36
アロエコートグローブ(パウダーフリー) p.34 活性型 MMP7 測定キット p.28 No.675 3 / 1 2019 研究室の フナコさん p.30 p.03 お花畑でつかまえて 細菌叢(マイクロバイオーム)・NGS(次世代シークエンス)関連製品

お花畑でつかまえて - Microsoft...アロエコートグローブ(パウダーフリー) p.34活性型MMP7測定キット p.282019 3/1 No.675 研究室の フナコさん

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アロエコートグローブ(パウダーフリー) ▼ p.34

活性型MMP7測定キット ▼ p.28

No.6753 /12019

研究室のフナコさん

▼ p.30

▼ p.03お花畑でつかまえて細菌叢(マイクロバイオーム)・NGS(次世代シークエンス)関連製品

フ ロ ー ラ

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フナコシニュース2019年 3月 1日号

No.675特集 細菌叢(腸内フローラ)� p.3~21

・次世代シークエンス(NGS)

The�Catcher�in�the�Flora

細菌叢(さいきんそう;マイクロバイオーム)は,生物の体内・皮膚,あるいは土壌などに存在する微生物の集まりのことです。腸内のものは特に「腸内フローラ」と呼ばれます。

次世代シークエンス(NGS:Next-generation sequencing)の登場によりゲノム解析手法が大幅に進歩しました。近年研究が加速し,論文数も急増しています。

機器

ビーズ式組織・細胞破砕装置 11 キャピラリー式電気泳動装置 11

細菌叢関連製品

細菌叢の標準試料 4DNA / RNA 試料を保存する試薬 5環境試料からの核酸抽出キット 6土壌・糞便用の核酸抽出キット 716S rRNA ライブラリー構築キット 8鎖長に応じて DNA を精製するキット 8細菌類を室温保存できるチューブ 9腸透過性測定キット 10細胞内ポリアミンの検出試薬 10

受託サービス

微生物ファイバ作製 受託 9細菌叢からの純化培養 受託 9細菌叢関連 解析 受託 12植物・微生物の遺伝子解析 受託 13外来 DNA の挿入位置解析 受託 13次世代シークエンス解析 受託 14バイサルファイトシークエンス 受託 15ChIP-Seq 受託 15

NGS関連製品

イルミナシークエンサー用 ポジティブコントロールライブラリー 16

NGS ライブラリー構築キット 17全ゲノム増幅キット 18

RNA-Seq 関連製品

3’ 末端特異的 RNA-Seq ライブラリー調製キット

20

small RNA のライブラリー構築に有用な逆転写酵素 21

ン タ

ビ ュ ー イ

研 究

室 File:02 東京大学 大学院薬学系研究科内山 聖一 助教

研究テーマ,ご自身のエピソード について語っていただきました!

p.32~33

遺伝子工学/機能解析

一塩基違いを PCR で検出するDNA ポリメラーゼ 22

Loading Dye 入りの PCR マスターミックス 22

TA クローニングキット 23DNase / RNase フリー水 23

NEW トランスフェクション試薬DharmaFECT 24

1st strand cDNA Panel Total RNA Panel 受託 25

サイトカイン/神経伝達/タンパク質

歯周病関連因子を 検出する抗体アレイ 26

抗 IL-1α マウス抗体 26神経伝達物質 ELISA キット 27

NEW 活性型 MMP7 ELISA キット 28オキシトシン測定キット 28

低分子化合物

細胞内の標的タンパク質分解を 誘導する低分子化合物 PROTAC 29

組織染色

NEW 透明化処理組織の観察に 適したチャンバー 30

植物研究

植物研究用 ローディングコントロール抗体 細胞小器官のマーカー抗体

31

機器・消耗品

NEW パウダーフリーの アロエコートグローブ

34

NEPTUNE チップ ラック変更のお知らせ 35

NEW i-NTER LENS アダプター/オプションiPhone専用ケース/iPod Touch セット

36

キャンペーン情報 35

研究室のフナコさん 30

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi news

NOTE※本紙に記載されている価格は,2019 年 3 月 1 日現在です。表示価格に,消費税等は含まれていませ

ん。一部価格が予告なく変更される場合がありますので,あらかじめご了承下さい。※本紙に掲載されている製品は研究用です。医薬品,診断用医薬品,食品,食品検査等の用途には使

用できません。※ 印の製品は,「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律

(通称:カルタヘナ法)」使用規制対象となりますので,ご使用に際しては規制に則し,適切にお取り扱い下さい。

※ 印の製品は,取り扱いに厳重な注意を要する製品であり,ご購入時に「使用目的確約書」が必要になります。ご注文の際は,「使用目的確約書」に直筆でご記入の上,販売店経由で当社までお送り下さい。確約書受領後に製品を発送させていただきます。また,これらの製品をご購入後は,鍵の掛かる場所での保管をお願いいたします。

※ 印の製品は,「毒物及び劇物取締法」に基づく医薬用外毒劇物です。法規制に従って,保管,廃棄等して下さい。

※ 印の製品は,毒性があるため,取り扱いに注意または厳重な注意が必要です。製品は,鍵の掛かる場所に保管して下さい。添付されているデータシートや商品ラベルをよくお読み下さい。

※ 印の製品には安全にご利用いただくための警告ラベルが貼られています。表示に従って安全対策を実施して下さい。

※ 印は,液体窒素中での保存を要する製品です。ドライアイス包装で配送していますが,製品到着後,直ちに液体窒素中で保存して下さい。

※ 印は,-80℃ での保存を要する製品です。ドライアイス包装で配送していますが,製品到着後,直ちに-80℃ のフリーザー等に保存して下さい。

※#以下の英数字は,商品コードを示します。※外観・仕様は改善のため,予告なく変更することがあります。※R&D Systems はテクネ コーポレイションの登録商標です。

使用に当たっては同社の許可が必要な場合があります。※記載されている会社および商品名は,各社の商標または登録商標です。※本紙には各メーカーから提供された画像・図表が掲載されています。なお,画像・図表の著作権は

各メーカーが保有しています。※ご注文の際は,[品名,メーカー,商品コード,包装,数量]をお知らせ下さい。※Apple,iPhone の名称およびそのロゴは,Apple Inc. の米国およびその他の国における商標または

登録商標です。

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細菌叢解析 受託サービスもおまかせ下さい!

細菌叢研究やメタゲノム解析を総合的にサポート

まずはお気軽にご相談下さい!

ご注文方法/価格などの詳細は,当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。� [メーカー:ZYR]

TEL�03-5684-1645  FAX�03-5684-6539   �:�[email protected]受託・特注品担当

解析例� [Webページ番号:45963]

Validated, Non-Biased Workflows from Collection to Analysis

p.4 p.5 p.6~7 下記p.8

Zymo�Research 社は 1994 年に米国カリフォルニア州で創業されたメーカーで,DNA/RNA 精製キットやエピジェネティクス研究用製品をお届けしています。遺伝子工学領域で培ってきた技術と経験を活かして,細菌叢解析データのバイアスを低減させる製品を開発・販売しています。ZymoBIOMICS は,細菌叢研究の全ワークフローをカバーした Zymo Research 社の製品ラインナップです。

各種試料(糞便,土壌,水,唾液,皮膚,植物,食物など)に存在する細菌叢の NGS(次世代シークエンシング) に よ る 遺 伝 子 解 析, バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス 解 析 を 承 り ま す。 ス タ ン ダ ー ド や 核 酸 抽 出 に はZymoBIOMICS 製品を用いるため,エラーやバイアスの少ない,再現性の高いデータが期待できます。

✓ 16S rRNA 遺伝子のシークエンシング(細菌叢の系統分類)✓ ショットガンシークエンシング(微生物を同定)

細菌叢の組成(属)解析 クラスター解析 α 多様性解析(試料内比較) β 多様性解析(試料間比較)

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi�news

細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

3

お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

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NGS を用いた細菌叢およびメタゲノミクス研究において,標準品として有用な微生物混合物/DNA 混合物です。

細菌叢の標準試料ZymoBIOMICS Microbial Community Standard

キットに含まれる微生物試料(10 種類)

グラム陰性菌(3 種類) グラム陽性菌(5 種類) 酵母(2 種類)

Pseudomonas aeruginosa

Escherichia coli

Salmonella enterica

Lactobacillus fermentum

Enterococcus faecalis

Staphylococcus aureus

Listeria monocytogenes

Bacillus subtilis

Saccharomyces cerevisiae

Cryptococcus neoformans

微生物構成比の異なる 2 種類のスタンダードがあります

Community Standard 

種 類理論上の構成比(%)

ゲノム DNA

16S rRNA

16S & 18S rRNA

ゲノム コピー数 細胞数

P. aeruginosa 12 4.2 3.6 6.1 6.1

E. coli 12 10.1 8.9 8.5 8.5

S. enterica 12 10.4 9.1 8.7 8.7

L. fermentum 12 18.4 16.1 21.6 21.4

E. faecalis 12 9.9 8.7 14.6 14.5

S. aureus 12 15.5 13.6 15.2 15.1

L. monocytogenes 12 14.1 12.4 13.9 13.8

B. subtilis 12 17.4 15.3 10.3 10.2

S. cerevisiae 2 NA 9.3 0.57 1.13

C. neoformans 2 NA 3.3 0.37 0.73

Ⅰ Community Standard 

種 類理論上の構成比(%)

ゲノム DNA

16S rRNA

16S & 18S rRNA

ゲノム コピー数 細胞数

L. monocytogenes 89.1 95.9 91.9 94.8 94.5

P. aeruginosa 8.9 2.8 2.7 4.2 4.2

B. subtilis 0.89 1.2 1.1 0.70 0.70

S. cerevisiae 0.89 NA 4.1 0.23 0.47

E. coli 0.089 0.069 0.066 0.058 0.058

S. enterica 0.089 0.070 0.067 0.059 0.059

L. fermentum 0.0089 0.012 0.012 0.015 0.015

E. faecalis 0.00089 0.00067 0.00064 0.001 0.00099

C. neoformans 0.00089 NA 0.0014 0.00015 0.00030

S. aureus 0.000089 0.00010 0.00010 0.00010 0.00010

ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard の使用例 (16S rRNA シークエンシング法のコントロールとして使用)

16S V3-4 領域に対するプライマーを用いて,16S rRNA-Seq 法の最適化を検討した。左側の円グラフで見られるノイズは,主に PCR によるアーティファクトやコンタミネーションによるもので,最適化されたワークフロー(右側)ではこれらの増幅が抑制された。

従来法 本製品を使用・Ultra-clean reagents・Ultra-clean processes・Limit PCR cycles・Good MiSeq run・Uchime filtration・Others

最適化ワークフロー

[メーカー:ZYR]

品 名 タイプ 商品コード 包 装 価格(¥)

ZYR336300 ZymoBIOMICS Microbial Community Standard10 種類の不活性化した微生物(グラム陰性菌 3 種類,グラム陽性菌 5 種類,酵母 2 種類)の混合物。

Ⅰ D6300  0.75 ml 49,000

ZYR336310 Ⅱ D6310  1 kit(0.75 ml) 59,000

ZYR336305ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard

10 種類の微生物から抽出・精製したゲノム DNA の混合物。

ⅠD6305 200 ng 20,000

ZYR336306 D6306 2,000 ng 39,000

ZYR336311 Ⅱ D6311 1 kit(200 ng/20μl) 30,000

65367

Web ページ番号検索

● ショットガン・メタゲノミクスシークエンシングを用いてロット毎の微生物構成を確認しています。● 外来 DNA 含有量は<0.01% で,不純物はほとんど含まれていません。

微生物ゲノム DNA の構成比が,10 倍希釈系列となっています。より高感度な解析や,微生物叢解析ワークフローの検出限界を調べる場合などに有用です。

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

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お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620   FAX:03-5684-1775   :[email protected]

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65363

Web ページ番号検索

微生物の増殖を抑制し,核酸を室温下でも安定的に保存できる試薬と,試薬が充填済みのチューブです。

サンプル

微生物由来の核酸を室温で採取・輸送できる!DNA / RNA Shield

特 長�●�室温下でDNAは2年以上,RNAは1か月まで保存できます。●�細胞を効果的に溶解し,ウイルスなどの感染因子を不活性化します。

DNA/RNA�Shield を使用し,室温下で 1か月間保存した試料の微生物叢の推移を解析した。上図に示した経過日数の試料からDNAをZymoBIOMICS�DNA�Mini�Kit(p.6参照)�を用いて抽出し,16S�rRNA遺伝子に対する微生物叢の構成のプロファイリングを行った(Genus�Composition)。DNA/RNA�Shield を用いた場合(右図),試料は安定的に保存され,微生物叢構成に変化は見られなかった。

Fecal�Collection�Tube(#R1101) Collection�Tube�with�Swab(#R1106)

製品ラインナップ�

DNA/RNA�Shield(2×concentrate)

Blood�Collection�Tube,�DNA/RNA�Shield

Collection�Tube�with�Swab,�DNA/RNA�Shield

Microbe�Lysis�Tube,�DNA/RNA�Shield

Saliva�Collection�Kit,�DNA/RNA�Shield

Fecal�Collection�Tube,�DNA/RNA�Shield

[メーカー:ZYR]

適用試料 品  名 タイプ DNA/RNA Shield 量 試料量 商品コード 包 装 価格(¥)

全種類

DNA/RNA�Shield  試薬のみ50�ml 試料により

異なるR1100-50 50�ml 13,000 ZYR171123

250�ml R1100-250 250�ml 45,000 ZYR171125

DNA/RNA�Shield�(2×concentrate) 試薬のみ25�ml 試料により

異なるR1200-25 25�ml 13,000 ZYR172025

125�ml R1200-125 125�ml 45,000 ZYR172125

DNA/RNA�Shield�Collection�Tube 2�ml チューブ入り 1�ml ≦100�μl R1102 50�pieces 39,000 ZYR371195

微生物 Microbe�Lysis�Tube,�DNA/RNA�Shield 2�ml チューブ入り�(Lysis 用ビーズを含む) 1�ml ≦100�μl

R1103 50�pieces 49,000 ZYR371115

R1104 50�pieces 59,000 ZYR171104

組織 Tissue�Lysis�Tube,�DNA/RNA�Shield 2�ml チューブ入り�(Lysis 用ビーズを含む) 1�ml ≦100�μl R1105 50�pieces 49,000 ZYR371155

血液 Blood�Collection�Tube,�DNA/RNA�Shield 16×100�mm真空チューブ入り 6�ml 3�ml R1150 50�pieces 88,000 ZYR371156

糞便 Fecal�Collection�Tube,�DNA/RNA�Shield 15�ml チューブ入り�+採取用スプーン 9�ml 約 1�mg�/�

1�ml R1101 10�pieces 18,000 ZYR371109

口腔,鼻腔喉表面

Collection�Tube�with�Swab,��DNA/RNA�Shield

5�ml チューブ入り�+スワブ 1�ml* ≦100�μl

R1106 10�pieces 14,000 ZYR571110

R1107 50�pieces 63,000 ZYR571150

唾液 Saliva�Collection�Kit,�DNA/RNA�Shield �DNA�/�RNA�Shield+唾液採取用チューブ 2�ml 2�ml

R1210 10�kits 15,000 ZYR172110

R1210 50�kits 70,000 ZYR172150

*2�ml のタイプ(#R1108,#R1109)もあります。詳細はWebをご覧下さい。

経費のかかるドライアイス輸送は不要!

