2
58 0.5000501 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf58.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt23.tpr 144 0.6960708 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf144.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt24.tpr %164 0.9035559 175 1.1119405 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf175.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt25.tpr 182 1.2990141 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf182.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt26.tpr 186 1.5230001 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf186.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt27.tpr 195 1.9011049 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf195.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt28.tpr 242 2.7120137 grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf242.gro -p topol.top -n index.ndx -o npt29.tp

Umbrella Sampling Extension

Embed Size (px)

DESCRIPTION

More nodes for the Umbrella Sampling Gromacs Tutorial

Citation preview

  • 5/25/2018 Umbrella Sampling Extension

    1/2

    58 0.5000501

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf58.gro -p topol.top -n

    index.ndx -o npt23.tpr

    144 0.6960708

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf144.gro -p topol.top -nindex.ndx -o npt24.tpr

    %164 0.9035559

    175 1.1119405

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf175.gro -p topol.top -n

    index.ndx -o npt25.tpr

    182 1.2990141

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf182.gro -p topol.top -n

    index.ndx -o npt26.tpr

    186 1.5230001

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf186.gro -p topol.top -n

    index.ndx -o npt27.tpr

    195 1.9011049

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf195.gro -p topol.top -n

    index.ndx -o npt28.tpr

    242 2.7120137

    grompp -f npt_umbrella.mdp -c conf242.gro -p topol.top -nindex.ndx -o npt29.tp

  • 5/25/2018 Umbrella Sampling Extension

    2/2