17
UvA-DARE is a service provided by the library of the University of Amsterdam (http://dare.uva.nl) UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for melioidosis New insights into the epidemiology and pathophysiology Birnie, E. Link to publication Creative Commons License (see https://creativecommons.org/use-remix/cc-licenses): Other Citation for published version (APA): Birnie, E. (2019). Digging for melioidosis: New insights into the epidemiology and pathophysiology. General rights It is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s), other than for strictly personal, individual use, unless the work is under an open content license (like Creative Commons). Disclaimer/Complaints regulations If you believe that digital publication of certain material infringes any of your rights or (privacy) interests, please let the Library know, stating your reasons. In case of a legitimate complaint, the Library will make the material inaccessible and/or remove it from the website. Please Ask the Library: https://uba.uva.nl/en/contact, or a letter to: Library of the University of Amsterdam, Secretariat, Singel 425, 1012 WP Amsterdam, The Netherlands. You will be contacted as soon as possible. Download date: 18 Oct 2020

UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

UvA-DARE is a service provided by the library of the University of Amsterdam (http://dare.uva.nl)

UvA-DARE (Digital Academic Repository)

Digging for melioidosisNew insights into the epidemiology and pathophysiologyBirnie, E.

Link to publication

Creative Commons License (see https://creativecommons.org/use-remix/cc-licenses):Other

Citation for published version (APA):Birnie, E. (2019). Digging for melioidosis: New insights into the epidemiology and pathophysiology.

General rightsIt is not permitted to download or to forward/distribute the text or part of it without the consent of the author(s) and/or copyright holder(s),other than for strictly personal, individual use, unless the work is under an open content license (like Creative Commons).

Disclaimer/Complaints regulationsIf you believe that digital publication of certain material infringes any of your rights or (privacy) interests, please let the Library know, statingyour reasons. In case of a legitimate complaint, the Library will make the material inaccessible and/or remove it from the website. Please Askthe Library: https://uba.uva.nl/en/contact, or a letter to: Library of the University of Amsterdam, Secretariat, Singel 425, 1012 WP Amsterdam,The Netherlands. You will be contacted as soon as possible.

Download date: 18 Oct 2020

Page 2: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

– P O R T F O L I O – L I S T O F A U T H O R S A N D A F F I L I A T I O N S– P U B L I C A T I O N L I S T – A B O U T T H E A U T H O R – D A N K W O O R D / W O R D O F T H A N K S

Digging for Mel io idosis

388

A D D E N D U M

Page 3: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

P O R T F O L I O

Emma BirniePhD period: October 2015 – June 2019Name PhD supervisors: Prof. dr. W. Joost Wiersinga & Prof. dr. Martin P. GrobuschPhD candidate at the Center for Experimental Molecular Medicine (CEMM) & Center for Tropical Medicine and Travel Medicine, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Courses year ECTSThe AMC World of Science 2015 0.7Basic Lab and Safety course 2015 1.0Basic course legislation and organization (BROK) 2015 1.0Practical Biostatistics 2015 1.1Laboratory Animals (art. 9) 2016 2.5Oral presentation course 2016 0.8Advanced qPCR course 2016 0.7Advanced Topics in Biostatistics 2018 2.1Computing in R 2018 0.4Diploma in Tropical Medicine and Hygiene (DTM&H), Liverpool, UK 2019 Planned

Seminars and MasterclassesCEMMinars 2015-2019 1.0CEMMposium 2015-2019 1.0Retraite Infection & Immunity, Radboud University & 2015-2019 2.0Amsterdam UMC

PresentationsIn search for melioidosis in Gabon: an environmental, and 2013 clinical 2013 0.5surveillance study. 7th World Melioidosis Congress, Bangkok, Thailand (poster)

Differences in inflammation patterns induced by African and Asian 2016 0.5Burkholderia pseudomallei isolates in mice.8th World Melioidosis Congress, Cebu, Philippines (poster)

Platelets play a protective role in the host defense against Burkholderia 2017 0.5pseudomallei (melioidosis). ISTH, Berlin, Germany (poster)

Platelets play a protective role in the host defense against Burkholderia 2017 0.5pseudomallei (melioidosis). South Asian Melioidosis Congress, Colombo, Sri Lanka (poster)

Platelets play a protective role in the host defense against Burkholderia 2017 0.5pseudomallei (melioidosis). European Shock Society, Paris, France (poster)

Sec t ion IV / Addendum

389

Page 4: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Melioidosis, Never heard of it? Course Infectious Diseases, Graduate School, 2017 0.5Amsterdam UMC, University of Amsterdam,The Netherlands (oral presentation)

Global burden of melioidosis: a systematic review and meta-analysis. 2017 0.528th ECCMID 2018, Madrid, Spain (poster)

The typical melioidosis patient: a systematic review. 2018 0.5European Melioidosis Congress, Oxford, United Kingdom (poster)

Platelets in the host defense against melioidosis. 2018 0.5European Melioidosis Congress, Oxford, United Kingdom (oral presentation)

