Møteplassen Torsdag 5. juni 2014
Mage - tarmUrinveisinfeksjon
LuftveisprøverPuss
Pål A. Jenum Avdelingssjef professor dr.med
Generelt om prøvetaking
Prøver inneholder ofte levende mikroorganismer
Krever rask og profesjonell prøvebehandling:• Riktig anatomiske lokalisasjon• Riktig teknikk og utstyr
(minimalisere kontaminering)
• Korrekt transportmedium• Rask transport til laboratoriet.
RELEVANTE KLINISKE OPPLYSNINGER !
HVA LETER VI ETTER?Diare - definisjoner
• Akutt diaré ≤ 14 dagers varighet• Persisterende diaré > 14 dager• Kronisk diaré > 30 dager
Non-infeksiøse årsaker er mer vanlig ved persisterende og kronisk diaré
”Langvarig”? 2 dager–2 måneder? – Hvor lenge!
HVA LETER VI ETTER?Campylobacter-Salmonella-Shigella-Yersinia
Cary Blair mediumEHEC, EPEC, (ETEC) – spesiell indikasjon dyrkning pluss PCR
Norovirus (PCR, to genotyper) Uten tilsetningRotavirus (antigen test)Adenovirus (antigen test)
Clostridium difficile toxin A+B (antigen test) Uten tilsetning/CBM GDH-test (glutamat dehydrogenase) → CD-toxin → dyrk→ CD toxin
Parasitter (mikroskopi) ParasittmediumHUSK gode kliniske opplysninger
Fæcesprøver
} Duplex-PCR
Fæcesprøver
EHEC + EPEC• Dyrker frem E.coli• Genetisk analyse på forekomst av Stx1+ Stx2 + eae (intimin) gener• Klassisk EHEC har alle disse tre genene• Atypisk EHEC har minst ett Stx-gen, men kan mangle andre
• EPEC har kun eae intimin-gen
• Klassisk ETEC har lt1, st1a og st1b gen (testes ikke rutinemessig)
• Andre enteropatogene E.coli: • EIEC enteroinvasiv: ipah-gen• EAEC enteroaggregerende: aggr-gen
Utstyr
Cairy-Blair transport mediumTransporttid: 24-48 tCampylobacterSalmonellaShigellaYersiniaEHEC/EPEC
Steril kontainer uten tilsetningNorovirusRotavirusAdenovirusClostridium difficile toxin A+B
(etter AB-behandling)(OBS max 24 timer)
Para-Pak for parasitterGiardiaCryptosporidiumEntamoebaCyclospora
(Oxuris, ascaris, shcistosomiasis, trichuris etc)
Urin
KLINISK BILDE•«UVI symptomer»
– UVI– Dysuri– Minst to av følgende:
– feber (OBS eldre infeksjonstegn uten klart fokus)– pollakisuri– hematuri– bankeømhet i nyreregion
•«Ikke UVI symptomer»– UVI?– vond lukt av urin, grumset urin– positiv stix– ingen opplysninger NB
Urin
KLINISK BILDE•Asymptomatisk bakteriuri ?
– Gravide– Etter behandling ved residiverende UVI– Før kirurgi i urinveiene
Urin
PRØVETAKING
Hovedpoeng: UNNGÅ kontaminering•Midtstrømsprøve
– NB: Klamydia: førstestråle!!
•Blærepunksjon •Kateterprøve
– Engangskateter– Permanentkateter NB: Kolonisering
•Poseprøve for spebarn?– «Alltid» kontaminert.
Kun negativ dyrkning har sikker verdi.
