Upload
dodang
View
228
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
EPREPR--SS--SLSL--STST--OxOx--II--primenprimenee u biolou biološškim sistemimakim sistemima--
Miloš Mojović
EElektronlektron PParamagnetnaaramagnetnaRRezonancijaezonancija
OSNOVNI PRINCIPIOSNOVNI PRINCIPI I NEKE I NEKE PRIMENEPRIMENE
EPR je rezonantna apsorpcija mikrotalasnog zračenja od strane nesparenog elektrona u prisustvu magnetnog polja
Terminologija
Electron Paramagnetic Resonance (EPR)Electron Spin Resonance (ESR)Electron Magnetic Resonance (EMR)
EPR = ESR = EMR
Ene
rgija
Ms
±½
B = 0 Magnetno polje (B)
ΔBpp
hν = gβBν= (gβ/h)B = 2.8024 x B MHz
za B = 3480 G ν = 9.75 GHz (X-band)za B = 420 G ν = 1.2 GHz (L-band)za B = 110 G ν = 300 MHz
(Radiofrekvencija)
EPREPR –– opopššti principti princip
Ms = +½
Ms = -½
h Plankova konstanta 6.626196 x 10-34 Jsν frekvencija (GHz)g g-faktor (približno 2.0)β Borov magneton (9.2741 x 10-24 J/T)B magnetno polje (Gauss ili T)
ΔE=hν=gβB
B > 0
Kako se moKako se možže dobiti EPR e dobiti EPR signal?signal?
DrDržži se konstantna mikrotalasna frekvencija a i se konstantna mikrotalasna frekvencija a kontinualno se menja magnetno polje (starije kontinualno se menja magnetno polje (starije CW CW mamaššine)ine)Na konstantnom magnetnom polju primeni se Na konstantnom magnetnom polju primeni se puls elektromagnetnih talasa (novije mapuls elektromagnetnih talasa (novije maššine) ine) –– analogno FT NMRanalogno FT NMR
Razvoj pulsnih EPR spektrometara je dugo bio ograniRazvoj pulsnih EPR spektrometara je dugo bio ograniččen en nepostojanjem elektronike koja radi u nanosekundnim renepostojanjem elektronike koja radi u nanosekundnim režžimima i imima i koja mokoja možže da registruje FID koji potie da registruje FID koji potičče od relaksacija elektrona e od relaksacija elektrona (mikrosekunde ili manje)(mikrosekunde ili manje)..
ShemaShema EPR EPR spektrometraspektrometra
EPR cavity (EPR cavity (rezonatorrezonator))
PrincipPrincip detekcijedetekcije signalasignala u EPR u EPR spektroskopijispektroskopijimodulacija magnetnog poljamodulacija magnetnog polja
ne
da
može
Modulacija magnetnog polja ‘skenira’ apsrorpcionu liniju i EPR spektar je prvi izvod apsorpcione linije
KlasiKlasiččnini EPR instrumentEPR instrument
Pulsni EPR
FID
Spektar
Pitanje:Pitanje:ČČemu snimati spektar nesparenog elektrona i za to emu snimati spektar nesparenog elektrona i za to koristiti instrumente koji su jako skupi, ako se dobije koristiti instrumente koji su jako skupi, ako se dobije samo ovo.. ?!samo ovo.. ?!
Odgovor:Odgovor:Pitanje ne uzima u obzir razliPitanje ne uzima u obzir različčite interakcije spinova u ite interakcije spinova u sistemu i mogusistemu i moguććnosti da se iz toga izvuku informacije o nosti da se iz toga izvuku informacije o sistemu koji se istrasistemu koji se istražžujeuje
EPR EPR HamiltonijanHamiltonijan
OpOpššti principti princip –– ččestice sa nesparenim spinovima rezonantno apsorbuju estice sa nesparenim spinovima rezonantno apsorbuju elektromagnetno zraelektromagnetno zraččenje kada se nalaze u magnetnom poljuenje kada se nalaze u magnetnom polju
Ukupni HamiltonijanUkupni HamiltonijanHHmm= H= HBSBS + H+ HBIBI + H+ HSSSS + H+ HISIS mmagnetnaagnetna spinskaspinska energijaenergija
HHee= H= HEe Ee + H+ HEkEk + H+ HQQ elektrostatielektrostatiččka energijaka energija
HHBSBS -- Zemanova energija elektronskih spinova Zemanova energija elektronskih spinova HHBI BI -- Zemanova energija nuZemanova energija nukklearnih spinovalearnih spinovaHHSSSS -- interakcija elektronskih spinova sa elektronskim spinovimainterakcija elektronskih spinova sa elektronskim spinovimaHHISIS -- interakcija elektronskih spinova sa nuklearnim spinovimainterakcija elektronskih spinova sa nuklearnim spinovimaHHEeEe -- interakcija elektrona sa spoljainterakcija elektrona sa spoljaššnjim elektrinjim električčnim poljemnim poljemHHEkEk -- interakcija jezgra sa spoljainterakcija jezgra sa spoljaššnjim elektrinjim električčnim poljem nim poljem HHQQ -- elektrielektriččna kvadrupolna interakcijana kvadrupolna interakcija
