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U NIVE RSIDAD DE C}UADALAJARA CENTRO UNIVERSITARIO DE LO S LAGOS D IVISION D E EST U DIOS DE LA BI O D IV ERSIDAD E INN OVACI ON TE CN OLOG ICA DEPARTAMENTO DE CI EN CI AS DE LA TI ERRA Y DE LA V IDA 1. IDENTIFICACION DEL CURSO Nombre de la materia I BIOLOGIA MOLECULAR Clave de la Horas de Horas de Total de Horas: materia: teoria: practica: 10187 48 16 64 Tipo de curso: (Marque con una X) Valor en 7 C= )< T= CT = s= L= )< C= M= curso Taller curso- seminario taller Nivel en que ubica: (Marque con una X) L=Licenciatura I L Prerrequisitos formales (Materias previas establecidas en el Plan de Estudios) Departamento: !Ciencias de la Tierra y de la Vida Laboratorio cilnica m6dulo P=Posgrado Prerrequisitos recomendados (Materias sugeridas en la ruta academica aprobada) Carrera: INGENIERIA EN ELECTRONICA Y COMPUTACION (UEC) Area de formaci6n: (Marque con una X) Bas i ca comun obl igatoria Basica particular obllgatoria. Basica particular selectiva . Especializante selectiva . X Optativa abierta. Enrique Di az de Le6n No. 1144, Coloni a Paseos de la MO il La ii a c.P . 47460. Lagos de Moreno, Jali sco, Mex i co Tels. [52) (474) 742 43 14 , 742 36 78, 746 4563 Ex t. 665 12, fa x Ext. 66527 www .lagos .udg.mx

U NIVERSIDAD DE C}UADALAJARA

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U NIVERSIDAD DE CUADALAJARA CENTRO UNIVERSITARIO DE LO S LAGOS D IV ISION D E EST U DIOS DE LA BI O D IV ERSIDAD E INNOVACI ON TECN O LOG ICA DEPARTAMENTO DE CI EN CI AS DE LA TI ERRA Y DE LA V IDA

1 IDENTIFICACION DEL CURSO

Nombre de la materia IBIOLOGIA MOLECULAR

Clave de la Horas de Horas de Total de Horas materia teoria practica

10187 48 16 64

Tipo de curso (Marque con una X)

Valor en cn~ditos

7

C= )lt T= CT = s= L= )lt C= M= curso Taller cursoshy seminario

taller

Nivel en que ubica (Marque con una X)

L=Licenciatura I L

Prerrequisitos formales (Materias previas establecidas en el Plan de Estudios)

Departamento

Ciencias de la Tierra y de la Vida

Laboratorio cilnica m6dulo

P=Posgrado

Prerrequisitos recomendados (Materias sugeridas en la ruta academica aprobada)

Carrera

INGENIERIA EN ELECTRONICA Y COMPUTACION (UEC)

Area de formaci6n (Marque con una X) Basica comun obl igatoria

Basica particular obllgatoria

Basica particular selectiva

Especializante selectiva

X Optativa abierta

Enrique Diaz de Le6n No 1144 Colonia Paseos de la MOilLa iia cP 47460 Lagos de Moreno Jali sco Mex ico Tels [52) (474) 742 43 14 742 3678 746 4563 Ex t 665 12 fax Ext 66527

wwwlagosudgmx

lJNIVERSIDAD DE CrUADALAJARA CENTRO UNIVERSITARIO DE LOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E INNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE C1ENClAS DE LA TLERRA Y DE LA VlDA

