1

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ*

ÖZGEÇMİŞ

Adı Soyadı: Turgay İBRİKÇİ

Öğrenim Durumu:

Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl

Lisans Fizik Bölümü Çukurova Üniversitesi 1981

Yüksek

Lisans

Bilgisayar Bilimleri Nova (Southeastern Nova) University,

Florida, ABD

1993

Doktora

Elektrik-Elektronik

Müh. / Bilgisayar

Anabilim Dalı

Çukurova Üniversitesi

2000

Doçent

Bilgisayar-Bilişim

Bilimleri ve

Mühendisliği

Üniversitelerarası Kurul

2014

Görevler:

Görev

Unvanı

Görev Yeri Yıl

Doçent Ç.Ü., İstatistik Uygulama ve Araştırma Merkezi 2014-

Doçent Ç.Ü Biyoteknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi

(Biyoteknoloji)

2014-

Doçent Ç.Ü., Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Elektrik-Elektronik

Mühendisliği Bölümü Bilgisayar Anabilim Dalı

2014-

Yrd.Doç.

Dr.

Ç.Ü., Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği

Bölümü (13B ile görevlendirme).

2005-

Yrd.Doç.

Dr.

Ç.Ü., Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Elektrik-Elektronik

Mühendisliği Bölümü.

2000- 2014

Misafir

Araştırmacı

Univ. of Texas at Houston, Computational Biomedicine Center

(CBMC), Houston, TX, ABD.

2000-2001

Öğretim

Görevlisi

Ç.Ü., Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Elektrik-Elektronik

Mühendisliği Bölümü.

1996-2000

Arş.Gör. Ç.Ü., Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Elektrik-Elektronik

Mühendisliği Bölümü.

1993-1996

Yazılım

Uz.

ELSAN A.Ş, Adana 1985-1988

Yazılım

Uz.

Ç. Ü., Bilgi İşlem Merkezi, Adana 1982-1985

2

Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri:

I. Ders Aşamasındaki Öğrenciler

1. Nusaibah Khalid ABDULMAJEED (2015)

2. Jean De Dieu UWISENGEYIMANA (2015)

3. Ali Fuat YALÇINKAYA (2016)

4. DERYA BİLGİÇ (Biyoteknoloji ) (2017)

II. Tamamlanan Tezler:

1- Mustafa Özber YÜCEKUL (2015), “Using Machine Learning Methods to Predict Protein

Contact Map”

2- İclal ÇETİN TAŞ (2012), "Depiction of Hemorrhagic Regions Caused By Diabetic

Retinopathy Images by Using Image Enhancement and Basic Classification Methods", ikinci

danışmanı Yrd. Doç. Dr. Sami Arıca (Çukurova Univ), Ve Çukurova Üniversitesi Araştırma

Fonu (MMF-2011YL2) projesi ile desteklenmiştir.

3- Esra KARABULUT (2012), “A Research on Performance of Decision Support Systems in

Diagnosis of Coronary Artery Disease”, Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (MMF-

2011YL19) projesi ile desteklenmiştir.

4- Mehmet Onur ŞAHLAR (2011), "Library Based Image Reconstruction on X-Ray Films for

External Fixator Automation", Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (MMF-2009YL58)

ve TÜBİTAK (106M0466) projeleri tarafından desteklenmiştir.

5- Gökhan ÇETİN (2010), "Artificial Neural Networks by Using the Internet Traffics on the

Internet Exit Routers (MRTG) Estimated Traffic Analysis and Planning for Future",

(Öğrenci aftından yararlanarak gelen öğrenci).

6- Okan ŞEN (2010), "Segmentation and Classification of Magnetic Resonance Images by

Neural Networks", (Öğrenci aftından yararlanarak gelen öğrenci).

7- Jale BEKTAŞ (2010), "Segmentation of Brain Region of MRIs and Comparisons between

Autistic and Healthy Adolescent".

8- Ahmet AYDIN (2009), "Applications of Medical Image Processing Techniques on a

Biomechanics System", Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (MMF-2008YL20) ve

TÜBİTAK (106M0466) projeleri tarafından desteklenmiştir.

9- Emine GEZMEZ (2007), "Clustering MRI Images with Principal Component Analysis

Methods".

10- Şehy Şamil ASLAN (2006), "Computer Controlled Robot Car".

11- Gülçin YİĞİTLER (2005), “New Techniques for Classification, Enhancement, and

Fusion of Multispectral Remote Sensing Images”, ikinci danışmanı Prof. Dr. Okan ERSOY

(Purdue Univ., ABD).

3

12- İrem ERSÖZ (2003), “Secondary Structure Prediction of Hemoglobin by Using

Combined Neural Networks”, Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (FBE-2002YL328) ve

TÜBİTAK-(EEEAG-100E037) (yürütücü: Yrd. Doç. Dr. Turgay İbrikçi) projeleri

tarafından desteklenmiştir.

Yönetilen Doktora Tezleri/Sanatta Yeterlik Çalışmaları:

I. Ders Aşamasındaki Öğrenciler

1. Eyüp GÜRCAN (2017)

2. Fahriye GEMCİ FURAT (2017)

II. Tamamlanan Tezler:

1- Esra MAHSERECİ KARABULUT (2016) “Investigation of Deep Learning

Approaches for Biomedical Data Classification”, Çukurova Üniversitesi Araştırma

Fonu (FDK-2015-4395)

2- Mustafa KARABULUT (2011), "Employing Data Mining Techniques on Biological

Sequences for Transcript for Transcription Factor Binding Identification".

3- İrem ERSÖZ KAYA (2008), "Computational Prediction of Disordered Regions in

Proteins", Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (MMF-2006D12) ve TÜBİTAK

(TBAG 104T505) (yürütücü: Yrd. Doç. Dr. Turgay İBRİKÇİ) projeleri tarafından

desteklenmiştir. İkinci danışman: Prof. Dr. Okan ERSOY (Purdue Univ. ABD).

Görev Yeri: Yrd. Doç. Dr.,Mersin Üniversitesi, Tarsus Teknoloji Fakültesi/ Yazılım

Mühendisliği Yazılım Mühendisliği Anabilim Dalı

4- Ayça ÇAKMAK PEHLİVANLI (2008), "Consensual Classification of Drug /

NonDrug Compounds for Drug Design", Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu

(MMF-2006D11) ve TÜBİTAK (TBAG 104T505) (yürütücü: Yrd. Doç. Dr. Turgay

İBRİKÇİ) projeleri tarafından desteklenmiştir. İkinci danışman: Prof. Dr. Okan ERSOY

(Purdue Univ. ABD).

