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SASによる2値データの解析
「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」
浜田知久馬 東京理科大学
Analysis of binary data using SAS
Chikuma Hamada Tokyo University of Science
1
キーワード:FREQプロシジャ,信頼区間,非劣性検証, ODS GRAPHICS
2
要旨 FREQプロシジャはV.9.3までに 大幅な機能拡張がなされた. チュートリアルとして新機能を紹介する. 1)割合の信頼区間 2)割合の差の信頼区間 3)非劣性・同等性仮説の検証 4)質的交互作用の検定 5) ODS GRAPHICSの機能
3
最尤法(Maximum Likelihood method)
• 尤度L(likelihood):確率(密度)関数を
未知母数の関数とみなしたもの.
• 確率が最大の母数の値は,観測値の関数
• 最尤法 尤度(L)または対数尤度(logL)
が最大になるように母数を推定
(MLE:Maximum Likelihood Estimator)
10(n)回中7(y)回表が出たときのMLE
37
710 )1( CL尤度:
0.7y/nMLE 4
5
帰無仮説から尤度山の頂点の 離れ具合を測るには?
(2)地図で位置を
確認する.
(1)高度を
測ってみる.
(3)傾斜角度を 測ってみる.
β0
尤度比検定 スコア検定 Wald検定
6
尤度比
Wald
スコア
3種類の検定の模式図
MLE )0(: 00 H
対数尤度
d
LdU
log)(
7
尤度原理に基づく3種類の検定 尤度比検定,Wald検定,スコア検定
例 の検定
1)尤度比検定
山の高さの違い
2) Wald検定
最尤推定量MLEからの隔たり
3)スコア検定
β0における傾きが0に近いか
00 : H
)(log)(log 0 LL
0
d
LdU
log)( 0
8
3種類の検定
尤度比検定,Wald検定,スコア検定
例 の検定
1)尤度比検定
高さ
2) Wald検定
距離
3)スコア検定
傾き
00 : H
))(log)((log2 0
2 LLX LR
][)(
][
)( 2
0
2
02
I
V
XWald
)(
)(
)]([
)(
0
2
0
0
2
02
I
U
UV
UX score
2次関数の場合
9
102 xy
x
2x
x2x
x2
2x
傾きは距離に比例 高さは距離の2乗に比例 高さ,距離,傾きは等価
距離
高さ
傾き
(0,10)
2次関数でない場合
10
5.
1.
高さ,距離,傾きは 非等価
73 )1( xxy
距離
高さ
傾き
11
正規分布の場合:一標本検定 分散σ2が既知の場合
対数尤度:
(μの2次関数)
スコア統計量:
最尤推定量MLE:
情報量:
の検定は?
2
2
2)(log
ynCL
2
log)(
yn
d
LdU
y
2
nI
00 : H
正規分布の3種類の検定
12
2
2
2)(log
ynCL
0
2
2
0
2
yn
0y
2
0
yn
尤度比 Wald
スコア
n
yX
2
2
02 )(
正規分布の対数尤度は2次関数
1) では高さはC,傾きは0
2) から高さは に比例して低下
3) から距離は に比例して増加
4) から傾きは に比例して増加
5)2次関数の場合は頂点からの離れ具合は
高さ,距離の2乗,傾きの2乗で等価.