Global burden of melioidosis: a systematic review and meta-analysis. 2018 0.5European Melioidosis Congress, Oxford, United Kingdom (oral presentation)

Mossy Foot – Documentary 2018 0.5 The First International Podoconiosis Conference, Addis Ababa, Ethiopia (presentation trailer of documentary)

ConferencesWorld Melioidosis Congress, Bangkok, Thailand, Cebu, Philippines 2013, 2016 2.0 South Asian Melioidosis Congress, Colombo, Sri Lanka 2017 1.0European Shock Society Congress, Paris, France 2017 1.0International Sepsis Symposium, Paris, France 2017 1.0European Melioidosis Congress, Oxford, UK 2018 1.0

WorkshopsBurkholderia pseudomallei soil sampling workshop, Mahidol, Ubon, Thailand 2012 1.5Pre-congress workshop, 8th World Melioidosis Congress, Cebu, Philippines 2016 0.5Foodborne Global Burden Disease workshop, RIVM, Bilthoven, The Neherlands 2017 0.5Global Burden Disease Technical Training Workshop two weeks, Greece 2017 3.0First WHO African Melioidosis Workshop, Lagos, Nigeria 2019 1.0

Awards & GrantsHonors prize - First prize competition Honours programme 2011 € 1.000Van Walree Scholarship - travel grant World Melioidosis Congress 2013 € 700AUF Spinoza Scholarship - travel grant World Melioidosis Congress 2013 € 450Hippocrates Prize - Best scientific internship of medical student 2014 € 2,000Dr I. Snapper prize - Best scientific contribution of student to internal medicine 2015 € 2,000Academic Medical Center PhD Scholarship award - Melioidosis in Africa - Awarded 2015 €205,000by Executive Board of the AMCT’Scholten Cordes Fund - Melioidosis in Africa 2016 € 5,000Amsterdam University Project Scholarship - In search of Melioidosis in Africa 2016 € 8,000VSB Scholarship - Diploma of Tropical Medicine & Hygiene 2016 € 7,000 Royal Society of Tropical Medicine & Hygiene - travel grant 2016 € 1,300 World Melioidosis Congress Genootschap ter bevordering van Natuur-Genees- en Heelkunde (GNGH) 2016 € 500- travel grant World Melioidosis Congress

Digging for Mel io idosis

Page 5: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Young Talent Fund (AMC) - Research Traineeship Oxford Tropical Medicine Unit, 2016 € 2,500 Bangkok, ThailandFoundation the Drie Lichten (the Netherlands) - In search for melioidosis in 2016 € 6,500Sierra Leone Dutch Albert Schweitzer Price - Prevent podoconiosis wear shoes, Ethiopia, 2016 € 5,000price best medical health project in Africa First poster prize - South Asian Melioidosis Congress, Cebu, Sri Lanka 2017European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 2018 € 20,000(ESCMID) Research Grant Young Investigator for outstanding research proposal - In Search of Melioidosis in NigeriaOtto Kranendonk Foundation - A Pragmatic Trial to treat and prevent 2018 €10,000podoconiosis patients,' Sodo, Ethiopia

Student monitoring and TeachingBachelor research Project - Dorien Salet 2016 0.5Master Thesis - Senne van ‘t Hoff 2017-2018 2.0Diverse Research Projects Honours Master Programme -Jelmer Savelkoel 2017-2019 2.0 Experience in collaborative research abroadMahidol Oxford Tropical Research Unit Ubon Ratchatjani & Bangkok, Thailand 2012- Soil sampling and serology training(Ass. Prof. D. Limmathurotsakul, Dr. V. Wuthiekanun)Albert Schweitzer Hospital, Gabon - Identification of melioidosis patient and 2012-2013new B. pseudomallei spp (Dr. A. Alabi, Prof. M.P Grobusch, Prof. W.J. Wiersinga)Lion Hart Medical Center, Yele, Sierra Leone - Identification of new 2017B. thailandensis spp in Sierra Leone (Drs. Y. Mansaray, Drs. A. Bijnsdorp, Drs. E. Huizenga, Prof. M.P. Grobusch, Prof. W.J. Wiersinga, Prof. M.P. Grobusch, Prof. W.J. Wiersinga)Mossy Foot Project, Sodo, Ethiopia - Prevent and treat podoconiosis patients 2017-current(Dr. A.L Cremes, Dr. B.J. Visser, Dr. Zebdewos Gethun, Prof. M. van Vugt) Lagos University Teaching Hospital, Lagos, Nigeria - In Search of Melioidosis 2019-currentin Nigeria (Prof A.S. Akanmu, Dr R. Oladele, Prof W.J. Wiersinga)

