107
SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3浜田知久馬 東京理科大学 Analysis of binary data using SAS Chikuma Hamada Tokyo University of Science 1

Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

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SASによる2値データの解析

「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」

浜田知久馬 東京理科大学

Analysis of binary data using SAS

Chikuma Hamada Tokyo University of Science

1

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キーワード:FREQプロシジャ,信頼区間,非劣性検証, ODS GRAPHICS

2

要旨 FREQプロシジャはV.9.3までに 大幅な機能拡張がなされた. チュートリアルとして新機能を紹介する. 1)割合の信頼区間 2)割合の差の信頼区間 3)非劣性・同等性仮説の検証 4)質的交互作用の検定 5) ODS GRAPHICSの機能

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3

最尤法(Maximum Likelihood method)

• 尤度L(likelihood):確率(密度)関数を

未知母数の関数とみなしたもの.

• 確率が最大の母数の値は,観測値の関数

• 最尤法 尤度(L)または対数尤度(logL)

が最大になるように母数を推定

(MLE:Maximum Likelihood Estimator)

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10(n)回中7(y)回表が出たときのMLE

37

710 )1( CL尤度:

0.7y/nMLE 4

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5

帰無仮説から尤度山の頂点の 離れ具合を測るには?

(2)地図で位置を

確認する.

(1)高度を

測ってみる.

(3)傾斜角度を 測ってみる.

β0

尤度比検定 スコア検定 Wald検定

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6

尤度比

Wald

スコア

3種類の検定の模式図

MLE )0(: 00 H

対数尤度

d

LdU

log)(

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7

尤度原理に基づく3種類の検定 尤度比検定,Wald検定,スコア検定

例 の検定

1)尤度比検定

山の高さの違い

2) Wald検定

最尤推定量MLEからの隔たり

3)スコア検定

β0における傾きが0に近いか

00 : H

)(log)(log 0 LL

0

d

LdU

log)( 0

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8

3種類の検定

尤度比検定,Wald検定,スコア検定

例 の検定

1)尤度比検定

高さ

2) Wald検定

距離

3)スコア検定

傾き

00 : H

))(log)((log2 0

2 LLX LR

][)(

][

)( 2

0

2

02

I

V

XWald

)(

)(

)]([

)(

0

2

0

0

2

02

I

U

UV

UX score

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2次関数の場合

9

102 xy

x

2x

x2x

x2

2x

傾きは距離に比例 高さは距離の2乗に比例 高さ,距離,傾きは等価

距離

高さ

傾き

(0,10)

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2次関数でない場合

10

5.

1.

高さ,距離,傾きは 非等価

73 )1( xxy

距離

高さ

傾き

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11

正規分布の場合:一標本検定 分散σ2が既知の場合

対数尤度:

(μの2次関数)

スコア統計量:

最尤推定量MLE:

情報量:

の検定は?

2

2

2)(log

ynCL

2

log)(

yn

d

LdU

y

2

nI

00 : H

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正規分布の3種類の検定

12

2

2

2)(log

ynCL

0

2

2

0

2

yn

0y

2

0

yn

尤度比 Wald

スコア

n

yX

2

2

02 )(

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正規分布の対数尤度は2次関数

1) では高さはC,傾きは0

2) から高さは に比例して低下

3) から距離は に比例して増加

4) から傾きは に比例して増加

5)2次関数の場合は頂点からの離れ具合は

高さ,距離の2乗,傾きの2乗で等価.

(3種類の検定は一致)

13

20y

0y

0y

n

yX

2

2

02 )(

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一標本割合の検定

n

pp

pIpV

nUVUEI

ny

d

LdU

ynyL

L

n

ypHH

yny

n

)1(

)(

1][

)1(][])([)(

)1(

)(log)(

)1log()(log)(log

)1(C)(

:,:

2

y

0100

情報量:

スコア関数:

対数尤度:

尤度:

最尤推定量:

14

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2項分布 尤度比検定

)1(

1log)(log

)1log()(log

)1log()(log

))(log)((log2

:,:

00

00

0

2

0100

pyn

py

yny

pynpy

LpLX

HH

15

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2項分布 Wald検定

n

ppZpCL

n

pp

p

pV

pX

n

pp

pIpV

n

yp

HH

)1(

)1(

)(

][

)(

)1(

)(

1][,

:,:

