GRUPA BADAWCZA – FIZJOLOGIA BAKTERII

w Zakładzie Mikrobiologii Stosowanej

2016-2017

SKŁAD OSOBOWY ZESPÓŁ BADAWCZY

• dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW (p. 420A)

• dr Agata Krawczyk-Balska (p. 320A)

• dr Dorota Korsak (p. 326A)

DOKTORANCI

• mgr Marta Piotrowska (p. 319A)

• Mgr Rafał Ostrowski (p. 426A)

ZAJĘCIA DYDAKTYCZNE

• Fizjologia Bakterii - Fakultet

TEMATYKA BADAWCZA I. Poszukiwanie nowych celów działania dla

chemioterapeutyków w leczeniu listeriozy:

• Badanie fizjologicznej funkcji wybranych białek powierzchniowych w komórkach L.

monocytogenes

• Charakterystyka hydrolaz mureiny L.monocytogenes (enzymów hydrolizujących wiązania w mureinie bakteryjnej ściany komórkowej), ich specyficzność substratowa oraz właściwości i regulacja ekspresji

• Identyfikacja genów L. monocytogenes pełniących ważną rolę w odpowiedzi na różne warunki stresowe oraz określenie udziału tych genów w procesie patogenezy i oporności na antybiotyki.

II. Mechanizmy oporności na antybiotyki i chemioterapeutyki

• Badanie występowania i mechanizmów oporności bakterii:

- bytujących w żywności (ang. food-borne bacteria), występujących w zakładach przetwórstwa spożywczego i w żywności

- żyjących w środowisku naturalnym (gleba, woda) oraz bytujących w oczyszczalniach ścieków

• Poszukiwanie nowych celów w szlakach biosyntezy mureiny dla antybiotyków

• Analiza mechanizmów regulacji ekspresji genów L. monocytogenes pełniących ważną rolę w odpowiedzi na stres oraz presję antybiotykową

• Poszukiwanie mutacji warunkujących oporność na rifampicyny, sulfonamidy i trimetoprim L. monocytogenes

TEMATYKA BADAWCZA

III. Proces bioremediacji

• Tworzenie szczepionek do bioremediacji terenów skażonych aromatycznymi związkami toksycznymi oraz metalami ciężkimi

Zadania badawcze realizowane są w ramach grantów badawczych

Stosowana metodyka:

Szeroki zakres technik mikrobiologicznych, analitycznych, fizjologicznych, biochemicznych, molekularnych i bioinformatycznych

WSPÓŁPRACA

Badania realizowane są we współpracy:

• Współpraca naukowa w ramach COST z 18 państwami UE

• dr hab. Mickael Desvaux – Instytut INRA, Francja

• dr Fiona - Biosciences and Electronic Engineering Facility, Department of Biology, NUI Maynooth, Maynooth, Co Kildare, Ireland.

• dr Isabel Henriques - Biology Department, University of Aveiro, Portugal

• prof. Hanne Ingmer and prof. Marianne Halberg Larsen, Department of Veterinary Disease Biology, University of Copenhagen, Denmark.

• prof. prof. Juan A. Ayala, Universidad de Buenos Aires, Hiszpania

• prof. M. Nguyen-Disteche - Centrum Inżynierii białek, Uniwersytet w Liege, Belgia • dr Beatrix Stessl, University of Veterinary Medicine, Vienna, Austria

Proponowane tematy prac licencjackich

• Prace teoretyczne związane z kierunkiem badań członków zespołu, a także

z przyszłym tematem pracy magisterskiej a dotyczące:

• regulacji ekspresji genów Listeria monocytogenes przy udziale małych niekodujących

RNA i znaczenia tej regulacji w procesie patogenezy i odpowiedzi na stres

• nanocząstek i ich oddziaływania na organizmy żywe (możliwa też praca praktyczna)

• białek powierzchniowych bakterii Gram-dodatnich

• Praca praktyczna polegająca na wykonaniu określonego zadania

badawczego:

- Tworzenie konstruktów genetycznych służących do nadekspresji danego białka lub

otrzymania mutantów delecyjnych

- Oddziaływanie nanocząstek na komórki bakterii patogennych dla roślin

Wybrane publikacje

1. Piotrowska M. and Popowska M. 2015. Insight into the mobilome of Aeromonas strains. Frontiers in Microbiology, 6:494. doi: 10.3389/fmicb.2015.00494.

2. Mąka Ł., Maćkiw E., Ścieżyńska H., Modzelewska M., Popowska M. 2015. Resistance to sulphonamides and dissemination of sul genes among Salmonella spp. isolated from food in Poland. Foodborne Pathogens and Disease. In press. doi:10.1089/fpd.2014.1825

3. Korsak D., Maćkiw E., Rozynek E., Żyłowska M. 2015. Prevalence of Campylobacter spp., in retail chicken, turkey, pork and beef meat in Poland between 2009-2013. J.Food Protect. In press

4. Lechowicz J, Krawczyk-Balska A. 2015. An update on the transport and metabolism of iron in Listeria monocytogenes - the role of proteins involved in pathogenicity. Biometals. In press

5. Milecka D, Samluk A, Wasiak K, Krawczyk-Balska A. 2015. An essential role of a ferritin-like protein in acid stress tolerance of Listeria monocytogenes. Arch Microbiol.197:347-351

6. Krawczyk-Balska A., Korsak D, Popowska M. 2014. The surface protein Lmo1941 with LysM domain influences cell wall structure and susceptibility of Listeria monocytogenes to cephalosporins. FEMS Microbiol Lett. 357(3): 175-183.

