2010 MGEL OT

2010. 2. 18-19

서울교육문화회관

송민교 성현아

발표 내용

BRL 과제1

위암 환자 대조군 연구2

Basic Research Laboratory

한국연구재단 기초연구사업사업 구조개편 내용 (2009년 4월)

한국연구재단 기초연구사업사업 구조개편 내용 (2009년 4월) – 집단 연구

구 분

사업

사업목적 및 특성 지원대상

최대 최대

사업명 연구 유형 지원규모 지원기간

집단연구

기초연구실(BRL)

특정 연구주제ㆍ분야를 중심으로 학과내 임계 연구그룹의 형성을 지원하여 국가경쟁력강화

대학 내 학과/학부 단위의연구조직

5억 5년(3+2)

(교수 4~5인)

선도 이공학분야

기초과학에 대한심층적 창의적 연구수행과 산업발전과 연계된 기초원천기술 연구수행및 우수인력 양성

이공계 석ㆍ박사과정

10억 7년(4+3)

연구 설치 대학

센터 기초기초의과학연구중심의

의ㆍ치ㆍ한의과대학 및

3-10억 9년(2+3+4)

(ACE) 의과학연구와 우수인력양성

약학대학

분야

학제간

창의적 기초연구및 핵심원천기술중심의 미래융합기술분야 연구 및 우수인력 양성

이공계 석ㆍ박사과정 설치 대학, 학제전공 대학원과정 신설과연계

20억 7년(1+3+3)

융합

분야

기초연구실 육성사업(BRL)

• 대학내 연구 기본단위인 교수의 개인 연구실을 학과/학부 단위의기초연구실로 육성시켜 대학의 잠재적 우수연구집단 육성

• 선정과정=>2009년 4월 30일 신규사업공고

-> 8월 28일 최종과제 공고

평가분과명 연구유형 연구과제명연구책임자

소속기관

의약학 실험중심 분자유전체암역학연구실 강대희 서울대학교(연건)

의약학 실험중심감염성, 식이성 및 환경성염증질환 제어기술 구축

정원일 한국과학기술원

의약학 실험중심수용체-리간드 기초연구

실김경만 전남대학교

의약학 실험중심신경퇴행 분자기전 및 제

어기술이명구 충북대학교

1차 선정 과제(의약학분야)

연구책임자 주관기관 연구과제명 연구유형

강대희 서울대(연건) 분자유전체 암역학 연구실 실험중심

고성은 건국대 다양체의 대역구조 연구실 이론중심

박철홍 부산대 비정질 산화물 기초 연구실 실험중심

박충년 전남대모바일 수소저장용 하이브리드

신소재 및 평가기술 개발연구실실험중심

이용희 KAIST생체물리를 위한 광학적 나노제

어 연구실실험중심

이창희 강원대헤테로 고리 기반 형광 나노바이

오소재 개발 및 특성 연구실실험중심

정헌택 울산대Meta-inflammation 제 어 기 전

연구실실험중심

조광현 KAIST

바이오메디컬 응용을 위한 생체

회로 시뮬레이션 IT 융합플랫폼

기술 개발 연구실

실험중심

주종남 서울대(관악)

멀티 스케일 다중 전개형 협업 로

봇의 설계 및 생산기술 개발 연구

실

실험중심

지성길 고려대 EMT 신호 조절 기작 연구실 실험중심

최종 선정 과제

(총 7개 분야, 31개 연구실 선정)

(10개 연구실 선정)

분자유전체암역학연구실Molecular & Genomic Cancer Epidemiology Laboratory

연구책임자: 강대희 (분자유전체역학, 예방의학)

연구원: 박웅양 (분자유전체의학, 생화학)

박수경 (암유전역학, 예방의학)

김윤준 (분자종양학, 간연구소)

이경무 (분자역학, 예방의학)

2009년 기초연구실사업(BRL) 신규과제

일반인구집단:역학적 응용

위험도 계산

모델 구축

모델 선별 및 검증

환자군 집단:임상적 응용

암 발생 및 재발위험도 모델 개발

위해도예측모델

miRNA profiling

DNA methylation

CNV/SNP/GWAS

Proteomics

바이오마커발굴

다중 생명정보동시분석

역학 연구기반 (DB, 바이오뱅크)

내적타당도

외적타당도

바이오마커타당도 검증

분자바이오마커

위험요인 데이터 구축

정상인 코호트 환자군환자-대조군1단계:YR1 ~ YR3

1단계:YR1 ~ YR3

2단계:YR4 ~ YR5

단계별 연구추진 체계

-총연구기간 : 2009. 09. 01 –2014. 02. 28 (54개월)-다년도협약연구기간 : 2009. 09. 01 - 2012. 02. 29 (30개월)

연구실 조직 및 핵심연구원의 역할

유전체분석기법 평가

유전체분석 수행

대용량 데이터 관리/분석

역학 연구기반 구축 및 관리(생체시료, 설문, 임상정보) 코호트 및 환자-대조군 연구

암 발생 및 재발 위험도예측 모델 개발

환자군 임상 정보 확보

바이오마커의 임상적 타당성 검증

약물치료효과 평가

역 학

:박수경, 이경무

분자유전체

역학연구실

:강대희

분자유전학

:박웅양 분자종양학

:김윤준

1차년도 연구 기간(2009. 09. 01~2010. 03.15) (6.5개월)