2

0

2

02

0100

16

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2項分布 スコア検定

n

p

n

n

ny

n

ny

n

ny

I

UX

nIUV

nyU

HH

)1(

)(

)1(

)(

)1(

)(

)1(

)1(

)(

)(

)(

)1()()]([,

)1()(

:,:

00

2

0

00

2

2

0

00

2

0

00

2

0

2

0

2

0

0

2

02

0100

17

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FREQ V9.2の新機能 割合の信頼区間

Tables文のBINOMIALオプション

AGRESTICOULL | AC

EXACT | CLOPPERPEARSON

JEFFREYS | J

WILSON | W

WALD 18

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n=20, y=5の信頼区間 data data;

input y w @@;

cards;

0 5 1 15

ods graphics on;

proc freq;

tables y/binomial(all);weight w;

ods output binomialcls=out;run;

ods graphics off; 19

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n=20, y=5の信頼区間 y = 0 の二項分布の比率

比率 0.2500

漸近標準誤差 0.0968

20

タイプ 95% 信頼限界

Wald 0.0602 0.4398 Wilsonスコア 0.1119 0.4687 Agresti-Coull 0.1081 0.4725 Jeffreys 0.1024 0.4642 Clopper-Pearson (Exact)

0.0866 0.4910

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信頼区間図示のプログラム data out;set out;risk=5/20;

proc sgplot data=out noautolegend;;

scatter x = risk y = type /

xerrorlower=lowercl xerrorupper=uppercl;

xaxis offsetmin=0.05 offsetmax=0.05

values=(0 to 0.5 by 0.1);

yaxis valueattrs=(size=15); run;

21

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n=20, y=5の信頼区間の図示

左右対称

広い

22

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検定と信頼区間 (両側1-2α α=0.025 95%信頼区間)

Z

n

pZ

Z

n

pp

pZWald

)1(

)1(:

00

0

0

スコア:

ではについて解く,限界値不等式を

が棄却されない

が信頼区間に含まれる

0

00

0

:

H

0

23

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スコア検定に基づく信頼区間

a

acbbx

cbxax

pn

Zp

n

Z

Zn

pZ

n

p

2

4

0

0)2()1(

2

)1()(,

)1(

2

2

2

0

22

0

2

0

2002

0

00

0

:二次方程式の解の公式

次方程式についての

24

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Waldとスコア検定の信頼区間 (両側1-2α α=0.025 95%信頼区間)

Wald信頼区間

Wilsonスコア 信頼区間

n

yp

n

ppZp

)1(

2

2

22

11

)1(

42

1

Zn

n

pp

n

ZZZ

np

25

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Agresti-Coull信頼区間

4

222

1

2

11

1

2

2

2

2

2

2

2

2

2

~

n

y

Zn

Zy

Zn

Znp

n

Z

n

Zp

n

Z

n

Zp

p

pと1/2の 重み付き平均

に近づく

はより

0.5

~

pp

26

n

yp

96.1025.0 Z

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Agresti-Coull信頼区間

27

15.05.045.0,4

)1(

)1(1)1(4

)1(

4

2

2

2

2

yVpn

pnpyV

pnppnpZ

nn

pp

n

Z

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信頼区間 Agresti-Coull信頼区間(スコア信頼区間の近似)

Clopper-Pearson

信頼区間

2項検定に基づく

H0:π=π0の下で

y以上の値がでる

確率が上側p値

2

2~

)(

2/)(

Zn

Zyp

n

ppZp

)1(~~

~

y

i

in

u

i

un

n

yi

in

l

i

ln

u

l

pp

pp

p

p

0

i

i

)1(C

,)1(C

は下側確率がα

は上側確率がα

28

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Clopper-Pearson (正確な)信頼区間(0.0866~0.4910)

data exact;

pl=1-cdf('binomial',4,0.0866,20);

pu=cdf('binomial',5,0.4910,20);

上側限界:2項検定で下側p値が0.025になるπ

下側限界:2項検定で上側p値が0.025になるπ

OBS pl (下側限界) pu (上側限界)

1 0.02500 0.02500 29

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30

n=20,y=5の正確な信頼下限 π=0.0866,5以上になる確率は.025

025.0

0866.0:,0866.0: 10

p

HH

上側二項検定

5以上になる確率は.025

確率 関数

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31

n=20,y=5の正確な信頼上限 π=0.4910,5以下になる確率は.025

025.0

4910.0:,4910.0: 10

p

HH

下側二項検定

5以下になる 確率は.025

確率 関数

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Jeffreys信頼区間

Jeffreys

信頼区間

2

1,

2

1,1

2

1,

2

1,

yny

yny

上限:

