TUGAS TULIS MATA KULIAH BIOLOGI MOLEKULER KWID PPDS 2012PPDS
Neurologi
Nama : 1. dr. Laila Zamhariro
2. dr. Henry Sugiharto
3. dr. Pinto Desti Ramadhoni
4. dr. Isma Yulianti
5. dr. Andika Okparasta
1. Mekanisme kerja antibiotika secara molekuler
Berdasarkan mekanisme kerjanya, antibiotika dibagi dalam 6
kelompok, yaitu : a. Inhibitor sintesis atau mengaktivasi enzim
yang merusak dinding sel bakteri sehingga menghilangkan kemampuan
berkembang biak dan sering kali terjadi lisis, mencakup golongan
Penicsillin, Polipeptida, sikloserin, basitrasin, vankomisin dan
Sefalosporin,misalnya ampisillin, penisillin G;b. Inhibitor
transkripsi dan replikasi, mencakup golongan Quinolone, misalnya
rifampicin,actinomycin D, nalidixic acid;c. Inhibitor sintesis
protein, yang mengganggu fungsi ribosom bakteri, menyebabkan
inhibisi sintesis protein secara reversibel, mencakup banyak jenis
antibiotik, terutama dari golongan Macrolide, Aminoglycoside, dan
Tetracycline, misalnya gentamycin, chloramphenicol,kanamycin,
streptomycin, oxytetracycline.d. Inhibitor fungsi membran sel,
mempengaruhi permeabilitas sehingga menimbulkan kehilangan senyawa
intraselular, misalnya ionomycin, valinomycin dan polimiksine
e. Inhibitor fungsi sel lainnya, misalnya difiksasi pada subunit
ribosom 30 S menyebabkan timbunan kompleks pemula sintesis protein,
salah membaca kode mRNA, produksipolipeptida abnormal. Contoh
aminoglikosida, golongan sulfa atau sulfonamida,
misalnyaoligomycin, tunicamycinf. Antimetabolit yang mengganggu
metabolisme asam nukleat. Contoh rifampin (inhibisiRNA polimerase
yang dependen DNA),azaserine2. Perpindahan resistensi antibiotika
melalui konjugasi, transporasi, transduksia. Konjugasi: Konjugasi
merupakan proses transfer materi genetik (DNA) antarsel dengan
memanfaatkan kontak antarsel berupa pilus yang akan menghubungan
sel donor dan sel resipien. Proses ini umunya hanya melibatkan
diparental mating yaitu sel donor dan sel resipien, namun juga
dapat dilakukan oleh triparental mating . Pada sistem diparental
mating, biasanya plasmid yang ditransfer merupakan
self-transmissible plasmid, salah satunya adalah F plasmid. Dengan
konyugasi, terbentuklah saluran antara isi sel kuman yang saling
berkonyugasi sehingga memungkinkan perpindahan berbagai komponen
antara kuman khususnya komponen pembawa faktor resistensib.
Transposisi:
Transposisi adalah perpindahan elemen loncat (transposon) ke
kromosom suatu bakteri. Transposon adalah sekuens DNA yang dapat
berpindah-pindah secara acak, baik pada kromosom sel yang sama
maupun antarkromosom. Transposon dapat melompat ke genom karena
adanya gen tnp penyandi transposase yang menyebabkan terjadinya
perpindahan secara autonom. c. Transduksi:
Pada transduksi, faktor resistensi dipindahkan dari suatu
mikroba resisten ke mikroba sensitif dengan perantaraan
bakteriofag. Dalam hal ini yang dipindahkan ialah suatu komponen
DNA dari kromosom yang mengandung faktor resistensi tersebut.
Potensi untuk mengadakan konyugasi ditentukan oleh suatu faktor
genetik dikenal sebagai faktor seks.
3. Resistensi akibat mutasiResistensi akibat mutasi merupakan
resistensi kromosomal. Resistensi kromosomal ini terjadi akibat
mutasi spontan dalam lokus yang mengontrol kepekaan obat
antimikroba yang diberikan. Adanya antimikroba bertindak sebagai
mekanisme selektif yakni membunuh bakteri yang peka dan membiarkan
tumbuh bakteri yang resisten. Kejadian ini dinamakan mutasi spontan
karena terjadi tanpa pengaruh ada tidaknya antimikroba tersebut.
