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20161008 MAPワークショップ事前学習 配布版

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先人に学ぼう!- 系統的な文献検索と批判的吟味 -

事前学習

兵庫県立尼崎総合医療センターHospital Care Research Unit

片岡裕貴、辻本啓、辻本康

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ある大学院生の実例

卒後6年目まで感染管理チームとして働いた肺癌の患者さんで発熱性好中球減少症を起こしても、血液培養が陽性になることは少ないな

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疑問の構造化

P :発熱性好中球減少症患者E :重症度高い (MASCC スコア +α で定義 )C :重症度低いO :血液培養の陽性

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4 週間後

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ところが、先行研究の Related citations に

Ha YE, Song J-H, Kang WK, Peck KR, Chung DR, Kang C-I, et al. Clinical factors predicting bacteremia in low-risk febrile neutropenia after anti-cancer chemotherapy. Support Care. 2011;19(11):1761–7.

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Step 2: 先人に学ぶ

わかっていること先行研究の系統的検索と吟味

わかっていないこと→何を明らかにしたいのか?

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構造化された疑問からどのデータベースでどんな検索式を使って文献を検索しどんな条件で該当する文献を選択するかを定義する

Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0. The Cochrane Collaboration; 2011

系統的検索 (Systematic Search)

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この WS 全体の行動目標

・系統的検索と発見的検索の違いを説明できる・統制語について説明できる・ PubMed advanced のための、系統的な検索式を作成できる・見つけた先行研究を自分の研究に活かすための交絡に関する批判的吟味ができる

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事前学習の目標

・系統的検索と発見的検索の違いを説明できる・統制語について説明できる

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PubMed 検索式について正しいものを全て選べ

• PubMed ではアスタリスク "*" を用いることで前方一致検索を行うことができる

• フレーズ検索 ( 熟語検索 ) を行う場合は、フレーズを「」でくくる

• PubMed Advanced で検索式を掛け合わせるときにAND や OR を用いる場合、 AND や OR はアルファベットの大文字でも小文字でもどちらでも良い

• PubMed Advanced において検索語の語尾の [tiab]といったサーチタグは主に MeSH を用いた検索のために使用される

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統制語について正しいものを全て選べ

• 統制語には上位概念と下位概念がある

• PubMed 検索する際に用いられている統制語はMeSH と呼ばれる

• 統制語は更新され付け替えられることがある

• 検索したい概念の統制語がないことがある

• ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率がともに上昇する

• 心不全 (Heart Failure) の MEDLINE での統制語に heart failure syndrome [mh] がある

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検索についてどの程度知っていますか?

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???

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Question

今日の夕方の天気は?

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発見的検索と系統的検索

発見的検索 系統的検索

目的 適当な情報を一本釣りする 全体像を把握する

日常の検索 向く 不向き

問に対する答え

1つあれば十分他に何があるか、は問題ではない

該当するものすべてが必要

やり方 より答えの出る確率の高い検索ワードを選ぶ該当するものの一部だけを見て選ぶ

記録 残らない 必ず残す( 検索日、データベース 検索ワード )

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諏訪 , 2013

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系統的検索のもっともよい方法?

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系統的検索のもっともよい方法

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諏訪 , 2013

全部読む

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流石にそれは無理なので

検索システムにお願い!

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諏訪 ,山下 , 2015

だけ抽出

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検索システムごとの差

命令そのまま• Cochrane Library• PubMed(Advanced)• Ovid Medline• 医中誌

裏でいろいろと気を回してくれる• PubMed• Google Scholar

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検索システムごとの差

命令そのまま• Cochrane Library• PubMed(Advanced)• Ovid Medline• 医中誌

裏でいろいろと気を回してくれる• PubMed• Google Scholar

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データベース

医学分野では

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http://onlinelibrary.wiley.com/cochranelibrary/search?searchRow.searchOptions.searchProducts=clinicalTrialsDoi

http://login.jamas.or.jp/

http://www.embase.com/login

参考 ) http://handbook.cochrane.org/chapter_6/6_2_1_3_medline_and_embase.htm

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検索システム

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http://onlinelibrary.wiley.com/cochranelibrary/search?searchRow.searchOptions.searchProducts=clinicalTrialsDoi

http://login.jamas.or.jp/

http://www.embase.com/login

参考 ) http://handbook.cochrane.org/chapter_6/6_2_1_3_medline_and_embase.htm

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/advancedhttp://ovidsp.tx.ovid.com

