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DNA Replica,on Prokaryotes

DNA$Replicaon$/$Prokaryotes$ of DNA.pdf · Photograph$ Reproduced$from$M.$Meselson$and$F.$W.$Stahl,$Proc.&Natl.&Acad.&Sci.& USA 44$(1958):$671/682.$Photo$courtesy$of$Mahew$S.$ Meselson,

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DNA  Replica,on  -­‐  Prokaryotes  

Figure  02B:  Conserva,ve  replica,on  

Figure  02A:  Semiconserva,ve  replica,on  

Photograph  

Reproduced  from  M.  Meselson  and  F.  W.  Stahl,  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA  44  (1958):  671-­‐682.  Photo  courtesy  of  MaQhew  S.  Meselson,  Harvard  University.  

Figure  04:  Demonstra,on  of  a  θ  structure  intermediate  in  E.  coli  chromosome  replica,on  

Reproduced  from  J.  Cairns,  Cold  Spring  Harb.  Symp.  Quant.  Biol.  28  (1964):  p.  44.    Copyright  1963,  Cold  Spring  Harbor  Laboratory  Press.  Used  with  permission  of  John  Cairns,  University  of  Oxford.  

Figure  05B:  Bidirec,onal  replica,on  

Figure  07:  Evidence  to  support  bidirec,onal  θ-­‐replica,on  

Reprinted  from  J.  Mol.  Biol.,  vol.  73,  E.  B.  Gyurasits  and  R.  G.  Wake,  Bidirec,onal  chromosome  replica,on...,  pp.  55-­‐58,  copyright  1973,  with  permission  from  Elsevier  [hQp://www.sciencedirect.com/science/journal/00222836].  Photo courtesy of R. G. Wake, Professor Emeritus, The University of Sydney, Australia.  

Figure  10:  Okazaki's  pulse  labeling  experiment  

Adapted  from  K.  Sugimoto,  T.  Okazaki,  and  R.  Okazaki,  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA  60  (1968):  1356-­‐1362.  

Figure  12:  Semidiscon,nuous  model  of  replica,on  

Figure  16:  Pathway  for  processing  Okazaki  fragments  

Figure  24:  DnaB  orienta,on  at  the  replica,on  fork.  

Adapted  from  K.  Marians,  Nat.  Struct.  Mol.  Biol.  15  (2008):  125-­‐127.  

Figure  35B:  Two  core  polymerases  are  involved  in  lagging  strand  synthesis  Reprinted  from  Mol.  Cell,  vol.  27,  P.  McInerney,  et  al.,  Characteriza,on  of  a  Triple  DNA  Polymerase  Replisome,  pp.  527-­‐538,  copyright  2007,  with  permission  from  Elsevier  [hQp://www.sciencedirect.com/science/journal/10972765].  

Figure  38:  Loca,ons  of  the  E.  coli  replica,on  terminator  (Ter  )  sites  

Adapted  from  S.  Mulugu,  et  al.,  Proc.  Natl.  Acad.  Sci.  USA  98  (2001):  9569-­‐9574.  

Figure  39:  Crystal  structure  of  the  Tus•Ter  complex  of  E.  coli  showing  the  DNA-­‐binding  region  of  β-­‐strands  and  the  helicase  blocking  end  

Structure  from  Protein  Data  Bank  1ECR.  K.  Kamada,  et  al.,  Nature  383  (1996):  598-­‐603.  Prepared  by  B.  E.  Tropp.  

Figure  10:  Conjugal  transfer  of  DNA  mediated  by  bacterial  sex  plasmids.