下限:

分布ベータ事後分布:β

の無情報事前分布

)(

)1()( 5.05.0

p

32

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n=20,y=5 Jeffreys信頼区間 (0.1024~0.4642)

data Jeffries;

pl=cdf('beta',0.1024,5.5,15.5);

pu=cdf('beta',0.4642,5.5,15.5);

proc print;run;

OBS pl pu

1 0.02500 0.9750

33

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πの事前分布 Beta(0.5,0.5) 5.05.0 )1()( p

確率密度 関数

34

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πの事後分布 Beta(5.5,15.5)

5.145.4

1555.05.0

)1(

)1()1()(

p

20

5

19

5.4

1

5.

n

y

離れる

からより0.5p

0.1024~0.4642

0.025 0.025

確率密度 関数

35

Page 36: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

n=20, y=1の信頼区間 data data; input y w @@; cards; 0 1 1 19 run; ods graphics on; proc freq; tables y/binomial(all); weight w; run; ods graphics off; 36

Page 37: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

n=20, y=1の信頼区間

タイプ 95% 信頼限界

Wald 0.0000 0.1455

Wilsonスコア 0.0089 0.2361

Agresti-Coull 0.0000 0.2541

Jeffreys 0.0054 0.2108

Clopper-Pearson (Exact)

0.0013 0.2487

37

Page 38: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

n=20, y=1の信頼区間の図示

広い

0に偏る

Wilsonに近い

0.5に偏る

狭い

38

Page 39: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

信頼水準95%の正確な被覆確率 n=20

Clopper-Pearson Jeffereys

Wald

被覆確率

Agresti-Coull Wilson score

CC Wilson score

割合の真値π

CC:連続修正 保守的

革新的

39

Page 40: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

割合の信頼区間の特徴

タイプ 信頼区間の特徴

Wald 革新的,狭い

Wilsonスコア 真中による

Agresti-Coull 真中による

Jeffreys 少し端による

Clopper-Pearson (Exact)

保守的,広い

40

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Table 36.12 RISKDIFF (Proportion Difference) Options Option Description COLUMN=1 | 2 Specifies the risk column CORRECT Requests continuity correction NORISKS Suppresses default risk tables Request Confidence Limits

CL=EXACT Displays exact confidence limits

CL=FM Requests Farrington-Manning confidence limits

CL=HA Requests Hauck-Anderson confidence limits CL=NEWCOMBE Requests Newcombe confidence limits CL=WALD Requests Wald confidence limits Request Tests EQUAL Requests an equality test EQUIV | EQUIVALENCE Requests an equivalence test NONINF | NONINFERIORITY Requests a noninferiority test SUP | SUPERIORITY Requests a superiority test MARGIN= Specifies the test margin METHOD= Specifies the test method VAR=SAMPLE | NULL Specifies the test variance

RISKDIFFオプション

41

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FREQ V9.3の新機能 割合の差の信頼区間

Tables文のRISKDIFF オプション

EXACT

FM

HA

NEWCOMBE | SCORE | WILSON WALD

42

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2群の割合の差の信頼区間 data small; input treat $ outcome $ count @@ ; datalines; drug Favorable 10 drug Unfavorable 2 cont Favorable 2 cont Unfavorable 4 proc freq order=data data=small; weight count; tables treat*outcome / riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)); exact riskdiff; ods output pdiffcls=pd; ods output riskfiffcol1=dif (keep=risk row where=(row='差'));run;

43

薬剤群 対照群

有効 10 2

無効

2 4

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2群の割合の差の信頼区間 data risk;set pd; if _n_ = 1 then set dif(drop=row); y = -_n_;l = y + 0.25;run; ods graphics on; proc sgplot data=risk noautolegend; title 'Confidence Intervals for the Difference

of Proportions'; scatter x = risk y = y / xerrorlower=lowercl xerrorupper=uppercl; scatter x = risk y = l / markerchar=type; yaxis display=none; xaxis offsetmin=0.025 offsetmax=0.025;run;

44

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2群の割合の差の信頼区間(修正なし)

比率(リスク)差の信頼限界

列 1 (outcome = Favorabl)

比率差 = 0.5000

タイプ 95% 信頼限界

正確 -0.0296 0.8813

Farrington-Manning 0.0380 0.9620

Hauck-Anderson -0.0516 1.0000

Newcombe スコア 0.0378 0.7651

Wald 0.0679 0.9321 45

Page 46: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

2群の割合の差の信頼区間(修正なし)