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網羅的な検索式をつくる

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問題提示

糖尿病の医療費は1兆2088億円

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インドア派:トジルDr.GWも自宅で文献検索

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漠然とした疑問

トジル Dr. の漠然とした疑問

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糖尿病の患者さんに対して減量手術を行っているときいた。そんな蛮行ゆるされるのか・・・かえって死をはやめるのでは?現存するエビデンスを調べたい。

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先輩の意見

都合の良い文献だけを pick upして紹介して、エビデンスが有ると主張してもダメです。

やっていることはセールスマンとかわらないですね。

フェアーな臨床的判断をするためには、現存するすべての関連する研究を総括したのちに、判断する必要が有ります。

また、その判断に至ったまでの過程を見える化する必要があります。

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構造化された疑問をそのまま検索式に

#1 AND #2 AND #3 →  140 件

これでいいでしょうか?

2015/4/3 実施

P: 糖尿病患者 # 1  diabetesI: 減量手術 # 2  gastrectomyC: 手術しないO: 死亡 # 3  death OR

mortality

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検索のポイント 0

検索の”網羅性と適合率”

網羅性 : 関連のある研究をできるだけ拾う適合率 : 関連のない研究をできるだけ拾わない

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検索のポイント 1 構造化からの検索式

※治療・介入に関する検索の場合Patients #1 健康状態を示す用語ANDIntervention/Exposure #2 介入 /暴露を表す用語

http://handbook.cochrane.org/chapter_6/6_4_2_structure_of_a_search_strategy.htm

※アウトカムに関連する用語は入れない! 必ずしも抄録に書かれていないことがある

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検索のポイント 2

統制語 (controlled indexing terms) を使う

データベース毎に固有のものがある例 :MeSH (MEDLINE), EMTREE (EMBASE)

“gastric resection” や” partial gastrectomy” の MeSH は” gastrectomy”

注意点:その MeSH word がいつ作られたかもチェック

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つまり

「胃切除術」という概念を検索したいとき

“gastrectomy” というキーワードのみで検索すると MEDLINE に収載されている抄録の中で、 “ gastrectomy” が入っているもののみを検索する→”Reau-en Y procedure” とだけ抄録に書かれていたら検索できない!

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だから MeSH を知ろう!

Medical Subject Headings

MEDLINE で検索可能な各論文に人力で付与されているキーワード階層性があるので、その上位、下位のどこまで検索するかを規定することができる

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PubMed のアブストからだと

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類似語

上位概念 下位概念

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検索のポイント 3

キーワードも加える

MeSH をつけているのは必ずしもその分野の専門ではない司書さんです。また、つけるまでに一定のタイムラグがあります。なので、追加で関連しそうなキーワードもOR で検索しておきましょう。

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再出: PICO を検索式に

#1 AND #2 AND #3

2015/4/3 実施

P: 糖尿病患者 # 1  diabetesI: 減量手術 # 2  gastrectomyC: 手術しないO: 死亡 # 3  death OR

mortality

どこがマズイか分かりますか?

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PICO を検索式に

#1 AND #2 AND #3

P: 糖尿病患者 # 1  diabetesI: 減量手術 # 2  gastrectomyC: 手術しないO: 死亡 # 3  death OR

mortality

ポイント 1 構造化からの検索式アウトカムは検索ワードに入れない!

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再出: PICO を検索式に

#1 AND #2 AND #3

P: 糖尿病患者 # 1  diabetesI: 減量手術 # 2  gastrectomyC: 手術しないO: 死亡 # 3  death OR

mortality

ポイント 2 統制語統制語を使っていない!

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再出: PICO を検索式に

#1 AND #2 AND #3

P: 糖尿病患者 # 1  diabetesI: 減量手術 # 2  gastrectomyC: 手術しないO: 死亡 # 3  death OR

mortality

ポイント 0 網羅性ポイント 4 キーワードを OR で加え

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なんとなくわかった

具体的にどうすれば?

