COVID-19 : point épidémiologique du 29 avril 2021

Point eacutepideacutemiologique COVID-19 ndeg 61 Situation au 29 avril 2021 p 1

Chiffres cleacutes

Indicateurs hebdomadaires en semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021)

Donneacutees consolideacutees

Du 1er mars 2020 au 27 avril 2021

Nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 (agrave lrsquohocircpital en EHPA ou autre ESMS) 103 632

S16 S15 Eacutevolution

Nombre de nouveaux cas confirmeacutes de COVID-19 (SI-DEP) 202 396 227 347 -11

Taux de positiviteacute () pour SARS-CoV-2 (SI-DEP) 99 98 +01 point

Nombre drsquoactes SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 2 437 2 866 -15

Nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (reacuteseau OSCOURreg)

10 659 11 418 -7

Nombre de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC)

12 397 13 194 -6

Nombre de nouvelles admissions en soins critiques de patients COVID-19 (SI-VIC)

2 971 2 980 -03

Nombre de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital en EHPA ou autres ESMS)

2 137 1 981 Non

consolideacutee

COVID-19 Point eacutepideacutemiologique hebdomadaire ndeg61 du 29 avril 2021

Santeacute publique France srsquoappuie sur un reacuteseau drsquoacteurs pour assurer la surveillance COVID-19 meacutedecins libeacuteraux SAMU Centre 15 meacutedecins hospitaliers laboratoires de biologie meacutedicale hospitaliers et de ville socieacuteteacutes savantes drsquoinfectiologie de reacuteanimation de meacutedecine drsquourgence Cnam Inserm Insee

Santeacute publique France dans le cadre de ses missions de surveillance drsquoalerte et de preacutevention analyse et publie les donneacutees concernant la COVID-19 issues de son reacuteseau de partenaires et de ses propres eacutetudes et enquecirctes Ce bilan est baseacute sur les donneacutees rapporteacutees agrave Santeacute publique France jusqursquoau 28 avril 2021

Points cleacutes

En semaine 16 diminution modeacutereacutee des indicateurs eacutepideacutemiologiques restant agrave des niveaux encore eacuteleveacutes avec une persistance de la tension hospitaliegravere

bull Diminution du taux drsquoincidence et du taux de deacutepistage pour la seconde semaine conseacutecutive mais moindre qursquoen semaine 15 bull Diminution limiteacutee des nouvelles hospitalisations stabilisation des admissions en soins critiques bull Impact beacuteneacutefique des mesures de restrictions sur lrsquoeacutevolution des indicateurs de surveillance bull Mortaliteacute lieacutee agrave la COVID-19 toujours eacuteleveacutee bull Meacutetropole reacutegions Icircle-de-France Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et Hauts-de-France les plus toucheacutees bull Outre-mer augmentation des indicateurs eacutepideacutemiologiques en Guyane et agrave La Reacuteunion

Variants

bull Proportions de suspicions de variants preacuteoccupants (VOC) par RT-PCR de criblage - suspicions de variant 20I501YV1 majoritaires et stables en meacutetropole agrave 827 - suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 agrave 50 avec des heacuteteacuterogeacuteneacuteiteacutes au niveau deacutepartemental

Preacutevention

bull Vaccination - 14 601 130 personnes ayant reccedilu au moins une dose couverture vaccinale de 218 - 6 115 998 personnes compleacutetement vaccineacutees couverture vaccinale de 91 bull Importance de lrsquoadoption systeacutematique des mesures barriegraveres et de la limitation des contacts et des deacuteplacements bull En cas de symptocircmes neacutecessiteacute drsquoun isolement immeacutediat et reacutealisation drsquoun test dans les plus brefs deacutelais

Point de situation en semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021)

En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques en population geacuteneacuterale eacutetaient agrave nouveau agrave la baisse mais de maniegravere plus modeacutereacutee que lors de la semaine preacuteceacutedente Si les R-effectifs sont significativement infeacuterieurs agrave 1 en meacutetropole pour la seconde semaine conseacutecutive lrsquoameacutelioration de la dynamique observeacutee semble moins marqueacutee que la semaine preacuteceacutedente Malgreacute la reacuteduction de lrsquoincidence depuis deux semaines la diminution de la pression hospitaliegravere reste tregraves limiteacutee notamment en services de soins critiques Agrave lrsquoapproche de la leveacutee annonceacutee de certaines restrictions les indicateurs eacutepideacutemiologiques restaient agrave des niveaux plus eacuteleveacutes que ceux observeacutes avant la leveacutee du preacuteceacutedent confinement La couverture vaccinale des personnes complegravetement vaccineacutees eacutetait en progression mais infeacuterieure agrave 10 de la population Dans ce contexte un haut niveau drsquoadheacutesion aux mesures de preacutevention individuelles et la progression rapide de la vaccination sont essentiels pour permettre un assouplissement prochain des mesures collectives sans risquer un deacutebordement des capaciteacutes hospitaliegraveres Au niveau national 202 396 nouveaux cas ont eacuteteacute confirmeacutes soit environ 29 000 cas en moyenne chaque jour Le taux drsquoincidence de la semaine 16 diminuait (302100 000 habitants en S16 vs 339 en S15 soit -11) pour la seconde semaine conseacutecutive Une diminution du recours au deacutepistage eacutetait observeacutee (3 036100 000 habitants vs 3 440 soit -12) Apregraves plusieurs semaines de progression le taux de positiviteacute srsquoest stabiliseacute agrave 99 en S16 Le taux hebdomadaire de nouvelles hospitalisations a leacutegegraverement diminueacute en semaine 16 pour la seconde semaine conseacutecutive mais le nombre de patients COVID-19 hospitaliseacutes srsquoest maintenu agrave un niveau eacuteleveacute avec 30 341 personnes hospitaliseacutees au 27 avril 2021 Le taux drsquoadmission en services de soins critiques en S16 eacutetait similaire agrave celui de S15 et le nombre de personnes hospitaliseacutees dans ces services eacutetait de 5 959 patients le 27 avril traduisant une pression qui se maintient en soins critiques En semaine 15 le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait toujours significativement supeacuterieur agrave celui attendu au niveau national et dans six reacutegions Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves de patients COVID-19 hospitaliseacutes en semaine 16 eacutetait en augmentation Le nombre de deacutecegraves en eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) restait faible traduisant lrsquoeffet de la vaccination Lrsquoanalyse de lrsquoeffet des mesures de restrictions indique que lrsquoeacutevolution des indicateurs eacutepideacutemiologiques en semaines 15 et 16 est compatible avec un effet beacuteneacutefique des mesures de restrictions renforceacutees mises en œuvre depuis le 20 mars 2021 coupleacutees aux vacances scolaires anticipeacutees La diminution du nombre de cas et de contacts et notamment du nombre de contacts extra-domiciliaires depuis la semaine 14 suggegravere aussi un effet positif des mesures de restrictions sur la circulation du virus Neacuteanmoins la situation eacutepideacutemiologique en France meacutetropolitaine agrave lrsquoapproche de la leveacutee annonceacutee de certaines mesures de restrictions renforceacutees apparaicirct beaucoup moins favorable qursquoelle ne lrsquoeacutetait une semaine avant la leveacutee du deuxiegraveme confinement (le 15 deacutecembre 2020) Lrsquoanalyse des reacutesultats de criblage des tests RT-PCR positifs indique une preacutedominance nette de la proportion de suspicions de variant preacuteoccupant 20I501YV1 qui repreacutesentait 827 des tests cribleacutes en S16 en France La proportion de suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 restait stable agrave environ 50 au niveau national avec cependant des heacuteteacuterogeacuteneacuteiteacutes deacutepartementales agrave suivre avec la plus grande attention dans les prochaines semaines Au 27 avril 2021 14 601 130 personnes avaient reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 et 6 115 998 eacutetaient complegravetement vaccineacutes soit respectivement 218 et 91 de la population Lrsquoestimation de la couverture vaccinale au sein de la population adulte (acircgeacutee de 18 ans ou plus) eacutetait de 277 pour au moins une dose et 116 pour la population complegravetement vaccineacutee La limitation des contacts et des deacuteplacements ainsi que lrsquoadoption systeacutematique des gestes barriegraveres sont indispensables pour tous y compris les personnes vaccineacutees Il demeure primordial que chaque personne preacutesentant des symptocircmes eacutevocateurs de la COVID-19 srsquoisole immeacutediatement et reacutealise un test diagnostique dans les plus brefs deacutelais Lrsquoacceacuteleacuteration de la campagne de vaccination reste un enjeu majeur pour faire face agrave la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie

SOMMAIRE

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE 4

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE 6

SURVEILLANCE GEacuteNOMIQUE DU SARS-CoV-2 16

IMPACT DES MESURES DE RESTRICTIONS SANITAIRES EN FRANCE MEacuteTROPOLITAINE 21

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS 24

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX 29

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) 31

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo 32

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER 34

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES

PEacuteDIATRIQUES 42

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute 44

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 50

SUIVI DE LrsquoADOPTION DES MESURES DE PREacuteVENTION

ET DES INDICATEURS DE SANTEacute MENTALE 55

SITUATION INTERNATIONALE 56

SYNTHEgraveSE 61

SOURCES DES DONNEacuteES 67

Retrouvez les derniegraveres donneacutees concernant - la surveillance des cas de COVID-19 chez les professionnels en eacutetablissements de santeacute dans le PE du 1er avril 2021 - les signalements drsquoinfections nosocomiales agrave SARS-CoV-2 dans le PE ndeg59 du 15 avril 2021 Leur actualisation est preacutevue agrave un rythme mensuel cette peacuteriodiciteacute pouvant ecirctre adapteacutee en fonction de lrsquoeacutevolution des situations et des connaissances

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE Reacuteseau Sentinelles La surveillance des infections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale par le reacuteseau Sentinelles permet drsquoestimer leur incidence en France meacutetropolitaine Ces donneacutees cliniques sont compleacuteteacutees depuis le 13 septembre 2020 par une surveillance virologique pour une partie des personnes chez lesquelles des preacutelegravevements sont reacutealiseacutes Les reacutesultats des deux derniegraveres semaines seront prochainement consolideacutes

En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) le taux drsquoincidence des consultations pour une IRA a eacuteteacute estimeacute agrave 70 pour 100 000 habitants (intervalle de confiance agrave 95 [58-82] en France meacutetropolitaine stable par rapport agrave la semaine 15 72100 000 habitants (IC95 [63-81]) (Figure 1) Sur les 13 preacutelegravevements effectueacutes chez des patients preacutesentant une IRA en S16 un srsquoest aveacutereacute positif pour le SARS-CoV-2 trois pour un virus respiratoire syncytial (VRS) et un pour un rhinovirus Depuis la semaine 37-2020 sur les 1105 preacutelegravevements naso-pharyngeacutes effectueacutes chez les patients qui ont eacuteteacute testeacutes pour les diffeacuterents virus respiratoires surveilleacutes 312 (28) eacutetaient positifs pour un rhinovirus 148 (13) pour le SARS-CoV-2 64 (6) pour un meacutetapneumovirus et 59 (5) pour un VRS Deux preacutelegravevements se sont aveacutereacutes positifs pour un virus grippal de type BVictoria en semaine 49-2020 et en semaine 02-2021 Figure 1 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) des cas drsquoinfection respiratoire aigueuml (IRA) vus en meacutedecine geacuteneacuterale par semaine depuis la semaine 12-2020 (du 16 au 22 mars) France meacutetropolitaine

Semaine 16 donneacutees non consolideacutees

Source Reacuteseau Sentinelles

Associations SOS Meacutedecins Depuis le 03 mars 2020 211 237 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 26 avril 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des associations ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) 2 437 actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes par les associations SOS Meacutedecins ayant transmis sans interruption sur la peacuteriode Ce nombre eacutetait en baisse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (2 866 actes en S15 soit -15) Lrsquoanalyse par classe drsquoacircge montre une baisse dans toutes les classes drsquoacircges chez les enfants (-14 soit -32 actes) et les adultes (-15 soit -400 actes) La reacutepartition du nombre drsquoactes par classe drsquoacircge eacutetait de 2 chez les 0-4 ans 6 chez les 5-14 ans 54 chez les 15-44 ans 24 chez les 45-64 ans 8 chez les 65-74 ans et 6 chez les 75 ans et plus (contre respectivement 4 6 54 23 6 et 5 en S15)

Au niveau reacutegional les actes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 eacutetaient stables ou en baisse dans toutes les reacutegions excepteacute en Nouvelle-Aquitaine La majoriteacute des actes a eacuteteacute enregistreacutee en Icircle-de-France (22) Auvergne-Rhocircne-Alpes (12) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (11) Nouvelle-Aquitaine (10) Hauts-de-France (9) et Grand Est (8) La part du nombre drsquoactes pour suspicion de COVID-19 dans lrsquoactiviteacute totale eacutetait en leacutegegravere baisse agrave 45 (49 en S15) (Figure 2) Figure 2 Nombre hebdomadaire drsquoactes SOS Meacutedecins et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 24 feacutevrier 2020 France

Figure 3 Taux hebdomadaire drsquoactes meacutedicaux pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 actes meacutedicaux SOS Meacutedecins par deacutepartement semaine 16-2021 France

Source SOS Meacutedecins Source SOS Meacutedecins

Pour en savoir + sur les donneacutees SOS Meacutedecins consulter Geacuteodes

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE La surveillance virologique baseacutee sur les laboratoires permet de deacuteterminer et de suivre lrsquoeacutevolution dans le temps et par reacutegion ou deacutepartement des taux drsquoincidence (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) des taux de positiviteacute (nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 rapporteacute au nombre de personnes testeacutees) et des taux de deacutepistage (nombre de personnes deacutepisteacutees rapporteacute agrave la population) La surveillance repose sur le systegraveme SI-DEP (systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) qui vise au suivi exhaustif de toutes les personnes testeacutees en France pour le diagnostic et le deacutepistage de la COVID-19 dans les laboratoires de ville les laboratoires hospitaliers et par les autres professionnels de santeacute Sont pris en compte dans les indicateurs SI-DEP les tests par amplification moleacuteculaire RT-PCR (avec lesquels sont compteacutes les tests RT-LAMP) et les tests antigeacuteniques reacutealiseacutes en laboratoire (TDR) ou hors laboratoire (TROD) Cas confirmeacute de COVID-19 personne preacutesentant une infection agrave SARS-CoV-2 confirmeacutee par test RT-PCR ou test antigeacutenique que cette personne soit symptomatique ou asymptomatique (voir deacutefinition de cas)

Une correction a eacuteteacute appliqueacutee aux taux drsquoincidence et de deacutepistage des semaines incluant un jour feacuterieacute (notamment S14) afin de prendre en compte son effet sur lrsquoactiviteacute de deacutepistage La meacutethodologie a eacuteteacute preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 15 avril 2021 et une note meacutethodologique la deacutecrivant plus preacuteciseacutement est disponible sur le site internet de Santeacute publique France

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage En semaine 16 2 037 777 personnes ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 2 308 631 en S15 soit -12) et 202 396 nouveaux cas confirmeacutes ont eacuteteacute rapporteacutes (Figures 4 et 5) Au 28 avril 2021 un total de 5 565 852 cas confirmeacutes de COVID-19 a eacuteteacute rapporteacute agrave Santeacute publique France depuis la mise en place de la surveillance en janvier 2020 Figure 4 Nombre de personnes testeacutees nombre de personnes testeacutees positives pour le SARS-CoV-2 et taux de positiviteacute par semaine France (donneacutees au 28 avril 2021)

Sources S09-S19 3 Labo et laboratoires hospitaliers depuis S20 SI-DEP

Figure 5 Nombre incident de cas confirmeacutes de COVID-19 par semaine (date de preacutelegravevement) rapporteacutes agrave Santeacute publique France du 11 mai 2020 au 25 avril 2021 France (donneacutees au 28 avril 2021)

Source SI-DEP

En S16 le taux de positiviteacute national hebdomadaire des personnes testeacutees eacutetait de 99 (calculeacute sur les personnes testeacutees et dont les tests sont valides) stable par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (+01 point) (Figure 4)

Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes (nombre de nouveaux cas rapporteacute agrave la population) eacutetait de 302100 000 habitants en S16 en diminution par rapport au taux consolideacute de la semaine preacuteceacutedente (339 cas100 000 habitants en S15 -11) (Figure 6)

Le taux de deacutepistage (nombre de personnes testeacutees pour SARS-CoV-2 rapporteacute agrave la population) hebdomadaire eacutetait de 3 036100 000 habitants en diminution par rapport au taux consolideacute de S15 (3 440 100 000 hab -12) (Figure 6) Figure 6 Eacutevolution des taux drsquoincidence et de deacutepistage par semaine avec ou sans correction depuis la semaine 23-2020 France (donneacutees au 28 avril 2021)

Source SI-DEP

La proportion de tests effectueacutes en S16 et inteacutegreacutes dans la base SI-DEP le jour mecircme ou le lendemain du preacutelegravevement eacutetait de 94 stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente

Analyse par classe drsquoacircge En semaine 16 au niveau national le taux drsquoincidence (pour 100 000 habitants) des cas confirmeacutes eacutetait de 176 chez les 0-14 ans 425 chez les 15-44 ans 318 chez les 45-64 ans 188 chez les 65-74 ans et 160 chez les 75 ans et plus (Figure 8a) Le taux drsquoincidence eacutetait en diminution par rapport agrave S15 dans toutes les classes drsquoacircge La diminution la plus marqueacutee eacutetait chez les 65-74 ans (-14) suivis par les 45-64 ans et les 75 ans et plus (-12) les 15-44 ans (-11) et les 0-14 ans (-7) (Figure 8a) Le taux de deacutepistage eacutetait en diminution par rapport agrave S15 dans toutes les classes drsquoacircge La diminution la plus importante eacutetait observeacutee chez les 0-14 ans (-16) suivis par les 15-44 ans (-13) les 45-64 ans et les 65-74 ans (-11) et les 75 ans et plus (-5) (Figure 8b) Le taux de positiviteacute des personnes testeacutees eacutetait en diminution par rapport agrave S15 dans toutes les classes drsquoacircge excepteacute chez les 0-14 ans (+12 point) et les 15-44 ans (+02 point) La diminution la plus forte eacutetait chez les 75 ans et plus (-05 point) suivis par les 65-74 ans (-02 point) et les 45-64 ans (-01 point) (Figure 8c)

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes En semaine 16 parmi les personnes testeacutees lrsquoinformation sur la preacutesence ou non de symptocircmes eacutetait disponible pour 87 (soit n=1 780 947) La part des personnes symptomatiques eacutetait de 185 en diminution par rapport agrave S15 (205) Le taux de positiviteacute eacutetait en augmentation chez les symptomatiques (293 vs 262 en S15) et stable chez les asymptomatiques (59) (Figure 7) Parmi les cas 53 eacutetaient symptomatiques proportion stable par rapport agrave S15 Le nombre de cas eacutetait en diminution chez les symptomatiques (96 312 vs 108 992 en S15 soit -12) et chez les asymptomatiques (85 013 vs 94 255 en S15 soit -10) (Figure 7) Figure 7 Eacutevolution du nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 et du taux de positiviteacute selon la preacutesence ou non

de symptocircmes par semaine depuis la semaine 23-2020 France (donneacutees au 28 avril 2021)

Source SI-DEP

Figure 8 Eacutevolution des taux drsquoincidence corrigeacutes et non corrigeacutes (8a) de deacutepistage corrigeacutes et non corrigeacutes (8b) et de positiviteacute (8c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge depuis la semaine 23-2020 France (donneacutees au 28 avril 2021)

8a Taux drsquoincidence

8b Taux de deacutepistage

8c Taux de positiviteacute

Semaine 16 donneacutees non consolideacutees Source SI-DEP

Au niveau reacutegional Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur GEODES et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

En meacutetropole En France meacutetropolitaine 198 407 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 16 correspondant agrave un taux drsquoincidence de 306 cas100 000 habitants (contre 344 en S15 soit -11) Le taux de deacutepistage srsquoeacutelevait agrave 3 039100 000 habitants Le taux de positiviteacute eacutetait de 10 stable par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente

En semaine 16 le taux drsquoincidence eacutetait au-dessus du seuil de 250100 000 habitants dans 51 deacutepartements (65 en S15) Les taux drsquoincidence les plus eacuteleveacutes eacutetaient observeacutes dans les deacutepartements de la Seine-Saint-Denis (547) du Val-drsquoOise (518) du Val-de-Marne (514) des Bouches-du-Rhocircne (476) de lrsquoEssonne (453) de la Seine-et-Marne (449) et de lrsquoOise (443) (Figure 9a) En S16 les deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant les plus forts taux de deacutepistage (pour 100 000 habitants) eacutetaient Paris (5 511) les Bouches-du-Rhocircne (4 539) la Moselle (4 195) la Corse-du-Sud (4 152) le Bas-Rhin (4 097) les Hauts-de-Seine (3 749) et le Val-de-Marne (3 732) (Figure 9c) Le taux de positiviteacute eacutetait supeacuterieur ou eacutegal agrave 10 dans 46 deacutepartements en S16 (43 en S15) Les taux les plus eacuteleveacutes eacutetaient rapporteacutes dans les deacutepartements du Val-drsquoOise (154) de la Seine-Saint-Denis (153) de lrsquoOise (147) de lrsquoEssonne (143) de la Loire et de la Haute-Loire (142) de la Seine-et-Marne (140) et du Val-de-Marne (138) (Figure 9b)

En Outre-mer En Guadeloupe le taux drsquoincidence eacutetait stable en S16 (229100 000 habitants vs 227 en S15) et le taux de positiviteacute en diminution agrave 109 (vs 119 en S15)

En Martinique le taux drsquoincidence eacutetait en diminution (180100 000 habitants vs 205 en S15) et le taux de positiviteacute stable agrave 84 (vs 85 en S15)

Agrave Saint-Martin les indicateurs eacutetaient stables avec un taux drsquoincidence de 59100 000 habitants (vs 54 en S15) et un taux de positiviteacute de 20 (vs 24 en S15)

En Guyane les indicateurs eacutetaient en augmentation avec un taux drsquoincidence de 241100 000 habitants (vs 195 en S15) et un taux de positiviteacute de 97 (vs 90 en S15) Agrave Mayotte les indicateurs eacutetaient en leacutegegravere augmentation avec un taux drsquoincidence de 53100 000 habitants (vs 51 en S15) et un taux de positiviteacute de 52 (vs 44 en S15)

Agrave La Reacuteunion les indicateurs eacutetaient eacutegalement en leacutegegravere augmentation avec un taux drsquoincidence de 127100 000 habitants (vs 109 en S15) et un taux de positiviteacute de 39 (vs 35 en S15)

Figure 9 Taux drsquoincidence (100 000 habitants) (9a) de positiviteacute () (9b) et de deacutepistage (nombre de

tests100 000 habitants) (9c) pour le SARS-CoV-2 du 19 au 25 avril 2021 par deacutepartement France

(donneacutees au 28 avril 2021)

9b Taux de positiviteacute

9c Taux de deacutepistage

Source SI-DEP

Pour plus drsquoinformation les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur Geacuteodes (donneacutees non corrigeacutees pour S14) et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

