OPEN ACCESS (OA)Les revues électroniques et l’OA : le meilleur et le pire
Hervé Maisonneuvewww.redactionmedicale.fr
Liens d’intérêts, H Maisonneuve• Rédacteur de www.redactionmedicale.fr
• Rédacteur adjoint de• Consultant en rédaction et en formation
professionnelle• Membre commission HAS sur la qualité des revues
(2010-2013)• Comité de rédaction de• Auteur de ‘La rédaction médicale’, Doin, 2010
• Rédacteur de ‘Science Editors’
Handbook’, EASE 2013Open Access RITME juin 2014 2
Depuis les années 90s, instabilité du système des revues scientifiques
• Après 200 ans de progrès réguliers, les années 90s ont apporté des changements majeurs
• « L’électronique » a débuté par des pdf en ligne et en 2014 les limites entre revues, sites, blogs deviennent floues
• « L’électronique » a apporté l’Open Access et avec
cela le meilleur, le pire et des truands
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Les revues biomédicales
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Les revues biomédicales
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http://www.articleofthefuture.com/
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Les revues ont changé
www.protocol-online.org
http://datadryad.org/
www.openwetware.org Open Access RITME juin 2014 7
Réseaux sociauxFacebook, …..
Podcasts, videos, crossref, crossmark
14.1
Web 2.0
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Où sont les revues ?
Open access: plus de 50 % de la science en 2014 ?
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Historique de l’Open Access
Ce mouvement n’est pas spécifique à la science
• 1994 : BMJ avec ELPS, Electronic Long Paper Short• 1995 : HighWire Press (Stanford University)• 1997 : Medline devient libre en tant que PubMed• 1999 : PubMed Central• 1999 : Open archives initiatives• 2000 : BioMed Central• 2001 : création de ‘Public Library of Science’, PLOS• 2001 / 2002 OMS Hinari• Des déclarations : Budapest 2002, Bethesda 2003
puis Berlin 2003,…
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Open access : progrès ou dangers
Deux stratégies complémentaires :1. Self-archiving : Open archives
initiative2. Open-access journals
Quel modèle économique ?Pouvez-vous définir les 3 modèles : green, gold and hybrid?
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Gold?Green? Hybrid?
Opaque?
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http://www.lemonde.fr/sciences/article/2013/02/28/a-qui-appartient-le-savoir_1840797_1650684.html
• Le meilleur : je veux tout, tout de suite et gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
• Le meilleur et le pire : peer-review et almetrics
• Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre
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Le meilleur : je veux tout, tout de suite, n’importe où, et gratuitement…
L’article du futur : le pdf n’aura plus d’intérêt…. clips vidéos et/ou
logiciels dans les illustrations, croisement des références et tous liens sans fin… tout ceci est bientôt du passé
Mais que vont faire les autres développements ? – Registres de protocoles– Registres de données sources– Registres d’archives ouvertes
– Notebooks– Google maps, google scholar– les modèles type eLife ou F1000 research– ORCID– Les réseaux sociaux…
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Registres de données sources (8/04/14)
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Directory of Open Access Repositories
DOAR
http://www.opendoar.org/
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Notebook: OpenWetWare
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Notebook: eNovalys
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http://www.myopennotes.org/
Google maps : épidémiologie, géographie, géologie,…
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Effects of land use changes on badland erosion in clayey drainage basins, Radicofani, Central Italy
Revues créées par des fondations
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Des modèles pour
déposer ses pdf ? Et ‘prendre
date’
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F1000 Research
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ORCID HM 0000-0001-8365-7558
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ResearcherID
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Lancet Oncology, 2013;14:583-589
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SHERPA FACT
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• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
• Le meilleur et le pire :
peer-review et almetrics
• Les truands : les
prédateurs peuvent tout
se permettre
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Des accidents ?
• Disparition de données, de liens hypertexte,… 404
error• Manipulation d’articles après publication
• Manipulation d’images en biochimie, chirurgie
plastique, histologie, etc…
Un plagiat sans limites, voire non dénoncé par les institutions……
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Gross manipulation of blots.
Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15
© 2004 Rockefeller University Press
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Misrepresentation of immunogold data.
Rossner M, Yamada K. JCB 2004;166:11-15
© 2004 Rockefeller University Press
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Volume de l’information !Logiciels anti-plagiat !
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Modèle économique en construction
• From ‘reader-pay’ to ‘author-pay’ : un progrès?• Tout est ‘gratuit’ comme eLife, ou pas cher comme
PeerJ (un droit à vie de 100 à 300 $)• APCs: Article Processing Charges de 500 à 9000 $
par article• Tous les modèles existent : payment en une ou
plusieurs fois (soumission, acceptation, nombre de pages, illustrations,…)
• Est-ce que le modèle APC influence le taux d’acceptation des articles ?
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Lancet : un modèle hybride, avec APC ‘facultatif’ de 5000 £…
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Autres ressources
• Publicitaires :– Quel transfert des publicités du
papier à l’écran
– Mais la publicité ciblée devient efficace et probablement redoutable
• Tirés à part : ont-ils disparu ?
• Des institutions payent des droits d’accès pour les chercheurs (modèle BioMedCentral par exemple)
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Que payent les institutions ?
• « Double dipping » : est-ce que les institutions ne payent pas 2 fois ?– Abonnements– APCs
• Ressources pour des archives ouvertes : réallocation de ressources ou nouveaux budgets ?
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• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
• Le meilleur et le pire : peer-review et altmetrics
• Les truands : les
prédateurs peuvent tout
se permettre
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Peer review et électronique !