以下、 2016/5/20 実施

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Mesh の検索画面へ

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まずは P に関する言葉を入れる

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結果からぴったりなものを探して選択

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上位?下位?

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MeSH の解説を読む

Diabetes Mellitus, Type 2

Year introduced: 2005 (1984)

Previous Indexing:Diabetes Mellitus (1966-1983)

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I を示す MeSH を同じように検索

Gastrectomy

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たしか、 Bariatric surgery とも呼んだはず

Gastrectomy とは別だった!

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つづいて検索の実行へ

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MeSH にはお経のように [mh] をつける!

Diabetes Mellitus, Type 2[mh]

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こんな感じになります

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I の概念は 2 つあったので”OR” 大文字 でつなぎましょう

# 2 OR #3

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最後に P と I をつなぎます

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MeSH にキーワードを掛け合わせる場合

dm[tiab]タイトルとアブストラクトの部分から検索(著者名などは除いて)

“metabolic surgery”[tiab]2単語は引用符でつなぐ

小文字と大文字は区別されない

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例えばこんな風に

#1 Diabetes Mellitus, Type2[mh]#2 dm[tiab] OR diabetes[tiab]#3 #1 OR #2#4 Gastrectomy[mh] #5 Bariatric Surgery[mh]#6 “gastric resection” [tiab] OR gastrectomy [tiab] OR “metabolic surgery” [tiab] OR “weight loss surgery”[tiab]#7 #4 OR #5 OR #6#8 #3 AND #7

DM

胃切除

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他の細かいルール:キーワード検索のために

http://www.lib.med.kyoto-u.ac.jp/pdf/pubmed_howto.pdf

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事前学習の目標

・系統的検索と発見的検索の違いを説明できる・統制語について説明できる

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PubMed 検索式について正しいものを全て選べ

• PubMed ではアスタリスク "*" を用いることで前方一致検索を行うことができる

• フレーズ検索 ( 熟語検索 ) を行う場合は、フレーズを「」でくくる

• PubMed Advanced で検索式を掛け合わせるときにAND や OR を用いる場合、 AND や OR はアルファベットの大文字でも小文字でもどちらでも良い

• PubMed Advanced において検索語の語尾の [tiab]といったサーチタグは主に MeSH を用いた検索のために使用される

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答え

• PubMed ではアスタリスク “ *” を用いることで前方一致検索を行うことができる →○

• フレーズ検索 ( 熟語検索 ) を行う場合は、フレーズを「」でくくる → X “” でくくる

• PubMed Advanced で検索式を掛け合わせるときに ANDや OR を用いる場合、 AND や OR はアルファベットの大文字でも小文字でもどちらでも良い → X 大文字のみ

• PubMed Advanced において検索語の語尾の [tiab] といったサーチタグは主に MeSH を用いた検索のために使用される 

  → X タイトルとアブストから文字列を検索

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統制語について正しいものを全て選べ

• 統制語には上位概念と下位概念がある

• PubMed 検索する際に用いられている統制語はMeSH と呼ばれる

• 統制語は更新され付け替えられることがある

• 検索したい概念の統制語がないことがある

• ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率がともに上昇する

• 心不全 (Heart Failure) の MEDLINE での統制語に heart failure syndrome [mh] がある

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答え

• 統制語には上位概念と下位概念がある→○

• PubMed 検索する際に用いられている統制語はMeSH と呼ばれる→○

• 統制語は更新され付け替えられることがある→○

• 検索したい概念の統制語がないことがある→○

• ぴったり合った統制語があると網羅性と適合率がともに上昇する→○

• 心不全 (Heart Failure) の MEDLINE での統制語に heart failure syndrome [mh] がある→○

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質問?

[email protected]まで

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事前課題

ここまでの知識を元に実施し、お送りしたフォームに入力してください

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参考資料

参考資料:• 京都大学医学図書館 "基礎から学ぶ

PubMed の使い方 " http://www.lib.med.kyoto-u.ac.jp/pdf/pubmed_howto.pdf

  Last accessed 8/7/2016• 諏訪敏幸『看護研究者・医療研究者のた

めの系統的文献検索概説』第一版 近畿病院図書室協議会 (2013)