46

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2群の割合の差の信頼区間(修正あり)

比率(リスク)差の信頼限界

列 1 (outcome = Favorabl)

比率差 = 0.5000

タイプ 95% 信頼限界

正確 -0.0296 0.8813

Farrington-Manning 0.0380 0.9620

Hauck-Anderson -0.0516 1.0000

Newcombe スコア(修正) -0.0352 0.8059

Wald (修正) -0.0571 1.0000 47

CORRECTオプション

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2群の割合の差の信頼区間(修正あり)

48 0を含む

CORRECTオプション

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49

2×2の分割表 薬剤群 対照群 計

有効 a b a+b

無効

c d c+d

計 n1 n2 n

有効割合 p1 (a/ n1) p2 (b/ n2) p (a+b)/n

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50

2×2の分割表 薬剤群 対照群 計

有効 10 2 12

無効

2 4 6

計 12 6 18

有効割合 83.3% 33.3% 66.7%

割合の差 =0.50

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51

カイ2乗検定の計算

50.4

6

)667.01(667.0

12

)667.01(667.0

)333.0833.0(

667.018

12

)1()1(

)(

,:

22

21

2

212

21210

X

n

bap

n

pp

n

pp

ppX

H

Page 52: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

2群の割合の差の信頼区間 Farrington-Manning(帰無仮説下での分散)

カイ2乗検定に対応

962.0,038.0462.0500.0

2356.096.1500.0

6

)667.01(667.0

12

)667.01(667.096.1500.0

)1()1(

21

21

n

pp

n

ppZpp

52

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2群の割合の差の信頼区間 Wald(対立仮説下での分散)

932.0,068.0432.0500.0

2204.096.1500.0

6

)333.01(333.0

12

)833.01(833.096.1500.0

)1()1(

2

22

1

1121

n

pp

n

ppZpp

53

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2群の割合の差の信頼区間 Hauck-Anderson(Waldの保守化)

000.1,052.0552.0500.0

)2389.096.10833.0(500.0

2389.05

)333.01(333.0

11

)833.01(833.0

0833.062

1

),min(2

1

1

)1(

1

)1(

21

2

22

1

1121

CI

nncc

n

pp

n

ppZccpp

連続修正:

54

Page 55: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

2群の割合の差の信頼区間 Newcombe Score

2

22

2

1121

2

22

2

1121

222

111

)()(

)()(

:,

:,

LppUpp

pULppp

WilsonpUL

WilsonpUL

スコア信頼区間の

スコア信頼区間の

55

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56

母平均の差の信頼区間

2

222

1121

2

2

2

121

222

2

1121

2

2

2

121

2222222

1111111

)()(

)96.1()96.1(

)()(

)96.1()96.1(

96.1,96.1,

96.1,96.1,

LXXUXX

SESEXX

XULXXX

SESEXX

SEXUSEXLX

SEXUSEXLX

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Newcombe Score 信頼区間のイメージ

57

L1

p1 U1

L2

p2 U2

← →

← →

L

U

←+→ →+←

差の 信頼 区間

スコア 信頼 区間

2

22

2

11 )()( pULp 2

22

2

11 )()( LppU

21 pp

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正確な割合の差の信頼区間

Unconditional exact CI n1,n2のみ固定 Santner, T. J. and Snell, M. K. (1980), "Small-

Sample Confidence Intervals for p1-p2 and p1/p2 in Contingency Tables," Journal of the American Statistical Association, 75, 386–394.

Agresti, A. and Min, Y. (2001), "On Small-Sample Confidence Intervals for Parameters in Discrete Distributions," Biometrics, 57, 963–971.

58

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正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)

割合の差δを推定するときにπ2が局外母数

(邪魔者)になる.

n1, n2,π2を固定した上で,観測された割合の差(t0=p1-p2=0.5)以上の差が生じる確率がαになるδを求める.

π2を動かして, δの最大値を求める.

→ 信頼限界値

全てのπ2について被覆確率を1-αに保つ.

