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Laura Ballestra – Piero Cavaleri

Pubmed

In sintesi: la principale risorsa gratuita per la ricerca di documentazione biomedica

Pubmed è una banca dati biomedica che spoglia la letteratura periodica, prodotta dal US National Library of Medicine di Bethesda (Stati Uniti) e dal National Institute of Health. Contiene oltre 17 milioni di citazioni tratte dalla base dati a pagamento MEDLINE e da altri archivi di periodici di scienze naturali a partire dal 1950. PubMed include anche link a periodici a testo pieno e ad altre risorse. Ha raccolto la tradizione di grandi e fondamentali repertori cartacei, Index Medicus, International Nursing Index, Index to Dental Lit…, il cui equivalente elettronico è inserito in Medline. Buona parte delle citazioni è corredata da abstract (70% delle citazioni a partire dal 1970). Il 70% dei contenuti è in lingua inglese. Gli articoli vengono indicizzati a seconda della priorità della rivista da 15 giorni a due mesi dopo la pubblicazione. I settori principali coperti comprendono: ricerca biomedica, clinica, oncologia, amministrazione, odontoiatria, scienze infermieristiche Pubmed consente di ricercare a testo libero o, per ottenere risultati di maggior precisione, impiegando un linguaggio controllato chiamato MESH (medical subject headings).

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Accesso a Pubmed

L’indirizzo di partenza è: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ La maschera iniziale è quella della ricerca semplice, che presenta una serie di possibilità di scelta tra archivi in cui lavorare (ad. Esempio l’archivio “Journals” o l’archivio “Mesh”, ma di default la ricerca viene svolta su Pubmed).

Selezionando la ricerca avanzata “Advanced search” ci si trova di fronte ad una maschera di ricerca più articolata:

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La pagina iniziale di Pubmed – visione d’insieme

In evidenza alcuni archivi, tra cui quello del MESH da cui si accede ai soggetti

Opzioni di ricerca. Di default è impostata quella semplice.

Pubmed, archivio di default. Tra gli altri archivi consultabili c’è MESH

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Cerchiamo nell’archivio PUBMED

Quando la ricerca è condotta in modalità semplice le possibilità sono due: 1)ricercare con uno o più termini che dovranno essere presenti in un punto qualunque del documento in contemporanea (operatore AND) 2)ricercare una frase (in questo caso è necessario inserire degli apici). Ad esempio: Digitando “ACTIVITY BASED COSTING” sarà possibile recuperare articoli come questi:

Il complesso di documenti trovati è di 146. In alcuni casi la frase cercata è presente nel titolo, in altri nell’abstract o in altre parti del documento. Osserviamo uno dei documenti che recuperiamo.

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Molto diverso sarebbe stato l’esito se la ricerca invece di essere condotta sulla frase “ACTIVITY BASED COSTING” fosse stata condotta introducendo i termini ACTIVITY BASED COSTING senza apici. Avremmo ottenuto 183 documenti e non 146, con alcuni, come quello che segue, che non trattano di activity based costing.

NB Il carattere impiegato per il troncamento è l’asterisco.

Abstract

citazione

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Significa che inserendo COST* troveremo citazioni che contengono il termine COST ma anche citazioni che contengono il termine COSTING. Alla ricerca impostata è possibile imporre alcune limitazioni scegliendole dal menu LIMIT

Le limitazioni riguardano la data di pubblicazione delle opere, la possibilità di svolgere la ricerca solo su alcuni periodici, o alcuni set di periodici (periodici core clinical, periodici di nursing…), o solo su periodici che abbiano il testo pieno o un abstract. La lingua, il tipo di età dei pazienti, il tipo di articolo (clinical trial, practice guideline…) sono altri dei criteri possibili.

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Ricerca avanzata

Oltre alla ricerca semplice esiste un’altra modalità di ricerca avanzata

La maschera di ricerca avanzata presenta molte opzioni. Oltre a riproporre le ricerche già svolte (Search history) consente di inserire limitazioni nel menu LIMITS in relazione alla lingua del contributo, tipi di periodico, età del paziente… Interessante è la ricchezza della funzione “Search builder” qui sotto evidenziata (Search Builder fields), perché il numero di campi in cui si può digitare sono molti:

Menu LIMITS

Search History

Search Builder Fields

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Un po’ più a fondo nelle liste e nei record bibliografici

Tornando alla nostra ricerca iniziale l’esito viene strutturato in una lista di titoli:

Sulla destra notiamo: - la storia delle nostre ricerche (RECENT ACTIVITY) - l’etichetta SEARCH DETAILS che chiarisce molto bene che tipo di ricerca stiamo svolgendo, perché esplicita il campo in cui abbiamo chiesto di ricercare uno o più termini (il titolo in questo caso) La visualizzazione della lista è impostata di default su Summary, ma può essere modificata nel caso si vogliano aggiungere per esempio anche gli abstract. Può essere utile per evitare di aprire tutte le citazioni per leggere i singoli abstract. La modifica si rende operativa agendo sul tasto Display.

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Anche all’interno di ogni scheda di articolo (record d’ora in poi) è possibile modificare le impostazioni. Particolarmente rilevante è l’opzione di visualizzazione MEDLINE perché consente di visualizzare i singoli campi e in particolar modo quelli del MESH. Questo significa che se recuperate un articolo interessante potete verificare come è stato indicizzato semanticamente. Non in tutti i record è possibile trovare i descrittori MESH, quelli che li hanno sono contrassegnati da “Pubmed - Indexed for MEDLINE” visibile dalla lista. In altri casi sulla lista si trovano indicazioni diverse, tipo “As supplied by the publisher”. Questo significa che non ci dobbiamo aspettare i descrittori del MESH anche se chiediamo la visualizzazione MEDLINE.

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Questo dettaglio visibile dalla visualizzazione MEDLINE riporta tutti i campi presenti nel record e anche i descrittori MESH

Possiamo notare tra l’altro: AU e FAU = L’autore in due forme (quella originale di PUBMED e quella introdotta dal 2002 con Cognome e Nome) LA=lingua del testo PT=tipo di documento (articolo di periodico) PL=luogo TA=titolo abbreviato del periodico JT=titolo del periodico

Descrittori MESH introdotti da MH -

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NB

Ricerca per elementi certi

Autori:

Solo per articoli dal 2002 è possibile cercare inserendo la forma COGNOME, NOME o NOME COGNOME Esempio di ricerca con Author=”Smith” AND Title=”activity based costing” Per eseguirla bisogna scegliere dal Search Builder i campi di interesse (title, author…), digitare quanto richiesto e poi fare click su ADD TO SEARCH BOX

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Fonti e approfondimenti

Tutorials di Pubmed <http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html> The basics of MESH <http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/mesh/> Naldi Enrico, Biavati Catia, Parma Dila “Il quesito di ricerca e la rete” in L'infermieristica basata su prove di efficacia : guida operativa per l'evidence-based nursing / Paolo Chiari ... [et al.]. - Milano [etc.] : McGraw-Hill, c2006. - xix, 415 p. : ill. Vellone, Ercole La ricerca bibliografica : applicazioni nel nursing e nelle scienze sanitarie / Ercole Vellone, Maria Sciuto ; presentazione di Annalisa Silvestro. - Milano [etc.] : McGraw-Hill Libri Italia, c2001. - xv, 215 p. ; 21 cm.