(3種類の検定は一致)
13
20y
0y
0y
n
yX
2
2
02 )(
一標本割合の検定
n
pp
pIpV
nUVUEI
ny
d
LdU
ynyL
L
n
ypHH
yny
n
)1(
)(
1][
)1(][])([)(
)1(
)(log)(
)1log()(log)(log
)1(C)(
:,:
2
y
0100
情報量:
スコア関数:
対数尤度:
尤度:
最尤推定量:
14
2項分布 尤度比検定
)1(
1log)(log
)1log()(log
)1log()(log
))(log)((log2
:,:
00
00
0
2
0100
pyn
py
yny
pynpy
LpLX
HH
15
2項分布 Wald検定
n
ppZpCL
n
pp
p
pV
pX
n
pp
pIpV
n
yp
HH
)1(
)1(
)(
][
)(
)1(
)(
1][,
:,:
2
0
2
02
0100
16
2項分布 スコア検定
n
p
n
n
ny
n
ny
n
ny
I
UX
nIUV
nyU
HH
)1(
)(
)1(
)(
)1(
)(
)1(
)1(
)(
)(
)(
)1()()]([,
)1()(
:,:
00
2
0
00
2
2
0
00
2
0
00
2
0
2
0
2
0
0
2
02
0100
17
FREQ V9.2の新機能 割合の信頼区間
Tables文のBINOMIALオプション
AGRESTICOULL | AC
EXACT | CLOPPERPEARSON
JEFFREYS | J
WILSON | W
WALD 18
n=20, y=5の信頼区間 data data;
input y w @@;
cards;
0 5 1 15
ods graphics on;
proc freq;
tables y/binomial(all);weight w;
ods output binomialcls=out;run;
ods graphics off; 19
n=20, y=5の信頼区間 y = 0 の二項分布の比率
比率 0.2500
漸近標準誤差 0.0968
20
タイプ 95% 信頼限界
Wald 0.0602 0.4398 Wilsonスコア 0.1119 0.4687 Agresti-Coull 0.1081 0.4725 Jeffreys 0.1024 0.4642 Clopper-Pearson (Exact)
0.0866 0.4910
信頼区間図示のプログラム data out;set out;risk=5/20;
proc sgplot data=out noautolegend;;
scatter x = risk y = type /
xerrorlower=lowercl xerrorupper=uppercl;
xaxis offsetmin=0.05 offsetmax=0.05
values=(0 to 0.5 by 0.1);
yaxis valueattrs=(size=15); run;
21
n=20, y=5の信頼区間の図示
左右対称
広い
22
検定と信頼区間 (両側1-2α α=0.025 95%信頼区間)
Z
n
pZ
Z
n
pp
pZWald
)1(
)1(:
00
0
0
スコア:
ではについて解く,限界値不等式を
が棄却されない
が信頼区間に含まれる
0
00
0
:
H
0
23
スコア検定に基づく信頼区間
a
acbbx
cbxax
pn
Zp
n
Z
Zn
pZ
n
p
2
4
0
0)2()1(
2
)1()(,
)1(
2
2
2
0
22
0
2
0
2002
0
00
0
:二次方程式の解の公式
次方程式についての
24
Waldとスコア検定の信頼区間 (両側1-2α α=0.025 95%信頼区間)
Wald信頼区間
Wilsonスコア 信頼区間
n
yp
n
ppZp
)1(
2
2
22
11
)1(
42
1
Zn
n
pp
n
ZZZ
np
25
Agresti-Coull信頼区間
4
222
1
2
11
1
2
2
2
2
2
2
2
2
2
~
n
y
Zn
Zy
Zn
Znp
n
Z
n
Zp
n
Z
n
Zp
p
≒
pと1/2の 重み付き平均
に近づく
はより
0.5
~
pp
26
n
yp
96.1025.0 Z
Agresti-Coull信頼区間
27
15.05.045.0,4
)1(
)1(1)1(4
)1(
4
2
2
2
2
yVpn
pnpyV
pnppnpZ
nn
pp
n
Z
≒
信頼区間 Agresti-Coull信頼区間(スコア信頼区間の近似)
Clopper-Pearson
信頼区間
2項検定に基づく
H0:π=π0の下で
y以上の値がでる
確率が上側p値
2
2~
)(
2/)(
Zn
Zyp
n
ppZp
)1(~~
~
y
i
in
u
i
un
n
yi
in
l
i
ln
u
l
pp
pp
p
p
0
i
i
)1(C
,)1(C
は下側確率がα
は上側確率がα
28
Clopper-Pearson (正確な)信頼区間(0.0866~0.4910)
data exact;
pl=1-cdf('binomial',4,0.0866,20);
pu=cdf('binomial',5,0.4910,20);
上側限界:2項検定で下側p値が0.025になるπ
下側限界:2項検定で上側p値が0.025になるπ
OBS pl (下側限界) pu (上側限界)
1 0.02500 0.02500 29
30
n=20,y=5の正確な信頼下限 π=0.0866,5以上になる確率は.025
025.0
0866.0:,0866.0: 10
p
HH
上側二項検定
5以上になる確率は.025
確率 関数
31
n=20,y=5の正確な信頼上限 π=0.4910,5以下になる確率は.025
025.0
4910.0:,4910.0: 10
p
HH
下側二項検定
5以下になる 確率は.025
確率 関数
Jeffreys信頼区間
Jeffreys
信頼区間
2
1,
2
1,1
2
1,
2
1,
yny
yny
上限:
下限:
分布ベータ事後分布:β
の無情報事前分布
)(
)1()( 5.05.0
p
32
n=20,y=5 Jeffreys信頼区間 (0.1024~0.4642)
data Jeffries;
pl=cdf('beta',0.1024,5.5,15.5);
pu=cdf('beta',0.4642,5.5,15.5);
proc print;run;
OBS pl pu
1 0.02500 0.9750
33
πの事前分布 Beta(0.5,0.5) 5.05.0 )1()( p
確率密度 関数
34
πの事後分布 Beta(5.5,15.5)
5.145.4
1555.05.0
)1(
)1()1()(
p
20
5
19
5.4
1
5.