Pour en savoir + sur les donneacutees SI-DEP consulter Geacuteodes

Analyse par niveaux scolaires En semaine 16 226 265 personnes de moins de 18 ans ont eacuteteacute testeacutees pour le SARS-CoV-2 (vs 265 542 en S15 soit -15) Un total de 29 683 nouveaux cas a eacuteteacute rapporteacute en diminution (-9) par rapport agrave S15 ougrave 32 618 nouveaux cas avaient eacuteteacute signaleacutes Les moins de 18 ans repreacutesentaient 15 de lrsquoensemble des nouveaux cas observeacutes dans la population geacuteneacuterale Si lrsquoon considegravere des classes drsquoacircge plus fines correspondant aux niveaux scolaires les 0-2 ans repreacutesentaient 4 des nouveaux cas parmi les moins de 18 ans les 3-5 ans 7 les 6-10 ans 29 les 11-14 ans 30 et les 15-17 ans 29 Le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes au niveau national eacutetait de 347100 000 habitants chez les 15-17 ans 269 chez les 11-14 ans 210 chez les 6-10 ans 90 chez les 3-5 ans et 60 chez les 0-2 ans (Figure 10a) Une diminution des taux drsquoincidence eacutetait de nouveau observeacutee chez les 6-10 ans (-4) les 11-14 ans (-14) et les 15-17 ans (-13) Chez les 0-2 ans le taux drsquoincidence eacutetait stable tandis qursquoil augmentait chez les 3-5 ans (+2) Le taux de deacutepistage a continueacute de diminuer dans toutes les classes drsquoacircge -16 chez les 0-2 ans -12 chez les 3-5 ans -13 chez les 6-10 ans -19 chez les 11-14 ans et -13 chez les 15-17 ans (Figure 10b) Le taux de positiviteacute a continueacute drsquoaugmenter pour la troisiegraveme semaine conseacutecutive pour une grande partie des classes drsquoacircge +18 point chez les 0-2 ans +22 points chez les 3-5 ans +13 point chez les 6-10 ans +07 point chez les 11-14 ans Il est resteacute stable chez les 15-17 ans (Figure 10c) Figure 10 Eacutevolution des taux drsquoincidence corrigeacutes et non corrigeacutes (10a) de deacutepistage corrigeacutes et non corrigeacutes (10b) et de positiviteacute (10c) des cas de COVID-19 selon les classes drsquoacircge des moins de 18 ans depuis la semaine 23-2020 France (donneacutees au 28 avril 2021) 10a Taux drsquoincidence

Source SI-DEP

Variants drsquointeacuterecirct analyse des reacutesultats des tests de criblage saisis dans SI-DEP De nombreux variants du SARS-CoV-2 circulent aujourdrsquohui sur le territoire dont certains sont qualifieacutes de laquo variants preacuteoccupants (VOC) raquo car leur impact (sur le plan de la transmissibiliteacute de la virulence ou de lrsquoeacutechappement immunitaire potentiel) justifie la mise en place drsquoune surveillance et de mesures de gestion speacutecifiques au niveau national dans lrsquoobjectif de contenir leur progression Santeacute publique France en lien avec le CNR Virus des infections respiratoires produit agrave intervalles reacuteguliers des analyses de risque permettant de caracteacuteriser et classer ces diffeacuterents variants Ces analyses de risque sont accessibles sur le site de Santeacute publique France Afin de faciliter ce suivi lrsquoapplication SI-DEP a eacutevolueacute depuis le 25 janvier 2021 et integravegre doreacutenavant les reacutesultats des tests RT-PCR de criblage qui disposent drsquoamorces speacutecifiques permettant la deacutetection des principales mutations qui caracteacuterisent les variants Ces tests de criblage sont utiliseacutes en seconde intention apregraves lrsquoutilisation drsquoun test RT-PCR classique de premiegravere intention pour le diagnostic drsquoune infection agrave SARS-CoV-2 Lrsquoanalyse des premiers reacutesultats permet de suspecter la preacutesence drsquoun variant 20I501YV1 (ayant eacutemergeacute au Royaume-Uni) 20H501YV2 (Afrique du Sud) ou 20J501YV3 (Breacutesil) (les deux derniers sans distinction) ou de conclure agrave lrsquoabsence de variant preacuteoccupant (VOC)

Au niveau national en semaine 16 sur les 232 382 tests de premiegravere intention positifs (tests RT-PCR et antigeacuteniques) enregistreacutes dans la plateforme SI-DEP 52 eacutetaient associeacutes agrave un test de criblage lui aussi enregistreacute dans SI-DEP (soit 121 355 tests positifs cribleacutes) Parmi ces tests positifs cribleacutes 827 (100 420) correspondaient agrave une suspicion de variant 20I501YV1 (contre 823 en S15) et 50 (6 086) agrave une suspicion de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 (contre 42 en S15) La proportion de tests positifs cribleacutes variait peu selon la classe drsquoacircge de 497 chez les 20-29 ans agrave 580 chez les 0-9 ans (Tableau 1) La proportion de suspicions de variant 20I501YV1 eacutetait comprise entre 772 chez les 90 ans et plus et 841 chez les 40-49 ans La proportion de suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 allait de 35 chez les 80-89 ans agrave 54 chez les 20-29 ans Tableau 1 Proportion de suspicions de variant preacuteoccupant (VOC) parmi les tests de criblage positifs 20I501YV1 20H501YV2 ou 20J501YV3 par classe drsquoacircge France (donneacutees au 28 avril 2021)

Acircge (ans)

Nb de tests (RT-PCR et TAG)

Nb de tests positifs (RT-PCR et TAG)

PCR de criblage 20I501YV1 20H501YV2

ou 20J501YV3

0-9 84 468 10 612 6 156 580 4 979 809 274 45

10-19 228 821 30 088 16 090 535 13 483 838 748 47

20-29 395 499 42 160 20 950 497 17 178 820 1 121 54

30-39 352 481 38 001 19 055 501 15 706 824 1 009 53

40-49 322 489 36 402 19 051 523 16 013 841 992 52

50-59 316 581 33 043 17 440 528 14 589 837 914 52

60-69 221 017 21 008 11 129 530 9 194 826 545 49

70-79 140 159 11 498 6 191 538 5 094 823 281 45

80-89 95 806 6 526 3 568 547 2 853 800 124 35

90 et plus 49 476 2 935 1 677 571 1 295 772 76 45

Inconnu 654 109 48 440 36 750 2 42

Tous 2 207 451 232 382 121 355 522 100 420 827 6 086 50

Parmi les tests positifs Parmi les PCR de criblage

Ces variants ont eacuteteacute deacutetecteacutes dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines avec des dispariteacutes deacutepartementales Parmi les deacutepartements meacutetropolitains la proportion du variant 20I501YV1 eacutetait supeacuterieure agrave 80 dans 68 deacutepartements et supeacuterieure agrave 90 dans 25 drsquoentre eux (Figure 11)

En meacutetropole sept deacutepartements avaient une proportion de suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 supeacuterieure agrave 10 Cette proportion a particuliegraverement augmenteacute en Haute-Saocircne (25 vs 17 en S15) et dans les Vosges (15 vs 102 en S14) Elle a diminueacute dans la Creuse (174 vs 305 en S15) et en Moselle (159 vs 185 en S15) (Figure 11)

Dans les territoires drsquooutre-mer ougrave les donneacutees sont interpreacutetables une forte proportion de suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 eacutetait observeacutee en Guyane (793) et agrave Mayotte (60) On note toujours une tregraves forte proportion de suspicions de variant 20I501YV1 en Martinique (963) et en Guadeloupe (954) (Figures 11 et 12) Figure 11 Proportion () de suspicions de variant preacuteoccupant 20I501YV1 parmi les tests de criblage positifs pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement France (donneacutees au 28 avril 2021)

Indicateur non interpreacutetable pour Saint-Martin Saint-Bartheacutelemy et Mayotte en raison drsquoun trop faible nombre de tests de criblage reacutealiseacutes

Source SI-DEP

Figure 12 Proportion () de suspicions de variant preacuteoccupant 20H501YV2 ou 20J501YV3 parmi les tests de criblage positifs pour le SARS-CoV-2 par deacutepartement France (donneacutees au 28 avril 2021)

Indicateur non interpreacutetable pour Saint-Martin et Saint-Bartheacutelemy en raison drsquoun trop faible nombre de tests de criblage reacutealiseacutes

Source SI-DEP

SURVEILLANCE GEacuteNOMIQUE DU SARS-CoV-2 Reacutesultats des enquecirctes Flash 6 et 7 La surveillance geacutenomique du SARS-CoV-2 relegraveve des missions du centre national de reacutefeacuterence (CNR) Virus des infections respiratoires et est conduite dans le cadre du consortium EMER-GEN qui associe Santeacute publique France lrsquoANRS Maladies infectieuses eacutemergentes (MIE) et de tregraves nombreux partenaires dont en particulier quatre plateformes de seacutequenccedilage (CNR Institut Pasteur (Paris) CNR Hospices civils de Lyon AP-HP Henri-Mondor (Creacuteteil) IHU Meacutediterraneacutee Infection) et le reacuteseau de virologie de lrsquoANRS MIE Les donneacutees ainsi geacuteneacutereacutees sont destineacutees agrave enrichir la surveillance de la COVID-19 agrave contribuer aux analyses de risque permettant de caracteacuteriser et de classer les diffeacuterents variants circulant en France et agrave alimenter des travaux de recherche

Cette surveillance geacutenomique a pour objectif de suivre leacutevolution moleacuteculaire des virus circulant sur le territoire afin de deacutetecter leacutemergence de lignages geacuteneacutetiques (variants) preacutesentant des mutations susceptibles drsquoavoir des conseacutequences sur la transmissibiliteacute la virulence ou lrsquoeacutechappement immunitaire et de suivre leur eacuteventuelle diffusion sur le territoire ou au sein de populations speacutecifiques Lrsquoidentification preacutecise des variants connus repose sur le seacutequenccedilage partiel du geacutenome viral (Sanger) ou du geacutenome complet par lrsquoutilisation du Next Generation Sequencing (NGS) Celle de nouveaux variants preacuteoccupants (VOC) neacutecessite une analyse complegravete du geacutenome viral par NGS Cette identification des variants par seacutequenccedilage est compleacutementaire et plus robuste que celle baseacutee sur les tests de criblage (RT-PCR) limiteacutee agrave la deacutetection de quelques mutations associeacutees aux variants preacuteoccupants deacutejagrave connus (20I501YV1 20H501YV2 20J501YV3) Les donneacutees de surveillance sont confronteacutees aux donneacutees eacutepideacutemiologiques et aux reacutesultats des travaux de virologie visant agrave eacutetudier les proprieacuteteacutes des virus concerneacutes Les enquecirctes Flash qui reposent sur une seacutelection aleacuteatoire de preacutelegravevements RT-PCR positifs font partie des cibles prioritaires de la strateacutegie nationale de surveillance geacutenomique et permettent drsquoeacutetablir une cartographie de la diffusion des variants circulant en France Ces enquecirctes sont proposeacutees deux fois par mois agrave tous les laboratoires de biologie meacutedicale (LBM) publics et priveacutes et reposent sur une participation volontaire Afin drsquoobtenir une cartographie globale (non limiteacutee aux variants preacuteoccupants (VOC) connus) des diffeacuterents types de virus SARS-CoV-2 circulant sur le territoire franccedilais il a eacuteteacute demandeacute aux LBM participants de transmettre aux plateformes du consortium EMER-GEN un eacutechantillonnage de preacutelegravevements positifs en RT-PCR quel que soit le reacutesultat du criblage Ces preacutelegravevements ne devaient pas provenir de lrsquoinvestigation drsquoun cluster afin drsquoeacuteviter des biais de seacutelection

Enquecircte Flash 6 du 30 mars 2021 (reacutesultats consolideacutes) Pour lrsquoenquecircte Flash 6 et afin de tenir compte de lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie les LBM participants devaient transmettre

15 des preacutelegravevements positifs du jour de lrsquoenquecircte pour les laboratoires en ayant plus de 20 ou la totaliteacute des

preacutelegravevements positifs du jour pour les laboratoires en ayant moins de 20 En compleacutement en lien avec une investigation

en cours autour de Lannion concernant lrsquoeacutemergence drsquoun nouveau variant appartenant au clade 20C le protocole de

lrsquoenquecircte Flash 6 a eacuteteacute adapteacute pour les laboratoires preacuteleveurs (publics ou priveacutes) de la reacutegion Bretagne qui devaient

transmettre 50 de leurs preacutelegravevements positifs Le protocole pour le deacutepartement de la Dordogne a eacutegalement eacuteteacute

modifieacute afin drsquoinclure la totaliteacute des preacutelegravevements positifs du jour de lrsquoenquecircte dans le cadre drsquoune investigation en cours

agrave la recherche du variant 19B501Y

Lrsquoenquecircte Flash 6 du 30 mars 2021 a porteacute sur 2 590 preacutelegravevements provenant de 14 reacutegions (Tableau 2)

Lrsquoenquecircte Flash 6 confirme la preacutedominance du variant preacuteoccupant 20I501YV1 (808 des seacutequences interpreacutetables) Les variants preacuteoccupants 20H501YV2 20J501YV3 et 20I484K ont eacuteteacute eacutegalement deacutetecteacutes mais en proportions plus faibles (respectivement 78 04 et 05 des seacutequences interpreacutetables) Les proportions des variants 20I501YV1 et 20J501YV3 eacutetaient globalement stables par rapport agrave celles de lrsquoenquecircte Flash 5 Une leacutegegravere augmentation est observeacutee pour les variants preacuteoccupants 20H501YV2 (64 (Flash 5) vs 78 (Flash 6)) et 20I484K (01 (Flash 5) vs 05 (Flash 6)) Comme pour lrsquoenquecircte Flash 5 le clade 20I501YV1 repreacutesentait plus de 70 des reacutesultats quelle que soit la classe drsquoacircge La diffusion de ce variant devient homogegravene au sein de la population Le variant preacuteoccupant 20H501YV2 a eacutegalement eacuteteacute identifieacute de faccedilon homogegravene dans toutes les classes drsquoacircge (Tableau 3) et sur le territoire (Tableau 2)

1 Un clade geacuteneacutetique est un regroupement de virus preacutesentant une seacutequence geacuteneacutetique similaire Cela permet de classer les virus et de faire lrsquoanalyse de leur eacutevolution

Le variant 20I501YV1 reste particuliegraverement preacutesent en Occitanie et Centre-Val de Loire (gt 90 des seacutequences interpreacutetables) et le variant 20H501YV2 est plus preacutesent en Icircle-de-France (126) dans le Grand Est (108) et en Bourgogne-Franche-Comteacute (95) Pour la Corse et la Guadeloupe les reacutesultats ne sont pas exploitables en raison du faible nombre de preacutelegravevements inclus

Ces reacutesultats par reacutegion sont agrave interpreacuteter avec prudence agrave ce jour tous les deacutepartements ne sont pas

encore repreacutesenteacutes au sein de certaines reacutegions ce qui peut biaiser les reacutesultats Des efforts sont entrepris

pour renforcer la participation agrave ces eacutetudes dans les reacutegions concerneacutees en sollicitant les reacuteseaux des

laboratoires en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France

Le sureacutechantillonnage reacutealiseacute en Dordogne a permis de deacuteterminer que 80 des souches circulant dans ce deacutepartement appartenaient au clade 20I501YV1 et 44 des preacutelegravevements correspondaient au variant 19B501Y (A27) Drsquoautres variants ont eacutegalement eacuteteacute deacutetecteacutes tels que le variant preacuteoccupant 20H501YV2 (22) le variant en cours drsquoeacutevaluation 20A214 Ins (22) ou encore le variant 20B484K (B11318 3) Pour la Bretagne aucun variant 20C655Y nrsquoa eacuteteacute deacutetecteacute au cours de cette enquecircte

Enquecircte Flash 7 du 13 avril 2021 (premiers reacutesultats) Pour lrsquoenquecircte Flash 7 les LBM participants devaient transmettre 15 des preacutelegravevements positifs du jour de lrsquoenquecircte pour les laboratoires en ayant plus de 20 ou la totaliteacute des preacutelegravevements positifs du jour pour les laboratoires en ayant moins de 20 En compleacutement le protocole appliqueacute pour le deacutepartement de la Dordogne lors de lrsquoEnquecircte Flash 6 a eacutegalement eacuteteacute renouveleacute afin drsquoinclure la totaliteacute des preacutelegravevements positifs du jour de lrsquoenquecircte

Les reacutesultats preacutesenteacutes pour lrsquoenquecircte Flash 7 du 13 avril 2021 portent sur lrsquoanalyse des seacutequences

issues de 1 177 preacutelegravevements provenant de 12 reacutegions parmi pregraves de 1 700 preacutelegravevements reccedilus (pregraves

de 70 des preacutelegravevements seacutequenceacutes) (Tableau 4)

Le variant preacuteoccupant 20I501YV1 repreacutesente 899 des seacutequences interpreacutetables parmi les reacutesultats disponibles Cette augmentation doit ecirctre interpreacuteteacutee avec prudence en attendant la consolidation des reacutesultats de lrsquoenquecircte Les variants preacuteoccupants 20H501YV2 20I484K et 20J501YV3 ont eacuteteacute eacutegalement deacutetecteacutes (respectivement 39 10 et 03 des seacutequences interpreacutetables) Le clade 20I501YV1 repreacutesentait plus de 80 des reacutesultats quelle que soit la classe drsquoacircge (Tableau 5)

La diffusion des variants preacuteoccupants 20I501YV1 et 20H501YV2 est relativement homogegravene sur le territoire (Tableau 4) Le variant 20I501YV1 reste particuliegraverement preacutesent en Nouvelle-Aquitaine et en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (gt 95 des seacutequences interpreacutetables) le variant 20H501YV2 est plus preacutesent en Icircle-de-France (82) et Occitanie (83) Le variant preacuteoccupant 20I484K est en augmentation en Icircle-de-France entre lrsquoenquecircte Flash 6 et cette nouvelle eacutedition (10 (Flash 6) vs 27 (Flash 7)) En Bretagne la proportion de variant 20I484K est eacutegalement en augmentation avec 30 pour Flash 7 (non deacutetecteacute pour Flash 6) Pour la Bourgogne-Franche-Comteacute la Guadeloupe et le Grand Est les reacutesultats ne sont pas encore exploitables en raison du faible nombre de preacutelegravevements seacutequenceacutes disponibles pour cette premiegravere analyse

Eacutevolution des diffeacuterents clades et variants au cours des enquecirctes Flash 3 agrave 7 du 16 feacutevrier 2021 au 13 avril 2021 La comparaison des reacutesultats des enquecirctes Flash baseacutees sur un eacutechantillonnage aleacuteatoire des

preacutelegravevements permet de mesurer lrsquoeacutevolution de la part des lignages et variants du SARS-CoV-2 circulant

sur le territoire franccedilais au cours du temps La figure 13 montre la forte augmentation de la proportion du

variant preacuteoccupant 20I501YV1 entre feacutevrier et avril 2021 une augmentation qui semble ralentir au cours

des derniegraveres semaines Dans Flash 7 la proportion du variant 20H501YV2 est de 39 (Flash 3 60

Flash 4 55 Flash 5 64 Flash 6 78) et celle du variant 20J501YV3 est de 03

(Flash 3 06 Flash 4 01 Flash 5 03 Flash 6 04) Pour le variant 20I484K lors de cette

nouvelle enquecircte la proportion est de 10 et est en augmentation (Flash 3 00 Flash 4 00 Flash

5 01 Flash 6 05) Les reacutesultats de lrsquoenquecircte Flash 7 sont encore preacuteliminaires et seront agrave

confirmer lors de la consolidation des donneacutees dans les prochaines enquecirctes Flash

Parmi les preacutelegravevements inclus dans les enquecirctes Flash le variant en cours drsquoeacutevaluation 20A484K semble

ecirctre en leacutegegravere augmentation (B1 Flash 5 00) Flash 6 02 et Flash 7 08) ainsi que le variant

20A484K (B1525 Flash 5 004 Flash 6 12 et Flash 7 17) Tous les autres lignages eacutetaient

stables ou en diminution

Figure 13 Eacutevolution des reacutesultats de seacutequenccedilage par clade enquecirctes Flash 3 agrave 7 donneacutees au 29 avril 2021 France

Lrsquoenquecircte Flash 8 baseacutee sur un eacutechantillonnage de preacutelegravevements aleacuteatoires a eacuteteacute conduite le 27 avril 2021 ses reacutesultats seront restitueacutes dans un prochain point eacutepideacutemiologique Santeacute publique France remercie lrsquoensemble des laboratoires de biologie meacutedicale publics et priveacutes qui participent agrave ces enquecirctes dont la mobilisation forte et rapide a permis drsquoobtenir ces reacutesultats

Flash 3 (16022021 n=699)

Flash 4 (02032021 n=1 656)

Flash 5 (16032021 n=2 860)

Flash 6 (30032021 n=2 590)

Flash 7 (12042021) - reacutesultats disponibles (n=1177)

Tableau 2 Reacutesultats de seacutequenccedilage par reacutegion du laboratoire preacuteleveur enquecircte Flash 6 30 mars 2021 France (n= 2 590 preacutelegravevements)

ARA Auvergne-Rhocircne-Alpes BFC Bourgogne-Franche-Comteacute BRE Bretagne CVL Centre-Val de Loire COR Corse GE Grand Est HDF Hauts-de-France IDF Icircle-de-France NOR Normandie NA Nouvelle-Aquitaine OCC Occitanie PDL Pays de la Loire PACA Provence-Alpes-Cocircte dAzur NR Non renseigneacute

Tableau 3 Reacutesultats de seacutequenccedilage par classe drsquoacircge enquecircte Flash 6 30 mars 2021 France (n= 2 590 preacutelegravevements)

NR Non renseigneacute

Reacutegion du laboratoire preacuteleveur

Preacutelegravevements totaux (N)

19A ()

19B ()

19B501Y ()

20A ()

20A (B13631)

20A214 Ins ()

20A484K (B1) ()

20A484K (B117757)

20A484K (B1525)

20AEU2 ()

20B ()

20B484K (B11318)

20B484K (P2) ()

20C ()

20C452R ()

20D ()

20E (EU1) ()

20I501Y V1 ()

20I484K ()

20H501Y V2 ()

20J501Y V3 ()

Total ()

ARA 232 - - 14 19 - 19 09 09 09 28 05 - 05 - - - 28 824 - 32 - 100 BFC 45 - - - 24 - - - - - 48 - - - - - - 48 786 - 95 - 100

BRE 107 - - 10 10 - 29 - - - - - - - - - - - 853 - 88 10 100 CVL 89 - - 12 12 - 12 12 - 24 24 - - - - - - - 906 - - - 100

COR 18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GE 77 - 14 - 41 - - - - - - 27 - - - - - - 811 - 108 - 100

GUA 2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - HDF 95 - - - 11 - 55 11 - - 55 - - - - - - 11 824 - 22 11 100

IDF 1 041 02 11 04 46 02 05 01 02 18 06 01 - - 03 - 08 02 750 10 126 05 100 NOR 104 - - - 10 - 10 - - 20 29 - - - - 10 - 20 833 10 59 - 100