MS=±½
ElektronS (½)
JezgroI (½)
Izborna pravilaΔMS = ±1 (elektron)
ΔMI = 0 (jezgro)
B
“dublet”
a
HHiiperfinperfino sprezanjeo sprezanjeDodatno cepanje linija usled interakcija
elektronskih i nuklearnih spinova
E = gβBSz + (hA0)SzIzE = gβBSz + (a)SzIz(hA0 (Hz) -> a (G) g-faktor)
+½
-½
-½
+½
MI
ΔE1 = gβB + a/2
ΔE2 = gβB - a/2ΔE1 – ΔE2 = a
ΔE1 ΔE2
-½
+½
Ms
MS=±½
ElektronS (½)
JezgroI (1)
Izborna pravilaΔMS = ±1 (elektron)
ΔMI = 0 (jezgro)
B
“triplet”
a
HHiperfino sprezanjeiperfino sprezanje
E = gβBSz + (hA0)SzIzE = gβBSz + (a)SzIz(hA0 (Hz) -> a (G) g-faktor)
-½
+½
Ms
ΔE1 ΔE2 ΔE3
+1
-1
-1
+1
MI
+0
+0
ΔE1 = gβB + aΔE2 = gβBΔE3 = gβB - a
HiperfinoHiperfino cepanjecepanje EPR EPR linijalinija2I + 1 (2I + 1 (1414N, I=1)N, I=1)
EPR spektar Tempona (14N)
Strukturna formula molekula nitroksida= stabilni slobodni radikal
Tempon
Da utvrdimo ...Da utvrdimo ...
ŠŠta ta ćće se desiti ako e se desiti ako 1414N zamenimo sa N zamenimo sa 1515N ???N ???
15N-PDT
• 15N je I=1/2, tj. moguće vrednostimagnetnog momenta su -1/2 i 1/2). Postoje sada dva dozvoljana prelaza i samo 2 linije
• Zamenom običnog vodonika deuteronima, (manji gN -faktor) manje je super hiper finocepanje (dodatno se smanjuje širina linija)
EPR spektar
Možemo detektovati i meriti slobodne radikale i paramagnetne vrste
• Visoka osetljivost (nanomolarne koncentracije)• Nema "pozadinskih" mešajućih signala• Kvalitativna & kvantitativna tehnika
Zašto EPR?
Načini detekcije
Vrste koje imaju nesparen elektron same po sebiPrimer: semihinoni, nitroksidi, prelazni metali ...
Vrste koje se mogu detektovati tehnikom spin-trapingaVrste: superoksidni, hidroksilni, alkil, NO radikali ...Spin-trapovi: DMPO, DEPMPO, EMPO ...
• Pozicija pikova (g-faktor)• Multipletnost (hiperfina interakcija)• Oblik linije (širina linije, simetrija, itd.)• Intenzitet (amplituda/površina pika)
Sve ovo se koristi kao "otisak prsta" prilikom identifikacije vrste i količine ispitivane vrste
ŠŠta se meri pomota se meri pomoćću EPRu EPR--a?a?
ampl
ituda
širina linije cepanje linija
Primeri primene EPRPrimeri primene EPR
Prelazni metali (Mn, Fe, itd..)Delokalizovani elektroniSpinske probe i spinski obeleSpinske probe i spinski obeležživaivaččiiSlobodni radikaliSlobodni radikaliEPRI EPRI In vivo EPR spektroskopijaIn vivo EPR spektroskopija
ManganMangan55Mn (I =5/2)
2I+1 pravilo = 6 linijaMn+2/MgO (1:500)
Uklanjanje spin-spin interakcije
Spinske probe i spinski Spinske probe i spinski obeleobeležživaivaččii
Spinske probe – stabilni (dugoživeći) slobodni radikali (nitroksidi) koji se ubacuju u sistem da bi se ispitala neka osobina
Spinski obeleživači (spin labels) – nitroksidi vezani za druge molekule – praćenje ponašanja obeleženih molekula
Sterno zaklanjanje reaktivne grupe
Modifikacija osobina ‘ručka’
-½
+½
Spinske probe i obeleSpinske probe i obeležživaivaččii(EPR spektri)(EPR spektri)
TEMPONE
EPR spektar
• Paramagnetni elektron spin-labela se nalazi u sp3
orbitali između N i O. IN=1, a IO=0. • Jezgro sa spinom 1 ima 3 moguće vrednosti magnetnog
momenta (+1,0,-1) pa dolazi do cepanja oba energetska nivoa elektrona (mS =1/2 i mS =- 1/2) na po tri.
• Iz jednačine ∆E = gβeB, vidimo da razlike u energiji vode ka različitim rezonantnim uslovima.
• Na osnovu izbornog pravila ΔmS=±1 (spinski nivoi) i ΔmI=0 (Zemanovi nivoi) moguća su 3 prelaza, pa postoje i 3 linije.
