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2 Genética de Poblaciones, Acuña Alonzo

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Genética y poblaciones

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  • 2. Genetica de poblaciones humanas y antropologia ffsica

    "Victor AcuiiaA19:OzO

    EI campo de estudio de Ia genetica antropo16gica ,

    La genetica antropol6gica se dedica al esnidio de la variabilidad

    genetica'de las poblaciones humanas, A diferencia de' arras areas de la genetica,se basamas en elmetodo,comparativo ,que en el experimental, por 10 quela investigaci6n de campo es su esencia y la interacci6ri con otras areas antropol6gicas es crucial. Ensu metodolog{a confluye en parte con la antfopologia dernogr;ffica y

    , sus aplicaciones iricluyenla epidemiologfa genetica y las ciencias forenses. En mucho~ aspectos Ia genetica antropol6gica es de

    , caracter hist6rico, en d sentido de que a traves del estudio de los ,pattones de variaci6n,de ciertos marcadoresgeneticos se pueden, abordar fen6menos demograflcos delpasado. De manera muy general, los temas principales dentro de este campo de estudio son el origen del Homo sapiens, la dispersion de las poblaciones humanas y la relaci6n de 1 .. variaci6n genetica con la adaptaci6n a diferentes presiones selectivas del ambiente.

    SegunMichael Cra~ford [2000)"frente a la genetica humana (realizada predominantemente desde las ciencias biomedicas),

    r

  • VICTOR ACUl'IA ALONZO

    la genetica antropol6gica se distingue por la perspectiva biocultural y por un muestreo poblacional, delimitado socioculturalmente y enfucado en la variad6n normal.

    Aunque la genetica oficialmente "nace" a finales del siglo XIX, el campo de 1a genetica humana se desarro1l6~nla segunda mitad del siglo xxyfue en ese contexte cuando investigadores como Roberts"Lasker, Livingstone y Pollitzer aplicaron la Teoda de la Genetica de pobladones a temas de interes antrcipol6gico [Crawford, 2000]. A mediados de la decada de 1960 y prindpalmente en los setenta. diferentes investigadones de primer nivel consolidan el campo de Ia genetica antropol6gica, empleando para ello polimorfismos de protdnas y cuantificando otras variables fisiol6gicas, geograficas y culturales.

    Cuadro I Genwca antropo16gica Genetica hurnana Perspectiva bioeultural amplia de las interacdones genes-ambiente

    Mecanismos y procesos, parcicularmente en eI estudio de la enfermedad

    Enfoque pobladonal, uso de las genealogfas para medir heredabilidad

    Familias de los casos, gemelos y familias de gemelos.

    Poblaciones peq1,lcfias y, aisladas repr()~ , duetivamente. con 'freeuend:u. "no oeddentales"

    " P~bladon~s urbanas y muestras clfnicas

    Pobladones definidas culturalmehte Las muestras pueden ser heterogeneas en 10 que tespeeta a: etnicidad y faetores sodoecon6micos

    Muestreo ,representativo de, la variad6n normal en ,una poblad6n Muestras obtenidas en COntextos clfnicos

    Intentos de ,caraeterizar y medir el am-, biente

    La variaci6n ambiental raramente es evaluada

    Estudio de la variad6n normal en rasgos complejos Dieotomfa enfermedad vs normalidad

    Diferencias en la aproximaciones met;dollSgicas entre la ant~pol6gica y la genetica humana (adaptado de Crawford [2000]),

    Desde prindpios de los sesenta, James Neel yFrandsco Salzano trabajaron con mtiltiplesgrupos indigenas aislados de Sudamerica como los xavante [Neel et at., 1964]. Su trabajo se extendi6 hasta el presente, y dieron a conocer los prindpales patrones de variaci6n 'genetica de las poblaciones amerindias, asi como aspectos demograficos y epidemiol6gicos. Francisco Salzano. sigue siendo una autoridad en

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  • LA COMPLEJIDAD DE LA ANTROPOLOGfA FislCA GEN~TICA DEPOBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOGtA FlslCA

    la genetica de poblaciones en Latinoamerica, ha publicado lasprincipales obras compilatorias acerca de la genetica de los indigenas sudamericanos (South Ameri~ can Indians: A Case Study in Evo[u#on), as! como de las poblaciones latinoamericanas en general (The Evolution and Genetics ofLatin American Populations);

    Luigi Cavalli-Sforza fue unos de los primeros cientfficos que compil6 de manera ex.haustiva frecuencias genicas de poblaciones de todo el mundo y las us6 para calcular distancias geneticas y realizar mapas, con la idea de que la variaci6n genetica humana es un reflejo de la historia evolutiva de nuestra especie [CavalliSfOrza, 1966]. En su trabajo de campo con pigmeos en Africa,estudi6 aspectos demognificos, geneticos y metab6licos [v. -Cavalli-Sforza et a/., 1969]. En 1994, Cavalli Sforzapublic61a principal obra de genetica antropo16gica: The History and Geography ofthe Human Genes.

    En Mexico es necesario destacar la obra del doctor Ruben Lisker; quien estudi6 variantes de proteinas plasmaticas, grupos sangu!neos y antfgenos de leucocitos en poblaciones indfgenas, afromestizas y mestizas, obras que a pesar del enfoque medico se podrian considerar como los primeros trabajos de genetica antropol6gica en Mexico [v. Rodriguez eta/., 1962; Lisker, 1963; Lisker eta/., 1969]. Gran parte del trabajo del doctor Lisker y de otros autores aparece compilado en su obra La estructura geneticade la poblaciOn mexicana. Aspectos medicos y antropolOgicos, la cual fue publicada en 1981 y hasta lafecha no hay obra que cqntenga los principales resultados de genecica de poblaciones en Mexico.

