TUGAS BIOLOGI SEL

TUGAS BIOLOGI SELNama: Rizqi Fauzia

NIM: 142210101091

KELAS: A

1. Gen 1

source 1..1473

mol_type="genomic DNA"

promoter2..7

note="-35 region"

promoter23..30

note="-10 region"

RBS 50..55

note="pot. ribosome binding site"

CDS 61..1383

terminator1417..1459

note="pot. stem-loop structure; pot. Transcription terminator"

1. tataaaatta ttatgttatt ctaataatgg ggattgaaac ttaactttta ggaggtttct

61.

atgaaaaatt acttatctat tggagtgatt gcactgctgt ttgcattaac atttggaaca121. gtcaagtcgg tccaagctat tgctgggtat ggatggctac cagaccgtcc acctatcaat

181. aacagccagt tagttgttag tatggccggt atcgttgaag gtaccgataa aaaagttttt

241. ataaattttt ttgaaatcga tctaacatca caacctgctc acggaggaaa gacagagcag

301. ggcttaagtc caaaatcaaa accatttgct acagataatg gcgcaatgcc acataaactt

361. gaaaaagctg acttattaaa agctattcaa aaacagctga tcgctaacgt tcacagtaac

421. gacggctact ttgaggtcat tgattttgca agcgatgcaa ccattactga tcgaaacggc

481. aaggtctact ttgctgacaa agatggttcg gtaaccttgc cgacccaacc tgtccaagaa

541. tttttggtta aaggacatgt gcgcgttaga ccatataaag aaaaaccagt acaaaatcaa

601. gcaaaatctg ttgatgtaga atatactgta cagtttactc ctttaaaccc tgatgacgat

661. ttcagaccag ggctcaaaga tactaagcta ttgaaaacac tagctatcgg tgacaccatc

721. acatctcaag aattactagc tcaagcacaa agcattttaa acaaaaccca cccaggctat

781. acgatttatg aacgtgactc ctcaatcgtc actcatgaca atgacatttt ccgtacgatt

841. ttaccaatgg atcaagagtt tacttaccat gtcaaaaatc gggaacaagc ttatgagatc

901. aatcctaaaa caggtattaa agaaaaaacg aacaacactg atctggtctc tgagaaatat961. tacgtcctta aacaagggga aaagccgtat gatccctttg atcgcagtca cttgaaactg1021. ttcaccatca aatacgttga tgtcaacacc aacgaattgc taaaaagcga gcagctctta1081. acagctagcg aaggtaactt agacttcaga gatttatacg atcctcgtga taaggctaaa

1141.ctactctaca acaatctcga tgcttttgat atcatgaact ataccttaac tggaaaagta

1201.gaggataatc acgataagaa taatcgtgtc gttacagttt atatgggcaa gcgccctaaa

1261.ggggcaaagg gtagctatca tttagcttat gataaagatc tctataccga agaagaacga1321.aaagcttaca gctacctgcg ttatacaggg acacctatac ctgataaccc taacgacaaa1381.taaccacgat cttctaaaat gatgagatta actgacaaaa aaagcaagca acatgctatc1441.aacagttgct tgcttttttc taacctctta gtt

Keterangan :

Merah = promoter

atg aug = kodon start Biru = RBS

taa uaa = kodon stop Hijau = terminator

Abu- abu = CDS

Jawaban :

1. Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai transkripsi

CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan

Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi

RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom

2. ATG AAA AAT TAC TTA AUG AAA AAU UAC UUA

Met Lys Asn Tyr Leu

61.