OtherBoard member - Project Group Global Health Education, Amsterdam UMC, 2013-current 1University of AmsterdamReviewer peer reviewed journals - Emerg Infect Dis, PLoS Negl Trop Dis, 2015-current 1PLoS Pathogens, PLoS One, AJTMH, Lancet Global Health, e.g.Associate Faculty Member F1000 - Prime Faculty Member 2015-current 0.5Key initiator and member organizing committee - First WHO African 2018-2019 2Melioidosis Workshop, March, 2019, Lagos, Nigeria,Mossy foot, documentary and photo project, crowdfunding event 2017-current 2Board member - Foundation Help Tropical Health 2019-current 0.5Member organizing committee of the Summer school - The Art of Academic 2019-current 1Writing, University of Accra, Ghana

Sec t ion IV / Addendum

391

Page 6: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

L I S T O F A U T H O R S A N D A F F I L I A T I O N S

Gregoire K. Adzoda Albert Schweitzer Hospital, Lambaréné, Gabon

Abraham S. AlabiAlbert Schweitzer Hospital, Lambaréné, Gabon

Eric BertheratDepartment of Infectious Hazard Management, Health Emergency programme, World Health Organization, Geneva, Switzerland

Clara BelzerLaboratory of Microbiology, Wageningen University, Wageningen, The Netherlands

Anne BijnsdorpLion Heart Medical Centre, Yele, Sierra Leone

Adriaan D. BinsDepartment of Internal Medicine, Division of Infectious Diseases, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Andries E. BuddingDepartment of Medical Microbiology, Amsterdam UMC, Vrije Universiteit, Amsterdam, The Netherlands

Theodora A. M. ClaushuisCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Anne Lia CremersCenter for Tropical Medicine and Travel Medicine, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands;

Nicholas P.J. DayDepartment of Tropical Hygiene, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand; Center for Tropical Medicine and Global Health, University of Oxford, United Kingdom

David A.B. DanceLao-Oxford-Mahosot Hospital-Wellcome Trust Research Unit, Microbiology Laboratory, Maho-sot Hospital, Vientiane, Lao PDR; Centre for Tropical Medicine and Global Health, University of Oxford, Oxford, UK; Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, UK

Brecht DevleesschauwerDepartment of Epidemiology and Public Health, Sciensano, Brussels, Belgium; Department of Veterinary Public Health and Food Safety, Faculty of Veterinary Medicine, Ghent University, Merelbeke, Belgium

Digging for Mel io idosis

392

Page 7: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Arie van der EndeDepartment of Medical Microbiology, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amster-dam, Amsterdam, The Netherlands

Jasmin Ersöz Center for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Merel EsenInstitute of Tropical Medicine, University of Tübingen and Partner site Tübingen, German Center for Infection Research, Tübingen, Germany

Bart FerwerdaDepartment of Neurology, Center of Infection and Immunity Amsterdam, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Martin P. Grobusch, Center for Tropical Medicine and Travel Medicine, Department of Infectious Diseases, Division of Internal Medicine, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands; Centre de Recherche Médicales de Lambaréné (CERMEL) and African Partner Insti-tution, German Center for Infection Research, Lambaréné, Gabon; Masanga Medical Research Unit, Masanga, Sierra Leone

Juanita HaagsmaDepartment of Public Health, Erasmus MC University Medical Center, Rotterdam, The Nether-lands

Bastiaan W. HaakCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Senne van ’t HofCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands Baidoung HouKey Laboratory of Infection and Immunity, Institute of Biophysics, Beijing, China

Riekelt H. Houtkooper Laboratory Genetic Metabolic Diseases, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amster-dam, Amsterdam, The Netherlands

Joppe W.R. HoviusCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM) & Department of Internal Medicine, Division of Infectious Diseases, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

393

Sec t ion IV / Addendum

Page 8: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Floor HugenholtzCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Robert A.G. Huis in ‘t VeldDepartment of Medical Microbiology, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amster-dam, Amsterdam, The Netherlands

Erdi HuizengaLion Heart Medical Centre, Yele, Sierra Leone

Michaela A.M. HusonCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Saskia KolkmanDepartment of Radiology, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amster-dam, The Netherlands Peter G. KremsnerCentre de Recherche Médicales de Lambaréné (CERMEL) and African Partner Institution, Ger-man Center for Infection Research, Lambaréné, Gabon; Institute of Tropical Medicine, University of Tübingen and Partner site Tübingen, German Center for Infection Research, Tübingen, Germany

Gavin C.K.W. KohDepartment of Medicine, University of Cambridge, Cambridge, United Kingdom

Jacqueline M. LankelmaCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Bertrand LellCentre de Recherche Médicales de Lambaréné (CERMEL) and African Partner Institution, Ger-man Center for Infection Research, Lambaréné, Gabon; Institute of Tropical Medicine, University of Tübingen and Partner site Tübingen, German Center for Infection Research, Tübingen, Germany

Direk LimmathurotsakulMahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Mahidol University, Bangkok, Thailand

Esther C. Löwenberg Department of Experimental Vascular Medicine, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Harry K. MabalaCentre de Recherche Médicales de Lambaréné (CERMEL) and African Partner Institution, Ger-man Center for Infection Research, Lambaréné, Gabon