7. Mąka Ł., Maćkiwa E., Ścieżyńska H., Pawłowska K., and Popowska M. 2013. Antimicrobial susceptibility of Salmonella strains isolated from meat products from retail in Poland between 2008 and 2012. Food Control.

8. Renier S, Chagnot C, Deschamps J, Caccia N, Szlavik J, Joyce SA, Popowska M, Hill C, Knøchel S, Briandet R, Hébraud M, Desvaux M. 2014. Inactivation of the SecA2 protein export pathway in Listeria monocytogenes promotes cell aggregation, impacts biofilm architecture and induces biofilm formation in environmental condition. Environ Microbiol. doi: 10.1111/1462-2920.12257.

9. Piotrowska M. and Popowska M. 2014. The prevalence of antibiotic resistance genes among Aeromonas species in aquatic environments. Annals of Microbiology, 64:921-934. DOI 10.1007/s13213-014-0911-2

10. Mąka Ł., Maćkiw E., Ścieżyńska H., Pawłowska K., Popowska M. 2013. Antimicrobial susceptibility of Salmonella strains isolated from retail meat products in Poland between 2008 and 2012. Food Control; 36(1):199-204

11. Cantas L., Shah SQA., Cavaco LM., Manaia C.M., Walsh F., Popowska M., Garelick H., Bürgmann H and Sørum H. 2013. A brief multi-disciplinary review on antimicrobial resistance in medicine and its linkage to the global environmental microbiota. Front. Microbiol. Praca w druku

12. Popowska M., Krawczyk-Balska A. 2013. Broad-Host-Range IncP-1 plasmids and their resistance potential. Front. Microbiol. 4:44. doi: 10.3389/fmicb.2013.00044.

13. Rożynek E., Maćkiw E., Kamińska W., Tomczuk K., Antos-Bielska M,. Dzierżanowska-Fangrat K., Korsak D. 2013. Emergence of macrolide-resistant Campylobacter strains in chicken meat in Poland and the resistance mechanisms involved. Foodborne Pathog Dis. 10(7):655-60. doi: 10.1089/fpd.2012.1333

14. Korsak D., A. Borek, S. Daniluk , A. Grabowska, K. Pappelbaum. 2012. Antimicrobial susceptibilities of Listeria monocytogenes strains isolated from food and food processing environment in Poland. Int J Food Microbiol. 158: 203–208

15. Maćkiw E., D. Korsak, K. Rzewuska, K. Tomczuk, E. Rożynek. 2012. “Antibiotic resistance in Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolated from food in Poland. Food Control 23:297-301

16. Krawczyk-Balska A., Marchlewicz J., Dudek D., Wasiak K., Samluk A. 2012. Identification of a ferritin-like protein of Listeria monocytogenes as a mediator of β-lactam tolerance and innate resistance to cephalosporins. BMC Microbiol. 12:278

17. Popowska M., Rzeczycka M., Miernik A., Krawczyk-Balska A., Walsh F., Duffy B. 2012. Influence of soil use on prevalence of tetracycline, streptomycin, and erythromycin resistance and associated resistance genes. Antimicrob. Agents Chemother. 56(3):1434-1443;

18. Popowska M., Osińska M., Rzeczkowska M. 2012. N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase (NagA) of Listeria monocytogenes EGD, an essential enzyme for the metabolism and recycling of amino sugars. Arch. Microbiol.; 194(4):255-68.

19. Krawczyk-Balska A., Popowska M. Markiewicz Z. 2012. Re-evaluation of the significance of penicillin binding protein 3 in the susceptibility of Listeria monocytogenes to beta-lactam antibiotics. BMC Microbiol. 12(1):57.

20. Popowska M., Rzeczycka M., Miernik A., Krawczyk-Balska A., Walsh F., Duffy B. 2011. Influence of soil use on prevalence of tetracycline, streptomycin, and erythromycin resistance and associated resistance genes. Antimicrob. Agents Chemother. 56(3):1434-1443; Popowska M., Miernik A,. Rzeczycka M., Łopaciuk A. 2010. The impact of environmental contamination with antibiotics on levels of resistance in soil bacteria. J Environ Qual. 39(5):1679-87.

21. Korsak D., Markiewicz Z., Gutkind GO.., Ayala J.A. 2010. Identification of the full set of Listeria monocytogenes penicillin-binding proteins and characterization of PBPD2 (Lmo2812). BMC Microbiol. 2010 Sep 15;10:239. doi: 10.1186/1471-2180-10-239.

Strona WWW grupy badawczej - FIZJOLOGIA BAKTERII http://www.biol.uw.edu.pl/fizjologia_bakterii

Warunki przyjęcia na pracownię licencjacką uzyskanie zaliczeń ze wszystkich przedmiotów wymaganych na II roku studiów licencjackich

Głównie z kierunku biotechnologia

licencjat: 4 osoby; pracownia magisterska: 6 osób

KONTAKT

dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW (p. 420A, e-mail: magdapop@biol.uw.edu.pl)

dr Agata Krawczyk-Balska (p. 320A, e-mail: akra@biol.uw.edu.pl)

dr Dorota Korsak (p. 326A, e-mail: d.korsak@uw.edu.pl)

dni otwarte od 25-29.04.2016 w godz. 10.00-15.00