    MiChael Crawford realiz6 otra:s de las primeras investigaciones con la esen-. cia de 10 que actualmente se entiende por genetica antropo16gica. Su principal aporte fue un vasto trabajo acerca de las poblaciones tlaxcaltecas a prim:ipios de los setenta que dio lugar a la publicaci6n de la obra The Tlaxcaltecans: Prehistory, Demography, Morphology and Genetics, as! como otraspublicadones posteriores. Ademas public6 Antropologia biolOgica de los indios americanos, un libro de referencia para entender la variabilidad biol6gica, los orfgenesyla historia demografica de indfgenas americanos.

    Quiza la aportaci6n mas impqrtante de la genetica antropo16gica ha sido enfatizar la necesidad deentender a la biodiversidad humana mediante el uso de categodas poblacionales y metodos cuantitativos, en lugarde usar macrocategodas radales, metodqs cualitativos y tipol6gicos. Un trabajo fundamental en el entendimiento de la variaci6n genetica entre y dentro de las pobladones humanas fue el de Richard Lewontin [1972], quien demostr6 que de la varia

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  • VICTOR ACU,I'lA ALONZO

    cion geneticaentre hutnanos es menos del 0%, atribliible a: la comparadon entre Hrazas'>.

    A mediados de lbsochenta, 'el uso de marcadores a nivel de DNA permitio la reconstruccion de la filogenia humana con gran predsion y Ia determinadon de tiempos de divergenda entre pobladones humanas y hada otras espedesprimates. De eSt0s' trabajos destacapor su repercusion el anaIisis de la variabilidad del DNA mitocondrialen las pobladones contemponineas, realizado pot Cann, Stoneking y Wilson [1987], el cual es un trabajo de referenda en cualquier discusion sobre el 6rigen del hombre.

    La bi6divefsidad es una co'ndicion interactivay dinamica que dene un componeilte de variadon genetico en casi todossus aspectos; dado que la antropologia fisica estudia la biodiversidad humana desde una perspectiva evoludonista, la genetieaantropologica es impottante en milchos de sus campos de estudio yaplicadon: Iivariadon en los patrones de crecimiento y desarrollo entre las pobhiciones y entre individuos tiene un' componentegenetico; la dieta de las pobladonesihumanas es un ejemplo de coevolucion de genes ycultura en escenarios ambientales particulares. La variaci6n en los patrone~ de salud de las poblaciones depende en 'derta medida de la variadon genetica.

    Porotra 'parte, el conocimierito del componente genetico de las capacidades , espedficas de Homo sapiens se ha incrementado notablemente en los Ultimos afios yes uno de los campos de estudio mas apasionantes ya que, ademas del interes biologico, contiene unacontribucion destacada al problema filosofico y anrropologico de la naturaleza humana. El estudio de la genetica de las poblaciones hurnanas es importante no s6lo en temas'cIasicos y apasionantesde ta antropologfa biol6gica, sino casi en cualquiet rama antropologica, pues conduce a una discusi6nprofunda y seria de laS cuestioneshumanas.

    Metodos usados engeneticaantropo16gica , La tarea basica de los estudios de genetica antropo16gica es caracterizar el pool genetico (acervo genetico) de las poblaciones humanas mediante el caIculo de las frecuendas alelicas de marcadores polim6rficos. Inicialmente, esto se realiz6 mediante el uso de grupos sangufneos (productos secundarios delgen) y/o protefnas (productos primarios delgen); tras el descubrimiento de1a elecrroforesisy su apli~ cad6n para la determinaci6n de pblimorfismos se constat6la riqueza de la variad6n humana y se alter6 de manera dramatica la forma de cuantificar la variadon en el

  • LA COMPLEJJDIU) DE LA ANTROPOLOGlA P!SJCA

    GENETICA DE POBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOGlA FlsICA

    genoma humano [Crawford, 2000J. En la actualidad, la tecnologla de secuenciaci6n automatica y el desarrollo de potentes herramientas bioinformaticas ha dado un nuevo giro a la investigaci6n de la variaci6n genetica al permitir analizar miles de polimorfismos en cientos de muestras en cuestion dehoras.

    Unavez que se ha construido el tema de interes, se ha determinadoque poblacion se,quiere investigar y que marca,dores geneticos se van a emplear, la investigacion en genetica antropo16gica pasapor lassiguientes etapas:

    Disefio del muestreo. Es la parte fundamental de to cia investigaci6n ya que de ella dependera el resto del proceso. En esta etapa debe delirnitarse la poblaci6n 0 grupo social, las caracterfsticas de la muestra de acuerdo con el numero de individuospartidpantes, edades, sexo, parentesco; fuctoressocioculturales, etc. Con base en la informacion, que se registrara en campo sedesignaran las variables y se desarrollaran instrumentos como cuestionarios y encuestas. Los estudios que, ademas de inve~tigar la estructura poblacional, indaguen'las interacciones genesambiente en rasgos complejos, implicaran mayor inversion en el disefio.