Digging for Mel io idosis

394

Page 9: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Yembeh MansarayLion Heart Medical Centre, Yele, Sierra Leone

Rapeephan R. MaudeFaculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand

Joost C.M. MeijersDepartment of Experimental Vascular Medicine & Department of Plasma Proteins, Sanquin Research, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Nether-lands

Daan W. NotermansCentre for Infectious Disease Control, National Institute for Public Health and the Environment (RIVM), Bilthoven, The Netherlands

Sharon J. PeacockFaculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand; Department of Medicine, University of Cambridge, Addenbrooke's Hospital, Cambridge, United Kindom

Tom van der PollCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM) & Department of Internal Medicine, Division of Infectious Diseases, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Yannick Raczynski-HenkEx-Situ Silex, Leiden, The Netherlands

Frans ReubsaetCentre for Infectious Disease Control, National Institute for Public Health and the Environment (RIVM), Bilthoven, The Netherlands

Joris J.T.H. RoelofsDepartment of Pathology, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amster-dam, The Netherlands

Jelmer SavelkoelCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Brendon P. SciclunaCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Robin SoetekouwSpaarne Gasthuis, Haarlem, The Netherlands

395

Sec t ion IV / Addendum

Page 10: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Rene SpijkerCochrane The Netherlands, Julius Center for Health Sciences and Primary Care, University Medical Center Utrecht, University Utrecht, The Netherlands and Medical Library, Amsterdam Public Health, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Jos J.A. TrentelmanCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Cornelis van ‘t VeerCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Harjeet S. VirkCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Caroline E. VisserDepartment of Medical Microbiology, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amster-dam, Amsterdam, The Netherlands

Alex F. de VosCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Alex WagemakersCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Jerry WareUniversity of Arkansas for Medical Sciences, Little Rock, United States

Tassili A.F. WeehuizenCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM), Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

W. Joost WiersingaCenter for Experimental and Molecular Medicine (CEMM) & Department of Internal Medicine, Division of Infectious Diseases, Amsterdam UMC, location AMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands

Vanaporn WuthiekanunMahidol-Oxford Tropical Medicine Research Unit, Mahidol University, Bangkok, Thailand

Digging for Mel io idosis

396

Page 11: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

P U B L I C A T I O N L I S T

Publications included in this thesisBirnie E, Savelkoel J, Reubsaet F, Roelofs JJTH, Kolkman S, Cremers AL, Grobusch MP, Noter-mans D, Wiersinga WJ on behalf of Dutch Melioidosis Study Group. Melioidosis in travelers: data from the Dutch Melioidosis Registry 1985-2018. Submitted.

Birnie E, Virk HS, Savelkoel J, Spijker R. Bertherat E, Dance DAB, Limmathurotsakul D, Devlees-schauwer B, Haagsma JA, Wiersinga WJ. Global burden of melioidosis, 2015: a systematic review and data synthesis. Accepted in Lancet Infect Dis 2019.

Birnie E, van 't Hof S, Bijnsdorp A, Mansaray Y, Huizenga E, van der Ende A, Hugenholtz F, Grousch MP, Wiersinga WJ. Burkholderia pseudomallei soil surveillance study in Sierra Leone. Accepted in PloS Negl Trop Dis 2019.

Birnie E, Claushuis TAM, Koh GCKW, Limmathurotsakul D, Day NPJ, Roelofs JJTH, Ware J, Hou B, de Vos AF, van der Poll T, van 't Veer C, Wiersinga WJ. Thrombocytopenia impairs host defense against Burkholderia pseudomallei (Melioidosis). J Infect Dis 2019; 29: 219(4): 648-59.

Birnie E, Weehuizen TAF, Ferwerda EB, Roelofs JJTH, de Vos AF, Grobusch MP, Wiersinga WJ. Differences in inflammation patterns induced by African and Asian Burkholderia pseudomallei isolates in mice. Am J Trop Med Hyg 2017; 96(6): 1365-1369.

Lankelma JM, Birnie E, Weehuizen TAF, Scicluna B, Belzer C, Houtkooper RH, Roelofs JJTH, de Vos AF, Budding AE, Wiersinga WJ. The gut microbiota as a modulator of innate immunity during melioidosis. PLoS Negl Trop Dis 2017; 19: 11(4): e0005548.

Lankelma JM, Wagemakers A, Birnie E, Haak BW, Trentelman JJA, Weehuizen TAF, Ersöz J, Roelofs JJTH, Hovius JW, Wiersinga WJ, Bins AD. Rapid DNA vaccination against Burkholderia pseudomallei flagellin by tattoo or intranasal application. Virulence 2017; 17: 8(8): 1683-94.

Birnie E, Koh GCKW, Löwenberg EC, Löwenberg EC, Meijers JCM, Maude RR, Day NPJ, Peacock SJ, van der Poll T, Wiersinga WJ. Increased Von Willebrand factor, decreased ADAMTS13 and thrombocytopenia in melioidosis. PLoS Negl Trop Dis 2017; 11(3): e0005468.

