牧場活動記2012

統合牧場RAえまさん

自己紹介

•えまさん

•TwitterID:@E_in_the_field

•2012年2月から参加入牧

自己紹介

•東京工業大学生命理工学部生命科学科２年

•大岡山→すずかけ台(イメージ図)

http://www.flickr.com/photos/sekido/4059934575/sizes/z/ http://www.flickr.com/photos/aigle_dore/7426885742/sizes/z/

統合牧場を知ったわけ

http://www.flickr.com/photos/lylesmu102/5904886715/

珍しく最前列に座って聞いていた授業で先生に紹介される

作成した統合TV

ArrayExpressInParanoid

OpenRefine

ArrayExpress

Atlas of Gene Expressionでは、検索した遺伝子がどの生物の

どの組織でどれくらい発現しているかを調べることができる

ArrayExpress

•牧場での初仕事、旧作アップデート版

•制作開始時は発現量やマイクロアレイの原理についても分かっていない状態

InParanoid

2種の生物間の相同遺伝子を、生物名、遺伝子名などから

調べることができる

InParanoid

•まったくの新作、InParanoidについて勉強しながら作成

•遺伝子についてかなり勉強になった

OpenRefine

ライフサイエンス分野にとどまらない

さまざまなデータをきれいに整理・整形できる

OpenRefine

•新作、ツールのチュートリアルを参考に生物データを用いた解説を作成

•マイナーだが用途の広い便利なツール

ツイッタラーの皆様、パソコンか携帯を開いてください！

①ツイッターを開きます

②検索欄に

と入力して検索しますtogotv_bot

③フォローボタンをクリックします

@togotv_bot

•昼間はランキングから統合TVを紹介

•夜間はランダムに統合TVを紹介

従来：ツールの使い方を知るために統合TVを見る

英語??専門用語??使い方わからない!

ම統合TVを見て使い方がわかった!

新提案：botから統合TVを見てツールの存在を知る

昨日のランキング1位?このツールなんだろう？

ම自分の研究に使えるかも！

（現状：牧場関係者がランキングの内容を楽しむ）

今後の展望

•OpenRefineの発展的な解説の統合TVを作る

•統合TVbotの拡充？（要望・意見募集中です！）

•TV作成以外のお仕事にも手を出してみたい