Est-il plus rapide grâce aux nouvelles technologies ?A-t-on plus de reviewers ? Sont-ils exaspérés par les relances par les emails ?Peer-review portable (PLOS, BMJ, eLife et BMC ont un accord)
Le ‘post-publication’ peer-review: un système qui ne marche pas bien
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Climate of the past
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Que penser de PLOS ONE ?
Acceptation de 70 % des articles soumis pour PLOS ONEAPCs de 1350 $Groupe PLOS : 32 000 articles en 2013
Groupe PLOS 2012 (million $)Publication fees 36,9 Membership fee 0,3Advertising 1,6
Total expenses 31,6
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Où va PLOS ONE ?
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10 000 revues OA
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Croissance articles OA chez les éditeurs majeurs
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Développement gold AO
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Facteur d’impact et SIGAPS• Impact factor : un indicateur créé dans les
années 60 pour évaluer la notoriété des revues, afin d’orienter les publicités : ISI, Institute for Scientific Information (Philadelphie, USA) acheté par Thomson Reuters ; une base de données de 8000 revues scientifiques, surtout américaines
• SIGAPS : Système d’Interrogation, de Gestion et d’Analyse des Publications Scientifiques, créé en 2002 au CHU de Lille, généralisé en 2008, utilisant la base MedLine (PubMed) qui contient 6000 revues de biomédecine (22 millions d’articles)
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Open Access RITME juin 2014
Nombre de citations en 2013 des articles citables en 2011 et 2012Nombre d’articles citables en 2011 et en 2012
Tout dépend de ce qui est pris en compte dans les articles « citables » ; de très nombreuses
‘manipulations’ de la part des revues
Revues classées en 6 catégories : A, B, C, D, E, NC et les praticiens doivent valider leurs publications dans SIGAPS, puis agrégation par service, pôle, hôpital54
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Facteur d’impact, SIGAPS
http://thomsonreuters.com/products_services/science/free/essays/impact_factor/
www.sigaps.fr
Des sites accessibles avec des codes
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http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.1001687
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Article Level Metrics
• ALM ou Almetrics : indicateurs au niveau des articles plutôt que notoriété de la revue
• Compétition entre plusieurs ‘systèmes’ ; BMC et PLOS contre les autres ?
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Metrics ?
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Metrics ?
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Disparition du facteur d’impact ? Oui mais pour quels indicateurs
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Green, gold, hybrid ou ?
• Confusion des systèmes par les chercheurs qui ne comprennent pas
• Est-ce que le gold est l’avenir ?
• À moins que les archives ouvertes ne dominent les publications ?
Mise en cause du peer-review, de l’open access ou du bruit pour rien dans Science en octobre 2013 ?
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Science, October 4, 2013
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Methods
• The paper took this form: Molecule X from lichen species Y inhibits the growth of cancer cell Z. To substitute for those variables, I created a database of molecules, lichens, and cancer cell lines and wrote a computer program to generate hundreds of unique papers. Other than those differences, the scientific content of each paper is identical.
• Author: Ocorrafoo Cobange, Wassee Institute of Medicine, Asmara
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Results : 255 réponses
• The final list of targets came to 304 open-access publishers: 167 from the DOAJ, 121 from Beall’s list, and 16 that were listed by both.
• By the time Science went to press, 157 of the journals had accepted the paper and 98 had rejected it. Of the remaining 49 journals, 29 seem to be derelict: websites abandoned by their creators. Editors from the other 20 had e-mailed the fictitious corresponding authors stating that the paper was still under review…
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Des articles ont été publiés
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Qu’en conclure ? Rien ?
• ‘Science’ a été critiqué :
– L’article de Bohannon n’a pas été reviewé– Les méthodes sont très mauvaises : pas de
comparaison, mauvaises données,…
• La communauté serait innocente !– Est-ce un problème d’open access ?– Est-ce que le peer-review ne sert à rien ?– Comment travaillent les revues scientifiques ?– Peut-on améliorer le système ?
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• Le meilleur : je veux tout,
tout de suite et
gratuitement…
• Le pire : que d’eau, que
d’eau mais je n’ai rien à
boire…
• Le meilleur et le pire :
peer-review et almetrics
• Les truands : les prédateurs peuvent tout se permettre
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Tout devient possible
• Un auteur devient ‘maison d’édition’… il peut mettre ses données sur de nombreux sites, avant même d’être reviewé..
• Des auteurs payent pour soumettre des articles à des revues dont la pérennité n’est pas assurée
• Bentham, OMICS, Hindawi, etc….liste de Jeffrey Beall, Denver
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Le meilleur, le pire ?
L’électronique ne résoudra pas les problèmes de la
science en général• Distorsion de la science car les études positives sont
publiées plusieurs fois et les études négatives peu publiées
• La reproductibilité des publications n’est pas assez
étudiée• 50 % des publications seraient embellies : à vérifier• Les batailles entre auteurs qui ont un effet délétère
sur la sérénité des équipes de recherche continueront• Conflits d’intérêts, plagiats, mauvaises pratiques….
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Une solution : la transparence ?
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Open Access de P Suber, MIT Press 2012
My honest belief from experience in the trenches is that the largest obstacle to OA is misunderstanding
The largest cause of misunderstanding is lack of familiarity, and the largest cause of unfamiliarity is preoccupation
Everyone is busy
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Les revues ont changé
www.protocol-online.org
http://datadryad.org/
www.openwetware.org Open Access RITME juin 2014 74
Réseaux sociauxFacebook, …..
Podcasts, videos, crossref, crossmark
www.ritme.com
Nicolas au 0142469874
Questions ?
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