Biométrie et Biologie Evolutive

Bilan du laboratoire de Biométrie et Biologie EvolutivePériode 2002-2005

Positionnement du laboratoire

Les personnels

La structure générale

Moyens pour la recherchemoyens financierslocauxinstruments, plates-formes

La production

L'enseignement

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

LBBE

UFRIFR

HCL

ClusterEnvironnementBioinformatique

Plates-formes:PRABI (RIO)

DTAMB

Génopole

Helix

Sao Paulo SIB

IN2P3

Université Lyon1CNRS

INRIA

Région

Réseaux

Relations au travers de l'activité personnelle de membres du LBBE

Direction de GDR: Evolution des relations parasitaires chez les insectes

Direction de GDRE: Comparative Genomics

Direction d'un ARC: Integrated Biological Networks

Le représentant français au BGIF

3 membres de sections du CoNRS (29 et 44)

1 membre du CNU (67)

1 président d'Université (Lyon 1)

Éditeurs associés de 10 journaux

Publications ou contrats communs

Publications ou contrats communs

Personnels Chercheurs entrés dans l'UMR pendant les deux deniers contrats (en bleu 2002-2005)

Nom Entrée Statut

Daubin Vincent 2001 CR1 GGE

Doligez Blandine 2004 CR2 EE

Dray Stéphane 2005 CR2 EE

Gibert Patricia 1999 CR2 GGE

Lerat Emmanuelle 2005 CR1 GGE

Loison Anne 1999 CR1 EE

Marais Gabriel 2004 CR2 GGE

Vavre Fabrice 2001 CR1 GGE

Sagot Marie-France 2001 DR2 GGE

Tannier Eric 2005 CR2 GGE

Kahn Daniel 2005 DR1 GGE

5 entrées au CNRS, 1 entrée INRIA, un détachement

Enseignants Chercheurs Science Lyon 1

Nom Entrée StatutAllainé Dominique 2002 PU EE

Desouhant Emmanuel 1998 MCU GGE

Dufour Anne-Béatrice 1999 MCU EE

Fromont Emmanuelle 1998 MCU EE

Gueguen Laurent 2000 MCU GGE

Mousset Sylvain 2004 MCU GGE

Royet Manuela 2005 MCU EE

Sauvage Franck 2005 MCU EE

Say Ludovic 2003 MCU EE

Varaldi Julien 2004 MCU GGE

Venner Samuel 2004 MCU EE

Vieira Christina 1999 MCU GGE

Enseignants chercheurs Santé Lyon 1

Nom Entrée StatutDavid Sandra 2005 AHU BMS

Maire Pascal 2005 PH BMS

Mignard Sophie 2005 AHU BMS

Guerin-Faublie Véronique 2004 EC-ENVL BMS

Ce tableau ne prend pas en compte l'entrée de l'équipe de Pascal Roy en 1999 dans l'unité.

Départ de l'unité 2002-2005 chercheurs et enseignants-chercheurs

Nom Date StatutAuger Pierre 2005 PR

Boulétreau Joceline CR

Lemaître Claire MCU

Lett Christophe (détachement IRD) MCU

Martel Evelyne MCU

Maury-Lechon Géma CR

Ney-Nifle Muriel 2005 CR

Pascal Jean-Pierre DR

Pavé Alain PR

Ploye Henri MCU

Prat Daniel PR

Sillans Daniel MCU

Personnel d'assistance à la recherche techniciens, ingénieurs, administratifs

Nom entrée départ statutHélène Henri 12/1999 Tch

Christiane Nardon 01/2000 01/2005 IE

Bruno Spataro 04/2001 IR

Monique Jacobzone 09/2001 IR

Anne-Marie Gonidec 07/2002 IR

Pierre Fouilllet 09/2002 IE

François Debias 09/2002 Tch

Stéphane Delmotte 09/2002 AI

Delphine Charif 12/2004 IE

Nicole Gautier 12/2004 IE

Simon Penel 01/2005 IE

1998 2002 2005

C+EC 36 (72%) 49 (75%) 59 (79%)

ITA+IATOS 14 (28%) 16 (25%) 16 (21%)

Total 50 65 75

Évolution de la composition en permanents

Doctorants

Animation de plusieurs masters

58 (69) doctorants (dans la configuration proposée)

44 thèses soutenues depuis octobre 200111 post-doc19 permanent recherche (CR, MCU, …)2 Ingénieurs3 autres permanents

Le nombre total de membres du laboratoire dans sa configuration actuelle: 75 + 58 + 10 = 143Dans la configuration proposée : 90+69+10=169

Post-Doctorants

10 prévus en décembre 2005

Équipes : 9 (11)Création :

Baobab (M.F. Sagot)Disparition :

Équipe "Biologie Mathématique" (P. Auger) Équipe "Ecologie Statistique" (J. Thioulouse)

La structure du laboratoire

Départements:Biomath-SantéGénomique et Génétique ÉvolutiveÉcologie Évolutive

Axes transversaux:MéthodologieInteractions durables

Sécurité et Formation:

Moyen financiers :

CNRS Univ. Total

2002 115 067 65 930690 600

(509 603)

2003 116 250 81 446625 325

(427 629)

2004 136 500 81 446650 250

(432 304)

2005 200 000 81 446586 700

(305 254)

sources financement

PropresCNRS

Université

Environ 650 000€ par an : 9% univ, 16% CNRS 75 % propres

Locaux :

Une indiscutable dispersion

Mais

Connexion réseauVisites régulières

Existence de collaborations entre sites

Construction des locaux du PRABI

un projet de 2000 qui voit le jour

interaction forte entre laboratoire et plate-forme

l'occasion de renforcer les plateaux techniques du laboratoire (voir exposé perspectives)

poursuivre une politique de développement commun:service informatiqueachat d'équipement de biologie moléculaireachat d'un microscope à fluorescence

La production

Articles cités au SCI

Laboratoire

BMS GGE EE

La production : Logiciels

Un aspect majeur de la production du laboratoire qui sera présenté au cours de l'exposé de l'axe transversal méthodologie.

La production : articles

Nb public Nb Perm Pub/(an.perm)

BMS 155(123) 14 2,76(1,72)

GGE 212(141) 24 2,20(1,82)

EE 173(129) 19 2,27(1,70)

LBBE 540(386) 57 2,36(1,69)

Chiffres en rouge: surestimation due aux doublons

Enseignement

Voir exposé de D. Mouchiroud