    Toma de muestras. Hay distintas opciones para la wma de muestras, se puede trabajar con cualquier muestra que contenga DNA (sangre, cabello, saliva) pero la eleccion dependera de los recursos, de losprotocolos del lab oratorio donde se realice la extraccion del material genetico y de aspectos como ladisponibilidad de los individuos a donar muestras ,mediante procedimientos invasivos. Por cuestiones eticasson preferibles los metodos noinvasivos (cabello y saliva), sin embargo, proporcionan una cantidad menor de material genetico. Un aspecto fundamental de la toma de muestras es el consentimiento informado. Es importante sefialar que losestudios de genetica antropologica no implican necesaria 0 exclusivamente trabajar con muestras biologicas, ya que hay metodos cuantitatives donde se utilizan fenotipos simples y complejos.

    , Trabajo delaboratorio. De la cantidad y calidad del DNA que se recupere de las muestras dependera la cantidad y el tipo de polimorfismos que se pueden analizar, pero por 10 general se estima que, en condiciones ideales, a partir de

    ,unos 5 ml de sangre se obtiene suficiente DNA para analizar mas de 3 mil polimorfismos. Si las muestras,de DNA se tratan ,adecuadamente y se conservan a baja temperatura (-70C), estas pueden permanecer estables por alios para su uso futuro. La extraccion del DNA se realiza con diferentes protocol os que pueden usar solventes, detergentes y/o enzimas proteoHticas, por 10 general,el proceso

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  • de extracci6n consta de varios pasos de centrifugaci6n y lavados en los que lisan los eritrocitos y se obtiene un pelet de leucocitos a partir de los cualrs extrae y purifica el DNA. Tanto para la toma de muestras como para el proceso; de extraccion hay una numerosa oferta de kits comerciales que se ajustan a todo tipo de necesidades en el trabajo de campo y de laboratorio y que simplifican los procesos.

    Pata la tipificacion. de polimorfismos se emplea la tecnologfa de la reaccion en cadena de la polimerasa (PCR) que permite la replicaci6n in vitro de fragmentos espedficos de DNA. La PCR se basa en las propiedades funcionales naturales de enzimas llamadas polimerasas. La tecnica consiste en varios cidos (30 0 40), ada uno de los cuales tiene las siguiente fases:

    1. Desnaturalizaci6n: aplicaci6n detemperaturaselevadas (90 a 95C) para rqmper los puentes de hidr6geno,del DNA, separat la doble hebra y obtener una hebra sencilla.

    2. Hibridacion (annealing): se disminuye la temperatura (entre 40 a 6o-C) para hacer posible que los primers se unan a las secuencias del fragmento que se va amplificar:

    3. Extensi6n:a una temperatura de 72"C, 1a Taq polimerasa incorporanucle6tidos en el extremo 3' del primer, siguiendo la secuenci~ de la cadena de DNA desnaturalizada. El siguientepaso en la determinaci6n de los polimorfismosimplica la electroforesis ola secuenciaci6n automatica.

    Andlisis de los datos. En primer lugar se describe la estructura poblacional encuanto a las frecuencias de los p0limorfismos, la diversidad qelamuestra, la proporci6n de heterocigotos y homocigotos y otros parametros como los de interes forense en caso que se estudien microsatelites. EI siguiente nivel de analisis depende de los objetivos de la investigacion, que por 10 general son de caracter comparativo. Los mas usados son las distancias biol6gicas, lasestimaciones de mestizaje yel analisis multiv~iado. En el caso del analisis de interacciones ge~es-ambiente puede ser necesario hacer analisis de covariaci6n, regresi6n multiple,etcetera.

    InterpretaciOn de los resultados. Finalmente los datos se interpretan de acuerdo con un conjunto de datos mas amplio que los datos geneticos y que por general implica evidencia arqueologica, hist6rica, demografica y etnografica.

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  • LA COMPLEJIDAD DE LA ANTROPOLOGIA FISICA GENETICA DE POBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOclA FlsICA

    Ejemplo: e1estudio del mestizajeen poblacioneslatinoamericanas con marcadoresbi y uniparentales ' EI estudio del mestizaje es una de las areas mas importantes en e1 campo actual de 1a genetica antropo1ogica en Latinoamerica. Las estimaciones de mestizaje, con marcadores clasicos en poblaciones latinoamericanas, mostraron un extraordinariamente diverso mosaico geneticoenel que la mezcla de poblaciones americanas, europeas y africanas se produjo en funci6n de la historia particular de cada region, ya que los componentes se fusionaronen mayor 0 menor medida, segun la proporcion de cada grupo etniCo y de varones y mujeres dentrode cada grupo, ademas de factores sociocu1turales.

    Enalgunas regiones los europeos, africanos e indigenas se "diluyeron" en una poblacion hfbrida, en otras, los componentes ancestrales aun son identificables y conservan su identidad etnica. Pocos grupos se mantuvieron completamente aislados.Lisker [1981], Lisker et aL [1996] yZavala et al. [1982] en Mexico, y Salzano [1988] en Sudamerica, argumentan que casi todos los grupos indigenas presentan algun grado de mestizaje con europeos y/o africanos. En America Latina y en d ambito Estado-nacion, los resultados han sido bastante distintos, hay quienes hablan de naciones predominantemente euromestizas como Argentina y Uruguay, aJi'omestizas como Brasil, indomestizas como Mexico y Peru, etc. Pero hay que ser muy cuidadosos al categorizar de esta forma, pues podemos caer en un gran error si ignoramos las diferencias dentro de cada pais.