n
y
離れる
からより0.5p
0.1024~0.4642
0.025 0.025
確率密度 関数
35
n=20, y=1の信頼区間 data data; input y w @@; cards; 0 1 1 19 run; ods graphics on; proc freq; tables y/binomial(all); weight w; run; ods graphics off; 36
n=20, y=1の信頼区間
タイプ 95% 信頼限界
Wald 0.0000 0.1455
Wilsonスコア 0.0089 0.2361
Agresti-Coull 0.0000 0.2541
Jeffreys 0.0054 0.2108
Clopper-Pearson (Exact)
0.0013 0.2487
37
n=20, y=1の信頼区間の図示
広い
0に偏る
Wilsonに近い
0.5に偏る
狭い
38
信頼水準95%の正確な被覆確率 n=20
Clopper-Pearson Jeffereys
Wald
被覆確率
Agresti-Coull Wilson score
CC Wilson score
割合の真値π
CC:連続修正 保守的
革新的
39
割合の信頼区間の特徴
タイプ 信頼区間の特徴
Wald 革新的,狭い
Wilsonスコア 真中による
Agresti-Coull 真中による
Jeffreys 少し端による
Clopper-Pearson (Exact)
保守的,広い
40
Table 36.12 RISKDIFF (Proportion Difference) Options Option Description COLUMN=1 | 2 Specifies the risk column CORRECT Requests continuity correction NORISKS Suppresses default risk tables Request Confidence Limits
CL=EXACT Displays exact confidence limits
CL=FM Requests Farrington-Manning confidence limits
CL=HA Requests Hauck-Anderson confidence limits CL=NEWCOMBE Requests Newcombe confidence limits CL=WALD Requests Wald confidence limits Request Tests EQUAL Requests an equality test EQUIV | EQUIVALENCE Requests an equivalence test NONINF | NONINFERIORITY Requests a noninferiority test SUP | SUPERIORITY Requests a superiority test MARGIN= Specifies the test margin METHOD= Specifies the test method VAR=SAMPLE | NULL Specifies the test variance
RISKDIFFオプション
41
FREQ V9.3の新機能 割合の差の信頼区間
Tables文のRISKDIFF オプション
EXACT
FM
HA
NEWCOMBE | SCORE | WILSON WALD
42
2群の割合の差の信頼区間 data small; input treat $ outcome $ count @@ ; datalines; drug Favorable 10 drug Unfavorable 2 cont Favorable 2 cont Unfavorable 4 proc freq order=data data=small; weight count; tables treat*outcome / riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)); exact riskdiff; ods output pdiffcls=pd; ods output riskfiffcol1=dif (keep=risk row where=(row='差'));run;
43
薬剤群 対照群
有効 10 2
無効
2 4
2群の割合の差の信頼区間 data risk;set pd; if _n_ = 1 then set dif(drop=row); y = -_n_;l = y + 0.25;run; ods graphics on; proc sgplot data=risk noautolegend; title 'Confidence Intervals for the Difference
of Proportions'; scatter x = risk y = y / xerrorlower=lowercl xerrorupper=uppercl; scatter x = risk y = l / markerchar=type; yaxis display=none; xaxis offsetmin=0.025 offsetmax=0.025;run;
44
2群の割合の差の信頼区間(修正なし)