Görev Yeri: Yrd. Doç. Dr, Mimar Sinan Güzel Sanatlar Üniversitesi - İstatistik Bölümü

III. Devam Etmekte Olan Tezler:

1- Jale BEKTAŞ (2013 -), “Use of Data Mining Techniques to Determine Presence of

Coronary Artery Disease and Deriving a Risk Score by Employing Risk Factors".

4

Projelerde Yaptığı Görevler:

A. TÜBİTAK Tarafından Desteklenen Projeler:

PROJE ADI BÜTÇE TARİH GÖREV PROJE

TÜRÜ

ARDEB

NO

Yeni Fiksatör Otomasyonu 281.000 01.12.2012/

30.11.2015

Araştırmacı Araştırma

– 1001 112M406

Fiksatör Otomasyonu 200.000 15.02.2007/

14.08.2010

Araştırmacı Araştırma

– 1001 106M466

Ön Yüklü Helisel Başı Yaylarının

Lineer Statik, Burkulma ve Serbest

Titreşim Problemleri için Bir Paket

Programın Hazırlanması ve Tasarım

Grafiklerinin Elde Edilmesi

103.130 01.09.2006/

30.09.2008

Araştırmacı Araştırma

- 1001 106M307

İşlemsel ve İstatistiksel Akıllı

Yöntemlerin Düzenli ve Düzensiz

Yapılı Proteinlerin İşlevlerinin

Tanımlanması ve Onarıcı İlaç

Tasarımına Uygulanması

38.760 01.06.2005/

30.09. 2007

Yürütücü Araştırma

- 1001 104T505

Destek Vektorleri Yöntemi

Kullanılarak Proteinlerin ikincil

Yapılarının Tanımlanması

21.760 01.04.2001/

01.02. 2003

Yürütücü Araştırma

-1001 100E037

B. Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu Tarafından Desteklenen Projeler:

PROJE ADI BÜTÇE TARİH GÖREV PROJE

TÜRÜ

PROJE NO

Diagnosing Knee Pathology Using

Surface Electromyography SEMG

and Artificial Neural Networks

4.287 08.03.2017/

08.03.2018

Yürütücü Yüksek

Lisans FYL-2017-7864

Classification the dataset in

medical care breast cancer Using

machine learning algorithms

2.800 29.08.2016/

29.08.2017

Yürütücü Yüksek

Lisans FYL-2016-6805

Biyomedikal Veri Sınıflandırma

İçin Derin Öğrenme Yaklaşımının

Kullanılması

5.500 03.07.2015/

03.01.2017

Yürütücü Doktora FDK-2015-

4395

Uluslararası Yayınlar Özendirme

Desteği

2.000 18.03.2015/

20/03/2017

Yürütücü Ödüllendir

me FDK-2015-

3566

Uluslararası Yayınlar Özendirme

Desteği

4.000 19.12.2013/

18.11.2014

Yürütücü Ödüllendir

me MMF-2013

DP13

Amiloid Proteinler Arasındaki

Yapısal İlişkilerin Biyoinformatik

Yönünden İncelenmesi

10.000 06.11.2013/

05.11.2015

Yürütücü BAP MMF-2013

BAP19

A Research on Performance of

Decision Support Systems in

Diagnosis of Coronary Artery

Disease

1,000 01.12.2011/

30.11.2012

Yürütücü Yüksek

Lisans MMF-2011

YL19

Detection of Diabetic Retinopathy

Complication by Using

Computational Learning Methods

on Images

1.980 01.03.2011/

28.02.2012

Yürütücü Yüksek

Lisans MMF-2011

YL2

Otistik ve Normal MR Görüntüleri

Arasındaki Farkların Kümeleme ve

Sınıflandırma Metotları Kullanarak

Belirlenmesi

8.000 07.04.2009/

06.07.2011

Yürütücü BAP MMF-2009

BAP02

Harici Fiksatör Otomasyonu için 2.000 01.10.2009/ Yürütücü Yüksek MMF-2009

5

Röntgen Filmleri Üzerinde

Kütüphane Tabanlı Görüntü

Tanımlama

30.09.2010 Lisans YL58

X-Ray Görüntülerinde Resim

Tamamlama ve Sınır Bulma

2.000 01.10.2008/

30.10.2009

Yürütücü Yüksek

Lisans MMF-2008

YL20

Functional Classification of

Disordered and Multi-Labeled

Proteins

3.960 07.04.2006/

06.04.2007

Yürütücü Doktora MMF-2006

D12

Drug Design By Artificial Neural

Networks as Data Mining Tools

3.960 07.04.2006/

06.04.2007

Yürütücü Doktora MMF-2006

D11

Destek Vektör Motorlarının

Çekirdek Fonksiyonlar Aracılığı ile

Protein Yapılarını Bulmak için

Gerekli Parametrelerin Optimize

Edilmesi

3.500 01.01.2005/

31.12.2005

Yürütücü BAP MMF-2004

BAP21

Neural Networks With Information

Theory on Secondary Structures of

Protein

1.040 01.09.2002/

30.08.2003

Yürütücü Yüksek

Lisans FBE-2002

YL328

Destek Vektörleri Yapay Sinir

Ağlarının Protein Yapılarına

Uygulanması

1.000 01.03.2000/

28.02.2001

Yürütücü BAP MMF-2000/41

D. Diğer Araştırma Fonları Tarafından Desteklenen Projeler:

PROJE ADI BÜTÇE TARİH GÖREV PROJE

TÜRÜ

PROJE NO

Yapay Zeka Yöntemleri Kullanarak

Akut İskemik İnme Tanısının Tespit

Edilmesi

5.000 01.01.2015/

30.12.2016

Araştırmacı Niğde ÜnV -

BAP 490

İdari Görevler:

1. Çukurova Üniversitesi, İstatistik Uygulama ve Araştırma Merkezi, Merkez Kurul Üyesi ve

Merkez Yönetim Kurulu Üyeliği (2015 - ).

2. Çukurova Üniversitesi, Uzay Bilimleri ve Güneş Enerjisi Araştırma Uygulama Merkezi

(UZAYMER), Merkez Kurul Üyesi ve Merkez Yönetim Kurulu Üyeliği (2011 - 2015).

3. Çukurova Üniversitesi, Mühendislik-Mimarlık Fak., Makine Alet Cihaz Tasarım İmalat

Araştırma ve Uygulama Merkezi (MACTİMARUM) Merkez Kurulu Üyesi (2007 - ).

4. Çukurova Üniversitesi, Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü, Doktora Yeterlilik

Kurul Üyesi (2007- 2010).

5. Çukurova Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, Bilgisayar Bilimleri Anabilim

Dalı Başkan Vekili (2005 - 2008).

6. Çukurova Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, Yazılım Anabilim Dalı Başkanı

( 2005 – 2008).