    E! auge en Latinoamerica de las investigaciones con polimorfismos de DNA y con marcadores uniparentales ha enriquecidoampliamente la aportacion de la genetica antropologica a la historia del mestizaje. En el Tabla 2 se pueden c~nsultar los resultados de estos trabajos respecto a las estimaciones de las aportaciones ancestrales con marcadores biparentales (autosomicos) y uniparentales Clinajes paternas y maternos). En conjunto, los datos muestran que hubo un patron de Iujo . genico desigual respecto al sexo, en el que la mayoria de los genes obtenidos por vIa materna eran ind~genas, "testigos"; 1a mayoda de los genes heredados por via paterna eran "transplantados" Cal ser europeos 0 africanos); y los autonomicos, los genes "nuevos", resuItado de la combinacion de varios acervos geneticos ancestrales (adjetivos usados por Bortolini et al. [2004]).

    Un ejemp10de la extraordinaria complejidad y diversidad de la estructura genetica de las poblaciones latinoamericanas es patente a traves de los estudios de genetica antropo1ogica realizados en Colombia, en donde en una muestra de An

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  • VICTOR ACUilA ALONW

    tioquia [Carvajal et aL, 2000]; se constatan patrones de flujo genico muy diferen" tes para Hnajes paternos y maternos: en el cromosoma Y 94% de los bloques geneticos fueron europeos, 5% africanos y 1 % amerindio, mientras que para el DNA mitoeondrial la contribuciOn amerindia fue de 90%. Estos resultados impliean un patron de mestizaje muy fuerte entre:varones de origen europeo y mujeres indigenas. El estudiode poblaciones indigenas en Colombia [Mesa et at., 2000] ha revelado que con frecuenda estas tienen aportacion genetica no amerindia, 10 eual se debe principalmente al flujo genico por via mascuiina, tal como 10 indica la presencia de linajes europeos y africanos en el cromosoma Y.

    Otro pais que destaea poruna extraordinada complejidad y diversidad es BrasiL Pena et aL [2000] estudiaron marcadoresdel cromosoma Yy de DNA mitocondrial en poblacion autoidentiflcada como "blanca" de diversas regiones de Brasil y se compararon con datos_de poblacion port,uguesa. Sorprendentemente, los resultados obtenidos mostraban que solo 39% de los linajes maternoseran de origen europeo, siendo 33% de origen amerindio y 28% de origen africano. Las frecuencias de los haplogrupos del cromosoma y fueron muy diferentes, puesmostraron una presencia minima de cromosomas de Africa subsahariana (2%) yamerindios (0); y una alta frecuencia de cromosomas Yeuropeos (entre ,66 y 90%). Estos datos claramente indican un patron de reproduccion direccional: en la poblacion "blanca" brasileiia la mayoda de los linajes maternos sonafricanos 0 amerindios, mie~tra~ que la gran ~ayoda de los linajes masculinos son europeos.

    En Venezuela, Castro et al. [2003] estudiaron tres poblacionesfundadas por migrantes procedentes de las Islas Canarias. Los resultados indican tambien un emparejamiento direccional, pues las estimaciones calculadascon datos de marca~ dores autosomicos demuestran que hubo mestizaje en grados variables con amerindios y africanos, pero las estimaciones obtenidas por el analisis del cromosoma Yno indican ningun gradode mestizaje, 10 que signiflca que los genes amerindios y africanos fueron aportados principal mente por mujeres.

    Un easo especial es el de las poblaciones'de afrodescendientes las cuales muestran tambien niveles importantes de mezcla y de flujo genetico direccional, como la introduecion de genes europeos por via masculina [Bortolini et aL, 1999]. La ciudad de Melo, en el noreste de Uruguay, es un caso de particular interes ya que muestra ladiflcultad de establecergeneralizaciones acerca de la composici6n generica de un pais (suele considerarse a Uruguay como un pais de eurodescendientes). Esta poblaci6n fue fundada en 1795 por lusobrasilefios durante eldominio

  • LA COMPLEJIDAD DE LA ANl'ROPOLOGIA FISICA GENETICA DE POBLACIONES HUMANAS,Y ANTROPOLOG1A flsICA

    portugues de Uruguay (1814-1828) yconserva poblacion afro mestiza. Sans et al [2002] realizaron las siguientes estimaciones,de contribucion ancestral: 47% africano, 38% europeo y 15% amerindio, con marcadores autos6micos; 52% africano, 19% europeo y 29% amerindio, en linajes de DNA mitocondrial; y 30% africano, 64% europeo y 6% amerindio, en el cromosoma Y. Estos datos revelan una mayor contribuciori amerindia por via femenina y una mayor contribucion europea por VIa masculina.

    En 2006, un grupo de investigadores,dirigido por el doctor Esteban Parra, de laVniversidad de Toronto, realizo un estudio de mestizaje en la Ciudad de Mexico con poblacion normal y pacientes con diabetes. Mediante el estudio de 69 marca- \ dores informativos de ancestria(AIMs) aui9S0;nico~,pti~ieron realizar estimaci6nes de mestizaje para cada individuo y compararlas con diferentes variables, asi como detectar estratificacion poblacional. AI correlacionar lasestimaciones de mestizaje individuales con el nivel de educaci6n, se encont'r6 una relaci6n, entre el nivel academico mas alto y una mayor eontribucion europea. Este dato indica que, de algun modo, se mantlene la relacion de desigualdad sodal entre grup~s'geneticamente diferentes que tiene su origen historico en la Colonia: "Esta asodacion de estatus socioeconomico con laproporcion de mestizaje individual muestra que la

    es~ratificad6n genetica en esta poblacion es paralela, y posiblemente mantenida por la estratificacion socioeconomica'. Por otra parte, el contraste entre las estimaciones de mestizaje con datos autosomicos y las estimaciones con marcadores uniparentales muesfran, como en otras pobladones latinoamericanas, que el proceso de mestizaje fue muy desigual respecto al sexo.