NA 199 - - 33 22 - 17 - - - - - 22 - - - - 50 839 - 17 - 100 OCC 86 - - - 12 - 24 - - - - 12 - - - - - - 940 - 12 - 100

PDL 143 - - 07 37 - 37 07 - 07 - - - - - - - 07 800 07 81 07 100 PACA 289 - - 21 14 - - - - 11 14 07 - - 04 - - 04 881 - 39 07 100

NR 63 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1000 - - - 100

Total 2 590 01 05 09 30 01 12 02 02 12 12 03 02 00 02 00 03 10 808 05 78 04 100

Classes drsquoacircge (ans)

19A ()

19B ()

19B501Y ()

20A ()

20A (B13631)

20A214 Ins ()

20A484K (B1) ()

20A484K (B117757)

20A484K (B1525)

20AEU2 ()

20B ()

20B484K (B11318)

20B484K (P2) ()

20C ()

20C452R ()

20D ()

20E (EU1) ()

20I501Y V1 ()

20I484K ()

20H501Y V2 ()

20J501Y V3 ()

Total ()

0-9 97 - 11 - 11 - 11 - - 11 22 11 11 - - - - 11 806 11 75 11 100

10-19 317 03 - 07 29 - 13 - - 07 10 - - - - - - 07 869 03 52 - 100

20-29 352 03 06 09 21 03 03 03 - 09 15 06 - - - - 03 - 824 06 85 06 100

30-39 380 - 03 19 41 03 22 - 03 30 05 05 - - - 03 05 11 762 03 77 08 100

40-49 381 - 11 14 22 - 14 03 03 11 08 - - 03 - - 05 11 810 - 84 03 100

50-59 373 - - 08 22 - 08 03 03 08 06 03 03 - 06 - 03 03 825 08 89 03 100

60-69 238 - - - 31 - 13 04 04 04 17 - 04 - - - - 26 790 09 92 04 100

70-79 182 - 17 12 29 - 06 12 - 12 12 - 06 - - - 06 12 797 12 70 - 100

80-89 134 - - - 47 - 16 - - - 31 - - - 08 - 08 24 772 - 94 - 100

ge 90 73 - 15 - 104 - 15 - - 15 15 15 - - 15 - - 15 746 - 30 15 100

NR 63 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1000 - - - 100

Total 2 590 01 05 09 30 01 12 02 02 12 12 03 02 00 02 00 03 10 808 05 78 04 100

Tableau 4 Reacutesultats de seacutequenccedilage par reacutegion du laboratoire preacuteleveur enquecircte Flash 7 13 avril 2021 France (n= 1 177 preacutelegravevements)

ARA Auvergne-Rhocircne-Alpes BFC Bourgogne-Franche-Comteacute BRE Bretagne CVL Centre-Val de Loire GE Grand Est GUA Guadeloupe HDF Hauts-de-France IDF Icircle-de-France NA Nouvelle-Aquitaine OCC Occitanie PDL Pays de la Loire PACA Provence-Alpes-Cocircte dAzur

Tableau 5 Reacutesultats de seacutequenccedilage par classe drsquoacircge enquecircte Flash 7 13 avril 2021 France (n= 1 177 preacutelegravevements)

19B ()

20A ()

20A (B1416)

20A214 Ins ()

20A484K (B1) ()

20A484K (B1177)

20A484K (B1525)

20A484K (B1619)

20AEU2 ()

20B ()

20B484K (B11318)

20D ()

20D452R ()

20D484K ()

20E (EU1) ()

20I501Y V1 ()

20I484K ()

20H501Y V2 ()

20J501Y V3 ()

Total ()

ARA 242 - 04 - - 13 - 09 - 09 04 - - 04 09 - 931 - 17 - 100 BFC 18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BRE 74 - - - - - - - - - - - 15 - - 15 894 30 45 - 100 CVL 69 - - - 33 33 - - - - - - - - - - 917 - 17 - 100 GE 15 - - - - - - 67 - - - - - - - - - - - - 7 GUA 4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - HDF 45 - - - - - - - - 49 - 24 - - - - 902 - 24 - 100 IDF 338 06 09 - - - - 24 - - - - - - - 03 840 27 82 09 100 NA 50 - - - - - - - - - - - - - - - 1000 - - - 100 OCC 43 - - - - - - - - - - - - - - - 917 - 83 - 100 PDL 155 - - 07 20 26 07 26 07 - - - - - - - 881 - 26 - 100 PACA 124 - - - - - - 34 - - - - - - - 08 958 - - - 100

Total 1 177 02 04 01 04 08 01 17 01 04 01 01 01 01 02 03 899 10 39 03 100

Classes drsquoacircges

19B ()

20A ()

20A (B1416)

20A214 Ins ()

20A484K (B1) ()

20A484K (B1177)

20A484K (B1525)

20A484K (B1619)

20AEU2 ()

20B ()

20B484K (B11318)

20D ()

20D452R ()

20D484K ()

20E (EU1) ()

20I501Y V1 ()

20I484K ()

20H501Y V2 ()

20J501Y V3 ()

Total ()

0-9 36 - - - - - - - - - - - - - - - 886 - 86 29 100

10-19 95 - - - 11 11 - 33 - - - - - 11 - - 912 22 - - 100

20-29 196 05 05 05 05 - - - - - - 05 - - 05 - 935 11 22 - 100

30-39 172 - 06 - - 12 - 30 - - - - - - 06 - 885 12 36 12 100

40-49 185 - 06 - - 11 06 17 - - - - 06 - - - 885 29 40 - 100

50-59 201 - 05 - 05 - - 37 - - 05 - - - - 10 880 - 58 - 100

60-69 93 - - - 22 22 - 11 - 22 - - - - - - 876 - 45 - 100

70-79 83 - - - - 13 - - - - - - - - - 13 921 - 53 - 100

80-89 76 14 - - - 14 - - 14 14 - - - - - - 884 - 58 - 100

ge 90 38 - - - - - - - - 29 - - - - - - 971 - - - 100

NR 2 - - - - - - - - - - - - - - - 1000 - - - 100

Total 1 177 02 04 01 04 08 01 17 01 04 01 01 01 01 02 03 899 10 39 03 100

IMPACT DES MESURES DE RESTRICTIONS SANITAIRES EN FRANCE MEacuteTROPOLITAINE Le 20 mars 2021 des mesures de restrictions sanitaires renforceacutees ont eacuteteacute mises en place dans 16 deacutepartements (212 millions drsquohabitants) Ces mesures ont eacuteteacute eacutelargies agrave trois autres deacutepartements le 27 mars (24 millions drsquohabitants) et ont eacuteteacute eacutetendues le 03 avril 2021 agrave lrsquoensemble de la France meacutetropolitaine (413 millions drsquohabitants) Dans ce contexte cette analyse vient fournir des eacuteleacutements descriptifs sur lrsquoeacutevolution de lrsquoincidence des cas confirmeacutes dans ces trois groupes de deacutepartements Les travaux preacutealablement reacutealiseacutes dans le cadre de lrsquoeacutetude Impact1 suite agrave la mise en place des mesures de freinage en octobre 2020 ainsi que les donneacutees disponibles dans la litteacuterature montrent que lrsquoeffet drsquoune mesure sur lrsquoeacutevolution des indicateurs eacutepideacutemiologiques est observable a minima 7 agrave 10 jours apregraves sa mise en place Les deacutepartements ont donc eacuteteacute classeacutes en trois groupes (Figure 14)

- Groupe 1 16 deacutepartements avec mesures de restrictions renforceacutees agrave partir du 20 mars 2021 - Groupe 2 3 deacutepartements avec mesures de restrictions renforceacutees agrave partir du 27 mars 2021 - Groupe 3 77 deacutepartements avec mesures de restrictions renforceacutees agrave partir du 03 avril 2021 Figure 14 Reacutepartition geacuteographique des deacutepartements par groupe de mesures de restrictions renforceacutees avril

2021 France meacutetropolitaine

Une correction a eacuteteacute appliqueacutee aux taux drsquoincidence et de deacutepistage des semaines incluant un jour feacuterieacute (notamment S14) afin de prendre en compte lrsquoeffet sur lrsquoactiviteacute de deacutepistage La meacutethodologie a eacuteteacute preacutesenteacutee dans le Point eacutepideacutemiologique du 15 avril 2021 et une note meacutethodologique la deacutecrivant plus preacuteciseacutement est disponible sur le site internet de Santeacute publique France

Dans les groupes 1 et 2 la baisse du taux drsquoincidence amorceacutee respectivement le 1er avril 2021 (milieu de S13) et le 07 avril 2021 (milieu de S14) se poursuivait (Figure 15) En S16 (du 19 au 25 avril 2021) la diminution observeacutee eacutetait leacutegegraverement moins marqueacutee qursquoau cours de la semaine preacuteceacutedente (-13 pour le groupe 1 et -14 pour le groupe 2 contre -18 et -19 en S15) Les niveaux drsquoincidence se situaient toujours au-dessus de 250 cas pour 100 000 habitants dans ces deux groupes (404100 000 habitants pour le groupe 1 et 348100 000 pour le groupe 2)

1 Spaccaferri Guillaume Larrieu Sophie Pouey Jeacuterocircme et al Early assessment of the impact of mitigation measures to control COVID-19 in 22

French metropolitan areas October to November 2020 Euro Surveill 202025(50)pii=2001974 httpsdoiorg1028071560-7917ES202025502001974]

Dans le groupe 3 une stabilisation du taux drsquoincidence eacutetait observeacutee depuis le 07 avril 2021 (milieu de S14) suivie drsquoune diminution agrave partir du 14 avril (milieu de S15) (Figure 15) En semaine 16 le taux drsquoincidence eacutetait de 253 cas pour 100 000 habitants et en baisse de 10 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (contre -16 en S15) (Tableau 6)

Depuis S14 une forte diminution de lrsquoactiviteacute de deacutepistage eacutetait observeacutee dans les trois groupes de deacutepartements (Figure 16) En semaine 16 la baisse du taux de deacutepistage eacutetait cependant moins marqueacutee que celle observeacutee la semaine preacuteceacutedente (-13 dans le groupe 1 -16 dans le groupe 2 et -11 dans le groupe 3 contre respectivement -22 -28 et -22 en S15) (Tableau 6) Figure 15 Eacutevolution du taux drsquoincidence sur sept jours glissants des cas confirmeacutes par groupe de deacutepartements du 28 septembre 2020 au 25 avril 2021 France meacutetropolitaine (donneacutees au 28 avril 2021)

Source SI-DEP

Figure 16 Eacutevolution du taux de deacutepistage sur sept jours glissants par groupe de deacutepartements du 28 septembre 2020 au 25 avril 2021 France meacutetropolitaine (donneacutees au 28 avril 2021)

Source SI-DEP

Tableau 6 Variations hebdomadaires du taux drsquoincidence des cas confirmeacutes et du taux de deacutepistage par groupe de deacutepartements semaine 13 agrave 16 France meacutetropolitaine (donneacutees au 28 avril 2021)

Groupe

Taux dincidence pour 100 000 hab

Eacutevolution relative du taux dincidence ()

Taux de deacutepistage pour

100 000 hab

Eacutevolution relative du taux de deacutepistage ()

S13 S14 S15 S16 S14

vs S13

S15 vs

S16 vs

S15 S13 S14 S15 S16

S14 vs

S15 vs

S16 vs

Groupe 1 599 564 464 404 -6 -18 -13 6 856 5 298 4 130 3 601 -23 -22 -13

Groupe 2 544 500 405 348 -8 -19 -14 6 421 4 859 3 508 2 942 -24 -28 -16

Groupe 3 320 332 280 253 4 -16 -10 5 111 4 244 3 307 2 945 -17 -22 -11

Conclusion En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) le taux drsquoincidence des cas confirmeacutes poursuivait sa diminution progressive dans les trois groupes de deacutepartements de France meacutetropolitaine Lrsquoeacutevolution de ces indicateurs est compatible avec lrsquohypothegravese drsquoun effet beacuteneacutefique des mesures de restrictions renforceacutees mises en œuvre depuis le 20 mars 2021 et coupleacutees agrave un renforcement des mesures de distanciation sociale en lien avec les vacances scolaires anticipeacutees Neacuteanmoins le ralentissement de la circulation virale et ses reacutepercussions sur lrsquoactiviteacute hospitaliegravere srsquoopegraverent lentement Agrave une semaine de la leveacutee annonceacutee de certaines restrictions pour le 03 mai 2021 le niveau drsquoincidence des cas confirmeacutes en France meacutetropolitaine est selon les groupes deux agrave trois fois supeacuterieur agrave celui observeacute une semaine avant le deacuteconfinement du 15 deacutecembre 2020 Lrsquoactiviteacute de deacutepistage bien qursquoen diminution est cependant plus intense au cours des derniegraveres semaines qursquoen 2020 et peut contribuer agrave la diffeacuterence des niveaux observeacutes Malgreacute tout la diffeacuterence entre le taux de deacutepistage actuel et celui observeacute fin novembre est moins marqueacutee que celle du taux drsquoincidence confirmant que la circulation virale actuelle est plus intense Concernant les indicateurs hospitaliers la situation est eacutegalement moins favorable qursquoelle ne lrsquoeacutetait en amont du preacuteceacutedent deacuteconfinement On note selon les groupes une incidence jusqursquoagrave deux fois plus eacuteleveacutee pour les nouvelles hospitalisations et jusqursquoagrave trois fois plus pour les admissions en soins critiques Par ailleurs la deacutecroissance actuelle des indicateurs srsquoopegravere plus lentement que lors du deuxiegraveme confinement En conclusion la situation eacutepideacutemiologique en France meacutetropolitaine agrave une semaine de la leveacutee partielle des mesures de restrictions renforceacutees est moins favorable qursquoelle ne lrsquoeacutetait une semaine avant la leveacutee du deuxiegraveme confinement

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS Le suivi des personnes-contacts des cas de SARS-CoV-2 vise agrave 1- limiter au maximum la diffusion du virus agrave partir des nouveaux cas 2 - deacutetecter et briser les chaicircnes de transmission le plus rapidement possible par lrsquoidentification des personnes-contacts agrave risque et leur isolement 3- repeacuterer drsquoeacuteventuels eacutepisodes de cas groupeacutes en vue de leur investigation et leur controcircle Cette strateacutegie repose sur une organisation en trois niveaux mobilisant les professionnels de santeacute de meacutedecine de ville et des eacutetablissements de santeacute lrsquoAssurance maladie et les agences reacutegionales de santeacute (ARS) en lien avec les cellules reacutegionales de Santeacute publique France Les donneacutees recueillies par la Cnam (Caisse nationale de lrsquoassurance maladie) dans le cadre des actions de suivi des contacts (base de donneacutees individuelles ContactCovid) complegravetent les donneacutees de surveillance pour eacutevaluer la situation eacutepideacutemiologique Les personnes-contacts identifieacutees dans ContactCovid peuvent ecirctre appeleacutees ou uniquement contacteacutees via un SMS renvoyant vers une page Internet deacutedieacutee contenant les informations utiles sur les mesures sanitaires agrave respecter et sur leurs droits La deacutefinition des contacts agrave risque est disponible sur le site de Santeacute publique France

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes En semaine 16 le nombre total de nouveaux cas et de nouvelles personnes-contacts eacutetait en baisse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente respectivement 175 794 nouveaux cas (soit -109) et 313 028 personnes-contacts (soit -115) (Figure 17) La baisse eacutetait cependant plus faible qursquoen S15 pour les personnes-contacts (-165 en S15)

Lrsquoacircge moyen des cas et des personnes-contacts agrave risque eacutetait inchangeacute en S16 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (39 ans pour les cas et 31 ans pour les personnes-contacts agrave risque) Parmi les personnes-contacts agrave risque la part des 65 ans et plus eacutetait eacutegalement inchangeacutee (62 vs 61 en S15) Figure 17 Nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes par semaine du 13 mai 2020 au 25 avril 2021 France

Le nombre de cas enregistreacutes diffegravere des donneacutees de surveillance issues de SI-DEP du fait drsquoun deacutelai de remonteacutee drsquoinformation dans ContactCovid En semaine 43-2020 les nombres de cas confirmeacutes et de personnes-contacts agrave risque enregistreacutes sont sous-estimeacutes en raison drsquoun problegraveme technique En raison des modaliteacutes du contact-tracing dans le deacutepartement de Mayotte les donneacutees de ContactCovid entre S02-2021 et S12-2021 nrsquoincluent pas ce deacutepartement

Source ContactCovid ndash Cnam

Un total de 508 cas ayant eu un lien avec le milieu scolaire ont eacuteteacute rapporteacutes en S16 soit agrave nouveau une diminution importante (-39 par rapport agrave S15 et -97 par rapport agrave S13) en lien avec la mise en place de lrsquoenseignement agrave distance le 06 avril puis les vacances scolaires (Figure 18) Parmi ces cas 48 eacutetaient des adolescents acircgeacutes de 10 agrave 18 ans et 34 eacutetaient acircgeacutes de plus de 18 ans Figure 18 Nombre de cas rapporteacutes ayant freacutequenteacute un milieu scolaire (avant ou apregraves le deacutebut des signes) par semaine du 13 mai 2020 au 25 avril 2021 France

La flegraveche rouge indique la date de mise en place de lrsquoenseignement agrave distance (06 avril 2021) Source ContactCovid - Cnam

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes En S16 la proportion de cas (93) et de personnes-contacts agrave risque (92) ayant pu ecirctre investigueacutes par lrsquoAssurance maladie eacutetait stable agrave un niveau eacuteleveacute 215 des personnes-contacts agrave risque ont eacuteteacute investigueacutees via le site Internet deacutedieacute (vs 255 en S15) sans ecirctre appeleacutees directement

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques En S16 parmi les cas symptomatiques avec des dates de deacutebut des signes cliniques et de preacutelegravevement pour diagnostic par RT-PCR ou tests antigeacuteniques renseigneacutes (soit 584 des cas) le deacutelai moyen de diagnostic eacutetait inchangeacute agrave 20 jours Ce deacutelai ne comprend pas le temps de la remise du reacutesultat au patient Le deacutelai entre lrsquoenregistrement drsquoune personne-contact agrave risque dans ContactCovid et le dernier contact de cette personne avec son cas index eacutetait inchangeacute agrave 31 jours

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas En S16 le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas se stabilisait agrave 17 apregraves les diminutions observeacutees en S13 S14 et S15 mais il restait toujours plus eacuteleveacute que lors du deuxiegraveme confinement de novembre (14 en S46-2020) Le nombre moyen de personnes-contact extra-domiciliaires par cas (09) devenait comparable agrave celui des personnes-contacts partageant le domicile du cas (08) apregraves plusieurs semaines durant lesquelles les personnes-contact extra-domiciliaires eacutetaient plus nombreuses que celles partageant le domicile du cas (Figure 19) Le pourcentage de cas ne rapportant aucune personne-contact agrave risque eacutetait stable agrave 447 Cette situation repreacutesentait 666 des cas acircgeacutes de 75 ans et plus contre 387 des cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans Le pourcentage de cas rapportant plus de cinq personnes-contacts agrave risque eacutetait stable agrave 69 Cette situation repreacutesentait seulement 24 des cas acircgeacutes de 75 ans et plus contre 88 des cas acircgeacutes de 15 agrave 44 ans Le nombre de personnes-contacts par cas eacutetait en moyenne plus faible parmi les cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque en comparaison de ceux qui nrsquoeacutetaient pas dans une chaicircne de transmission connue (11 vs 20) Figure 19 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas (intra-foyer hors foyer et les deux confondus) par semaine du 13 mai 2020 au 25 avril 2021 France

Indicateur non estimable pour la semaine 43-2020 Les donneacutees sur le caractegravere intra-foyer des contacts agrave risque ne sont estimables qursquoagrave partir de S51-2020 S16-2021 valeur non consolideacutee

Source ContactCovid - Cnam

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts En S16 les cas acircgeacutes de moins de 65 ans avaient peu de contacts avec des personnes acircgeacutees de 65 ans et plus (soit 81 de leurs personnes-contacts) Par ailleurs 286 des personnes-contacts des cas de plus de 65 ans avaient elles-mecircmes plus de 65 ans Le nombre de personnes-contacts par cas eacutetait similaire agrave celui de S15 quel que soit lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts (Figure 20) Figure 20 Nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts pour les semaines 42-2020 (semaine de deacutebut drsquoun couvre-feu dans certains territoires) 46-2020 (deuxiegraveme confinement) 15 et 16-2021 France

Note de lecture Cette figure repreacutesente pour une semaine donneacutee le nombre moyen de personnes-contacts agrave risque par cas en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts Cette figure est un proxy du rapprochement et de la freacutequentation entre classes drsquoacircge preacutesenteacutee pour des semaines cleacutes dans lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie situation au deacutebut des couvre-feux ou drsquoun confinement par exemple La couleur des cases srsquoeacutechelonne de violet sombre (faible interaction) agrave jaune (forte interaction) Les deacutelais de consolidation des donneacutees peuvent induire des ajustements sur les valeurs rapporteacutees durant la semaine n-1 Valeurs calculeacutees quand lrsquoinformation est disponible pour au moins 30 cas

Acircge des cas

Acircge

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque La proportion des nouveaux cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque drsquoun autre cas eacutetait en hausse depuis S13 (284 en S16 vs 245 en S13 Figure 21) La proportion des personnes-contacts identifieacutees en S15 devenues des cas a augmenteacute (129 valeur non consolideacutee) contre 119 en S14 (valeur consolideacutee) Ce nombre eacutetait plus eacuteleveacute pour les personnes-contacts de cas symptomatiques (149) que de cas asymptomatiques (88) et lorsque leur cas index appartenait au mecircme foyer qursquoelles (193) que lorsque cela nrsquoeacutetait pas le cas (81) Figure 21 Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque par semaine du 13 mai 2020 au 25 avril 2021 France

Les informations des cas ou des personnes-contacts pouvant eacutevoluer dune semaine sur lautre en raison des investigations eacutepideacutemiologiques les indicateurs dune semaine donneacutee peuvent leacutegegraverement eacutevoluer dun Point eacutepideacutemiologique agrave lautre Indicateur non estimable en semaine 43-2020

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts En S16 le pourcentage de cas ayant voyageacute en France hors de leur reacutegion de reacutesidence habituelle eacutetait inchangeacute agrave 20

Le pourcentage de cas ayant voyageacute hors de France eacutetait inchangeacute agrave 08

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX Du 1er mars 2020 au 25 avril 2021 30 892 signalements drsquoun ou plusieurs cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes ou non ont eacuteteacute deacuteclareacutes dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) agrave Santeacute publique France via le portail national des signalements du ministegravere de la Santeacute (Tableau 7)

Il srsquoagissait de 18 784 (61) signalements dans les eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (Ehpad et autres EHPA) et 12 108 (39) dans les autres ESMS (heacutebergement pour personnes handicapeacutees (HPH) Aide agrave lrsquoenfance et autres ESMS) (Tableau 7)