π2

δ

59

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正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)

))(:inf(),)(:sup(

::),(22:

)),,,,((sup)(

)),,,,,((sup)(

)1()()1()(

),,,,,(22

021

,

22121

,

22121

2222

221

21

02

02

2

2

1

1

LUUL

tTA

L

tTA

U

bnb

bn

ana

an

PP

RDObservedtRDTnntableA

nnyyfP

nnyyfP

CC

nnbaf

下側確率:

上側確率:

表の同時確率:

60

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局外母数π2を変えたときの片側確率 片側確率

π2

δ=0.881の (π1=0.999) 下側確率

δ= -0.030の (π1=0.526) 上側確率

0.556 0.118 61

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正確な割合の差の信頼区間 (-0.030~0.881)

025.0

)556.0,030.0,6,12,,()030.0(

025.0)118.0,881.0,6,12,,()881.0(

5.06

2

12

10,

612

)1()()1()(

),,6,12,,(

5.0,

21

5.0,

21

21021

6

226

12

2212

221

22

2

11

1

TA

U

TA

L

yy

y

yy

y

yyfP

yyfP

pptyy

T

CC

yyf

62

Page 63: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

信頼下限 Y1:Bin(12,0.526)Y2:Bin(6,0.556)の同時確率

ハートとダイヤ の確率の和は0.025

5.021 pp

確率関数

上側確率 63

5.06

2

12

100 t

y2 y1

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5.021 pp

信頼上限 Y1:Bin(12,0.999) Y2:Bin(6,0.118)の同時確率

ハートとクローバーの確率の和は0.025

下側確率

64

5.06

2

12

100 t

確率関数

y1

y2

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信頼水準95%の正確な被覆確率 n1=20 n2=20

2

5.01

65

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割合の差の信頼区間の特徴

タイプ 信頼区間の特徴

Wald 革新的,狭い

Farrington-Manning 保守的,広い

Hauck-Anderson 中央:保守的 端:革新的

Newcombe スコア

95%に近い

正確

保守的,広い

66

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仮説検証の型と帰無仮説

指標:平均値の差,割合の差,ハザード比 等

π1 : 群1の母発現割合(新薬)

π2 : 群2の母発現割合(標準薬)

δ: 非劣性マージン

優越性 H0:π2≧π1

非劣性 H0:π2- δ ≧π1

同等性 H0:π2- δ ≧π1

and π2+ δ ≦π1

67

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優越性,非劣性,同等性 帰無仮説H0 対立仮説H1

優越性

非劣性

同等性

68

H0 H1

π2-δ≧π1

π2-δ≧π1 π2+δ≦π1

π2≧π1

-δ δ

π2 ≦ π1

π2-δ ≦π1

-δ ≦ π1 - π2 ≦ δ

2つの片側検定(TOST) (two one-sided tests) H0:π2-δ≧π1 , π2+δ≦π1

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優越性,非劣性,同等性 信頼区間と判定

-δ(マージン) δ

0

優越性

非劣性

同等性

証明されず

(N不足)

割合の差の信頼区間 69

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非劣性 有効割合の差10% δ=0.10 H0:π2-0.10 ≧π1

50% 60%

群1 (新薬) 群2 (標準薬)

有効

無効 40%

70

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割合の差の非劣性検証 data infer;

input x y w @@;

cards;

1 0 40 1 1 60 2 0 50 2 1 50

;

proc freq order=data;

tables x*y / plots=freqplot(twoway=stack)

alpha=0.025

riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)

noninf margin=0.1 method=wald column=2);

exact riskdiff;

weight w;run;

Farrington-Manning

Hauck-Anderson

Newcombe スコア

Wald

71

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割合の差の両側信頼区間の出力

比率(リスク)差の信頼限界

列 1 (y = 1)

比率差 = 0.1000

タイプ 95% 信頼限界

正確 -0.0435 0.2405

Farrington-Manning -0.0379 0.2379

Hauck-Anderson -0.0429 0.2429

Newcombe スコア -0.0373 0.2321

Wald -0.0372 0.2372

信頼下限は0を含むが -0.10を含まない

72

Page 73: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

割合の差の両側95%信頼区間 信頼下限は0を含むが-0.10を含まない

δ=0 δ=-0.10 73

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Wald法の非劣性仮説の検定 δ(マージン)=0.10

8571.20700.0

1.01.0

)1()1(

2

2211

21

n

pp

n

pp

ppZ

δ

Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin

Margin = 0.1 Wald Method

Proportion

Difference ASE (Sample)