augaaaaauu acuuaucuau uggagugauu gcacugcugu uugcauuaac auuuggaaca

121. gucaagucgg uccaagcuau ugcuggguau ggauggcuac cagaccgucc accuaucaau

181. aacagccagu uaguuguuag uauggccggu aucguugaag guaccgauaa aaaaguuuuu

241. ataaauuuuu uugaaaucga ucuaacauca caaccugcuc acggaggaaa gacagagcag

301. ggcuuaaguc caaaaucaaa accauuugcu acagauaaug gcgcaaugcc acauaaacuu

361. gaaaaagcug acuuauuaaa agcuauucaa aaacagcuga ucgcuaacgu ucacaguaac

421. gacggcuacu uugaggucau ugauuuugca agcgaugcaa ccauuacuga ucgaaacggc

481. aaggucuacu uugcugacaa agaugguucg guaaccuugc cgacccaacc uguccaagaa

541. uuuuugguua aaggacaugu gcgcguuaga ccauauaaag aaaaaccagu acaaaaucaa

601. gcaaaaucug uugauguaga auauacugua caguuuacuc cuuuaaaccc ugaugacgau

661. uucagaccag ggcucaaaga uacuaagcua uugaaaacac uagcuaucgg ugacaccauc

721. acaucucaag aauuacuagc ucaagcacaa agcauuuuaa acaaaaccca cccaggcuau

781. acgauuuaug aacgugacuc cucaaucguc acucaugaca augacauuuu ccguacgauu

841. uuaccaaugg aucaagaguu uacuuaccau gucaaaaauc gggaacaagc uuaugagauc

901. aauccuaaaa cagguauuaa agaaaaaacg aacaacacug aucuggucuc ugagaaauau

961. uacguccuua aacaagggga aaagccguau gaucccuuug aucgcaguca cuugaaacug

1021. uucaccauca aauacguuga ugucaacacc aacgaauugc uaaaaagcga gcagcucuua

1081. acagcuagcg aagguaacuu agacuucaga gauuuauacg auccucguga uaaggcuaaa

1141.cuacucuaca acaaucucga ugcuuuugau aucaugaacu auaccuuaac uggaaaagua

1201.gaggauaauc acgauaagaa uaaucguguc guuacaguuu auaugggcaa gcgcccugaa

1261.ggggcaaagg guagcuauca uuuagcuuau gauaaagauc ucuauaccga agaagaacga

1321.aaagcuuaca gcuaccugcg uuauacaggg acaccuauac cugauaaccc uaacgacaaa

1381.uaa3. Da = 439 x 110 = 48290

kDa = 48290 / 1000 = 48.29

2. Gen 2

source 1..1095

/mol_type="genomic DNA"

promoter41..45

/note="-35 region"

promoter63..69

/note="-10 region"

RBS 106..111

/note="pot. ribosome binding site"

CDS 118..918

terminator1017..1049

/note="pot. stem-loop structure"

1. atcattaaat ataattaatt ttcttttaat atttttttaa ttgaatattt aagattataa

61.gatatattta aagtgtatct agatactttt tgggaatgtt ggatgaagga gataaaaatg121.aataagagtc gatttatttc atgcgtaatt ttgatattcg cacttatact agttcttttt181.acacccaacg tattagcaga gagccaacca gaccctacgc cagatgagtt gcacaaagcg

241.agtaaattca ctggtttgat ggaaaatatg aaagttttat atgatgatca ttatgtatca

301.gcaactaaag ttaagtctgt agataaattt ttggcacatg atttaattta taacattagt361.gataaaaaac tgaaaaatta tgacaaagtg aaaacagagt tattaaatga aggtttagca421.aagaagtaca aagatgaagt agttgatgtg tatggatcaa attactatgt aaactgctat

481.ttttcatcca aagataatgt aggtaaagtt acaggtggca aaacttgtat gtatggagga

541.ataacaaaac atgaaggaaa ccactttgat aatgggaact tacaaaatgt acttataaga

601.gtttatgaaa ataaaagaaa cacaatttct tttgaagtgc aaactgataa gaaaagtgta

661.acagctcaag aactagacat aaaagctagg aattttttaa ttaataaaaa aaatttgtat

721.gagtttaaca gttcaccata tgaaacagga tatataaaat ttattgaaaa taacggcaat

781.actttttggt atgatatgat gcctgcacca ggcgataagt ttgaccaatc taaatattta

841.atgatgtaca acgacaataa aacggttgat tctaaaagtg tgaagataga agtccacctt

901.acaacaaaga atggataatg ttaatccgat tttgatataa aaagtgaaag tattagatat

961.atttgaaagg taagtacttc ggtgcttgcc tttttaggat gcatatatat agattaaacc1021.gcacttctat attaatagaa agtgcggtta tttatacact caatctaaac tataataatt

1081.ggaatcatct tcaaa

Keterangan :

Merah = promoter

atg aug = kodon start Biru = RBS

taa uaa = kodon stop Hijau = terminator

Abu - abu = CDS

Jawaban :

1. Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai transkripsi

CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan

Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi

RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom

2. ATG AAT AAG AGT CGA AUG AAU AAG AGU CGA

Met Asn Lys Ser Arg

augaauaagaguc gauuuauuuc augcguaauu uugauauucg cacuuauacu aguucuuuuu

acacccaacg uauuagcaga gagccaacca gacccuacgc cagaugaguu gcacaaagcg

agtaaauuca ctgguuugau ggaaaauaug aaaguuuuau augaugauca uuauguaucagcaacuaaag uuaagucugu agauaaauuu uuggcacaug auuuaauuua uaacauuagu

gauaaaaaac ugaaaaauua ugacaaagug aaaacagagu uauuaaauga agguuuagcaaagaaguaca aagaugaagu aguugaugug uauggaucaa auuacuaugu aaacugcuauuuuucaucca aagauaaugu agguaaaguu acagguggca aaacuuguau guauggaggaauaacaaaac augaaggaaa ccacuuugau aaugggaacu uacaaaaugu acuuauaagaguuuaugaaa auaaaagaaa cacaauuucu uuugaagugc aaacugauaa gaaaaguguaacagcucaag aacuagacau aaaagcuagg aauuuuuuaa uuaauaaaaa aaauuuguaugaguuuaaca guucaccaua ugaaacagga uauauaaaau uuauugaaaa uaacggcaau

acuuuuuggu augauaugau gccugcacca ggcgauaagu uugaccaauc uaaauauuuaaugauguaca acgacaauaa aacgguugau ucuaaaagug ugaagauaga aguccaccuu

acaacaaaga auggauaa3. Da = 265 x 110 = 29150

kDa = 29150 / 1000 = 29,150

3. Gen 3

source 1..914

/mol_type="genomic DNA"

promoter148..177

/note="-35 and -10 regions"

RBS 340..344

/note="pot. ribosome binding site"

CDS 354..656

terminator668..713

/note="pot. stem-loop structure"

1 cagctggtgg ccgcgggagc gccgccgtcg ccgctggacg tgcccagtga cccgggtctg

61 cccgtgatgc aggggcaggt gcggtgaccc ggacattgca cctggcgtac ccggacacgc

121 tggcaaccag gaagcaaggg ggcgcccttg agtgctagca ctctcatgta tagagtgcta

181 gatggcaatc ggctaacccc tgcgtcggca cccgcgacga cggcgcgagg gcgcggacga

241 atgccgaatc acctggtaat tcggacggtt ccggggcacg ccccggaccg accgccaact

301 ccggtccggg cgagcgtccc gggctctgat ccaaatagtg gagggctcca atcgtggcga361 aggtgaacat caagccact gaggacaaga ttctcgtgca ggccaacgag gccgagacca421 cgaccgcgtc cggtctggtc attcctgaca ccgccaagga gaagccgcag gagggcaccg

481 tcgttgccgt cggccctggc cggtgggacg aggacggcga gaagcggatc ccgctggacg

541 ttgcggaggg tgacaccgtc atctacagca agtacggcgg caccgagatc aagtacaacg601 gcgaggaata cctgatcctg tcggcacgcg acgtgctggc cgtcgtttcc aagtagtaga

661 gcgtgttccg ccccggcgat ccccgtgctc accacgggtg atttccgggg cggcatgcgt

721 tagcggacta gccctgcgta gaggagcctg atgagcaagc tgatcgaata cgacgaaacc

781 gcgcgtcgcg ccatggaggt cggcatggac aagctggccg acaccgtgcg ggtgacgctg

841 gggccgcgcg gccggcatgt ggtgctggcc aaggcgtttg gcggacccac ggttaccaac

901 gacggcgtca cggt

Keterangan :

Merah = promoter

Biru = RBS

tag uag = kodon stop Hijau = terminator

Abu - abu = CDS

Jawaban :

1. Promoter, fungsinya adalah sebagai tempat RNA polymerase menempel dan memulai transkripsi

CDS, fungsinya adalah sebagai daerah yang akan diterjemahkan

Terminator, fungsinya adalah sebagai tempat pemberhentian pada proses translasi

RBS, fungsinya adalah sebagai tempat menempelnya ribosom

2. guggcga

aggugaacau caagccacuc gaggacaaga uucucgugca ggccaacgag gccgagacca

cgaccgcguc cggucugguc auuccugaca ccgccaagga gaagccgcag gagggcaccg

ucguugccgu cggcccuggc cggugggacg aggacggcga gaagcggauc ccgcuggacg

uugcggaggg ugacaccguc aucuacagca aguacggcgg caccgagauc aaguacaacg

gcgaggaaua ccugauccug ucggcacgcg acgugcuggc cgucguuucc aaguag3. Da = 99 x 110 = 10890

kDa = 10890 : 1000 = 10,890