Parmi les 30 892 signalements en ESMS 207 490 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes chez les reacutesidents (Tableau 7) Parmi les 26 233 deacutecegraves survenus dans les eacutetablissements 25 962 (99) concernaient des reacutesidents en eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees Tableau 7 Nombre de signalements de cas de COVID-19 et de deacutecegraves par type drsquoESMS chez les reacutesidents et le personnel rapporteacutes entre le 1er mars 2020 et le 25 avril 2021 France

EHPA1 HPH2

Aide enfance3

Autres4 Total

Signalements5 18 784 8 815 1 133 2 160 30 892

Chez les reacutesidents

Cas confirmeacutes6 175 729 25 635 1 562 4 564 207 490

Deacutecegraves7 hocircpitaux 10 406 481 0 131 11 018

Deacutecegraves7 eacutetablissements 25 962 215 0 56 26 233

Chez le personnel Cas confirmeacutes6 87 571 19 171 1 616 2 023 110 381

1 Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees 2 Eacutetablissement drsquoheacutebergement pour personnes handicapeacutees 3 Eacutetablissement de lrsquoAide sociale agrave lrsquoenfance 4 Autres eacutetablissements

5 Signalement drsquoau moins un cas de COVID-19 confirmeacute ou possible 6 Cas de COVID-19 biologiquement confirmeacutes 7 Cas possibles et confirmeacutes deacuteceacutedeacutes

De la semaine 05 agrave la semaine 09-2021 une diminution du nombre de signalements a eacuteteacute observeacutee Depuis une stabilisation est constateacutee En semaines 15 et 16-2021 432 et 353 signalements ont eacuteteacute respectivement enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 16 ne sont pas consolideacutees (Figure 22)

Figure 22 Nombre hebdomadaire de signalements drsquoeacutepisode avec au moins un cas (possible ou confirmeacute)

de COVID-19 en ESMS par date de deacutebut des signes du premier cas entre le 06 juillet 2020 et le 25 avril 2021

France

S11 le deacuteploiement de la nouvelle application permettant la collecte des donneacutees a entraicircneacute une sous-deacuteclaration cette semaine S12 et S13 rattrapage de la sous-deacuteclaration des eacutepisodes en S11 S16 donneacutees non consolideacutees

Le nombre de cas confirmeacutes a augmenteacute en semaines 01 et 02-2021 puis srsquoest stabiliseacute autour de 9 300 cas jusqursquoagrave deacutebut feacutevrier Le nombre de cas confirmeacutes a diminueacute agrave partir de la semaine 06 et une stabilisation est constateacutee depuis la semaine 10 En semaines 15 et 16 2 377 et 2 345 cas ont eacuteteacute respectivement enregistreacutes Agrave noter que les donneacutees de la semaine 16 ne sont pas consolideacutees (Figure 23) Figure 23 Nombre de cas confirmeacutes de COVID-19 chez les reacutesidents et le personnel en ESMS par semaine entre le 20 juillet 2020 et le 25 avril 2021 France

S11 le deacuteploiement de la nouvelle application permettant la collecte des donneacutees a entraicircneacute une sous-deacuteclaration cette semaine S12 et S13 rattrapage de la sous-deacuteclaration des cas en S11 S16 donneacutees non consolideacutees

Le nombre de deacutecegraves en eacutetablissement a diminueacute agrave partir de la semaine 05 et srsquoest stabiliseacute depuis la semaine 13 (43 deacutecegraves ont eacuteteacute enregistreacutes en S16 donneacutees non consolideacutees) Le nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur sept jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents par date de signalement du deacutecegraves dans lrsquoensemble des ESMS semble se stabiliser pour les deacutecegraves en eacutetablissement et ceux agrave lrsquohocircpital depuis plusieurs semaines (Figure 24)

Figure 24 Nombre moyen quotidien (moyenne glissante sur sept jours) de nouveaux deacutecegraves de COVID-19 chez les reacutesidents en ESMS par date de signalement du deacutecegraves rapporteacutes entre le 15 juillet 2020 et le 25 avril 2021 France

Derniegraveres donneacutees de deacutecegraves le 22 avril 2021 pour lrsquoestimation de la moyenne glissante sur 7 jours

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg) Depuis le deacutebut de la surveillance le 24 feacutevrier 2020 466 333 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute enregistreacutes (donneacutees au 27 avril 2021 inteacutegrant lrsquoensemble des services drsquourgence ayant transmis au moins une fois sur toute la peacuteriode) (Figure 25) En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) 10 659 passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes par les eacutetablissements ayant transmis sans interruption sur toute la peacuteriode (vs 11 418 passages en S15 soit -7) Il srsquoagit de la deuxiegraveme semaine de baisse apregraves une eacutetape de stabilisation en S14 (Figure 25) La part drsquoactiviteacute (4 en S16 vs 45 en S15) eacutetait en baisse tandis que le pourcentage drsquohospitalisations apregraves passages pour suspicion de COVID-19 eacutetait en leacutegegravere hausse (58 en S16 vs 56 en S15) Le nombre de passages pour suspicion de COVID-19 eacutetait en baisse chez les enfants (-12 soit -19 passages) et chez les adultes (-7 soit -740 passages) La reacutepartition du nombre de passages par classe drsquoacircge restait neacuteanmoins comparable agrave la semaine preacuteceacutedente 0-4 ans (1) 5-14 ans (1) 15-44 ans (24) 45-64 ans (37) 65-74 ans (18) 75 ans et plus (19) (Figure 25) Au niveau reacutegional les passages pour suspicion de COVID-19 eacutetaient stables ou en baisse dans toutes les reacutegions excepteacute en Guyane (+24 soit +12 passages) et agrave La Reacuteunion (+24 soit +17 passages) En semaine 16 comme au cours des semaines preacuteceacutedentes sur lrsquoensemble des passages pour suspicion de COVID-19 au niveau national la majoriteacute eacutetait enregistreacutee en Icircle-de-France (27) Auvergne-Rhocircne-Alpes (13) et Provence-Alpes-Cocircte dAzur (11) Figure 25 Nombre hebdomadaire de passages aux urgences et part drsquoactiviteacute pour suspicion de COVID-19 par classe drsquoacircge depuis le 24 feacutevrier 2020 France

Figure 26 Taux hebdomadaire de passages pour suspicion de COVID-19 pour 10 000 passages aux urgences par deacutepartement semaine 16-2021 France

Source OSCOURreg Source OSCOURreg

Pour en savoir + sur les donneacutees OSCOURreg consulter Geacuteodes

NOMBRE DE REPRODUCTION EFFECTIF laquo R-effectif raquo

Le nombre de reproduction R (nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas) est estimeacute selon la meacutethode de Cori1 avec une fenecirctre temporelle mobile de sept jours Il permet de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission Les estimations reacutegionales sont produites agrave partir des donneacutees virologiques du dispositif SI-DEP des passages aux urgences (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC Les estimations des nombres de reproduction sont obtenues agrave partir des donneacutees virologiques (SI-DEP) non corrigeacutees Le R-effectif estimeacute agrave partir de ces donneacutees est un indicateur de la dynamique de transmission du virus environ une agrave deux semaines auparavant (inteacutegrant le deacutelai entre la contamination et le test et le fait que le calcul est effectueacute sur une peacuteriode de sept jours) Lrsquoindicateur SI-DEP peut ecirctre instable notamment lorsque lrsquoincidence est faible car il est influenceacute par les actions locales de deacutepistage Les indicateurs calculeacutes agrave partir des donneacutees de passages aux urgences et des hospitalisations sont plus stables mais montrent des tendances plus tardives Une valeur supeacuterieure agrave 1 est en faveur drsquoune tendance agrave lrsquoaugmentation du nombre de cas Les valeurs de R ne doivent donc pas ecirctre interpreacuteteacutees de faccedilon isoleacutee mais ecirctre mises en perspective avec les autres donneacutees eacutepideacutemiologiques disponibles et lrsquoanalyse fine de la situation locale

Lrsquoestimation du nombre de reproduction effectif en France meacutetropolitaine eacutetait significativement infeacuterieure agrave 1 agrave partir des trois sources de donneacutees pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Ainsi au 24 avril agrave partir des donneacutees virologiques (SI-DEP) elle eacutetait de 089 (IC95 [089-090]) Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) lrsquoestimation du nombre de reproduction au 24 avril eacutetait de 092 (IC95 [090-094]) Au 25 avril celle obtenue agrave partir des donneacutees drsquohospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) eacutetait de 092 (IC95 [091-094]) (Tableau 8 et Figure 27)

Reacutegions meacutetropolitaines Au 24 avril 2021 les estimations des nombres de reproduction agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP eacutetaient significativement infeacuterieures agrave 1 dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines (Tableau 8) Agrave partir des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) les estimations des nombres de reproduction au 24 avril eacutetaient supeacuterieures agrave 1 de faccedilon non significative en Bourgogne-Franche-Comteacute et Pays de la Loire (Tableau 8) Agrave partir des hospitalisations de patients COVID-19 rapporteacutees dans SI-VIC lrsquoestimation du nombre de reproduction au 25 avril eacutetait supeacuterieure agrave 1 mais non significativement dans quatre reacutegions meacutetropolitaines Bretagne Corse Normandie et Nouvelle-Aquitaine (Tableau 8) Les estimations du nombre de reproduction eacutetaient significativement infeacuterieures agrave 1 agrave partir des trois sources de donneacutees dans six reacutegions meacutetropolitaines Auvergne-Rhocircne-Alpes Grand Est Hauts-de-France Icircle-de-France Occitanie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur

Reacutegions drsquooutre-mer Au 24 avril les estimations du nombre de reproduction eacutetaient significativement supeacuterieures agrave 1 en Guyane et agrave La Reacuteunion agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP et de faccedilon non significative agrave partir des deux autres sources de donneacutees (Tableau 8)

Le nombre de reproduction estimeacute exceacutedait 1 mais non significativement en Guadeloupe agrave partir des donneacutees virologiques SI-DEP [1] Cori A Ferguson NM Fraser C Cauchemez S A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics Am J Epidemiol 20131781505-12

Figure 27 Trajectoire du nombre de reproduction effectif (R-effectif) agrave partir des tests positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) des passages aux urgences avec suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) du 15 mars 2020 au 25 avril 2021 France meacutetropolitaine

Sources SI-DEP OSCOURreg et SI-VIC

Tableau 8 Nombre de reproduction effectif du 24 avril 2021 agrave partir des tests positifs au SARS-CoV-2 (SI-DEP) et des passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 (OSCOURreg) et nombre de reproduction effectif du 25 avril 2021 agrave partir des hospitalisations pour COVID-19 (SI-VIC) par reacutegion France

Territoire Reacutegion

R-effectif (Intervalle de confiance agrave 95)

SI-DEP

OSCOURreg

SI-VIC

France

meacutetropolitaine

Auvergne-Rhocircne-Alpes 090 (089-091) 089 (084-093) 094 (089-099)

Bourgogne-Franche-Comteacute 094 (092-096) 100 (092-109) 096 (088-105)

Bretagne 095 (093-097) 091 (080-102) 108 (097-120)

Centre-Val de Loire 092 (090-094) 097 (088-107) 091 (083-100)

Corse 089 (081-097) 084 (056-117) 106 (072-146)

Grand Est 089 (088-091) 089 (083-096) 091 (085-097)

Hauts-de-France 090 (089-091) 091 (085-097) 091 (085-096)

Icircle-de-France 086 (085-087) 091 (088-094) 088 (085-092)

Normandie 093 (091-095) 096 (087-106) 102 (094-111)

Nouvelle-Aquitaine 091 (090-093) 099 (091-107) 106 (098-115)

Occitanie 091 (089-092) 092 (085-099) 089 (083-096)

Pays de la Loire 093 (091-094) 104 (095-113) 092 (083-101)

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 088 (087-089) 087 (082-092) 089 (084-095)

France meacutetropolitaine 089 (089-090) 092 (090-094) 092 (091-094)

France ultramarine

Guadeloupe 101 (094-108) 092 (075-110) 097 (075-122)

Guyane 114 (106-123) 123 (095-155) 113 (081-151)

La Reacuteunion 106 (100-113) 103 (082-127) 111 (089-136)

Martinique 083 (077-090) NA 083 (064-105)

Mayotte 095 (080-111) NC NC

NC le nombre de reproduction nrsquoest pas estimable de faccedilon fiable en raison drsquoun nombre de cas insuffisant sur les sept derniers jours NA donneacutees non disponibles pour cette reacutegion

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER Depuis mars 2020 lrsquooutil SI-VIC a eacuteteacute deacuteployeacute dans les hocircpitaux afin de suivre lrsquohospitalisation des patients infecteacutes par le SARS-CoV-2 Un deacutelai entre la date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital en services de soins critiques ou le deacutecegraves drsquoun patient COVID-19 et la date de deacuteclaration ou de mise agrave jour du statut du patient dans le systegraveme SI-VIC est freacutequent Les donneacutees par dates drsquoadmission et de deacutecegraves neacutecessitant en moyenne une semaine de consolidation ce deacutelai peut entraicircner un retard dans lrsquoobservation des tendances Crsquoest pourquoi afin de suivre au plus pregraves lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie les donneacutees preacutesenteacutees ci-dessous le sont principalement par date de deacuteclaration Les reacutesultats par dates drsquoadmission et de deacutecegraves sont mentionneacutes afin de confirmer ou preacuteciser les tendances observeacutees

Hospitalisations admissions en services de soins critiques deacutecegraves

Patients actuellement hospitaliseacutes et nombre total de deacutecegraves

Le 27 avril 2021 30 341 patients COVID-19 eacutetaient hospitaliseacutes en France (vs 31 147 le 20 avril soit -3)

(Figure 28) dont - 5 959 en services de soins critiques (vs 6 000 le 20 avril soit -1) (Figure 29) Parmi ceux-ci 4 529

eacutetaient en services de reacuteanimation et 1 430 dans drsquoautres services de soins critiques (soins intensifs ou soins continus)

- 16 385 en hospitalisation conventionnelle (soit - 5) - 7 447 en soins de suite et reacuteadaptation et 550 en autres uniteacutes de soins

Figure 28 Nombre de patients COVID-19 en cours drsquohospitalisation par date de deacuteclaration depuis le 23 mars 2020 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Figure 29 Nombre de patients COVID-19 en services de soins critiques par date de deacuteclaration depuis le 23 mars 2020 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Source SI-VIC

Parmi les 442 630 patients ayant eacuteteacute hospitaliseacutes depuis le 1er mars 2020 (Tableau 9)

- lrsquoacircge meacutedian des patients eacutetait de 73 ans et 52 eacutetaient des hommes

- 77 399 patients sont deacuteceacutedeacutes 74 eacutetaient acircgeacutes de 75 ans et plus et 58 eacutetaient des hommes

Tableau 9 Nombre de patients COVID-19 hospitaliseacutes (dont en services de soins critiques) le 27 avril 2021 et nombre de deacutecegraves lors drsquoune hospitalisation depuis le 1er mars 2020 par classe drsquoacircge et par reacutegion France

Le 27 avril 2021 Depuis le 1er mars 2020

Hospitalisations Dont Soins Critiques Deacutecegraves

Total 30 341 5 959 77 399

Classes dacircge

Total 30 065 5 915 76 986

0-14 ans 75 lt1 14 lt1 6 lt1

15-44 ans 1 863 6 451 8 555 lt1

45-64 ans 7 316 24 2 384 40 6 173 8

65-74 ans 7 488 25 2 221 38 13 075 17

75 et + 13 323 44 845 14 57 177 74

Reacutegions

Total 30 281 5 943 77 370

Meacutetropole

Auvergne-Rhocircne-Alpes 3 622 12 662 11 10 876 14

Bourgogne-Franche-Comteacute 1 364 5 218 4 4 502 6

Bretagne 838 3 118 2 1 487 2

Centre-Val de Loire 1 108 4 213 4 2 470 3

Corse 87 lt1 14 lt1 190 lt1

Grand Est 2 568 8 486 8 9 596 12

Hauts-de-France 3 472 11 689 12 8 289 11

Icircle-de-France 7 882 26 1 789 30 18 751 24

Normandie 1 481 5 236 4 3 011 4

Nouvelle-Aquitaine 1 396 5 287 5 3 483 5

Occitanie 1 859 6 396 7 4 118 5

Pays de la Loire 978 3 159 3 2 493 3

Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 3 077 10 543 9 7 423 10

Outre-mer

La Reacuteunion 156 lt1 42 lt1 156 lt1

Martinique 123 lt1 33 lt1 75 lt1

Mayotte 21 lt1 6 lt1 125 lt1

Guadeloupe 176 lt1 33 lt1 230 lt1

Guyane 73 lt1 19 lt1 95 lt1

Lrsquoinformation sur lrsquoacircge ou sur la reacutegion nrsquoest pas disponible pour tous les cas Lrsquoinformation par reacutegion nrsquoest pas renseigneacutee pour les personnes transfeacutereacutees agrave lrsquoeacutetranger

Source SI-VIC

Nouvelles hospitalisations et nouveaux deacutecegraves La diminution du nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations observeacutee en S15 se poursuit en S16 12 397 en S16 vs 13 194 en S15 soit -6 (Figure 30) En S16 92 de ces patients eacutetaient hospitaliseacutes pour traitement de la COVID-19 Figure 30 Nombre hebdomadaire de patients COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes selon la date de deacuteclaration depuis le 23 mars 2020 France (donneacutees au 25 avril 2021)

Source SI-VIC

Apregraves consolidation les donneacutees par date drsquoadmission agrave lrsquohocircpital montrent que le nombre de nouvelles hospitalisations a leacutegegraverement diminueacute en S15 (-5 par rapport agrave S14) Les donneacutees de S16 (-9 par rapport agrave S15) ne sont pas encore consolideacutees

Le taux drsquohospitalisations par date drsquoadmission a augmenteacute dans toutes les classes drsquoacircge entre les semaines 10 et 13 Apregraves une stabilisation chez les 15-64 ans et un deacutebut de diminution chez les 65 ans et plus en S14 le taux a diminueacute pour ces classes dacircge en S15 Les donneacutees de S16 ne sont pas encore consolideacutees (Figure 31) Figure 31 Taux de patients COVID-19 nouvellement hospitaliseacutes par semaine et par classe drsquoacircge selon la date drsquoadmission depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 27 avril 2021)

S16 donneacutees non consolideacutees

Source SI-VIC

En S16 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations par date de deacuteclaration eacutetait de 185100 000 habitants vs 197 en S15 En France meacutetropolitaine en S16 le taux hebdomadaire drsquohospitalisations eacutetait en augmentation en Corse (+15) Normandie (+14) et Nouvelle-Aquitaine (+5) Il eacutetait stable ou en diminution dans les autres reacutegions meacutetropolitaines Les taux drsquohospitalisations les plus eacuteleveacutes de meacutetropole eacutetaient enregistreacutes en Icircle-de-France (275100 000 habitants) Provence-Alpes-Cocircte dAzur (233) Hauts-de-France (220) Les autres reacutegions meacutetropolitaines enregistraient des taux infeacuterieurs agrave 20 pour 100 000 habitants (Figure 32) En Outre-mer le plus fort taux drsquohospitalisations eacutetait observeacute en Guadeloupe (281100 000 habitants) en augmentation par rapport agrave S15 (+93 soit +51 hospitalisations) Le taux hebdomadaire drsquohospitalisations poursuivait sa diminution en Martinique (-11 soit -8 hospitalisations) Il eacutetait en augmentation en Guyane (+33 soit +11 hospitalisations) et agrave La Reacuteunion (+4 hospitalisations) et en baisse agrave Mayotte (-3 hospitalisations) Figure 32 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquohospitalisations de patients COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion du 05 au 25 avril 2021 (S14 agrave S16 date de deacuteclaration) France

du 05 au 11 avril (S14) du 12 au 18 avril (S15) du 19 au 25 avril (S16)

Source SI-VIC

Apregraves avoir diminueacute en S15 le nombre de deacuteclarations de nouvelles admissions en services de soins critiques de patients COVID-19 srsquoest stabiliseacute en S16 2 971 vs 2 980 en S15 soit -03 (Figure 33) Parmi ceux-ci - 97 des patients eacutetaient hospitaliseacutes pour traitement de la COVID-19 - le nombre de nouvelles deacuteclarations drsquoadmission en services de reacuteanimation eacutetait de 1 996 (vs 2 006 en S15 soit -05) Figure 33 Nombre hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en services de soins critiques selon la date de deacuteclaration depuis le 23 mars 2020 France (donneacutees au 25 avril 2021)

Source SI-VIC

Apregraves consolidation les donneacutees par date drsquoadmission en services de soins critiques montrent que le nombre de nouvelles admissions a leacutegegraverement diminueacute en S15 (-6 par rapport agrave S14) Les donneacutees de S16 (-7 par rapport agrave S15) ne sont pas encore consolideacutees Une augmentation des taux drsquoadmission en soins critiques eacutetait observeacutee pour toutes les classes dacircge entre S07 et S13 Ce taux a diminueacute en S14 et S15 chez les plus de 65 ans Il a augmenteacute en S14 puis diminueacute agrave nouveau en S15 chez les 15-64 ans Les donneacutees de S16 ne sont pas consolideacutees (Figure 34) Figure 34 Taux drsquoadmission hebdomadaire de patients COVID-19 en services de soins critiques par classe drsquoacircge selon la date drsquoadmission depuis le 02 mars 2020 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Source SI-VIC

Le taux hebdomadaire de nouvelles admissions de patients COVID-19 en services de soins critiques par date de deacuteclaration eacutetait de 44100 000 habitants en S16 inchangeacute par rapport agrave S15

En France meacutetropolitaine le taux drsquoadmissions en services de soins critiques en S16 eacutetait en augmentation en Bourgogne-Franche-Comteacute (+38) Corse (+33) Pays de la Loire (+23) Nouvelle-Aquitaine (+22) Normandie (+14) Bretagne (+12) et Hauts-de-France (+6) Il eacutetait stable ou en diminution dans les autres reacutegions de France meacutetropolitaine Dans les reacutegions Nouvelle Aquitaine et Bretagne une part des admissions en services de soins critiques provenait drsquoeacutevacuations sanitaires en provenance drsquoIcircle-de-France de Bourgogne-Franche-Comteacute et Hauts-de-France

En S16 les plus forts taux hebdomadaires drsquoadmission en services de soins critiques en meacutetropole eacutetaient rapporteacutes en Icircle-de-France (70100 000 habitants) Hauts-de-France (57) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (50) Centre-Val de Loire (47) Auvergne-Rhocircne-Alpes (44) Bourgogne-Franche-Comteacute (42) et Grand Est (41) Les autres reacutegions meacutetropolitaines enregistraient des taux infeacuterieurs agrave 37 pour 100 000 habitants (Figure 35)

En Outre-mer le plus fort taux hebdomadaire drsquoadmission en services de soins critiques en S16 eacutetait encore observeacute en Martinique (50100 000 habitants +1 hospitalisation par rapport agrave S15) Il eacutetait de 48100 000 en Guadeloupe (+2 hospitalisations) 45100 000 en Guyane (+6 hospitalisations) 31100 000 agrave La Reacuteunion (+3 hospitalisations) et 04100 000 agrave Mayotte (-1 hospitalisation) Figure 35 Eacutevolution du taux hebdomadaire drsquoadmission en services de soins critiques de patients COVID-19 pour 100 000 habitants par reacutegion du 05 au 25 avril 2021 (S14 agrave S16 par date de deacuteclaration) France