Z Pr > Z 非劣性の限界

95% 信頼区間

0.1000 0.0700 2.8571 0.0021 -0.1000 -0.0372 0.2372

74

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Farrington-Manning 法

MLE::,

6085.20700.0

1.01.0

)1()1(

0

~

1

~

1

2

~

2

~

1

~

1

~

2

~

1

δの差があるときの

δ

Hpp

n

p

n

pp

ppZ

Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin

Margin = 0.1 Farrington-Manning Method

Proportion Difference

ASE (F-M) Z Pr > Z 非劣性の限界

95% 信頼区間

0.1000 0.0700 2.8560 0.0021 -0.1000 -0.0373 0.2373

75

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Newcombe Score法

スコア信頼区間に基づいた方法

Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 - P2 <= -Margin Ha: P1 - P2 > -Margin

Margin = 0.1 Newcombe Score Method

Proportion Difference

非劣性の限界 95% 信頼区間

0.1000 -0.1000 -0.0373 0.2321

76

2

22

2

1121

2

22

2

1121

)()(

)()(

LppUpp

pULppp

Page 77: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Hauck-Anderson法 Noninferiority Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P2 – P1 <= -Margin Ha: P2 – P1 > -Margin

Margin = 0.1 Hauck-Anderson Method

Proportion Difference

ASE (Sample H-A)

Z Pr > Z 非劣性の限界

95% 信頼区間

0.1000 0.0704 2.7718 0.0028 -0.1000 -0.0429 0.2429

信頼限界と検定には連続修正が含まれます。

7718.2

1

)1(

1

)1(

2

22

1

11

21

n

pp

n

pp

ccppZ

77

cc: contuinity correction

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同等性 有効割合の差1%

有効

無効

δ=0.15 H0:π2-0.15≧π1and π2+0.15≦π1

50%

50%

51%

49%

78

群1 (新薬) 群2 (標準薬)

Page 79: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

割合の差の同等性検証 data equiv;

input x y w @@;

cards;

1 0 49 1 1 51 2 0 50 2 1 50

;

proc freq order=data;

tables x*y / plots=freqplot(twoway=stack)

alpha=0.025

riskdiff(cl=(wald newcombe fm ha exact)

equiv margin=-0.15,0.15 method=wald column=2);

exact riskdiff;

weight w;run;

Farrington-Manning

Hauck-Anderson

Newcombe スコア

Wald

79

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比率(リスク)差の信頼限界

列 1 (y = 1)

比率差 = 0.0100

タイプ 95% 信頼限界

正確 -0.1328 0.1525

Farrington-Manning -0.1286 0.1486

Hauck-Anderson -0.1343 0.1543

Newcombe スコア -0.1263 0.1457

Wald -0.1286 0.1486

信頼区間の出力

80

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95%信頼区間の出力

δ=-0.15 δ=0.15 81

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Wald法の同等性仮説の検定 δ(マージン)=0.10

2 つの片側検定 (TOST)

検定 Z p 値

Lower Margin 2.2630 Pr > Z 0.0118

Upper Margin -1.9801 Pr < Z 0.0238

Overall 0.0238

同等性の限界 95% 信頼区間

-0.1500 0.1500 -0.1286 0.1486

Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 - P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin

Ha: Lower Margin < P1 - P2 < Upper Margin

Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Wald Method

Proportion Difference ASE (Sample)

0.0100 0.0707

82

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Farrington-Manning 法 Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin

Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin

Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Farrington-Manning Method

Proportion Difference ASE (F-M)

0.0100 0.0699

2 つの片側検定 (TOST)

検定 Z p 値

Lower Margin 2.2887 Pr > Z 0.0110

Upper Margin -2.0027 Pr < Z 0.0226

Overall 0.0226

同等性の限界 95% 信頼区間

-0.1500 0.1500 -0.1270 0.1470

83

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Newcombe Score法

Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin

Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin

Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Newcombe Score Method

Proportion Difference

同等性の限界 95% 信頼区間

0.0100 -0.1500 0.1500 -0.1263 0.1457

84

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Hauck-Anderson法 Equivalence Analysis for the Proportion (Risk) Difference

H0: P1 – P2 <= Lower Margin または >= Upper Margin

Ha: Lower Margin < P1 – P2 < Upper Margin

Lower Margin = -0.15 Upper Margin = 0.15 Hauck-Anderson Method

Proportion Difference ASE (Sample H-A)

0.0100 0.0711

2 つの片側検定 (TOST)

検定 Z p 値

Lower Margin 2.1813 Pr > Z 0.0146

Upper Margin -1.8998 Pr < Z 0.0287

Overall 0.0287

同等性の限界 95% 信頼区間

-0.1500 0.1500 -0.1343 0.1543

信頼限界と検定には連続修正が含まれます。

85

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86

交互作用(interaction)

交互作用(相互作用)

AとBの2つの要因が重なったときに,A、Bそれぞれの効果の加法モデルで予想されるよりも,大きい(相乗)または小さい(拮抗)効果があるとき,AとBには交互作用があるという.

