Asam Nukleotida

NUKLEOTIDA ASAM NUKLEAT dan DNA, RNA

. Pengertian Nukleosida dan Nukleotida

. Pengertian Asam Nukleat

Ir. EVY ROSSI, MSC

• Menjadi bahan penelitian para ahli biokimia sejak senyawa ini diisolasi dari inti sel pertama kalinya.

• Terdiri dari dua jenis yatu DNA (deoksiribonucleic acids) dan RNA (ribonucleic acids).

• Merupakan polimer seperti protein, tetapi monomer penyusunnya adalah nukleotida

• Asam nukleat ini umumnya berikatan dengan protein yang disebut nucleoprotein

NUKLEO PROTEIN

PROTEIN ASAM NUKLEAT

NUKLEOTIDA

PENTOSABASA PURIN/PIRIMIDIN

NUKLEOSIDA ASAM FOSPAT

RIBOSADEOKSIRIBOSA

PENTOSA: RIBOSA DAN DEOKSIRIBOSA

RIBOSA

Basa Purin

Basa Pirimidin

Nukleosida

• Dihasilkan dari bergabungnya satu gula (pentosa) dg basa purin atau pirimidin melalui ikatan N-glikosidik– Ikatan antara atom C1’ pentosa dengan atom N9 pada

basa purin atau N 1 pada basa pirimidin.

Tata Cara Pemberian Nama

• Nukleosida:– Nukleosida Purin diberi akhiran “-sin”

• Adenosin, Guanosin

– Nukleosida Pirimidin diberi akhiran “-din”• Thimidin, Sitidin, Uridin

Bila pentosanya deoksi ribosa diberi nama dengan menambahkan kata deoksi didepannya.contoh : deoksi guanosin dll

Nukleosida

NUKLEOTIDA

• Nukleotida adalah adalah monomer dari asam nukleat

• Jika nukleoprotein dihidrolisis dihasilkan protein, asam fospat, dan basa purin atau pirimidin.

Nukleotida• Hasil dari bergabungnya satu atau lebih fosfat dg

nukleosida melalui esterifikasi

Gugus Fosfat

• Mono-, di- atau trifosfat

• fosfat dapat dikaitkan ke atom C3 dari pentosa

Tata Cara Pemberian Nama

• Nukleotida:– Dimulai dg nama nukleosida kemudian ditambahkan

“mono-”, “di-”, atau “trifosfat”

• Adenosin Monofosfat, Sitidin Trifosfat, Deoksithimidin Difosfat

PENAMAAN NUKLEOTIDA (2)

JENIS NUKLEOTIDAJENIS NUKLEOTIDA

Jenis nukleotida Jenis nukleotida tergantung pada basatergantung pada basa dan dan Jumlah Jumlah fosfat yang dimilikifosfat yang dimiliki::

Adenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATPAdenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP

Guanin Guanin GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTPGMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP

Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP

Timin TMP, TDP, TTP, -Timin TMP, TDP, TTP, -

Urasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTPUrasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP

Ket: MP = Mono pospat, DP = Di Pospat, TP = Tripospat

FUNGSI NUKLEOTIDA

1. Prekursor Aktif DNA dan RNA.

2. Derivat nukleotida merupakan zat antara aktif pada banyak proses biosintesis, misal UDP-glukosa dan CDP diasilgliserol merupakan prekursor glikogen dan fosfogliserida.

3. ATP yaitu suatu nukleotida adenin adalah suatu penukar energi yang universal pada sistem biologi.

4. GTP merupakan sumber energi pada banyak jenis gerakan makromolekul seperti translokasi rantai peptida pada rantai ribosom.

5. Nukleotida adenin merupakan komponen tiga macam koenzim terpenting NAD,FAD dan KoA.

6. Berperan sebagai regulator metabolik

Bases, Nucleosides and Nucleotides1 April 2007

ASAM NUKLEAT

• Asam nukleat senyawa yang terdapat pada inti sel yang berperan dalam sintesis protein.