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi news

細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

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お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620   FAX:03-5684-1775   :[email protected]

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65463

Web ページ番号検索

土壌・糞便などの試料に含まれる細菌,真菌類,原生動物,藻類,ウイルス,ミトコンドリア および宿主の核酸を,バイアス無く抽出するキットです。試料中の微生物,ウイルスなどを効果的に溶解し,PCR 阻害物質を含まない核酸が得られます。※DNA 抽出キットは 16S rRNA 遺伝子の qPCR によりキットに微生物の混入がほぼ無いこと (溶出液 1 μl 中にバクテリアゲノムのコピー数が 3 以下)

を確認しています。

サンプル

様々な環境試料からの核酸抽出に対応!ZymoBIOMICS DNA/RNA Kit

従来の核酸精製キットでは 微生物の種類によって DNA 抽出効率にバイアスが生じる可能性がある

10 種類の微生物があらかじめ所定の割合で混合されている 微生物叢スタンダード*1 から,4 種類の方法で DNA を抽出し,細菌由来 16S rRNA 遺伝子の解析を行った。

その結果,溶解効率の違いが影響したためか,精製された核酸は理論値と異なる微生物の存在比を示した。

本製品のみ理論値に近い正確なプロファイルが示され,微生物の種類によらず正確に DNA を抽出できた。

*1 ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(p.4 参照)を使用した。

*2 Human Microbiome Project fecal DNA extraction protocol

100%

90%

80%

70%

60%

50%

40%

30%

20%

10%

0%

Microbial Composition(16S Counts)

理論値 A社製品 B社製品本製品(DNA Mini Kit)

HMP Protocol*2

Bacillus subtilis (G+)

Listeria Monocytogenes (G+)

Staphylococcus aureus (G+)

Enterococcus faecalis (G+)

Lactobacillus fermentum (G+)

Salmonella enterica (G-)

E.coli (G-)

Peudomonas aeruginosa (G-)

[メーカー:ZYR]

キットの種類DNA 抽出 RNA 抽出

MicroPrep MiniPrep 96 Kit 96 MagBead Kit MiniPrep

フォーマット スピンカラム 96 well スピンカラム

試料量

哺乳動物糞便 ≦50 mg ≦200 mg ≦100 mg ≦200 mg

土 壌 ≦100 mg ≦250 mg ≦100 mg ≦200 mg ≦250 mg

細 胞

湿重量 5~20 mg 50~100 mg 5~20 mg 5~20 mg 50~100 mg

細 菌 2×108 cells 1×109 cells 2×108 cells 2×108 cells 109 cells

酵 母 2×107 cells 1×108 cells 2×107 cells 2×107 cells 108 cells

水,スワブ試料 250 μl,または水試料をろ過したフィルター

ZYR034301 DNA/RNA 回収量 ≦5 μg ≦25 μg ≦5 μg ≦10 μg ≦100 μg

ZYR334300 用 途 PCR,RT-PCR,アレイ,16S rRNA 遺伝子シークエンシング,ショットガン・シークエンシングなど

ZYR034303 使用回数 50 preps 50 preps 2×96 preps 2×96 preps 50 preps

ZYR034309 精製 DNA/RNA サイズ 15~20 kb ≧17 nt

ZYR034302 溶出液量 10~20 μl 50~100 μl 20 μl 37.5~50 μl 50~100 μl

ZYR034308 商品コード D4301*3 D4300*3 D4303*4 D4309*3 D4302*4 D4308*3 R2001*3

ZYR172001 包装/価格(¥) 1 kit / 57,000 1 kit / 57,000 1 kit / 179,000 1 kit / 179,000 1 kit / 182,000 1 kit / 182,000 1 kit / 83,000

破砕方法:Lysis Tube(*3),Lysis Rack(*4)

65370操作方法によって,同一の試料から DNA および RNA それぞれを単離,または全核酸の単離が可能な DNA/RNA Mini Kit(#R2002)もあります。

DNA RNA

小包装の無料サンプル品をご用意しています。ご希望の方は当社テクニカルサポート(試薬担当)までお問い合わせ下さい。

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

6

お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620   FAX:03-5684-1775   :[email protected]

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糞便,砂,粘土,泥炭などの試料を破砕ビーズで効率的に溶解し,バクテリアや菌類,藻類, 原虫などの様々な微生物やウイルスの核酸を抽出するキットです。

土壌・糞便からの核酸抽出に最適Quick-Fecal / Soil Microbe Kit

4801

Webページ番号検索Quick-RNA

496

Webページ番号検索Quick-DNA

使用例�

A他社製品本製品

(Miniprep Kit) B

1 kb DNALadder Total RNA

DNA�MiniPrep�Kit(#D6010)または他社製品を用いて,ラット糞便試料から抽出したDNAの電気泳動像

250�mg の汚泥から RNA�MicroPrep�Kit(#R2040)を�使用して精製したArthrobacter 属の total�RNA

Check�it�out!� [メーカー:MPB]

試料の破砕には�Fastprep-24�5G�(#6005-500,MP�Biomedicals 社)をオススメします!

FastPrep の詳細は

p.11

製品ラインナップ�[メーカー:ZYR]

キットの種類DNA抽出 RNA抽出

96 MicroPrep MiniPrep MidiPrep MicroPrep

フォーマット 96�well スピンカラム スピンカラム

試料量糞 便 ≦80�mg ≦150�mg ≦375�mg ≦250�mg

土 壌 ≦135�mg ≦250�mg ≦5�g ≦250�mg

DNA/RNA回収量 ≦5�μg ≦5�μg ≦25�μg ≦125�μg 10�μg ZYR036110

精製核酸のサイズ 100�bp~40�kb ≦40�kb 100�bp~40�kb >17�nt ZYR036120

使用回数 2×96�preps 50�preps 50�preps 25�preps 50�preps ZYR036100

商品コード D6011 D6012 D6010 D6110 R2040 ZYR336100

包装/価格(¥) 1�kit�/�125,000 1�kit�/�41,000 1�kit�/�41,000 1�kit�/�88,000 1�kit�/�63,000 ZYR172400

Zymo Research 社 核酸抽出・精製キットの特長バッファー類の残留を防ぐ�スピンカラム構造

破砕・溶解が困難な試料に�最適化された破砕ビーズを採用

キット構成品は�単品でも購入可能*

特殊フィルターにより�PCR阻害物質を効率的に除去最適化された破砕ビーズを採用

*一部購入できない製品もあります。

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

7

お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620   FAX:03-5684-1775   :[email protected]

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68084

Web ページ番号検索

63883

Web ページ番号検索

細菌叢のプロファイリング時に用いられる,16S rRNA 遺伝子の NGS に最適な DNA ライブラリーを迅速に構築するキットです。

ライブラリー調製,PCR,制限酵素処理,ライゲーション後などの試料から,特定範囲の鎖長の DNA 断片を迅速かつ簡便に精製するキットです。

16S rRNA ライブラリー構築キットQuick-16S NGS Library Prep Kit

鎖長に応じて DNA を精製Select-a-Size DNA

Clean & Concentrator

特 長�●�共通の 16S プライマーではなく,独自の 2 組のプライマーセットを用いることで,バクテリア・古細菌を系統学的に広くカバーしたライブラリーを構築できます。

●�構築したライブラリーの定量に必要な定量 PCR 試薬がキットに含まれています。

●�構築したライブラリーは Illumina 社のMiSeqシークエンシングにそのまま使用できます。

●�操作時間はわずか 1.5 時間です。●�試料 DNAの事前のノーマライズは不要です(DNA濃度の範囲:5~20�ng/μl)。

●�キットに含まれる酵素で PCR後の精製が可能です。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Quick-16S NGS Library Prep Kit(96 reactions)ZYR036400 ZYR D6400 1�kit�/ 195,000

キット内容:Quick-16S�qPCR�premix,Quick-16S�primer�set�V1-V2,Quick-16S�primer�set�V3-V4,ZymoBIOMICS�DNase/RNase�free�water,ZymoBIOMICS�microbial�community�DNA�standard,Reaction�clean-up�solution,Index�primer�set�A,Fluorescence�standards�set(standard�1~4),Select-a-Size�MagBeads,DNA�wash�buffer,Magnetic�rod

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Select-a-Size DNA Clean & Concentrator(25 preps)ZYR D4080 1�kit�/ 10,000 ZYR034800キット内容:Select-a-Size�DNA�binding,DNA�wash�buffer,DNA�elution�buffer,Zymo-Spin�columns,Collection�tubes

Select-a-Size DNA MagBead KitZYR D4084 MagBeads 10 ml 1�kit�/ 43,000 ZYR034840ZYR D4085 MagBeads 50 ml 1�kit�/ 149,000 ZYR034850キット内容:Select-a-Size�MagBeads,DNA�wash�buffer,DNA�elution�buffer

特 長�●�精製した DNA は次世代シークエンシングやライブラリー調製,PCR,ライゲーション,酵素処理などに使用できます。

※MagBead�Kit(磁気ビーズフォーマット)の使用には別途磁気ラックが必要です。

フォーマット スピンカラム 磁気ビーズ

商品コード D4080 D4084D4085

分子量 カットオフ値

≧300�bp,≧200�bp,≧150�bp,≧100�bp,

≧50�bp

≧1,000�bp,≧800�bp,≧500�bp,≧400�bp,≧300�bp,≧200�bp,≧150�bp,≧100�bp

DNA 結合容量 ≦3�μg ≦10�μg

操作時間 7 分(2�preps),�20 分(24�samples) ≦10分

溶出液量 ≧10�μl

使用例�

Select-a-Size DNA Clean and Concentrator(#D4080)を用いた分画精製≧300�bp,≧200�bp,≧150�bp,≧100�bp の DNA 断片をそれぞれ精製し,バイオアナライザーで分析した。試料:超音波処理したサケ精子DNA(700�μg)

使用例�

PCRキメラの発生

試料:等量の糞便由来DNAから構築したライブラリー

本製品 HMP Protocol(30 Cycles)

EMP Protocol(35 Cycles)

本製品は PCR 由来のバイアスや PCR キメラを抑えることができ,ほとんどの場合 PCRキメラの存在量は 2%以下となります。

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67555

Web ページ番号検索細菌類の群集組成を維持しつつ 生きたまま保存します

キットに付属のスワブを用いて口腔内,糞便,土壌から得られた試料を 専用チューブ(iSWAB vial)に採取するだけで,細菌類を室温保存できます。

口腔内,糞便,土壌中の細菌類を室温保存iSWAB-Microbiome

特 長� 使用例�●�採取した細菌類は,室温で 8週間安定です。●�好気性・嫌気性の両方の細菌類群集組成を維持できます。●�採取した試料を培地に移して培養できます。●�哺乳動物細胞と細菌を分離できるため,宿主由来の核酸の混入を最小限に抑え,細菌由来の核酸のみを抽出可能です。

●�qPCR,マイクロアレイ,次世代シークエンシングなどに使用できます。

室温で 2週間保存した試料から抽出したRNAも,�採取当日に抽出した場合と変わらない

上清:�細菌

沈殿:�口腔細胞

本製品で採取し 14日間保管した糞便試料または口腔内試料からRNAを抽出した。(20�ng/well)

Gut/Fecal Oral

マーカー 0日 14日後0日 14日後

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

iSWAB Microbiome Collection Kit, 1.0 mlMDT007000 MDT ISWAB-MB-1200 1�kit�/ 3,000

iSWAB Microbiome Collection Tube, Rack Format(1.0 ml×50)MDT701901 MDT ISM-T-1200-R 1�pack�/ 90,000

ラック入りチューブ×50本。スワブは付属していません。

68067

Web ページ番号検索

6683

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受 託

微生物を封入したゲルチューブ微生物ファイバ作製受託サービス

受 託

有用微生物のスクリーニングに細菌叢からの純化培養サービス

中 空 の ハ イ ド ロ ゲ ル チ ュ ー ブ に 微 生 物 を 内 包 し た 「微生物ファイバ」を作製する受託サービスです。

有用微生物を複数種含むカクテル状態の微生物群から純化して個々に培養を行うことで,細菌叢中の各微生物を分離・同定します。

太さ内径:50~500 μm外形:100~1,000 μm

外殻のアルギン酸ゲルは,約 2,000 kDa 以下の物質を透過させる

ファイバ外部に存在する他種の菌などから封入した菌を保護できる

菌体を隔離したまま,低分子の物質を透過させることができる

[メーカー:CEF]

受託内容�

■純化サービス●�複数の培地を用いて分離培養を試みます(細菌・カビなど)。●�確認されたコロニー数と形態確認を行います。●�分離・同定の実施についてはご相談させていただきます。※同定試験の際,DNA抽出は1コロニーにつき最大2回まで実施します。※取得したシークエンスはBLAST�Search による参照を行います。

■培養・保管サービス●�小スケール検証培養(1�L)� ● 拡大培養(10�L など)� ● 保管[メーカー:AHC]

詳細は当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645  :[email protected]お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620  :[email protected]

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2 種類の非消化糖類(ラクツロース,D-マンニトール)をそれぞれ定量し,その吸収率の比から腸透過性を測定するキットです。※本製品は研究用です。臨床用途には使用できません。

簡便な腸透過性測定キットEnzyChrom Intestinal Permeability Assay Kit

Memo腸透過性(Intestinal Permeability)とは0.4 nm 以下の分子やイオンは,腸管内腔から上皮細胞間の密着結合を介して血流へ漏出します。ラクツロースのみが細胞間隙から吸収されるため,ラクツロース/マンニトール比によって腸透過性を表すことができます。

操作方法概略

1. ラクツロース,マンニトールを含む試験液*を経口摂取させる。

2. 全尿を採取する。(試験液摂取後 6 時間以内)

3. ラクツロースおよびマンニトール総量をそれぞれ測定する。

4. その吸収率の比から腸透過率を決定する。*測定には別途,飲用のラクツロース,マンニトールが必要です。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Intestinal Permeability Assay Kit, EnzyChrom (100 tests)BAS031033 BAS EIPM-100 1 kit / 108,000

下記 Lactulose Assay Kit と D-Mannitol Assay Kit のセット。

個別キット

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Lactulose Assay Kit, EnzyChrom (100 tests)BAS031034 BAS ELTL-100 1 kit / 79,000

測定範囲:3~300 μM(96 well plate 使用時),検出限界:3 μM,測定波長:565 nm

D-Mannitol Assay Kit, EnzyChrom (100 tests)BAS423910 BAS EMNT-100 1 kit / 73,000

測定範囲:0.007~3 mM(96 well plate 使用時),検出限界:7 μM,測定波長:565 nm

特 長

● 測定動物種:ヒト● 測定時間:60 分(ラクツロース),30 分(マンニトール)

67882

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ポリアミンと特異的に反応し赤色蛍光色素 TAMRA を付加する細胞透過性の試薬です。※本製品は,国立研究開発法人 理化学研究所 開拓研究本部 田中生体

機能合成化学研究室の研究成果を元に製品化されました。 原著論文:Vong K., et al., Chem. Commun., 53, 8403 (2017).