7. Çukurova Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, 13.b ile Görevlendirilme (2005- )

8. Çukurova Üniversitesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Kurucu Üyesi (2003 - 2004).

9. Çukurova Üniversitesi Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü, Elektromanyetik Alanlar

Anabilim Dalı Başkan Vekili (2004 - 2007).

10. Çukurova Üniversitesi, Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Bilgisayar, Elektronik Cihaz,

Elektrikli Cihaz Teknik Alım Satım Komisyonu Üyesi (2003- 2005).

11. Çukurova Üniversitesi, Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü, Bilgisayar Bilimleri

Anabilim Dalı Başkanı (2001-2004).

6

12. Çukurova Üniversitesi, Üniversite-Sanayi Araştırma Merkezi (ÜSAM-TÜBİTAK)

Yazılım Grubu Üyesi (2000 - 2002).

13. Çukurova Üniversitesi, Mühendislik-Mimarlık Fakültesi, Bilgi İşlem Komisyonu Üyesi

(1997- 1999).

14. Çukurova Üniversitesi Rektörlüğü, Bilgisayar Bilimleri Uygulama ve Araştırma

Merkezi, Proje Yöneticisi, (1982 - 1985).

Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler:

ÜYELİK

DÖNEMİ

ÜYELİK TÜRÜ KURULUŞ

2000 - 2012 Üye IEEE, ABD

2000 - 2010 Üye IEEE-EMBS, Biomedikal Kulubü

1996 - 2012 Üye IEEE- Bilgisayar Kulubü

1996 - 2000 Ç.Ü. Öğrenci Kolu Başkanı IEEE, ABD

1995 - 1999 Öğrenci Üye IEEE, ABD

Patents:

İBRAHİM DENİZ AKÇALI, MEHMET ONUR ŞAHLAR, AHMET AYDIN, KEREM ÜN,

TURGAY İBRİKÇİ, "Redüksiyon sistemi", TÜRKIYE, Patent, 2010-G-253119, Ocak

2011

Ödül ve Destekler:

Konferans Katılım Desteği (2016), “International Conference on Intelligent Computing,

Computer Science and Information Systems (ICCSIS-16)”, 28-29 Nisan 2016, Pattaya,

Tayland, Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu (FDK-2015-4395), (4000.- TL )

Konferans Katılım Desteği (2016), “7th ICISA2016 International Conference on Information

Science and Applications 2016 “, 15 - 18 Şubat 2016, Saigon, Vietnam, Çukurova

Üniversitesi Araştırma Fonu (5603 – FYD-2015-3566), (7000.- TL )

International Center for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB) ve United

Nations University (BIOLAC) (2015), “Theoretical and Practical Course "High

Performance and Cloud Computing for Bioinformatics", 1 - 5 Haziran 2015 Manizales,

Caldas, Kolombiya, (Tam destek, ICGEB ve Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu- Yolluk- MMF-2013 BAP19).

TÜBİTAK (2014), Bilimsel Yayın Destekleme (2 Adet Yayından Dolayı).

7

Konferans Katılım Desteği (2014), “International Conference on Computational Intelligence

and Software Engineering (CiSE 2014)”, 11-13 Temmuz 2014 Pekin, Çin, Çukurova

Üniversitesi Araştırma Fonu, (3000.- TL )

Erasmus Öğretim Elemanı Değişimi (2014), “University of Avero, Portekiz”, Ç.Ü Rektörlüğü

Dışilişkiler Bölümü, 2 – 6 Haziran 2014 (Tam destek).

International Center for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB) (2013),

“Applications of Bioinformatics in Modern Moleculer Biology”, ICGEB – New Delhi

Component Aruna Asaf Ali Marg, New Delhi – 110067 Hindistan, 21-25 Ekim 2013, (Tam

destek).

TÜBİTAK (2012), Bilimsel Yayın Destekleme (2 Adet Yayından Dolayı).

TÜBİTAK (2011), Bilimsel Yayın Destekleme (2 Adet Yayından Dolayı).

Yüksek Öğrenim Kurulu –YÖK (2011), Yurtdışı Öğretim Üyesi Yetiştirme Programı, The

Center for Tropical & Emerging Global Diseases & Department of Genetics, University of

Georgia, 20 Haziran – 16 Eylül 2011 (Tam destek)

TÜBİTAK ( 2010 ), Bilimsel Yayın Destekleme.

International Center for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB) ve United

Nations University (BIOLAC) (2010), “Caribbean Training Programme on

Bioinformatics: Applications of Structural and Computational Biology in Biomedical

Sciences”, The University of the West Indies, St. Augustine Campus, Trinidad and Tobago,

18-29 Ocak 2010, (Tam destek).

Konferans Katılım Desteği (2009), “IPCV2009- The 2009 International Conference on Image

Processing, Computer Vision, and Pattern Recognition” Konferansa Katılım, Las Vegas,

Nevada, USA, 13-16 Temmuz 2009, Çukurova Üniversitesi Araştırma Fonu, (2000.- TL )

Konferans Katılım Desteği (2009), “III. Ulusal Tıbbi Cihazlar İmalat Sanayi Kongre ve

Sergisi (TİSKON 2009)” sine Katılım, Samsun, 06-07 Kasım 2009, TÜBİTAK-106M466

nolu projesi, (Tam destek).

Konferans Katılım Desteği (2007), “ANNIE2007- SMART SYSTEMS ENGINEERING:

Computational Intelligence in Architecting Complex Engineering Systems” Konferansa

Katılım, St. Louis, Missouri, USA, 11-14 Kasım 2007, Çukurova Üniversitesi Araştırma

Fonu, ( 2000.- TL ).

European Science Foundation (2007), “ESF Mining of High-Throughput Data in Functional

Genomics”, Coleraine, Northern Ireland, 8-10 Mayıs 2007, European Science Foundation

fonundan, (Kısmi destek).

Erasmus Öğretim Elemanı Değişimi (2007), “University of Avero, Portekiz”, 14-18 Temmuz

2007, Ç.Ü Rektörlüğü Dışilişkiler Bölümü, (Tam destek).

IEEE-Student Branch-R8 (2000) “IEEE-R8 Student Branch Congress 2000”, Eindhoven,

Hollanda, 14-19 Mayıs 2000, IEEE – Türkiye, (Tam destek).

8

NATO Advanced Study Institute (1996), “Learning in Graphical Models”, International

School of Neural Nets, Ettore Maiorana Centre, Erice, İtalya, 26 Eylül - 7 Ekim 1996,

NATO, (Tam destek).

Ödül:

Best Session Paper: “E. M. Karabulut, T. Ibrikci (2016), “Texture analysis of

Melanoma Images for Computer-aided Diagnosis”, International Conference on

Intelligent Computing, Computer Science and Information Systems (ICCSIS-16).