比率(リスク)差の信頼限界
列 1 (outcome = Favorabl)
比率差 = 0.5000
タイプ 95% 信頼限界
正確 -0.0296 0.8813
Farrington-Manning 0.0380 0.9620
Hauck-Anderson -0.0516 1.0000
Newcombe スコア 0.0378 0.7651
Wald 0.0679 0.9321 45
2群の割合の差の信頼区間(修正なし)
46
2群の割合の差の信頼区間(修正あり)
比率(リスク)差の信頼限界
列 1 (outcome = Favorabl)
比率差 = 0.5000
タイプ 95% 信頼限界
正確 -0.0296 0.8813
Farrington-Manning 0.0380 0.9620
Hauck-Anderson -0.0516 1.0000
Newcombe スコア(修正) -0.0352 0.8059
Wald (修正) -0.0571 1.0000 47
CORRECTオプション
2群の割合の差の信頼区間(修正あり)
48 0を含む
CORRECTオプション
49
2×2の分割表 薬剤群 対照群 計
有効 a b a+b
無効
c d c+d
計 n1 n2 n
有効割合 p1 (a/ n1) p2 (b/ n2) p (a+b)/n
50
2×2の分割表 薬剤群 対照群 計
有効 10 2 12
無効
2 4 6
計 12 6 18
有効割合 83.3% 33.3% 66.7%
割合の差 =0.50
51
カイ2乗検定の計算
50.4
6
)667.01(667.0
12
)667.01(667.0
)333.0833.0(
667.018
12
)1()1(
)(
,:
22
21
2
212
21210
X
n
bap
n
pp
n
pp
ppX
H
2群の割合の差の信頼区間 Farrington-Manning(帰無仮説下での分散)
カイ2乗検定に対応
962.0,038.0462.0500.0
2356.096.1500.0
6
)667.01(667.0
12
)667.01(667.096.1500.0
)1()1(
21
21
n
pp
n
ppZpp
52
2群の割合の差の信頼区間 Wald(対立仮説下での分散)
932.0,068.0432.0500.0
2204.096.1500.0
6
)333.01(333.0
12
)833.01(833.096.1500.0
)1()1(
2
22
1
1121
n
pp
n
ppZpp
53
2群の割合の差の信頼区間 Hauck-Anderson(Waldの保守化)
000.1,052.0552.0500.0
)2389.096.10833.0(500.0
2389.05
)333.01(333.0
11
)833.01(833.0
0833.062
1
),min(2
1
1
)1(
1
)1(
21
2
22
1
1121
CI
nncc
n
pp
n
ppZccpp
連続修正:
54
2群の割合の差の信頼区間 Newcombe Score
2
22
2
1121
2
22
2
1121
222
111
)()(
)()(
:,
:,
LppUpp
pULppp
WilsonpUL
WilsonpUL
スコア信頼区間の
スコア信頼区間の
55
56
母平均の差の信頼区間
2
222
1121
2
2
2
121
222
2
1121
2
2
2
121
2222222
1111111
)()(
)96.1()96.1(
)()(
)96.1()96.1(
96.1,96.1,
96.1,96.1,
LXXUXX
SESEXX
XULXXX
SESEXX
SEXUSEXLX
SEXUSEXLX
Newcombe Score 信頼区間のイメージ
57
L1
p1 U1
L2
p2 U2
← →
← →
L
U
←+→ →+←
差の 信頼 区間
スコア 信頼 区間
2
22
2
11 )()( pULp 2
22
2
11 )()( LppU
21 pp
正確な割合の差の信頼区間
Unconditional exact CI n1,n2のみ固定 Santner, T. J. and Snell, M. K. (1980), "Small-
Sample Confidence Intervals for p1-p2 and p1/p2 in Contingency Tables," Journal of the American Statistical Association, 75, 386–394.
Agresti, A. and Min, Y. (2001), "On Small-Sample Confidence Intervals for Parameters in Discrete Distributions," Biometrics, 57, 963–971.
58
正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)
割合の差δを推定するときにπ2が局外母数
(邪魔者)になる.
n1, n2,π2を固定した上で,観測された割合の差(t0=p1-p2=0.5)以上の差が生じる確率がαになるδを求める.
π2を動かして, δの最大値を求める.
→ 信頼限界値
全てのπ2について被覆確率を1-αに保つ.