Pertama, terjadi mutasi pada porin (lubang-lubang kecil) yang
terdapat pada dinding luar bakteri. Porin ini merupakan suatu jalur
bagi antibiotik untuk masuk dan secara efektif menghentikan
pertumbuhan bakteri. Akibat mutasi yang terjadi pada porin,
antibiotik tidak lagi dapat mencapai tempat kerjanya di dalam sel
bakteri.4. Sifat resisten sebagai marker genetik dalam rekombinasi
DNA5. Plasmid resistensPlasmid merupakan suatu elemen genetik (DNA,
plasmid) yang diperoleh dari DNA kromosom jadi merupakan suatu DNA
ekstrakromosomal yang dapat bereplikasi secara autonom dan bisa
ditemukan pada sel hidup. Faktor resistensi yang dipindahkan
terdapat dalam bentuk plasmid atau episom. Tidak setiap plasmid
dapat dipindahkan,yang dapat dipindahkan ialah plasmid R (plasmid
penular). Faktor R adalah sekelompok plasmid yang membawa gen
resistensi terhadap satu atau beberapa obat antimikroba. Gen
plasmid untuk resistensi antimikroba mengontrol pembentukan enzim
yang mampu merusak antimikrobia. Faktor R terdiri atas dua unit,
yaitu segmen RTF (Resistance Transfer Factor) dan determinan-r48
(unit-r). Segmen RTF memungkinkan terjadinya perpindahan dalam
faktor R. Masing-masing unit-r membawa sifat resistensi terhadap
satu antimikroba. Dengan demikian berbagai unit r pada plasma
faktor R membawa sifat resistensi terhadap berbagai antimikroba
sekaligus, misalnya sulfonamid, penisilin, kloramfenikol,
tetrasiklin dan sebagainya.
6. Cara deteksi molekuler mikroorganismea. Recombinant DNA
Technologyb. Cloning DNAc. Polymerase Chain Reaction (PCR)d.
Southern dan Northern Blotting. 7. Cara deteksi molekuler untuk :
Thypus, TBC, Lepra, Tetanus, Syphilis, Malaria dan penyakit infeksi
lainnyaa. ThypusDeteksi molekular sensitif untuk Thypus adalah
dengan metode PCR menggunakan serum darah. PCR menggunakan urine
dan feces juga dapat digunakan untuk mendiagnosis thypoid namun
sensitifitasnya rendah.
b. TBCTeknik Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP)
adalah salah satu metode untuk uji diagnostik molekuler TB.
Amplifikasi DNA bakteri dilakukan pada suhu tetap dengan
menggunakan multi primer. Penggunaan suhu tetap dapat mengeliminasi
pengadaan alat thermocycler yang sangat mahal yang biasa digunakan
pada proses amplifikasi DNA konvensional. Penambahan enzim
polymerase dalam proses reaksi juga mencegah kemungkinan terjadinya
inhibisi amplifikasi. Dengan prinsip amplifikasi DNA bakteri pada
suhu tetap serta deteksi hasil positif berupa presipitasi ataupun
pendar fluoresensi yang dapat diamati secara mudah. Metode lainnya
yaitu dengan metode PCR nested dan PCR dupleks.
c. LepraDiagnosis molekular untuk lepra adalah metode PCR
d. TetanusDiagnosis molekular untuk tetanus adalah metode PCRe.
SyphilisDiagnosis molekular untuk syphilis adalah metode PCR
f. MalariaDeteksi molekuler malaria yang paling banyak tersedia
yaitu QT-NASBA berdasarkan reaksi rantai polimerase (PCR).g.
HIVDeteksi molekuler HIV yaitu dengan tes reaksi berantai
polimerase (PCR) pada HIV sering pula dikenal sebagai tes beban
virus atau tes amplifikasi asam nukleat (HIV NAAT). PCR DNA biasa
merupakan metode kualitatif yang hanya bisa mendeteksi ada atau
tidaknya DNA virus. Sedangkan, untuk deteksi RNA virus dapat
dilakukan dengan metode real-time PCR yang merupakan metode
kuantitatif. Deteksi asam nukleat ini dapat mendeteksi keberadaan
HIV pada 11-16 hari sejak awal infeksi terjadi. Tes ini biasanya
digunakan untuk mendeteksi HIV pada bayi yang baru lahir, namun
jarang digunakan pada individu dewasa karena biaya tes PCR yang
mahal dan tingkat kesulitan mengelola dan menafsirkan hasil tes ini
lebih tinggi bila dibandingkan tes lainnya.h. DBD
Prinsip diagnosis molekular untuk DBD adalah metode PCR, yaitu
untuk melacak susunan RNA virus Dengue. RNA virus Dengue diperoleh
dari ekstraksi serum, plasma darah, atau sel dari jaringan tubuh
yang terinfeksi virus Dengue.