Excellent Oral Presentation: “JaleBektaş, T. Ibrikci(2017), “Hybrid Classification

Procedure Using SVM with LR on Two Distinctive Datasets Submission”, 2017 6th

International Conference on Software and Computer Applications Proceedings

(ICSCA-2017)

9

Uluslararası Ortak Çalışmalar :

Temmuz-Ağustos

2012

Genetik çalışmalar üzerine

incelemeklerde bulunmak

(Kişisel Ziyaret)

Cornell University,

Ithaca, NY, USA

Haziran-Eylül 2011 Sıtma Genetiği Üzerine

Çalışmalar

Prof. Dr. Jessica Kissinger

Department of Genetics, Institute of

Bioinformatics, Univ. of Georgia,

Athens, GA, USA.

Haziran-Eylül 2004 Biomedikalde Otistik Çocukların

Beyin Görüntüleri Üzerine

Doktora Sonrası Çalışmalar

Assoc. Prof. Dr. M. Brandt

Univ. of Texas at Houston,

Computational Biomedicine Center

(CBMC ).

Houston, TX, USA.

Haziran 2001 –

Eylül 2002

Biomedikalde Otistik Çocukların

Beyin Görüntüleri Üzerine

Doktora Sonrası Çalışmalar

Assoc. Prof. Dr. M. Brandt

Univ. of Texas at Houston,

Computational Biomedicine Center

(CBMC).

Houston, TX, USA.

Haziran-Eylül 1999 Yapay Sinir Ağları ile Protein

Yapıları Tanımı Uygulamaları

Çalışmaları

Prof. Dr. J. Principe

Univ. of Florida, Computational

NeuroEngineering Lab (CNEL).

Gainesville, FL, USA.

Haziran-Eylül 1997 Yapay Sinir Ağları ile Protein

Yapıları Tanımı Uygulamaları

Çalışmaları

Prof. Dr. Daniel Berleant

Univ. of Arkansas, Computer

Engineering Dept.

Fayetteville,AR, USA

Ulusal Ortak Çalışmalar :

Eylül 1995-Mayıs 1996 Doktora Ön Çalışmaları Boğaziçi Üniv., Mühendislik

Fak. Bilgisayar Mühendisliği,

İstanbul, Türkiye

Bilimsel Dergilerdeki ve Projelerdeki Hakemlikler

1. Misafir Editor- OMICS Publishing Group - Journal of Data Mining in Genomics

& Proteomics Open Access, Özel sayı, Başlık: Algorithms for Molecular Biology,

( Dec. 2013 )

2. Applied Soft Computing (2013- )

3. PLOS ONE (2013- )

4. BMC Medical Informations and Decision Making (2012 - )

10

5. Journal of Medical Systems (2012- )

6. TÜBİTAK – Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences ( Konu

Editörlüğü - Hakemlik) ( 2010 - )

7. Expert Systems (2009 - )

8. Türkiye Biyokimya Dergisi ( 2008 - )

9. Bioinformatics ( 2008 – 2011 )

10. TÜBİTAK- TEYDEB Proje Hakemi (2016) – Hakem

11. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı – KOSGEB Proje İzleyicisi – ( 2016 )

12. TÜBİTAK- 2015-2223B 2015 2. DÖNEM (2015) - Dış Danışmanı

13. TÜBİTAK – 1001 Biyoinformatik Araştırma Projeleri - ( 2015 )

14. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı – TeknoGirişim Projeleri – ( 2015 )

15. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı – Ar-Ge Merkezi – ( 2015 )

16. TÜBİTAK- Ortaöğretim Öğrencileri Araştırma Projeleri Yarışması (2015) - Akdeniz

Bölgesi Bilgisayar Jüri Üyesi

17. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı – TeknoGirişim Projeleri – ( 2014 )

18. TÜBİTAK-4006 Bilim Fuarları Destekleme Programı TÜBİTAK’ı temsilen (2014)

19. TÜBİTAK- Ortaöğretim Öğrencileri Araştırma Projeleri Yarışması (2014) - Akdeniz

Bölgesi Bilgisayar Jüri Üyesi

20. TÜBİTAK – 1001 Araştırma Projeleri - ( 2013 )

21. TÜBİTAK- Biyomühendislik Değerlendirmesi (2013) - Dış Danışmanı

22. TÜBİTAK- Ortaöğretim Öğrencileri Araştırma Projeleri Yarışması (2013) - Akdeniz

Bölgesi Bilgisayar Jüri Üyesi

23. TÜBİTAK – 1001 Araştırma Projeleri - ( 2011 )

24. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı – TeknoGirişim Projeleri – ( 2012 )

25. IC-IC 2008 International Conference on Intelligent Computing Sept. 15-18, 2008

26. IC-IC 2007 International Conference on Intelligent Computing Aug. 21-24, 2007

27. IC-IC 2006 International Conference on Intelligent Computing Aug. 16-19, 2006

Sempozyum Görevleri

1. The 2015 International Conference on Fuzzy System and Data Mining

(FSDM2015), 12-15 Aralık 2015, Shanghai, Çin, Hakem

2. SIU-2015 16-19 Mayıs 2015 tarihleri arasında İnönü Ünv. Malatya, Hakem

3. SIU-2014 23-25 Nisan 2014 tarihleri arasında K.T.Ü, Trabzon, Hakem

4. ELECO-2013 29 Kasım - 01 Aralık 2012, Bursa, Hakem

5. ELECO-2012 29 Kasım - 01 Aralık 2012, Bursa, Hakem

6. ITUSEM’2009 Çukurova Üniversitesi, Yürütme Kurul Üyesi

7. ITUSEM’2007 Çukurova Üniversitesi 18-19 Ekim 2007, Yürütme Kurul Üyesi

8. ITUSEM’2005 Çukurova Üniversitesi, 17-19 Kasım 2005,Yürütme Kurul Üyesi

9. INISTA’2005 International Symposium on Innovations in Intelligent Systems and

Applications 15-18 Haziran 2005 Istanbul Bilimsel Kurul Üyesi

10. BIYOMUT’2005 Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı – Boğaziçi Üniversitesi

25-27 Mayıs 2005, Program Üyesi

11. TAINN’96 5. Türk Yapay Zekâ ve Yapay Sinir Ağları Sempozyumu – Boğaziçi

Üniversitesi İstanbul, Yerel Düzenleme Kurulu Üyesi

11

Verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler

1. EEE-117 Computer Programming I

2. INF-101 Fundamentals of Infor. Tech.

3. EEE-425 Programming Language

4. ENF-102 Bilgisayar Programlamaya Giriş

5. EEE-448 Computer Networks

6. BIL-438 Hesaplamalı Biyoloji

7. BIL-429 İnsan-Bilgisayar Etkileşimi

8. BIL-252 İşletim Sistemi

9. BIL-304 Yazılım Mühendisliği

10. EE-587 Artificial Intelligent

11. EE-589 Intr. to Neural Networks

12. EE 588 Advanced Topics in Neural Networks

“EE” ile başlayan dersler, yüksek lisans ve doktora dersleridir.