* Svaka linija je i dodatno proširena usled interakcije sa protonima (I=1/2) iz susednih CH3 grupa (super hiper fina interakcija), vide se i 13C (I=1/2) sateliti ... ali, polako
MS=±½
B“triplet”
a
ΔE1 ΔE2 ΔE3
+1
-1
-1
+1
MI
+0
+0
MI
KretanjeKretanje lipidalipida u u membranimembrani
Termalni pokretihidrofobnog dela
Uređenost unutrašnjosti membrane
Transverzalno kretanjeflip-flop
Lateralno kretanje lipidadifuzija
Fosfolipidne membrane kao modeli za ispitivanje Fosfolipidne membrane kao modeli za ispitivanje osobina membranaosobina membrana. S. Spontano ili indukovano formiranje pontano ili indukovano formiranje
fosfolipidnogfosfolipidnog dvoslojadvosloja
Planarne membrane (Planarne membrane (black film)black film)
Problem je šta sa krajevima, pa se krajevi zakače za nešto
SUV (out-in 65-35%)
Liposomi (lipidne vezikule)spontano ili sonifikacija
LUV (out-in 50-50%)Small or large unilamellar vesicles
MLVMultilamellar vesicles
EM multilamelarne Goldžijeve strukture
LipozomiLipozomi -- uređenost i fazni prelazi uređenost i fazni prelaziEPR spinske probeEPR spinske probe
Selektivno obeležavanje pozicije duž lanca
Uticaj pokretljivosti spinske probe na izgled EPR spektra
DS u vodi
DS u membrani
Određivanje faktora uređenosti S fosfolipidnog dvosloja metodom EPR spinskih proba
Fazni prelaz = gel (uređeno) ↔ neuređeno (tečni kristal)
ŠŠta se deta se deššava sa EPR spektrima spinava sa EPR spektrima spin--labela labela kada se ugrade u membranu ???kada se ugrade u membranu ???
C
O OH
ON
O
++
++ HH22OOU vodenom rastvoru
7-DS
Integrisan u membranu
• Ukupan spektar 7DS-a ugradjenog u membranu potpuno odudara od onog iz rastvora. Do toga dolazi zbog anizotropije.
77--DS u membraniDS u membraniMembrana ima delimiMembrana ima delimiččno kristalni karakter pa utino kristalni karakter pa utičču i u i gg i i aa anizotropija. anizotropija. Molekul 7Molekul 7--DS pokazuje aksijalnu simetriju i pretpostavka je da moDS pokazuje aksijalnu simetriju i pretpostavka je da možže slobodno da rotira oko te ose pa e slobodno da rotira oko te ose pa se efekti anizotropije gube u xyse efekti anizotropije gube u xy--ravni, tj Bravni, tj Blocloc je ujednaje ujednaččeno u toj ravni pa se x i y osa eno u toj ravni pa se x i y osa ““izjednaizjednaččavajuavaju””..Bitno je u kakvom je poloBitno je u kakvom je položžaju u odnosu na spoljaaju u odnosu na spoljaššnje magnetno polje postavljena osa molekula nje magnetno polje postavljena osa molekula (paralelna sa z) u odnosu na vektor spolja(paralelna sa z) u odnosu na vektor spoljaššnjeg mag. polja. Za gnjeg mag. polja. Za g--anizotropiju vaanizotropiju važži da je i da je gg┴┴=1/2(g=1/2(gxx+g+gyy) ) ii ggzz=g=g||||, a za , a za aa anizotropijuanizotropiju aa┴┴=1/2(a=1/2(axx+a+ayy) ) ii aazz=a=a||||Zbog razliZbog različčitih itih gg┴┴ i i gg||||, i , i aa┴┴ i i aa|||| vrednosti dobijamo razlivrednosti dobijamo različčite spektre za dve idealne situacije: kada je ite spektre za dve idealne situacije: kada je osa molekula normalna u odnosu na B i kada je paralelna sa Bosa molekula normalna u odnosu na B i kada je paralelna sa B
Naravno, kada je spin-label u membrani mi u jednom uzorku imamo obe situacije pa dolazi do superponiranja spektara i dobija se dobro poznati spektar.
g⊥ = ½(gxx + gyy)
A⊥ = ½(Axx + Ayy)
34203400338033603340332033003280
0,003
0,002
0,001
0
-0,001
-0,002
||
3440342034003380336033403320
0,006
0,004
0,002
0
-0,002
-0,004
⊥
g// = gzz
A// = Azz
3 4 4 03 4 2 03 4 0 03 3 8 03 3 6 03 3 4 03 3 2 0
0 , 0 0 6
0 , 0 0 4
0 , 0 0 2
0
- 0 , 0 0 2
- 0 , 0 0 4
⊥3 4 2 03 4 0 03 3 8 03 3 6 03 3 4 03 3 2 03 3 0 03 2 8 0
0 , 0 0 3
0 , 0 0 2
0 , 0 0 1
0
- 0 , 0 0 1
- 0 , 0 0 2
| |
┴&||
2A||
2A┴
5,7,125,7,12--DS u membraniDS u membraniŠŠto je fluidnost veto je fluidnost većća, molekuli se slobodnije krea, molekuli se slobodnije krećću pa dolazi do postepenog gubitka anizotropije i spektar je sve u pa dolazi do postepenog gubitka anizotropije i spektar je sve slisliččniji onom iz rastvora. niji onom iz rastvora. SSpektri za dve ekstremne situacije postaju identipektri za dve ekstremne situacije postaju identiččni, a ukupni spektar uni, a ukupni spektar užžii ––zazaššto ???to ???
