Infra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidade Vanderlei Perez Canhos...

Infra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidadeInfra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidade

Vanderlei Perez CanhosVanderlei Perez Canhosvcanhos@cria.org.brvcanhos@cria.org.br

www.cria.org.brwww.cria.org.br

Coleções Biológicas e Sistemas de InformaçãoColeções Biológicas e Sistemas de InformaçãoBrasilia, DF, Julho de 2005 Brasilia, DF, Julho de 2005

dadosdados

informaçãoinformação

conhecimentoconhecimento

açãoação

Desafio: ampliaçao do uso de dados científicos sobre biodiversidade

mundo real mundo real

observaçõesobservações

Tomada de decisão• conservação• recuperação ambiental• gerenciamento de recursos

naturais• uso sustentável

Políticas e Estratégias

• governamentais• corporativas• individuais

Marco Legal: A Convenção sobre Diversidade BiológicaMarco Legal: A Convenção sobre Diversidade Biológica

• Clearing-House Mechanism: - Intercâmbio de informação e cooperação técnica

• 2010 Biodiversity Target– Redução da taxa de perda de espécies: depende de dados

sobre a ocorrência de espécies• Global Taxonomy Initiative

– Definição do ponto focal nacional e estratégias• International Pollinators Initiative

– Iniciativa do Brasil: coletas, taxonomia, checklists• Global Strategy for Plant Conservation

– Objetivo: conter a perda da diversidade de plantas– Objetivo específico: compreender e documentar a diversidade

de plantas

Sistemas de Informação: cenário internacionalSistemas de Informação: cenário internacional

• GBIF – Global Biodiversity Information Facility• IABIN – Inter-American Biodiversity Information

Network• Catálogo da Vida (Species 2000, ITIS)• Conabio (Remib) • IIAP (Siamazonia)• INBio• NYBG (repatriação)

Cenário Nacional – MCT programasCenário Nacional – MCT programas

• PROANTAR, PPG7, Revizee, Institutos do Milênio, Xingó, ... todos geradores de dados e informações - falta uma política para coleções de dados

• Inexistência de um sistema de avaliação coletiva dos projetos que envolvem a geração de dados e informações

• Inexistência de uma estratégia inter-agências explícita visando estruturar uma rede de dados e informações de acesso público

• Inexistência de uma política de disponibilização e compartilhamento dos resultados das pesquisas financiadas pelo MCT

• Necessidade de política para a recuperação de acervos históricos e de preservação e disseminação dos dados que já nascem digitais

• Recomendação: MCT desenvolva uma estratégia explícita para o desenvolvimento e manutenção de uma infra-estrutura de dados científicos para o país

biodiversity informatics

True bioinformatics …True bioinformatics …

“bioinformatics” ecoinformatic

s genomics

proteomics

Serviços Web tornam possível a integração de dados Serviços Web tornam possível a integração de dados estruturadosestruturados

ServiçosWeb

UsuárioUsuário

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Bancos de dadosheterogêneos

Dados Padronizados e

Estruturados

Interoperabilidade entre sistemas de informaçãoInteroperabilidade entre sistemas de informação

Com os desenvolvimentos recentes catalisados pelo GBIF, dados de fontes distribuidas podem ser integrados através de única busca. Informação compilada sobre

espécimens, genética e ecologia

Global Biodiversity Information Facity (GBIF)Global Biodiversity Information Facity (GBIF)

Provedores de informação

Specimen DataSpecimen DataLinks para outros dados

Specimen DataSpecimen DataListas de Nomes

Specimen DataSpecimen DataObservações

Specimen DataSpecimen DataEspécimes

Catálogo da Vida

Portal de Acesso a dados sobre Biodiversidade

Índice de Dados sobre

Biodiversidade

Serviço de

nomes taxonô-micos

Metadado

Metadado

Metadado

Metadado

Solicitação do usuário

Busca

Collections at Smithsonian, NMNH

Photos: Chip Clark

Dados sobre biodiversidadeDados sobre biodiversidade

Family: Pyralidae

Order: Lepidoptera

Class: Insecta

Genus: Ostrinia Hübner, 1825

Vernacular (FR): Pyrale du maïs

Vernacular (ES): Piral del maíz

Vernacular (DE): Maiszünsler

Vernacular (EN): European Corn-borer

Collection: DGH LepidopteraRecord id: DGHEUR_003217Country: FranceCoordinates: 03.047˚E 48.730˚NDate: 28 June 2003Collector: Donald Hobern

Dados sobre espécimes e observações de coleta

Nomes Taxonômicos

Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796)

Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796

Foodplant: Zea mais L. 1753

Interações Ecológicas

Locus: AAL35331Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase

1 mvpyattadg hpekdecfed...

Dados de Seqüências

Average RainfallLocation: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ...182.3 120.6 158.1 204.9 ...