“EEE” ile başlayan dersler, Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümüne verilen derslerdir.

“BIL” ile başlayan dersler, Bilgisayar Mühendisliği Bölümüne verilen derslerdir.

12

ESERLER

A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler :

1. I.E. Kaya, A.Ç. Pehlivanli, E.G. Sekizkardeş, T. Ibrikci (2017), “PCA Based Clustering

for Brain Tumor Segmentation of T1w MRI Images”,

Computer Methods and Programs in Biomedicine, (ISI), 140: 19–28

DOI:10.1016/j.cmpb.2016.11.011

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169260716304199

2. E.M. Karabulut, T. Ibrikci (2017), “Discriminative deep belief networks for microarray

based cancer classification”. Biomedical Research, (ISI), 28 (3): 1016-1024

http://www.biomedres.info/biomedical-research/discriminative-deep-belief-networks-for-

microarray-based-cancer-classification.pdf

3. J. de Dieu Uwisengeyimana, A. Teke, T. Ibrikci (2016), "Current Overview of Renewable

Energy Resources in Rwanda", Journal of Energy and Natural Resources; 5(6): 92-97 DOI:

10.11648/j.jenr.20160506.13

http://article.sciencepublishinggroup.com/pdf/10.11648.j.jenr.20160506.13.pdf

4. J de Dieu Uwisengeyimana, NK Al_Salihy, T. Ibrikci (2016), "Statistical Performance

Effect of Feature Selection Techniques on Eye State Prediction Using EEG", International

Journal of Statistics in Medical Research, 5(3):224-230

http://lifescienceglobal.com/pms/index.php/ijsmr/article/view/4036

5. T. Ibrikci, E. M. Karabulut, J. D. Uwisengeyimana (2016), "Meta Learning on Small

Biomedical Datasets", Lecture Notes in Electrical Engineering, (376): 933-939,

DOI:10.1007/978-981-10-0557-2_89 - 7th International Conference on Information

Science & Applications (ICISA) 2016

http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-981-10-0557-2_89

6. E.M. Karabulut, T. Ibrikci (2014), “Analysis of Cardiotocogram Data for Fetal Distress

Determination by Decision Tree Based Adaptive Boosting Approach”, Journal of

Computer and Communications, 2: 32-37, DOI:10.4236/jcc.2014.29005

http://www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=47718

7. E.M. Karabulut, T. Ibrikci (2014), “Effective Automated Prediction of Vertebral Column

Pathologies Based on Logistic Model Tree with SMOTE Preprocessing”, Journal of

Medical Systems, (ISI); 38(5):50. DOI:10.1007/s10916-014-0050-0

http://link.springer.com/article/10.1007/s10916-014-0050-0#page-1

8. I. Ersöz Kaya, A. Çakmak Pehlivanli, and T. Ibrikci, (2014),”Enhanced Prediction of

Intrinsically Disordered Regions with the Optimized Data”, Int. Jour. of Bioscience,

Biochemistry and Bioinformatics, 4(1): 39-44 , DOI: 10.7763/IJBBB.2014.V4.307

http://www.ijbbb.org/papers/307-CB033.pdf

9. M. Karabulut, T. Ibrikci, (2014), “Identification of transcription factor binding sites using

Gaussian mixture models”, Expert Systems, (ISI), 31(1) 70-80. DOI: 10.1111/exsy.12004

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/exsy.12004/abstract

13

10. M. Karabulut, T. Ibrikci, (2012), “A Bayesian Scoring Scheme based Particle Swarm

Optimization algorithm to identify Transcription Factor Binding Sites”, Applied Soft

Computing (ISI), 12(9): 2846-2855. DOI: 10.1016/j.asoc.2012.04.006

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1568494612001809

11. M. Karabulut, T. Ibrikci, (2012), “A Fuzzy Self-organizing Map Algorithm for Biology

Pattern Recognition”, Expert Systems, (ISI), 29(1) 25– 38. DOI:

10.1111/j.1468-0394.2010.00560.x

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1468-0394.2010.00560.x/abstract

12. T. Ibrikci, D. Üstün, İ. Ersoz Kaya, (2012), “Diagnosis of Several Diseases by Using a

Novel Hybrid Kernel Support Vector Machine”, Journal of Medical Systems, 36(3) : 1831-

1840. (ISI), DOI: 10.1007/s10916-010-9642-5

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10916-010-9642-5#page-1

13. A. Aydın, T. Ibrikci, İ.D. Akçalı, (2012), “A Hybrid Image Processing System for X-Ray

Images of an Eexternal Fixator”, Computer Methods in Biomechanics and Biomedical

Engineering, 15(7) : 753-759. (ISI), DOI: 10.1080/10255842.2011.560840

http://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/10255842.2011.560840#.U1oinK2KBnc

14. E. M. Karabulut, T. Ibrikçi, (2012) “Effective Diagnosis of Coronary Artery Disease

Using rotation Forest Ensemble Method”, Journal of Medical Systems, 36(5): 3011–3018.

(ISI), DOI: 10.1007/s10916-011-9778-y

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10916-011-9778-y#page-1

15. E. M. Karabulut, S.A. Özel, T. Ibrikci, (2011), “A Comparative Study on the Effect of

Feature Selection on Classification Accuracy”, Procedia Technology 1 (2012), 323 – 327.

DOI: 10.1016/j.protcy.2012.02.068

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2212017312000692

16. İ. Ersöz Kaya, T. Ibrikci, O. K Ersoy, (2011), “Prediction of Disorder with New

Computational Tool: BVDEA”, Expert Systems with Applications. 38(12): 14451-14459.

(ISI), DOI: 10.1016/j.eswa.2011.04.160

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0957417411006877

17. M. Karabulut, T. Ibrikci, (2011), “Assessment of Clustering Algorithms for Unsupervised

Transcription Factor Binding Site Discovery”, Expert Systems with Applications, 38(9) :

11160-11166. (ISI), DOI: 10.1016/j.eswa.2011.02.161

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S095741741100385X

18. A. Keskiner, T. Ibrikci, M. Çetin (2011), “Yapay Sinir Ağlarıyla Coğrafi Bilgi Sistemi

Ortamında Olasılıklı Sıcaklık Tahmini ve Karşılaştırılması”, Tarım Bilimleri Dergisi, 17 :

241- 252 (Türkçe). (ISI).

https://editor.ankara.edu.tr/index.php/tarim_bilimleri/article/view/818

19. C. Türeli Bilen, P.Kokcü, T. Ibrikci (2012) “Application of Artificial Neural Networks

(ANNs) for Weight Predictions of Blue Crabs (Callinectes sapidus RATHBUN, 1896)

Using Predictor Variables”, Mediterranean Marine Science, 12(2) : 439-446. (ISI).