π2
δ
59
正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)
))(:inf(),)(:sup(
::),(22:
)),,,,((sup)(
)),,,,,((sup)(
)1()()1()(
),,,,,(22
021
,
22121
,
22121
2222
221
21
02
02
2
2
1
1
LUUL
tTA
L
tTA
U
bnb
bn
ana
an
PP
RDObservedtRDTnntableA
nnyyfP
nnyyfP
CC
nnbaf
下側確率:
上側確率:
表の同時確率:
60
局外母数π2を変えたときの片側確率 片側確率
π2
δ=0.881の (π1=0.999) 下側確率
δ= -0.030の (π1=0.526) 上側確率
0.556 0.118 61
正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)
025.0
)556.0,030.0,6,12,,()030.0(
025.0)118.0,881.0,6,12,,()881.0(
5.06
2
12
10,
612
)1()()1()(
),,6,12,,(
5.0,
21
5.0,
21
21021
6
226
12
2212
221
22
2
11
1
TA
U
TA
L
yy
y
yy
y
yyfP
yyfP
pptyy
T
CC
yyf
62
信頼下限 Y1:Bin(12,0.526)Y2:Bin(6,0.556)の同時確率
ハートとダイヤ の確率の和は0.025
5.021 pp
確率関数
上側確率 63
5.06
2
12
100 t
y2 y1
5.021 pp
信頼上限 Y1:Bin(12,0.999) Y2:Bin(6,0.118)の同時確率
ハートとクローバーの確率の和は0.025
下側確率
64
5.06
2
12
100 t
確率関数
y1
y2
信頼水準95%の正確な被覆確率 n1=20 n2=20
2
5.01
65
割合の差の信頼区間の特徴
タイプ 信頼区間の特徴
Wald 革新的,狭い
Farrington-Manning 保守的,広い
Hauck-Anderson 中央:保守的 端:革新的
Newcombe スコア
95%に近い
正確
保守的,広い
66
仮説検証の型と帰無仮説
指標:平均値の差,割合の差,ハザード比 等
π1 : 群1の母発現割合(新薬)
π2 : 群2の母発現割合(標準薬)
δ: 非劣性マージン
優越性 H0:π2≧π1
非劣性 H0:π2- δ ≧π1
同等性 H0:π2- δ ≧π1
and π2+ δ ≦π1
67
優越性,非劣性,同等性 帰無仮説H0 対立仮説H1
優越性
非劣性
同等性
68
H0 H1
π2-δ≧π1
π2-δ≧π1 π2+δ≦π1
π2≧π1
-δ δ
π2 ≦ π1
π2-δ ≦π1
-δ ≦ π1 - π2 ≦ δ
2つの片側検定(TOST) (two one-sided tests) H0:π2-δ≧π1 , π2+δ≦π1
優越性,非劣性,同等性 信頼区間と判定
-δ(マージン) δ
0
優越性
非劣性
同等性
証明されず
(N不足)
割合の差の信頼区間 69
非劣性 有効割合の差10% δ=0.10 H0:π2-0.10 ≧π1
50% 60%
群1 (新薬) 群2 (標準薬)
有効
無効 40%
70
割合の差の非劣性検証 data infer;
input x y w @@;
cards;
1 0 40 1 1 60 2 0 50 2 1 50
;
proc freq order=data;
tables x*y / plots=freqplot(twoway=stack)
alpha=0.025
riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)
noninf margin=0.1 method=wald column=2);
exact riskdiff;
weight w;run;
Farrington-Manning
Hauck-Anderson
Newcombe スコア
Wald
71
割合の差の両側信頼区間の出力
比率(リスク)差の信頼限界
列 1 (y = 1)
比率差 = 0.1000
タイプ 95% 信頼限界
正確 -0.0435 0.2405
Farrington-Manning -0.0379 0.2379
Hauck-Anderson -0.0429 0.2429
Newcombe スコア -0.0373 0.2321
Wald -0.0372 0.2372
信頼下限は0を含むが -0.10を含まない
72
割合の差の両側95%信頼区間 信頼下限は0を含むが-0.10を含まない
δ=0 δ=-0.10 73
Wald法の非劣性仮説の検定 δ(マージン)=0.10
8571.20700.0
1.01.0
)1()1(
2
2211
21
n
pp
n
pp
ppZ
1
δ
Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin
Margin = 0.1 Wald Method
Proportion
Difference ASE (Sample)
Z Pr > Z 非劣性の限界
95% 信頼区間
0.1000 0.0700 2.8571 0.0021 -0.1000 -0.0372 0.2372
74
Farrington-Manning 法
MLE::,
6085.20700.0
1.01.0
)1()1(
0
~
1
~
1
2
~
2
~
1
~
1
~
2
~
1
δの差があるときの
δ
1
Hpp
n
p
n
pp
ppZ
Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin
Margin = 0.1 Farrington-Manning Method
Proportion Difference
ASE (F-M) Z Pr > Z 非劣性の限界
95% 信頼区間
0.1000 0.0700 2.8560 0.0021 -0.1000 -0.0373 0.2373
75
Newcombe Score法
スコア信頼区間に基づいた方法
Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin
Margin = 0.1 Newcombe Score Method
Proportion Difference
非劣性の限界 95% 信頼区間