Apregraves une diminution en S15 le nombre de deacuteclarations de deacutecegraves de patients COVID-19 survenus au cours drsquoune hospitalisation eacutetait en augmentation en S16 2 094 deacutecegraves contre 1 944 en S15 (soit +8) (Figure 36) En S16 89 de ces patients eacutetaient hospitaliseacutes pour traitement de la COVID-19

Apregraves consolidation les donneacutees par date de survenue du deacutecegraves agrave lrsquohocircpital montrent une leacutegegravere diminution du nombre de deacutecegraves en S15 (-5 par rapport agrave S14) Les donneacutees de S16 (-3 par rapport agrave S15) ne sont pas encore consolideacutees

Figure 36 Nombre hebdomadaire de nouveaux deacutecegraves de patients COVID-19 selon la date de deacuteclaration depuis le 23 mars 2020 France (donneacutees au 25 avril 2021)

Source SI-VIC

Le taux hebdomadaire de deacutecegraves de patients COVID-19 eacutetait de 31100 000 habitants en S16 contre 29 en S15

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation La surveillance des cas graves de COVID-19 repose sur un reacuteseau sentinelle de 226 services de reacuteanimation situeacutes en France meacutetropolitaine et dans les DROM Cette surveillance a eacuteteacute reacuteactiveacutee le 05 octobre 2020 en mecircme temps que celle des cas graves de grippe Elle a pour objectif de deacutecrire les caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 ou de grippe admis en reacuteanimation mais nrsquoa pas vocation agrave les deacutenombrer (voir le protocole de la surveillance et la fiche de recueil) Les donneacutees de surveillance des cas graves de grippe sont disponibles dans le Bulletin grippe hebdomadaire

Entre le 05 octobre 2020 et le 27 avril 2021 parmi les 11 708 patients signaleacutes avec un diagnostic confirmeacute de COVID-19 69 eacutetaient des hommes Cette proportion a diminueacute entre les peacuteriodes septembre-deacutecembre 2020 et janvier-avril 2021 (72 vs 68 plt0001) Lrsquoacircge meacutedian des patients continue de diminuer passant de 68 ans (intervalle interquartile (IIQ) [60-75]) agrave 65 ans (IIQ [56-73]) (plt0001) entre les deux peacuteriodes La proportion de patients acircgeacutes de 65 ans et plus a diminueacute de faccedilon significative (63 vs 53 plt0001) Agrave lrsquoinverse la part des cas de 45-64 ans a augmenteacute sur la peacuteriode de janvier agrave avril par rapport agrave la peacuteriode preacuteceacutedente (39 vs 31 plt0001) La proportion de cas peacutediatriques (0-14 ans) reste comparable entre les deux peacuteriodes Au total 145 patients eacutetaient des professionnels de santeacute 89 des patients admis en reacuteanimation en septembre-deacutecembre 2020 preacutesentaient au moins une comorbiditeacute contre 87 en janvier-avril 2021 (plt0003) Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient pour les deux peacuteriodes lrsquoobeacutesiteacute (IMCge30kgm-2) lrsquohypertension arteacuterielle et le diabegravete (Tableau 10) Parmi les 9 079 patients pour lesquels lrsquoinformation eacutetait renseigneacutee 48 ont preacutesenteacute un syndrome de deacutetresse respiratoire aigueuml (SDRA) seacutevegravere au cours de leur seacutejour Cette proportion reste comparable entre les deux peacuteriodes La prise en charge ventilatoire eacutetait renseigneacutee pour 9 268 patients 46 drsquoentre eux ont beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit 42 drsquoune ventilation invasive et 3 drsquoune assistance extracorporelle (ECMOECCO2R) au cours de leur seacutejour en reacuteanimation La proportion de patients ayant beacuteneacuteficieacute drsquoune oxygeacutenotheacuterapie agrave haut deacutebit au cours du seacutejour en reacuteanimation continue drsquoaugmenter en janvier-avril 2021 par rapport agrave septembre-deacutecembre 2020 (49 vs 43) Inversement la proportion de patients ayant neacutecessiteacute une ventilation invasive eacutetait en baisse (45 vs 39) Il est agrave noter toutefois que les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees notamment pour les signalements les plus reacutecents Par conseacutequent ces indicateurs sont susceptibles drsquoecirctre modifieacutes pour la peacuteriode la plus reacutecente 2 188 deacutecegraves ont eacuteteacute rapporteacutes agrave ce jour (dont 10 professionnels de santeacute) 1 195 parmi les patients admis en septembre-deacutecembre 2020 (soit 23) et 1 036 parmi les patients admis en janvier-avril 2021 (soit 15 agrave ce jour donneacutee non consolideacutee par manque de recul) Lrsquoacircge meacutedian des personnes deacuteceacutedeacutees eacutetait de 73 ans (IIQ [67-78]) 80 eacutetaient acircgeacutees de 65 ans et plus et 93 preacutesentaient au moins une comorbiditeacute Les comorbiditeacutes les plus freacutequemment rapporteacutees eacutetaient lrsquohypertension arteacuterielle (55) lrsquoobeacutesiteacute (42 des cas deacuteceacutedeacutes dont lrsquoIMC eacutetait renseigneacute) les pathologies cardiaques (37) et le diabegravete (35) Le recul insuffisant ne permet pas de comparer les caracteacuteristiques des patients deacuteceacutedeacutes entre les deux peacuteriodes drsquoeacutetude Entre le 05 octobre 2020 et le 27 avril 2021 7 049 sorties de reacuteanimation ont eacuteteacute rapporteacutees 3 394 parmi les patients admis en septembre-deacutecembre 2020 et 3 655 parmi ceux admis en janvier-avril 2021

Tableau 10 Acircge et comorbiditeacutes des patients atteints de COVID-19 admis en reacuteanimation et signaleacutes du 05 octobre 2020 au 27 avril 2021 par les services de reacuteanimation participant agrave la surveillance sentinelle France

Septembre-deacutecembre 2020

(n=5 158) Janvier-avril 2021

(n=6 550)

Classe dacircge n n

0-14 ans 11 lt1 22 lt1

15-44 ans 289 6 542 8

45-64 ans 1 606 31 2 510 39

65-74 ans 1 933 38 2 293 35

75 ans et + 1 298 25 1 149 18

Non renseigneacute 21 34

Comorbiditeacutes1 n 2 n 2

Aucune 556 11 817 13

Au moins une comorbiditeacute 4 470 89 5 520 87

Hypertension arteacuterielle 2 300 46 2 909 46

Obeacutesiteacute (IMCgt=30)3 2 487 55 2 851 49

Diabegravete 1 589 32 1 706 27

Pathologie cardiaque 1 262 25 1 307 21

Pathologie pulmonaire 1 070 21 1 262 20

Pathologie reacutenale 448 9 480 8

Immunodeacutepression 381 8 335 5

Cancer 364 7 389 6

Pathologie neuromusculaire 163 3 194 3

Pathologie heacutepatique 120 2 124 2

Autre 793 16 805 13

1 Un patient peut preacutesenter plusieurs comorbiditeacutes parmi celles listeacutees dans le tableau 2 Les pourcentages sont calculeacutes pour les patients pour lesquels linformation sur les comorbiditeacutes est renseigneacutee 3 La preacutevalence de lobeacutesiteacute est calculeacutee agrave partir des donneacutees des patients dont lIMC est renseigneacute (n=4 513 sur la peacuteriode septembre-deacutecembre 2020 et n=5 861 sur la peacuteriode janvier-avril 2021)

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES Fin avril 2020 le signalement de cas de myocardite avec eacutetat de choc cardiogeacutenique chez des enfants avec une infection COVID-19 reacutecente a conduit agrave la mise en place par Santeacute publique France et les socieacuteteacutes savantes de peacutediatrie drsquoune surveillance active de ces tableaux cliniques atypiques Ces syndromes sont recenseacutes sous lrsquoappellation de laquo syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques raquo ou PIMS La meacutethodologie et les premiers reacutesultats de leur surveillance en France ont eacuteteacute publieacutes en juin 2020

Entre le 1er mars 2020 et le 25 avril 2021 501 cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (ou PIMS) ont eacuteteacute signaleacutes

220 cas (44) ont concerneacute des filles Lrsquoacircge meacutedian des cas eacutetait de 7 ans (25 des cas avaient le 3 ans

et 75 le 11 ans)

Plus de trois quarts des cas eacutetaient confirmeacutes par une RT-PCR etou une seacuterologie pour

SARS-CoV-2 positives (n=387 77) Le lien avec le virus eacutetait probable chez 19 patients soit 4 des cas (contage avec un sujet positif ou scanner eacutevocateur) et consideacutereacute comme possible chez 28 patients (6) Pour les 67 patients restants (13) ce lien nrsquoa pas pu ecirctre eacutetabli

Parmi les 434 patients pour lesquels le lien avec la COVID-19 eacutetait possible probable ou confirmeacute les

PIMS eacutetaient associeacutes agrave une myocardite pour 313 cas (72) Parmi les 67 patients sans lien eacutetabli avec la COVID-19 une myocardite nrsquoa eacuteteacute retrouveacutee que chez cinq drsquoentre eux

Un seacutejour en reacuteanimation a eacuteteacute neacutecessaire pour 215 enfants (43) et en uniteacute de soins critiques pour 122

(24) Les autres enfants ont eacuteteacute hospitaliseacutes en service de peacutediatrie Un enfant acircgeacute de 9 ans est deacuteceacutedeacute dans un tableau drsquoinflammation systeacutemique avec myocardite

Les reacutegions ayant signaleacute le plus grand nombre de cas sont lrsquoIcircle-de-France (204 cas 41) lrsquoAuvergne-

Rhocircne-Alpes (69 cas 14) la Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (64 cas 13) et le Grand Est (39 cas 8) Les autres reacutegions ont rapporteacute moins de 30 cas (Tableau 11)

Un deacutelai moyen de survenue des PIMS de quatre agrave cinq semaines apregraves lrsquoinfection par le

SARS-CoV-2 avait eacuteteacute observeacute lors de la premiegravere vague de lrsquoeacutepideacutemie Apregraves un pic observeacute en semaine 18-2020 (semaine drsquohospitalisation) le nombre de cas signaleacutes a diminueacute de maniegravere importante au cours de lrsquoeacuteteacute avant une nouvelle augmentation depuis la semaine 39 (fin septembre) 285 cas ont eacuteteacute rapporteacutes entre le 21 septembre 2020 et le 25 avril 2021 majoritairement en lien avec le SARS-CoV-2 (276 cas 97) (Figure 37)

Au total les donneacutees recueillies confirment lrsquoexistence drsquoun syndrome inflammatoire pluri-systeacutemique rare

chez lrsquoenfant avec freacutequente atteinte cardiaque lieacute agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 eacutegalement observeacute dans drsquoautres pays En France lrsquoincidence cumuleacutee des PIMS en lien avec la COVID-19 (434 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 299 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans (soit 14 511 544 habitants donneacutees Insee 2019)

Tableau 11 Nombre de cas de PIMS par reacutegion en fonction de leur lien avec le SARS-CoV-2 du 02 mars 2020 au 25 avril 2021 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Nombre de cas de PIMS selon le lien avec le SARS-CoV-2

Reacutegions meacutetropolitaines Lien confirmeacute Lien probable Lien possible Lien non eacutetabli Total

Icircle-de-France 160 8 10 26 204

Auvergne-Rhocircne-Alpes 53 3 2 11 69

Provence-Alpes-Cocircte dAzur 53 1 4 6 64

Grand Est 32 2 2 3 39

Nouvelle-Aquitaine 20 1 1 4 26

Pays de la Loire 11 1 1 6 19

Normandie 8 1 2 5 16

Occitanie 12 0 0 1 13

Bourgogne-Franche-Comteacute 7 1 0 2 10

Hauts-de-France 6 0 2 0 8

Centre-Val de Loire 3 0 2 0 5

Bretagne 2 0 1 1 4

Corse 0 0 0 0 0

Reacutegions ultramarines

Mayotte 12 0 0 0 12

Guadeloupe 6 1 1 2 10

Guyane 1 0 0 0 1

La Reacuteunion 1 0 0 0 1

Martinique 0 0 0 0 0

France entiegravere 387 19 28 67 501

Figure 37 Nombre hebdomadaire drsquohospitalisations pour PIMS en fonction du lien avec la COVID-19 et drsquohospitalisations COVID-19 tous acircges du 02 mars 2020 au 25 avril 2021 France (donneacutees au 27 avril 2021)

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS Entre le 1er mars 2020 et le 27 avril 2021 103 632 deacutecegraves de patients COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes agrave Santeacute publique France 77 399 deacutecegraves sont survenus au cours drsquoune hospitalisation et 26 233 deacutecegraves en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees (EHPA) et autres eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) (donneacutees au 25 avril 2021) 93 des cas de COVID-19 deacuteceacutedeacutes eacutetaient acircgeacutes de 65 ans ou plus Au niveau national le nombre hebdomadaire de deacutecegraves eacutetait en diminution en semaine 15 avec 1 981 deacutecegraves contre 2 112 en S14 (-6) En semaine 16 il eacutetait en augmentation avec 2 137 deacutecegraves signaleacutes mais les donneacutees ne sont pas encore consolideacutees - En ESMS le nombre hebdomadaire de deacutecegraves eacutetait stable depuis S13 (46 deacutecegraves signaleacutes en S14 37 en S15 et 43 en S16 donneacutees non consolideacutees en S16) - En hospitalisation apregraves une leacutegegravere diminution observeacutee en S15 (-6) le nombre de deacutecegraves eacutetait agrave nouveau en hausse en S16 (+8) Agrave lrsquoeacutechelle nationale le taux hebdomadaire de deacutecegraves eacutetait de 30 pour 100 000 habitants en S15 En S16 (donneacutees non consolideacutees) il eacutetait de 32 pour 100 000 habitants En semaine 16 (donneacutees non consolideacutees pour les ESMS) les plus forts taux de deacutecegraves par reacutegion rapporteacutes agrave la population eacutetaient observeacutes en Icircle-de-France (45100 000) Hauts-de-France (43) Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (38) Grand Est (36) Bourgogne-Franche-Comteacute (34) Normandie (34) Centre-Val de Loire (32) et Auvergne-Rhocircne-Alpes (32) (Figure 38) Entre les semaines 15 et 16 bien que les donneacutees ne soient pas consolideacutees une augmentation du taux de deacutecegraves eacutetait observeacutee dans toutes les reacutegions agrave lrsquoexception des reacutegions Bourgogne-Franche-Comteacute (+0) et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (-4) Les effectifs reacuteduits des deacutecegraves dans les reacutegions drsquooutre-mer ne permettent pas drsquointerpreacuteter les diffeacuterences par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Figure 38 Taux hebdomadaires de deacutecegraves de patients COVID-19 pour 100 000 habitants (deacutecegraves agrave lrsquohocircpital ou en ESMS) eacutevolution du 05 au 25 avril 2021 (S14 agrave S16) par reacutegion France

du 05 avril au 11 avril (S14) du 12 au 18 avril (S15) du 19 au 25 avril (S16)

Semaine 16 donneacutees non consolideacutees pour les ESMS

Sources SI-VIC et ESMS

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves Parmi les certificats de deacutecegraves reacutedigeacutes par voie eacutelectronique et transmis agrave Santeacute publique France depuis le 1er mars 2020 45 853 certificats contenaient une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves renseigneacutees (Tableau 12) Ils repreacutesentent 21 des deacutecegraves toutes causes confondus certifieacutes par voie eacutelectronique Des comorbiditeacutes eacutetaient renseigneacutees pour 29 766 deacutecegraves soit 65 des certificats de deacutecegraves preacutesentant une mention de COVID-19 Une mention de pathologie cardiaque eacutetait indiqueacutee pour 36 de ces deacutecegraves et drsquohypertension arteacuterielle pour 22 Pour la semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) 1 067 deacutecegraves faisaient lrsquoobjet drsquoune mention de COVID-19 dans le certificat repreacutesentant 251 de lrsquoensemble des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique (Figure 39) Ce nombre de deacutecegraves eacutetait en baisse de 31 par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (soit -34 deacutecegraves) La proportion de certificats de deacutecegraves avec mention drsquoinfection au SARS-CoV-2 confirmeacutee eacutetait de 61 Figure 39 Nombre hebdomadaire de deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 25 avril 2021 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Sources Santeacute publique France Inserm-CeacutepiDc

Tableau 12 Description des deacutecegraves certifieacutes par voie eacutelectronique avec une mention de COVID-19 dans les causes meacutedicales de deacutecegraves du 1er mars 2020 au 26 avril 2021 France (donneacutees au 27 avril 2021)

Sexe n

Hommes 25 165 55

Femmes 20 687 45

Cas selon la classe dacircges Sans comorbiditeacute ou non

renseigneacute 1 Avec comorbiditeacutes1 Totalsup2

0-14 ans 1 20 4 80 5 0

15-44 ans 91 32 195 68 286 1

45-64 ans 924 29 2 253 71 3 177 7

65-74 ans 2 129 31 4 805 69 6 934 15

75 ans ou plus 12 942 37 22 509 63 35 451 77

Tous acircges 16 087 35 29 766 65 45 853 100

Description des comorbiditeacutes n

Pathologie cardiaque 10 611 36

Hypertension arteacuterielle 6 688 22

Diabegravete 4 854 16

Pathologie respiratoire 4 016 13

Pathologie reacutenale 3 943 13

Pathologies neurologiques 2 562 9

Obeacutesiteacute 1 827 6

Immunodeacuteficience 675 2

Ce groupe inclut les pathologies neurovasculaires et neuromusculaires 1 Pourcentages preacutesenteacutes en ligne 2 Pourcentages preacutesenteacutes en colonne

Mortaliteacute toutes causes Lrsquoanalyse de la mortaliteacute toutes causes confondues srsquoappuie sur les donneacutees drsquoeacutetat civil drsquoenviron 3 000 communes franccedilaises enregistrant 77 de la mortaliteacute nationale Ces donneacutees ne permettent pas de disposer des causes meacutedicales de deacutecegraves

Au niveau national le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu depuis S40-2020 (du 28 septembre au 04 octobre 2020) jusqursquoen S15-2021 (du 12 au 18 avril 2021) Les effectifs avaient franchi un premier pic en semaines 45 et 46-2020 (atteignant respectivement +33 et +31 par rapport agrave la mortaliteacute attendue) puis un deuxiegraveme de moindre amplitude en semaine 03-2021 (atteignant +22) Apregraves une diminution observeacutee entre les semaines 04 et 10 la mortaliteacute est agrave nouveau repartie agrave la hausse jusqursquoen semaine 13 et semble se stabiliser en semaines 14 et 15 (Figure 40) Lrsquoexcegraves estimeacute en semaine 14 atteint +13 (Tableau 13) La hausse du nombre de deacutecegraves agrave partir de la semaine 11 eacutetait essentiellement observeacutee chez les personnes de 65 agrave 84 ans Dans cette classe drsquoacircge le nombre de deacutecegraves restait significativement supeacuterieur agrave celui attendu jusqursquoen semaine 15 Le nombre de deacutecegraves des personnes de 85 ans ou plus avaient agrave nouveau franchi la limite haute des marges de fluctuation habituelles en semaines 13 et 14 Celui des personnes de 15-64 ans eacutetait eacutegalement supeacuterieur agrave celui attendu entre les semaines 12 et 14 agrave la limite des marges de fluctuation habituelles Tableau 13 Estimation de la proportion () de lrsquoexcegraves de deacutecegraves par rapport agrave la mortaliteacute attendue tous acircges confondus dans un eacutechantillon de 3 000 communes de la semaine 01 agrave la semaine 14-2021 France

2021 Semaine S01 S02 S03 S04 S05 S06 S07 S08 S09 S10 S11 S12 S13 S14

+18 +17 +22 +19 +18 +16 +16 +11 +9 +8 +11 +10 +15 +13

Estimations non consolideacutees pour les semaines S12 agrave S14

Sources Santeacute publique France Insee

Figure 40 Mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus de la semaine 36-2014 agrave la semaine 15-2021 France

Au niveau reacutegional le nombre de deacutecegraves restait eacuteleveacute et supeacuterieur agrave celui attendu en Icircle-de-France jusqursquoen semaine 15 Dans les Hauts-de-France le nombre de deacutecegraves repartait agrave la hausse en semaine 15 alors qursquoil avait diminueacute en semaine 14 En Auvergne-Rhocircne-Alpes et Bourgogne-Franche-Comteacute le nombre de deacutecegraves semblait se stabiliser voire diminuer en semaine 15 (Figure 41) En Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur il srsquoeacutetait stabiliseacute en semaine 14 et semblait en baisse en semaine 15 mais restait toujours significativement supeacuterieur agrave celui attendu Ces dynamiques restent agrave confirmer avec la consolidation des donneacutees Au total six reacutegions meacutetropolitaines preacutesentaient un nombre de deacutecegraves significativement supeacuterieur agrave celui attendu en semaine 15 Auvergne-Rhocircne-Alpes Hauts-de-France Grand Est Icircle-de-France Normandie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (Figure 41)

Figure 41 Niveau drsquoexcegraves de mortaliteacute toutes causes confondues pour les semaines 13 14 et 15 par reacutegion France (donneacutees au 27 avril 2021)

du 29 mars au 04 avril (S13) du 05 au 11 avril (S14) du 12 au 18 avril (S15)

Pas drsquoexcegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) lt2 Excegraves modeacutereacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 2 et 499 Excegraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 5 et 699 Excegraves tregraves eacuteleveacute de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) compris entre 7 et 1199 Excegraves exceptionnel de deacutecegraves indicateur standardiseacute de deacutecegraves (Z-score) supeacuterieur agrave 12 Sources Santeacute publique France Insee

NB Du fait des deacutelais habituels de transmission des certificats de deacutecegraves par les bureaux drsquoeacutetat civil les donneacutees des derniegraveres semaines sont encore incomplegravetes en particulier pour les semaines 10 agrave 14 et seront consolideacutees dans les prochaines semaines En lrsquoabsence drsquoinformation sur les causes meacutedicales de deacutecegraves il nrsquoest pas possible drsquoestimer la part de la mortaliteacute attribuable agrave lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19

Les donneacutees deacutetailleacutees notamment deacutepartementales sont doreacutenavant publieacutees dans le Point hebdomadaire Surveillance sanitaire de la mortaliteacute des bulletins SurSaUDreg

Pour en savoir + sur les eacutevolutions de la mortaliteacute toutes causes consulter la page des Bulletins SurSaUDreg