Aval de la Academia

Enero 2017

Nombre Firma Presidente Secretario Vocales

DR Cesar Soria Fregozo

Cargo

Presidente C$5av ~l~ ~-

Ora Sofia Loza Cornejo Secretario Wo~~

~C

2 PRESENTACION LA ASIGNATURA DE BIOLOGIA MOLECULAR SE UBICA DENTRO DE LA CARRERA DE INGENIERIA

BIOQUIMICA EN EL AREA BAslCA PARTICULAR OBLIGATORIA Y LE SERVIRA AL ESTUDIANTE PARA

COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES DEL FUfICIONAMIENTO CELULAR LOS MECANISMOS QUE

PUEDEN ESTAR ALTERADOS PARA DAR LUGAR A UNA PATOLOGIA Y LAS TECNICAS MOLECULARES

QUE LE SERVIRAN EN UN MOMENTO DADO PARA REALIZAR UN ESTUDIO ADECUADO EN EL AREA

BIOMEDICA DE LA AGRICULTURA INDUSTRIAL Y FARMACETICA

ESTA ASIGNATURA CONSISTE EN EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS CELULARES BAslCOS QUE REGULAN

LA EXPRESION GENICA EN LA CUAL EL ALUMNO RELIZARA UNA INTEGRACION DE LOS

CONOCIIIIENTOS PREVIAMENTE RECIBIDOS EN LA ASIGNATURA DE BIOQUIMICA Y TENDRA

CONTINUACION CON LOS CONOCIMIENTOS QUE SE ADQUIRIRAN EN LA ASIGNATURA DE GENETICA

2 OBJETIVO GENERAL COMPRENDER LA RELACION QUE EXISTE ENTRE EL DNA Y LOS PROCESOS CELULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE RIGEN EL FUNCIONAMIENTO CELULAR Y LOS FUNDAMENTOS DE LA TECNOLOGA DEL DNA RECOMBINANTE UTILES EN LA IDENTIFICACION DE LAS DIFERENTES AREAS COMO LAS BIOMEDICAS Y BIOTECNOLOGICAS ENTRE OTRAS MEDIANTE LA COMPRENSION DE LOS ELEMENTOS BAslCOS QUE PARTICIPAN EN EL MANTENIIVlIENTO DE LA EXPRESION Y REGULACION GENICA

3 OBJETIVOS ESPECIFICOS 1 CONOCER EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR LOS CONCEPTOS BAslCOS DE ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO CELULAR Y SU RELACION CON EL DNA AS COMO LOS FUNDAMENTOS DE LA EXPRESION DE LOS GENES Asi MISMO CONOCER LAS BASES MOLECULARES DE LAS PATOLOGiAS HUMANAS QUE MAs

IMPACTO TIENEN EN LA POBLACION MEXICANA LA AGRICUL TURA LA BIOTECNOLOGiA EN LA INDUSTRIA Y FARMACEUTICA

2 IDENTIFICAR LOS METODOS MAs COMUNES DE LA BIOLOGA MOLECULAR SU APLICACION E INTERPRETACION Y RELACIONAR LAS ALTERACIONES

Emique Diaz de Leon No 1144 Colonia Paseos de Is Montana C p 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 fax Ext 66527

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I

~------

UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA C ENTRO UN IV ERSlTARIO DE LOS LAG OS DIV ISION DE EST U DI OS DE LA BI O DIVE RS I DAD E lNNOVAC IO N TECNOLOGICA

D EPARTAMENTO DE CiEN CIAS DE LA TI ERRA Y DE LA VIDA

Historial de revisiones

Accion Fecha Responsable

Revision Elaboracion

Ora Maria de la Luz Miranda Beltran de 2005

Elaboraci6n 01 de Febrero

-

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 15 de Julio de Dr SORIA FREGOZO CESAR

2013 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA LOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra LUZ AMELIA MALDONADO FLORESI~ Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 31 de Enero Dr SORIA FREGOZO CESAR

2014 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVI ANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE lA lUZRevision 31 de Enero 2015 Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

MtraLUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZEnero 2016 Revision Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Academia

Ciencias l3iol6gicas

El1Ijqllc DiD de Leon No 1144 Colonia Pascos de la Montaiia CP 47460 Lagos de Morell o J ~tli s c () M6xico leis [52 1 (474) 742 4314 742 367S 746 4563 Ext 665 12 Fax Ext 66527

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I

i_

middot)~reglltll ~ CENTRO UNIVERSITAR10 DE lOS tAGOS

-middotmiddot middot 1 ~tf ONIVERSIDAD DE GUADALAJARA

D IVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E I NNOVACION TEC N OLOGICA DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA1)~~ MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES

3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APLICARLOS EN EL TRATAMIENTO PRACTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TI2MAS MOLECULARES

4- SE FOMENTARA EN EL ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACION Y LA NECESIDAD DE ACTUALIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQUIPO Y LA AUTOCRTICA AS MISMO LA DISCIPLlNA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUALQUIER ACCION RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

5 CONTENIDO Temas y Subtemas

1 Introducci6n a la biologia molecular

11 Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza de los acidos nucleicos aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientfficos como Chargaff Griffith Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore

12 Conceptos generales del DNA gen nucle6tido cromatina RNA dogma central de la biologfa molecular

13 Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en general

2 Organizaci6n del genoma humane

21 Ac Nuclefcos conformaci6n de la doble helice DNA-A B Z 22 Niveles de organizaci6n en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funci6n 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S y G2) y de compactacion (divisi6n) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo as como la clasificacion de cada una de estas