Dados Abióticos

Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; …

Descrições Taxonômicas

Pheromones of Ostriniahttp://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html

Literatura Digitale Recursos Web

Instituto Virtual da Biodiversidade-Biota FAPESP (Março 1998)Instituto Virtual da Biodiversidade-Biota FAPESP (Março 1998)

Estudar e conhecer a biodiversidade do Estado de São Paulo e divulgar este conhecimento e sua importância

Ampliar a capacidade das organizações públicas e privadas no gerenciamento, monitoramento e utilização da biodiversidade

Subsidiar a tomada de decisão sobre projetos de desenvolvimento, especialmente os de desenvolvimento sustentável

Sistemas de Informação de apoio ao programa Sistemas de Informação de apoio ao programa Biota/FapespBiota/Fapesp

SinBiota

Revista Biota Neotropica

Rede speciesLink

acacia glomerosapyrostegia

IntegraçãoIntegração

speciesLink uma rede

de informação que

permite a integração

dinâmica, síntese e

visualização de dados

primários de coleções

biológicas

http://splink.cria.org.br

• integração dinâmica de dados distribuídos

• software livre e de código aberto

• equipamentos de baixo custo

• integra sistemas diversos de gerenciamento de coleções (sistema operacional, software,...)

• integra de dados de diferentes grupos taxonômicos

• rede integrada com outros sistemas e redes de informação (SinBiota, SICol, Species Analyst, GBIF)

Servidor Regional

Servidor Regional

Servidor Regional

Servidor Regional

Z M

MZB

B

Z

Z

Z

Z

B

B

B

B

B

M

M

Herbário do InstitutoAgronômico deCampinas

Herbário da UNICAMP,Campinas

Coleção de AcariMuseu de Zoologia,ESALQ, Piracicaba

Herbário do DepartamentoDe Ciências Biológicas daESALQ, Piracicaba

Herbário da USP,São Paulo

Coleção de PeixesMuseu de Zoologia da USP,São Paulo

Coleção de FungosInstituto de Botânica,São Paulo

Coleção de AlgasInstituto de Botânica,São Paulo

Coleção de FanerógamasHerbário do Instituto de Botânica,São Paulo

Coleção de PeixesDept. Zoologia e

Botânica, UNESP,São José do Rio Preto

Coleção de AcariDept. Zoologia e

Botânica, UNESP,São José do Rio Preto

Coleção de Peixes doLaboratório deIctiologia, USP,Ribeirão Preto

Col. Culturas de FitobactériasLab. De Bacteriologia Vegetal

Instituto Biológico,Campinas

SinBiotaSistema de InformaçãoAmbiental do Programa

Biota - Fapesp

Coleção de Microrganismos deAmbiente e Indústria, UNICAMPCampinas

ZColeção de Anfíbios

Dept. Zoologia eBotânica, UNESP,

São José do Rio Preto

ZColeção de Quirópteros

Dept. Zoologia eBotânica, UNESP,

São José do Rio Preto

Servidor Regional

Servidor Regional

BHerbário do Instituto de

Biociências, UNESP,Botucatu

Z

BHerbário do Instituto de Biociências, UNESPRio Claro

Coleção de Anfíbios doInstituto de BiociênciasUNESP, Rio Claro

BHerbário de Ilha Solteira, UNESPIlha Solteira

ZColeção do Museude Entomologia da FEIS/UNESPIlha Solteira

Coleção Científica de Aranhas do Dept. Zoologia

e Botânica, UNESP,Botucatu

Z

BHerbário Dom Bento Pickeldo Instituto Florestal,São Paulo

BHerbário do

Jardim Botânico doRio de Janeiro

Construção da infra-estrutura Construção da infra-estrutura compartilhada de dadoscompartilhada de dados

é um esforço coletivo.....

locality data

precipitation

topography

distributional prediction

temperature

alg

ori

thm

localidades amostradas

distribuição potencial

temperatura

precipitação

topografia

Byrsonima subterraneaByrsonima subterranea

Somente um registro de ocorrência

Inclusão na lista de espécies ameaçadas do Estado de São Paulo (1999)

Novo registro de ocorrência na Estação Ecológica de Assis

Uso da modelagem para auxiliar na localização da espécie

Classificação do Solo + Similaridade Ecológica + Manchas de Classificação do Solo + Similaridade Ecológica + Manchas de CerradoCerrado

Validação do Validação do modelomodelo no campo no campo

Previsão de distribuição de Acosmium subelegans no presente e no futuro (2055)

Área habitável em 2055 (+1% CO2)

Área habitável em 2055 (+ 0,5% CO2)

Previsão de riqueza (cenário Previsão de riqueza (cenário atual) para 162 espécies de atual) para 162 espécies de

árvores do Cerradoárvores do Cerrado

Áreas prioritárias para conservação da Áreas prioritárias para conservação da Biodiversidade do Cerrado e do Biodiversidade do Cerrado e do

Pantanal Pantanal

Conservation International do Brasil Conservation International do Brasil 19981998

As áreas circunscritas em azul e rosa correspondem as regiões mais indicadas para conservação segundo critérios baseados nas projeções climáticas futuras

Checklist Flora brasiliensis

Herbário Virtual

Aplicativos: Modelagem preditiva Protocolos de interoperabilidade Servidor de nome Servidor de localidades Banco de imagens Bancos de dados primários (pesquisa) Guias de campo dinâmicos Chaves interativas

Outras Floras Regionais

Outros Herbários na

Internet

Redes Temáticas

Resultado EsperadoResultado Esperado Croton urucuranaCroton urucurana

Dados Históricos

Exsicata em HerbárioExsicata em Herbário

Imagem no campoImagem no campo

Croton urucuranaCroton urucurana

Gestão da Informação

Gestão Ambiental

Obrigado

Vanderlei Perez Canhos(vcanhos@cria.org.br