    En conjunto, estos datos dibujan un panorama de gran complejidad etnica y genetica en Latinoameric;a, donde el proceso historico de mestizaje implico el

    '

    Iujo,

    geneticodesigual respecto al sexo, 10 que ha originado combinaciones y grados de mestizaje regionalesparticulares, creando ademas subestructuras poblacionales locales quedeben tomarse en cuenta tanto en estudios epidemiologicos como en las aplicaciones forenses de los marcadores geneticos.

    Conceptos bQsicos Poblacion Lo ideal seria definir una poblaci6n en terminos biologicos, como un conjunto de individuos que forman una red social en la que se pueden dar relaciones de parentesco y que, por tener en comun cierta historia demogr~fica, tienen algu

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  • VICTOR Acul'lA ALONZO

    na afinidad genetica. Sin embargo, dado que estos eventos no son facilrriente observab1es (casi nunca se estudia la afinidad genetica sin antes haber definido la poblaci6n) y que en un mismo espacio suden convivir divers os grupos de individuos que potencialmente pueden ser considerados como poblaciones,en la practica se emplean muchos criterios para definira una poblaci6n, siendo casi todos ellos de indole cultural, como la lengua, la identidad, la elase social, etc.; geografico (compartir un mismo espacio 0 tener un lugar de origen comun), y biologico (con frecuencia se recurre al fenotipo como criterio para seleccionar a los individuos).

    Cuadro 2

    Poblaci6n

    Contribuci6n de los componentes (%) >>: ",.

    0...

    Mar~dores autos6micos (DNA y proteinas)

    linajes de mIDNA

    .. linajes de cromosomaY6

    Amer Bur Afr Amer Bur Afr Amer Bur Afr Region andina, P

  • LA COMPLE/IDAD DE LA ANTltOPOLOGIA FislCA GENETleA DE pOBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOG!A F!SICA

    Cuadro 2 (Continuacion) Curiepe,

    70.4 0 20 80 0 Venezuela 6.4 23.2 0 100 (AP) 0.4 3 3 Birongo, Venezuela 24.6 15.3 60.1 100 0 0 0 .93 7 (AP) Sotillo, Vene 13.4 25.6 61 56 0 44 0 51 49zuela (AP) Panaquire, I Venezuela 26 19 55 25 0 75 38 62 0 (AP) Embera, 95 -Colombia 79 0 21 100 0-5 0-5 75 14 11 (AM) Ingano, 96 -Colombia 69 0 31 100 0-4 0-4 80 20 0 (AM) .

    : Ticuna, ~ Colombia 100 0 0 100 0 0 97 :3 0, 7 (AM) Wayuu, Colombia 82 0 18 100 0 0 48 46 6 (AM) Zenu,

    i 95 -Colombia 75 18 7 100 0-5 0-5 35 62 3 (AM) Antioquia, 90 n/c n/e 1 94 5 8Colombia

    Brasil (E) 33 39 28 0 66 - 2.5 990 San Antonio, 8 Venezuela t 88 4 0 100 0

    San Diego, 8 78 14 0 100 0Venezuela t i 10 H. de la I Cumbre, 8 92 0 0 100 0 i Venezuela t Valle Central, Costa 83 nlc nle 6 86 7 11 Rica I

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  • VICTOR ACUNA ALONZO

    Ciudadde M6dco, Mexico

    65 30

    Cuadro 2 (Contiullaci6n)

    5 90.5 ~7.5 0 40 60 n/e 12

    Mestiza)e en pobladones latinoamericanas estimado con marcadores autos6micos, de DNA mitocondrial y de cromosoma y (evidencia de emparejamiento direccional). (AF) afromestizos; (AM) amerindios; (E) euromestizos. t Componente ell.ropeo evaluado con muestras de Canarias y Espafia n/c, no considerado. Reformcias: (1) Merriwether et at., [1997]; (2) Rodriguez Delfin L., Rubin de Celis V.E. y Zago M.A. "Estimativa da miscegenacao andina do Peru com base em marcadores de DNAmt e cromossomo Y." Gm Mot BioI. 21: 354 [en Sans, 2000]; (3) Dipierri et at. [1998]; (4) Sans [2000]: (5) Sans et at. [2002]: (6) Bortolini et at. [1999]: (7) Mesa et at. [2000]: (8)Carvajal et at. [2000]; (9)Pena et at. [2000J: Carvalho Silva et at. [2001]; Alves Silva etat. [20PO]; (0) Castro etal. [2003]: (ll) Carvajal et al. [2003]; (12) Martfnez Marignac et ai. [2006].

    Raza En su sentido bio16gico; se ha utilizado para clasificar a las pob1aciones en grandes areas geogcificas y su ap1icaci6n se basa en 1a observaci6n de caracterfsticas fenotf-' picas y culturales. Sin embargo, por 1a historia misma del uso del concepto, este ha sido muy criticado yen ciertos ambitos esta en desuso. En la actualidad es preferible considerar a 1a pob1aci6n como unidad de analisis.