3 Replicaci6n 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes

EnriC]ue Dia7 de Ic6n No1 144 Colonia Pascos de 13 Monlafia CP 47460 Lugos de Morello Jalisco Mexico Tels1521 (474) 742 4314 742 367R 746 4563 Exl 66512 Fax Jxt 66527

wlVlVlagos udgmx

UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UN IVERS lTAR O DE lOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERS IDAD E INNOVACION TECNOLOCICA DEPARTAMENTO DE CI ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

32 Caracteristicas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa proteinas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacion elongacion y terminacion en procariotes y eucariotes 36 La telomerosa y mecanisme de accion de la telomerasa en replicacion

4 Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion yestructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario I~NAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I I y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminaci6n 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales

i 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional

49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

5 Traduccion

51 Definicion 52 Codigo genetico 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traducci6n en eucariotes 54 Modificaciones Postraduccionales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de I

modificaciones ejemplos etc) 55 Protefnas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas y chaperones entre otras)

6 Mutaciones y la Reparacion en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificacion puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos quimicos fisicos y biologicos 63 Teratogenos carcinogenos 0 clastogenos 64 Reparacion por excision fotoreparacion sistemas SOS Rad etc Ejemplo de defectos en los sistemas de reparacion Xeroderma Pigmentoso

7 Tecnicas DNA recombinante

Enrique Dinz de l e611 No 1144 Colonia Pascos de la MontalJa CPo 47460 Lagos de ivlureno Jalisco Mexico TeJsl52 (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 665 27

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVERSlTARIO DE LOS lAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E [NNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE ClENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

2

Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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- -- - - - -

UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVE RSITARIO DE LOS LAGOS DIVIS ION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E INNOV ACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE C1ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

3

4

5

LODISH HARVEY BERK ARNOLD ZIPURSKY S LAWRENCE MATSUDAIRA PAUL BALTIMORE DAVID DARNELL JAMES E MOLECULAR CELL BIOLOGY PANAMERICANA2007

GERALD KARP BIOLOGIA MOLECULAR McGraw-HilI

LEWIN BENJAMIN GENES IX OXFORD

MEDICAL CELL BIOLOGY Steven R Goodman Lippincot-Raven 2da Edici6n 2

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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lJNIVERSIDAD DE CrUADALAJARA CENTRO UNIVERSITARIO DE LOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E INNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE C1ENClAS DE LA TLERRA Y DE LA VlDA

Aval de la Academia

Enero 2017

Nombre Firma Presidente Secretario Vocales

DR Cesar Soria Fregozo

Cargo

Presidente C$5av ~l~ ~-

Ora Sofia Loza Cornejo Secretario Wo~~

~C

2 PRESENTACION LA ASIGNATURA DE BIOLOGIA MOLECULAR SE UBICA DENTRO DE LA CARRERA DE INGENIERIA

BIOQUIMICA EN EL AREA BAslCA PARTICULAR OBLIGATORIA Y LE SERVIRA AL ESTUDIANTE PARA

COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES DEL FUfICIONAMIENTO CELULAR LOS MECANISMOS QUE

PUEDEN ESTAR ALTERADOS PARA DAR LUGAR A UNA PATOLOGIA Y LAS TECNICAS MOLECULARES

QUE LE SERVIRAN EN UN MOMENTO DADO PARA REALIZAR UN ESTUDIO ADECUADO EN EL AREA

BIOMEDICA DE LA AGRICULTURA INDUSTRIAL Y FARMACETICA

ESTA ASIGNATURA CONSISTE EN EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS CELULARES BAslCOS QUE REGULAN

LA EXPRESION GENICA EN LA CUAL EL ALUMNO RELIZARA UNA INTEGRACION DE LOS

CONOCIIIIENTOS PREVIAMENTE RECIBIDOS EN LA ASIGNATURA DE BIOQUIMICA Y TENDRA

CONTINUACION CON LOS CONOCIMIENTOS QUE SE ADQUIRIRAN EN LA ASIGNATURA DE GENETICA

2 OBJETIVO GENERAL COMPRENDER LA RELACION QUE EXISTE ENTRE EL DNA Y LOS PROCESOS CELULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS QUE RIGEN EL FUNCIONAMIENTO CELULAR Y LOS FUNDAMENTOS DE LA TECNOLOGA DEL DNA RECOMBINANTE UTILES EN LA IDENTIFICACION DE LAS DIFERENTES AREAS COMO LAS BIOMEDICAS Y BIOTECNOLOGICAS ENTRE OTRAS MEDIANTE LA COMPRENSION DE LOS ELEMENTOS BAslCOS QUE PARTICIPAN EN EL MANTENIIVlIENTO DE LA EXPRESION Y REGULACION GENICA