細胞内のポリアミンを検出する蛍光性試薬

特 長

● 前処理不要かつ簡便な操作で,生細胞内ポリアミンの検出や,半定量*,局在評価を行えます。

● ポリアミン(プトレシン,スペルミジン,スペルミン)に高い特異性を示し,アミノ酸やモノアミンにはほとんど反応しません。

*総ポリアミンを検出するため,個々のポリアミン種の定量はできません。※ローダミンのフィルターセットで観察できます(励起/蛍光 波長:

560 nm/585 nm)。

使用例

がん細胞と非がん細胞のポリアミン検出がん細胞および非がん細胞を本製品(30 μM)で 10 分間処理し,PBS で 3 回洗浄,DAPI染色後に細胞をホルマリン固定した。がん細胞で有意に TAMRA のシグナルが見られた。一方,非がん細胞にはポリアミン量が少ないため,シグナルがほとんど検出されなかった。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

PolyamineRED 〈Intracellular Polyamine Detection Reagent〉FNA FDV-0020 0.5 mg / 35,000 FNA000020

Memoポリアミンは哺乳動物,微生物,植物に広く存在し,DNA/RNA やタンパク質と相互作用して様々な生理活性を示すことが知られています。ヒトを含む動物では食事と腸内細菌が重要なポリアミン供給源です。ポリアミンの一種(プトレシン)は複数の腸内細菌の代謝経路を経由して生合成されることが分かっています。Kitada Y., et. al., Sci. Adv. Jun 27; 4 (6) (2018) [PMID: 29963630]

腸内フローラのバランス異常(dysbiosis)と腸管バリア機能の低下には関連性が示唆されています。腸透過性が高まる(leaky gut)と細菌や有害物質が血中へ移行しやすくなり,炎症を引き起こします。

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お問い合わせ先:〈試薬〉TEL:03-5684-1620   FAX:03-5684-1775   :[email protected]

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ビーズ式組織・細胞破砕装置FastPrep-24 5G

キャピラリー式電気泳動装置Qsep100

●試料別の最適な破砕条件(73 種類)があらかじめ登録されており,カラータッチパネル液晶で選択するだけで簡単に使用できます。

●別売 試料ホルダーの使用により,多検体や大容量の試料,冷却しながら処理することも可能です(下記参照)。

39W×49D×50Hcm,26kg

設定時間範囲 1~120秒間(1秒単位)

標準装備ホルダー 2.0ml 専用チューブ:24本

電 源 AC100~240V,50/60Hz

[メーカー:MPB]

商品コード 包 装 価格(¥)

MPB600550 6005-500 1unit 980,000

[メーカー:MPB]

MPB600258MPB600253MPB610253

CoolPrep#6002-528

2ml×24本1piece/¥230,000

CoolTeenPrep#6002-530

15ml×6本1piece/¥250,000

CoolBigPrep#6002-531

50ml×2本1piece/¥250,000

低温 低温 低温

[メーカー:MPB]

MPB602545MPB600257MPB600254

All-Metal QuickPrep#6002-545

2ml×24本1piece/¥220,000

HighPrep#6002-527

2ml×48本1piece/¥220,000

TallPrep#6002-540

15ml×12本1piece/¥220,000

MPB600256MPB600255

TeenPrep#6002-526

4.5ml×24本1piece/¥220,000

BigPrep#6002-525

50ml×2本1piece/¥220,000

別売 試料ホルダー

■低温用(ドライアイス使用)

■常温用

*2 試料の種類(DNA/RNA)および分解能に応じて別売カートリッジキットをご購入下さい。詳細はWebをご覧下さい。

※別途,PC(Windows7 以上)が必要です。

●NGS 用のDNA/RNAのサイズチェックに最適です。●ペン型のキャピラリーゲルカートリッジ(別売,使い捨て)をセットするだけで,簡単に操作できます。

●測定試料数:1~96

デモ承ります

当社機器担当までお問い合わせ下さい。

使用例

[メーカー:BOP]

商品コード 包 装 価格(¥)

C100100 1unit 2,600,000 BOP001000

Range(bp) ng / μl % total nmole/L Avg.size

Library 100~5000 55.98 99.71% 101.71 846.96

400~600 7.63 13.62% 23.75 493.97

600~800 7.16 15.03% 15.53 709.73

800~1000 9.22 19.37% 15.82 896.50

1000~1200 5.29 10.40% 7.52 1082.95

フラグメント化 DNA の品質確認より高品質のシークエンスデータを得るためには,DNA断片の大きさをある範囲内にそろえる必要がある。図の場合,DNAが平均895bpに断片化されていることがわかる(赤)。

Quality control of fragmented DNA

泳動時間(分)

Qsep100 本体ペン型キャピラリーゲルカートリッジ*2

解析用 ソフトウェア

付属

検出感度 分解能*1

0.1 ng/μl 2 bp ~

分析時間

2~7分 /sample

38L×30W×40Hcm

*1 100~500bp 範囲の場合。

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細菌叢・次世代シークエンス

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お問い合わせ先:〈機器〉TEL:03-5684-1619   FAX:03-5684-5643   :[email protected]

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受 託

細菌叢関連 解析受託サービス

糞便からの腸内細菌のゲノム DNA 抽出と 定量解析サービス

NGS による 微生物相解析受託サービス

合同会社 PGL(ピージーエル)[メーカー:PGL] 64844Webページ番号検索

日鉄住金環境株式会社[メーカー:JBI] 7853Webページ番号検索

こんなお悩みの方にオススメ!✓ 糞便試料処理の設備が不十分。✓ DNA抽出を外注し,研究効率の向上を図りたい。✓ 決まった属種だけを定量したい。✓ 安価で簡易に腸内フローラを解析したい。

こんなお悩みの方にオススメ!✓ �汚泥,土壌,地下水,腸内などに存在する微生物の種類やその割合を調べたい。

✓ DNA抽出からデータ解析まで,全工程を外注したい。✓ 各試料間の菌群組成,類似性を視覚的に提示してほしい。

●�糞便からのゲノムDNA抽出●�細菌 16S�rRNA 遺伝子を標的としたリアルタイム PCR による定量

各種腸内細菌定量に対応した 16S�rRNAプライマーセットおよびスタンダード DNA があり,総菌数,バクテロイデス属,クロストリジウム属,ビフィドバクテリウム属などの菌種を絶対量で算出します。

●�DNA抽出   ● PCR増幅   ●シークエンス解析●�NGS(MiSeq)を用いた 16S�rRNA遺伝子の定量●�データ解析16S�rRNA 遺伝子定量結果およびブラウザ上で確認可能な解析結果を報告します。

●�相同性検索結果,菌相構造,α�多様性解析●�オプション:�β�多様性解析,病原性の一次スクリーニング,

文献調査

受託内容�

NGS による 16S rRNA 解析(細菌叢解析)

株式会社DNAチップ研究所[メーカー:DNA] 64845Webページ番号検索

こんなお悩みの方にオススメ!✓ 糞便,唾液,皮膚試料に存在する菌種の組成を調べたい。✓ 抽出したDNA試料を解析してほしい。

●�糞便等の検体からのDNA抽出   ● PCR増幅●�NGS によるシークエンス解析●�16S�rRNA配列データベースに対する相同性解析●�データ解析(Excel ファイル,報告書)

早稲田大学大学院先進理工学研究科にて整備された高品質なデータベースと実験解析パイプラインを用いており,高精度なプロファイル結果を算出します。

※試料の採取キットや説明書もご用意しております。採取前に送付させていただきます。※対象生物種:ヒト,マウス(その他の生物種については,当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。)

受託内容�

受託内容�

メタボローム解析 (低分子化合物の質量分析)受託サービス

公益財団法人かずさDNA研究所[メーカー:KDR] 67973Webページ番号検索

こんなお悩みの方にオススメ!✓ �新規化合物を含め,試料中の化合物の網羅的な質量分析情報を取得したい。

✓ 複数試料の差異を視覚化したい(主成分解析(PCA))。✓ バイオマーカー探索や機能性成分解析を行いたい。

●�微生物抽出物,土壌,糞便などの様々な試料中に含まれる幅広い低分子化合物を質量分析します(LC-MSまたはGC-MS)。

●�候補分子式および候補化合物のリスト化までを行います(Excel ファイル)。

受託内容�

解析対象 解析領域 リード長

細菌 V1,V2 340�bp

細菌 V3,V4 430�bp

細菌・古細菌 V4,V5 410�bp

真菌 ITS1 450�bp230�bp(オプション,シングルリード)

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細菌叢・次世代シークエンス

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

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63536

Web ページ番号検索

64832

Web ページ番号検索

受 託

植物の遺伝子解析受託サービス受 託

外来 DNA の挿入位置 解析受託サービス

既知の遺伝子配列が,ゲノム内のどこに入っているかを解析します。

(株)インプランタイノベーションズでは,植物の栽培から遺伝子解析まで植物の研究開発に関わる幅広いサービスを提供しています。

次世代シークエンシング�

■全ゲノム de novo シークエンス解析●�これまでにリファレンスシークエンスが利用できない,未知のゲノム解析を行います。

●�シークエンスプラットフォームとシークエンスリード長,ペア-エンドおよびメイト-エンドライブラリーオプションとの組み合わせにより,様々な生物の全ゲノム解析を可能にします。

●�シロイヌナズナ,野菜類などで実績があります。●�微生物ゲノムの解析も承ります。

■全ゲノムリシークエンス解析●�既にリファレンスシークエンスが利用できるものについて全ゲノムリシークエンス解析を行います。

●�変異体の解析,2つの品種間の比較,遺伝子マッピングなどに,幅広くご利用いただけます。SNP解析などデータ解析も承ります。

その他のサービスもあります!�

メニューにないサービスでもお気軽にご相談下さい。●�完全長 cDNA作製サービス●�DNA・RNA抽出サービス●�クローニング・ベクター構築●�サザン解析,Tail-PCR,トランスクリプトーム解析など

株式会社インプランタイノベーションズ(国研)理化学研究所の植物開発の技術・インフラを広く提供する理研発ベンチャーです。

日本で唯一の植物の受託研究会社であり,�遺伝子解析・形質転換から温室,隔離圃場�栽培までのフルサービスを提供しています。

まずはお気軽にご相談下さい!

TEL 03-5684-1645  FAX 03-5684-6539 : [email protected]

受託・特注品担当 [メーカー:INP]

特 長�

応用例�

ご用意いただくもの�

●�合同会社 PGL 独自の技術である PGL 法(特許申請中)を用いて検出/解析します。

●�前後のゲノム配列との融合遺伝子配列として結果が分かります。●�複数箇所にも対応できます。

●�トランスジーンの導入位置の探索●�ウイルスのインテグレーション位置の探索●�融合遺伝子の探索� など

●�トランスジーンの配列情報●�使用したウイルス,ウイルスベクターなどの情報●�トランスジェニック生物のゲノムDNA(100�ng/μl,A260/A280>1.6,A260/A230>1.6)

PGL 法の原理末端をビオチン化した既知配列特異的プライマーを用いて,断片化したゲノムDNAから外来配列を含む配列を増幅します。ビオチン化された PCR 産物をカラム精製し,隣接配列を含む PCR 産物のみを増幅し,シークエンスを決定します。

B

外来遺伝子(既知配列)

PCR

カラム精製

PCR

B

BBB

任意のプライマー

ご注文方法/価格�

詳細は当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。[メーカー:PGL]

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細菌叢・次世代シークエンス

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

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受 託

次世代シークエンス解析受託サービス専門のスタッフが Illumina 社のHiSeq,NextSeq またはMiSeq を用いてシークエンスを行う受託サービスです。ライブラリー作製やデータ解析のみのご依頼も承ります。

下記参照

Webページ番号検索

ご注文方法/価格などの詳細は,当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。� [メーカー:DNA]

TEL�03-5684-1645  FAX�03-5684-6539   �[email protected]受託・特注品担当

まずはお気軽にご相談下さい!

●遺伝子発現に大きく影響を与えることが知られているmiRNAを次世代シークエンサーにより網羅的に解析します。

●血清,血漿試料からの解析にも対応しています。●微量のRNA(1ng~)からでもライブラリー調製が可能です。

■miRNA-Seq(microRNA-Seq)解析受託サービス

64721Webページ番号検索

●エクソン領域のみを濃縮して解析することにより,効率的にエクソン上の変異(SNV(SNP)/InDel)を検出します。

●既知の変異だけではなく,未知の変異についても同定することができ,希少疾患の原因遺伝子同定に威力を発揮します。

■エクソーム解析受託サービス

64722Webページ番号検索

●がん遺伝子のエクソン領域およびホットスポット領域を PCR増幅し,次世代シークエンサーを用いて高感度に遺伝子変異を検出します。

●カスタムパネルを作製して,解析を行うことも可能です。

■がんパネル解析受託サービス

64799Webページ番号検索

mRNAや lincRNA の配列をシークエンスし,発現変動のある遺伝子を同定する受託サービスです。RNA-Seq は,融合遺伝子の検出や新規スプライス部位の検出,エクソンレベルでの発現差解析など豊富な情報が得られます。

ストランド特異的RNA-Seq センス鎖,アンチセンス鎖を区別しての解析が可能です。

微量試料からのRNA-Seq*(ヒト・マウスのみ対応)

RNA 換算で 10pg(プロトコル上のインプット量は 10pg~10ng)からの使用に耐えるスペックとなっています。数十細胞からの解析実績があります(シングルセルについてはお問い合わせ下さい)。

rRNA除去によるRNA-Seq(ヒト,マウス,ラットのみ対応)

rRNA除去により,poly-A を持つmRNAだけでなく,non-codingRNAの解析も可能になります。また,RNAの分解が進んだ FFPE 試料からの解析も可能です。

*微量のため,試料の品質検査は行いません。totalRNA(DNase 処理済み)をご送付いただきます。

■RNA-Seq解析受託サービス 64720Webページ番号検索

■ChIP-Seq解析受託サービス

64718Webページ番号検索

●ChIP-Seq 法により転写因子やその他のタンパク質が相互作用するDNAの特定部位を検出し,DNA-タンパク質間の相互作用を解析します。

●クロマチン免疫沈降(ChIP)後の試料について,ライブラリー調製,シークエンス,バイオインフォマティクス解析を行います。ココがすごい!