• 역학연구기반 확충(DB, 바이오뱅크)- 위암, 갑상선암 환자-대조군 연구- 연구 프로토콜 구축- 연구자 네트워크 강화

• 매월 1, 3 주 수요일 5pm 정기 세미나 (대학원강의실 308호)- 10/7 숙명여자대학교 박종훈 교수님- 11/4 경희대학교 최정혜 교수님- 11/18 연세대학교 권영근 교수님

• 매월 2, 4 주 수요일 5pm 실무자 회의

• 각종 연수 및 W/S 지원

2차년도 연구 기간(2010. 03. 16~2011. 03.15) (12개월)

• 역학 자원 확충 원년[DB, 바이오뱅크) ; 강대희, 박수경, 이경무교수님- 위암, 갑상선암 환자-대조군 연구- 세부 프로토콜 점검, 대조군 확정, 연구 가설 정립- 목표 대상자수 위암, 갑상선암, 대조군 각 400 건 이상

• 간암의 세부 암종에 대한 진단 바이오마커 발굴 ; 김윤준 교수님간암 시료 및 임상자료 기확보- mRNA-miRNA profiling 동시 분석

• 유방암 세부 암종에 대한 진단 바이오마커 발굴 ; 박웅양 교수님- mRNA-miRNA profiling 동시 분석- MeDIP 기반 methylation 패턴 분석

2차년도 연구 기간(2010. 03. 16~2011. 03.15) (12개월)

• BRL 세미나 ; 매월 첫째 또는 둘째주 수요일 5pm (예방의학교실회의실)- 3월 10일 연세대학교 권영근 교수님- 4월 7일 KRIBB 김용성 교수님- 5월 12일 삼성의료원 김동환 교수님 (* 오후 5:30) - 6월 2일 경희대학교 윤경식 교수님

• 매월 1 회 월례회 실시 (둘째 주 목요일 점심]

• 각종 연수 및 W/S 지원

• 연구모임

위암 환자-대조군 연구

Gastric Cancer Case-Control Study

• 위암은 전세계적으로 발생률이 점차 감소하고 있지만, 여전히 암발생률 4위를 차지하고 있고, 예후가 좋지 않아 사망률로는 2위를 차지 (2002년 기준)

• 세계적으로 차이가 있는데, 우리나라와 일본이 높음

• 전체적인 발생률은 감소하는 반면, 분문부 위암은 증가 추세

• 우리나라에서 가장 흔한 암 (남자 전체 암 발생자 중 약 24% (1위) , 여자 전체 암 발생자 중 약 15.3% (2위), [3위 2005년 기준])

• 남녀 비=2~4 :1

• 발생률은 제일 높지만 2004년 사망률은 폐암에 이어 두번째

• 조기에 진단되는 경우가 점차 늘고 있고, 수술 방법의 발전과 항암제 등의 발달 등에힘입어 치료 효과 또한 향상되고 있기 때문에 사망률은 계속 감소하고 있는 추세

• 고연령에서 높은 발생/사망

위암 발생의 역학적 특징

Increase Risk Decrease riskFamily historyDiet (high in nitrates, salt, fat)Familial polyposisGastric adenomasHereditary nonpolyposis colorectal cancerHelicobacter pylori infectionAtrophic gastritis, intestinal metaplasia, dysplasiaPrevious gastrectomy or gastrojejunostomy (> 10 years ago)Tobacco useMenetrier’s diseaseEbstein-Barr virusObesityLow SESGeography (developing countries)Bile refluxPernicious anemiaAgeHypochlorhydria

AspirinDiet (high fresh fruit and vegetable intake)Vitamin C

Factors Increasing and Decreasing the Risk for Gastric Cancer

Modified from M. Verma (ed.), Methods of Molecular Biology, Cancer Epidemiology, vol. 472,2009 Humana Press

Abnormalities Genes (approximate frequency, %)Deletion/suppression P53 (60-70%), FHIT (60%), APC (50%), DCC (50

%),E-cadherin (<5%)

Amplification/overexpression

COX-2 (70%), HGF/SF (60%), VEGF (50%), c-met (45%), AIB-1 (40%), β-catenin (25%), k-sam (20%), ras (10-15%), c-erb B-2 (5-7%)

Microsatellite instability (25-40%)

DNA aneuploidy (60-75%)

Genetic Abnormalities in Gastric Cancer (ref. Scwartz’Surgery)

연구 배경 및 필요성

• 위암-환자 대조군 연구는 2009년도 기초연구실사업 (교육과학기술부 과제) 중 하나

• 위암의 역학적/임상적 중요성에 비해 잘 기획된 연구가 부족한 실정

• 특히 명확한 노출평가 등의 부재로 임상 자료와의 연계가 부족하여위암의 원인/예후 인자에 대한 파악이 미흡

• 또한 cardia/noncardia의 해부학적 분류나 조직학적 분류 등에 따른 위험요인을 밝히거나, 여러 biomarker를 이용한 분자유전학적연구가 필요