0.1000 -0.1000 -0.0373 0.2321
76
2
22
2
1121
2
22
2
1121
)()(
)()(
LppUpp
pULppp
Hauck-Anderson法 Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P2 – P1 <= -Margin Ha: P2 – P1 > -Margin
Margin = 0.1 Hauck-Anderson Method
Proportion Difference
ASE (Sample H-A)
Z Pr > Z 非劣性の限界
95% 信頼区間
0.1000 0.0704 2.7718 0.0028 -0.1000 -0.0429 0.2429
信頼限界と検定には連続修正が含まれます。
7718.2
1
)1(
1
)1(
2
22
1
11
21
n
pp
n
pp
ccppZ
77
cc: contuinity correction
同等性 有効割合の差1%
有効
無効
δ=0.15 H0:π2-0.15≧π1and π2+0.15≦π1
50%
50%
51%
49%
78
群1 (新薬) 群2 (標準薬)
割合の差の同等性検証 data equiv;
input x y w @@;
cards;
1 0 49 1 1 51 2 0 50 2 1 50
;
proc freq order=data;
tables x*y / plots=freqplot(twoway=stack)
alpha=0.025
riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)
equiv margin=-0.15,0.15 method=wald column=2);
exact riskdiff;
weight w;run;
Farrington-Manning
Hauck-Anderson
Newcombe スコア
Wald
79
比率(リスク)差の信頼限界
列 1 (y = 1)
比率差 = 0.0100
タイプ 95% 信頼限界
正確 -0.1328 0.1525
Farrington-Manning -0.1286 0.1486
Hauck-Anderson -0.1343 0.1543
Newcombe スコア -0.1263 0.1457
Wald -0.1286 0.1486
信頼区間の出力
80
95%信頼区間の出力
δ=-0.15 δ=0.15 81
Wald法の同等性仮説の検定 δ(マージン)=0.10
2 つの片側検定 (TOST)
検定 Z p 値
Lower Margin 2.2630 Pr > Z 0.0118
Upper Margin -1.9801 Pr < Z 0.0238
Overall 0.0238
同等性の限界 95% 信頼区間
-0.1500 0.1500 -0.1286 0.1486
Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 - P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin
Ha: Lower Margin < P1 - P2 < Upper Margin
Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Wald Method
Proportion Difference ASE (Sample)
0.0100 0.0707
82
Farrington-Manning 法 Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin
Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin
Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Farrington-Manning Method
Proportion Difference ASE (F-M)
0.0100 0.0699
2 つの片側検定 (TOST)
検定 Z p 値
Lower Margin 2.2887 Pr > Z 0.0110
Upper Margin -2.0027 Pr < Z 0.0226
Overall 0.0226
同等性の限界 95% 信頼区間
-0.1500 0.1500 -0.1270 0.1470
83
Newcombe Score法
Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin
Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin
Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Newcombe Score Method
Proportion Difference
同等性の限界 95% 信頼区間
0.0100 -0.1500 0.1500 -0.1263 0.1457
84
Hauck-Anderson法 Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference
H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin
Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin
Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Hauck-Anderson Method
Proportion Difference ASE (Sample H-A)
0.0100 0.0711
2 つの片側検定 (TOST)
検定 Z p 値
Lower Margin 2.1813 Pr > Z 0.0146
Upper Margin -1.8998 Pr < Z 0.0287
Overall 0.0287
同等性の限界 95% 信頼区間
-0.1500 0.1500 -0.1343 0.1543
信頼限界と検定には連続修正が含まれます。
85
86
交互作用(interaction)
交互作用(相互作用)
AとBの2つの要因が重なったときに,A、Bそれぞれの効果の加法モデルで予想されるよりも,大きい(相乗)または小さい(拮抗)効果があるとき,AとBには交互作用があるという.