エクソーム解析では 1試料あたり数万の変異が検出されます。そこから目的の変異を絞り込むのは非常に困難です。そこで,タンパク質に影響を与える変異とアレル頻度情報による変異の絞り込みを行い,充実したアノテーションを付加して結果をお返しします。

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi�news

細菌叢・次世代シークエンス

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

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5391

Webページ番号検索

8751

Webページ番号検索

受 託

NGSを用いたDNAメチル化解析バイサルファイトシークエンス­

受託サービス

受 託

NGSを用いたChIP解析ChIP-­Seq 受託サービス

幅広い種類の試料からゲノムワイドな DNA メチル化(5-mC)解析を行うサービスです。

特 長�

受託内容�

サービスラインナップ�

●�幅広い試料(ヒト,マウス,ラット,植物など)に対応します。●�少量のDNA(>10�ng)から測定できます。●�1 塩基の解像度で定量的なデータが得られます。

●�ゲノムDNA試料(お客様ご用意)からライブラリー調製●�NGS によるシークエンス解析●�バイオインフォマティクス解析●�Publishable�Data の作成

■Methyl-MiniSeq(カバー率:3~4�million�sites)■Methyl-MidiSeq(カバー率:8~9�million�sites)■Methyl-MaxiSeq(カバー率:全ゲノム)

解析例�

クロマチン免疫沈降(ChIP)の実施からライブラリーの構築,シークエンシング,バイオインフォマティクス解析まで一貫したサービスをご提供します。

特 長�●�ヒストン修飾,タンパク質-DNA 相互作用に関するゲノムワイドな網羅解析や,タンパク質結合部位の同定に有用です。

●�最適化されたワークフローと,解析方法のカスタマイズにより,高品質なデータをご提供します。

●�ご提供いただいた試料を用いて,Zymo�Research 社が最適化したクロマチンの断片化および濃縮技術を用いて ChIPアッセイを行います。その後,ChIP-Seq 用のライブラリーを構築し,シークエンシング,解析を行います。

●� Illumina 社の次世代シークエンサーHiSeq を用いてシークエンシングを行います。

●�ご自身で ChIP アッセイを行い,試料 DNA を送付していただくことも可能です。

●�少量の試料からでも解析可能です。

解析例�

ピークコーリング(ゲノム上のタンパク質結合部位と結合量の解析図)

まずはお気軽にご相談下さい!

ご注文方法/価格などの詳細は,当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。� [メーカー:ZYR]

TEL�03-5684-1645  FAX�03-5684-6539   �:�[email protected]受託・特注品担当

7736任意の遺伝子配列に対してバイサルファイトシークエンシングを行う�受託サービスもあります。

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi�news

細菌叢・次世代シークエンス

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65458

Web ページ番号検索

Illumina 社 PhiX V3 コントロール用ライブラリーに代わるライブラリーです。より鮮明な生データが取得できます。

イルミナシークエンサー用 ポジティブコントロールライブラリーTailorMix Dual Indexed PhiX Control Library

ココがすごい!通常,次世代シークエンスでは,ランのクオリティーをモニタリングするためにコントロールライブラリー(Illumina 社標準品:PhiX V3 Control Library)の Spike-in を行います。ところが,一度に複数の試料をシークエンスするマルチプレックスシークエンスにおいて,コントロールライブラリーのリードが目的試料のものとして読まれてしまい,得られたデータにコンタミネーションするという問題があります。本製品はイルミナシークエンサーにおいて,PhiX ライブラリーの代わりに使用できます。マルチプレックスシークエンシングでデータにコンタミネーションしにくく,よりクリアなデータが得られます。

特 長

● PhiX リードのコンタミネーションを低減することでデータ処理の手間を省き,より正確なデータが取得できます。

● GC 含量 45% のランダム配列で構成されており,塩基多様性が低い試料に添加することでランのクオリティーが向上します。

● イルミナの全ソフトウェアによるマルチプレックス解析にも適応した 2 種類のバーコードが含まれています。

製品ラインナップ

[メーカー:SQM]

タイプ Denatured (一本鎖)

Nondenatured (二本鎖)

対応 機種

MiSeq,MiniSeq,NextSeq,HiSeq 2500 ○ ○

HiSeq X, HiSeq 3000/4000,Nova Seq

× ○

バッファー HT1 buffer TE buffer (pH8.0)

濃 度 20 pM (Ready-to-use) 10 nM

インサートサイズ 380 bp

商品コード TM-502 TM-580

包 装 200 μl 10 μl SQM315020

価格(¥) 43,000 43,000 SQM315080

使用例

本製品を使用した場合,Illumina 社の PhiX コントロールライブラリーを使用した場合に比べてコントロールリードのコンタミネーションが低減される

■本製品■Unindexed Phix (Illumina 社標準品)

■TailorMix Indexed PhiX

1% PhiX Spike In

0%0%

1%

2%

6%

4%

5%

6%

0.35% 0.19%

5.60%

20% PhiX Spike In

■Unindexed PhiX

添加した PhiX シークエンスの検出率Illumina 社の PhiX コントロールライブラリーまたは本製品を 1% または 20% Spike-in し,マルチプレックスシークエンシングを行った。リードを PhiX174 ゲノムにマッピングした。

イルミナ対応 RNA-Seq 用 miRNA ライブラリー調製キットTailorMix miRNA Sample Preparation Kit

[Web ページ番号:64864 / 64865]

キット名 TailorMix miRNA Sample Preparation Kit V2

TailorMix Gel-Free miRNA Sample Preparation Kit

実績のある試料 エクソソーム,ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE),血清,全血,組織,HITS-CLIP 由来 RNA

Input total RNA 推奨 10 ng 以上 推奨 150 ng 以上

ライブラリー 精製方法

PAGE 精製独自の RNA 抽出ツール (キットに付属)を用いた 簡便な精製が可能です。

磁気ビーズによる精製PAGE 精製と比べ,短時間での精製が可能です。

Check it out! [メーカー:SQM]

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新しい全ゲノムライブラリー調製法(AFT 法)により,標的 DNA の増幅,断片化,タグ標識を一度の反応で行います。ヒト,シロイヌナズナ,E. coli のゲノム DNA において良好な結果が得られています。※テンプレートDNAの鎖長が 1,000 bp 以上であることが必要です。そのため,FFPE 試料や液体生検試料由来のDNAからのライブラリー構築には適していません。

NEW

わずか 3 時間の操作で NGS 用ライブラリーを構築できますAFT Linked-Reads Library Preparation Kit

● 増幅の正確性が高い● 事前のDNA断片化は不要で,実験操作が簡便

■操作方法概略

(細胞の溶解)ゲノムDNAの変性

~15分

AFT 反応・精製

80分

ライブラリー PCR

20~40分

ライブラリーの精製

~40分

ココがすごい!

AFT 法の原理 

製品ラインナップ 

試料の種類に応じた 4種類の製品ラインナップがあります。シングルセル用/全血用/バクテリア用キットには,細胞溶解のための Lysis Solution と Stop solution が含まれています。※精製用および構築ライブラリー定量用製品はキットに含まれていません。

[メーカー:FSQ]

試 料 品 名 操作時間 使用回数 商品コード 包装/価格(¥)

ゲノムDNA(5 pg~10 ng) Whole-Genome Kit 3 時間以内 24回分 6729001 1 kit / 260,000 FSQ290010

シングルセル Single-Cell Whole-Genome Kit 3 時間以内 24回分 6729002 1 kit / 320,000 FSQ290020

全血(0.1 μl) Raw Blood WGS Kit 3 時間以内 24回分 6729003 1 kit / 320,000 FSQ290030

フィルターろ過したバクテリア Raw Sample Metagenomics Kit 3 時間以内 24回分 6729004 1 kit / 320,000 FSQ290040

● GC リッチ領域も増幅でき,増幅の偏りが少ない● シングルセルレベルのより少ない DNA(5 pg~)からライブラリーを構築できる

Illumina 社のシークエンサーに対応したライブラリーを調製できます

AFT(Amplification, Fragmentation, and Tagging of tar-get DNA)法は,5’ 末端にタグ配列を有する縮重プライマー(AFT primer)を使用することにより,1 反応で増幅・断片化・タグ付けを行うことができる技術です。

AFT primerは 5’ 末端にタグ配列を有する縮重プライマーで,標的DNA鎖中の複数部位にランダムに結合する。鎖置換DNAポリメラーゼにより AFT primerからDNA鎖が伸長される。その際に,鎖置換DNAポリメラーゼにより,前方の増幅産物が後方の増幅産物に置換され一本鎖になる。合成された増幅産物(1st amplicon)に対して,反対側の鎖の AFT primerが同様に複数個同時に結合し,更なる増幅が行われる。そのため,同一の 1st amplicon から増幅された産物は,3’ 末端部分が共通の配列になる。この共通配列が天然のバーコード配列として機能し,長鎖解読時の足場となる。また,de novo シークエンシングや,染色体ハプロタイプのアサインを容易にする。

AFT primer

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合成ランダムプライマーを用いず,シングルセルまたは少量の精製ゲノムDNAから全ゲノム増幅(WGA)を行えるキットです。高い再現性で10 kb 以上のDNA産物が得られます。

プライマー不要!全ゲノム増幅を行うキットTruePrime WGA Kit

63437

Web ページ番号検索精製ゲノム DNA 用

63436

Web ページ番号検索シングルセル用

得られた DNA 産物は,次世代シークエンスに使用できます(Illumina や Ion Torrent でのワークフローで試験済み)。

特 長�●�Tth�PrimPol がプライマーを合成するため,プライマーの添加は不要です。

●�合成プライマーを用いた従来法に比べ,増幅バイアスが減少します。

●�MDA 法は極微量の DNA を増幅する反応であり,専用のクリーンボックス内で操作を行い外部からのDNA の混入を防ぐ必要があります。一方 TruePrime 法は変性 DNA から出発する増幅反応のため,非変性の DNA は系に影響せず,変性処理後のコンタミネーションは最小限に抑えられます。

ココがすごい!ランダムプライマーによるアーティファクトや,外部DNA汚染の影響を低減Phi29�DNAポリメラーゼを用いたDNA増幅方法はMultiple�strand�Displacement�Amplification(MDA)法と呼ばれ,シングルセルからの均一なDNA増幅が可能な方法として注目されています。しかし,合成ランダムプライマーを使用するため,プライマー由来のバイアスが生じることが知られており,問題視されていました。TruePrime法は,Phi29�DNAポリメラーゼと新規のDNAプライマーゼTthPrimPolを組み合わせ,ランダムプライマーによるアーティファクトや,外部DNA汚染の影響を低減できます。

■プライマー由来のアーティファクト産生(従来法との比較)

Unknown19.92%

Invertebrates4.11% Synthetic

0.10%

Human 75.84%

従来法 (ランダムプライマーを用いた 

MDA法)

Unknown0.62%

Invertebrates0.04%

Human 99.34%

TruePrime法

試料: 1 pg のヒトゲノムDNA(ヒト/哺乳動物細胞1個の含有量の1/6に相当)

MDA法で増幅したDNA産物の塩基配列を確認したところ,およそ20%が,データベース上のいかなる生物にもマッチしないもの(Unknown)であり,無視できない量のアーティファクトが生成されていた。

■外部 DNA 汚染の影響の比較Invertebrates1.61%

Unknown6.40%

Synthetic0.50%

Others 0.14%Environmental

0.14%

Human 37.76%

Yeast 53.43%

従来法 (ランダムプライマーを用いた 

MDA法)

Unknown2.90%

Synthetic0.04%

Human 89.57%

Yeast 7.48%

TruePrime法

試料: 変性処理済みの鋳型DNA(1 pg のヒトゲノムDNA)+1,000 倍量の酵母DNA(人為的DNA汚染操作)

MDA法によるDNA産物は,酵母由来DNAが50%以上含まれるという結果になったが,TruePrime法によるDNA産物のうち酵母DNAにマップされるものは7.48%であった。

TruePrime法の原理�

1. �TthPrimPol プライマーゼ■が変性 DNA の異なる部位に結合し,短いDNA プライマーを合成する。

3. �Phi29�DNA ポリメラーゼ●が鎖置換を起こす。

2. �Phi29�DNA ポリメラーゼ●が TthPrimPol ■と置き換わり合成を開始する。

4. �TthPrimPol ■ が 新生DNA に結合し,新しいDNA プライマーを合成する。

5. �Phi29�DNA ポリメラーゼ●が TthPrimPol ■と置き換わり,DNA プライマーと結合し,合成を開始する。

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使用例�

非増幅 DNA TruePrime 他社製品 A 他社製品 B ランダムプライマー

Mapped reads 99.53% 96.86% 99.64% 98.62% 97.42%

Read in pair 92.03% 86.77% 91.50% 37.94% 59.07%

ゲノムカバー率 53% 49% 38% 1% 28%

理論値 (ポアソン分布) 59% 57% 59% 31% 44%

偏差 10.2% 13.8% 35.4% 96.7% 35.76%

シングルセル(HEK293 細胞)から,MDA法を用いたそれぞれの方法でDNAを増幅した。配列解析から得られた 1,200 万の Read�pair をヒトゲノムにマッピングし,カバー率を比較した。(右図)第 3染色体のゲノムカバー率比較TruePrime法によるピークは非増幅DNAを用いた場合の結果と類似性が非常に高いことが分かる。

操作方法概略(Single Cell WGA Kit の場合)�

1.�細胞懸濁液と Lysis�buffer を加える。

2.�室温で 5分間,95℃で 1分間インキュベートし,氷上へ移す。

3.�Neutralization�buffer を加え中和する。

4.�Amplification�mix を加える。

5.�30℃で 3時間インキュベーションする。

6.�65℃で 10分加熱し酵素を失活させる。

製品ラインナップ�

■シングルセル用●�単一哺乳動物細胞から,3時間の反応で 3~4�μg/50�μl 以上のDNA増幅が可能です。

●�試料量:1~50�cells,0.4~20�cells/μl

■精製ゲノム DNA 用●�1�ng のゲノム DNA から,3時間の反応で 5�μg/50�μl 以上の DNA 増幅が可能です。フェムトグラム(fg)レベルの試料からの増幅も行えます。

●�微生物集団に対するメタゲノム解析にも使用できます。●�試料量:2.5�μl/reaction(0.2�ml�PCR チューブ)

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

TruePrime Single Cell WGA Kit Version2SYN351025 SYN 351025 25 reactions 1�kit�/ 93,000SYN351100 SYN 351100 100 reactions 1�kit�/ 290,000

キット内容:�Lysis�buffer,Neutralization�buffer,Reaction�buffer,TthPrimPol,Phi29�DNA�polymerase,DTT,dNTPs,H2O,human�genomic�DNA

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

TruePrime WGA KitSYN 370025 25 reactions 1�kit�/ 44,000 SYN700250SYN 380100 100 reactions 1�kit�/ 116,000 SYN801000キット内容:�Denaturing�buffer,Neutralization�buffer,Reaction�buffer,dNTP,

H2O,TthPrimPol,Phi29�DNA�polymerase

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

CovCheck KitSYN CVC0004 4 reactions 1�kit�/ 96,000 SYN000400キット内容:�Reaction�Buffer,Magnesium�Chloride�solution,dNTP�mix,

Taq�Polymerase,PCR�primers(96-well�plate)

関連製品�

■CovCheck Kit●�全ゲノム増幅率を確認できる PCR キットです。結果はアガロース電気泳動などで簡単に確認できます。

●�ヒト染色体の各領域を増幅する 24 種類のプライマーセットが含まれ,一度に 4つのゲノムが検定できます。

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mRNAの 3’ 末端構造解析に特化した次世代RNA-Seq ライブラリーの調製キットです。Illumina 社のプラットフォームに対応しています。