연구 목적

• 기존 연구들에 비해 해부학적 분류/조직학적 분류에 대한정보와 함께 보다 명확한 노출평가에 초점을 맞춘 설문지와각종 생체지표를 이용하여 평가하고자 함(alcohol/smoking/diet/약물력 등)

① 기존의 알려진 위험인자의 확인과 논란이 있거나 가설수준의 위험인자에 대한 확인

② 위암은 조기발견이 용이한 질환이나 (위내시경) - 암 발생및 예후와 연관된 새로운 분자유전학적 biomarker 개발

③ 발굴된 분자유전학적 biomarker의 활용 적합성을 검증(validation study)

④ 개별적 암위험도를 평가하는 예측모델 개발

연구 개요

• 병원 환자-대조군 연구

• 다기관 공동연구 (서울대 예방의학교실을 중심으로 서울대 본원 내과/외과, 분당건강검진센터 등)

• 1차년도는 연구 setting을 목적으로 연구디자인, 네트워크 생성, 설문지 개발에 중점을 둠.

• 전체적인 규모는 3년간 환자, 대조군 각 2000명 이상

연구기관 네트워크

서울의대분자유전체역학연구실

서울대병원(본원) 서울대병원(분당)

내과

외과

병리과

설문지개발

시료관리

데이터관리

건강검진센터

1차년도 연구 추진 현황

9월 12월 1월 2월

서울대 병원 환자 현황

병원 교수님 연간 수술건수

서울대 외과 본원 이건욱, 양한광, 이혁준 700~900

분당 김형호, 박도준 400~500

서울대 내과 본원 김상균EMR+ESD

= 200(adenoma)+200(EGC)

분당 박영수 50

국립암센터 700

보라매 70~80

Total 연간 2000여건

- 대조군 : 가정의학과/검진센터 biopsy (25명/일)

환자, 대조군 선정 방법

<환자선정>- Case definition : 임상적/병리조직학적으로 새로 확진된 위암환자(incident case)- 대상병원/과 : 서울대학교병원 (내과/외과)- 제외기준이들 잠정적 환자군 중 설문에의 응답거부 혹은 주소불명 등의 이유로 환

자군이 될 수 없는 경우는 연구대상에서 제외

<대조군 선정>- control definition : 대조군은 환자군과 동 기간동안 같은 지역 의료기관에서

1) 검진을 목적으로 하여 내원한 환자 2) Ulcer 진단 중 과거 암병력이 없고, 위 수술을 받지 않은 대상으로 선정- - 제외기준 : 환자군과 동일

연구 추진 체계

1) 서울대 예방의학교실 : 전체 연구 디자인 설계 설문지/CRF 개발, IRB 신청, 설문조사, 임상정보 수집, 시료수집, 면접원 교육

2) 서울대병원(본원): 외과, 내과 – 환자군 모집

3) 서울대병원[분당]

: 건강검진 센터 – 대조군 모집

시료 수집

채취 량 용기 시료종류 시료량 보관용기 보관량 보관 방법 비고

blood 8cc EDTA DNA 1cc e-tube 3 vialpaper box (9*

9)deep freezer

whole blood

2cc e-tube 0.5cc * 4paper box (9*

9)deep freezer

plasma 5cc e-tube 0.5cc * 4 paper box (9*

9)deep freezer

8cc SST serum 8cc e-tube 0.5cc * 7paper box (9*

9)deep freezer

갑상선의 경우

serum 0.5cc*2 vial을외과팀에게

urineurine cup

urine 10cc e-tube 1cc * 6paper box (9*

9)deep freezer

설문지

• 위암 기본설문지 - 대도시건강검진 코호트설문지 기반, 불필요 문항삭제

• 위암 추가설문지 - 잠재적위험 요인에대한 추가 문항

설문지 구성

• 일반사항교육수준, 결혼상태, 평균수입, 가족수, 거주지역/기간, 직업력

• 체중현재 체중/키, 체중변화, 다이어트 여부

• 흡연흡연여부, 총흡연량, 간접흡연

• 음주음주여부, 음주종류/량

• 운동, 신체활동평상시 신체활동, 규칙적인운동 여부/종류

• 여성력초경, 생리주기, 폐경여부, 피임약/호르몬제 사용여부, 불임치료, 임신력, 여성암 (유방, 자궁근종, 난소암, 자궁내막암)

• 과거력/수술력/약물복용력

• 식이설문

연구수행 모식도 - 외과

연구수행 모식도 - 내과

과제 진행 상황

• 랩지노믹스 계약 완료 [2/12]

• IRB 1차 심의 신청(1/25) 신속심의 결과 발표(2/12, 수정 후 재심의] IRB 2차 심의 신청(-2/24]

• 대조군 시료 수집 세부 사항 논의중 [2/18, 분당병원회의]

• IRB 승인 후 연구 수행 가능성 및 효율성 타진을 위한pilot study 시작

감사합니다