81
Endang S. Rahayu Fak.Teknologi Pertanian UGM Molekular Genetika: Molekular Teknik Endang S. Rahayu

Mikrobiologi Bioteknologi

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Molekular Genetika: Molekular TeknikEndang S. RahayuEndang S. Rahayu Fak.Teknologi Pertanian UGMAvery-MacLeod-McCarty experiment1944 Streptococcus pneumoniaEndang S. Rahayu Fak.Teknologi Pertanian UGMEndang S. Rahayu Fak.Teknologi Pertanian UGMMutasi, Recombinasi, Rekayasa Genetika• Mutasi, • Recombinasi– Transformasi – Transduksi – Konjugasi• Rekayasa GenetikaMutasiFigure 6.1Base-Pair SubstitutionsFigure 9.3Shifts in Reading FrameFigure 9.4RekombinasiGe

Citation preview

Page 1: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Molekular Genetika:

Molekular Teknik

Endang S. Rahayu

Page 2: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Avery-MacLeod-McCarty experiment

1944 Streptococcus pneumonia

Page 3: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 4: Mikrobiologi Bioteknologi

Mutasi, Recombinasi, Rekayasa

Genetika

• Mutasi,

• Recombinasi

– Transformasi

– Transduksi

– Konjugasi

• Rekayasa Genetika

Page 5: Mikrobiologi Bioteknologi

Mutasi

Page 6: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 6.1

Page 7: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.3

Base-Pair Substitutions

Page 8: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.4

Shifts in Reading Frame

Page 9: Mikrobiologi Bioteknologi

Rekombinasi

Page 10: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.9

Genetic Recombination

Page 11: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 12: Mikrobiologi Bioteknologi

Transformasi

Page 13: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.10

Page 14: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.14

Transformation

Page 15: Mikrobiologi Bioteknologi

Transduksi

Page 16: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 17: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.16

Generalized Transduction

Page 18: Mikrobiologi Bioteknologi

Specialized Transduction

Figure 9.17

Page 19: Mikrobiologi Bioteknologi

Konjugasi

Page 20: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 21: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 22: Mikrobiologi Bioteknologi

Pla

sm

ids

Page 24: Mikrobiologi Bioteknologi

Figure 9.23

Page 25: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 26: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 27: Mikrobiologi Bioteknologi

Mechanism of Conjugation

Page 28: Mikrobiologi Bioteknologi

Genetic Engineering Started in 1970s

Page 29: Mikrobiologi Bioteknologi

Other names • Gene manipulation

• Recombinant DNA technology

• Recombinant DNA science

• Gene transfer

• Gene splicing

• Gene cloning

Page 30: Mikrobiologi Bioteknologi

Genetic engineering • Technology involved in removing,

modifying, or adding genes to a DNA

molecule

• The transfer of genes (segment of

DNA) from one species to another.

• This is impossible in naturally

breeding

Page 31: Mikrobiologi Bioteknologi

Gene manipulation

• The formation of new combinations of

heritable material by the insertion of

nucleic acid molecules, produced by

whatever means outside the cell, into any

virus, bacterial plasmid or other vector

system so as to allow their incorporation

into a host organism in which they do not

naturally occur but in which they are

capable of continued propagation

Page 32: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Genetically Modified Organisms (GMOs)

Organisms that contain genetic

material that has been altered in

a manner that does not occur by

natural mutation, mating, or

recombination event

Page 33: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 34: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 35: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 36: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Products:

Recombinant Cultures

Page 37: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 38: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Topik

• Plasmids

• Restriction enzymes

• Gel electrophoresis

• Shouthern Blot

• PCR – Polymerase Chain Reactions

• Sequencing of the DNA

• Genetic Maps

Page 39: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

What is Plasmids ?

• Extrachromosomal DNA

• Having ori (origin of replication)

• Very small

• Carry genetic information

• Can be isolated from bacterial cells

• Important in a genetic engineering

Page 40: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Natural role of a plasmid in bacteria?

• Plasmids usually contain one or two gene

that confer a selective advantage on the

bacterium e.g. antibiotic resistance gene.

• Every plasmid possess a replicator gene

can duplicated independently from the

chromosomal DNA.

Page 41: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Antibiotic resistance genens and

replicator gene

Page 42: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Plasmid pBR322

Page 43: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 44: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 45: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 46: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 47: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Restriction Enzymes

Page 48: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

DNA double helixes are cut

at the axis of symmetry:

Page 49: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

DNA double helixes are cut

: sticky end

Page 50: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 51: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 52: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 53: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 54: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

EcoR1 Recognition Site

Figure 6.13

Page 55: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 56: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Electrophoresis

Page 57: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 58: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 59: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 60: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 61: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 62: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 63: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Southern Blot

Page 64: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 65: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 66: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 67: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Polymerase Chain Reaction

Page 68: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 69: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 70: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 71: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 72: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 73: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 74: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 75: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 76: Mikrobiologi Bioteknologi
Page 77: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Sequencing the DNA

Page 78: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 79: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Page 80: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM

Genetic maps of E. coli

Page 81: Mikrobiologi Bioteknologi

Endang S. Rahayu

Fak.Teknologi Pertanian UGM