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2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
生 物 統 計 学̶ データに基づく「よりよい推論」のために ̶
三中 信宏MINAKA Nobuhiro
独立行政法人 農業環境技術研究所 生態系計測研究領域 上席研究員
東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物・環境工学専攻 教授[生態系計測学]
東京農業大学大学院 農学研究科 客員教授[応用昆虫学]
[email protected](メール)
http://twitter.com/leeswijzer(ツイッター)
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/(ウェブサイト)
http://d.hatena.ne.jp/leeswijzer/(書評ブログ)
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
講義予定と内容(2010 年 10月~ 2011 年 1月)10月 7日(木) ガイダンス/統計学的思考
10月 14日(木) 統計学概論/統計言語〈R〉紹介
10月 21日(木) データの視覚化とそのツール(散布図,箱ひげ図 etc. )
10 月 28日(木) パラメトリック統計学と正規分布/分散概念の段階的導出
11月 4日(木) 実験計画法(1):完全無作為化法と分散分析
11月 11日(木) 実験計画法(2):一要因・二要因の乱塊法/多重比較
11月 18日(木) モデル選択論/最尤法
11月 25日(木) 線形モデル/正規性と等分散性/一般化線形モデル
12月 2日(木) 計算統計学(1):リサンプリング統計手法
12月 9日(木) 計算統計学(2):ベイズ統計学
12月 16日(木) 計算統計学(3):ベイジアンMCMC
1月 6日(木) 多変量解析:共変動と高次元空間における散布パターン
1月 13日(木) 形態測定学:生物形態の幾何学的情報と形態変形解析
1月 20日(木) 生物系統学:系統樹を推定するための統計理論
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
「三中信宏」の講義関連情報窓口
[email protected](電子メール)
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/(ウェブサイト)
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/R/R-top.html(R)
http://twitter.com/leeswijzer(ツイッター)
#TodaiStat(講義用 hashtag)受講生は各自ツイッターアカウントを取得して三中のアカウント
@leeswijzer をフォローしてください.質問などはハッシュタグ
#TodaiStat のご利用を.
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
Mandala
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MINAKA Nobuhiros pagina(玄関サイト)
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/
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租界Rの門前にて(統計学サイト)
http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/R/R-top.html
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leeswijzer van der dagboek(書評ブログ)
http://d.hatena.ne.jp/leeswijzer/
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成績評価の方法
1) 毎回の講義の出席点
2) 課題レポートの提出(二回)
※ 試験は実施しません.
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
統計学へのお誘い本リスト
三中信宏
大学での講義や統計研修の受講生から,「統計学の参考図書を紹介してほしい」との依頼があったので,下記のよ
うな「お誘い本リスト」をつくってみた.日本語の本のみのリストである.“門前”から“門”までの「参道」が
やや長い気がするが,そこは気の迷いや逡巡が憑いてまわる相手のために,ということでご容赦いただきたい.
また,いったん“入門”してしまった後は,統計手法ごとにそれぞれ特化したより適切な本(中級書以上)がき
っとあると思うが,下のリストはまったく網羅的ではない.個人的に,生物系・農学系の学生や研究員を相手に
講義をする機会が多いので,リストの最初の方はできるだけ“数式汚染”されていない統計本を中心に挙げてあ
る.なお,統計ソフトウェア〈R〉に関する参考書のより広範なリストは,日本語R掲示板である〈RjpWiki〉の
中にある「R本リスト」を参照すれば最新情報が得られるだろう.また,下記のリスト内のリンクは,私のサイ
ト(http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/R/InvitationStatistics.html)を参照されたい(「※」印の本は,新刊での入手
は現在不可能と思われる).