Urin
FORSENDELSEHovedpoeng: RASKT til laboratoriet•Urin uten tilsetning
– Kun dersom levert lab umiddelbart for utsæd
•Urin på borsyre– Foretrukket valg. Borsyre er bakteriostatisk (2-3 dgn)
•DyppeagarFordeler – Raskt negativt svar, indikasjon på species
Ulemper– Forsinket svar ved positivt funn, – vanskelig å vurdere forurensning, – vanskelig å vurdere lave bakterietall ved reell infeksjon
Urin forsendelse
Urin beholderMED borsyre
Urin beholder UTEN borsyre
Urin
TOLKNING
Hovedpoeng: Hvilken bakterie!•Primær- og sekundærpatogene:
– E.coli, S.saprophyticus, Salmonella– Klebsiella, Proteus, Enterobacter
Enterokokker, S.aureus, Pseudomonas aeruginosa
•Tvilsomt patogene, apatogene– KNST, Aerococcus, Pseudomonas, gjærsopp,
Gruppe B streptokokker (OBS gravide), grønne streptokokker, Lactobaciller, Gardnerella
Urin
TOLKNING
Hovedpoeng: UVI kontra Assymptomatisk
Primær- og sekundærpatogene•Renkultur
– UVI >10.000 bakterier/ml– 103 – 104 bakt/ml: Forurensning mulig
– Assympt > 100.000 bakterier/ml– 103 – 104 bakt/ml: Ingen signifikant vekst– 104 – 105 bakt/ml: Forurensning mulig
•Blærepunksjon – >100 bakterier/ml
Urin
TOLKNING• Én i dominans (>80%): Dominerer i blanding
Forurensning mulig
•2 arter isolert – Lik mengde: Forurensning sannsynlig
•> 2 arter: Blandingsflora. Forurensning (sannsynlig)
•Tvilsomt patogene og apatogeneUansett mengde:
Forurensning (sannsynlig)
Luftveisprøver
HVA LETER VI ETTER?
Bakteriologisk dyrkning ved klinisk sykdom• NESE
– Ved otitt, sinusitt, rhinitt, bronkitt (?), pneumoni (?)Pneumokokker, H.influenzae, Beta-hemolytiske streptokokkerMoraxella catharrhalis
• HALS– Ved tonsilitt, hissig pharyngitt
Beta-hemolytiske streptokokker (Gruppe A, C og G)
Bordetella pertussis, Corynebacterium diphtheriae dyrkes ikke
Luftveisprøver
HVA LETER VI ETTER?
Bakteriologisk dyrkning ved klinisk sykdom• EKSPEKTORAT
– Sjelden indisert (obs TB)
• ØYE, ØRE (perforert otitis media)– Funn som ved neseprøve
Luftveisprøver
HVA LETER VI ETTER?
Genmolekylær analyse ved klinisk sykdom• Nasopharynxpensel /halspensel E-swab
ØLI, NLI–Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis (Hostepakke)–Influensa A og B, Parainfluensa 1-2-3–Rhinovirus, Metapneumovirus, RSV (barn), –Enterovirus, parechovirus–Adenovirus
LuftveisprøvereSwab transportmedium
(flytende!)Leveres med tynn eller tykk pensel.
Fargen på korken kan variere.
Benyttes til prøver som skal: 1. Undersøkes på kravstore bakterier
Anaerobe bakterier (dype sår), Gonokokker
2. Undersøkes med PCR teknikk Virus (Herpes Simplex,Varicella, RSV, Influensa m.m), Mycoplasma pneum., Respiratorisk chlamydia, B.pertussis
Eswab utleveres fra laboratoriet. Brukes rutinemessig.Prøven bør oppbevares i kjøleskap før forsendelse.
AMIES transportmediumfor bakterier
Benyttes for undersøkelse av:Pussprøver, overflatiske sår, øre, nese, hals, sopp og MRSA
Prøven bør sendes samme dag, evt oppbevares i kjøleskap for så å sendes neste dag.
E-swabPensler til PCR
AmiesPensler til
bakteriologisk dyrkning
SårprøverHVA LETER VI ETTER?
Postoperative sår / skadesår• Stafylococcus aureus (inklusive MRSA)• Beta-haemolytiske streptokokker• Pseudomonas aeruginosa• Pasteurella (bittsår)• Blandingsinfeksjoner -> kolonisering (obs diabetes)• Anaerober (abscesser, bitt, diabetes)
Trykksår• Oftest blandingsinfeksjoner
KOLONISERING – LOKALBEHANDLING SÅRSTELL