ŠŠirina spektralnih linija irina spektralnih linija = = (2(2ττ11))--11 + (1 + + (1 + γγee22BB11
22ττ11ττ22))1/21/2 ττ22--11 gde sugde su::
ττ11 i i ττ22 longitudinalno i transverzalno relaksaciono vreme,longitudinalno i transverzalno relaksaciono vreme, BB11 je magnetna komponenta ulaznog zraje magnetna komponenta ulaznog zraččenja)enja); ; γγee je je žžiromagnetni odnosiromagnetni odnos..
ττ11 opisuje gubitak magnetizacije, relaksaciju koja nastaje kroz opisuje gubitak magnetizacije, relaksaciju koja nastaje kroz proces gde proces gde apsorbovana energija prelazi u toplotu apsorbovana energija prelazi u toplotu ((spinspin--rereššetkaetka relaksacijarelaksacija)). . ττ22 opisuje gubitak magnetizacije kroz gubitak faze, energija opisuje gubitak magnetizacije kroz gubitak faze, energija se se prenosi sa elektrona na prenosi sa elektrona na elektron (spinelektron (spin--spin relaksacija) spin relaksacija)
ŠŠirina linije irina linije je uje u principu obrnuto proporcionalna brzini relaksacije.principu obrnuto proporcionalna brzini relaksacije.
Kada je membrana rigidnija, spinovi su bliKada je membrana rigidnija, spinovi su bližži jedan drugome takoi jedan drugome takoda lakda lakšše dolazi do spinske difuzije, a vee dolazi do spinske difuzije, a većći broj sudara doprinosii broj sudara doprinosispinspin--rereššetkaetka relaksaciji. Relaksacija je tada brrelaksaciji. Relaksacija je tada bržža, a linije a, a linije ššire. ire. Kada se poveKada se povećća mobilnost molekula (spina mobilnost molekula (spin--labellabel--a) u membrani a) u membrani relaksacija ide sporije, pa su i linije urelaksacija ide sporije, pa su i linije užže. Ovo je joe. Ovo je jošš jedan faktor, jedan faktor, osim anizotropije, koji daje direktnu vezu izmedju fluidnosti osim anizotropije, koji daje direktnu vezu izmedju fluidnosti membrane i membrane i šširine spektralnih linija.irine spektralnih linija.
Fluidnost membrane se poveFluidnost membrane se poveććava od povrava od površšine prema ine prema unutra. Polarne glave su relativno gusto spakovane na unutra. Polarne glave su relativno gusto spakovane na povrpovrššini, mini, međusobno se privlaeđusobno se privlačče ili odbijaju i interaguju e ili odbijaju i interaguju sa vodom u okolini. Od njih se prema sredini membrane sa vodom u okolini. Od njih se prema sredini membrane prupružža(ju) masnokiselinski lanac koji nepolaran. U blizini a(ju) masnokiselinski lanac koji nepolaran. U blizini glave on je slabo pokretan. Mglave on je slabo pokretan. Međutim eđutim ššto se ide dalje od to se ide dalje od polarnog dela, hidrofobni rep je sve slobodniji i tu se mopolarnog dela, hidrofobni rep je sve slobodniji i tu se možže e uouoččiti veiti većća fluidnost.a fluidnost.
OdređivanjeOdređivanje ffazniaznihh prelaza lipidnog dvoslojaprelaza lipidnog dvoslojametodom metodom EPR EPR spinspin obeleobeležžavanjaavanja
7-DS
T = 20 °C
T = 75 °C
Fosfolipidi
Spinska proba
temperatura
SGel – ispod faznog prelaza
Tečni kristal – iznad faznog prelaza
+
LipozomiLipozomilateralnalateralna difuzijadifuzija fosfolipidafosfolipida
Spin-spin širenje
Bliski kontakt spinova dovodi do širenja linije i indukuje da su obeleženi fosfolipidi u kontaktu
Pojavljivanje tri linije ukazujena ‘razblaživanje’ lateralnom difuzijom
LipozomiLipozomiflipflip--flopflop--
fosfolipidafosfolipida
vreme
1
0.5
Asc na 0oC
Asc na 30oC
Od svih proteina okoOd svih proteina oko 30%30% su membranski proteinisu membranski proteini
Do sada je poznata strukturaDo sada je poznata struktura ≈≈25,00025,000 proteina, ali samo proteina, ali samo ≈≈8080membranskih proteinamembranskih proteina
Primeri Primeri membranmembranskihskih proteinproteina poznate strukturea poznate strukture::
FFotosotosiintetntetski rski reaeakckcionioni centrii centri1988 Nobel Prize in Chemistry:1988 Nobel Prize in Chemistry: DeisenhoferDeisenhofer, Huber and Michel, Huber and Michel
RodopsinRodopsiniiββ--burebure mmembranembranskiski pproteinroteiniiMembranMembranskiski kanali kanali ((i.e.i.e. KcsAKcsA, AQP), AQP)
2003 Nobel Prize in Chemistry:2003 Nobel Prize in Chemistry: AgreAgre and MacKinnonand MacKinnonCCiitohrometohrome C C oksidazeoksidaze
Ili šta sve treba uraditi i koliko se namučiti da bi se dobila struktura proteina, naročito ako je to membranski protein?