Aの効果+Bの効果≠ AとBを併用時の効果
87
交互作用(interaction)の模式図 交互作用がない:平行
拮抗作用(antagonism)
相乗作用(synergism)
交互作用なし
A- A+ A- A+ A- A+
B+
B-
拮抗作用 相乗作用
Aの効果
Bの効果 反応
88
量的・質的交互作用 交互作用がない:平行
質的交互作用:効果の逆転が生じる
量的交互作用:効果の逆転は起こらないが,
A-とA+では,Bの効果の大きさが異なる 量的交互作用 質的交互作用
quantitative qualitative
A- A+ A- A+
B+
B-
反 応
89
)0(Q),0(Q
}0,,0{O
}0,,0{O
SEd:s(:d
),,1(:
12
2
12
2
i
m
i i
ii
m
i i
i
mi
mi
iii
i
dIs
ddI
s
d
mi
+
+
はない.であれば質的交互作用
効果が負
効果が正
の割合の差)推定治療効果
層iの真の治療効果
質的交互作用のGail-Simon検定
交互作用(m=2)
δ1
δ2
量的交互作用
量的交互作用
質的交互作用
質的交互作用
0
交互作用なし 12
0,0 21
0,0 21 0,0 21
0,0 21
母数空間
90
質的交互作用の模式図(m=4)
0
d1 d2 d3 d4
+ ー
d1 d2 d3 d4
質的交互作用 なし
d1 d2 d3 d4 質的交互作用 あり
2
2
2
2
2
1
2
1Qs
d
s
d
2
4
2
4
2
3
2
3Qs
d
s
d
91
Gail-Simon検定(上側検定)
))Q(1(25.0))Q(1(5.0:2
2i:)(
)5.0())Q(1(
)0()0(Q
0,,0:H
}0,,0{O
21
1
,
1
2
12
2
0
FFpm
xF
BinFp
dIZdIs
d
i
m
i
imi
i
m
i
ii
m
i i
i
mi
mi
乗分布の累積分布のカイ自由度
の片側検定
+
92
25.0)5.0(
5.0)5.0(
2,2
1,2
Bin
Bin
H0 χ12
χ22
χ12
Gail-Simon検定(下側検定)
))Q(1(25.0))Q(1(5.0:2
2i:)(
)5.0())Q(1(
)0()0(Q
0,,0:H
}0,,0{O
21
1
,
1
2
12
2
0
FFpm
xF
BinFp
dIZdIs
d
i
m
i
imi
i
m
i
ii
m
i i
i
mi
mi
乗分布の累積分布のカイ自由度
>>
の片側検定
効果が負
+
+
+
93
25.0)5.0(
5.0)5.0(
2,2
1,2
Bin
Bin
94
))Q(1(5.0:2
2i:)(
)5.0())Q(1(
)0(Q),0(Q
)Q,Qmin(
1
1
1
1,1
12
2
12
2
Fpm
xF
BinFp
dIs
ddI
s
d
Q
i
m
i
mi
i
m
i i
ii
m
i i
i
乗分布の累積分布のカイ自由度
+
+
Gail-Simon検定(両側)
5.0)5.0(1,1 Bin
H0
H0
χ12
χ12
Gail-Simon検定(片側)
したがう:混合カイ2乗分布に
のカイ2乗分布自由度iを固定した下では,
は個の中の負の個数
したがう:混合カイ2乗分布に
のカイ2乗分布自由度iを固定した下では,
は個の中の負の個数
の下
Q
i
)5.0(i
Q
i
)5.0(i
0,,0
,
,
im
im
mi
Binm
Binm
95
96
したがう.は混合カイ2乗分布に
のカイ2乗分布度を固定した下では自由
の分布は
までからΣは
負であれば全て正
の下
+ )Q,Qmin(
ii
)5.0(
1-m1
0Qor
0,,0:H
i1,-
0
Q
Bini
i
m
mi
Gail-Simon検定(両側)
0.25
0,0 21
確率
dd
0.25
0,0 21
確率
dd
0.25
0,0 21
確率
dd
0.25
0,0 21
確率
dd
Z1とZ2の確率密度(δ1=0,δ2=0)の 等高線プロット
標本空間
97
m=2の上側検定の統計量とp値
)Q(25.0)Q(5.025.01
)Q(25.0)Q(5.025.0
21
21
FFp
FF累積分布:
H0 χ12
χ22
χ12
Q 98 p=0.75 p=0.22
m=2の両側検定の統計量とp値
)Q(5.05.01
)Q(5.05.0
1
1
Fp
F
累積分布:
H0
H0
χ12
χ12
Q99 p=0.50
75 p=0.11
Gail-Simon検定 data migraine;
input gender $ treatment $ response $ count @@;
datalines;
female Active Better 16 female Active Same 11
female Placebo Better 5 female Placebo Same 20
male Active Better 12 male Active Same 16