1. 門前で迷っている人のためのコミック系入門書
• アイリーン・マグネロ&ボリン・ヴァン・ルーン[神永正博監訳/井口耕二訳]『マンガ 統計学入門:学
びたい人のための最短コース』(2010 年 4月 20日刊行,講談社[ブルーバックス B1681],本体価格 800 円,
ISBN:978-4-06-257681-9 →版元ページ)
• 高橋信『マンガでわかる統計学』(2004 年 7月刊行,オーム社,ISBN:4274065707 →版元ページ)
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
2. 統計学の科学史と科学哲学
• デイヴィッド・サルツブルグ[竹内惠行・熊谷悦生訳]『統計学を拓いた異才たち:経験則から科学へ進
展した一世紀』(2010 年 4月 1日刊行,日本経済新聞出版社[日経ビジネス人文庫 1143],東京,504 pp.,
税込価格 1,200 円,ISBN:978-4-532-19539-7 → 版元ページ|書評)
• C・R・ラオ[藤越康祝・柳井晴夫・田栗正章訳]『統計学とは何か:偶然を生かす』(2010 年 2月 10日刊行,
筑摩書房[ちくま学芸文庫],東京,321 pp.,本体価格 1,300 円,ISBN:978-4-480-09271-7 → 版元ページ)
• サミール・オカーシャ著[廣瀬覚訳]『1冊でわかる 科学哲学』(2008 年 3月 25日刊行,岩波書店[〈1
冊でわかる〉シリーズ],vi+194+v pp.,本体価格 1,500 円,ISBN:978-4-00-026896-7 → 版元ページ)
3. 入門の覚悟を決めた人のための本
• 粕谷英一『生物学を学ぶ人のための統計のはなし:きみにも出せる有意差』(1998 年 3月刊行,文一総合
出版,ISBN:4829921234 →書評と目次)
• 佐藤俊哉『宇宙怪人しまりす医療統計を学ぶ』(2005 年 12 月刊行,岩波書店[岩波科学ライブラリー
114],本体価格 1,200 円.ISBN:4000074547 →版元ページ)
• 竹村彰通『統計[第 2版]』(2007 年 9月刊行, 共立出版[共立講座・21世紀の数学:第 14巻],
ISBN:978-4-320-01851-8 → 目次|コンパニオン・サイト)
4. ひたすらヴィジュアル系な入門書
• 市原清志『バイオサイエンスの統計学:正しく活用するための実践理論』(1990 年 2月刊行,南江堂,
ISBN:4524220364)
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
• 市原清志・岩本美江子『カラーイメージで学ぶ統計学の基礎』(2006 年 10 月刊行,日本教育研究センター,
ISBN:4890261230)
5. Rを片手に統計修行
• 青木繁伸『Rによる統計解析』(2009 年 4月 15日刊行,オーム社,x + 322 pp., 本体価格 3,800 円,
ISBN:978-4-274-06757-0 → 版元ページ)
• 舟尾暢男『R Commander ハンドブック』(2008 年 12 月 15日刊行,オーム社, x + 265 pp.,本体価格
3,200 円,ISBN:978-4-274-06745-7[CD-ROM付き]→ 版元ページ)
• 山田剛史・杉澤武俊・村井潤一郎『Rによるやさしい統計学』(2008 年 1月刊行,オーム社,xvi+404
pp.,本体価格 2,835 円,ISBN:978-4-274-06710-5 → 目次|版元ページ)
• Peter Dalgaard[岡田昌史監訳]『Rによる医療統計学』(2007 年 1月 31日刊行, 丸善出版事業部,
ISBN:4-621-07811-2 → 版元ページ|サポートページ)
6. すでに入門してしまった人のための次なる本(線形モデルまわり)
• Michael J. Crawley 著[野間口謙太郎・菊池泰樹訳]『統計学:Rを用いた入門書』(2008 年 5月刊行,共
立出版,xiv+344 pp.,本体価格 4,300 円,ISBN:978-4-320-01857-0 → 目次|版元ページ)
• lan Grafen,Rosie Hails 著[野間口謙太郎・野間口眞太郎訳]『一般線形モデルによる生物科学の
ための現代統計学-あなたの実験をどのように解析するか-』(2007 年 1月 30日刊行,共立出版,
ISBN-13:978-4-320-05639-8 →情報|版元ページ)
2009 年度・東京大学第4学期・理学部専門科目(木曜第 5限)三中信宏〈生物統計学〉:2010年 10月~ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室
7. ややイノチ懸け系な数理統計学書
• 竹村彰通『現代数理統計学』(1991 年 12 月刊行,創文社,ISBN:4423895080 →目次)
• 竹村彰通『多変量推測統計の基礎』(1991 年 9月刊行,共立出版,ISBN:4320014480 →目次)
• C・R・ラオ『統計的推測とその応用』(1977 年 11 月刊行,東京図書,ISBN:4489001746)※
8. たまにはベイズもいかが?
• 伊庭幸人『ベイズ統計と統計物理』(2003 年 8月 27日刊行,岩波書店[岩波講座〈物理の世界〉:物理
と情報3],ISBN:4000111582 → 版元ページ)
9. 実例ごりごり系な大御所エンサイクロペディア
• R・R・ソーカル& F・J・ロルフ『生物統計学』(1983 年 10 月刊行,共立出版,ISBN:4320052684)
• G・W・スネデッカー&W・G・コクラン『統計的方法(原書第 6版)』(1972 年刊行,岩波書店)※
• 竹内啓他(編)『統計学辞典』(1989 年 12 月刊行,東洋経済新報社,ISBN:4492010386)※
10. なお余力がある人は統計科学の最前線へどうぞ!
• 甘利俊一・竹内 啓・竹村彰通・伊庭幸人(編)〈シリーズ・統計科学のフロンティア[全 12巻]〉(2002
年~ 2005 年[完結],岩波書店 → 版元ページ)
• 甘利俊一,麻生英樹,伊庭幸人(編)〈シリーズ・確率と情報の科学[第I期・全 15巻]〉(2008 年~[刊
行中],岩波書店 → 版元ページ)