EPR i EPR i strukturastruktura proteinaproteina
ŠŠta je problem u određivanju ta je problem u određivanju strukture membranskih proteinastrukture membranskih proteina??
ZaZašštoto??
XX--zracizraci: : ““nnemaema”” kristala membranskih proteina, jer jekristala membranskih proteina, jer je struktura struktura određena interakcijama u membrani određena interakcijama u membrani NMR: membrane NMR: membrane susu anizotropanizotropnini ssiistemstemii
-- NMR NMR spektrispektri visokevisoke rezolucijerezolucije se se mogumogu dobitidobiti samosamo za proteine u za proteine u micelama, ali ne i u lipozomimamicelama, ali ne i u lipozomima
-- ObogaObogaććivanje sa ivanje sa 1313C and C and 1515NN je neophodnoje neophodno ((komplikovano i komplikovano i izuzetno skupoizuzetno skupo))
••DDifrakcija ifrakcija XX--zrakazraka ii NMR NMR susu ““standardstandardnene metmetooddee”” u određivanju strukture u određivanju strukture proteinaproteina
••Ove tehnike nisu najbolje reOve tehnike nisu najbolje reššenje za određivanje strukture membranskih enje za određivanje strukture membranskih proteina.proteina.
SiteSite--Directed Directed sspepekktrostroskopijakopijaIspitivani Ispitivani protein: protein: M13 coat proteinM13 coat protein
50 amino 50 amino kiselinskih ostatakakiselinskih ostatakaTransmembranTransmembranskiski proteinprotein
SpeSpekktrostroskopija bazirana na kopija bazirana na sitesite--directed directed mutagenemutagenezzii-- Kao mesto obelezavanja koristi seKao mesto obelezavanja koristi se CysCys
-- PoPoččinje se sa proteinom bezinje se sa proteinom bez CysCys-- PrPripremi se mutant sa jednomipremi se mutant sa jednom CysCys (relativno bezbedne mutacije(relativno bezbedne mutacije CysCys
zamenjujezamenjuje AlaAla, , SerSer, , iliili ThrThr-- CysCys se obelese obeležži podobnim obelezivai podobnim obelezivaččem zaem za EEPPRR iliili fluorescenfluorescentnu tnu
spektroskopijuspektroskopiju-- Protein se ubaci u fosfolipidni dvoslojProtein se ubaci u fosfolipidni dvosloj
M13 M13 pproteinrotein sa prikasa prikaččenim spinskim enim spinskim obeleobeležživaivaččemem
Konsekutivnoobeležavanje i merenje na pojedinoj lokaciji
membrana-vodainterface
Pretpostavljena struktura
ObeleObeležžavanje spinskim obeleavanje spinskim obeležživaivaččemem1
50
ZNAČI:• Na Cys se nakači spin-label• Može se raditi i izmena Ala, Ser ili Thr sa Cys (pravljenje proteina-mutanata)
• Analiza EPR spektara dobijenih labela može nam pomoći da odredimo strukturu membranskih proteina.
• Evo kako se to radi ...
S
HN
NOO
O
•
+N
NOO
O
• S
5-maleimido-proxylspin label
Cys EPR aktivnaAK
Reakcija maleimido-proxyl spin labela sa proteinom koji ima cisteine
ŠŠtata se se događadogađa sasa EPR EPR spektrimaspektrima ??
Slobodna rotacija Ograničena ‘anizotropna’ rotacija
•• EPR informacijeEPR informacije u u zavisnodtizavisnodti odod ppokretljivostokretljivosti pi polarnost okolineolarnost okoline
S
HN
NOO
O
•
+N
NOO
O
• S
5-maleimido-proxylspin label
Cys EPR aktivnaAK
EPR spektar proteinaEPR spektar proteina--mutanatamutanata
16 19
2325
29
34
42
4649
2Azz
• Gustina pakovanja oko spin-labela kojije zakačen za protein, srazmerna je2AZZ u EPR spektru.
• Upotrebom mutant-proteina (zamenom određenih AK sa Cys i kačenjem spin-labela, može se dobiti korisna informacija o okruženju.