3 OBJETIVOS ESPECIFICOS 1 CONOCER EL DESARROLLO DE LA BIOLOGIA MOLECULAR LOS CONCEPTOS BAslCOS DE ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO CELULAR Y SU RELACION CON EL DNA AS COMO LOS FUNDAMENTOS DE LA EXPRESION DE LOS GENES Asi MISMO CONOCER LAS BASES MOLECULARES DE LAS PATOLOGiAS HUMANAS QUE MAs

IMPACTO TIENEN EN LA POBLACION MEXICANA LA AGRICUL TURA LA BIOTECNOLOGiA EN LA INDUSTRIA Y FARMACEUTICA

2 IDENTIFICAR LOS METODOS MAs COMUNES DE LA BIOLOGA MOLECULAR SU APLICACION E INTERPRETACION Y RELACIONAR LAS ALTERACIONES

Emique Diaz de Leon No 1144 Colonia Paseos de Is Montana C p 47460 Lagos de Moreno Jalisco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 3678 746 4563 Ext 66512 fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA C ENTRO UN IV ERSlTARIO DE LOS LAG OS DIV ISION DE EST U DI OS DE LA BI O DIVE RS I DAD E lNNOVAC IO N TECNOLOGICA

D EPARTAMENTO DE CiEN CIAS DE LA TI ERRA Y DE LA VIDA

Historial de revisiones

Accion Fecha Responsable

Revision Elaboracion

Ora Maria de la Luz Miranda Beltran de 2005

Elaboraci6n 01 de Febrero

-

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 15 de Julio de Dr SORIA FREGOZO CESAR

2013 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA LOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra LUZ AMELIA MALDONADO FLORESI~ Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 31 de Enero Dr SORIA FREGOZO CESAR

2014 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVI ANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE lA lUZRevision 31 de Enero 2015 Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

MtraLUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZEnero 2016 Revision Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Academia

Ciencias l3iol6gicas

El1Ijqllc DiD de Leon No 1144 Colonia Pascos de la Montaiia CP 47460 Lagos de Morell o J ~tli s c () M6xico leis [52 1 (474) 742 4314 742 367S 746 4563 Ext 665 12 Fax Ext 66527

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I

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-middotmiddot middot 1 ~tf ONIVERSIDAD DE GUADALAJARA

D IVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E I NNOVACION TEC N OLOGICA DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA1)~~ MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES

3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APLICARLOS EN EL TRATAMIENTO PRACTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TI2MAS MOLECULARES

4- SE FOMENTARA EN EL ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACION Y LA NECESIDAD DE ACTUALIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQUIPO Y LA AUTOCRTICA AS MISMO LA DISCIPLlNA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUALQUIER ACCION RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

5 CONTENIDO Temas y Subtemas

1 Introducci6n a la biologia molecular

11 Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza de los acidos nucleicos aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientfficos como Chargaff Griffith Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore

12 Conceptos generales del DNA gen nucle6tido cromatina RNA dogma central de la biologfa molecular

13 Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en general

2 Organizaci6n del genoma humane

21 Ac Nuclefcos conformaci6n de la doble helice DNA-A B Z 22 Niveles de organizaci6n en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funci6n 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S y G2) y de compactacion (divisi6n) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo as como la clasificacion de cada una de estas

3 Replicaci6n 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes

EnriC]ue Dia7 de Ic6n No1 144 Colonia Pascos de 13 Monlafia CP 47460 Lugos de Morello Jalisco Mexico Tels1521 (474) 742 4314 742 367R 746 4563 Exl 66512 Fax Jxt 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UN IVERS lTAR O DE lOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERS IDAD E INNOVACION TECNOLOCICA DEPARTAMENTO DE CI ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

32 Caracteristicas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa proteinas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacion elongacion y terminacion en procariotes y eucariotes 36 La telomerosa y mecanisme de accion de la telomerasa en replicacion

