2
Announcement of population data STR data for nine loci from Sri Lanka Neil Fernandopulle, Maya B. Gunasekera, Nalin C.W. Goonesekere * Department of Chemistry, University of Colombo, Colombo 3, Sri Lanka Received 13 January 2002; accepted 16 January 2002 Abstract Allele frequencies for the nine STRs CSF1PO, TPOX, TH01, D16S539, D7S820, D13S317, F13A01, FESFPS, and vWA) were obtained from a sample of 139±179 unrelated individuals born in Sri Lanka, from CTT, FFv and Silver III GenePrint kits of Promega Corporation. Keywords: Short tandem repeats; Population data; GenePrint; Sri Lanka Population: Unrelated healthy volunteer donors born in Sri Lanka. Extraction: Phenol-chloroform or Chelex-100. PCR: A 50±100 ng target DNA following manufacturer's Promega) instructions for GeneAmp 9600 thermal cycler Perkin-Elmer). Typing: Manual typing by polyacrylamide gel electro- phoresis followed by silver staining and comparison with allelic ladders Promega Corporation). Results: See Table 1. Quality control: Allelic ladders, pGEM DNA size mar- ker and K562 DNA positive control Promega Corporation) were used. Analysis of data: GENEPOP [1] and PowerStats Pro- mega Corporation) computer programs. Access to data: by e-mail: Forward requests via e-mail: [email protected]. Other remarks: Interclass correlations yielding P < 0:05 for pairwise comparisons for F13A01/vWA and FESFPS/ vWA loci. Forensic Science International 126 2002) 93±94 * Corresponding author. Tel.: 1-301-457-8749; fax: 1-301-480-4659. E-mail address: [email protected] N.C.W. Goonesekere). 0379-0738/02/$ ± see front matter PII:S0379-073802)00014-2

STR data for nine loci from Sri Lanka

  • View
    225

  • Download
    4

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: STR data for nine loci from Sri Lanka

������������ � ����� �� ����

��� ���� �� � �� ��� ��� �� �����

�� � ������������� ���� �� ����������� ��� � ���� �����������

���������� ���� ����� �� ���� �� ����� ���� �� �� �����

���� !�� "# $������ %&&%' ������� "( $������ %&&%

��������

������ ��)���� �� �� �*� � �� ���� +���",-� �,-.� �/&"� 0"(�1#2� 03�4%&� 0"#�#"3� �"#�&"� �5��,�� ��� !��6

7��� �8�� ��� ��� � ����� � "#29"32 ��������� �� ! ����� 8��� � �� ������ ��� ���� ��! ��� � �!�� ::: ����,� �� � �� �

,����;� ������� ���

�������� �*��� ������ ������' ,����� �� ����' ����,� ��' �� �����

����� �� <�������� *����*� !�������� ������ 8��� �

�� ������

������� �� ,*����=�*������� �� �*���>="&&�

����� 1&9"&& �; ���;�� 0�� ����7 �; �����������?�

+,����;�6 ������� ��� �� ������ 2(&& �*����� ������

+,��� �=5����6�

�� ��� ������ �� �; 8� ���������� �� ;�� �������=

*���� � ����7�� 8� � �!�� ��� � �; ��� ����� ��� 7 �*

����� � ������� +,����;� ������� ��6�

�������� ��� ��8�� "�

���� �� ������ ����� � �������� �5� 0�� � @� ���=

��� ��� A1(% 0�� �� � !� ������� +,����;� ������� ��6

7��� �����

������ � � ����� �5�5,-, B"C ��� ,�7������� +,��=

��;� ������� ��6 ������� ��;�����

������ � ����� �� ���� �� ���7��� ��)����� ! � �=�� �D

;����������E����� �� �����������

����� �������� :��������� �������� ��� � ��� �; � � &�&1�� � �7 �� ����� ���� �� �"#�&"F!�� ��� �5��,�F

!�� ��� �

������ � �� ���� :������� ���� "%( +%&&%6 2#92G

��������� �; ���*��� ����D �"=#&"=G13=43G2'

�>D �"=#&"=G4&=G(12�

���� � �������� ;����������E����� �� ����������

+������ �����������6�

&#32=&3#4F&%FH 9 ��� ���� ������

,::D � & # 3 2 = & 3 # 4 + & % 6 & & & " G = %

Page 2: STR data for nine loci from Sri Lanka

���� ����������

�* � ����� 7�� ������� 8� � ;���� +��F2(F�"%6 ���

�*� ��� ���� �� ���� ������� �� � �� ������

���������

B"C �� �������� �� �������� �5�5,-, +!��� �� #�%�6D ����=

� ��� ;���� �� ���7��� �� �>��� ����� ��� ������ � ��� $�

/���� �� 4( +"2216 %G49%G2�

��8�� "

������ ��)���� �� �� � �� ��� ��� � �*� ����� �� � �� �����

������ ���",-

+ D "326

�,-.

+ D "326

�/&"

+ D "326

0"(�1#2

+ D "#26

03�4%&2

+ D "#26

0"#�#"3

+ D "#26

�"#�&"

+ D "G#6

�5��,�

+ D "G#6

!��

+ D "G#6

#�% &�&4&

G &�"1G

1 &�&&# &�G14

( &�%#1 &�&&G &�"41

3 &�&&4 &�&&4 &�"G& &�&G& &�&&G &�&4&

4 &�&&# &�#"4 &�"%4 &�&1G &�%G1 &�%G1 &�&%G &�&%G

2 &�&G% &�"G1 &�#%G &�&23 &�&(1 &�"&4 &�&&3 &�&3&

2�# &�&42

"& &�"(4 &�"&" &�&(3 &�"&4 &�%&2 &�&32 &�%#G

"" &�##% &�#4# &�&"G &�%1% &�%%# &�%"% &�#"4

"% &�#G2 &�&G% &�%"2 &�"3# &�%1% &�%G"

"# &�&4G &�&&# &�"3# &�&#( &�&4( &�""% &�&#4

"G &�&"" &�&2& &�&&3 &�&"G &�&&# &�&24

"1 &�&&3 &�&&3 &�""2

"( &�&&# &�"4%

"3 &�%%G

"4 &�%#"

"2 &�&24

%& &�&"&

/ &�(4%" &�3&21 &�32## &�4&13 &�4G"3 &�34G% &�323% &�311% &�4&G%

,0 &�44( &�4(4 &�2%# &�2G# &�2%2 &�2## &�432 &�2&( &�2#3

�5 &�G&& &�GG# &�143 &�("& &�(32 &�13& &�12G &�1"2 &�(&3

, &�3%(( &�&(2& &�"1&4 &�"G1" &�"2"& &�34%4 &�&%%G &�#%24 &�&""4

/D �8���!�� *�����@�;�� ��� ,0D �7�� � � ��� � ��� ��� �5D � � �� �*���� � �>���� ��� ,D /����9�� �8��; �)� � 8� ��� �>��� ����

+�����! �*� � ���������D ������� @�� ��' %&&&� 8���*��' "1&&� ����� ��� �� 8���*' "1&&6�

2G ! "�������#��� �� ��! $ "���� % �% ��%� &������� ��� '() *(++(, -�.-/