DOI: 10.12681/mms.43

14

http://www.medit-mar-sc.net/index.php/marine/article/view/43

20. T. Ibrikci, M. Karabulut, (2010), “Employing Fuzzy C-Means for DNA Transcription

Factor Binding Site Identification”, Journal of Circuits, Systems, and Computers, 19(1):

15-30. (ISI), DOI: 10.1142/S0218126610005925

http://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0218126610005925

21. T. Ibrikci, S. Sacma, V. Yıldırım, T. Koca, (2010), “Application of Artificial Neural

Networks in the Prediction of Critical Buckling Loads of Helical Compression Springs”,

Journal of Mechanical Engineering, 56 (6): 409-417. (ISI).

http://ojs.sv-jme.eu/index.php/sv-jme/article/view/117

22. I. Kaya, T. Ibrikci, A. Cakmak, (2008), “Accurate Prediction of Protein Secondary

Structure by Non-Parametric Models”. Journal of Computational Intelligence in

Bioinformatics, 1: 1-11.

http://www.ripublication.com/Volume/jcibv1n1.htm

23. A. Ç. Pehlivanlı, T. Ibrikci, O. K Ersoy, (2008), “Consensual Classification of Drug and

Nondrug Compounds”, International Jour. of Computational Biology and Drug Design, 1

(3): 224-234. DOI: 10.1504/IJCBDD.2008.021416

https://inderscience.metapress.com/content/55105wjp7150t105/resource-

secured/?target=fulltext.pdf

24. A. Ç Pehlivanlı, O. K Ersoy, T. Ibrikci, (2008), “Drug/Nondrug Classification with

Consensual Self-Organising Map and Self-Organizing Global Ranking Algorithms”,

International Jounal of Computational Biology and Drug Design, 1(4): 434-445. DOI:

10.1504/IJCBDD.2008.022212

http://inderscience.metapress.com/content/d422980j035wq572/

25. M. Karabulut, T. Ibrikci, (2008), “Fuzzy C-Means Based Motif Discovery”, Lecture Notes

in Computer Science, 5226: 207-218. (ISI) DOI: 10.1007/978-3-540-87442-3_24

http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-540-87442-3_24

26. U. Orhan, M. Hekim, T. Ibrikci, (2008), “Supervised Gravitational Clustering with

Bipolar Fuzzification”, Lecture Notes in Artificial Intelligence, 5227: 667-674. (ISI) DOI:

10.1007/978-3-540-85984-0_8

http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-540-85984-0_80

27. U. Orhan, M. Hekim, T. Ibrikci, (2008), “Gravitational Fuzzy Clustering”, Lecture Notes

in Artificial Intelligence, 5317: 524-531. (ISI). DOI: 10.1007/978-3-540-88636-5_50

http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-540-88636-5_50

B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler :

1. Bektas J., İbrikçi T., "Hybrid Classification Procedure Using SVM with LR on Two

Distinctive Datasets ", The 2017 6th International Conference on Software and

Computer Applications (ICSCA 2017), Bangkok, THAILAND, Feb. 26-28, 2017

15

2. Al-Salihy N.K. , İbrikçi T., "Classifying Breast Cancer by Using Decision Tree

Algorithms ", The 2017 6th International Conference on Software and Computer

Applications (ICSCA 2017), Bangkok, THAILAND, Feb.,26-28 2017, pp.1-5

3. T. İbrikçi, İ. E. Kaya, (2016), "SAA proteinlerinin yapısal özelliklerinin makina

öğrenme metotları ile ortaya konulması", 1st International Mediterranean Science &

Engineering Congress (IMSEC2016), Oct.26-28, 2016, Adana/TURKEY, pp:1001-1007

4. E. Özcan, M. S. Ardıç, T. İbrikçi, A. Teke (2016), "Bölgesel toplam güneş radyasyonu

tahminlerinde yapay sinir ağları ve destek vektör makineleri metotlarının kıyaslanmaları",

1st International Mediterranean Science&Engineering Congress(IMSEC2016), Oct.26-

28, 2016, Adana/TURKEY pp:12-17

5. M. Ö. Yücekul, T. İbrikçi(2016), "Prediction of protein residue contact maps by using

supervised learning methods", 1st International Mediterranean Science&Engineering

Congress(IMSEC2016), Oct.26-28, 2016, Adana/TURKEY, pp: 3356-3363

6. İ. E. Kaya, T. İbrikçi, A.Ç. Pehlivanlı(2016), "Düzensiz proteinlerin yapı tahmininde

açıklayıcı özelliklerin etkisi", 1st International Mediterranean Science&Engineering

Congress(IMSEC2016), Oct.26-28, 2016, Adana/TURKEY, pp:4604-4612

7. E. M. Karabulut, T. Ibrikci (2016), “Texture analysis of Melanoma Images for

Computer-aided Diagnosis”, International Conference on Intelligent Computing,

Computer Science and Information Systems (ICCSIS-16), At Pattaya, Thailand, Volume:

Vol. II. DOI : 10.15242/IAE.IAE 416011

http://ia-e.org/images/proceedings_pdf/IAE0416011.pdf

8. E. Karabulut, T. Ibrikci, (2015), “Emphysema Discrimination from Raw HRCT Images

by Convolutional Neural Networks”, The 9th International Conference on Electrical and

Electronics Engineering, ELECO 2015, Nov. 26-28, 2015, Bursa, Turkey.

http://ieeexplore.ieee.org/document/7394441/?arnumber=7394441&tag=1

9. İ. D. Akçalı, E. Avşar, A. Durmaz, A. Aydın, M. K. Ün, T. İbrikçi, H. Mutlu, , C. Özkan,

Ö. S. Biçer,(2015), “Singularity Detection in An External Fizator of Gough-Stewart

Plotform Type”, International Conference on Innovation Technologies, IN-TECH 2015

Oct. 09-11, 2015, Dubrovnik, Croatia.

