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Carmen M. Redondo Marey Unidad Oncología Genética. CHUVI 28 Septiembre 2012
Herramientas en la web para el investigador.
Gestores documentales (docs, netvibes)
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Índice
1. Introducción
– Herramientas informáticas en investigación, en qué nos ayudan
– Ejemplos de herramientas
2. Gestores documentales
– Qué son ?
– Tipos:
. Netvibes y mashups
. Herramientas colaborativas
3. Resumen
4. Bibliografía
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Herramientas en la web para el investigador. Introducción.
1. Introducción
- Qué son ?
Software general disponible en internet, muchas veces gratuito, que podemos usar/adaptar en nuestra investigación.
- En qué nos pueden ayudar ?
. Búsqueda de información
. Análisis de información y resultados del proyecto
. Planificación de proyectos
. Presentación de la información
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1. Introducción: Búsqueda de información
• Búsqueda de información:
- Bases de datos o portales bibliográficos:
PubMed (MedLINE), OMIM, IME, Embase, SCOPUS, LILACS,
Cochrane Plus, WHOLIS, Bibliosaúde, Web of Knowledge/Science
- Bases de datos de proteínas, genes y rutas metabólicas:
NCBI: CDD, Gene, UniGene
EBI: UniProt, PDBe, Reactome
KEGG: KEGG, KEGG Pathways
- Encuestas: encuesta fácil, Lime Survey, SurveyMonkey
- Gestores documentales: Netvibes
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1. Introducción: Análisis de información y resultados.
• Análisis de información y resultados:
- Programas estadísticos: EpiInfo, EpiDat, R
- Programas gráficos: Gnuplot, Grace, Jmol, Vmd
- Programas análisis información/resultados proteínas y genes:
- proteínas: estructura 3D, función, dinámica, docking
Blast, Pfam, NAMD, AutoDock
- genes: Babelomics
- Mashups
- Gestores documentales: Herramientas colaborativas
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1. Introducción: Gestión de proyectos y Presentación de resultados
• Gestión de proyectos:
Openproj, Onepoint Community Server
(cronogramas, gestión recursos, análisis de camino crítico)
• Presentación de información/resultados:
- Gestores documentales: Herramientas colaborativas
- Gestores de referencias
EndNote, RefWorks, integrados en texto (Word, Latex)
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2. Gestores documentales: netvibes, mashups y herramientas colaborativas
2. Gestores documentales
- Qué son ?
Software que permite crear, capturar, organizar, almacenar y
recuperar documentos
- Tipos:
. Netvibes y mashups
. Herramientas colaborativas
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2. Gestores documentales: Netvibes
• Netvibes: www.netvibes.com/usalbiomedica#Biblioteca
- “universo de ventanas”, “portal de entrada”
- escritorio virtual que agrupa fuentes de información (de nuestro
interés) que se actualizan frecuentemente (feeds)
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2. Gestores documentales: Mashups
• Mashups:
- Aplicación web que usa información de distintas fuentes relevantes (netvibes) para crear un nuevo servicio usando Servicios Web y APIs públicas.
- HealthMap: mapa mundial de alertas epidemiológicas
http://www.healthmap.org/es/
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2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups
• PubMedReMiner: bioinfo.amc.uva.nl/human-genetics/pubreminer/
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2. Gestores documentales: Netvibes y Mashups
• Pubgle: guías de práctica clínica www.pubgle.com
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Herramientas colaborativas:
- Qué son?
Herramientas disponibles en internet que permiten el trabajo en
equipo sin tenernos que reunir físicamente.
- En qué nos ayudan ?
1. Crear y compartir documentos
2. Publicaciones colaborativas
3. Compartir calendarios de trabajo / lista tareas pendientes
4. Compartir enlaces y recursos web
5. Crear foros de comunicación
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Herramientas colaborativas:
- Son sencillas de usar (para algunas se necesita formación)
- Se adaptan a nuestras necesidades
(distintas tareas, personas con distintas habilidades informáticas, …)
- Hay muchas para escoger
- No dependen del ordenador/tablet/smartphone que tengamos
ni de dónde estemos físicamente
- Se usan en muchos entornos (sanidad, educación, empresas…)
- Permite decidir quién puede ver/modificar los documentos
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Entornos colaborativos:
Espacio virtual con herramientas comunes que facilitan el intercambio de información, el trabajo colaborativo y la comunicación entre usuarios
- Yahoo groups y Google groups:
. Exigen tener cuenta de correo Yahoo o Google
. Google ha eliminado algunas herramientas
- GNOSS:
. Comunicación y compartir recursos
. Enlace con redes sociales (Facebook, Twitter, etc.)
- Wiggio:
. Calendario, archivos, mensajes, foros, reuniones virtuales
. Subgrupos de trabajo
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Crear y modificar documentos:
- Google Docs:
. Crear nuevos documentos o compartir los ya existentes (doc, xls, odt,
ods, csv, ppt, etc.)
. Compartir documentos, hojas de cálculo, presentaciones o formularios.
. Necesitamos tener cuenta en Google
. Varias personas pueden modificar el documento a la vez pero, sabemos
quién ha cambiado qué y cuándo.
. Diferentes permisos (lector, colaborador).