    Mestizaje Se define como un evento en el que al menos dos pob1aciones estab1ecen contacto y flujo genetico, tras un periodo de aislamiento 10 suficientemente largo como para que sehayan diferenciado en sus frecuencias geneticas. E1 analisis del mestizaje consiste en ecuaciones que calcu1an el porcentaje de contribuci6n de cada poblaci6n ancestral en 1a pob1aci6n mestiza. Existen diferentes metodos matematicos y, aunque en esencia todos los que se usan actualmente son va1idos,puede haber diferencias en los calculos obtenidos por un metodo 0 por otro. Los resultados que se obtienen son estimaciones que poseen un derto rango de error. En un modelo trihibrido se necesitan cuatro poblaciones estudiadas: la poblaci6n mestiza y tres representativas de los componentes ancestrales. Obviamente, es muy importante que los marcadores usados en cada poblaci6n sean los mismos.

    Distancia biol6gica Es una tnedida que permite relacionar poblaciones intentando "describir afinidades interpoblacionales basadas en variables categ6ricas, como los somatotipos y los marcadores geneticos" [Chakraborty, 1986]. Diferentes caracteristicas se han

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  • ALONZO

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    LA COMPLEIIDAD DE LA ANTROPOLOGfA FisICA GENETICA DE POBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOGIA plSICA

    consideq.do para calcular distancias biologicas; podemos dividirlas en fenotipicas y genodpicas.

    1. Fenotlpicas: caracterfsticas morfologicas (como los rasgos epigeneticos del craneo{ los dentales, algunos (ndices antropometricos; dermatoglifds, entre otros).

    2. Genotipicas: Lascaracterfsticas genotfpicas poseen la ventaja de aportar . informacion mis precisa y confiable sobre las relaciones filogeneticas de las poblaciones, pero tienen el inconveniente de requerir mayon:s recursos y de no ser aplicables en muchos casos a restos oseos antiguos. Las princi. palesdificultades para un estudio de distanciasbiologicassuelenserlosta'

    . . . .~

    mafios de muestra, que en muchos estudios requerirfan ser mayo res para poder lograr que esta sea realrp.ente representativa, una yentaja de usar, variables morfologicas es que al ser menos costosas permiten ampliar el tamano muestral. Otro problema es la clasif1cacion previa que se haga de las muestras, ya que para def1nir a las poblaciones de estudio se siguen en muchos casos critedos lingufsticos 0 socioculturales, def1nidos a priori.

    Marcador genetico Secuencia de DNA del que se conocen localizacion, funcion -si la tiene- y modo de herencia y se utiliza para estudios de genetica a nivel individual 0 poblacionaL Segan los prop6sitos de cada investigacion se pueden usar distintos tipos de marcadoresde diferentes sistemas geneticos. A continuaci6n se present an algunas de las particularidades que los hacen diferentes y algunas caracterfsticas de aquellos que se usan en lagenetica.antropol6gica (con enfasis en los que han sido util.es en el estudio del mestizaje).

    A) Marcadores cldsicos: se obtienen por tecnicas inmunol6gicas (consistentes en observar la reaccion ante un antisuero de anticuerpos espedficos) 0 por tecnicas electroforeticas (basadas en la distinta movilidad de las protdnas debida a su carga electrica). Losgerres de grupos sangufneos, hemoglobinas, enzimas, inmunog"Jbulinas, haptoglobfnas ylos del sistema HLA (antfgenos de leucocitos humanos), entre otros, han sido estudiados frecuen'temente con tecnieasserologicas yelectroforeticas, pero en la actualidad tambien se estudian con tecnicas ~oleculares.

    177

  • VlcroR Acut'lA ALONZO'

    ( . A continuaci6n se enlistan los sistemas mas usados' considerados cIasi

    cos l , la informacion se obtuvo en su mayorfa de Lisker [1981] y Crawford ! [1992], donde se pueden obtener mayo res detalles de cada sistema. Algunos

    de los sistemas no estan caracterizados con la informaci6n mas ,reciente (de la era molecular), sin embargo, es sumamente uti! para poder interpretar los polimorfismos "clasicos". 1. Grupos sanguineos

    En d Cuadro 3 se enumeran los aldos (separados por comas) y los genes ligados2 (separados pOf punto y coma).

    1. Ant/genos eritrocitarios 0 grupos sangulneos: cuando se estudian con tecnicas inmunolOgicas se buscan en los eritrocitos, tambitn estan

    El A tiene dos variantes: el Al Y eI A2, pero la mayorla de los estudios los con;ideran uno s610. El hecho de que la gran mayoria de los amerindios sean 'del grupo sangufneo ohizo que este sistema fuera interesante para estudiar directarnente el grade de mestizaje con europeos de grupos

    A, B, O. amerindios (ver por ejemplo las estimaciones de Zavala et at. [1982]). Sin embargo, se ha sefialado que dado que se han presentado frecuenciaS para eI alelo A muy diferentes eh grupos amerindios en Norteamerica no puede considerarse que necesariamente este aldo haya sido transplantado con

    , [Crawford, 1992]. .

    ABO: 9q

    La presencia delalelo RH*RO (coe) en poblaciones americanas se ha atribuido a mestizaje con africanos, sin embargo,

    D, d; C, se ha encontrado en poblaciones siberianas aisladas, por 10Rh Ip c; E, e. que las estimaciones de mestizaje con africanos basadas en la

    frecucncia del RH*RO pueden sobreestimar la contribuci6n de dicho . [Crawford, 1992].