Polarni region
OksimetrijaOksimetrija
EPR oksimetrijaEPR oksimetrijaPrincipPrincip::-- Kiseonik je paramagnetik i menja (Kiseonik je paramagnetik i menja (šširi) EPR linijeiri) EPR linijeRedukcijaRedukcija nitroksidanitroksida jeje uspuspoorenarena u u prisustvuprisustvu kiseonikakiseonika
EPR senzoriEPR senzoriNitroksidi i partikule (ugalj, mastilo, LiPcNitroksidi i partikule (ugalj, mastilo, LiPc--kristalkristal litlitijumijum fftaloctalocijaninaijanina))
ZAŠTO MERITI KISEONIK U BIOLOŠKIM SISTEMIMA?In vitro – metabolizam, slobodni radikaliIn vivo - radioterapija tumora, ishemija, inflamacije, reperfuzije
Kako?Kako?Klasičan pristup su elektrode ili merenje proizvodnje (gubitka)Teško ili nemoguće je ovako meriti unutarćelijski kiseonik
Kalibraciona kriva litijum ftalocianina (LiPc) na PO2. (A) Primer kako se širina EPR linije LiPc menja sa pritiskom (0 mm Hg i 35.6 mm Hg O2). (B) Kalibraciona kriva LiPC za različite PO2 pokazuje linearnost.
EPR oksimetrijaEPR oksimetrija--biljkebiljke--
Kalibracija probe(širina linije vs. pO2)
Profil koncentracije kiseonika dužmembrane tilakoida
(selektivno obeležavanje pozicija u membrani)
N2
Princip: Vrši se merenje širine EPR linije neke spinske probe koja zavisi od pO2
EPR spinEPR spin--trappingtrapping
Metoda koja se koristi zaMetoda koja se koristi za““hvatanjehvatanje”” katkokatkožživeiveććihih radikalskih radikalskih vrsta.vrsta.Korste se substance koje zovemo Korste se substance koje zovemo spinspin--trapovi trapovi (hvata(hvatačči spinova)i spinova)S.T. u reakciji sa slobodnim S.T. u reakciji sa slobodnim radikalima prave stabilnije EPR radikalima prave stabilnije EPR aktivno jedinjenje koje se moaktivno jedinjenje koje se možže e detektovati standardnom EPR detektovati standardnom EPR metodom.metodom.
ŠŠta se mota se možže raditi metodome raditi metodom EPREPR kada su u kada su u pitanju kratkopitanju kratkožživeivećći (i (μμss) slobodni radikali) slobodni radikali??
Spin trap = zamka za kratko Spin trap = zamka za kratko žživeivećće radikalee radikale
EPR spinEPR spin--trapovitrapovi
Ima ih veliki broj i predstavljaju veoma unosan biznisCjena – sitnica ! (0.5g = 1000€) Npr.: 0.5g Au ≈ 10€Svake godine na tržištu se pojavi novi trap koji je neznatno bolji od prethodnog
N
O
CH3
CH3
HN
O
CH3
CH3
H
OH
Spin-trap(EPR neaktivna vrsta)
● OH+
Spin-adukt(EPR aktivna vrsta)
Radikal
Princip rada spinPrincip rada spin--trapovatrapova
Postoje razni spinPostoje razni spin--trapovitrapoviRazlikuju se: po hemijskoj strukturi bočne grupe, stabilnosti trapa i adukata, EPR spektru, rastvorljivosti, načinu čuvanja.
Neki su specifični za određene radikale, ali idealni trap bi trebalo da razlikuje više radikala koji se simultano proizvode u istom sistemu
Eksperimenti i kompjuterske simulacije su ukazale na postojanje reaktivnog vodonika (H-radikal) kod različitih
bioloških sistema (Mojović et.al.)
Postojanje reduktivne vrste u produkciji radikala ukazuje na moguće regulacione mehanizme u toku oksidatvnog stresa, ulogu radikala u nekim bolestima itd.
Primer: uloga slobodnih radikala kod amiotrofične lateralne skleroze (ALS)
Normalna osoba
ALS pacijent
Kompjuterska simulacija OH i H radikala
Kod ALS pacijenata postoji povećana produkcija ‘zlih’·OH radikala koja nije regulisana proizvodnjom ‘dobrih’ ·H radikala
EPR spin-trap spektri likvora
Prednosti i mane EPR Prednosti i mane EPR spinspin--trappingatrappinga
MoMožžemo detektovati emo detektovati veoma kratkoveoma kratkožživeivećće e radikalske vrsteradikalske vrsteMoMožžemo razlikovati viemo razlikovati višše e vrsta koje se prave u vrsta koje se prave u istom sistemuistom sistemuPotrebne male koliPotrebne male količčine ine uzorka (uzorka (μμl)l)Relativno jednostavna Relativno jednostavna eksperimentalna tehnikaeksperimentalna tehnika
Relativno su skupiRelativno su skupiVeVeććina se mora ina se mora naknadno prenaknadno preččistiti istiti ššto to dodatno povedodatno poveććava cenuava cenuSpektri razliSpektri različčitih adukata itih adukata se se ččesto delimiesto delimiččno no preklapajupreklapajuSimulacije EPR spektara Simulacije EPR spektara je dosta teje dosta tešško izvesti sa ko izvesti sa 100% ta100% taččnonostisti
PREDNOSTI MANE
IN VIVO EPRIN VIVO EPR
MRI EPR
Da! Ali postoji jedan "mali" problem!