3’ 末端だけ! 集中的にシークエンスMACE Kit(Massive Analysis of cDNA Ends)

ココがすごい!MACEはmRNAの 3’ 末端を特異的にシークエンスする技術です。RNAの分解にも強く,短いRNAや低発現のmRNAも検出可能です。一般的な RNA-Seq では,転写産物のサイズが大きいものほどリード数が多くなり,短いものほど少なくなるためデータの正規化を要し,その方法によって結果が異なってしまう問題があります。MACE は転写産物 1 分子あたり 1 リードのみが読み取られるため,短くコピー数の少ない転写産物も少ないシーケンス(読み)深度で同定できます。また,転写産物の長さによるデータの正規化が不要です。

MACE

RNA-Seq

SNP SNP SNP

SNP SNP

Reads

Reads

SNP

SNPs with enough coverage:2

SNPs with enough coverage:0

cDNA

cDNA

AT

AT

CG

AT

CG

AT

RNA-Seq では同定できない SNP も,MACE では SNP の多い 3’-UTR を集中的にシークエンシングすることにより同定できる。

アプリケーション�●�対立遺伝子のアレル特異的な発現の同定●�遺伝子マッピング●�植物・動物のマーカー選抜による育種への活用●�3’ 末端のポリアデニル化部位の異なるバリアント(選択的ポリアデニル化)の解析

●�SNP 解析●�低コピー数 RNAの定量品  名

メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)MACE Kit

GXP604600 GXP 16046.1 6 reactions(MiSeq 用) 1�kit�/ 98,000GXP604241 GXP 160424.1 24 reactions(HiSeq / NextSeq用)1�kit�/ 330,000

Additional Adapter SetGXP604243 GXP 160424.3 1�set�/ 40,000

HiSeq�/�NextSeq 用(#160424.1)を 4キット使用して 96�MACE 同時解析を行う場合に必要な,別売りの追加アダプターセットです。

特 長�●�PCR 増幅前にテンプレート分子をラベリングする TrueQuant 法により,PCR バイアス(不均一な増幅やアーティファクト)を認識し,データセットから排除できます。

●�MACEの受託サービスもあります。詳細はお問い合わせ下さい。

■MACE と一般的な RNA-Seq の比較

(左図)同じシークエンス量(20 M リード)の解析で同定できた異なる転写物の数

(右図)左図のうち,30×以上のシークエンス(読み)深度で配列が得られた遺伝子座の数試料:ヒト胎盤組織MACE は転写産物の狭い範囲(多型が豊富な部分)の読み取りを集中して行うため,読み深度が増え,対立遺伝子をより正確に発見できる。

メーカーインタビューVol. 233’mRNA 解析から新しい研究の提案へ

65833

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GenXPro�社は�フランクフルト大学・パリ大学発のベンチャー企業です。「モデル生物を使わない,低コストな遺伝子発現解析」を実現するため 2005 年に設立されました。2013 年(日本では 2017 年)に発売されたMACE Kitは,海外の研究者から高い評価を受けています。

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原核生物や真菌などのレトロトランスポゾン内に存在する逆転写酵素を遺伝子改変した製品です。※TGIRT(Thermostable Group Ⅱ Intron Reverse Transcriptase)

small RNA のライブラリー構築に有用な逆転写酵素TGIRT-Ⅲ

特 長

● 熱安定性(反応温度:60℃),転写効率(伸長活性),正確性(fidelity)が優れています。● 逆転写酵素活性に加えて,アダプターを付加する活性(Template-switching 活性)も有するため,別途 RNA3’ アダプターの結

合は不要です。

ココがすごい!TGIRT-Ⅲによる Template Switching 活性miRNA や tRNA,snoRNA などの poly A tail がない RNA の cDNA ライブラリーを構築する場合,逆転写反応前に共通のアダプター配列をRNA の末端に導入する必要があります(Template switching)。従来は T4 ligase がアダプターの付加に用いられていますが,アダプター付加の段階でバイアスが生じることが問題視されています。TGIRT-Ⅲは逆転写反応の際に,RNA アダプターと DNA プライマーのハイブリッドプライマーを用いることにより,別途 RNA アダプターを付加する反応を必要とせずに,cDNA の 5’ 末端にアダプターを付加することができます。

1)Template-switching および逆転写反応

2)Small RNA解析

CircLigaseⅡにより環状化

2)網羅的 RNA解析

第 2アダプターをDNA ligase を用いて付加

5’

TGIRT

RNA-seq adapter

NDNA primer

3’OH

RNA/DNAハイブリッド

DNAプライマーの 3’側に 1塩基だけヌクレオチドが突出している。

1塩基突出ヌクレオチドに Target RNAがアニーリングし,cDNAが合成される。

高温によりRNA立体構造が解け鎖状になっている。

変性 PAGE

3’

5’

TGIRT

RNA-seq adapter

NDNA primer

3’OHTarget RNA5’

3’

N=A 25%T 25%C 25%G 25%

アプリケーション例

● 統合的な鎖特異的トランスクリプトーム解析● RNA-seq(エクソソーム由来 RNA,細胞由来 RNA,血漿中

RNA,細胞外 RNA の解析)● snRNA の網羅的ライブラリー構築● RNA 構造マッピング● 一般的な RT-PCR や qRT-PCR

他社製品 1

Percent small ncRNA reads

他社製品 2

small ncRNA100

75

50

25

0

A1A2A3B1B2B3A1A2A3B1B2B3

A1A2A3B1B2B3

tRNAsnoRNAsnRNA7SK7SLMiscRNAY-RNAVault RNApiRNAmiRNA

本製品

使用例

本製品または他社 RNA-Seq Kit を用いて構築したライブラリーを用いた網羅的 RNA 解析のうち,Small RNA についての結果を示した。試料: Universal Human Reference RNA(図中 A1~A3),

Human Brain Reference RNA(図中 B1~B3)

立体構造が原因でライブラリー構築が困難とされてきた

tRNA が検出されている

製品ラインナップ

■TGIRT-Ⅲ 酵素単品

RNA アダプターと DNA プライマーは別途ご用意下さい。

■TGIRT Template-Switching RNA-seq Kit

Illumina 社 R2 アダプター用の RNA-Seq ライブラリー構築用キットです。※Illumina 社 R1R DNA オリゴは別途ご用意下さい。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

TGIRT-Ⅲ EnzymeIGX TGIRT10 10 reactions 10 μl / 44,000 IGX190600IGX TGIRT50 50 reactions 50 μl / 139,000 IGX190610

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

TGIRT Template-Switching RNA-seq kit, ver.2IGX kTGIRT-10 10 tests 1 kit / 44,000 IGX101900IGX kTGIRT-25 25 tests 1 kit / 123,000 IGX101910Illumina 社の RNA-seq 用に最適化されたキット。キット内容:TGIRT-Ⅲ Enzyme,Primer mix,Reaction buffer,DTT

※反応バッファーは添付されていません。別途調製が必要です。詳細は製品データシートをご覧下さい。

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プライマー 3’ 末端とテンプレート間の 1 塩基のミスマッチを認識できる改変型 Taq DNA ポリメラーゼです。ミスマッチがあると増幅効率が著しく低下するため,PCR で SNP 検出ができます。※HiDi=High Discrimination

一塩基違いを PCR で検出HiDi DNA Polymerase

特 長

● 60~200 bp の増幅に最適化されています。● ヌクレアーゼ活性を有さない HiDi と,5’→3’ エキソヌクレ

アーゼ活性をもつ HiDi Taq DNA があります。● リアルタイム PCR でもご使用いただけます。SYBR Green

な ど の 蛍 光 色 素 で 検 出 す る 際 に は HiDi を,Hydrolysis Probes での検出には HiDi Taq の使用を推奨します。

● マスターミックス仕様で簡便に調製できる HiDi 2× PCR Master Mix*もあります。

*蛍光色素は含みません。また,Hydrolysis Probes での検出には使用できません。

46104

Web ページ番号検索

あらかじめ loading dye(赤色)が添加されている PCR マスターミックスです。PCR後,産物をそのままゲルにアプライし,電気泳動できます。

Loading dye 入りのマスターミックスTaq DNA Polymerase

Master Mix RED

特 長

● 増幅した断片の末端にアデニンのオーバーハング(3‘dA)を形成するため,増幅断片は TA クローニングに最適です。

● 電気泳動時,Dye の先頭は 300~1,000 bp(0.5~1.5%アガロースゲル)となります。

● 産物をシークエンシングに用いる場合には,スピンカラムを用いた遠心などによって Dye を除去できます。

● 増幅鎖長:~5 kb※マスターミックスに含まれる耐熱性 DNA ポリメラーゼは,3’ → 5’

エキソヌクレアーゼ活性を持ちません。

使用例

本製品または他社製品を用いて 4 種類*の遺伝子断片を増幅した。* PAH(203 bp),Q8(727 bp),CFTR(613 bp),BAIP(788 bp)

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Taq DNA Polymerase, 2× Master Mix REDAMQ A180301 with 1.5mM MgCl2 100 tests / 8,000 AMQ680301AMQ A180303 with 1.5mM MgCl2 500 tests / 26,000 AMQ680303AMQ A180306 with 1.5mM MgCl2 2,500 tests / 94,000 AMQ680306AMQ A180307 with 1.5mM MgCl2 5,000 tests / 178,000 AMQ180307AMQ A190301 with 2.0mM MgCl2 100 tests / 8,000 AMQ690301AMQ A190303 with 2.0mM MgCl2 500 tests / 26,000 AMQ690303AMQ A190306 with 2.0mM MgCl2 2,500 tests / 94,000 AMQ690306AMQ A190307 with 2.0mM MgCl2 5,000 tests / 178,000 AMQ190307

Taq DNA Polymerase, 1.1× Master Mix REDAMQ A160301 with 1.5mM MgCl2 100 tests / 8,000 AMQ660301AMQ A160303 with 1.5mM MgCl2 500 tests / 34,000 AMQ660303AMQ A160306 with 1.5mM MgCl2 2,500 tests / 147,000 AMQ660306AMQ A160307 with 1.5mM MgCl2 5,000 tests / 279,000 AMQ160307AMQ A170301 with 2.0mM MgCl2 100 tests / 8,000 AMQ670301AMQ A170303 with 2.0mM MgCl2 500 tests / 34,000 AMQ670303AMQ A170306 with 2.0mM MgCl2 2,500 tests / 147,000 AMQ670306AMQ A170307 with 2.0mM MgCl2 5,000 tests / 279,000 AMQ170307

使用例

■SNP の解析

SNP(rs72921001)は,ヒト 11 番染色体のポジション 6868417 番の C(WT:野生型)が A(SNP:変異型)に置換された変異型である。1 ng/μl HeLa gDNA をテンプレートに,各アレル特異的プライマーと本製品を用いてアレル特異的 PCR を実施した。その結果 C-アレル特異的プライマーのみ増幅が見られた。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

HiDi DNA PolymeraseMYP900100 MYP 9001S 50 μl 250 units / 18,000MYP900110 MYP 9001M 200 μl 1,000 units / 64,000

HiDi Taq DNA PolymeraseMYP920100 MYP 9201S 50 μl 250 units / 18,000MYP920110 MYP 9201M 200 μl 1,000 units / 64,000

HiDi 2× PCR Master MixMYP910100 MYP 9101S 100 tests / 20,000MYP910110 MYP 9101M 500 tests / 90,000

GreenDye 20×MYP200000 MYP 2000S 200 reactions 250 μl / 13,000MYP200010 MYP 2000M 800 reactions 1,000 μl / 38,000

HiDi DNA polymerase を使用したリアルタイム PCR 実験にお勧めの PCR 用蛍光色素です。

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本製品 A 社 B 社

0

2,000

4,000

6,000

8,000

10,000

12,00010,670

73

2,640

473

5,847

157

白色コロニー

青色コロニー

コロニー数

全操作において各社 TA Cloning Kitを用いてサブクローニングした結果(PCR断片:約 1 kbp,20 ng)

T7

RⅠ

ⅠⅠⅠⅠ

HⅠⅠⅠ

ⅠⅠ

dⅢ

EcoSacKpnSmaXho

Bam

Hin

pTAC-12734 bp

Amp

lacZ

ORI

T7

NotⅠRⅠ

ⅠⅠⅠⅠ

BamHⅠ

dⅢⅠ

ⅠⅠⅠⅠ

pTAC-22786 bp

Amp

lacZ

ORIT7

SP6

SP6NotRⅠⅠ

ⅠⅠⅠⅠ

BamHⅠ

ⅠⅠⅠⅠ

dⅢ

pTAKN-22739 bp

Kan

lacZ

ORI

XbaSalPstSph

Xho

EcoSacKpnSma

Not

XbaSalPstSphHin

Xho

EcoSacKpnSma

Not

XbaSalPstSphHin

401

Web ページ番号検索

ライゲーション効率が良い TA クローニングキットTA PCR Cloning KitDynaExpress

[メーカー:BDL]

品 名 商品コード 包 装 価格(¥)

BDL200125TA PCR Cloning Kit, pTAC-1

DS125 20 units(20 reactions) 12,500

BDL200126 DS125L 80 units(80 reactions) 39,000

BDL200120 TA PCR Cloning Kit, pTAC-1 DH5αコンピテントセル付き DS120 20 units(20 reactions) 27,000

BDL000126TA PCR Cloning Kit, pTAC-2

DS126 20 units(20 reactions) 12,500

BDL100126 DS126L 80 units(80 reactions) 39,500

BDL000127 TA PCR Cloning Kit, pTAC-2 DH5αコンピテントセル付き DS127 20 units(20 reactions) 27,000

BDL100130TA PCR Cloning Kit, pTAKN-2

DS130 20 units(20 reactions) 12,500

BDL200130 DS130L 80 units(80 reactions) 39,500

8752

Web ページ番号検索

DNase / RNase 活性が見られないことを確認済みです。*

*本製品中にプラスミド DNA を添加した後,18 時間後も DNase 活性は見られません。

 また,本製品中に rRNA を添加した後,18 時間後も RNase 活性は見られません。

実験に必要不可欠な「水」DEPC 処理水/RNase フリー水

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Water, DEPC-TreatedBDL DR110 5×1 ml / 3,000 BDL300110BDL DR115 2×50 ml / 4,000 BDL300115BDL DR117 500 ml / 8,000 BDL3001170.1% DEPC 処理および,オートクレーブ処理済み。

Water, RNase-free, Non DEPC-TreatedBDL DR120 5×1 ml / 3,000 BDL300120BDL DR125 2×50 ml / 4,000 BDL300125BDL DR127 500 ml / 8,000 BDL300127DEPC 処理を行わず,限外濾過により精製を行った製品。