Birnie E, Wiersinga WJ, Limmathurotsakul D, Grobusch MP. Melioidosis in Africa, should we be looking more closely? Future Microbiol 2015; 10(2): 273-81.

Birnie E, Wiersinga WJ, Weehuizen TAF, Alabi AS, Huson MA, Huis in 't Veld RA, Mabala HK, Adzoda GK, Raczynski-Henk Y, Esen M, Lell B, Kremsner PG, Visser C, Wuthiekanun V, Peacock SJ, van der Ende A, Limmathurotsakul D, Grobusch MP. Clinical, environmental and serologic surveillance studies of melioidosis in Gabon. Emerg Infect Dis 2015; 21(1): 40-7.

Publications not included in this thesisBirnie E, Weehuizen TAF, Lankelma JM, de Jong HK, Koh GC, van Lieshout MHP, Roelofs JJTH, Budding AE, de Vos AF, van der Poll T, Wiersinga WJ. Toll-Like receptor 5 (TLR5) plays a flagel-lin-independent protective role during experimental melioidosis. Accepted in Infect Immun 2019.

Tuberculosis patients' pre-hospital delay and non-compliance with a longstanding DOT pro-gramme: a mixed methods study in urban Zambia. Cremers AL, Gerrets R, Kapata N, Kabika A, Birnie E, Klipstein-Grobusch K, Grobusch MP. BMC Public Health 2016 28; 16(1).

397

Sec t ion IV / Addendum

Page 12: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

A B O U T T H E A U T H O R

Emma Birnie was born in Amsterdam on 24th November 1988. After secondary school at the Stedelijk Gymnasium Leiden, she travelled to South America, ending up as crew member on asailing yacht to the Galapagos and Tahiti, French Polynesia. During her high school and post-secondary studies, Emma has been always very active in soccer and played at national level. However, she always maintained a passion for becoming a doctor and so enrolled for the study of Medicine at the University of Amsterdam (UvA) in 2008. Infectious diseases have continually played a significant role in her medical education, reflected by the subjects and locations of her studies (South Africa, Gabon, Sierra Leone, Thailand, Ethiopia). During her internship from 2012 to 2013, she discovered a novel Burkholderia pseudomallei sequence type and identified the first melioidosis patient in Gabon, Central Africa; this resulted in multiple awards and grants inclu-ding the Hippocrates Prize and the Snapper Prize. In 2015 she obtained her Honours Masters Degree in Medicine cum laude and started working as a resident at the Internal Department at Ter Gooi Hospital in Hilversum.

Emma was awarded an AMC PhD Scholarship and started her PhD project at the Center for Experimental Molecular Medicine & Center for Tropical and Travel Medicine (Supervisors Prof. Dr. W. Joost Wiersinga and Prof. Dr. Martin P. Grobusch). From 2015 to 2019, she studied the epidemiology and pathophysiology of melioidosis with a special interest in sub-Saharan Africa. Her work on the global burden of melioidosis was recently accepted for publication in the Lancet Infect Dis. She was one of the key initiators and member of the organizing committee for the First WHO African Melioidosis Workshop in Lagos, Nigeria, March 2019. During this workshop, she launched a pilot study ‘In search for melioidosis in Nigeria’, for which she was awarded a research grant from the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID). Her interest in other neglected tropical diseases led to a community research project on podoco-niosis in Ethiopia and the start of the foundation Help Tropical Health. Fascinated by the tropics, she will start the Diploma in Tropical Medicine and Hygiene post-graduate course in Liverpool, UK, from September 2019. She lives with her beloved wife Lianne Cremers in Amsterdam.

Digging for Mel io idosis

398

Page 13: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

D A N K W O O R D / W O R D O F T H A N K S

Dit proefschrift had nooit tot stand kunnen komen zonder jullie hulp. Jullie hebben belangrijke bijdrages geleverd; ieder op zijn eigen manier. Jullie hebben ervoor gezorgd dat ik mijn PhD heb kunnen afronden!

'Cross the river in a crowd and the crocodile won’t eat you'.

Om te beginnen wil ik mijn promotor en mentor Joost Wiersinga bedanken. Joost, ik leerde je zeven jaar geleden kennen. Ik was nog geneeskunde student en ik zocht een wetenschappelijk stage. Je bleek nog wel een leuk project te hebben zei je; ik mocht voor een spoedcursus naar Thailand en daarna naar Gabon. Dit was mijn kennismaking met het melioidose onderzoek en met Afrika. Jouw onnavolgbare positieve inslag heeft ervoor gezorgd dat ik vertrouwen bleef houden in onderzoek, ondanks de bijbehorende tegenslagen. Je leerde me focussen op de juiste momenten. Ik werd in het diepe gegooid en moest gewoon doen. Wel moest ik leren zorgvuldig te blijven in de presentatie (zowel op papier als in persoon). Ik had nooit gedacht dat ik uiteinde-lijk zoveel plezier zou beleven aan onderzoek doen. Je hebt me heel veel ruimte gegeven en altijd wilde je meedenken over nieuwe mogelijkheden. Het was een eer voor mij om jouw ceremonie-meester te zijn bij jouw oratie, wat een bijzondere dag! De vele tussenbiertjes samen met jou in Gabon, Thailand, Filipijnen, Sri Lanka en Nigeria waren onmisbaar, omdat ik je betrokkenheid voelde. Hopelijk is dit pas het begin van onze samenwerking!