Biološki uzorci su "vodeni" i zbog toga podležu nespecifičnoj (nerezonantnoj) apsorpciji mikrotalsne energije, zato je dubina prodiranja mikrotalasa u uzorak mala. Ako povećamo mikrotalasnu snagu, dubina prodiranja se povećava ali .......
Da li možemo koristiti EPR u biološkim sistemima"in vivo" ili "ex vivo" ?
FreFrekvencijakvencija ~300 MHz~300 MHz ~750 MHz~750 MHz 11--2 GHz2 GHz ~3 GHz~3 GHz 99--10 GHz10 GHz
Dubina Dubina prodiranjaprodiranja
> 10 cm> 10 cm 66--8 cm8 cm 11--1.5 cm1.5 cm 11--3 mm3 mm 1 mm1 mm
BioloBiološški uzorarki uzorar Ljudi, pacovLjudi, pacov Pacov, miPacov, mišš MiMišš, , srce pacovasrce pacova
MiMiššiji rep, iji rep, kokožžaa
Uzorci "Uzorci "in vitroin vitro""(~100 (~100 μμll))
Problem dubine prodiranja se može rešiti i smanjenjem frekvencije mikrotalasa.
Da, ali smanjenje frekvencije smanjuje vrednost B0 a time i osetljivostNema EPRI za ljude i verovatno ga nikada neće ni biti :(EM zračenje slabi zbog dielektričnih gubitaka (B prolazi ali ne E jer mi nismo čista voda)
hν = gβBo
EPRIEPRI((Electron ParamagneticElectron Paramagnetic RResonance esonance IImaging)maging)•• Dobijanje slika Dobijanje slika pomopomoććuu EPREPR--a ( Spectrala ( Spectral--spatial CWspatial CW--EPRI):EPRI):
Kako saznati prostorni polozaj pramagnetnih vrsta?Princip je menjati orjentaciju gradijenta magnetnog polja u odnosu na uzorak i zatim uraditi rekonstrukciju slike.
Zavisnost oblika EPR signala iz 2 rastvora nitroksida od smeragradijanta magnetnog polja B.
Kako napraviti sliku u više od1 dimenzije?Praviti gradijente B duž svihosa (X,Y,Z).Problemi?Uzorci često nemaju samo 1 pik (kao H u NMR-u) a i širinasignala utiče na preklapanjepikova.Sta je dobro?Može se praviti image biločega što utiče na EPR spektar (ne samo 3D image već + nova dimenzija kaoosobina sistema ). SpectralSpectral--spatial Xspatial X--band CWband CW--EPR imageEPR image
KakoKako to to stvarnostvarno izgledaizgleda??
MRI MRI v.sv.s. EPRI . EPRI PostojePostoje bitnebitne razlikerazlike u u osobinamaosobinama jezgarajezgara i i elektronaelektrona ((žžiromagnetniiromagnetni odnosiodnosi, , hiperfinehiperfinekonstantekonstante cepanjacepanja, , relaksacionarelaksaciona vremenavremena).).ZbogZbog toga se toga se MRI MRI uvekuvek izvodiizvodi u u pulsnompulsnom rerežžimuimu (RF(RF--pulspuls + + frekventnifrekventni, , faznifazni i "slice" i "slice" gradijentigradijenti magnetnogmagnetnog poljapolja, , uzuz raznerazne sekvencesekvence tipatipa spinspin--ehoeho.., 2D FT i .., 2D FT i rekonstrukcijerekonstrukcijeslikeslike iziz vokselavoksela..EPRI se EPRI se ččestoesto izvodiizvodi u CW u CW rerežžimuimu uzuz rotirajurotirajuććee magnetnemagnetne gradijentegradijente..MRI MRI imaima do 10do 1066 putaputa veveććuu koncentracijukoncentraciju spinovaspinova u u sistemusistemu, , kaokao i do 10i do 1066 dudužžeerelaksacionorelaksaciono vremevreme zaza tete isteiste spinovespinove..ProseProseččnana šširinairina EPR EPR pikovapikova jeje znatnoznatno veveććaa u u odnosuodnosu nana rarasspolopoložživiv opsegopsegmagnetnogmagnetnog poljapolja u u odnosuodnosu nana NMR signal H NMR signal H kojikoji se se posmatraposmatra u MRI.u MRI.PulsniPulsni EPRI EPRI zatozato zahtevazahteva vrlovrlo preciznupreciznu i i naprednunaprednu elektronikuelektroniku uzuz brzebrze raraččunareunare kojikojiććee zadavatizadavati sekvencesekvence i i dedeššifrovatiifrovati dobijenedobijene rezultaterezultate. .