    1, Aunque, como se ha selialado, el calificativo de Cli3Sicos depende en ocasiones de c6mo se estudien. Asf, aunque el HLA se puede considerar como clasico por haber side estudiado con tecnicas inmuno16gicas, en la actualidad tambi!m se estudia con tecnicas moleculares y se ha descubierto un gran numero de pqlimorfismos.

    2. Genes que por su proximidad en un cromosoma setransmiten en bloque.

    178

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    LA COMPLEjlDAD DE LA ANTltOPOLOGlA .lsICA GENETICA DE POBLJ\CIONES HUMANAS Y ANTROPOLOG!A plSlCA

    Duffy: .

    Diego: .

    FY*A,

    FY*B

    DI*A, ,DI'i'B

    .EI aldo DI*A es poco frecuente en europeos y dene mayor frecuenda en asiaticosy amerindios.

    Kidd: 12p JK*A, JK*B EI alelo JK*Adene sus frec~encias mas altas en africanos.

    2. Hemoglobinas

    EI gen k dene una frecuenda entre 3 y 5% en europeos no mezelados y practicamente no existe en amerindios.

    Las variantes de la hemoglobina (Hb) han resultado de gran interes antropologico por su distribucion geografica y su relacion con ciertas enfermedades (hemoglobinopatfas y talasemias), los aIelos mas comunes son los siguientes (locus en el cromosoma 11): Hbg *A: codifica la variante normal de la hemoglobina humana.. , Hbts: codifica uria variante(Hb s) responsable de la anemia falCiforme. La relaci6n entre la Hbs y la malaria constituye el ejemplo .trulS claro de la acci6n de la selecci6n natural en humanos. Esta variante es mas frecuente en africanos y en sus descendientes en America: las frecuendas mas altas se han reportado en Surinam, Belice y las Bahamas [Salzano, 2001:217). Ademas, es comun encontrarla en poblaciones mestizas latinoamericanas. Hbtc: codifica otra variante frecuente en africanos.

    3. Enzimas eritrocitarias Glucosa~6-Fosfato Deshidrogenasa: se conocen mas ~e 100 variantes, dos de ellas son muy frecuentes a nivel mundial: B (frecuente en pobladones mediternineas), A (frecuente en pobhldones africanas). EI gen que codifica para estaenzima se encuentra en el cromosoma x.

    4. Proteinas plasmtiticas Haptoglobinas: dos lod: (l)cadenas.8 (16p), tiene los alelos HPA*l y HPA*2; y (2) cadenas K Alotipos de las inmunoglobulinas: sistemas Gm (14p) y Km. El sistema Gm es' de gran interes antropologico por la gran variabilidad en la fre..: cuenda de sus antfgenos (existen mas de 23).

    179

  • VICTOR ACUNA ALONZO

    Albtiminas.plq): acttian como amortigtiador del pH ycoritribuye~ mantener la viscosidad del plasma. La albtimina Mexico (ALB*MEX) es una var~ante mesoamericana y ha sido utilizada por Crawford et ai. [1981] para estudiar el grado de mestizaje de los garffunas de Beliee (afrocaribefios) con poblaciones amerindias centroamericanas (la variante no se encuentra en poblaciones amerindias de las Islas del Caribe ni de Sudamerica) .

    5. HLA Se considera al sistema HLA (antfgenos de leucocitos humanos) como cl sistema genetieo mas polim6rfico del ser humano (con mas de 150 antfgenos anivel de la proteina y aun mayor polimorfismo a nivel de secuencias de nucle6tidos). El sistema HLA forma parte del Complejo 9 Sistema Principal de Histocompatibilidad (MHC), se encuentra en el brazo corto del cromosoma 6 y la mayoria de sus genes codifican moIeculas involucradas en la respuesta inmune.

    B) Marcadores de DNA (sise obtiene una secuencia de las bases nitrogenadas de ciertas regiones mediante tecnicas moleculares): Los marcadores de DNA son mucho mas polim6rficos que los marcadores clasieos y ofrecen un mayor rendimiento para estudiar la diversidad humana. Por el tipo de polimorfismo . pueden ser:

    I.SNPS (Single nucleotidepolimorfims). Estos polimorfismos varian en un s6lo nucle6tido y constituyen la mayor fuente de variaci6n in.dividual en el genoma. En la actualidad existe un consorciointernacional dedieado a . la investigaci6n de estos polimorfismos (Hap Map) y de su relaci6n con enfermedades en poblaciones de todo el mundo; hasta 2002 se habian descubierto cerca de 2 millones de estos polimorfismos.3 Algunos SNPS tienen frecuencias altamente contrastantes entre poblaciones por 10 que se utilizan para anilisis de subestructuras de poblaci6n y de mestizaje. Se conocen como "marcadores informativos de ancestrla" (AIMS, Ancestry Informative Markers).

    3. http://snp.cshl.org

    180

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    LA COMPLEJIDAD DE LA AN'TROPOLOCIA FisICA GENETICA DE POBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOCJA FtSlCA

    2. Polimorfismos dei.nserdon:.1argos (LINE); 0 cortos (Alu)~ sec~enciasde aproximadamente 300 pares de bases que se 'encuentran en primates. La, pocafrecuencia con que ocurren estas inserciones hacen que algunas de estas secuencias (las que por ser mas recientes en la historia evolutiva del Homo sapiens sapiens son polimorficas en diferentes poblaciones) sean marcadores ideales para estudiar las relaciones entre las poblaciones, se les ha llamado "aldos espedficos de poblaciones" (PSAS, Population Espe- ' cific Alleles).