Aの効果+Bの効果≠ AとBを併用時の効果

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87

交互作用(interaction)の模式図 交互作用がない:平行

拮抗作用(antagonism)

相乗作用(synergism)

交互作用なし

A- A+ A- A+ A- A+

B+

B-

拮抗作用 相乗作用

Aの効果

Bの効果 反応

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88

量的・質的交互作用 交互作用がない:平行

質的交互作用:効果の逆転が生じる

量的交互作用:効果の逆転は起こらないが,

A-とA+では,Bの効果の大きさが異なる 量的交互作用 質的交互作用

quantitative qualitative

A- A+ A- A+

B+

B-

反 応

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89

)0(Q),0(Q

}0,,0{O

}0,,0{O

SEd:s(:d

),,1(:

12

2

12

2

i

m

i i

ii

m

i i

i

mi

mi

iii

i

dIs

ddI

s

d

mi

はない.であれば質的交互作用

 効果が負

 効果が正

の割合の差)推定治療効果

層iの真の治療効果

質的交互作用のGail-Simon検定

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交互作用(m=2)

δ1

δ2

量的交互作用

量的交互作用

質的交互作用

質的交互作用

0

交互作用なし 12

0,0 21

0,0 21 0,0 21

0,0 21

母数空間

90

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質的交互作用の模式図(m=4)

d1 d2 d3 d4

+ ー

d1 d2 d3 d4

質的交互作用 なし

d1 d2 d3 d4 質的交互作用 あり

2

2

2

2

2

1

2

1Qs

d

s

d

2

4

2

4

2

3

2

3Qs

d

s

d

91

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Gail-Simon検定(上側検定)

))Q(1(25.0))Q(1(5.0:2

2i:)(

)5.0())Q(1(

)0()0(Q

0,,0:H

}0,,0{O

21

1

,

1

2

12

2

0

FFpm

xF

BinFp

dIZdIs

d

i

m

i

imi

i

m

i

ii

m

i i

i

mi

mi

乗分布の累積分布のカイ自由度

の片側検定

92

25.0)5.0(

5.0)5.0(

2,2

1,2

Bin

Bin

H0 χ12

χ22

χ12

Page 93: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定(下側検定)

))Q(1(25.0))Q(1(5.0:2

2i:)(

)5.0())Q(1(

)0()0(Q

0,,0:H

}0,,0{O

21

1

,

1

2

12

2

0

FFpm

xF

BinFp

dIZdIs

d

i

m

i

imi

i

m

i

ii

m

i i

i

mi

mi

乗分布の累積分布のカイ自由度

>>

の片側検定

 効果が負

93

25.0)5.0(

5.0)5.0(

2,2

1,2

Bin

Bin

Page 94: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

94

))Q(1(5.0:2

2i:)(

)5.0())Q(1(

)0(Q),0(Q

)Q,Qmin(

1

1

1

1,1

12

2

12

2

Fpm

xF

BinFp

dIs

ddI

s

d

Q

i

m

i

mi

i

m

i i

ii

m

i i

i

乗分布の累積分布のカイ自由度

Gail-Simon検定(両側)

5.0)5.0(1,1 Bin

H0

H0

χ12

χ12

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Gail-Simon検定(片側)

したがう:混合カイ2乗分布に

のカイ2乗分布自由度iを固定した下では,

は個の中の負の個数

したがう:混合カイ2乗分布に

のカイ2乗分布自由度iを固定した下では,

は個の中の負の個数

の下

Q

i

)5.0(i

Q

i

)5.0(i

0,,0

,

,

im

im

mi

Binm

Binm

95

Page 96: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

96

したがう.は混合カイ2乗分布に

のカイ2乗分布度を固定した下では自由

の分布は

までからΣは

負であれば全て正

の下

+ )Q,Qmin(

ii

)5.0(

1-m1

0Qor

0,,0:H

i1,-

0

Q

Bini

i

m

mi

Gail-Simon検定(両側)

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0.25

0,0 21

確率

dd

0.25

0,0 21

確率

dd

0.25

0,0 21

確率

dd

0.25

0,0 21

確率

dd

Z1とZ2の確率密度(δ1=0,δ2=0)の 等高線プロット

標本空間

97

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m=2の上側検定の統計量とp値

)Q(25.0)Q(5.025.01

)Q(25.0)Q(5.025.0

21

21

FFp

FF累積分布:

H0 χ12

χ22

χ12

Q 98 p=0.75 p=0.22

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m=2の両側検定の統計量とp値

)Q(5.05.01

)Q(5.05.0

1

1

Fp

F

累積分布:

H0

H0

χ12

χ12

Q99 p=0.50

75 p=0.11

Page 100: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定 data migraine;

input gender $ treatment $ response $ count @@;

datalines;

female Active Better 16 female Active Same 11

female Placebo Better 5 female Placebo Same 20

male Active Better 12 male Active Same 16

male Placebo Better 7 male Placebo Same 19

title 'Clinical Trial for Treatment of Migraine Headaches’;

100

Page 101: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定

ods graphics on;

proc freq data=migraine;

tables gender*treatment*response /chisq gailsimon riskdiff relrisk

plots(only)=relriskplot(stats) cmh

noprint;

weight count;run;

ods graphics off;

101

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Gail-Simon検定

表 1 : Treatment * Response

層別変数 : Gender=female

Treatment Response

Better Same 合計

Active

16

76.19

11

35.48

27

Placebo

5

23.81

20

64.52

25

合計

21

31

52

Better Same 合計

Active 16 11 27 59.26 40.74 Placebo 5 20 25 20 80 合計 21 31 52

Better Same 合計

Active 12 16 28

42.86 57.14

Placebo 7 19 26

26.92 73.08

合計 19 35 54

05.101239.0

3926.02

2

2

1

2

1 s

d

56.11277.0

1543.02

2

2

2

2

2 s

d

102

Page 103: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定 質的交互作用の Gail-Simon 検定

統計量 値 p 値

Q+ (正のリスク差) 11.6027 0.0011

Q- (負のリスク差) 0.0000 0.7500

Q (両側) 0.0000 0.5000

0),(

0

60.1156.105.10

1277.0

1543.0

1239.0

3926.02

2

2

2

2

2

QQMINQ

Q

s

dQ

i

i オッズ比等質性に対する Breslow-Day 検定

カイ 2 乗値 1.4929

自由度 1

Pr > ChiSq 0.2218 103

下側検定

上側検定

Page 104: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定 data migraine2;

input gender $ treatment $ response $ count @@;

datalines;

female Active Better 16 female Active Same 11

female Placebo Better 5 female Placebo Same 20

male Active Better 16 male Active Same 12

male Placebo Better 19 male Placebo Same 7

ods graphics on;

proc freq data=migraine2 order=data;

tables gender*treatment*response /nocol nopercent

chisq gailsimon riskdiff(cl=(wald))

relrisk plots(only)=riskdiffplot(stats) cmh ;

weight count;

title 'Clinical Trial for Treatment of Migraine Headaches’;run;

ods graphics off;

104

Page 105: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

Gail-Simon検定

Better Same 合計 Active 16 12 28 57.14 42.86 Placebo 19 7 26 73.08 26.92 合計 35 19 54

Better Same 合計

Active 16 11 27 59.26 40.74 Placebo 5 20 25 20 80 合計 21 31 52

Better Same 合計

Active 16 12 28 57.14 42.86 Placebo 19 7 26 73.08 26.92 合計 35 19 54

05.101239.0

3926.02

2

2

1

2

1 s

d

56.11277.0

)1543.0(2

2

2

2

2

2

s

d

105

Page 106: Sas Institute - 浜田知久馬 東京理科大学...SASによる2値データの解析 「ここまでできる FREQプロシジャV.9.3」 浜田知久馬 東京理科大学 Analysis

質的交互作用の Gail-Simon 検定

統計量 値 p 値

Q+ (正のリスク差) 10.0464 0.0024

Q- (負のリスク差) 1.5563 0.2209

Q (両側) 1.5563 0.1061

56.1),(

56.11277.0

)1543.0(

05.101239.0

3926.0

2

2

2

2

QQMINQ

Q

Q オッズ比等質性に対する Breslow-Day 検定

カイ 2 乗値 8.5464

自由度 1

Pr > ChiSq 0.0035

106

下側検定

上側検定

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まとめ

1)Wald信頼区間は,革新的

2)正確な信頼区間は,保守的

3)スコア検定ベースの信頼区間は,被覆確率が信頼水準に近い

107

Wald

スコア 正確