8. Penyakit- penyakit akibat kelainan C-Reactive Protein, pada
disiplin anda9. Obat-obat yang dibuat dengan teknologi biologi
molekuler,yang ada dipasaran saat ini sesuai disiplin spesialis
anda -. IVIG untuk penyakit SGBTUGAS TULIS MATA KULIAH BIOLOGI
MOLEKULER KWID PPDS 2012
PPDS Neurologi
Nama : 1. dr. Laila Zamhariro
2. dr. Henry Sugiharto
3. dr. Pinto Desti Ramadhoni
4. dr. Isma Yulianti
5. dr. Andika Okparasta
1. PREVALENSI KANKER DI INDONESIA, ASEAN, EROPA, USAa.
Prevalensi kanker di duniaKasus kematian akibat kanker diperkirakan
sekitar 12,7 juta dan 7,6 juta pada tahun 2008 di seluruh dunia,
dengan 56% kasus dan 64% kasus terjadi pada negara berkembang.
Kanker payudara pada wanita dan kanker paru-paru pada laki-laki
adalah kanker yang paling sering didiagnosis dan penyebab utama
kematian kanker untuk setiap jenis kelamin di kedua negara ekonomi
maju dan berkembang, kecuali kanker paru-paru didahului oleh kanker
prostat sebagai kanker yang paling sering di antara laki-laki dalam
ekonomi negara-negara maju. Kanker ini diikuti, tanpa urutan
peringkat tertentu, oleh lambung dan kanker hati pada pria dan
kanker leher rahim dan paru-paru pada wanita di negara-negara
ekonomi berkembang dan oleh kanker kolorektal dan paru-paru pada
wanita dan kolorektal dan kanker paru-paru atau prostat pada
laki-laki di negara berkembang.b. Prevalensi kanker di USA
Pada tanggal 1 Januari 2008, di Amerika Serikat terdapat
11.957.599 penduduk yang menderita kanker (5.505.862 laki-laki dan
6.451.737 perempuan). c. Prevalensi kanker di Indonesia
Berdasarkan patologi, terdapat 10 kanker yang memiliki
prevalensi tertinggi di Indonesia, yaitu ca. serviks, ca. payudara,
limfoma, ca. kulit, ca. nasofaring, ca. ovarium, ca. rectum, ca.
tyroid, ca. colon dan kanker dari jaringan lunak.
Table The 10 most frequent primary cancers in Indonesia:
pathology based 198891 No.1988
Site %1989
Site %1990
Site %1991
Site %
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.Cervix 18.41
Breast 11.59
Lymph node 4.91
Skin 8.24
Nasopharynx 8.15
Ovary 4.94
Rectum 4.42
Soft tissue 3.50
Thyroid 3.34
Colon 2.81 Cervix 18.61
Breast 12.60
Lymph node 4.48 Skin 8.37 Nasopharynx 5.95 Ovary 4.68 Rectum
4.68 Thyroid 3.42
Unknown P 6.24 Colon 2.88 Cervix 19.18 Breast 11.52 Lymph node
4.74 Skin 8.64 Nasopharynx 6.23 Ovary 4.95 Rectum 4.95 Soft tissue
2.75 Unknown P 4.41 Thyroid 3.26 Cervix 19.18
Breast 12.10
Lymph node 5.62
Skin 7.69
Ovary 5.31
Nasopharynx 5.64
Rectum 4.42
Thyroid 3.88
Soft tissue 2.58
Colon 2.82
Source of the table: CME. Prevention and Early Detection of
Cancer. Jakarta: Medical Faculty, University of Indonesia 1998.