Mijn promotor, Martin Grobusch, was een onvoorwaardelijke steun tijdens mijn PhD. Martin, meerdere keren ben je in Gabon langsgekomen om ervoor te zorgen dat ik het melioidose pro-ject eindelijk kon opstarten en je zorgde ervoor dat ons niets ontbrak! Door jouw toedoen zijn er drie dingen gestart waarvan ik nooit had durven dromen; een PhD, mijn passie voor Afrika, maar bovenal heb je mij 'gekoepeld' aan de liefde van mijn leven.

Tom van de Poll: op afstand heb je mijn PhD meegemaakt en je was niet te beroerd om soms scherp commentaar te geven. Grote waardering heb ik voor je hoe je de Tommies begeleidt en meteen tot de kern kunt komen.

Thanks to members of the committee for examining this dissertation! A special thanks to Susiefor coming all the way from the UK.

Alex de Vos en Kees; de twee steun en toe verlaten van ons lab, die altijd bereid en geduldig waren om advies te geven als ik weer eens vastliep met mijn experimenten. Joppe; de oratie samen met Joost was een geweldig feest en nu ook nog in mijn commissie! Brendon thanks for your critical reflections during the weekly meetings!

Heleen en Monique de steunpilaren van CEMM, zonder jullie had ik niet zorgeloos in Afrika kun-nen zitten. Tinne en Monique ook bedankt al jullie support. Monique, alle last minute bestellin-gen had je binnen een handomdraai keurig geordend klaar voor mijn Afrika avonturen. Regina en Danielle als ik weer iets niet kon vinden, vonden jullie het wel! Joost en Mariekje, jullie maakten de tijd bij de muizen aangenaam en indien nodig wilden jullie ook buiten kantooruren naar het muizenhuis komen! Wouter, ik kon altijd bij je terecht met vragen over de werkprotocollen!

399

Sec t ion IV / Addendum

Page 14: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Jasmin en Andy, beiden hebben jullie mij veel geholpen. Jasmin met haar lijstjes tot het bijstaan in de DM3 en Andy programmeerde, kookte en bouwde ook nog even een website tussendoor. Samen maakten we deel uit van de feestlunch met Mariekje, Dorith, Michelle en Lianne.

Michelle, we vulden elkaar uitstekend aan tijdens de voorbereidingen van de oratie van Joost en Joppe! Hessel, samen sporten, fietsen en jouw gezelligheid waren een welkome aanvulling in de laatste fase van mijn PhD! Ik wacht nog steeds op ons tafeltennistoernooi. Joe and Fabrice, I could always ask you questions about epidemiology. Lonneke, je kwam terug voor een Post-doc, wat een stimulans! Jos, jouw tips over bacteriën waren onmisbaar! Alex W, samen met Katja en Joost was je mee naar de Filipijnen, gelukkig hebben we de beveiligingsbeelden van het hotel nog:-)

Tassili, wat wist je veel melioidose projecten op te starten! Jacqueline, jouw eindeloze geduld tijdens het inwerken van mij in het lab zorgde ervoor dat ik niet helemaal in het diepe werd ge-gooid. Joosties; Katja, Tassili, Jacqueline, Duncan, Vanessa, Bas, Harjeet, Floor, Max, Nora, Berke, Tjitske, Alex, Rosan en Angelique jullie tips tijdens onze wekelijkse meetings waren altijd zeer welkom. Bas, we begonnen ongeveer tegelijkertijd aan onze promotie bij Joost en vaak kwam je met slim advies en nieuwe mogelijkheden!

Tommies, dank voor jullie tips in het lab en jullie feedback tijdens onze wekelijkse meeting. Maar bovenal waren de gezamenlijke uitjes en congressen een feestje. Hi Ha tequila!

Joris, je maakte het scoren van coupes tot een hilarische bezigheid! 'Geniet van het moment! ' De dames van de elektronenmicroscopie, Nicole, Anita en Daisy bedankt voor al de mooie plaatjes die jullie gemaakt hebben van mijn lievelingsbacterie Burkholderia pseudomallei. Arie, jouw en-thousiasme over B. pseudomallei bacteriestammen werkt aanstekelijk!

Juanita en Brecht, de redders in nood. Jullie hebben me de wonderen geleerd van de DALY. Zon-der jullie hulp, kennis, inzet en enthousiasme hadden we nooit de DALY voor melioidose kunnen berekenen. Al het harde werken heeft zich uiteindelijk uitbetaald in een hele mooie publicatie! Hopelijk kunnen we nog meer samen werken in de toekomst.