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne Parmi les 28 pays ou reacutegions du consortium EuroMOMO qui participent agrave lrsquoanalyse agreacutegeacutee agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne et qui utilisent le mecircme modegravele statistique que celui utiliseacute en France une hausse de la mortaliteacute eacutetait noteacutee depuis le deacutebut du mois drsquooctobre 2020 qui srsquoeacutetait accrue agrave partir de S43 jusqursquoagrave S46 (Figure 42) Le nombre de deacutecegraves eacutetait resteacute en plateau agrave un niveau eacuteleveacute jusqursquoen semaine 52 avant de repartir agrave la hausse jusqursquoen semaine 03 Une diminution rapide srsquoobserve depuis la semaine 04 jusqursquoagrave revenir dans les marges de fluctuation habituelles entre la semaine 08 et la semaine 14 tous acircges confondus (Figure 42) Un excegraves reste observeacute chez les personnes de 45-64 ans et de 65-74 ans alors que les effectifs sont revenus dans les marges de fluctuation habituelles chez les personnes de plus de 75 ans Ces eacutevolutions restent agrave confirmer avec la consolidation des donneacutees de chaque paysreacutegion

Un excegraves de mortaliteacute eacutetait observeacute dans huit paysreacutegions en semaine 11 dans six paysreacutegions en semaines 12 et 13 et dans cinq paysreacutegions en semaine 14 (Estonie Ukraine France Italie et Gregravece) (Figure 43) Figure 42 Eacutevolution hebdomadaire de la mortaliteacute toutes causes tous acircges confondus dans 28 paysreacutegions europeacuteens de la semaine 17-2017 agrave la semaine 14-2021 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 23 avril 2021)

Source EuroMOMO

Figure 43 Carte europeacuteenne des niveaux drsquoexcegraves de mortaliteacute tous acircges en semaine 14-2021 (donneacutees incomplegravetes du fait des deacutelais de transmission - actualisation au 23 avril 2021)

Source EuroMOMO

VACCINATION CONTRE LA COVID-19 La vaccination contre la COVID-19 a deacutebuteacute en France le 27 deacutecembre 2020 Les personnes concerneacutees par cette vaccination sont les suivantes lrsquoensemble des personnes de 55 ans et plus quels que soient leur lieu de vie et leur eacutetat de santeacute (avec ou sans comorbiditeacutes) les femmes enceintes agrave partir du deuxiegraveme trimestre de la grossesse les reacutesidents en eacutetablissements drsquoheacutebergement pour personnes acircgeacutees deacutependantes et uniteacutes de soins de longue dureacutee ou heacutebergeacutees en reacutesidences autonomie et reacutesidences services les personnes de plus de 18 ans souffrant drsquoune pathologie agrave tregraves haut risque de forme grave de Covid-19 (liste) les personnes de 50 agrave 54 ans inclus souffrant drsquoune ou plusieurs comorbiditeacute(s) les personnes en situation de handicap heacutebergeacutees en maisons drsquoaccueil speacutecialiseacutees (MAS) et foyers drsquoaccueil meacutedicaliseacutes (FAM) les reacutesidents de 60 ans et plus dans les foyers de travailleurs migrants (FTM) certaines cateacutegories de professionnels dont les professionnels de santeacute drsquoun eacutetablissement de santeacute drsquoun eacutetablissement ou service meacutedico-social intervenant aupregraves de personnes vulneacuterables les salarieacutes de particulier employeur intervenant aupregraves de personnes acircgeacutees et handicapeacutees vulneacuterables les meacutediateurs de lutte anticovid les sapeurs-pompiers et les veacuteteacuterinaires La liste exhaustive des professionnels concerneacutes est disponible sur le site du ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute La campagne de vaccination srsquoaccompagne du suivi des nombres de personnes vaccineacutees ainsi que des couvertures vaccinales Le systegraveme drsquoinformation Vaccin Covid permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 a eacuteteacute mis en œuvre le 04 janvier 2021 Il est administreacute par la Caisse nationale de lrsquoassurance maladie (Cnam) et alimenteacute par les professionnels de santeacute reacutealisant les vaccinations Depuis le 27 janvier 2021 lrsquoestimation des nombres de personnes vaccineacutees en France contre la COVID-19 est issue de cette source de donneacutees

Les indicateurs de couvertures vaccinales ont eacutevolueacute Ils incluent depuis le 26 avril 2021 - Les personnes vaccineacutees par au moins une dose personnes ayant reccedilu une deux ou trois doses de vaccin - Les personnes complegravetement vaccineacutees personnes vaccineacutees par deux doses de vaccins neacutecessitant deux doses (vaccins Pfizer Moderna ou AstraZeneca) personnes vaccineacutees par une dose de vaccins neacutecessitant une seule dose (vaccin Janssen) personnes vaccineacutees par une seule dose en cas drsquoanteacuteceacutedent de COVID-19 Seront eacutegalement incluses les personnes particuliegraverement agrave risque (notamment personnes immunodeacuteprimeacutees) vaccineacutees par trois doses de vaccin

En population geacuteneacuterale Le 27 avril 2021 14 601 130 personnes ont reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 en France et 6 115 998 sont complegravetement vaccineacutees (donneacutees par date drsquoinjection) Il est ainsi estimeacute qursquoagrave cette date 218 de la population en France a reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 et 91 est complegravetement vaccineacutee (Tableau 14) Lrsquoestimation de la couverture vaccinale au sein de la population adulte (acircgeacutee de 18 ans ou plus) est de 277 pour au moins une dose et 116 pour une vaccination complegravete

Tableau 14 Nombres de personnes ayant reccedilu au moins une dose de vaccin et une vaccination complegravete contre la COVID-19 et couvertures vaccinales ( de la population) au 27 avril 2021 par reacutegion France

Donneacutees Vaccin Covid Cnam exploitation Santeacute publique France

En une semaine (depuis le 20 avril 2021) plus de 15 million de personnes ont reccedilu leur premiegravere dose de vaccin soit en moyenne 226 000 personnes par jour (Figure 44) Figure 44 Nombres cumuleacutes de personnes ayant reccedilu au moins une dose de vaccin et une vaccination complegravete contre la COVID-19 par jour de vaccination France (donneacutees du 27 deacutecembre 2020 au 27 avril 2021)

Sources donneacutees Vaccin Covid Cnam exploitation Santeacute publique France

Les couvertures vaccinales les plus eacuteleveacutees sont observeacutees chez les personnes les plus acircgeacutees (Tableau 15) du fait de leur ciblage prioritaire par la campagne de vaccination comme recommandeacute par la Haute Autoriteacute de santeacute (HAS) reacutesidents en Ehpad ou USLD personnes de 55 ans et plus Pour les personnes acircgeacutees de 75 ans et plus la couverture vaccinale pour au moins une dose est de 720 (vaccination complegravete 527) Pour les personnes acircgeacutees de 75 agrave 79 ans la couverture vaccinale pour au moins une dose est de 777 (vaccination complegravete 561) Pour les 80 ans et plus elle est de 689 (vaccination complegravete 508) et eacutevolue peu par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (665 le 20 avril 2021) Cette faible progression chez les personnes les plus acircgeacutees invite au renforcement des actions pour aller vers ces personnes notamment au travers de la vaccination agrave domicile Tableau 15 Nombres de personnes ayant reccedilu au moins une dose de vaccin et une vaccination complegravete contre la COVID-19 et couvertures vaccinales ( de la population) au 27 avril 2021 par classe drsquoacircge France

Classes dacircge Au moins une dose de

vaccin (N) Couverture vaccinale

une dose () Vaccination complegravete

Couverture vaccinale Vaccination complegravete

18-24 181 531 33 50 181 09

25-29 207 416 56 68 680 18

30-39 563 825 68 200 159 24

40-49 828 100 96 302 735 35

50-59 2 166 437 246 624 053 71

60-64 1 718 582 419 329 021 80

65-69 1 924 175 493 414 634 106

70-74 2 419 132 695 767 471 221

75-79 1 721 941 777 1 243 957 561

80 ans et + 2 866 043 689 2 113 886 508

inconnu 3 948 non applicable 1 221 non applicable

France 14 601 130 218 6 115 998 91

Inconnu et incluant les personnes vaccineacutees et mentionneacutees comme acircgeacutees de moins de 18 ans Donneacutees Vaccin Covid Cnam exploitation Santeacute publique France

Les couvertures vaccinales pour au moins une dose sont de 196 pour les hommes et de 237 pour les femmes La majoriteacute des personnes vaccineacutees lrsquoont eacuteteacute avec le vaccin PfizerBioNTech Pour les premiegraveres doses 664 des vaccinations ont eacuteteacute reacutealiseacutees avec le vaccin PfizerBioNtech 258 avec AstraZeneca et 78 avec Moderna Les premiegraveres vaccinations reacutealiseacutees avec le vaccin Janssen apparaissent cette semaine (Tableau 16 Figure 45) Tableau 16 Nombres de personnes vaccineacutees par type de vaccins pour la premiegravere dose et la seconde dose

en France (donneacutees du 27 deacutecembre 2020 au 27 avril 2021)

Vaccin Premiegravere dose

(N) Reacutepartition

Seconde dose

Reacutepartition ()

PfizerBioNTech 9 688 374 664 5 338 072 907

Moderna 1 134 109 78 535 908 91

AstraZeneca 3 764 637 258 11 332 02

Janssen 14 010 01 0 00

Non preacuteciseacute 0 00 2 00

Total 14 601 130 1000 5 885 314 1000

Figure 45 Proportion de personnes vaccineacutees par type de vaccin pour la premiegravere dose en France (donneacutees du 27 deacutecembre 2020 au 27 avril 2021)

Reacutesidents en Ehpad ou en USLD

Les couvertures vaccinales pour les reacutesidents en Ehpad ou USLD sont actuellement surestimeacutees Ces surestimations sont tregraves certainement lieacutees agrave la vaccination en Ehpad ou USLD de personnes de plus de 65 ans ne reacutesidant pas dans ces structures notamment pour eacuteviter de perdre des doses De ce fait la publication de ces indicateurs est suspendue Des analyses sont en cours afin drsquoeacutetudier les alternatives permettant de produire de nouvelles estimations dans cette population

Professionnels exerccedilant en Ehpad ou en USLD Sont inclus les professionnels travaillant en Ehpad ou en USLD qursquoils soient professionnels de santeacute ou non Les deacutefinition modaliteacute de constitution et limites des indicateurs sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les couvertures vaccinales des professionnels en Ehpad ou en USLD peuvent ecirctre surestimeacutees si des personnes non professionnelles de lrsquoEhpad ou de lrsquoUSLD ont eacuteteacute vaccineacutees dans lrsquoEhpad ainsi que si des personnels inteacuterimaires ou personnels de socieacuteteacute de sous-traitance stagiaires ou intervenants occasionnels acircgeacutes de moins de 65 ans ont eacuteteacute vaccineacutes en Ehpad ou en USLD car ils ne sont pas pris en compte dans les deacutenominateurs utiliseacutes pour la couverture vaccinale

Au 27 avril 2021 357 317 professionnels exerccedilant en Ehpad ou en USLD ont reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 en France (donneacutees par date drsquoinjection) Il est ainsi estimeacute que 764 des professionnels exerccedilant en Ehpad ou en USLD ont reccedilu une premiegravere dose de vaccin et 191 353 sont complegravetement vaccineacutes soit 489 des professionnels

Il est cependant suspecteacute que les nombres de personnes vaccineacutees et les couvertures vaccinales chez les professionnels exerccedilant en Ehpad ou USLD soient surestimeacutees si des personnes de moins de 65 ans ont eacuteteacute vaccineacutees dans ces structures sans y exercer notamment afin drsquoeacuteviter les pertes de doses

Professionnels de santeacute Sont inclus tous les professionnels de santeacute quel que soit leur lieu drsquoexercice (libeacuteral eacutetablissement de santeacute priveacute ou public eacutetablissement meacutedico-social autres ) Les deacutefinition modaliteacute de constitution et limites des indicateurs sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Les professionnels de santeacute sont identifieacutes dans la base Vaccin Covid par une saisie manuelle rendue possible agrave compter du 28 janvier 2021 (ajout drsquoune variable dans lrsquooutil VAC-SI) Sont retenus comme professionnels de santeacute les personnes preacutesentant un codage manuel mentionnant qursquoil est un professionnel de santeacute quel que soit son lieu drsquoexercice (eacutetablissement de santeacute public ou priveacute eacutetablissement meacutedico-social ambulatoire autres professionnels de santeacute eacutetudiants professionnels de preacutevention) Cet indicateur est sous-estimeacute du fait que le codage manuel nrsquoa eacuteteacute mis en œuvre qursquoagrave partir du 28 janvier 2021 Les personnes ayant reccedilu leurs deux doses avant le 28 janvier 2021 ne sont pas prises en compte

Au 27 avril 2021 (donneacutees par date drsquoinjection) 1 755 855 personnes deacuteclareacutees comme professionnels de santeacute dans Vaccin Covid ont reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 en France et 877 832 sont entiegraverement vaccineacutees Sur la base de ces donneacutees les couvertures vaccinales seraient ainsi estimeacutees agrave 790 (au moins une dose) et 395 (complegravetement vaccineacutees) La courbe par date drsquoinjection montre une nette augmentation des vaccinations depuis deacutebut avril 2021 (Figure 46) Les couvertures vaccinales sont surestimeacutees avec dans plusieurs reacutegions des couvertures vaccinales pour au moins une dose supeacuterieures agrave 99 La surestimation est tregraves certainement lieacutee au fait que des personnes ont eacuteteacute enregistreacutees comme professionnels de santeacute dans Vaccin Covid sans lrsquoecirctre reacuteellement ou sans ecirctre en activiteacute Le deacutenominateur utiliseacute ne prend par exemple pas en compte les agents non professionnels de santeacute travaillant en milieu hospitalier ou en ESMS ou les professionnels de santeacute retraiteacutes Figure 46 Nombres cumuleacutes de professionnels de santeacute ayant reccedilu au moins une dose de vaccin et une vaccination complegravete contre la COVID-19 par jour de vaccination France (donneacutees du 27 deacutecembre 2020 au 27 avril 2021)

Donneacutees non applicables agrave Mayotte Surestimation possible dans certaines reacutegions due agrave un deacutenominateur impreacutecis et aux limites de lrsquoindicateur

Les donneacutees relatives aux nombres de personnes vaccineacutees et aux couvertures vaccinales sont disponibles en open data sur la plateforme Geodes ainsi que sur datagouvfr

SUIVI DE LrsquoADOPTION DES MESURES DE PREacuteVENTION ET DES INDICATEURS DE SANTEacute MENTALE Les donneacutees proviennent de lrsquoenquecircte Santeacute publique France CoviPrev enquecirctes Internet reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons indeacutependants non probabilistes de 2 000 personnes acircgeacutees de 18 ans et plus reacutesidant en France meacutetropolitaine (Access panel) de mars 2020 agrave avril 2021

Les reacutesultats de la vague 22 de lrsquoenquecircte CoviPrev qui srsquoest deacuterouleacutee du 15 au 17 mars 2021 ont eacuteteacute publieacutes dans le Point eacutepideacutemiologique du 25 mars 2021 Une nouvelle enquecircte srsquoest tenue fin avril 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique du 06 mai

En preacutesence de signes de deacutepression (tristesse perte drsquointeacuterecirct drsquoeacutenergie) ou drsquoanxieacuteteacute (tension irritabiliteacute) il est important de srsquoinformer et drsquoen parler afin drsquoecirctre conseilleacute sur les aides et les solutions disponibles Il ne faut pas heacutesiter agrave prendre conseil aupregraves de son meacutedecin ou agrave appeler le 0 800 130 00 pour demander agrave ecirctre orienteacute vers une eacutecoute ou un soutien psychologique Pour plus drsquoinformation sur la santeacute mentale et les ressources disponibles httpswwwpsycomorg httpswwwsantepubliquefrancefrcoronavirussante-mentale

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public sur le site de Santeacute publique France Des informations sur la vaccination contre la COVID-19 sont eacutegalement disponibles et mises agrave jour reacuteguliegraverement dans les volets Professionnels et Grand public du site Vaccination Info Servicefr

SITUATION INTERNATIONALE Selon lrsquoOrganisation mondiale de la santeacute (OMS) 147 539 302 cas confirmeacutes de COVID-19 ont eacuteteacute rapporteacutes dans le monde ndash dont 3 116 444 deacutecegraves ndash au 27 avril 2021 En semaine 16 plus de 57 millions de nouveaux cas ont eacuteteacute signaleacutes soit une hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente (+8) observeacutee pour la neuviegraveme semaine conseacutecutive Le nombre de deacutecegraves srsquoeacutelevant agrave 87 862 eacutetait eacutegalement en hausse (+5)

Foyers majeurs En semaine 16 les foyers majeurs de lrsquoeacutepideacutemie se situaient dans les zones Asie du Sud-Est (2 269 114 cas et 17 126 deacutecegraves rapporteacutes) Europe (1 466 680 cas et 25 341 deacutecegraves) et Ameacuteriques (1 400 004 cas et 36 530 deacutecegraves) Ces reacutegions eacutetaient agrave lrsquoorigine de respectivement 40 26 et 25 des nouveaux cas de COVID-19 rapporteacutes au niveau mondial et de 19 29 et 42 des nouveaux deacutecegraves en S16 (Figure 47 Tableau 17)

Les pays signalant les plus grands nombres de nouveaux cas en S16 eacutetaient lrsquoInde (+2 172 063 nouveaux cas) les Eacutetats-Unis (+406 001) le Breacutesil (+404 623) la Turquie (+378 771) et la France (+202 396) Figure 47 Nombre de cas de COVID-19 rapporteacutes dans le monde pour 100 000 habitants donneacutees de la semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021)

Source OMS

Tendances En semaine 16 le nombre de nouveaux cas eacutetait en hausse par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente en Asie du Sud-Est (+49) tandis qursquoil se stabilisait ou baissait dans les autres reacutegions OMS (Tableau 17) Le nombre de nouveaux deacutecegraves augmentait dans deux reacutegions OMS lrsquoAsie du Sud-Est (+81) et la Meacutediterraneacutee orientale (+17) Tableau 17 Nombre de cas drsquoinfection au SARS-CoV-2 et de deacutecegraves lieacutes agrave la COVID-19 rapporteacutes dans le monde en semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) et eacutevolution par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente

Reacutegion OMS

Afrique Ameacuteriques Asie du Sud-Est

Europe Meacutediterraneacutee

orientale Pacifique occidental

Cas rapporteacutes +49 453 +1 400 004 +2 269 114 +1 466 680 +378 248 +131 777

Tendance -9 -8 +49 -12 -2 +3

Deacutecegraves rapporteacutes +1 155 +36 530 +17 126 +25 341 +6 370 +1 304

Tendance -1 -7 +81 -5 +17 -10

Les flegraveches vertes repreacutesentent une diminution du nombre de cas de 5 ou plus par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente Les flegraveches noires repreacutesentent une eacutevolution (diminution ou augmentation) infeacuterieure agrave 5 Les flegraveches rouges indiquent une augmentation du nombre de cas de 5 ou plus par rapport agrave la semaine preacuteceacutedente

Source OMS

Par reacutegion La reacutegion de lAsie du Sud-Est a signaleacute plus de 22 millions de nouveaux cas et plus de 17 000 deacutecegraves La tendance agrave la hausse des nouveaux cas et des deacutecegraves se poursuit et semble srsquoacceacuteleacuterer avec des cas hebdomadaires en forte hausse pour la septiegraveme semaine conseacutecutive tandis que les deacutecegraves hebdomadaires ont augmenteacute pour la sixiegraveme semaine conseacutecutive La dynamique de la reacutegion continue agrave ecirctre porteacutee par lrsquoInde qui comptait 2 172 063 nouveaux cas soit 157 pour 100 000 habitants (+52 par rapport agrave la semaine 14) Les autres pays rapportant les nombres de nouveaux cas les plus eacuteleveacutes eacutetaient lrsquoIndoneacutesie avec 37 029 nouveaux cas soit 14 pour 100 000 habitants (stable par rapport agrave S15) et le Bangladesh avec 27 148 nouveaux cas soit 17 cas pour 100 000 habitants (-25) Les trois pays cumulant le plus de deacutecegraves eacutetaient lrsquoInde (15 161 deacutecegraves +93) lrsquoIndoneacutesie (1 172 +32) et le Bangladesh (669 +8) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Asie du Sud-Est cliquez ici

En reacutegion Europe plus de 14 million de nouveaux cas et plus de 25 000 deacutecegraves ont eacuteteacute signaleacutes en S16 Les nombres de nouveaux cas et de nouveaux deacutecegraves sont en baisse pour la deuxiegraveme semaine conseacutecutive Les pays ayant signaleacute les plus grands nombres de nouveaux cas eacutetaient la Turquie avec 378 771 nouveaux cas (449 pour 100 000 habitants soit -9 par rapport agrave S15) la France avec 202 396 nouveaux cas (302 pour 100 000 habitants soit -11) et lrsquoAllemagne avec 145 156 nouveaux cas (175 pour 100 000 habitants soit +1) Les pays rapportant les plus grands nombres de deacutecegraves eacutetaient la Pologne qui a enregistreacute 3 383 nouveaux deacutecegraves (-6) la Russie avec 2 650 nouveaux deacutecegraves (+2) et lrsquoUkraine avec 2 537 nouveaux deacutecegraves (-8) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Europe cliquez ici La reacutegion des Ameacuteriques a signaleacute plus de 14 million de nouveaux cas et plus de 36 000 nouveaux deacutecegraves On observe une tendance agrave la baisse des nouveaux cas apregraves huit semaines daugmentation progressive Les deacutecegraves ont eacutegalement diminueacute Les pays rapportant les plus grands nombres de nouveaux cas eacutetaient les Eacutetats-Unis avec 406 001 nouveaux cas soit 123 pour 100 000 habitants (-15 par rapport agrave S15) le Breacutesil avec 404 623 nouveaux cas soit 190 pour 100 000 habitants (-12) et lrsquoArgentine avec 166 024 nouveaux cas soit 367 pour 100 000 habitants (+3) Les pays connaissant les plus grands nombres de nouveaux deacutecegraves eacutetaient le Breacutesil qui a enregistreacute 17 667 nouveaux deacutecegraves (-12) les Eacutetats-Unis avec 4 951 nouveaux deacutecegraves (-4) et la Colombie avec 2 882 nouveaux deacutecegraves (+26) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Ameacuteriques cliquez ici

En reacutegion Meacutediterraneacutee orientale un peu plus de 378 000 nouveaux cas et plus de 6 300 deacutecegraves ont eacuteteacute signaleacutes en semaine 16 Le nombre de nouveaux cas restait stable apregraves dix semaines drsquoaugmentation tandis que le nombre de nouveaux deacutecegraves continuait drsquoaugmenter pour la neuviegraveme semaine conseacutecutive Les pays comptant les plus grands nombres de nouveaux cas eacutetaient lrsquoIran avec 161 594 nouveaux cas soit 192 pour 100 000 habitants (-3) lrsquoIrak avec 54 301 nouveaux cas soit 135 pour 100 000 habitants (+3) et le Pakistan avec 39 858 nouveaux cas soit 18 pour 100 000 habitants (+17) Les plus grands nombres de deacutecegraves ont eacuteteacute observeacutes en Iran (2 793 deacutecegraves +33) au Pakistan (905 +18) et en Tunisie (514 +7) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Meacutediterraneacutee orientale cliquez ici En reacutegion Pacifique occidental pregraves de 132 000 nouveaux cas ont eacuteteacute rapporteacutes en semaine 16 ainsi que plus de 1 300 deacutecegraves Le nombre de cas augmentait dans la reacutegion pour la septiegraveme semaine conseacutecutive tandis que les deacutecegraves baissaient leacutegegraverement depuis deux semaines Les trois pays signalant les plus grands nombres de nouveaux cas eacutetaient les Philippines avec 63 364 nouveaux cas (58 pour 100 000 habitants soit -13) le Japon avec 32 312 nouveaux cas (26 pour 100 000 habitants soit +22) et la Malaisie avec 17 393 nouveaux cas (54 pour 100 000 habitants soit +27) Les pays signalant les plus grands nombres de deacutecegraves eacutetaient les Philippines (864 deacutecegraves -19) le Japon (291 +21) et la Malaisie (56 +14) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Pacifique occidental cliquez ici