EPR i tumoriEPR i tumori in vitroin vitro
Objekat:Sferoidi (model za solidne tumore)
Cilj:Ispitivanje viabilnosti tumora
Tehnika:X-band EPRI
Senzor: 15N-PDT (sve ćelije)‘Kontrastni agens’:Fe (‘mrtve’ ćelije)
EPRIprimena
200μm
15N-PDT ulazi svuda a Fe-kompleks ulazi samo u mrtve ćelije (a ne i u žive).
In vivoIn vivo spektroskopijaspektroskopija--ppovrovrššinska zavojnicainska zavojnica--
- Princip EPR snimanja putem korišćenjapovršinske zavojnice- Dubina prodiranja bitno zavisi od frenvencijemikrotalasa (dielektrične osobine i E vektor EM zračenja)- Koriste se manje frekvencije mikrotalasa (svesmo bliže RF oblasti) (L, S, X band).- Da se podsetimo:1-2 GHz (L-oblast), 2-4GHz (S-oblast), 8-10 GHz (X-oblast), 35 GHz (Q-oblast) i 95 GHz (W-oblast)
Surface-coil resonator
IN VIVOIN VIVO spektroskopijaspektroskopija--KOKOŽŽAA--
Slobodni radikal idukovan antralinom (lek za psorijazu)
- Psorijaza: Autoimuno oboljenjekože čili je uzrok nepoznat(veruje se da ima genetskukomponentu).- Jedan od načina tretmanaprotiv ove bolesti je tretmanpomadama koje sadržedithranol (anthralin).- Proučava se delovanjeAntralina koji u interakciji saodređenim supstancama u kožistvara slobodne radikale. Kakoih izmeriti?- Koristi se L-band EPR oblast i površinska zavojnica koja se stavlja direktno na kožu- Upotrebljava se eksperimentalni nude-mouse
Osoba obolela odpsorijaze
Nude mouse
EPR oksimetrijaEPR oksimetrijapOpO22 u srcuu srcu
Ex vivo EPRI merenja u uslovima perfuzije nitroksidima
- Zašto i kako meriti kisonik?- Ishemija, hiperoksija, reperfuzija i oksidativni stres su najvažnije stvari koje trebapratiti u živim sistemima. Uzročnici su i posledica velikog broja patoloških stanja.
- Moze li nam ovde MRI pomoći? Teško.- Langendorfova preparacija srca. U rastvor za preparaciju ubačen nitroksid.- Signal se razlikuje jer odr. delovi srca imaju razl. količinu O2 (paramagnetik)- Uraditi EPRI snimanje, a kao dimenziju uzeti širinu EPR linije
EPR oEPR oksimetrijaksimetrija. . LokalizovaneLokalizovane ((implantiraneimplantirane) ) EPR EPR oksimetrijskeoksimetrijske probe (pOprobe (pO22))
Simultano merenje pO2 na 2 mesta u mozgu korišćenjem LiPC kristala
T2* - nagnašena MRI slika mozga u koji su implantirani LiPC (po jedan u
stvaki rezanj mozga). Tamne regije su veće od veličine LiPC kristala(<100 μm) zbog namerno izazvanih artefakata susceptibilnosti
-Subjekat: Mongolski gerbils-Nekopletan Willisov krug dozvoljavaindukciju ishemije samo jedne strane mozgaunilateralnom karotidnom okluzijom-Metod za praćenje ishemije
EPR spektar dva LiPC kristala u dva režnja odražavarazliku pO2 nakon unilateralne karotidne okluzije.
Gradijant magnetnog polja
In vivoIn vivo EPR EPR oksimetrijaoksimetrija, , obeleobeležžavanjeavanje, , tumoritumori, , radioterapijaradioterapija
Tumori: Zračenjem izazvan fibrosarcoma RIF-1 i mammary adenocarcinomaMTG-B koji su zatim implanirani u miša.Površinske zavojnice EPRS na 1.2 GHz; Oksimetrijska proba: Fusinit Zračenje: jedna doza od 20 Gy
Količina kiseonika u tumoru je ključni faktor za uspešnu radioterapiju
Post-radijacionadeoksigenacija i reoksigenacija tumora zavisiod tipa tumora(prokrvljenosti?)
Personalizovana radioterapija?
20 Gy
Ali ...$$$$$$$ po pacijentu
Kombinovana MRI & EPRI tehnika za proučavanjeROS upotrebom hidroksilamina
- Oksidativni stres koji je izazvanreperfuzijom. - EPR signal dobija se tekoksidacijom hidroksilamina koji nijeEPR aktivna vrsta a koji se injektuje u miša pre ishemije.- Poređenjem MRI i EPRI slike možese lokalizovati ishemično mesto i izvršiti kiseonično mapiranje.
EPR i NMR slike mišakoji je doživeo šlog
NMR slika EPR slika
PreklopljenaEPR/NMR slika
Kisonično mapiranje mišjegmozga tokom ishemije