4 Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion yestructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario I~NAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I I y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminaci6n 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales

i 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional

49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

5 Traduccion

51 Definicion 52 Codigo genetico 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traducci6n en eucariotes 54 Modificaciones Postraduccionales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de I

modificaciones ejemplos etc) 55 Protefnas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas y chaperones entre otras)

6 Mutaciones y la Reparacion en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificacion puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos quimicos fisicos y biologicos 63 Teratogenos carcinogenos 0 clastogenos 64 Reparacion por excision fotoreparacion sistemas SOS Rad etc Ejemplo de defectos en los sistemas de reparacion Xeroderma Pigmentoso

7 Tecnicas DNA recombinante

Enrique Dinz de l e611 No 1144 Colonia Pascos de la MontalJa CPo 47460 Lagos de ivlureno Jalisco Mexico TeJsl52 (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 665 27

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVERSlTARIO DE LOS lAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E [NNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE ClENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

2

Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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- -- - - - -

UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVE RSITARIO DE LOS LAGOS DIVIS ION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E INNOV ACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE C1ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

3

4

5

LODISH HARVEY BERK ARNOLD ZIPURSKY S LAWRENCE MATSUDAIRA PAUL BALTIMORE DAVID DARNELL JAMES E MOLECULAR CELL BIOLOGY PANAMERICANA2007

GERALD KARP BIOLOGIA MOLECULAR McGraw-HilI

LEWIN BENJAMIN GENES IX OXFORD

MEDICAL CELL BIOLOGY Steven R Goodman Lippincot-Raven 2da Edici6n 2

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA C ENTRO UN IV ERSlTARIO DE LOS LAG OS DIV ISION DE EST U DI OS DE LA BI O DIVE RS I DAD E lNNOVAC IO N TECNOLOGICA

D EPARTAMENTO DE CiEN CIAS DE LA TI ERRA Y DE LA VIDA

Historial de revisiones

Accion Fecha Responsable

Revision Elaboracion

Ora Maria de la Luz Miranda Beltran de 2005

Elaboraci6n 01 de Febrero

-

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 15 de Julio de Dr SORIA FREGOZO CESAR

2013 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA LOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra LUZ AMELIA MALDONADO FLORESI~ Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZRevision 31 de Enero Dr SORIA FREGOZO CESAR

2014 Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVI ANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE lA lUZRevision 31 de Enero 2015 Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

MtraLUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Dra MESA CORNEJO VIVIANA MATILDE

Dra MIRANDA BELTRAN MARIA DE LA LUZEnero 2016 Revision Dr SORIA FREGOZO CESAR

Dr GUTIERREZ CORONADO OSCAR

Dra SOFIA lOZA CORNEJO

MTRO JUAN JOSE ZARAGOZA BARBA

Mtra lUZ AMELIA MALDONADO FLORES

Academia

Ciencias l3iol6gicas

El1Ijqllc DiD de Leon No 1144 Colonia Pascos de la Montaiia CP 47460 Lagos de Morell o J ~tli s c () M6xico leis [52 1 (474) 742 4314 742 367S 746 4563 Ext 665 12 Fax Ext 66527

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I

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middot)~reglltll ~ CENTRO UNIVERSITAR10 DE lOS tAGOS

-middotmiddot middot 1 ~tf ONIVERSIDAD DE GUADALAJARA

D IVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E I NNOVACION TEC N OLOGICA DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA1)~~ MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES

3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APLICARLOS EN EL TRATAMIENTO PRACTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TI2MAS MOLECULARES

4- SE FOMENTARA EN EL ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACION Y LA NECESIDAD DE ACTUALIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQUIPO Y LA AUTOCRTICA AS MISMO LA DISCIPLlNA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUALQUIER ACCION RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

5 CONTENIDO Temas y Subtemas

1 Introducci6n a la biologia molecular

11 Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza de los acidos nucleicos aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientfficos como Chargaff Griffith Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore

12 Conceptos generales del DNA gen nucle6tido cromatina RNA dogma central de la biologfa molecular

13 Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en general

2 Organizaci6n del genoma humane

21 Ac Nuclefcos conformaci6n de la doble helice DNA-A B Z 22 Niveles de organizaci6n en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funci6n 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S y G2) y de compactacion (divisi6n) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo as como la clasificacion de cada una de estas

3 Replicaci6n 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes

EnriC]ue Dia7 de Ic6n No1 144 Colonia Pascos de 13 Monlafia CP 47460 Lugos de Morello Jalisco Mexico Tels1521 (474) 742 4314 742 367R 746 4563 Exl 66512 Fax Jxt 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UN IVERS lTAR O DE lOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERS IDAD E INNOVACION TECNOLOCICA DEPARTAMENTO DE CI ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