    3. STRS: Short tandem repeats 0 microsatelites. Polimorfismos de repeticiones cortas en tandem (contienen unidades repetidas de 2 a 6 pares). Son regiones de un gran polimorfismo, baja tasa de mutacion, herencia d~ tipo mendeliana y su amplificacion con tecnicas de peR, aSI como su tipificacion; suden ser factibles incluso en materiales degradados. Sus caracterfsticas y d hecho de que se consideren ,en los estandares para aplicaciones forenses los hacen unos de los polimorfismos mas interesante~y mas utilizados actualmente. Las repeticiones tetranucleotidas han sido las degidas por los genetistas porque pueden ser amplificadas mediante la tecnica de peR con mayor fidelidad que las repeticiones dirtucleotidas.

    4. VNTRS: 'Variable number oftandem repeats 0 minisatelites. Son polimorfismos de un numero variable de repeticiones de bases en tandem (contienen unidades repetidas de 9 a 80 pares de bases).

    Los marcadores del DNA mitoconclrial (mtDNA) tienen la particularidad de que no se r~combinan, tienen tasas de mutacion superiores a las del -DNA nuclear y de transmitirse por vIa materna. El mtDNA es una moleculacircular de 16 569 pares de bases de las cuales aproximada:mente 1 122 son no codificantes. En la mayoriade los estudios de genetica antropologica se estudian las regiones hipervariables (HRVI y HRvn), situadas en la region control (D-Loop). Existen haplotipos mitocondriales espedficos por regiones continentales que permiten realizar estudios de filogeograffa. E1 mtDNA ha sido una excelente herramienta para estudios de evoluci6n humana. Entre otras razones, ya que al no recombinarse, todos los cambios en su secuencia se deben ala acumulaci6n de mutaciones, ya que las tasas de mutaci6n son mayores en d DNA nuclear (especialmente en region control). Los principales haplogrupos (clados de haplotipos) son los siguientes:

    181

  • Comentarios finales .

    VICTOR ACUNA ALONZO

    En 2001, el Consordo de Secuenciaci6n del Ge~lOma Humano dio aconocer la secuencia completa de nuestro genoma (2.85 Gb4 y de 20 a 25 mil genes codificadores de protefnas). Sin embargo, conocer la secuencia de' nucleotidos de un individuo revela poco de.sus caracterfsticas; aun hay muchas preguntasacerca de la relacion entre la estructura y contenido del genoma y lascaracterfsticas de los organismos; asfcomo)a magnitud y significado de la vadaci6n genetica individual y poblacional. Uno de los grandes desafios de la genetica esrevelar el fundamentode la variaci6n funcional del genoma humano, en esesentido, el proyecto internacional Hap Map es una iniciativa que sin lugar a dudas aportara datos sumamente relevantes. Sin embargo, la genetica antropo16gica desempefiara tambien un papel importante y critico debido a ciertas ventajas metodologicas del trabajo de campo y la comparacion poblacional. La genetica antropol6gica dene dos temas fundamentales: la evoluci6n humana yla diversidad en las poblaciones actuales; desde estos dos ambitos contribuye a conocer la historia del genoma y su significado funcional.

    El alcance de la genetica va mas alla de 10 estrictamente cientffico, pues constituye ya una importante industria de alto impacto economico. Los avances en esta area se deben al desarrollo biotecnologico e inforntatico pero tam bien al desarrolfo de solidos modelos teo.ricos evolucionistas con fundamento matematico. El fmpetu de la genetica, su popularidad yel alto estatus que goza (capaz ahora de conocer

    4, Miles de millones de nucle6tidos.

    182

    africano L

    Se ha propuesto que e.1 haplogrupo X llego a America por Europa y no por via asiatica.

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    LA COMPLEJIDAD DE LA ANTROPOLOGiA FiSICA GEN~T[CA DE POBLACIONES HUMANAS Y ANTROPOLOGIA FlslCA

    y manipular organismos anivel del genoma), lleva a que algunos de sus juicios puedan convertirsefacilmenteen dogmas.

    Los antropOlogos deben tener un buen conocimiento de genetica porque 1) pueden participar criticamente en la interpretacion del conocimiento que produce y en el debate que se pueda suscitar por sus aplicadones, y 2) es un area de trabajo imprescindible para entender muchos aspectos de la variadon humana.

    Al plantear' estos problemas se sugiere que el estudio de la genetica es importante en antropologfa, no solo en temas chisicos y apasionantes de la antropologfa biologica, sino casien cualquier rama antropologica, ya que permite una discusion profunda y seria de cuestiones humanas y ademas, que los antrop610gos participen con una vision crftica en las controversias susdtadas por el deslumbrante desarrollo tecnologico, conceptual y economico de este campo del conocimiento.

    Pese al recelo de algunos especialistas de las ciencias humanas, quienes yen en todo 10 relacionado con la genetica el pecado del determinismo bio16gico, la genetica antropologica constituye un campo de estudio multidisciplinario indispensable para entender el origen de la humanidad y las diferencias al interior de nuestra especie, debido a que'la variacion genetica es un componente importante del resto de las diferencias.

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