2007)

Hög specificitet (>95%)

Surrogat markör för behandlingseffekt•

Flera studier, sjunkande antigennivåer vid positiv behandlingseffekt

Upprepad screening med lung-CT och GM•

Mindre empirisk behandling (Maertens

2005)

Page 35: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

GalactomannanScreening av serum för tidig detektion av invasiv

aspergillos hos neutropena ell. stamcellstransplanteradepatienter

Hur bra är det för icke-hematologiska patienter?

Analys av balKänslig metod för hematologiska och icke-hematologiska patienter (organtransplanterade, ICU, AIDS)Högt positivt prediktivt värdeKonfirmerande diagnostisk test under pågående sjukdom

Page 36: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

1-3-beta-D-Glucan

antigen

• Candida, Aspergillus, Fusarium, Pneumocystis

• Ej hos

zygomyceter

• Låga nivåer

Cryptococcus

• Serum

Page 37: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

β-glucan

En

proteas-zymogen-baserad kolorimetrisk

kinetisk analys

Page 38: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

β-glucan• Varierande känslighet i olika studier

• Högt negativt prediktivt värde

• Begränsningar•

Data för nyfödda och spädbarn <6 mån saknas

• Falskt positiva testresultat•

Glukaninnehållande

gasväv

Hemodialyspatienter•

Antibiotika med svampursprung (piperacillin)

Albumin och immunoglobuliner•

β-glucan

reaktivitet hos P. aeruginosa, A. faecalis, S.

pneumoniae

Page 39: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Cryptococcus

Antigen påvisning

Likvor, serum, urin

Latex test•

Kommersiell

Mycket känsligEIA test

Samma känslighetsom agglutination

Page 40: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

Molekylär diagnostik

rDNA

av

Aspergillus target

för PCR

Page 41: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

PCR•

PCR ingår inte i EORTC definition av sannolik IFI diagnos

Standardisering av metodik behövs•

In house

kommersiella metoder•

Europeisk initiativ ISHAM:

Olika PCR metoder•

Detektion ok

DNA extraktion fungerar sämre

Page 42: Laboratoriediagnostik av svampinfektioner–rebro läns landsting... · 397 arter i Atlas of Clinical Fungi (de Hoog) ... Hematologi+onkologi Geriatri Öron. Övervakningsodlingar

PCR

Kvarvarande frågor:•

Optimal provmaterial

Serum/plasma: fritt DNA•

Helblod: cell-associerad DNA

Huddinge analyserar både plasma och cellfraktion•

Likvor: både fritt och cell-ass. DNA

Biopsier (färska prov)•

Bal: fördel att svamp (jäst,

conidia ell. hyfer) finns

Kinetik av

Aspergillus DNAemia

i blodet•

Tidpunkt för provtagning