Consola

Script

Significa NewVar = 1, esto es el valor 1 es guardado en la memoria como NewVar

Luego de escribir NewVar se oprime la tecla ENTER

Entre comillas “ “

Significa que el valor de CharVar es justamente “Gene1”

tabla de datos

númerica carácter

Este ejemplo interprételo de la siguiente manera: hay 8 individuos (una muestra), y en un determinado sitio del genoma se “midió” el par de bases de nucleótidos

Esta función summary( ) realiza el cálculo de las frecuencias para cada nivel.

Como podemos observar, la entrada de la función matrix ( ) es un vector conteniendo los elementos de la matriz, empezando por la esquina izquierda para formar la primera columna de ocho filas, y luego empezando nuevamente otra vez desde arriba para completar la segunda columna. El número de filas está especificado por la instrucción nrow = 8

Se ha formado la misma matriz “uniendo” los vectores columnas x1 y x2.

Indica que es efectivamente una matriz de caracteres

Indica que la entrada (1, 2), primera fila y segunda columna, es el par “GC” recalcando que se encuentra en la segunda columna llamada x2

Indica que la matriz X es esencialmente un vector de longitud 16, y conserva las posiciones donde los primeros 8 elementos corresponden a la primera columna y los 8 restantes a la segunda columna

Esta función entrega las dimensiones de la matriz y los nombre de filas y columna. En este caso no tienen nombre las filas de esta matriz y sí para las columnas.

Cada atributo puede imprimirse separadamente, por ejemplo

Una gran tabla de datos en el Internet

Indica que en la primera fila del archivo de texto está el nombre de la variable

Indica que en la primera fila del archivo de texto son datos

Indica que los datos están delimitados por por tabulación (tab)

Indica que los datos están separados por columnas

Indica que los datos están separados por uno o más espacios

Sitio donde se encuentra el archivo llamado FMS_data.txt en el Internet

Renombramiento y configuración de los datos para su lectura

En el script

En la consola del R

single-nucleotide polymorphisms

La función que construye una tabla de datos

Observemos que podemos “aislar” los datos por columna con la instrucción $ seguido del nombre de la columna

Bajo contexto, trabajando con esa tabla de datos y para citar a la columna “rapiodamente, usamos la instrucción

… luego llamamos a las diferentes columnas de la tabla mediante su nombre

Recuerde que está “adjuntado” la tabla Datamuestra, y por eso utilizamos solo los nombres de las columnas

Observe las diferentes maneras de obtener el porcentaje del género

Observe el paso de codificación de caracteres a codificación numérica, en este caso 1 = mujer y 0 = hombre

Esta instrucción considera la segunda y cuarta columna

Esta instrucción “condiciona” solo los valores para el género mujer

Esta instrucción considera solo la tercera fila

Esta instrucción considera solo la cuarta columna