male Placebo Better 7 male Placebo Same 19
title 'Clinical Trial for Treatment of Migraine Headaches’;
100
Gail-Simon検定
ods graphics on;
proc freq data=migraine;
tables gender*treatment*response /chisq gailsimon riskdiff relrisk
plots(only)=relriskplot(stats) cmh
noprint;
weight count;run;
ods graphics off;
101
Gail-Simon検定
表 1 : Treatment * Response
層別変数 : Gender=female
Treatment Response
Better Same 合計
Active
16
76.19
11
35.48
27
Placebo
5
23.81
20
64.52
25
合計
21
31
52
Better Same 合計
Active 16 11 27 59.26 40.74 Placebo 5 20 25 20 80 合計 21 31 52
Better Same 合計
Active 12 16 28
42.86 57.14
Placebo 7 19 26
26.92 73.08
合計 19 35 54
05.101239.0
3926.02
2
2
1
2
1 s
d
56.11277.0
1543.02
2
2
2
2
2 s
d
102
Gail-Simon検定 質的交互作用の Gail-Simon 検定
統計量 値 p 値
Q+ (正のリスク差) 11.6027 0.0011
Q- (負のリスク差) 0.0000 0.7500
Q (両側) 0.0000 0.5000
0),(
0
60.1156.105.10
1277.0
1543.0
1239.0
3926.02
2
2
2
2
2
QQMINQ
Q
s
dQ
i
i オッズ比等質性に対する Breslow-Day 検定
カイ 2 乗値 1.4929
自由度 1
Pr > ChiSq 0.2218 103
下側検定
上側検定
Gail-Simon検定 data migraine2;
input gender $ treatment $ response $ count @@;
datalines;
female Active Better 16 female Active Same 11
female Placebo Better 5 female Placebo Same 20
male Active Better 16 male Active Same 12
male Placebo Better 19 male Placebo Same 7
ods graphics on;
proc freq data=migraine2 order=data;
tables gender*treatment*response /nocol nopercent
chisq gailsimon riskdiff(cl=(wald))
relrisk plots(only)=riskdiffplot(stats) cmh ;
weight count;
title 'Clinical Trial for Treatment of Migraine Headaches’;run;
ods graphics off;
104
Gail-Simon検定
Better Same 合計 Active 16 12 28 57.14 42.86 Placebo 19 7 26 73.08 26.92 合計 35 19 54
Better Same 合計
Active 16 11 27 59.26 40.74 Placebo 5 20 25 20 80 合計 21 31 52
Better Same 合計
Active 16 12 28 57.14 42.86 Placebo 19 7 26 73.08 26.92 合計 35 19 54
05.101239.0
3926.02
2
2
1
2
1 s
d
56.11277.0
)1543.0(2
2
2
2
2
2
s
d
105
質的交互作用の Gail-Simon 検定
統計量 値 p 値
Q+ (正のリスク差) 10.0464 0.0024
Q- (負のリスク差) 1.5563 0.2209
Q (両側) 1.5563 0.1061
56.1),(
56.11277.0
)1543.0(
05.101239.0
3926.0
2
2
2
2
QQMINQ
Q
Q オッズ比等質性に対する Breslow-Day 検定
カイ 2 乗値 8.5464
自由度 1
Pr > ChiSq 0.0035
106
下側検定
上側検定
まとめ
1)Wald信頼区間は,革新的
2)正確な信頼区間は,保守的
3)スコア検定ベースの信頼区間は,被覆確率が信頼水準に近い
107
Wald
スコア 正確