• Asam nukleat terdiri atas: - DNA (Deoksiribonukleic acid) - RNA (Ribonucleic acid) - DNA dan RNA terikat dengan protein . Senyawa gabungan asam nukleat dengan protein dinamakan dengan nukleoprotein• Asam nukleat merupakan polimer dari nukleotida• Fungsi utamanya adalah dalam mekanisme molekuler yaitu menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsikan informasi genetika.

• RNA (ribonucleic acid) merupakan polimer dr ribonukleotida

• DNA (deoxyribonucleic acid) merupakan polimer dr deoksiribonukleotida

• Keduanya (deoxy- dan ribonukleotida) mengandung Adenin, Guanin and Sitosin– Ribonukleotida mengandung Uracil– Deoksiribonukleotida mengandung Thimin

1 April 2009

IKATAN KIMIAIKATAN KIMIAASAM NUKLEATASAM NUKLEAT

• Fosfat berikatan dg hidroksil C5 gula ribosa atau deoksiribosa (AMP, ADP, ATP)-menyumbang kepada muatan negatif pada nukleotida (ikatan kovalen)

• Gula dan basa disambung oleh ikatan N-glikosidik (C dan N)

• Dua nukleosida disambung oleh ikatan fosfodiester pada 5’C dan 3’ C pada gula

IKATAN KIMIAIKATAN KIMIAASAM NUKLEATASAM NUKLEAT

• Ikatan H menyambung antara 2 nukleotida (pada basa)

• Tarikan hidrofobik (teras hidrofobik) akan terjadi antara pasangan-pasangan basa yang saling berurutan. Ini menghasilkan sebatian yang tidak polar (tiada kumpulan bercas). Ini menyebabkan DNA sangat tidak larut dan sifat ini penting dalam proses penulenannya.

IKATAN ANTARA NUKLEOTIDAIKATAN ANTARA NUKLEOTIDA

IKATAN ANTARA BASAIKATAN ANTARA BASA

RANTAI DNA

Rantai Ganda 2 DNA

Pasangan Basa

• Nukleotida akan selalu berpasangan dg nukleotida yg sama-sama saling melengkapi– Pasangan basa yg saling melengkapi

• DNA– A berpasangan dg T – C berpasangan dg G

• RNA– A berpasangan dg U – C berpasangan dg G

Deoxyribonucleic Acid: (DNA)

• DNA disusun dr nukleotida: dg molekul gula pentosa (deoxyribose)– Basa yg mengandung Nitrogen

• purin (cincin ganda)– adenin (A) dan guanin (G)

• pirimidin (cincin tunggal) – Sitosin (C) dan thimin (T)

– Gugus fosfat

• 2 untaian (helaian) berlilit/bergulung ke dalam

double helix

DNA Structure

Ribonucleic Acid (RNA)• RNA (seperti DNA) disusun dari nukleotida,

masing-masing mengandung:– Molekul gula pentosa (ribosa)– Basa nitrogennya:

• purin: adenin (A) dan guanin (G)• pirimidin: sitosin (C) dan uracil (U)

– Gugus fosfat

• Setiap helaian RNA terbuat dari tulang belakang( a backbone) gula ribosa yg berganti-ganti dg gugus fosfat.

• Setiap gula ribosa diikatkan ke basa A, G, C, atau U.

RNA

• Setiap molekul RNA terdiri dr helaian tunggal nukleotida.

• Ada 3 jenis molekul RNA yg membantu sel dlm sintesis protein :– Messenger RNA (mRNA) membawa kode untuk sintesis

protein, dari nukleus ke ‘mesin’ sintesis protein dalam sitoplasma (yaitu: ribosome).

RNA– Transfer RNA (tRNA) membawa asam amino yg tepat ke

ribosom untuk di gabung ke dalam protein yg sedang dibentuk (baru)

– Ribosomal RNA (rRNA) bersama-sama dg protein membuat protein yg disintesis mesin ribosom

KODE GENETIKKODE GENETIK