他社製品との比較 ベクターマップ

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NEW 受 託

細胞毒性が低く抑えられたトランスフェクション試薬DharmaFECT Transfection Reagent

67998

Web ページ番号検索DharmaFECT Duo

67999

Web ページ番号検索DharmaFECT kb DNA

67997

Web ページ番号検索DharmaFECT 1~4

●細胞にあわせて最適条件で使い分ける 4種類の smallRNA用トランスフェクション試薬シリーズです。

●miRIDIANmicroRNAMimic および HairpinInhibitor の導入にも使用できます。

●DharmaFECT1 が最も汎用性が高い製品です。●細胞株によっては,DharmaFECT2/3/4 の使用により最も高い導入効率を得ることができます。

●DharmaFECT1~4をセットにしたDharmaFECTSetof4もあります。

●smallRNAとプラスミドDNAを同時にトランスフェクション(コトランスフェクション)するための試薬です。

●プラスミドベクターから発現する遺伝子と siRNA の機能解析に使用可能です。

●プラスミド DNA を効率良く細胞へ導入するためのトランスフェクション試薬です。

●Cas9 ヌクレアーゼと sgRNA 発現の各プラスミドの共導入(コトランスフェクション)に使用可能です。

■DharmaFECT 1~4 ■DharmaFECT Duo

■DharmaFECT kb DNA

品 名 DharmaFECT 1 DharmaFECT 2 DharmaFECT 3 DharmaFECT 4 DharmaFECT Duo DharmaFECT kb DNA

用 途 smallRNA(siRNA,microRNA,crRNA,tracrRNA)導入用 smallRNAとプラスミドDNAの同時導入用

プラスミドDNA導入用

対象細胞 HCT116,HEK293,UMRなど A549など Huh7,XMD5など HeLa,SKOV3,

MDA-MB-231 などES-D3,HeLa,

HepG2,Jurkat などHeLa,HEK293T,U2OS,MCF-7 など

商品コード T-2001 T-2002 T-2003 T-2004 T-2010 T-2006-01

※導入確認済みの細胞リスト,導入条件と推奨DharmaFECT の種類についてはWebをご覧下さい。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

DharmaFECT 1 Transfection Reagent NEW

DHA007860 DHA T-2001-01 0.2ml/ 18,100DHA007870 DHA T-2001-02 0.75ml/ 52,000DHA007880 DHA T-2001-03 1.5ml/ 87,000DHA007890 DHA T-2001-04 5×1.5ml/ 410,300

DharmaFECT 2 Transfection Reagent NEW

DHA007900 DHA T-2002-01 0.2ml/ 18,100DHA007910 DHA T-2002-02 0.75ml/ 52,000DHA007920 DHA T-2002-03 1.5ml/ 87,000DHA007930 DHA T-2002-04 5×1.5ml/ 410,300

DharmaFECT 3 Transfection Reagent NEW

DHA007940 DHA T-2003-01 0.2ml/ 18,100DHA007950 DHA T-2003-02 0.75ml/ 52,000DHA007960 DHA T-2003-03 1.5ml/ 87,000DHA007970 DHA T-2003-04 5×1.5ml/ 410,300

DharmaFECT 4 Transfection Reagent NEW

DHA007980 DHA T-2004-01 0.2ml/ 18,100DHA007990 DHA T-2004-02 0.75ml/ 52,000DHA008000 DHA T-2004-03 1.5ml/ 87,000DHA008010 DHA T-2004-04 5×1.5ml/ 410,300

DharmaFECT Set of 4 Transfection Reagents NEW

DHA008020 DHA T-2005-01 0.2ml/ 68,900DHA008030 DHA T-2005-02 0.75ml/ 200,400DHA008040 DHA T-2005-03 1.5ml/ 340,300

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

DharmaFECT Duo Transfection Reagent NEW

DHA T-2010-01 0.2ml/ 18,100 DHA008060DHA T-2010-02 0.75ml/ 52,000 DHA008070DHA T-2010-03 1.5ml/ 87,000 DHA008080DHA T-2010-04 5×1.5ml/ 410,300 DHA008090

DharmaFECT kb DNA transfection reagent NEW

DHA T-2006-01 1ml/ 48,000 DHA008050

『Dharmacon 製品のご注文はオンラインで!』

製品はHorizon 社 Dharmacon 製品のWebサイトにてオンラインでご注文いただけます。ご注文にはユーザー登録が必要です。初めてご注文されるお客様は,事前に登録をお願いいたします。

ご注文方法の詳細は  81062

Web ページ番号検索

Edit-R CRISPR-Cas9ゲノム編集試薬(デザイン済みguide RNAおよびCas9ヌクレアーゼ)の導入やRNAi(siRNA導入)などに使用できるトランスフェクション試薬です。

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

遺伝子工学

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受 託

パネル形式(小容量ずつのセット)にて販売いたしますマウス・ラット 1st strand cDNA Panel/マウス total RNA Panel

ご希望の製品をお選びいただき,セットとしてご購入いただける cDNA / RNA 製品です。

80944

Web ページ番号検索Total RNA Panel

80945

Web ページ番号検索1st strand cDNA Panel

単品でのご購入も可能です。詳細は当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。

■ 1st strand cDNA Panel ■ Total RNA Panel

多組織での発現解析などにご利用いただけます。 組織での発現解析(リアルタイム PCR,ノーザンブロッティング)などにご利用いただけます。

製品概要�●�濃度:25�ng/μl(cDNA量として)●�容量:5�μl(5反応分)の 6~10本セット●�溶液組成:10�mM�Tris-HCl(pH�8.0),1�mM�EDTA●�品質保証期限:到着後より 1年間●�保存:-20℃●�PCR によりGAPDH遺伝子の増幅を確認済みです。

製品概要�●�濃度:1�μg/μl●�容量:10�μl の 8~10本セット●�溶液組成:1�mM�Citrate�buffer(pH�6.0)●�品質保証期限:到着後より 1年間●�保存:-80℃※受注生産品です。

製品ラインナップ�[メーカー:GNS]

品名(商品コード) セット内容 包装/価格(¥)

1st strand cDNA Panel

GNS999276 マウス一般組織(10 種セット)(#MDP-10) マウスC57BL/6�8 週齢の組織/胎仔日齢から 10種類を選択いただけます*。 1�set�/�50,000

GNS999275 マウス胎仔組織別(8 種セット)(#MDEP-08) マウス胎仔の組織/胎仔日齢から 8種類を選択いただけます*。 1�set�/�50,000

GNS999274 マウス 脳部位別(#MDP-Brain)

(8種類固定)マウスC57BL/6�8 週齢全脳,大脳皮質,小脳,嗅球,海馬,延髄,線条体,視床+視床下部+橋 1�set�/�70,000

GNS999202 マウス 自然発症皮膚炎(#MDP-Derm)

(6種類固定)マウスNC/NgaAlc�11 週齢皮膚炎マウス(皮膚,脾臓,胸腺),SPF マウス(皮膚,脾臓,胸腺) 1�set�/�70,000

GNS999201 マウス コラーゲン誘導関節炎(#MDP-Cia)

(6種類固定)マウスDBA/1jjmsSlc�13 週齢関節炎マウス(足首,脾臓,胸腺),無処理マウス(足首,脾臓,胸腺) 1�set�/�70,000

GNS999200 ラット 2 型糖尿病(#RDP-Diab)

(10種類固定)ラットZDF-�Lepr�fa�/CrlCrlj�13 週齢糖尿病ラット(膵臓,眼,腎臓,大動脈,肝臓),正常ラット(膵臓,眼,腎臓,大動脈,肝臓)

1�set�/�70,000

Total RNA Panel

GNS998499 マウス一般組織(10 種セット)(#MTP-10) マウスC57BL/6�8 週齢の組織/胎仔日齢から 10種類を選択いただけます*。 1�set�/�35,000

GNS998399 マウス胎仔組織(8 種セット)(#MTEP-8) マウス胎仔の組織/胎仔日齢から 8種類を選択いただけます*。 1�set�/�45,000

*選択いただける組織の種類,胎仔日齢についてはWebをご覧下さい。

ご注文方法�

セット内容をお選びいただく製品(*)をご注文の際は,フナコシWebからダウンロードできる専用注文書に必要事項をご記入の上,ご利用の販売店にお渡し下さい。

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お問い合わせ先:〈受託〉TEL:03-5684-1645   FAX:03-5684-6539   :[email protected]

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63496

Web ページ番号検索

歯周病に関連した複数のサイトカインを,簡便に同時測定できるアレイです。

歯周病関連因子を検出する抗体アレイHuman Periodontal Disease Array C1

特 長�●�専用機器は不要です。全ての化学発光イメージングシステムと互換性があります。

●�担体:メンブレン●�ポジティブコントロールとネガティブコントロールがスポットされています。

●�測定試料:�細胞培養上清,血清,血漿,細胞/組織ライセート

検出可能な因子(20 種類)

IL-1α IL-1β IL-2 IL-4 IL-6 IL-8 IL-10

IL-12�p70 IL-17A IFN-γ TGFβ1 TNFα OPG MIP-1α

MMP-13 MMP-9 Osteopontin RANK CRP Osteoactivin

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Human Periodontal Disease Array C1RAY AAH-PDD-1-2 2 Sample Kit 1�kit�/ 55,000 RAY970953RAY AAH-PDD-1-4 4 Sample Kit 1�kit�/ 80,000 RAY970952RAY AAH-PDD-1-8 8 Sample Kit 1�kit�/ 125,000 RAY970951

63920

Web ページ番号検索

抗 IL-1α マウスモノクローナル抗体

●�抗原:マウス成熟 IL-1α�組換え体タンパク質●�形状:溶液(濃度:1�mg/ml)

■特異性●�クローン Teo-1:マウス IL-1α� の全長および p18 切断フラグメントを認識します。

●�クローン Bamboo-1/2:マウス IL-1α�を認識します。

抗 IL-1α マウスモノクローナル抗体(クローン:Teo-1)(#AG-20B-0064-C100)を用いたウェスタンブロッティング像試料:�LPS およびいくつかのインフラマソーム活性化因子で処理した骨髄由来樹状細胞

(BMDC)1. LPS 処理2. LPS+ATP処理3. LPS+Nigericin 処理4. LPS+MSU処理

品 名 抗原種 免疫動物(クローン) 標識 適用 メーカー 商品コード 包 装 価格(¥)

Anti-IL-1α(p18)クラス:IgG,交差性:Mouse

Mouse-Mono(Teo-1)

- ELISA, West

KOM AG-20B-0064-C100 100 μg 65,000 KOM997173

Anti-IL-1αクラス:IgG,交差性:Mouse

Mouse-Mono(Bamboo-1)

- ELISA, West

KOM AG-20B-0050-C100 100 μg 74,000 KOM999010

Anti-IL-1αクラス:IgG1κ,交差性:Mouse

Mouse-Mono(Bamboo-2)

- ELISA KOM AG-20B-0058-C100 100 μg 74,000 KOM998857

Anti-IL-1α, Biotinクラス:IgG1κ,交差性:Mouse

Mouse-Mono(Bamboo-2)

Biotin ELISA KOM AG-20B-0058B-C100 100 μg 81,000 KOM998632

※略号 West:ウェスタンブロット

特 長� 使用例�

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サイトカイン

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65606

Webページ番号検索

特 長�●�高感度で測定に長時間要するキット(SENSITIVE)と短時間で測定が終了するキット(FAST)のタイプがあります。

●�測定波長:450�nm

製品ラインナップ�

■2種類または 3種類の ELISA キットがセットになった製品

[メーカー:ISM]

測定因子 試 料 商品コード 包 装 価格(¥)

Adrenaline�(Epinephrine)

生体試料 BA-E-5100 1�kit 92,000 ISM285100

尿,血漿 BA-E-6100 1�kit 90,000 ISM286100

Dopamine生体試料 BA-E-5300 1�kit 92,000 ISM285300

尿,血漿 BA-E-6300 1�kit 90,000 ISM286300

GABA 生体試料 BA-E-2500 1�kit 88,000 ISM282500

Glycine 尿 BA-E-2100 1�kit 132,000 ISM282100

L-Glutamic�acid 生体試料 BA-E-2400 1�kit 88,000 ISM282400

5-HIAA 尿 BA-E-1900 1�kit 65,000 ISM281900

Histamine

生体試料 BA-E-5800 1�kit 102,000 ISM285800

尿,血漿 BA-E-1000 1�kit 65,000 ISM281000

細胞培養上清,尿,全血 BA-E-1700 1�kit 67,000 ISM281700

L-Kynurenine 血清,血漿 BA-E-2200 1�kit 97,000 ISM282200

Metanephrine血漿 BA-E-8100 1�kit 97,000 ISM288100

尿 BA-E-8400 1�kit 83,000 ISM288400

Noradrenaline�(Norepinephrine)

生体試料 BA-E-5200 1�kit 92,000 ISM285200

尿,血漿 BA-E-6200 1�kit 90,000 ISM286200

Normetanephrine血漿 BA-E-8200 1�kit 97,000 ISM288200

尿 BA-E-8500 1�kit 83,000 ISM288500

L-Tryptophan 血清,血漿,尿 BA-E-2700 1�kit 90,000 ISM282700

[メーカー:ISM]

セット 試 料 商品コード 包 装 価格(¥)

・Adrenaline・Noradrenaline

生体試料 BA-E-5400 1�kit 184,000 ISM285400

尿,血漿 BA-E-6500 1�kit 180,000 ISM286500

・Adrenaline・Noradrenaline・Dopamine

生体試料 BA-E-5600 1�kit 275,000 ISM285600

尿,血漿 BA-E-6600 1�kit 270,000 ISM286600

・free�L-Metanephrine・free�L-Normetanephrine 血漿 BA-E-8300 1�kit 194,000 ISM288300

・Metanephrine・Normetanephrine 尿 BA-E-8600 1�kit 166,000 ISM288600

・Noradrenaline・Dopamine 生体試料 BA-E-5500 1�kit 184,000 ISM285500

・Kynurenine・Tryptophan 血清,血漿 ISE-2227 1�kit 187,000 ISM272227

生体試料中の神経伝達物質を,競合法により比色定量する ELISA キットです。

神経伝達物質 ELISA キット

SENSITIVE

FAST

神経伝達物質・代謝関連物質を 免疫染色するための前処理キットSTAINperfect Kit

● �本キットと別売の ImmuSmol 社抗体を組み合わせることで,ドーパミンやフェニルアラニンなど,染色が難しいとされている低分子化合物の鮮明な染色像を得ることができます。

● �培養細胞,凍結組織切片,ホールマウントのそれぞれに特化したプロトコルが確立されています。

試料:初代中脳ニューロン緑:Dopamine赤:Serotonin

64758Webページ番号検索

Check�it�out!� [メーカー:ISM]

[メーカー:ISM]

品 名 Serotonin�ELISA�Kit

商品コード BA-E-5900 BA-E-8900

タイプ SENSITIVE FAST

検出対象 Serotonin(5-HT)

測定試料 生体試料 血清,尿,血小板

測定範囲 0.015~2.5�ng/ml 15~2,500�ng/ml

感 度 5�pg/ml 6.2�ng/ml

ISM285900 測定時間 30 分+overnight 15 分+1時間

ISM288900 包装/価格(¥) 1�kit�/�88,000 1�kit�/�67,000

■セロトニン ELISA キット オススメ!