En reacutegion Afrique plus de 49 000 nouveaux cas et plus de 1 100 nouveaux deacutecegraves ont eacuteteacute signaleacutes Le nombre de cas hebdomadaires continue de fluctuer sans tendance claire comme depuis neuf semaines bien que les deacutecegraves aient tendance agrave baisser depuis le pic atteint agrave la mi-janvier Les trois pays ayant signaleacute les plus grands nombres de nouveaux cas eacutetaient lrsquoEacutethiopie avec 10 719 nouveaux cas (9 pour 100 000 habitants soit -17 par rapport agrave la semaine 15) lrsquoAfrique du Sud avec 8 690 nouveaux cas (15 pour 100 000 habitants soit +7) et le Kenya avec 5 031 nouveaux cas (9 cas pour 100 000 habitants soit -18) Les pays rapportant les plus grands nombres de deacutecegraves eacutetaient lrsquoAfrique du Sud (414 deacutecegraves -9) lrsquoEacutethiopie (203 +12) et le Kenya (140 +5) Pour plus de deacutetails sur la reacutegion Afrique cliquez ici

NB Les donneacutees preacutesenteacutees ne tiennent pas compte des speacutecificiteacutes des systegravemes de surveillance et des capaciteacutes diagnostiques des diffeacuterents pays

Pour en savoir + sur la situation internationale

- dans le monde OMS - Weekly Epidemiological Update

- en Europe ECDC - Weekly Surveillance Report

Variants preacuteoccupants (VOC) et variants agrave suivre (VOI) du SARS-CoV-2 au niveau international Plusieurs variants du SARS-CoV-2 ont eacutemergeacute au cours des derniers mois quatre drsquoentre eux eacutetant qualifieacutes de variants preacuteoccupants (VOC) en raison de leur transmissibiliteacute augmenteacutee et du risque drsquoeacutechappement agrave la reacuteponse immunitaire Les variants 20I501YV1 identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni 20H501YV2 repeacutereacute pour la premiegravere fois en Afrique du Sud et 20J501YV3 ayant eacutemergeacute au Breacutesil font lrsquoobjet drsquoune attention particuliegravere du fait de leur circulation importante agrave lrsquoeacutechelle internationale Le quatriegraveme variant preacuteoccupant VOC 20I484K ou 484Q (B117 + E484KQ) a eacuteteacute identifieacute pour la premiegravere fois au Royaume-Uni

Variant 20I501YV1 lignage B117 Ce variant est associeacute agrave une transmissibiliteacute accrue (de 43 agrave 90) et possiblement agrave une forme plus seacutevegravere de la maladie agrave un plus haut risque drsquohospitalisation (40-64) et agrave une mortaliteacute plus eacuteleveacutee (30-70) Dans le monde au 27 avril 2021 la preacutesence du variant 20I501YV1 a eacuteteacute rapporteacutee dans 139 pays par lrsquoOMS soit sept pays de plus depuis le 13 avril

Variant 20H501YV2 lignage B1351 Des eacutetudes preacuteliminaires suggegraverent que ce variant est associeacute agrave une transmissibiliteacute plus eacuteleveacutee de 50 et un risque plus eacuteleveacute drsquoeacutechappement immunitaire et de reacuteinfection Certaines recherches indiquent un risque accru de deacutecegraves agrave lrsquohocircpital de lrsquoordre de 20 Ce variant aurait la capaciteacute drsquoeacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire post-infection et post-vaccinale et pourrait par conseacutequent accroicirctre le risque de reacuteinfection Dans le monde au 27 avril 2021 la preacutesence du variant 20H501YV2 a eacuteteacute rapporteacutee dans 87 pays selon lrsquoOMS soit cinq pays de plus depuis le 13 avril

Variant 20J501YV3 lignage B11281 (P1) Plusieurs eacutetudes montrent une transmissibiliteacute plus importante par rapport aux souches autres que variantes (de 40 agrave 120) Ce variant aurait eacutegalement la capaciteacute drsquoeacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire post-infection et post-vaccinale Dans le monde au 27 avril 2021 la preacutesence du variant 20J501YV3 a eacuteteacute rapporteacutee dans 54 pays soit deux pays de plus depuis le 13 avril Retrouvez les cartes illustrant la preacutesence des diffeacuterents variants preacuteoccupants (VOC) dans le monde dans le Weekly Epidemiological Update de lrsquoOMS

Variant agrave suivre B1617 Le variant B1617 identifieacute pour la premiegravere fois en Inde a eacuteteacute reacutecemment deacutesigneacute comme variant agrave suivre (VOI) par lrsquoOMS et Santeacute publique France Ce variant comprend plusieurs sous-ligneacutees dont B16171 B16172 et B16173 qui diffegraverent leacutegegraverement par leurs mutations caracteacuteristiques

Les trois mutations caracteacuteristiques de ce variant sont les L452R P681R et E484Q (observeacutees dans les sous-ligneacutees B16171 et B16173) qui sont associeacutees comme pour drsquoautres VOIVOCs agrave une transmissibiliteacute plus importante par rapport aux souches autres que variantes et une possibiliteacute drsquoeacutechapper agrave la reacuteponse immunitaire

Les souches B16171 et B16172 montrent une preacutevalence croissante en Inde qui coiumlncide avec la forte augmentation de cas observeacutee dans le pays lors des semaines reacutecentes Agrave la mi-avril 2021 le variant B1617 (toutes sous-ligneacutees confondues) repreacutesentait 61 des eacutechantillons seacutequenceacutes dans lrsquoEacutetat du Maharashtra ougrave il a eacuteteacute deacutecouvert et 15 agrave 20 des seacutequenccedilages au niveau national Agrave la date du 27 avril plus de 1 200 seacutequences provenant drsquoau moins 17 pays ont eacuteteacute ajouteacutees sur le site de deacutepocirct de seacutequences GISAID

Autres variants en cours drsquoeacutetude La surveillance de lrsquoeacutemergence de variants du SARS-CoV-2 est reacutealiseacutee de maniegravere continue au niveau international Huit variants ont eacuteteacute deacuteclareacutes en France comme variants agrave suivre et six sont en cours drsquoeacutevaluation Plus de deacutetails sur la page Circulation des variants du SARS-CoV-2 de Santeacute publique France

LrsquoECDC et lrsquoOMS rappellent qursquoagrave ce stade de lrsquoeacutevolution de la circulation des nouveaux variants la comparaison du nombre de cas entre pays nrsquoest pas pertinente puisqursquoelle est tregraves deacutependante des capaciteacutes des laboratoires et de la capaciteacute de deacutetection des variants de chaque pays En effet les variants peuvent deacutejagrave circuler sans que les pays aient eacuteteacute en mesure de les identifier

Pour en savoir + sur ces variants du SARS-CoV-2 Weekly Epidemiological Update de lrsquoOMS du 27 avril 2021

SYNTHEgraveSE Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux En semaine 16 (du 19 au 25 avril 2021) les indicateurs eacutepideacutemiologiques en population geacuteneacuterale eacutetaient agrave nouveau agrave la baisse mais de maniegravere plus modeacutereacutee que lors de la semaine preacuteceacutedente Si les R-effectifs sont significativement infeacuterieurs agrave 1 en meacutetropole pour la seconde semaine conseacutecutive lrsquoameacutelioration de la dynamique observeacutee semble moins marqueacutee que la semaine preacuteceacutedente Malgreacute la reacuteduction de lrsquoincidence depuis deux semaines la diminution de la pression hospitaliegravere reste tregraves limiteacutee notamment en services de soins critiques Agrave lrsquoapproche de la leveacutee annonceacutee de certaines restrictions les indicateurs eacutepideacutemiologiques restaient agrave des niveaux plus eacuteleveacutes que ceux observeacutes avant la leveacutee du preacuteceacutedent confinement La couverture vaccinale des personnes complegravetement vaccineacutees eacutetait en progression mais infeacuterieure agrave 10 de la population Dans ce contexte un haut niveau drsquoadheacutesion aux mesures de preacutevention individuelles et la progression rapide de la vaccination sont essentiels pour permettre un assouplissement prochain des mesures collectives sans risquer un deacutebordement des capaciteacutes hospitaliegraveres Au niveau national 202 396 nouveaux cas ont eacuteteacute confirmeacutes soit environ 29 000 cas en moyenne chaque jour Le taux drsquoincidence de la semaine 16 diminuait (302100 000 habitants en S16 vs 339 en S15 soit -11) pour la seconde semaine conseacutecutive Une diminution du recours au deacutepistage eacutetait observeacutee (3 036100 000 habitants vs 3 440 soit -12) Cette diminution concernait toutes les classes drsquoacircge restait plus marqueacutee chez les 0-14 ans (-16) et moins marqueacutee chez les 75 ans et plus (-5) Le taux de positiviteacute (99) eacutetait stable par rapport agrave S15 La part des personnes symptomatiques parmi les personnes testeacutees a diminueacute en S16 Le nombre de cas eacutetait en diminution chez les symptomatiques et chez les asymptomatiques (respectivement de -12 et -10) Le taux de positiviteacute eacutetait en augmentation chez les personnes symptomatiques alors qursquoil est resteacute stable chez les asymptomatiques La semaine 16 est marqueacutee par une diminution des nouveaux cas et des nouvelles personnes-contacts agrave risque moindre cependant qursquoen S15 pour les personnes-contacts Ces reacutesultats suggegraverent un effet positif des mesures de freinage mises en place fin mars-deacutebut avril sur la circulation du virus Cependant plusieurs indicateurs du contact tracing eacutetaient similaires en S16 et S15 nombre moyen de personnes-contacts par cas (quel que soit lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts) deacutelai de deacutepistage deacutelai drsquoenregistrement depuis le dernier contact avec le cas Ceci suggegravere que les mesures de restrictions ont atteint un palier en termes de reacuteduction des interactions sociales et donc secondairement drsquoimpact sur la transmission La diminution du nombre de cas et de personnes-contacts devrait donc se poursuivre au mecircme rythme sans acceacuteleacuteration En particulier le nombre moyen de personnes-contacts extra-domiciliaires par cas srsquoest stabiliseacute apregraves trois semaines de diminution ce qui pourrait signifier que les contacts hors du foyer ont eacuteteacute reacuteduits au minimum possible au regard des mesures de restrictions en cours Le nombre de cas ayant freacutequenteacute le milieu scolaire est agrave son minimum depuis que cet indicateur est suivi en lien avec la fermeture des eacutecoles et les vacances scolaires La reprise de la scolariteacute en S17 pourrait entraicircner une hausse de cet indicateur au cours des prochaines semaines Les deacuteplacements inter-reacutegionaux recueillis lors de lrsquoentretien avec les cas et les personnes contacts se maintiennent agrave un niveau faible mais constant en deacutepit des mesures de restrictions Enfin deux indicateurs majeurs du contact tracing sont en nette ameacutelioration depuis plusieurs semaines le pourcentage de nouveaux contacts auparavant connus comme des cas et le pourcentage de personnes-contacts devenant des cas Cette eacutevolution traduit agrave la fois une ameacutelioration des performances du contact tracing et la diminution du nombre de personnes-contacts En outre les cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque ont toujours moins de personnes-contacts agrave risque probablement en raison drsquoune meilleure adheacutesion agrave la mesure de lrsquoisolement

En meacutedecine ambulatoire le taux drsquoincidence des consultations pour une infection respiratoire aigueuml (IRA) estimeacute par le reacuteseau Sentinelles eacutetait stable (70100 000 habitants en S16 vs 72 en S15) Le nombre drsquoactes meacutedicaux SOS Meacutedecins pour suspicion de COVID-19 eacutetait en baisse (-15 par rapport agrave S15) Cette baisse concernait les enfants (-14) et les adultes (-15) En semaine 16 le nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 eacutetait en diminution chez les enfants (-12) et les adultes (-7) Le nombre de deacuteclarations de nouvelles hospitalisations de patients COVID-19 a leacutegegraverement diminueacute en S16 (-6) pour la seconde semaine conseacutecutive Le nombre de deacuteclarations de nouvelles admissions de patients COVID-19 en services de soins critiques en S16 eacutetait similaire agrave celui de S15 (2 971 vs 2 980 soit -03) Le nombre de personnes en cours drsquohospitalisation se maintenait agrave un niveau eacuteleveacute avec 30 341 personnes hospitaliseacutees au 27 avril (vs 31 147 le 20 avril soit -3) dont 5 959 patients en soins critiques (vs 6 000 soit -1) Par comparaison une semaine avant la leveacutee du confinement au 15 deacutecembre 2020 on comptabilisait 25 914 patients hospitaliseacutes pour COVID-19 dont 3 088 en soins critiques En France meacutetropolitaine les estimations du R-effectif calculeacutees agrave partir des trois sources de donneacutees eacutetaient significativement infeacuterieures agrave 1 donneacutees virologiques (tests RT-PCR et tests antigeacuteniques SI-DEP 089) passages aux urgences (OSCOURreg 092) et hospitalisations de patients COVID-19 (SI-VIC 092) Le nombre hebdomadaire de deacutecegraves de patients COVID-19 hospitaliseacutes en semaine 16 eacutetait en augmentation (2 094 vs 1 944 deacutecegraves en S15 soit +8) En eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) le nombre de deacutecegraves restait faible (moins de 50 deacutecegraves hebdomadaires) et stable depuis la semaine 13 (donneacutees S16 non consolideacutees) traduisant lrsquoimpact de la vaccination Le nombre de deacutecegraves toutes causes et tous acircges confondus eacutetait significativement supeacuterieur agrave celui attendu (sur la base des donneacutees historiques) depuis la semaine 40-2020 et jusqursquoagrave la semaine 15-2021 Apregraves une diminution observeacutee entre les semaines 04 et 10 la mortaliteacute eacutetait agrave nouveau repartie agrave la hausse jusqursquoen semaine 13 et semblait se stabiliser en semaines 14 et 15 Le nombre de deacutecegraves tous acircges confondus eacutetait supeacuterieur agrave celui attendu en S15 dans six reacutegions Auvergne-Rhocircne-Alpes Hauts-de-France Icircle-de-France Grand-Est Normandie et Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (donneacutees non consolideacutees) Lrsquoanalyse de lrsquoimpact des mesures de restrictions montre que lrsquoeacutevolution des indicateurs eacutepideacutemiologiques en semaines 15 et 16 est compatible avec lrsquohypothegravese drsquoun effet beacuteneacutefique des mesures de restrictions renforceacutees mises en œuvre depuis le 20 mars 2021 et coupleacutees agrave un renforcement des mesures de distanciation sociale en lien avec les vacances scolaires anticipeacutees Neacuteanmoins agrave une semaine de la leveacutee annonceacutee de certaines restrictions pour le 03 mai 2021 les taux drsquoincidence drsquohospitalisations et drsquoadmissions en soins critiques en France meacutetropolitaine sont nettement supeacuterieurs agrave ceux enregistreacutes en amont de la leveacutee du confinement au 15 deacutecembre 2020 La pression hospitaliegravere actuelle notamment pour les patients hospitaliseacutes en soins critiques est presque deux fois plus eacuteleveacutee De plus la deacutecroissance actuelle des indicateurs hospitaliers srsquoopegravere plus lentement qursquoen amont de la leveacutee du preacuteceacutedent confinement

Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux Reacutegions meacutetropolitaines En semaine 16 les taux drsquoincidence eacutetaient en diminution dans lrsquoensemble des reacutegions par rapport agrave la semaine 15 Cette diminution variait de -5 en Bourgogne-Franche-Comteacute agrave -20 en Corse Les taux de deacutepistage en S16 eacutetaient de nouveau en diminution dans toutes les reacutegions (diminutions comprises entre -9 et -15) Les reacutegions les plus toucheacutees en semaine 16 eacutetaient toujours lrsquoIcircle-de-France la Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur et les Hauts-de-France Ces reacutegions preacutesentaient les plus forts taux drsquoincidence (supeacuterieurs agrave 340100 000 habitants) drsquohospitalisations (supeacuterieurs agrave 22100 000 habitants) et drsquoadmissions en services de soins critiques (supeacuterieurs agrave 5100 000 habitants) Les estimations des R-effectifs agrave partir des donneacutees virologiques eacutetaient significativement infeacuterieures agrave 1 dans toutes les reacutegions meacutetropolitaines et aucune reacutegion meacutetropolitaine ne preacutesentait de R-effectif significativement supeacuterieur agrave 1 pour les estimations agrave partir des passages aux urgences ou des hospitalisations de patients COVID-19

En Icircle-de-France le taux drsquoincidence eacutetait de 459 pour 100 000 habitants en diminution par rapport agrave S15 (533 soit -14) Le taux de deacutepistage eacutetait eacutegalement en diminution par rapport agrave S15 (-14) Le taux de positiviteacute eacutetait toujours le plus eacuteleveacute de meacutetropole agrave 122 mais se stabilisait (+01 point par rapport agrave S15) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en services de soins critiques diminuaient respectivement agrave 275100 000 habitants (-6 par rapport agrave S15) et 70 (-6 par rapport agrave S15) Dans les Hauts-de-France le taux drsquoincidence eacutetait de 358100 000 habitants en diminution par rapport agrave S15 (404 soit -11) Le taux de deacutepistage eacutetait eacutegalement en diminution par rapport agrave S15 (-11) Le taux de positiviteacute restait eacuteleveacute agrave 116 La tendance agrave lrsquoameacutelioration des taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en services de soins critiques nrsquoeacutetait plus observeacutee en S16 avec respectivement des taux de 220100 000 habitants (-2 par rapport agrave S15) et 57 (+6 par rapport agrave S15) En Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur le taux drsquoincidence eacutetait de 344100 000 habitants en diminution par rapport agrave S15 (382 soit -10) Le taux de deacutepistage eacutetait eacutegalement en diminution par rapport agrave S15 (-9) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmission en services de soins critiques eacutetaient en diminution agrave respectivement 233100 000 habitants (-13 par rapport agrave S15) et 50100 000 habitants (-9 par rapport agrave S15)

Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM) En Guyane le taux drsquoincidence augmentait agrave 241100 000 habitants (vs 195 en S15 soit +23) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en soins critiques augmentaient agrave respectivement 151100 000 habitants (soit +11 hospitalisations par rapport agrave S15) et 45 (soit +6 admissions par rapport agrave S15) En Guadeloupe le taux drsquoincidence se stabilisait agrave 229100 000 habitants (vs 227 en S15 soit +1) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en soins critiques augmentaient agrave respectivement 281100 000 habitants (soit +51 hospitalisations par rapport agrave S15) et 48 (soit +2 admissions par rapport agrave S15) Un confinement a eacuteteacute instaureacute le 27 avril 2021 Agrave La Reacuteunion le taux drsquoincidence augmentait agrave 127100 000 habitants (vs 109 en S15 soit +17) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en soins critiques augmentaient agrave respectivement 88100 000 habitants (soit +4 hospitalisations par rapport agrave S15) et 31 (soit +3 admissions par rapport agrave S15) En Martinique le taux drsquoincidence diminuait agrave 180100 000 habitants (vs 205 en S15 soit -12) Le taux drsquohospitalisations diminuait agrave 178100 000 habitants (soit -8 hospitalisations par rapport agrave S15) tandis que le taux drsquoadmissions en soins critiques augmentait agrave 50 (soit +1 admission par rapport agrave S15) Agrave Mayotte le taux drsquoincidence augmentait leacutegegraverement agrave 53100 000 habitants (vs 51 en S15 soit +4) Les taux drsquohospitalisations et drsquoadmissions en soins critiques diminuaient agrave respectivement 07100 000 habitants (soit -3 hospitalisations par rapport agrave S15) et 04 (soit -1 admission par rapport agrave S15) Pour en savoir + Les donneacutees reacutegionales deacutetailleacutees sont accessibles sur Geacuteodes et sont mises en perspective dans les points eacutepideacutemiologiques reacutegionaux