32 Caracteristicas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa proteinas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacion elongacion y terminacion en procariotes y eucariotes 36 La telomerosa y mecanisme de accion de la telomerasa en replicacion

4 Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion yestructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario I~NAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I I y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminaci6n 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales

i 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional

49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

5 Traduccion

51 Definicion 52 Codigo genetico 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traducci6n en eucariotes 54 Modificaciones Postraduccionales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de I

modificaciones ejemplos etc) 55 Protefnas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas y chaperones entre otras)

6 Mutaciones y la Reparacion en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificacion puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos quimicos fisicos y biologicos 63 Teratogenos carcinogenos 0 clastogenos 64 Reparacion por excision fotoreparacion sistemas SOS Rad etc Ejemplo de defectos en los sistemas de reparacion Xeroderma Pigmentoso

7 Tecnicas DNA recombinante

Enrique Dinz de l e611 No 1144 Colonia Pascos de la MontalJa CPo 47460 Lagos de ivlureno Jalisco Mexico TeJsl52 (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 665 27

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVERSlTARIO DE LOS lAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E [NNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE ClENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

2

Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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LODISH HARVEY BERK ARNOLD ZIPURSKY S LAWRENCE MATSUDAIRA PAUL BALTIMORE DAVID DARNELL JAMES E MOLECULAR CELL BIOLOGY PANAMERICANA2007

GERALD KARP BIOLOGIA MOLECULAR McGraw-HilI

LEWIN BENJAMIN GENES IX OXFORD

MEDICAL CELL BIOLOGY Steven R Goodman Lippincot-Raven 2da Edici6n 2

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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-middotmiddot middot 1 ~tf ONIVERSIDAD DE GUADALAJARA

D IVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSIDAD E I NNOVACION TEC N OLOGICA DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA1)~~ MOLECULARES EN LA MEDICINA EN LAS PLANTAS Y ANIMALES

3- ELEGIR Y MANEJAR LAS MUESTRAS PARA ESTUDIOS MOLECULARES ASI COMO INTERPRETAR LOS RESULTADOS Y APLICARLOS EN EL TRATAMIENTO PRACTICO ADEMAs DE ENTENDER ARTICULOS DE ACTUALIZACION QUE VERSEN SOBRE TI2MAS MOLECULARES

4- SE FOMENTARA EN EL ALUMNO EL ESPIRITU DE LA INVESTIGACION Y LA NECESIDAD DE ACTUALIZARSE CONSTANTEMENTE EL TRABAJO EN EQUIPO Y LA AUTOCRTICA AS MISMO LA DISCIPLlNA EL ORDEN Y LA ETICA PROFESIONAL ANTE CUALQUIER ACCION RELACIONADA CON LA VIDA HUMANA

5 CONTENIDO Temas y Subtemas

1 Introducci6n a la biologia molecular

11 Experimentos sobre como se descubri6 la naturaleza de los acidos nucleicos aportaciones para el descubrimiento del DNA por cientfficos como Chargaff Griffith Avery MacLeod Beadle Tatum Garrod Watson y Crick Jacob Monod Termin Baltimore

12 Conceptos generales del DNA gen nucle6tido cromatina RNA dogma central de la biologfa molecular

13 Definir su objeto de estudio dar ejemplos de aplicaciones de la biologfa molecular en general

2 Organizaci6n del genoma humane

21 Ac Nuclefcos conformaci6n de la doble helice DNA-A B Z 22 Niveles de organizaci6n en eucariotes Nucleosoma fibra de 10nm 30nm solenoide bucles cromosomas su estructura y comportamiento durante el cicio celular tipos y funci6n 23 Tipos de cromatina Eucromatina heterocromatina constitutiva y facultativa DNA Gen y cromosomas 24 EI cicio celular y sus etapas con enfasis en comportamiento del DNA Cicio de descompactacion duplicacion y preparacion para la division de la cromatina (G1 S y G2) y de compactacion (divisi6n) 25 Participacion de las ciclinas y kinasas dependientes de ciclinas (cdks) en el cicio asf como de las protefnas p53 y p21 p27 26 Organizacion del genoma Clases de DNA De copia unica y repetitivo as como la clasificacion de cada una de estas