Daan en Frans, ons Nederlandse melioidose project hebben we in een sneltreinvaart af kunnen ronden, zonder jullie en de inzet van de Dutch Melioidosis Study Group was dit nooit gelukt.

Het tropencentrum: Martin, Bram, Kees, Pieter en Michèle, dank voor de wonderen wereld van de tropen. Michèle, vanaf het begin af aan had je vertrouwen in ons Mossy Foot project. Podoco-niosis: de start van een nieuw avontuur!

Jelle, helaas ben ik jou niet vergeten te bedanken. Jouw creatief vermogen om van alles een groots avontuur te maken heeft mij ontzettend geïnspireerd tijdens mijn PhD. Wat bezit jij veel slimmigheidjes! Ons project en de reis in Ethiopië (samen met Jasmyn en Lianne), ons crowd-funding event, en ook nog onze gezamenlijk stichting 'Help Tropical Health' is het begin van iets moois.

Digging for Mel io idosis

400

Page 15: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Senne, doorzetter, een half jaar heb je geploeterd op qPCRs en gaf je nooit op! Floor, bedankt voor onze gezamenlijke begeleiding van Senne. Dorien, ons avontuur naar Ghana verliep niet helemaal zoals gepland, maar we hebben het toch wel erg naar ons zin gehad, wat een flexibili-teit. Abe, wat een prachtige figuren maak jij, ontzettend bedankt voor de mooie illustraties voor mijn proefschrift.

Jelmer, alle projecten deed je met volle overgave en efficiëntie naast je coschappen; dagenlang artikelen screenen voor ons DALY-project en hierna ook nog 100% inzet voor onze Nederlandse melioidose studie. Het was een waar genoegen om samen te werken, hopelijk blijven we dat in de toekomst doen!

I would like to thank the whole melioidosis community, especially the melioidosis team from the Mahidol Oxford Tropical Research Unit in Bangkok, Thailand: P'lek, Kung, and Oh. You have educated me on all the tricks of soil sampling for B. pseudomallei and always provided me with meaningful advice, wherever I was. Direk, thank you for all our collaborations and for your time when explaining to me the epidemiology of melioidosis! Gavin, you explained me the endless world of statistics!

Dear Karoline, you enlightened me on everything about molecular techniques and soil sampling. Ivo, thank you for all your support on my research in Africa. Our latest collaboration to organize the First WHO Melioidosis Workshop in Lagos was a great success, hopefully many more will follow!

I would like to thank the crew in Lambarène, Gabon. My roommates Lisa and Miriam, your support and love during this intense time made me feel instantly welcome. Harry, I really appre-ciated your patience and humor in the microbiology lab and thanks to Abraham for the research opportunities. Soil sampling team, we dug so many holes in the heat of Central Africa!Mischa, je had heerlijke brownies toen ik ze nodig had. Sebas, de eerste keren grond verzamelen was hard werken met zelfs een zonnesteek als gevolg. Saskia, ik denk met veel plezier terug aan al onze avonturen in Gabon, het dansen in de Ogooué-guini en de rap op onze vakantie. Samen met Gys in Zuid-Afrika hebben we een te gekke tijd gehad! Clara en Thom die jou overal naartoe volgden maakten het allemaal compleet.

Thanks to the staff of the Lion Hart Hospital and the soil sampling team in Sierra Leone: Ali, Fodey, Lamsama and Zaro. Anne en Erdi; jullie support tijdens mijn verblijf in Sierra Leone was onmisbaar, ik bewonder jullie werk en zal ons gezamenlijk onderwijs over de man en vrouw verhouding niet snel vergeten! Anne, de surftrips naar de Buray Boys waren geweldig en wat een geweldige outfits hadden we gekocht.

I would like to thank Prof Akanmu and Dr Rita for the start of a new collaboration. Many thanks for your kind support and enthusiasm for our melioidosis project in Nigeria. The First African Melioidosis Workshop in Lagos was a great success! Dhamari, I won't forget the weekend in Abu-ja! Wole, my Nigerian brother, you took such good care of me in Nigeria! Many thanks to Folake, Adobe, Jumoke for all the lab support and happiness. Jumoke and Femi, you guys picked up the work very quickly! Let the search for melioidosis in Nigeria begin!