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神経伝達物質

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68635

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ヒ ト 試 料 中 に 含 ま れ る 活 性 型 MMP7(Matrilysin,PUMP-1 Proteinase)を,サンドイッチ法により比色定量する ELISA キットです。活性型 MMP7 は,がん転移や炎症への関与が知られるプロテアーゼです。

NEW キャンペーン

活性型 MMP7 を測定Active Human MMP7 ELISA Kit

使用例�

Active�MMP-7�ELISA(#ARG82010)は Pro-MMP7を認識せず,活性型MMP7を特異的に定量できる

品  名メーカー 商品コード 包装 /

通常  価格(¥)

キャンペーン価格(¥)

MMP7 (Active), Human, ELISA Kit NEW

ARI820100 ARI ARG82010 1�kit�/ 126,000 � 100,800測定試料:血清,血漿(EDTA,ヘパリン処理),唾液,尿,細胞培養上清,検出方法:比色(450�nm),測定範囲:0.3125~20�ng/ml,測定感度:0.102�ng/ml

関連製品:全量ヒト MMP7 ELISA キット�

測定対象 Human�MMP7(total)

商品コード ARG81414 ARG82009

検出方法 比色(450�nm)

測定範囲 156~10,000�pg/ml 0.3125~20�ng/ml

測定感度 78�pg/ml 0.21�ng/ml

品  名メーカー 商品コード 包装 /

通常  価格(¥)

キャンペーン価格(¥)

MMP7 (total), Human, ELISA Kit NEW

ARI814140 ARI ARG81414 1�kit�/ 144,000 � 115,200測定試料:血清,血漿(ヘパリン処理),唾液,尿,細胞培養上清

MMP7 (total), Human, ELISA Kit NEW

ARI820090 ARI ARG82009 1�kit�/ 105,000 � 84,000測定試料:血清,血漿(EDTA,ヘパリン処理),唾液,尿,細胞ライセート,細胞培養上清

63432

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比色法の EIA キットと,より高感度測定が可能な化学発光法の CLIA キットがあります。

唾液試料にも対応!オキシトシン測定キットOxytocine EIA / CLIA Kit

特 長�●�固相抽出は不要です。キット内の試薬を用いて試料の前処理も行えます。

●�標準物質はWHO�International�Standard に準拠して較正されています。

●�メソトシン(Mesotocin)やイソトシン(Isotocin)も検出できるため,鳥類や魚類も含めた様々な動物種の幅広い試料から測定可能です。

●�オンラインツール(MyAssays)のテンプレートへ測定結果を入力することで,濃度計算が簡単に行えます。

商品コード K048-H K048-C

測定方法 競合 EIA法 競合 CLIA法

検出方法(測定波長) 比色(450�nm) 化学発光

測定動物種 哺乳動物,鳥類,魚類

測定試料 血清,血漿(EDTA,ヘパリン処理),母乳(Clarified�milk),唾液,組織培養液

交差性

Oxytocin 100% 100%

Isotocin 94.3% 95.9%

Mesotocin 88.4% 88.4%

Lys8-Vasopressin 0.14% 0.14%

Arg8-Vasotocin 0.13% 0.13%

Arg8-Vasopressin 0.12% 0.12%

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Oxytocin EIA Kit, DetectXARB K048-H1 96 well plate 1�kit�/ 73,000 ARB104810ARB K048-H5 5×96 well plate 1�kit�/ 281,000 ARB104811測定範囲:16.38~10,000�pg/ml,測定感度:17.0�pg/ml,検出限界:22.9�pg/ml

Oxytocin CLIA Kit, DetectXARB K048-C1 96 well plate 1�kit�/ 77,000 ARB104800ARB K048-C5 5×96 well plate 1�kit�/ 300,000 ARB104801測定範囲:8.192~5,000�pg/ml,測定感度:6.33�pg/ml,検出限界:15.5�pg/ml

Memoオキシトシンは 9つのアミノ酸からなる神経ペプチドです。メソトシンとイソトシンはオキシトシンから一つまたは二つのアミノ酸が置換された類縁のペプチドです。メソトシンは両生類・爬虫類・鳥類で,イソトシンは魚類で,哺乳動物におけるオキシトシンと同様の行動調節ホルモンとして作用していると考えられています。

全製品 20% OFF キャンペーン81177[期間:~2019/3/29]

抗体,ELISA キットなど約 17,000 点がキャンペーン対象!

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

タンパク質解析

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63923

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プロテアソームによるBRD4の選択的分解を誘導するPROTACをご紹介します。

細胞内の標的タンパク質分解を誘導する低分子化合物PROTAC

MemoPROTACとはPROTAC(Proteolysis Targeting Chimera,タンパク質分解誘導キメラタンパク質,プロタック)は,ユビキチンプロテアソームシステム(UPS)により細胞内の標的タンパク質を選択的に分解・除去する,ヘテロ二機能性の低分子化合物です。

PROTACNH2 NH2

NH2

Target Protein

Peptide fragments Proteasome Polyubiquitination

Catalytic - PROTAC is recycled

Ternarycomplex

UPS では,E3 リガーゼによる標的タンパク質へのユビキチン付加により,タンパク質の分解が起こります。PROTAC は E3 リガーゼへの結合部位と標的タンパク質結合部位がリンカーを介して結合した構造をとっています。標的タンパク質,PROTAC,E3 リガーゼは三重複合体を形成し,標的タンパク質には E3 リガーゼによりユビキチンが付加されます。ポリユビキチン鎖が付加された標的タンパク質はプロテアソームにより分解されます。PROTAC の特徴はその触媒作用にあり,ユビキチン化後は標的タンパク質から解離して新たな標的タンパク質に結合して繰り返し作用します。

AT1 [Web ページ番号:67856]

dBET1 [Web ページ番号:67669]

MZ1 [Web ページ番号:66506]

● BRD4 阻害物質(+)-JQ1 の構造を基にして,E3 リガーゼの基質認識部位である von Hippel-Lindau(VHL)リガンドを結合させた,細胞透過性 PROTAC です。MZ-1 よりも優れた活性を示します。

● セレブロンに結合し,BRD4 の分解を引き起こします。BRD4の分解によって細胞中の BRD4 が枯渇し,細胞はアポトーシスを起こします。

● AT1 と同様,JQ1 構造を基に VHL リガンドを結合させた細胞透過性 PROTAC です。

● BRD2,BRD3,BRD4 に対して高いアフィニティ(Kd=13~60 nM)を示しますが,分解誘導作用は BRD4 に対し選択性を示します。

MZ1(BRD4分解誘導物質)

■各種 PROTAC

■PROTAC 合成用リンカー含有化合物

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

AT 1RSD 6356/5 5 mg / 110,000 RSD063560CAS No:2098836-45-2,純度:≧98%(HPLC)

dBET1RSD 6327/5 5 mg / 57,000 RSD063275CAS No:1799711-21-9,純度:≧98%(HPLC)

MZ1RSD 6154/5 5 mg / 107,000 RSD061545CAS No:1797406-69-9,純度:≧98%(HPLC)

cis MZ1RSD 6155/5 5 mg / 107,000 RSD061555MZ1 のネガティブコントロール。VHL 結合親和性を示さない。CAS No:1797406-72-4,純度:≧98%(HPLC)

CM11RSD 6416/5 5 mg / 110,000 RSD064165M.W.:1179.46,純度:≧98%(HPLC)

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Pomalidomide - LinkerRSD 6637/25 25 mg / 41,000 RSD066370CRBN(Cereblon)リンカー,純度:≧95%(HPLC)

Thalidomide - LinkerRSD 6627/25 25 mg / 41,000 RSD066270CRBN(Cereblon)リンカー,純度:≧95%(HPLC)

VH 032, Amine HydrochlorideRSD 6462/100 100 mg / 175,000 RSD064620VHL リンカー,CAS No:1448189-80-7,純度:≧98%(HPLC)

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi news

低分子化合物

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68082

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特 長�●�スライドガラスに自然に吸着し,カバーガラスを上に置くだけで観察できます。

●�化学的に不活性で,任意の透明化技術に用いることができます。●�組織試料の厚みに応じた製品ラインナップがあります。品  名

メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)ClearWell Silicon Imaging Chamber NEW

VSK022200 VSK CW0.75 0.75 mm 6�pieces�/ 9,000VSK022210 VSK CW1.75 1.75 mm 6�pieces�/ 10,000VSK022220 VSK CW3.5 3.5 mm 6�pieces�/ 13,000VSK022230 VSK CW7 7 mm 6�pieces�/ 14,000

組織をありのままの姿で透明化Visikol HISTO

各種組織切片用の透明化試薬です。透明化された組織を初期状態に復元(非透明化)できるため,3Dイメージングを行った後,追加アッセイや免疫組織染色が行えます。

65456Web ページ番号検索

蛍光プローブや免疫染色による組織観察にVisikol HISTO-M

スフェロイド,オルガノイド,細胞塊,微小培養組織など組織培養試料用の透明化試薬です。

非透明化試料Visikol�HISTO-Mで透明化

68013Web ページ番号検索

Check�it�out! [メーカー:VSK]

厚さ:0.75�mm 厚さ:1.75�mm

厚さ:3.5�mm 厚さ:7�mm

©樹庵じゅあん

透明化処理組織の観察に適したシリコーン製のチャンバーです。

NEW

透明化処理組織の観察に適したチャンバーClearWell Silicon

Imaging Chamber

#CW0.75 #CW1.75

#CW3.5 #CW7

マウス脳組織スライサーMouse Brain Slicer

マウス脳から厚さ 1�mmまたは 2�mmの断片を容易に作製するための器具です。

68038Web ページ番号検索

Check�it�out! [メーカー:VSK]

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

免疫組織染色

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65156

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植物試料を用いたウェスタンブロットなどの実験における内部標準として最適な,ローディングコントロール用抗体です。

植物研究用 ローディングコントロール抗体

製品例�

■抗アクチン抗体●�適用:�免疫蛍光法(IF),ウェスタンブロッティング●�交差性:�Agrostis�stolonifera�cv.�‘Penncross’,�

Arabidopsis�thaliana,�Cynara�cardunculus,�Glycine�max,�Hordeum�vulgare,�Solanum�tuberosum,�Zea�mays など

3674

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葉緑体やミトコンドリアなど, 細胞小器官画分の純度推定に使用できます。

植物細胞小器官のマーカー抗体

製品例�

■ミトコンドリアマーカー(抗 COXⅡ抗体)

■葉緑体チラコイド膜マーカー(抗 PsbA 抗体)

■原形質膜(細胞膜)マーカー(抗 H+-ATPase 抗体)

●�適用:�Blue�Native-PAGE(BN-PAGE),ウェスタンブロッティング

●�交差性:�真正双子葉類,単子葉類,Physcomitrella�patens*交差性(具体的な学名)についてはメーカーWebをご覧下さい。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Anti-COXⅡ , Rabbit-Poly 〈Anti-Cytochrome Oxidase Subunit Ⅱ〉AGS AS04-053A 50�μg�/ 86,000 AGS140531

●�適用:�ImmunoGold(IG),ウェスタンブロッティング●�交差性:�[global�antibody]高等植物,藻類,珪藻,苔類,

シアノバクテリア*交差性(具体的な学名)についてはメーカーWebをご覧下さい。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Anti-PsbA, Rabbit-Poly 〈Anti-D1 protein of PSⅡ, C-terminal〉AGS AS05-084 50�μl�/ 86,000 AGS050845

●�適用:�免疫蛍光法(IF),Immunolocalization(IL),�ウェスタンブロッティング

●�交差性:�[global�antibody]双子葉類,単子葉類,針葉樹,シダ植物,セン類,緑藻

*交差性(具体的な学名)についてはメーカーWebをご覧下さい。

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Anti-H+ATPase, Plasma Membrane, Rabbit-PolyAGS AS07-260 50�μl�/ 86,000 AGS272601

Agrisera 社は植物研究用抗体を多数取り扱うスウェーデンのメーカーです。その他の製品ラインナップは Web を�ご覧下さい。

シロイヌナズナ アクチン骨格の観察試料:�ホルムアルデヒド固定シロイヌナズナ�

(Arabidopsis�thaliana)芽生え(5日)緑:アクチン,赤:PIN1,青:DAPI画像提供:�Dr.�Taras�Pasternak,�Freiburg�University,�Germany

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Anti-ACT, Rabbit-Poly 〈Anti-Actin, Rabbit-Poly〉AGS132640 AGS AS13-2640 50�μl�/ 86,000

■抗 RuBisCO(大サブユニット)抗体●�適用:�免疫蛍光法(IF),Immunolocalization(IL),�

免疫金電子顕微鏡法(IG),Tissue�Printing,�ウェスタンブロッティング

●�交差性:�[global�antibody]高等植物,地衣類,藻類,�珪藻,渦鞭毛藻,シアノバクテリア

*交差性(具体的な学名)についてはメーカーWebをご覧下さい。

225 -1 2 3

- Rubisco

4

97 -

66 -

50 -

kDa ウェスタンブロットによる RbcL の検出(1,2)クリプト藻クロロフィル(1�μg)(3)�シロイヌナズナ葉クロロフィル

(1�μg)(4)�シロイヌナズナ葉�総タンパク質

(10�μg)

品  名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)

Anti-RbcL, Rabbit-Poly〈Anti-Rubisco, Large Subunit, Form Ⅰ/Ⅱ〉AGS030377 AGS AS03-037 50�μl�/ 84,000

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植物研究

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まずは現在の研究テーマと,そこに興味を持った理由を教えて下さい。

「作動原理」という言葉がぴんと来なかったのですが…

なるほど。CRISPR や iPS 細胞もそうですよね。それで,最初に考えついた人がノーベル賞をとる(笑)。

今の研究テーマは,新しい作動原理によって機能する蛍光センサーや蛍光プローブの開発です。具体的には 3つに分かれています。1つ目がフナコシ(株)から

販売されている温度プローブの開発。2 つ目が,非常に小さい範囲の pH 変化に応答する pH セン

サー。普通のフルオレセインのようなものではなくて,デジタル型と言って,0.2 程度の pHの違いで劇的に蛍光性が変わります。3 つ目が,ナノスケールの膜や DNA の近傍で,プロトンやナ

トリウムイオンが,どのような濃度勾配を持っているかを測れるイオンセンサーの開発です。全部,蛍光現象を使っていますね。蛍光試薬の開発は,4年生で研究室に配属されてからの一貫し

たテーマです。なぜかというと,単に綺麗だから(笑)。昔から,エレクトリカルパレードのような光り物が好きでした。研究室に配属された際に,いくつかのテーマが考えられていたように記憶しているんですけど,いろんな蛍光分子を作るというのが綺麗そうだったから選んだ,という感じで,そのまま今に至っています。

プローブというと,化学の世界では普通は小分子なので,例えばフルオレセインのような pHセンサーだったら,フェノール性-OH基が-O-になるとか,官能基の単純な平衡反応(酸塩基平衡の解離・非解離)を原理にしているものがほとんどです。温度センサーの場合も,ローダミン Bのような小分子の,温度に依存する一般的な励起緩和過程を原理に使っています。しかし,生物実験に使うにはこれらの感度は中程度なので,そ

