David J. Lipman é uma figura muito respeitada

no meio da Bioinformática. Lipman é o diretor

do NCBI, um dos autores originais do BLAST,

programa de alinhamento de sequência.

Fundado em 1988, o NCBI (Centro Nacional para

Informação Biotecnológica) serve como um recurso

nacional para informações sobre biologia molecular.

Este é um órgão mantido pelo NIH (Institutos Nacionais

de Saúde) dos Estados Unidos.

O NCBI cria uma base de dados públicos, realiza

investigação em biologia computacional, desenvolve

software para análise de dados do genoma e dissemina

informações biomédicas, tudo para melhor

compreensão dos processos moleculares das doenças

que afetam a saúde humana.

e

Estabelecimento de banco de dados públicos que

possibilitem aos cientistas trocarem

compartilharem sequências genéticas. Todos os dias

novas sequências são depositadas no banco de

dados públicos do NCBI, chamado GenBank;

o A bioinformática tem revolucionado

desenvolvimento da pesquisa médico-biológica e

tem possibilitado que novas descobertas relevantes

sejam realizadas todos os dias.

e

Estabelecimento de banco de dados públicos que

possibilitem aos cientistas trocarem

compartilharem sequências genéticas. Todos os dias

novas sequências são depositadas no banco de

dados públicos do NCBI, chamado GenBank;

Mais especificamente, o NCBI foi montado com a

criação de sistemas automatizados para armazenar e

analisar os conhecimentos sobre Biologia Molecular,

Bioquímica e Genética;

Facilitar a utilização deste tipo de base de dados e

softwares para a investigação da comunidade

médica;

Coordena esforços para recolher informação, tanto

a nível de biotecnologia nacional quanto

internacional e realiza pesquisas em métodos

avançados de processamento de informação

baseado em sistemas computacionais para analisar

a estrutura e função de moléculas biologicamente

importantes.

É um banco de dados online sobre heranças

mendelianas humanas. O OMIM contém

informações sobre todas as doenças mendelianas

conhecidas e mais de 12.000 genes;

O OMIM oferece a relação entre genótipo e fenótipo

desses genes. Ele é atualizado diariamente e editado

no Instituto Mckusick–Nathan de Genética Médica na

Universidade Johns Hopkins, sob a direção do Dr.

Ada Hamosh;

A base de dados do OMIM é aberta ao público em

geral. Embora, seu principal objetivo seja uma fonte

de consulta para médicos, geneticistas e estudantes

das áreas científicas.

Esta ferramenta nos permite o conhecimento mais

aprofundado de um determinado gene. Cada gene

conhecido recebe um único número identificador, o

GeneID (como se fosse a “carteira de identidade” do

gene).

É uma ferramenta que tem como objetivo dar um

nome único e uma classificação para cada gene

humano. A finalidade deste esforço é para que todos

os pesquisadores, ao se referirem a um determinado

gene usem nomes e símbolos em comum, unificando

as informações;

Este trabalho é realizado pelo HUGO (Organização

do Genoma Humano). Atualmente, há mais de vinte

e cinco mil nomes e símbolos já aprovados, que, na

sua maioria, são usados para a codificação de

proteínas e genes, e também para incluir, símbolos

para pseudogenes, RNAs não codificantes e

características fenotípicas e genotípicas.

São as sequências de referências. Estas sequências

são cuidadosamente analisadas pelo NCBI (curadas).

Vamos encontrar, neste link, Entrez Nucleotide, os

nucleotídeos que formam o gene pesquisado;

É uma coleção de sequências de DNA, RNA,

proteínas de diversos taxons, como plasmídeos,

vírus, archae, bactérias e eucariotos. O objetivo é

fornecer um padrão abragente de dados que

represente uma sequência de informações das espé

ies catalogadas.

São as sequências das proteínas obtidas a partir das

espécies pesquisadas e catalogadas neste link. São

as traduções das regiões codificantes do gene,

anotadas no GenBank;

Os aminoácidos que formam as proteínas são

identificados pelas letras: A (Ala), C (Cis), D (Asp), E

(Glu), F (Fen), G (Gli), H (Hist), I ( Iso), L (Leu) K (Lis),

M (Met), N (Asp), P (Pro), Q ( Glu), R ( Arg), S (Ser), T

(Tre), V (Val), W (Trip), Y (Tir).