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Bedeutung der Heterozyklischen Aromaten
I. Purine und Pyrimidine
II. Alkaloide
III. Nukleotide:
Energieträger Phytohormone Proteinbiosynthese Hauptbestandteil von DNA und RNA
Gen-Umwelt-Kontroverse:
VGesamt = VUmw. + VGen + VRest
Einschätzung des Anteils der Umwelt-Einflüsse und genetischen Einflüsse an der Variabilität von Biomasse und Pflanzenproduktivität
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Ausgangsstoffe zur Bildung der Nukleinsäuren
BiosyntheseN-haltigerheterocyclischerAromaten:
Purine:
und Pyrimidine:
Alkaloid-Biosynthese: aus Lys , Phe , Tyr , Trp , Nicotinsäure
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Wichtige Pyrimidine
DNA-Pyrimidine: Cytosin + ThyminRNA: Cytosin + Uracil
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Wichtige Purine
Adenin und Guanin in DNA und RNA
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Pyrimidine und Purine
Amino-substituierte Derivate der Pyrimidine und Purine
Hydroxy-substitutierte Pyrimidine und Purine existieren v.a. in Keto-Formen.
4-Aminopyrimidin 6-Aminopurin
HH NN NN
NNNN
HHHH
NNHH22
NN
NN
HH
HH
HHHH22NN
KetoEnol
HHNN
NN
NNNN
HH
HH
OOHH
HHNN NN
NN
HH
HH
OO
HHNN
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Alkaloide:
Coffein:
Kaffeebohnen 1-1,5%, getrockneter schwarzer Tee bis zu 5%, Guarana (bis 6,5%) Kakaobohnen (bis 0,2%)
TheobrominKakao 1,5 - 3%in Tee, ColanussMate
Theophyllin: "typisches" Alkaloid des grünen Tees
Chinin: Krampf-, Fiebersenkend v.a. bei Malaria Aus Chinarinde
Chinin
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Nicotinerge Acetylcholinrezeptoren und Insektizide
besetzt Acetylcholin-Rezeptoren
Sterische Ähnlichkeit zu ACh
Erregungsübertragung:
Erregung der sympathischen und parasympathischen Nerven
Ausschüttung von Noradrenalin und Adrenalin
in höheren Dosen: Rezeptoren ständig besetzt
verhindert weitere Erregung durch natürliches Acetylcholin
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Alkaloid-Pflanzen
NachtschattengewächseTropanalkaloide (typisch f. Solanaceen)
bei inneren Krankheiten und Augenheilkundewirken auf glatte Muskulatur Krampflösend Spezif. Wirkung d abhängig vom Verhältnis zw. Atropingehalt : Scopolamingehalt
Schwarze Tollkirsche (Atropa bella-donna L., A: Scopolamin, Hyoscyamin, Atropin, ApoatropinSchwarzes Bilsenkraut (Hyoscyamus niger L., : Scopolamin, Hyoscyamin, Atropin) Gemeiner Stechapfel (Datura stramonium L., A: Scopolamin, Atropin, Hyoscyamin), Alraune (Mandragora Officinarum L., A: Scopolamin, Hyoscyamin, Mandragorin).
Schlafmohn (Papaver somniferum L., A: Morphin, Codein, Thebain, Papaverin, Narvein). Schmerzstillend hustenstillend krampflösend
Mutterkorn (Claviceps purpurea) Behandlung von Nervenkrankheiten.
Weißer Germer (Veratrum album L.),
Herbstzeitlose (Colchicium autumnale L.)
blauer Eisenhut (Aconitum napellus L.)
großes Schöllkraut (Chelidonium majus L.)
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Nucleoside Klassische strukturelle Definition:
Nucleosid = Pyrimidin o. Purin- N-glycosid von: D-Ribofuranose oder 2-Deoxy-D-Ribofuranose.
Ausweitung der Def. auf Purine oder Pyrimidin-N-glycoside
von fast allen Kohlehydraten.
Purin oder Pyrimidin- Teil eines Nucleosides =
“Purin oder Pyrimidin-Base”
Adenosin Cytidin Guanosin Thymidin
Uridin: RNA (Base = Uracil)
2-Deoxy-Analogon
DNA
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Adenosin Triphosphat (AMP, ADP ATP)
Die NukleotideATP, CTP, GTP, TTP sind notwendig für
Energie-Haushalt uPhosphorylierung
dienen auch als Cofaktoren beienzymatischen Reaktionen
ATP: ein prominentes Nucleotid:Nucleotide = Phosphorsäure-Ester von Nucleosiden
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CytokinineCytokinine – Die WurzelhormoneEntdeckt durch Folke Skoog im Labor .. Cytokinin-Biosynthese: Mehrere Wege
Cytokinine Cytokinine Cytokinine
AdeninPhosphoribosyl-Transferase
5´- Nucleotidase
AdensosinKinase
AdenosinNucleosidase
AdenosinPhosphorylase
Nucleotid- Nucleosid- Freie- Basen-
z.B.: Kinetin
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ATP und Phosphorylierung
ATP +
1. Schritt imGlucose-Stoffwechsel
ADP +
Hexokinase
HOCH2O
OHHOHO
HO
O
OHHO
HOHO(HO)2POCH2
O
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Hydrolyse des ATP
= die Thermodynamik biologischer Prozesse.