10. İ. D. Akçalı, E. Avşar, M. K. Ün, A. Aydın, T. İbrikçi, H. Mutlu, Ö. S. Biçer, C. Özkan,

A. Durmaz,(2014) “Displacement Analysis of Robotic Frames for Reliable and Versatile

Use as External Fixator”, The 4th Annual IEEE International Conference on CYBER

Technology in Automation, Control, and Intelligent Systems (IEEE-CYBER 2014),180-

185, June 4-7, 2014 Hong Kong, Çin.

http://ieeexplore.ieee.org/document/6917457/?arnumber=6917457&tag=1

11. İ. D. Akçalı, M. O. Şahlar, K. Ün, A. Aydın, T. Ibrikci, R. Esen, M. Gülşen, H. Bayram,

H., (2009), “A Mathematical Model in the Implementation of a Stewart-Gough Platform

as an External Fixator”, Medical Physics and Biomedical Engineering World Congress,

IFMBE Proceeding 25/V :708-711, 7-12 Sept. 2009, Munih, Almanya.

http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-3-642-03882-2_189

16

12. İ. D. Akçalı, M. O. Şahlar, A. Aydın, T. Ibrikci, K. Ün, R. Esen, M. Gülşen, H. Bayram,

(2009), “Alignment of Bone Fragments Through the Deployment of a Stewart Platform

Mechanism”, Artificial Organs, 33(8) : A99 (Özetçe).

13. J. Bektas, T. Ibrikci, (2009), “Using Threshold Techniques with K-Means Approch for

MRI Segmentation”, The 2009 International Conf. on Image Processing, Computer

Vision, and Pattern Recognition (IPCV'09), 2: 651-655, 13-16 July 2009, Las Vegas,

Nevada, ABD.

14. U. Orhan, I. Ersoz, T. Ibrikci, (2007), “Prediction of Disordered Regions of Proteins

with N-Pieces Naive Algorithm”, Intelligent Engineering Systems Through Artificial

Neural Networks: Smart System Engineering (ANNIE'07), 17: 43-48, 11-14 Nov. 2007,

St. Louis, Missouri, ABD.

15. G. Yiğitler, O. K. Ersoy, T. Ibrikci, (2005), “New Transform Techniques for

Enhancement and Fusion of Multispectral and Hyperspectral Images”, ICSC Congress on

Computational Intelligence Methods and Applications (CIMA2005), 15-17 Dec. 2005,

İstanbul, Türkiye. DOI: 10.1109/CIMA.2005.1662344

16. T. Ibrikci, A. Cakmak, I. Ersoz, O. K. Ersoy, (2005), “Hemoglobin Secondary Structure

Predicts with Four Kernels on Support Vector Machines”, ICSC Congress on

Computational Intelligence Methods and Applications (CIMA2005), 15-17 Dec. 2005,

İstanbul, Türkiye. DOI: 10.1109/CIMA.2005.1662310

17. T. Ibrikci, A. Çakmak, I. Ersöz, O. K. Ersoy, 2005, “Support Vector Machines on

Hemoglobin Secondary Structures”, 3rd European Medical & Biological Engineering

Conference (EMBEC'05), 11(1), 20-25 Nov. 2005, Prag, Çek Cumhuriyeti.

18. C. Şahin, T. Ibrikci, R. Erol, (2005), “Neural Networks Approach to the Lot Sizing

Problem”, 35th International Conference on Computers and Industrial Engineering

(CIE2005), 15-19 June 2005, İstanbul, Türkiye.

19. I. Ersoz, T. Ibrikci, A. Cakmak, O. K. Ersoy, (2004), “Secondary Structure Prediction of

Hemoglobin by Neural Networks”, Intelligent Engineering Systems Through Artificial

Neural Networks: Smart System Engineering (ANNIE'04), 14: 837-842, 7-10 Nov. 2004,

St. Louis, Missouri, ABD.

20. M. Brandt, J. Frederick, T. Ibrikci, L. Kramer, K. Davidson, and J. Fletcher, (2003),

“Estimation of Brain Tissue Volumes from Magnetic Resonance Scans in Spina

Bifida”, Thirty-First Annual International Neuropsychological Society Conference,

Journal of the International Neuropsychological Society, 9, 176, 5-8 Feb. 2003,

Honolulu, Hawaii.

21. T. Ibrikci, M. Brandt, G.Wang, M. Açıkkar, (2002), “Mahalanobis Distance with Radial

Basis Function Network on Protein Secondary Structures”, 24rd International IEEE-

Engineering in Medicine and Biology (EMBS2002), 3: 2184-2185, 23-26 Oct. 2002,

Houston, TX, ABD.

17

22. V. Krishnamurthi, T. Ibrikci, S. Arıca, (1995), “Signal of Processing and Modeling of

the Response of Crayfish Photosensitive Ganglion”, International 14th IEEE-Engineering

in Medicine and Biology (EMBS1995), 2: 74-75, 15-18 Feb. 1995, New Delhi, Hindistan.

23. T. Ibrikci, V. Krishnamurthi, (1995), “Application of Neural Network For Home

Security System”, the Second International Conference on Artificial Neural Networks

and Genetic Algorithms (ICANNGA'95), sf: 448-451, 19-21 April 1995, Alès, Fransa.

D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler :

1. Ahmet AYDIN, İbrahim D. AKÇALI, Ercan AVŞAR, M. Kerem ÜN, Hüseyin MUTLU,

T. İbrikçi, Ömer S. BİÇER, Cenk ÖZKAN ve Atakan DURMAZ(2015), Tekil Olmayan

Fiksatör Otomasyonu, Ç.Ü. Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, 30(2), 81-92.

2. Ercan AVŞAR, İbrahim D. AKÇALI, Ahmet AYDIN, M. Kerem ÜN, Hüseyin MUTLU,

T. İbrikçi, Cenk ÖZKAN ve Ömer S. BİÇER(2015), Ortopedik Uygulamalarda

Bilgisayarlı Denetim Sistemi, Ç.Ü. Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dergisi, 30(2), 93-

101.

3. J. Bektaş, T. İbrikçi, (2013), “An MRI Study on Volumetric Changes in the Brain of

Female Adolescents with Autism” , Ç.Ü. Journal of Faculty of Engineering and

Architecture, 28 (2): 27-34.

4. T. İbrikçi, O.Şen (2012), “Comparison of Nonlinear Classication on Brain MRI’s” , Ç.Ü.

Journal of Science and Engineering, 28 (3): 128-137.

5. İ.D. Akçalı, M.O. Şahlar, A. Aydın, T. Ibrikci, K. Ün, R. Esen, M. Gülşen, H. Bayram,

(2010), “Ortopedik Klinik Uygulamaları için Bir Fiksatörün Tasarımı İmalatı ve

Kullanışı”, Mühendislik ve Makina, 51 (600): 2-9.

6. G. Çetin, T. Ibrikci, (2010), “Internet Traffic Forecasting and Analyzing of Turkey by

Using Neural Networks”, Ç.Ü. Journal of Science and Engineering, 23(3): 187-198.

