Kompjuterska predikcija post-translacionih modifikacija proteina HIF-1 alfa Mini esej Miloš Diklić, dipl. biohem. Hipoksija inducibilni faktor 1 je heterodimer koji se eksprimira kod svih aerobnih organizama. Visoko konzervirani transkripcioni faktor je sačinjen od dve subjedinice, HIF-1 α i HIF-1 β. HIF-1 α subjedinicu kodira HIF1A gen i javlja se u vidu dva alternativna transkripta. Količina i aktivnost ovog proteina su regulisani na NF-κB zavisan način. Protein je glavni transkripcioni regulator adaptivnog odgovora na hipoksiju. Pod hipoksičnim uslovima aktivira transkripciju preko 40 gena. Igra važnu ulogu u vaskularizaciji, angiogenezi tumora i patofiziologiji ishemijskuh procesa. Podleže većem broju posttranslacionih modifikacija koje su značajne za funkciju proteina. U normoksiji podleže hidroksilaciji na Pro-402 i Pro-564. Hidroksilacija prolina promoviše interakciju sa VHL, inicirajući brzu ubikvitinaciju i proteazomalnu degradaciju. U normoksiji se takođe hidroksiluje Asn-803, što sprečava interakciju sa CREBP i aktivaciju transkripcije. S-nitrozilacija Cys-800 je značajna za regrutovanje p300 koaktivatora neophodnog za transkripcionu aktivnost. N-terminus – a bHLH domain for DNA binding central region – Per-ARNT-Sim (PAS) domain which facilitates heterodimerization C-terminus – recruits transcriptional coregulatory proteins
Hipoksija inducibilni faktor 1 je heterodimer koji se eksprimira
kod svih aerobnih organizama. Visoko konzervirani transkripcioni
faktor je sainjen od dve subjedinice, HIF-1 i HIF-1 . HIF-1
subjedinicu kodira HIF1A gen i javlja se u vidu dva alternativna
transkripta. Koliina i aktivnost ovog proteina su regulisani na
NF-B zavisan nain. Protein je glavni transkripcioni regulator
adaptivnog odgovora na hipoksiju. Pod hipoksinim uslovima aktivira
transkripciju preko 40 gena. Igra vanu ulogu u vaskularizaciji,
angiogenezi tumora i patofiziologiji ishemijskuh procesa.Podlee
veem broju posttranslacionih modifikacija koje su znaajne za
funkciju proteina. U normoksiji podlee hidroksilaciji na Pro-402 i
Pro-564. Hidroksilacija prolina promovie interakciju sa VHL,
inicirajui brzu ubikvitinaciju i proteazomalnu degradaciju. U
normoksiji se takoe hidroksiluje Asn-803, to spreava interakciju sa
CREBP i aktivaciju transkripcije. S-nitrozilacija Cys-800 je
znaajna za regrutovanje p300 koaktivatora neophodnog za
transkripcionu aktivnost.
N-terminus a bHLH domain for DNA binding central region
Per-ARNT-Sim (PAS) domain which facilitates heterodimerization
C-terminus recruits transcriptional coregulatory proteins