d. Prevalensi kanker di Asia
Pada tahun 2002, 4,2 juta kasus kanker baru (39% dari kasus baru
didiagnosis di seluruh dunia)-terdapat di belas negara Asia yaitu:
Jepang, Taiwan , Singapura, Korea Selatan, Malaysia, Thailand,
Cina, Filipina, Sri Lanka, Vietnam, Indonesia, Mongolia, India,
Laos, dan Kamboja. Cina dan India. Pada 7 dari negara-negara Asia,
kanker paru-paru memiliki tingkat kejadian tertinggi (usia-standar)
dari semua kanker pada pria, dankanker payudara adalah kanker
insiden tertinggi untuk perempuan. Kanker paru-paru memiliki
tingkat kematian tertinggi (usia-standar) untuk laki-laki di
sebagian besar negara-negara Asia, dan peringkat kanker payudara
memiliki kematian tertinggi pada perempuan. Di sebagian besar
negara-negara Asia, kanker usus besar dan rektum adalah yang paling
umum di antara penderita kanker laki-laki; kalangan selamat
perempuan, kanker payudara adalah yang paling umum di kebanyakan
negara Asia.
Insiden tertinggi pada 15 negara Asia angka kejadian kanker pada
pria yaitu pada Taiwan, Korea, dan Jepang; tingkat kanker perempuan
jumlah insiden yang tertinggi di Taiwan, Singapura, dan Filipina.
Kanker paru-paru adalah kanker yang paling umum atau kedua paling
umum di antara laki-laki di semua negara Asia, tetapi untuk India,
Jepang, Mongolia, dan Taiwan. Kanker perut adalah kanker
insiden-angka tertinggi di kalangan pria dan wanita di Korea, itu
adalah yang paling umum di antara perempuan di Cina, dan yang
paling umum di antara laki-laki di Jepang. Di antara perempuan,
kanker payudara adalah kanker insiden tertinggi di 7
negara-Indonesia, Jepang, Malaysia, Filipina, Singapura, Sri Lanka,
dan Taiwan. 41% dari semua kanker yang baru didiagnosis pada
laki-laki, dan 37% dari kanker didiagnosis pada wanita berada di
lima belas negara Asia2. PREVALENSI KANKER DI BIDANG SPESIALIS
NEUROLOGITumor jinak memiliki prevalensi sekitar dua kali lebih
banyak pada orang dewasa (usia 20 tahun). Perempuan memiliki
tingkat insiden tumor otak secara keseluruhan 26,55 per 100 000
orang; laki-laki memiliki tingkat yang sesuai 22,37. Tumor jaringan
neuroepithelial adalah kelompok histologis yang paling umum dari
tumor otak ganas, terjadi lebih sering pada pria daripada wanita.
Glioblastoma yang terjadi 1,6 kali lebih banyak pada pria merupakan
tumor neuroepitelial yang paling sering dijumpai.Jenis yang paling
umum dari tumor otak orang dewasa jinak adalah meningioma, yang
adalah 2,3 kali lebih umum pada wanita dibandingkan pria, dengan
tingkat kejadian 12,42 per 100 000 berbanding 5,46 per 100 000
orang. Meningioma lebih banyak terjadi pada wanita. Hanya 2,1% dari
meningioma yang ganas. Tingkat insiden antara anak-anak berusia
0-19 tahun jauh lebih rendah dibandingkan pada orang dewasa (48,47
per 1 000 000 anak berbanding 24,55 per 100 000 orang dewasa), tapi
tumor lebih mungkin menjadi ganas pada anak-anak: 65,2% berbanding
33,7% menjadi ganas pada orang dewasa. Tumor jaringan
neuroepithelial lebih mungkin menjadi ganas pada orang dewasa,
sedangkan tumor sel germinal lebih mungkin menjadi ganas pada
anak-anak. Tumor pada selubung saraf jarang ganas, dan limfoma otak
relatif jarang terjadi pada orang dewasa dan anak-anak.Glioblastoma
adalah jenis yang paling umum dari tumor otak ganas, dengan insiden
tertinggi pada kulit putih. Dua jenis yang paling umum dari tumor
otak nonmalignant lebih tinggi di antara orang kulit hitam
dibanding kulit putih. Meningioma adalah tumor otak yang paling
umum, dengan insiden tertinggi pada perempuan kulit hitam (9,7 per
100 000 orang).
.