3 Replicaci6n 31 Definicion de Replicacion en celulas procariotes y eucariotes

EnriC]ue Dia7 de Ic6n No1 144 Colonia Pascos de 13 Monlafia CP 47460 Lugos de Morello Jalisco Mexico Tels1521 (474) 742 4314 742 367R 746 4563 Exl 66512 Fax Jxt 66527

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32 Caracteristicas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa proteinas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacion elongacion y terminacion en procariotes y eucariotes 36 La telomerosa y mecanisme de accion de la telomerasa en replicacion

4 Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion yestructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario I~NAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I I y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminaci6n 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales

i 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional

49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

5 Traduccion

51 Definicion 52 Codigo genetico 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traducci6n en eucariotes 54 Modificaciones Postraduccionales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de I

modificaciones ejemplos etc) 55 Protefnas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas y chaperones entre otras)

6 Mutaciones y la Reparacion en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificacion puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos quimicos fisicos y biologicos 63 Teratogenos carcinogenos 0 clastogenos 64 Reparacion por excision fotoreparacion sistemas SOS Rad etc Ejemplo de defectos en los sistemas de reparacion Xeroderma Pigmentoso

7 Tecnicas DNA recombinante

Enrique Dinz de l e611 No 1144 Colonia Pascos de la MontalJa CPo 47460 Lagos de ivlureno Jalisco Mexico TeJsl52 (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 665 27

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72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

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Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UN IVERS lTAR O DE lOS LAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERS IDAD E INNOVACION TECNOLOCICA DEPARTAMENTO DE CI ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

32 Caracteristicas de DNA Semiconservativa bidireccional cadena Ifder retrazada 33 Enzimas involucradas en la replicacion primasa helicasa proteinas (RPA) SSB topoisomerasas ligasas y polimerasas I II y III 34 Conceptos de replicon replisoma horquilla formacion de los fragmentos de Okazaki 35 Iniciacion elongacion y terminacion en procariotes y eucariotes 36 La telomerosa y mecanisme de accion de la telomerasa en replicacion

4 Expresion de genes (Transcripcion)

41 Definicion funcion clasificacion yestructura 42 Conceptos de Gen eucariote Elementos estructurales (exones intrones sitio de iniciacion de la transcripcion y elementos reguladores de un gen (region promotora y otras regiones reguladoras) 43 Conceptos elementales de expresion productos primarios de expresion (RNA primario I~NAm RNAr y RNAt polipeptido 0 proteina) 44 Elementos que conforman el reconocimiento del promotor sitios de inicio regiones consenso RNA polimerasas I I y III detalle de la region transcrita incluyendo la de terminaci6n 45 Iniciacion elongacion y terminacion 46 Participacion de los factores transcripcionales

i 47 Corte y empalme edicion caperuza 5 cola poliA 48 Niveles de regulacion pretranscripcional transcripcional postranscripcional

49 Ejercicios a realizar de como a partir del DNA se obtiene un RNA

5 Traduccion

51 Definicion 52 Codigo genetico 53 Iniciacion elongacion y terminacion de Traducci6n en eucariotes 54 Modificaciones Postraduccionales del polipeptido que sufre en la celula (tipos de I

modificaciones ejemplos etc) 55 Protefnas involucradas en el procesamiento de maduracion del polipeptido (Carabinas y chaperones entre otras)

6 Mutaciones y la Reparacion en el DNA

61 Tipos de mutaciones por el tipo de dano al DNA clasificacion puntuales deleciones inserciones etc 62 Mutagenos quimicos fisicos y biologicos 63 Teratogenos carcinogenos 0 clastogenos 64 Reparacion por excision fotoreparacion sistemas SOS Rad etc Ejemplo de defectos en los sistemas de reparacion Xeroderma Pigmentoso

7 Tecnicas DNA recombinante

Enrique Dinz de l e611 No 1144 Colonia Pascos de la MontalJa CPo 47460 Lagos de ivlureno Jalisco Mexico TeJsl52 (474) 742 4314 742 3678 7464563 Ext 66512 Fax Ext 665 27

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72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

2

Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

wwwlagoslIdgmx

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVE RSITARIO DE LOS LAGOS DIVIS ION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E INNOV ACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE C1ENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

3

4

5

LODISH HARVEY BERK ARNOLD ZIPURSKY S LAWRENCE MATSUDAIRA PAUL BALTIMORE DAVID DARNELL JAMES E MOLECULAR CELL BIOLOGY PANAMERICANA2007