こからひと工夫入れて,従来のものとは違う,感度の良い蛍光プローブを作っています。なぜ「作動原理」にこだわっているかというと,もし,新しい

作動原理を提唱できれば,自分以外の研究者もその概念を使って新しいプローブを作ってくれるかもしれない,という自分の研究に端を発する「発展性」に期待しているからです。最近,特に思うんですけれど,あんまり競争が好きではないの

で…。もともと存在する常識的な考えをテーマに取り入れると,どちらがより感度が良いか,より使いやすいか,より選択的か,というような競争になっていくんですよね。でも原理を作る分には,競争にはならないので,結果として優雅に暮らせるという…(笑)。もし原理が優れていれば,むしろほかの人がそれを元に研究成果を出してくれるじゃないですか。だからこの温度プローブも,今後,既存のものより良いものが

できるかもしれないですけれど,それでも原理を作った自分の貢献・寄与が無くなるわけではないんですよね。実際,ThermoProbe® の原理を元にしてこれまでに 50 以上

の研究グループが論文を出しています。何もしなくても citationで自分の仕事に触れられて,自分で結果を出さなくても,周りが日々結果を出してくれるという。それによってずいぶんと楽をしています(笑)。

自分が本当に楽しめる ことを見つけ, それに突き進む

略 歴   1993 年 筑波大学附属高等学校 卒業

1997年 東京大学薬学部卒業

2002年 �東京大学大学院薬学系研究科博士課程修了 博士(薬学)

2002年 奈良女子大学理学部化学科

2003年 英国Queen’s 大学化学科

2005年 東京大学大学院薬学系研究科 助手(助教)

趣 味   継続しているのは競馬と料理でしょうか。最近では,国内より海外の競馬場に行く方が多いです。

料理の信念は「必要な材料を事前に全てそろえておくこと」です。レシピなどを見ずに気まぐれに調理しています。

最近,約 25年ぶりに将棋を再開しました。電王戦でAIがプロ棋士に勝つくらいまでになったというので,理系人間として興味が沸いて。実は最近、娘が女流棋士の資格を取得しました。もうかなわないですね。

ン タ

ビ ュ ー イ

研 究

室 File:02

自分が本当に楽しめることを見つけ,それに突き進む

ンタ

ビ ュ ーイ

研究

室 File:02

研究テーマ:新しい作動原理に基づく蛍光試薬の開発

東京大学 大学院薬学系研究科

内うち

山やま

 聖せい

一いち

 助教

Thermoprobe® の温度感受による発光の原理Thermoprobe® は,東京大学およびキリン(株)より研究用試薬としてライセンスを受け,フナコシ(株)から販売しています。詳細はフナコシWeb[Webページ番号:63732]をご覧下さい。

感温性ユニット

蛍光性ユニット

カチオン性ユニット

水分子

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

研究室でインタビュー

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65182

Webページ番号検索本インタビューは フナコシ Web でも公開中

サイエンスに興味を持ったきっかけは?どんな学生だったのでしょう。

わざわざお小遣いを薬品に使う小学生はなかなかいないのでは…早くから化学に興味がおありだったのですね。

それは…知的好奇心のなせるわざですね(笑)進路選択のころはいかがでしたか?

今までに研究で嬉しかったことはどんなことですか?

最後に,学生・若手研究者にメッセージをお願いします!

本日はお忙しい中ありがとうございました!

記憶に残る限り,きっかけというのはないですね。最初から科学に興味を持っていたと思います。小学生の頃は毎月届けられる学研の「科学*」とその付録をとても楽しみにしていましたし,薬局に行ってお小遣いで薬品を購入していました。フェノールフタレイン溶液とか,アンモニア水とか…*かつて学習研究社(現 学研ホールディングス)から刊行されていた

小学生向け学習雑誌

いや,今アメリカで研究職に就いている友人も,子どものときに絵の具を全色なめて味の違いを確認したって言ってましたけどね。白は一番多くてどの色とも合うので「ご飯」,他の色は「おかず」,だそうです。

高校のときも,化学の授業は半分以上が実験で,夏休みも実験合宿があって面白かったので,当時から化学を専攻したいと思っていましたね。大学では,講義には全然出席しない学生でしたけど,実習にはちゃんと出席して,レポートはキッチリ書いて提出していました。教養学部時代に受けた「薬学への招待」という授業が面白く,薬学部でも化学が学べるということで,そちらに進みました。

研究室に配属された後も研究をとても面白く感じたので,その後の進学も迷い無く,自然な選択でした。

ただ,学生やポスドクのときには,研究の道に進むにあたって,どうやって身を立てていくのかというのは考えていたと思います。ただ好きなだけでは職につけないので。博士課程の時には,そこそこの雑誌にそれなりに論文を出していたんですけど,学振*に採用されなくて…。ポスドクをやってみようと思った時に,何かしらの制度に採用されなければ,きっぱりと別の道も探そうと考えていたのですが,幸いにも学振の特別研究員に選ばれました。だからその時点で,少し(研究者として)やっていけるのかなっていう風に思ったんですね。*日本学術振興会特別研究員

これまでの研究人生で言えば,面白い実験結果が出た時よりも,研究成果が最初に J. Am. Chem. Soc. 誌(アメリカ化学会誌)に受理された時の方が,嬉しい気持ちは強かったように思います。自分がこの世界で化学者としてやっていっても良い,という許可証を頂いた気分でした。

元々,分析化学の研究室出身なので,当時は分析化学の Ana-lytical Chemistry という論文誌にばかり投稿していたんです。それがもっと幅広い,一般化学のトップジャーナルである J. Am. Chem. Soc. 誌に採択されたので,もう少し色々なところで,自分の分野に制限なく研究出来るのかなって思うようになりました。J. Am. Chem. Soc. 誌に受理される事がなかったら,分析化学に特化した研究者として生きていこうと思っていました。5 回目の挑戦で初めてのアクセプトだったので,めげない心は大切ですね。

あとはやっぱり実験そのものが大好きなので,この年になっても実験し続けられることが一番嬉しいです。ネガティブなデータが出ても壁にぶつかったとは思わないです。化学の人って,そもそも地球上の現象がどのように起きているのかを知りたいという好奇心が原動力にあると思うんです。正しく実験して「変化がない」という結果が出たのならば,「変化がない」ということが分かったというだけです。だからそれでがっかりすることはほとんどありません。試薬をこぼした時の方が,よっぽどがっかりですね。

若いうちに自分が本当に楽しめることを見つけ,それに突き進んで欲しいと思います。一見すると,日本の社会は色々なスキルを備えたバランスの良い人材が重宝されるように思われがちですが,この世界ではそれは幻想だと思います。一芸に突出しようとする人への風当たりは強いですが,出すぎた杭は打たれません。同じ時間をかけるなら,一つのことに集中している人のほうが結果が出る気がしますね。外界の声に惑わされず,失敗を恐れず,「挑戦し続けられる心」

を育んで欲しいと思います。

内山先生のウェブサイト :http://www9.plala.or.jp/Seiichi_Uchiyama/index.html

左: 先生のお部屋にウクレレがあったのでポーズを取っていただきました。 ちなみに…「弾けません」とのこと。

右: ロータリーエバポレーターなどの装置がある実験室。 窓からはスカイツリーも見えました!

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi news

東京大学 

内山

聖一助教

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NEW

パウダーフリーのラボ用グローブアロエコートグローブ

内側をアロエ成分でコーティングしてありますニトリル製アロエコートグローブ� ラテックス製アロエコートグローブ�

●�ラテックスや PVC(ポリ塩化ビニル)に比べ,広範囲の化学薬品耐性があります。

●�丈夫で破れにくく,突き刺しにも強い材質です。●�ニトリルゴム特有の匂いを低減しました。

●�優れたフィット感,弾力性および伸縮性があります。●�ラテックスアレルギーの原因となる水溶性タンパク質の含有量が少なくなっています。

材 質 合成ニトリルゴム 天然ラテックスゴム

長 さ 240�mm

 さ

指先部分 0.15�mm±0.01�mm

手のひら部分 0.14�mm 0.13�mm

袖口(カフ) 0.14�mm 0.10�mm

引っ張り強度 20.5�MPa 以上 22�MPa 以上

弾性/伸張性 700%以上 800%以上

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サイズ 商品コード 包 装 価格(¥)

WEX000001S

19-050-550A 100�pieces 3,560

WEX200001 19-050-550AV 10×100�pieces 33,800

WEX000002M

19-050-550B 100�pieces 3,560

WEX200002 19-050-550BV 10×100�pieces 33,800

WEX000003L

19-050-550C 100�pieces 3,560

WEX200003 19-050-550CV 10×100�pieces 33,800

WEX000004XL

19-050-550D 100�pieces 3,560

WEX200004 19-050-550DV 10×100�pieces 33,800

[メーカー:WEX]

サイズ 商品コード 包 装 価格(¥)

S19-050-548A 100�pieces 2,760 WEX000005

19-050-548AV 10×100�pieces 26,100 WEX200005

M19-050-548B 100�pieces 2,760 WEX000006

19-050-548BV 10×100�pieces 26,100 WEX200006

L19-050-548C 100�pieces 2,760 WEX000007

19-050-548CV 10×100�pieces 26,100 WEX200007

XL19-050-548D 100�pieces 2,760 WEX000008

19-050-548DV 10×100�pieces 26,100 WEX200008

パウダーフリーニトリルグローブアロエコート

パウダーフリーラテックスグローブアロエコート

各種サンプル品あります    :[email protected]

ご希望の方は,当社テクニカルサポート(機器担当)までお問い合わせ下さい。

フナコシニュース2019年 3月 1日号(No.675)funakoshi news

機器・消耗品

本誌に掲載されている製品はすべて研究用です

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お問い合わせ先:〈機器〉TEL:03-5684-1619   FAX:03-5684-5643   :[email protected]

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重要な お知らせ

NEPTUNE チップラック 変更のお知らせ

このたびBiotix 社の NEPTUNEピペットチップラックの仕様が一部変更となりました。これにより,流通段階での在庫の関係で,しばらくの間従来品と変更品が混在する可能性があります。

何卒ご了承いただきますようお願い申し上げます。

第 33 回 日本糖尿病・肥満動物学会 3 月 15日(金)~16日(土) @九州大学医学部百年講堂

第 18 回 日本再生医療学会総会 3 月 21日(木)~23日(土) @神戸国際会議場

日本農芸化学会 2019 年度大会 3 月 25日(月)~27日(水) @東京農業大学世田谷キャンパス

展示会出展のお知らせ 会場にお越しの際はフナコシ展示ブースに是非お立ち寄り下さい!

キャンペーン情報https://www.funakoshi.co.jp/ja-JP/campaign_monitors キャンペーン期間

Web ページ番号 2019 年 3 月 4 月 5 月

20%OFF ELISA キットや抗体など全製品 81177 ArigoBiolaboratories社   ~3/29

20%OFF コラーゲン試薬 81176 (株)ニッピ   ~3/29

10%OFF 無細胞タンパク質合成キット 81171 NUProtein(株)   ~3/29

変更点1 ラックの形状 変更点2 フタの形状 変更点3 詰め替え用タブ

SBS 規格(一般的な 96 ウェルプレートのサイズ)に準拠したフットプリントとなりました。

手の小さな方でも片手で持てるよう,SnapCard(中板)のタブの位置が左右から前後に変更になりました。なお,変更に伴い従来のラックには詰め替えできなくなります。

不用意にフタが開かないようにロックが搭載されました。また,ヒンジ部分も変更され,オートクレーブへの耐性が上がりました。

8.55cm 12.77cm

サイズがやや大きくなりました

63926

Webページ番号検索変更の詳細はウェブページでご確認下さい。

@Funakoshi_CoLtd

たまにフォロワー限定プレゼントキャンペーンをやっていることも…

フナコシ株式会社 @Funakoshi_CoLtd 1月 21日研究成果発表を控える皆様に,弊社社員の過去の経験から伝えたい言葉があります。ぜひこのツイートを見て,今すぐ実践して頂ければと思います。

_人人人人人人人人人人人人人人人人人_> データのバックアップをとろう! < ̄Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^Y^ ̄

以上です。ご査収下さい。

フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)funakoshi news

お知らせ

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お問い合わせ先:〈機器〉TEL:03-5684-1619   FAX:03-5684-5643   :[email protected]

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とにかく綺麗に,簡単に撮れます。そう,i-NTER LENS ならね。

顕微鏡画像を iPhone で撮影するための 接続アダプターです。

接眼レンズの代わりに挿し込むだけ!ネジや工具は不要です。

[取り付け可能な顕微鏡]接眼レンズを外した鏡筒の内径:23.2 mm / 30.0 mm※製造年を問わずほとんどの顕微鏡の接眼部に取り付けできます

i-NTER LENS 専用アプリ

Download on the

App Store

i-NTER SHOT

i-NTER LENS

ご使用 iPhone のモデルに対応した専用ケースを取りそろえています

67957

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メーカー 商品コード 包装/価格(¥)

i-NTER LENS と iPod touch 取付けプレートのセット(iPod touch をお持ちの方向け) MEC MR-6i-NP6 1 set / 90,000 MEC000079

iPod touch*本体と i-NTER LENS のセット*iPod touch 第 6 世代(電話機能なし,設定完了済み)付属 MEC MR-6i-P6 1 set / 135,000 MEC000078

1 set / ¥90,000

メーカー専用ケースのサイズと商品コード

iPhone XS Max

iPhone XR

iPhone X / XS

iPhone 7+/ 8+

iPhone 7 / 8

iPhone 6+/ 6s+

iPhone 6 / 6s

iPhone 5 / 5s / SE

MEC MR-6i-XSMax MR-6i-XR MR-6i-X MR-6i-7+ MR-6i-7 MR-6i-6+ MR-6i-6 MR-6i-5

1 piece / ¥5,000

メーカー専用ケースのサイズと商品コード

iPhone XS Max

iPhone XR

iPhone X / XS

iPhone 7+/ 8+

iPhone 7 / 8

iPhone 6+/ 6s+

iPhone 6 / 6s

iPhone 5 / 5s / SE

MEC iLXSMC iLXRC iLXC iL7PC iL7C iL6PC iL6C iL5C

i-NTER LENS と iPhone 専用ケースのセット

追加購入用 iPhone ケースご使用 iPhone モデルに合った専用ケースを追加購入いただくことで, i-NTER LENS を複数モデルの iPhone で共用いただけます。

iPod touch 用 i-NTER LENS セットが新発売!実験室で個人 iPhone や備品以外の器具が使用できない場合も大丈夫!iPhone と同様に使用でき,通信契約は不要です。使用動画あります

36

funakoshi news フナコシニュース 2019 年 3 月 1 日号(No.675)

販売店

※本紙に記載されている価格は,2019年 3月1日現在です。 FUN-6390( 2019.3, № 675 )

フナコシ株式会社 〒113-0033 東京都文京区本郷2丁目9番7号http://www.funakoshi.co.jp/ e-mail : info@funakoshi.co.jp

e-mail : kiki@funakoshi.co.jp

e-mail : reagent@funakoshi.co.jp試薬に関して : Tel.03-5684-1620  Fax.03-5684-1775

機器に関して : Tel.03-5684-1619  Fax.03-5684-5643

@Funakoshi_CoLtd