ΔG beschreibt: ob eine Reaktion Energie freisetzt ( exergonisch)oder Energiezufuhr benötigt ( endergonisch)
Wichtig ist der “Freie Energie Wechsel” (ΔG):wenn ΔG negativ ist -> Spontane Reaktionwenn delta G = 0 ist -> Reaktionsgleichgewichtwenn ΔG positiv ist -> keine spontane Reaktion
ΔG°' für die Hydrolyse des ATP zu ADP = –31 kJ/mol
ATP: eine“hoch-energetische" Verbindung: im Vergl. zu ADP + HPO42–.
Umwandlung von ATP in ADP: Kopplung mit anderen Prozessen
Lieferung v. EnergieUmwandlung des endergonischen Prozess exergonischer Prozess
ATP + H2O ADP + HPO42–
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Glutaminsäure Glutamin
Reaktion in Verbindung mit derHydrolyse von ATP: exergonisch
+ NH4+–OCCH2CH2CHCO–
+NH3
O O
+ ATP
ΔG°' = -31 +14 kJ= -17 kJ
+ HPO42–H2NCCH2CH2CHCO–
+NH3
O O
+ ADP
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Phosphodiester, Oligonukleotide und Polynukleotide- Das Trinukleotid GAC
PhosphodiesterBindg. zw. 3' des einen Nt und 5' des nächsten Nts.
Freie 3´u. 5' Enden
freies 5' Ende
freies 3' Ende
C
G
A
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Basen-Paarung
Watson and Crick: komplementäre Wasserstoffbrückenbindungen
2-Deoxyribose2-Deoxyribose
AT
NNN
N NH
H
NN
O CH3
O
H
2-Deoxyribose
2-Deoxyribose
G C
NNN
N O
NH
H
HN
N
N
O
HH
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HistoneTertiär-Struktur der DNA: Supercoils
Generelle Tendenz zum ´coiling´Proteine, sog. Histone bewirken effizientes ´coiling´ der DNA
Histone im ZellkernHistone: reich an basischen Aminosäuren (Lysin und Arginin).Histone: bei biologischen pH positiv geladen.
DNA ist negativ geladenDNA windet sich um Histonproteine um Nucleosomen zu formen.
Ein Nucleosom bindet ca. 146 BasenpaareDer Linker enthält ca. 50 Basenpaare
Nucleosom
DNA
Linker-DNA
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Von der Helix zum Chromosom
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Die DNA Polymerase dockt an einemStrang an und synthesisiert einenkontinuierlichen neuen Strang.
Die DNA Polymerase die am Gegenstrang andockt, synthesisiert nur kurze DNA Segmente.
DNA PolymeraseNeuer Strang
ParentaleDoppelhelix
ReplikationsgabelDNA Helicase
DNA Replikation
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Sequenzierung nach Sanger:
ddAddA ddTddT ddGddG ddCddC
TT AA
TTGG AACC
TTGGAA AACCTT
TTGGAACC AACCTTGG
TTGGAACCAA AACCTTGGTT
TTGGAACCAATT AACCTTGGTTAA
TTGGAACCAATTAA AACCTTGGTTAATT
TTGGAACCAATTAACC AACCTTGGTTAATTGG
TTGGAACCAATTAACCGG AACCTTGGTTAATTGGCC
TTGGAACCAATTAACCGGTT AACCTTGGTTAATTGGCCAA
Sequenz des Fragments
Sequenz derOriginal-DNA
Modif. NTPs
Lauf
richt
ung
derA
uftr
ennu
ng
Fluoreszenz-markierte Didesoxy-NTPs Kettenabbruch
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PCR Polymerase Chain Reaction (PCR
1. Denaturieren
2. Annealing("priming")
´
3. Synthese
“Extension" oder
“Elongation“
Zielregion
95°C
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Elongation
PCR
Gel-Elektrophorese nach PCR
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Transkription
Ermöglicht der Pflanze die Situationsgerechte Reaktion auf wechselnde Umwelt-Bedingungen. Z.B.
Nährstoff-Mangel (Bsp. Siderophor-Bildung) Trockenstress Pathogen-Befall etc.
Transkriptionskontrolle setzt am Promotor an
DNA
TranskribierterBereich
RNA
Promotor polyA Signal
Kodierbereich
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Agrobakterien
Acetosyringonaktiviert Virulenz-gene
Vir Proteine synthetisieren ssTDNA
Opinesynthetisiert Von Agrobact.
Einzelstrang-T-DNAIntermediat
Verwundete PflanzenzelleproduziertAcetosyringon
AgrobacteriumTi -Plasmidca. 200 kbp
T-DNA
VirRegion
T-DNA an zufälliger Stelle in Kern-DNAintegriert
Auxin und Cytokinin-Syntheseverursacht Tumor-Bildung in A.t. infiziertenPflanzenzellen
AuxinSynthese
Cytokinin-Synthese
OpinSynthese
Gesunde Zelle einer anfälligen Pflanze
T-DNA Import und Integration in Kern-DNA
T-DNA Transfer
Acetosyringon