GERALD KARP BIOLOGIA MOLECULAR McGraw-HilI

LEWIN BENJAMIN GENES IX OXFORD

MEDICAL CELL BIOLOGY Steven R Goodman Lippincot-Raven 2da Edici6n 2

9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA CENTRO UNIVERSlTARIO DE LOS lAGOS DIVISION DE ESTUDIOS DE LA BIODIVERSlDAD E [NNOVACION TECNOLOGICA DEPARTAMENTO DE ClENCIAS DE LA TIERRA Y DE LA VIDA

72 Extracci6n de DNA manejo de muestras 73 Enzimas de restricci6n nucleasas polimerasas Desnaturalizaci6n

renaturallzaci6n hibridaci6n obtenci6n y utilidad de las sondas Clasificaci6n de las ER descubrimiento nomenclatura Secuencia palindr6micas Tipos de extremos que generan romo cohesiv~ mapas de restricci6n

74 Electroforesis principios basicos Tecnicas de blot dot slot Northern Southern con ejemplos de aplicaciones hibridaci6n in situ

75 PCR tipos (simple semicuantitativo cuantitativo y tiempo real) aplicaciones PCR e interpretaci6n de estudios

76 middot Definici6n vectores fundamentos yaplicaciones bibliotecas 77 Secuenciaci6n 78 Microarreglos 79 Diagn6stico Molecular 8 Bases moleculares de las principales patologias en Mexico

81- Senalizaci6n de insulina Mecanismos moleculares en la DM2 82- Biolog1a molecular en lipidos y obesidad Bases moleculares de hambre-saciedad Diabesidad 83 - Bases moleculares de Enfermedades infecciosas (Hepatitis Virales ABC y VIH) 84- Biologia molecular del Cancer ( cicio celular CDK ciclinas puntos de restricci6n proto-oncogenes oncogenes genes supresores de tumor (APC p53 pRb BRCA)) 85 Biologfa molecular en Diferentes tipos de cancer ( Cancer de colon CA de mama) 9 Proyecto del Genoma Humano y la Etica

91- Terapia genica Estrategias moleculares de terapia genica metodos de envfo de genes) 92- Biolog1a molecular y etica medica DNA y medicina predictiva Consejo Genetico Etica y terapia genica Aspectos legales La Biologia Molecular y la Sociedad 93-Proyecto genoma humano estado actual genomita prote6mica 94- Perspectivas en la agricultura ( mafz transgenico)

6 TAREAS ACCIONES YO PRAcTICAS DE LABORATORIO a) Aprendizaje grupal mediante lecturas relacionadas con los temas b) Preguntas sobre el tema antes de iniciar la clase c) Ejercicios en clase trabajos de investigaci6n presentaciones entre otros) d) Realizaci6n de una practica demostrativa

JOSE LUQUE Y ANGEL HERRAEZ BIOLOGIA MOLECULAR E INGENIERIA GENETICA Ed HARCOURT5a Edicion Mexico 2005

BRUCE ALBERTS DENNIS BRAY JULIAN LEWIS MARTIN RAFF KEITH ROBERTS Y JAMES WATSON MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL PANAMERICANA 2006

2

Enrique OIU7 de Lcon No 1144 Colonia Pascos de la Montana CP 47460 Lagos Lie Moreno Jal isco Mexico Tels [52] (474) 742 4314 742 367l 746 4563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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9 CRITERIOS Y MECANISMOS PARA LA ACREDITACION Acreditaci6n Para tener derecho a examen ordinario el alum no debera cumplir con un 80 de las asistencias y para tener derecho a examen extraordinario el alumno debera cumplir con el 60 de las asistencias Asimismo esta materia puede ser acreditada por

~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

Examen Parcial II 20

Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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~on1petencias para 10 cual el alumno debera registrar su solicitud en el departamento al cual pertenece la materia de acuerdo con el calendario escolar vigente

Esta materia tam bien puede ser sujeta a revalidaci6n acreditaci6n 0 convalidaci6n de acuerdo con la normatividad vigente

10 EVALUACION Y CALIFICACION Unidad de Competencia Porcentaje

Examen Departamental 30

Examen Parcial I 15

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Trabajo final 20

Participaci6n en clase 10

Tareas pIesentaci6n de articulos 5

Total 100

Enrique DIal de Lc6n No1 144 CoJonia Pascos de Ja Montana cP 47460 Lagos de Moreno Jai1isco Mexico Te1s [521 (474) 742 4314 742 36n 746 1563 Ext 66512 Fax Ext 66527

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