7. I. Kaya, Ersöz, T. Ibrikci, O. K Ersoy, (2008), “Prediction of Protein Disorder Regions

with Support Vector Machines”, Ç.Ü. Journal of Faculty of Engineering and

Architecture, 23 (2): 257-267.

8. U. Eşme, I. Kaya, Ersöz, F. Kahraman, A. Sağbaş, T. Ibrikci, (2008), “Comprative

Modelling in Low Plasticity Burning (LPB) Process Using Back-Propagation (BPN) and

General-Regression Networks (GRNN)”, Ç.Ü. Journal of Faculty of Engineering and

Architecture, 23 (2): 1-13.

E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler:

18

1. İ. D. Akçalı, E. Avşar, A. Durmaz, İ. Sağdıç, A. Aydın, M.K. Ün, H. Mutlu, T. İbrikçi,

C. Özkan, Ö. S. Biçer,(2015), “Fiksatörün En Yakın Noktalar Yaklaşımıyla Tekillik

Denetimi”, Tıp Teknolojileri Ulusal Kongresi, TIPTEKNO’15, 15-18 Ekim 2015,

Bodrum, Türkiye

2. G. Dişken, T. İbrikçi, (2015), “Mel-Frekans Kestral Katsayıları ve Dinamik Zaman

Bükmesi Yöntemi Kullanılarak Konuşma-Dışı Seslerin Tanınması- Recognition of non-

speech sounds using Mel-frequency cepstrum coefficients and dynamic time warping

method”, SİU-2015, 16-19 Mayıs 2015, 48-51, Malatya, Türkiye

3. İ. Çetin Taş, T. İbrikçi, S. Arıca, (2012), “Fundus Floresan Anjiografi Görüntülerinde

Diyabetik Retinopati Nedeniyle Oluşan Kanamaların Kümeleme, Sınıflama ve İyileştirme

Yöntemlerini Kullanarak Belirginleştirilmesi”, ELECO 2012, 29 Kasım-01 Aralık 2012,

Bursa, Türkiye.

4. E. Karabulut, T. İbrikçi, (2010), “Birleştirilmiş Yapay Sinir Ağlarıyla Parkinson

Hastalığı Teşhisi”, ELECO 2010, 2-5 Aralık 2010, Bursa, Türkiye.

5. İ.D. Akçalı, M.O. Şahlar, A. Aydın, T. İbrikçi, K. Ün, R. Esen, M. Gülşen, H. Bayram,

(2009), “Ortopedik Klinik Uygulamalar İçin Bir Fiksatörün Tasarımı İmalatı ve

Kullanılışı”, III. Ulusal Tıbbi Cihazlar İmalatı Sanayi Kongre ve Sergisi (TİSKON 2009),

33-43, 6-7 Kasım 2009, Samsun, Türkiye.

6. P. Kökçü, C. Türeli, T. İbrikçi, “Sepia officinalis (L.)’nin Bazı Morfolojik Özelliklerinin

Hesaplanmasında Yeni Bir Yaklaşım: Yapay Sinir Ağlarının Kullanılması”, XV. Ulusal

Su Ürünleri Sempozyumu, 01-04 Temmuz 2009, Rize

7. İ.D. Akçalı, M.O. Şahlar, A. Aydın, T. İbrikçi, K. Ün, R. Esen, M. Gülşen, H. Bayram,

(2009), “Stewart Platform Mekanizmasının Konuşlandırılmasıyla Kemik Fragmanlarının

Hızlanması”, 2.Ulusal Yapay Organlar ve Destek Sistemleri Kongresi, 16, 23-26 Nisan

2009, Antalya, Türkiye.

8. T. İbrikçi, A. Çakmak, İ. Ersöz, M. Açıkkar, (2004), “Destek Vektörlerinin Proteinlerin

İkincil Yapılarını Tahmin etmek için Uygulanması”, X. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal

Toplantısı (BİYOMUT 2004), 114-118, 25-27 Mayıs 2004, İstanbul, Türkiye.

9. T. İbrikçi, A. Çakmak, İ. Ersöz, (2003), “Protein İkincil Yapıların Kendi Kendine

Organize Olma Metodu ile Tahmin Edilmesi”, IX. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal

Toplantısı (BİYOMUT 2003), 29-30 Mayıs, 2003, İstanbul, Türkiye.

10. N. Özdemir, T. İbrikçi, V. Tunay, N. Köroğlu, (2002), “El Yazı Rakamların Hatayı

Hızla Geriye Yayma Metodu Kullanılarak Tanınması”, Dr. Arslan Yazıcı Sempozyumu,

37-39, 27-29 Kasım 2002, Adana, Türkiye.

11. T. İbrikçi, M. Güler, (2000), “Multilayer Networks Applied to Protein Secondary

Structure Prediction”, Türk Yapay Zekâ ve Sinir Ağları Sempozyumu (TAINN 2000), 199-

208, 21-23 Haziran, 2000, İzmir, Türkiye.

19

12. T. İbrikçi, K. Balasubramanian, Z.G. Altun, (1994), “Learning Time in Neural

Network”, Ç.Ü Müh-Mim. Fak. 15 Yıl Sempozyumu, Çukurova Üniv. Müh-Mim. Fak.

Dergisi Özel Sayısı, 1: 439 - 444, 4-7 Nisan 1994, Adana, Türkiye.

F. Diğer yayınlar :

1. İ. D. Akçalı, R.Esen, T. İbrikçi, M.K. Ün, (2010), “Fixatör Otomasyonu”, TÜBİTAK

Final Raporu, Proje No: 106M466.

2. V. Yıldırım, T. İbrikçi, N. Tütüncü, (2008), “Ön Yüklü Helisel Başı Yaylarının Lineer

Statik, Burkulma ve Serbest Titreşim Problemleri için Bir Paket Programın Hazırlanması

ve Tasarım Grafiklerinin Elde Edilmesi”, TÜBİTAK Final Raporu, Proje No: 106M307.

3. T. İbrikçi, (2007), “İşlemsel ve İstatistiksel Akıllı Yöntemlerin Düzenli ve Düzensiz

Yapılı Proteinlerin İşlevlerinin Tanımlanması ve Onarıcı İlaç Tasarımına Uygulanması”,

TÜBİTAK Final Raporu, Proje No: 104T505.

4. T. İbrikçi, (2003), “Destek Vektörleri Yöntemi Kullanarak Proteinlerin İkincil

Yapılarının Tanımlanması”, TÜBİTAK Final Raporu, Proje No: 100E037.

20

Uluslararası atıflar :

1. ISI Web of Science’ a göre 45 atıf

Average Citations per Item : 1.54

h-index :4

2. Google Scholar’ a göre 148 atıf

h-index : 7

i-10 = 3

*29-05-2017 tarihinde güncellenmiştir.