Variants preacuteoccupants (VOC) du SARS-CoV-2 Agrave ce jour quatre variants ont eacuteteacute qualifieacutes de preacuteoccupants (VOC) en raison de leur transmissibiliteacute augmenteacutee et du risque drsquoeacutechappement agrave la reacuteponse immunitaire Trois drsquoentre eux les variants 20I501YV1 (ayant eacutemergeacute au Royaume-Uni) 20H501YV2 (ayant eacutemergeacute en Afrique du Sud) et 20J501YV3 (ayant eacutemergeacute au Breacutesil) circulent en France depuis le deacutebut de lrsquoanneacutee 2021 tandis que le quatriegraveme (20I484K (B117 + E484K) ayant eacutemergeacute au Royaume-Uni deacutebut 2021) a eacuteteacute peu deacutetecteacute en France jusqursquoici Drsquoautres variants du SARS-CoV-2 caracteacuteriseacutes par un changement pheacutenotypique par rapport agrave un virus de reacutefeacuterence ou ayant des mutations conduisant agrave des changements en acides amineacutes associeacutes agrave des implications pheacutenotypiques confirmeacutees ou suspecteacutees sont qualifieacutes de variants agrave suivre (VOI) apregraves une analyse de risque conjointe par le Centre national de reacutefeacuterence des virus respiratoires et Santeacute publique France Certains ont deacutejagrave eacuteteacute deacutetecteacutes sur le territoire et leur circulation est suivie avec attention dans les enquecirctes Flash il srsquoagit notamment des variants 20A484 (lignage B1525) deacutetecteacute plus freacutequemment en France depuis peu 20C655Y (lignage B1616) ayant eacuteteacute identifieacute en Bretagne en deacutebut drsquoanneacutee 2021 dans le cadre drsquoun foyer eacutepideacutemique hospitalier et 19B501Y (lignage A27) Le variant 20A484Q (lignage B1617) qui aurait eacutemergeacute en Inde est eacutegalement classeacute comme VOI Il a eacuteteacute deacutetecteacute chez deux voyageurs en provenance drsquoInde et en transit par la Guadeloupe Les autoriteacutes sanitaires maintiennent une vigilance eacuteleveacutee devant toute suspicion drsquoinfection par le variant B1617 Des informations sur ces variants sont disponibles sur le site de Santeacute publique France Drsquoautres variants porteurs de mutations confeacuterant un avantage seacutelectif par rapport aux autres virus SARS-CoV-2 circulant sont susceptibles drsquoeacutemerger dans le futur ce qui entraicircnerait de nouvelles alertes et une mise agrave jour de la liste des variants preacuteoccupants Au niveau national en S16 parmi les tests positifs cribleacutes dont les reacutesultats eacutetaient disponibles dans SI-DEP (52 de lrsquoensemble des tests de premiegravere intention positifs) 827 correspondaient agrave une suspicion de variant 20I501YV1 et 50 de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 Les suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 restaient heacuteteacuterogegravenes selon les deacutepartements Parmi les 96 deacutepartements meacutetropolitains preacutesentant des donneacutees interpreacutetables la proportion du variant 20I501YV1 eacutetait supeacuterieure agrave 80 dans 68 deacutepartements et supeacuterieure agrave 90 dans 25 drsquoentre eux La proportion de suspicions de variant 20H501YV2 ou 20J501YV3 eacutetait supeacuterieure agrave 10 dans sept deacutepartements avec des augmentations importantes en Haute-Saocircne et dans les Vosges Les premiers reacutesultats de Lrsquoenquecircte Flash 7 du 13 avril 2021 montrent que la circulation des variants preacuteoccupants 20I501YV1 et 20H501YV2 devenait plus homogegravene sur le territoire Le variant preacuteoccupant 20I501YV1 repreacutesentait 899 des seacutequences interpreacutetables parmi les reacutesultats disponibles Le variant 20I501YV1 restait particuliegraverement preacutesent en Nouvelle-Aquitaine et en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur (gt 95 des seacutequences interpreacutetables) le variant 20H501YV2 eacutetait plus preacutesent en Occitanie (83) et en Icircle-de-France (82) Le variant preacuteoccupant 20I484K est en augmentation en Icircle-de-France entre les enquecirctes Flash 6 et Flash 7 (de 10 agrave 27) En Bretagne la proportion de variant 20I484K est eacutegalement en augmentation avec 30 pour Flash 7 (non deacutetecteacute pour Flash 6) Variant de clade 20C ayant eacutemergeacute en Bretagne Un cluster drsquoinfections par un variant de clade 20C (laquovariant 20CH655Yraquo ou B1616) a eacuteteacute deacutetecteacute dans les Cocirctes-drsquoArmor avec des cas survenus entre janvier et avril 2021 La particulariteacute associeacutee aux cas confirmeacutes drsquoinfections par ce variant est la possibiliteacute de preacutesenter des symptocircmes eacutevocateurs de la COVID-19 avec une RT-PCR neacutegative sur les preacutelegravevements nasopharyngeacutes habituels Le virus est neacuteanmoins deacutetectable par les techniques de RT-PCR habituelles mais semble ecirctre identifieacute de maniegravere preacutefeacuterentielle dans les voies aeacuteriennes basses Agrave ce jour il nrsquoest pas deacutemontreacute que ce variant serait plus transmissible qursquoil entraicircnerait des formes plus seacutevegraveres ou qursquoil eacutechapperait agrave lrsquoimmuniteacute acquise apregraves infection ou induite par la vaccination

Une surveillance renforceacutee a eacuteteacute mise en place dans la zone geacuteographique concerneacutee en Bretagne Un protocole national drsquoinvestigation des cas eacutevocateurs drsquoinfection par le variant 20C655Y a eacuteteacute diffuseacute pour identifier et deacutecrire les cas qui surviendraient en dehors de cette zone geacuteographique En cas de suspicion drsquoinfection par ce variant (protocole dinvestigation disponible sur le site Internet de Santeacute publique France) des preacutelegravevements au-delagrave de la sphegravere nasopharyngeacutee doivent ecirctre proposeacutes chaque fois que possible pour augmenter la sensibiliteacute du diagnostic par RT-PCR Au 28 avril 40 cas drsquoinfection par le variant 20C655Y ont eacuteteacute confirmeacutes (37 en Bretagne trois dans drsquoautres reacutegions) Le diagnostic a eacuteteacute porteacute sur une premiegravere RT-PCR positive agrave partir drsquoun preacutelegravevement nasopharyngeacute pour 13 drsquoentre eux et agrave partir drsquoun preacutelegravevement profond pour 68 des cas Tous les cas ont un lien direct ou indirect avec la zone de surveillance renforceacutee en Bretagne La majoriteacute des cas est relieacutee agrave des transmissions au sein de clusters hospitaliers dans la zone Quelques cas ont eacuteteacute rapporteacutes en lien avec une chaicircne de transmission en communauteacute mais agrave ce jour les indicateurs de surveillance ne suggegraverent pas une diffusion communautaire importante de ce variant dans la population que ce soit en Bretagne ou ailleurs Les investigations eacutepideacutemiologiques se poursuivent pour caracteacuteriser lrsquoeacutepisode et suivre la diffusion de ce variant Situation eacutepideacutemiologique du VOC 20I484K Le VOC 20I484K a eacuteteacute identifieacute pour la premiegravere fois en Grande-Bretagne suite agrave lrsquoacquisition par le VOC 20I501YV1 de la mutation E484K sans signal agrave ce jour en faveur drsquoune diffusion significative au Royaume- Uni ou ailleurs dans le monde Au 2804 51 cas drsquoinfection par ce variant ont eacuteteacute deacutetecteacutes en France 22 cas en Ile-de-France 22 cas en Bretagne (10 par seacutequenccedilage et 12 par criblage) 3 cas dans les Hauts-de-France 1 cas en Provence-Alpes-Cocircte drsquoAzur 1 cas dans les Pays de la Loire et 2 cas en Centre-Val de Loire Depuis le deacutebut du mois drsquoavril une augmentation du nombre de cas confirmeacutes drsquoinfection par le 20I484K a eacuteteacute observeacutee en Ile-de-France et dans une zone limiteacutee autour de Brest en Bretagne laissant suspecter un deacutebut de transmission communautaire dans ces deux zones geacuteographiques Toutefois le variant 20I484K reste tregraves nettement minoritaire en comparaison avec le variant 20I501Y Les investigations eacutepideacutemiologiques se poursuivent

Surveillances speacutecifiques et populationnelles Parmi les 11 708 patients recenseacutes par la surveillance speacutecifique des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation depuis le 05 octobre 2020 69 eacutetaient des hommes Depuis janvier 2021 et compareacute au dernier trimestre 2020 un rajeunissement des patients admis en reacuteanimation est observeacute avec une diminution de la part de patients acircgeacutes de 65 ans et plus et une augmentation de la part des cas de 45-64 ans La proportion de cas peacutediatriques (0-14 ans) est resteacutee comparable entre les deux peacuteriodes La part des patients admis en reacuteanimation sans comorbiditeacutes a leacutegegraverement augmenteacute depuis janvier 2021 Parmi les personnes deacuteceacutedeacutees seules 7 ne preacutesentaient pas de comorbiditeacutes Les indicateurs de la surveillance des signalements dans les eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) qui concernent majoritairement des EHPAD indiquaient une stabilisation depuis S10 du nombre de signalements de cas et de deacutecegraves Les enfants sont tregraves peu repreacutesenteacutes chez les patients hospitaliseacutes pour COVID-19 et parmi les deacutecegraves (moins de 1) Une surveillance des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) permet drsquoestimer lrsquoincidence de ces cas en lien avec la COVID-19 Entre le 02 mars 2020 et le 25 avril 2021 501 cas de PIMS ont eacuteteacute signaleacutes En France lrsquoincidence des PIMS en lien avec la COVID-19 (434 cas) a eacuteteacute estimeacutee agrave 30 cas par million drsquohabitants dans la population des moins de 18 ans

Santeacute mentale Les reacutesultats de la vague 22 de lrsquoenquecircte CoviPrev qui srsquoest deacuterouleacutee du 15 au 17 mars 2021 ont eacuteteacute publieacutes dans le Point eacutepideacutemiologique du 25 mars 2021 Une nouvelle enquecircte srsquoest tenue fin avril 2021 Les reacutesultats seront preacutesenteacutes dans le Point eacutepideacutemiologique du 06 mai

Preacutevention Les reacutesultats de lrsquoenquecircte CoviPrev (vague 22 du 15 au 17 mars 2021) deacutetailleacutes dans le Point eacutepideacutemiologique du 25 mars 2021 montraient que si les mesures barriegraveres eacutetaient largement utiliseacutees par la population lrsquoadoption systeacutematique de reacuteduction des contacts tendait agrave baisser probable reflet de la lassitude drsquoune partie de la population vis-agrave-vis des mesures de controcircle Lrsquointention de se faire vacciner pour ceux qui ne le sont pas encore srsquoest maintenue La vaccination semble srsquoaccompagner drsquoun relacircchement des mesures barriegraveres alors qursquoil est pourtant important de les maintenir Concernant la vaccination contre la COVID-19 le 27 avril 2021 14 601 130 personnes ont reccedilu au moins une dose de vaccin contre la COVID-19 et 6 115 998 sont complegravetement vaccineacutes soit respectivement 218 et 91 de la population Lrsquoestimation de la couverture vaccinale au sein de la population adulte (acircgeacutee de 18 ans ou plus) eacutetait de 277 pour au moins une dose et 116 pour la population complegravetement vaccineacutee Pour les personnes acircgeacutees de 75-79 ans la couverture vaccinale pour au moins une dose eacutetait de 777 (complegravetement vaccineacutees 561) et de 689 pour les 80 ans et plus (complegravetement vaccineacutees 508) En une semaine (20-27 avril 2021) plus de 15 million de personnes ont reccedilu leur premiegravere dose de vaccin soit en moyenne 226 000 personnes par jour Les donneacutees issues de Vaccin Covid sont disponibles en open data sur la plateforme Geacuteodes ainsi que sur datagouvfr et sont mises agrave jour quotidiennement Pour en savoir + sur la vaccination Vaccination Info Service

SOURCES DES DONNEacuteES

Le suivi de lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 en population est effectueacute agrave partir de plusieurs sources qui permettent 1- de suivre lrsquoeacutevolution de lrsquoeacutepideacutemie en France au moyen drsquoindicateurs issus des donneacutees de meacutedecine de ville et drsquoeacutetablissements hospitaliers ou sociaux et meacutedico-sociaux (recours aux soins admissions en reacuteanimation surveillance virologique deacutecegraveshellip) les objectifs de ces surveillances sont de suivre la dynamique de lrsquoeacutepideacutemie et drsquoen mesurer lrsquoimpact en termes de morbiditeacute et de mortaliteacute 2- de mesurer au moyen drsquoenquecirctes reacutepeacuteteacutees en population geacuteneacuterale et dans certaines populations speacutecifiques lrsquoeacutevolution des comportements en matiegravere de preacutevention individuelle lrsquoimpact de lrsquoeacutepideacutemie sur la santeacute mentale et les intentions de recours agrave la vaccination

Ci-apregraves une description succincte de chacune de ces sources de donneacutees

Reacuteseau Sentinelles nombre drsquoinfections respiratoires aigueumls (IRA) observeacutees en meacutedecine geacuteneacuterale et en peacutediatrie Surveillance clinique compleacuteteacutee par une surveillance virologique (France meacutetropolitaine depuis mars 2020) OSCOURreg et SOS Meacutedecins nombre de recours aux services drsquourgences et aux associations SOS Meacutedecins pour une suspicion drsquoinfection agrave COVID-19 (codeacutee de maniegravere speacutecifique) (depuis le 24 feacutevrier 2020)

SI-VIC (Systegraveme drsquoinformation pour le suivi des victimes) nombre de patients hospitaliseacutes pour COVID-19 admis en reacuteanimation en soins intensifs ou en uniteacutes de surveillance continue ainsi que les deacutecegraves survenus pendant lrsquohospitalisation rapporteacutes par les eacutetablissements hospitaliers (depuis le 13 mars 2020)

SI-DEP (Systegraveme drsquoinformation de deacutepistage) plateforme seacutecuriseacutee avec enregistrement systeacutematique des reacutesultats des laboratoires de tests pour le deacutepistage et le diagnostic de lrsquoinfection par le SARS-CoV-2 (depuis le 13 mai 2020)

ContactCovid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie incluant les donneacutees de suivi des contacts autour des cas de COVID-19 (depuis le 13 mai 2020)

Eacutetablissements sociaux et meacutedico-sociaux (ESMS) nombre de cas probables et confirmeacutes de COVID-19 signaleacutes via le portail des signalements du ministegravere de la Santeacute chez les reacutesidents et le personnel ainsi que le nombre de deacutecegraves (depuis le 28 mars 2020)

Taux de reproduction effectif laquo R-eff raquo nombre moyen de personnes infecteacutees par un cas estimeacute selon la meacutethode de Cori avec une fenecirctre temporelle mobile de 7 jours permettant de suivre les tendances reacutecentes de la dynamique de transmission (depuis le 28 mai 2020)

Cas probables et confirmeacutes de COVID-19 et deacutecegraves parmi les professionnels drsquoun eacutetablissement de santeacute public ou priveacute donneacutees deacuteclaratives hebdomadaires par eacutetablissement (depuis le 22 avril 2020 avec donneacutees reacutetrospectives depuis le 1er mars)

Signalements e-SIN signalements drsquoinfections associeacutees aux soins lieacutees au SARS-CoV-2 saisis par les eacutetablissements de santeacute dans lrsquoapplication seacutecuriseacutee drsquoenregistrement e-SIN (depuis le 3 mars 2020)

Services de reacuteanimation sentinelles donneacutees non exhaustives agrave viseacutee de caracteacuterisation en termes drsquoacircge de seacuteveacuteriteacute et drsquoeacutevolution clinique des cas de COVID-19 admis en reacuteanimation (depuis le 16 mars 2020)

Signalement des cas de syndromes inflammatoires multi-systeacutemiques peacutediatriques (PIMS) signalement par les peacutediatres hospitaliers des cas de PIMS possiblement en lien avec la COVID-19 (depuis le 30 avril 2020)

Enquecircte CoviPrev enquecirctes Internet par vagues reacutepeacuteteacutees aupregraves drsquoeacutechantillons en population geacuteneacuterale de personnes acircgeacutees de 18 ans et plus Elles permettent de mesurer et de suivre les tendances eacutevolutives de lrsquoadoption des mesures de preacutevention et protection individuelle vis-agrave-vis de la COVID-19 drsquoindicateurs de la santeacute mentale (niveau drsquoanxieacuteteacute et de deacutepression niveau de satisfaction de vie actuelle) et de lrsquoacceptabiliteacute de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis mars 2020)

Vaccin Covid systegraveme drsquoinformation geacutereacute par lrsquoAssurance maladie et alimenteacute par les professionnels de santeacute permettant le suivi de la vaccination contre la COVID-19 en France (depuis le 04 janvier 2021)

Enquecircte Professionnels de santeacute preacutevention et COVID-19 enquecircte reacutepeacuteteacutee aupregraves de 1 509 professionnels de santeacute libeacuteraux repreacutesentatifs pour mesurer et suivre les tendances eacutevolutives de leurs opinions et attitudes agrave lrsquoeacutegard de la vaccination contre la COVID-19 (France meacutetropolitaine depuis le 13 octobre 2020)

Mortaliteacute toutes causes (Insee) nombre de deacutecegraves toutes causes par acircge avec estimation de lrsquoexcegraves par rapport agrave lrsquoattendu par acircge deacutepartement et reacutegion (deux agrave trois semaines de deacutelai pour consolidation)

Certification eacutelectronique des deacutecegraves (CeacutepiDC) deacutecegraves certifieacutes de faccedilon deacutemateacuterialiseacutee et permettant de connaicirctre les causes meacutedicales du deacutecegraves

Scheacutema de la surveillance de la COVID-19 coordonneacutee par Santeacute publique France

Pour en savoir + sur les meacutethodes du systegraveme de surveillance consulter la page Santeacute publique France Pour en savoir + sur nos partenaires et les sources de donneacutees consulter les pages de SurSaUDreg | OSCOURreg | SOS Meacutedecins | Reacuteseau Sentinelles | SI-VIC | CeacutepiDc | Assurance Maladie

Retrouvez tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public

Freacutequence

Hocircpital

Mortaliteacute

Cas en (teacuteleacute-)consultations

(Reacuteseau Sentinelles SOS Meacutedecins)

Cas confirmeacutes (SI-DEP)

Clusters (MONIC) Contact-tracing (Cnam) Vaccination (Vaccin Covid) Preacutevention-Santeacute mentale (CoviPrev)

Cas hospitaliseacutes cas en

reacuteanimation (SI-VIC SSR) Cas aux urgences (Oscourreg)

Clusters (MONIC) Professionnels de santeacute

Signalements drsquoinfections nosocomiales (e-sin)

deacuteceacutedeacutes

(SI-VIC ESMS

Insee CeacutepiDc)

CeacutepiDc-Inserm Centre deacutepideacutemiologie sur les causes meacutedicales de deacutecegraves Ehpad Eacutetablissement drsquoheacutebergement

pour personnes acircgeacutees deacutependantes EMS Eacutetablissement meacutedico-social ESMS Eacutetablissement social et meacutedico-

social Insee Institut national de la statistique et des eacutetudes eacuteconomiques MONIC Systegraveme drsquoinformation de

monitorage des clusters Oscourreg Organisation de la surveillance coordonneacutee des urgences SI-DEP Systegraveme

drsquoinformations de deacutepistage SI-VIC Systegraveme drsquoinformation des victimes SSR Services sentinelles de

reacuteanimationsoins intensifs Cnam Caisse nationale de lrsquoassurance maladie

Autres

Pour en savoir + sur lrsquoeacutepideacutemie de COVID-19 En France Santeacute publique France et Ministegravere des Solidariteacutes et de la Santeacute Agrave lrsquointernational OMS et ECDC

Retrouvez sur notre site tous les outils de preacutevention destineacutes aux professionnels de santeacute et au grand public Vaccination Info Service

Directrice de publication

Pr Geneviegraveve Checircne Directrice adjointe de publication

Pr Laeumltitia Huiart Contributeurs

Coordination Fanny Chereau Nicolas Meacutethy Delphine Viriot Leacutea Manchec Daniel Levy-Bruhl

Systegravemes de surveillance Leacutelia Abad Pauline Adam Denise Antona Jonathan Bastard Pascale Bernillon Clara Blondel Christophe Bonaldi Cleacutementine Calba Christine Campegravese Ceacuteline Caserio-Schoumlnemann Edouard Chatignoux Bruno Coignard Jamel Daoudi Jean-Claude Desenclos Julien Durand Myriam Fayad Adeline Feri Laure Fonteneau Camille Fortas Anne Fouillet Laurence Guldner Katia Hamdad Eline Hassan Sophie Larrieu Yann Le Strat Daniel Levy-Bruhl Etienne Lucas Alexandra Mailles Freacutedeacuteric Moisan Michael Padget Camille Pelat Alessandro Pini Elisabeth Pinto Johnny Platon Isabelle Pontais Jeacuterocircme Pouey Patrick Rolland Julian Rozenberg Ceacutecile Sommen Benjamin Taisne Marie-Michegravele Thiam Sophie Vaux

Avec lrsquoensemble des eacutequipes de Santeacute publique France aux niveaux national et reacutegional Contact presse

Vanessa Lemoine Teacutel +33 (0)1 55 12 53 36 pressesantepubliquefrancefr Diffusion

Santeacute publique France 12 rue du Val drsquoOsne 94415 Saint-Maurice Teacutel +33 (0)1 41 79 67 00 wwwsantepubliquefrancefr Date de publication

29 avril 2021

Points cleacutes

Chiffres cleacutes

SURVEILLANCE EN MEacuteDECINE AMBULATOIRE

Reacuteseau Sentinelles

Associations SOS Meacutedecins

SURVEILLANCE VIROLOGIQUE

Au niveau national cas confirmeacutes taux drsquoincidence de positiviteacute et de deacutepistage

Analyse par classe drsquoacircge

Deacutepistage selon la preacutesence de symptocircmes

Au niveau reacutegional

En meacutetropole

En Outre-mer

Analyse par niveaux scolaires

Variants drsquointeacuterecirct analyse des reacutesultats des tests de criblage saisis dans SI-DEP

SURVEILLANCE GEacuteNOMIQUE DU SARS-CoV-2Reacutesultats des enquecirctes Flash 6 et 7

Enquecircte Flash 6 du 30 mars 2021 (reacutesultats consolideacutes)

Enquecircte Flash 7 du 13 avril 2021 (premiers reacutesultats)

Eacutevolution des diffeacuterents clades et variants au cours des enquecirctes Flash 3 agrave 7 du 16 feacutevrier 2021 au 13 avril 2021

MPACT DES MESURES DE RESTRICTIONS SANITAIRES EN FRANCE MEacuteTROPOLITAINE

ACTIVITEacute DrsquoIDENTIFICATION DES CONTACTS

Eacutevolution du nombre de cas et de personnes-contacts agrave risque identifieacutes

Proportion des cas et des personnes-contacts agrave risque investigueacutes

Deacutelai de diagnostic des cas symptomatiques

Nombre de personnes-contacts agrave risque par cas

Caracteacuteristiques des contacts agrave risque en fonction de lrsquoacircge des cas et des personnes-contacts

Proportion des cas preacuteceacutedemment connus comme personnes-contacts agrave risque

Mobiliteacute des cas et des personnes-contacts

SURVEILLANCE DANS LES EacuteTABLISSEMENTS SOCIAUX ET MEacuteDICO-SOCIAUX

PASSAGES AUX URGENCES POUR SUSPICION DE COVID-19 (Reacuteseau OSCOURreg)


Reacutegions meacutetropolitaines

Reacutegions drsquooutre-mer

SURVEILLANCE EN MILIEU HOSPITALIER



Nouvelles hospitalisations et nouveaux deacutecegraves

Caracteacuteristiques des cas graves de COVID-19 admis en reacuteanimation

SURVEILLANCE DES CAS DE SYNDROMES INFLAMMATOIRES MULTI-SYSTEacuteMIQUES PEacuteDIATRIQUES

SURVEILLANCE DE LA MORTALITEacute

Mortaliteacute lors drsquoune hospitalisation et en ESMS

Mortaliteacute issue de la certification eacutelectronique des deacutecegraves

Mortaliteacute toutes causes

Mortaliteacute agrave lrsquoeacutechelle europeacuteenne

VACCINATION CONTRE LA COVID-19

En population geacuteneacuterale


Professionnels exerccedilant en Ehpad ou en USLD

Professionnels de santeacute

SUIVI DE LrsquoADOPTION DES MESURES DE PREacuteVENTION ET DES INDICATEURS DE SANTEacute MENTALE

SITUATION INTERNATIONALE

Foyers majeurs

Tendances

Par reacutegion

Variants preacuteoccupants (VOC) et variants agrave suivre (VOI) du SARS-CoV-2 au niveau international

Variant 20I501YV1 lignage B117

Variant 20H501YV2 lignage B1351

Variant 20J501YV3 lignage B11281 (P1)

Variant agrave suivre B1617

Autres variants en cours drsquoeacutetude

SYNTHEgraveSE

Indicateurs eacutepideacutemiologiques nationaux

Indicateurs eacutepideacutemiologiques reacutegionaux


Deacutepartements et reacutegions drsquooutre-mer (DROM)

Variants preacuteoccupants (VOC) du SARS-CoV-2

Variant de clade 20C ayant eacutemergeacute en Bretagne

Situation eacutepideacutemiologique du VOC 20I484K

Surveillances speacutecifiques et populationnelles

Santeacute mentale

Preacutevention