. Publicar directamente el documento como web o blog.
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Crear y modificar documentos:
- Dropbox:
. Guardar archivos en “local” para trabajar sin internet
. Guardar archivos “en la nube” para acceder desde cualquier sitio
. La versión “local” se sincroniza con la remota al conectarnos y así trabajamos siempre sobre la última versión del documento.
. Si dos personas hacen cambios al mismo tiempo guarda las dos versiones y avisa
- Zoho:
. Revisar los cambios introducidos por otros
. Exportar los textos a distintos formatos: doc, pdf, latex
. Copia “en local” y copia “en la nube”
. Presentación online colaborativa
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Crear y modificar documentos:
- Crocodoc:
. Revisar y comentar documentos word, powerpoint, pdfs, imágenes, etc entre varias personas.
- Prezi:
. Crear una presentación online colaborativa
- Etherpad:
. Bloc de notas colaborativo
- Lucidchart:
. Crear diagrama de flujos o mapas de ideas
- SkyDrive: (Microsoft)
. Compartir documentos con otros usuarios y entre equipos (ordenador, smartphone, tablet) de forma muy sencilla y rápida
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Publicación colaborativa: Blogs
. Publicación web que organiza sus contenidos cronológicamente
. No exige saber programar
. Integrar imágenes, vídeos, presentaciones, mashups …
. Eficaz para recoger las conclusiones de una reunión científica,
divulgar resultados de investigación al público en general …
. Editar por varios autores “internos” y colaboraciones “externas”
. www.blogger.com/start es.wordpress.com
http://www.somosmedicina.com/2010/02/blogs-sanitarios-en-espanol-activos-y_24.html
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Publicación colaborativa: Blogs:
http://medicablogs.diariomedico.com/drdelgado/
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Publicación colaborativa: Wiki
. Página web que se puede crear, borrar o modificar de forma
interactiva, fácil y por cualquier usuario que acceda a ella (registrado)
. Debate sobre contenido/información de un tema
. Cada uno aporta su conocimiento, experiencia
. “Tablón de anuncios”
. wiki.zoho.com www.wikispaces.com
. Wikipedia, wiki de cursos, compañías (modificar desde intranet)
http://webtrends.about.com/od/wikilists/tp/list_of_health_wikis.htm
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Publicación colaborativa: WikiHealth www.wikihealth.com
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Compartir calendarios y lista de tareas pendientes:
- Google calendar:
. Compartir calendario común con múltiples personas
. Copia local sincronizada
(para consultar sin estar conectados a internet)
. Ideal para: calendarios de reuniones, tareas de un proyecto, etc.
. Acceder a los datos desde el móvil
. Se necesita cuenta en Google para poder modificar el calendario,
no para consultarlo.
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Compartir calendarios y lista de tareas pendientes:
- Doodle:
. Muy sencilla de usar
. Fijar reuniones, eventos
. Elegir quién participa
(invitamos por email)
. Muestra resumen actividad
realizada
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Compartir enlaces y recursos web:
- Delicious:
. Guardar los marcadores web de “Favoritos” para poderlos ver desde cualquier equipo desde el que nos conectemos.
. Compartir nuestros marcadores con otros usuarios
. Se integra en cualquier navegador (Explorer, Firefox)
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Compartir enlaces y recursos web:
- Diigo:
. Compartir enlaces con un grupo de personas
. Compartir notas, imágenes, capturas de pantallas, etc.
. Más sencilla de usar que Delicious
. Se integra en el navegador (Explorer, Firefox)
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Foros de comunicación:
- Vyew:
. Webminars (seminarios web), presentaciones, reuniones de equipo, ayudar a clientes en tiempo real…
. Compartir documentos, imágenes, vídeos, presentaciones
que se pueden modificar conjuntamente
. Guardar la sesión como vídeo para verlo después
. Comentarios en vivo o a través de chat, webcam para ver al participante que habla (si quiere)
. Visualizar el escritorio remoto del moderador
. Se necesita tener Java y Flash instalado.
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2. Gestores documentales: Herramientas colaborativas
• Foros de comunicación:
- Skype:
. Escribir, hablar o videoconferencia con varias personas a la vez
. Muy sencillo de instalar y usar
. Permite retomar conversaciones pasadas
. Funciona en cualquier ordenador/smartphone
. Permite compartir escritorio
. Útil llamadas internacionales gratis
. Envío de archivos
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Resumen
3. Resumen
1. Las herramientas disponibles en la web ayudan al investigador en todas
y cada una de las etapas de investigación.
2. Hay herramientas disponibles que se ajustan a nuestras necesidades,
sólo hay que buscar !!!
3. Netvibes y mashups permiten agrupar fuentes de información
que se actualizan rápidamente y extraer nuevo contenido.
4. Las herramientas colaborativas permiten el trabajo
conjunto con otros sin tenernos que reunir físicamente
5. con los datos personales/pacientes: LOPD
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4.Bibliografía
1. http://cooltoolsforschools.wikispaces.com/Collaborative+Tools
2. http://www.library.uq.edu.au/research-support/research-collaboration-tools
3. http://whitepapers.virtualprivatelibrary.net/Online%20Research%20Tools.pdf
4.