401

Sec t ion IV / Addendum

Page 16: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Jurgen, wat een wonder dat jij niet gek geworden bent van al mijn micro-management over de lay-out van dit boekje. Maar wat een ontzettend mooi resultaat!Jill, alle creaties voor de hoogtepunten uit ons leven kwamen door jouw inzet! En de kleur die je dit boekje hebt weten te geven, te gek! Liefste vrienden, deze paragraaf zou eindeloos lang moeten worden. Jullie geplaag, reflectiever-mogen, humor, liefde, oprechte interesse en eindeloze steun in alles wat ik doe hebben ervoor gezorgd dat ik ben wie ik ben. Waar ik ook heen ging en hoeveel plezier ik ook had, jullie zorgden ervoor dat ik altijd terug wilde naar Nederland. De etentjes, feestjes, festivals, weekendjes weg, sporten, vakanties (van surfen tot wintersport) en de eindeloze hoopjes zorgen ervoor dat mijn leven compleet is. Bovendien kan ik jullie altijd om advies vragen, zeker ook over mijn promotie. Jullie mening was van groot belang! Velen van jullie heb ik misbruikt, sorry hiervoor, en de lijst namen die ik hier eigenlijk zou moeten opnoemen zal toch wel gauw een halve pagina in beslag nemen. Jullie zijn fantastisch en wat zijn jullie me dierbaar! Dank dat jullie er altijd voor mij zijn!

Harjiti, I remember the first time when we had a conversation trough Skype. You were interested in doing research on melioidosis, how marvelous! I am really grateful that you joined our group and that you became my all-time melioidosis buddy and friend. Your creative mind and critical (English) reflections really improved my work. Finally, our hard work resulted in our beautiful publication in the Lancet Infect Dis. Hopefully, together, we can put melioidosis on the WHO agenda as a neglected tropical disease.

Dorith, paranimf, zonder jou had ik mijn PhD waarschijnlijk nooit afgerond, of in ieder geval niet binnen de tijd die ervoor stond. Alle levenslessen leerde ik van jou. Gelukkig heb ik jou ook weten te vermaken met het bekende eindeloze lijstje van mijn blunders. Wonder boven wonder, eindigde ons gezamenlijke project toch in een mooie publicatie. Het eeuwige chocola eten en koffiedrinken hield op toen je naar Eindhoven/Maastricht vertrok, voor mij was dit misschien wel het dieptepunt uit mijn PhD historie. Maar ik weet 1 ding heel zeker; je bent nog lang niet van mij af!

De Familie Cremers; Diana, Pieter dank voor jullie oprechte interesse en steun. Jullie waren het die Lianne opvingen toen ik zo ver weg in Nigeria zat. Oom Eric, Elleke (Rozemarijn en Julia), Paul en Sanne (Nora en Lucas), Willemijn en Rolf (en jullie toekomstige kindje) jullie zijn mijn nieuwe broers, zussen, neefje en nichtjes. Wat zijn jullie een warme familie!

Lief zusje, lieve Lin, altijd sta je voor me klaar. Ik ben ongelooflijk trots op jou en jouw nuchter-heid zorgt ervoor dat ik soms even weer met beide benen op grond sta. Samen met Emmy kan jij alles aan! Emmy, je hebt zoveel geduld en oog voor detail, beiden onmisbaar in vormgeven van dit boekje. Lieve Martijn, grote broer, mijn grote voorbeeld in alles. Je hebt je zaken dik voor mekaar met je twee allerliefste zonen Morris en Caes en een pracht van een vrouw Emma. Emma, jouw liefde en vrolijkheid is het beste wat Martijn en ons ooit is overkomen!

Lieve Papa en Mama, jullie eindeloze interesse, het vertrouwen en de steun die jullie ons geven is ontzettend bijzonder. Dag en nacht staan jullie voor ons klaar. Papa, je hebt mij altijd geleerd om door te zetten en vol te houden en ik ken niemand die zo ongelooflijk trots op ons is als jij. Jouw liefde voor het vak heeft mij ertoe aangezet om ook geneeskunde te studeren.Mama, jouw eeuwig durende liefdevolle (overbe)zorg, gezellig en vrolijkheid hebben ervoor gezorgd dat ons gezin een chaos van warmte en liefde is. Iedereen komt graag thuis, en alles en iedereen is welkom!

Digging for Mel io idosis

402

Page 17: UvA-DARE (Digital Academic Repository) Digging for ... · Oral presentation course0.8 2016 ... First prize competition Honours programme 2011 € 1.000 Van Walree Scholarship - travel

Liefste Lianne, mijn vrouw, levenspartner en paranimf, dit boekje begon en eindigt met jou. Ik ontmoette jou in Gabon tijdens mijn zoektocht. Je geeft mijn leven meer kleur en bij jou vind ik rust, al denkt de hele wereld soms dat wij nooit rust hebben. Ik ken niemand die zo veel oprechte interesse heeft in zijn medemens en zo positief in het leven staat als jij. Als jij erbij bent is alles nog intenser en nog fijner en dan het liefst ook nog in Afrika. Liefste, durfal, ik bewonder je, je bent mijn alles. Je hebt mij altijd gesteund in mijn gestruikel tijdens mijn PhD als ik het even niet meer zag zitten, je las al mijn artikelen, luisterde keer op keer naar mijn presentaties en dacht mee over keuzes. Dank voor je onvoorwaardelijke steun tot vaak diep in de nacht. Op naar nog heel veel meer avontuur, plezier en liefde!

403

Sec t ion IV / Addendum