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Travaux pratiques de mycologie
Veronica RODRIGUEZ-NAVA – Aymeric MENARD – Frédéric LAURENT
Patrick BOIRON
Laboratoire de MycologieFaculté de Pharmacie, Lyon, France
Classification
Spores
Asexuée Sexuée
Endospores
Conidies
ZygosporesZygomycètes
AscosporesAscomycètes
BasidiosporesBasidiomycètesDeutéromycètes
Champignons inférieurs
Classe des Zygomycètes
Les Zygomycètes
• Les champignons de la Classe des Zygomycètes sont caractérisés par :
• Un mycélium non cloisonné (= siphonné = cœnocytique)
• Une multiplication asexuée par endospores : sporocystospores
• Une reproduction sexuée : zygospore
Intérêts des Zygomycètes
• Moisissures communes : agents de pourritures et d’altérations alimentaires (Mucor, Absidia, Rhizopus, Rhizomucor, …)
• Mycoses humaines, peu fréquentes mais graves : mucormycoses (Rhizopus, …)
• Industries agro-alimentaires :
• Fermentation de l’amidon en anaérobiose : alcool de riz, de pomme de terre, … (choum choum, whiskys, vodkas, schnaps, …)
• Affinage de certains fromages (Cantal), galettes de soja (Tempeh)
• Industries chimiques et pharmaceutiques :
• Production d’acides aminés, acide lactique, présure, vitamine A, …
• Bioconversion des stéroïdes
Absidia glauca
Sporocystophore
Sporocyste
Columelle
Apophyse
Aspect macroscopique
Mucor
Absidia
Zygorhynchus heterogamus
Suspenseurs
Les Rhizopus (non vu en TP)
Les Rhizopus (non vu en TP)
• Cosmopolites et ubiquitaires
• Environ 12 espèces de Rhizopus
• Allergies de type I et III
• Mycoses : mucormycoses
• Industries agro-alimentaires (fromages, fermentations diverses), chimiques (alcool, acides organiques) et papetières
Les Mucor (non vu en TP)
Les Mucor (non vu en TP)
• Cosmopolites et ubiquitaires
• Environ 50 espèces de Mucor
• Allergies de type I et III
• Mycoses (rares) : mucormycoses
• Industries agro-alimentaires (fromages)
Champignons supérieurs
Classe des Ascomycètes
Les Ascomycètes
• Les champignons de la Classe des Ascomycètes sont caractérisés par :
• Un mycélium cloisonné (= septé = articulé)
• Une multiplication asexuée par conidies : modes de conidiogénèse très variés
• Une reproduction sexuée : ascospores dans les asques
Intérêts des Aspergillacées
Les Aspergillus
• Moisissures très communes : bois, pain, confiture, fruits, …
• Biodétérioration : textiles, papiers, cuirs, matières plastiques, matériels électroniques et optiques, …
• Mycotoxicoses : aflatoxines, ochratoxine, …
• Mycoses souvent graves : API, aspergillome, ABPA, AAE, …
• Industrie chimique : acides (citrique, gluconique, oxalique, fumarique, gallique, …), dextranes, amylases, …
Les Penicillium
• Industries agro-alimentaires : affinage de fromages (roqueforts, bleus, camemberts, …)
• Pourriture des fruits : agrumes, pommes
• Mycotoxicose : patuline
• Industrie pharmaceutique : antibiotique (pénicilline), antifongique (griséofulvine)
• Industrie chimique : acide citrique, …
• Mycose tropicale : pénicilliose à Penicillium marneffei
Aspects macroscopiques
Aspergillus flavus
Vésicule
Phialides
Conidiophore (stipe)
Phialoconidies
Métules
Aspérités
Aspergillus ochraceus
Zones concentriques
Aspergillus niger (non vu en TP)
Aspergillus versicolor (non vu en TP)
Penicillium frequentans
Phialides
Conidiophore (stipe)
Phialoconidies
Complexité du conidiophore
Complexité du conidiophore
Penicillium
Chaetomium globosum
Asques
Ascocarpe : périthèce
Ascospores
Les Chaetomium
• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
• Environ 80 espèces de Chaetomium
• Intérêt industriel : production de cellulase
• Mycotoxines : chaetomine, sterigmatocystine chez quelques espèces de Chaetomium, chaetoglobosines chez Chaetomium globosum
• Mycoses (rares) : onychomycose
• Allergie de type I ?
• Phytopathogènes
Champignons supérieurs
« Classe » des Deutéromycètes
Aspergillus fumigatus (non vu en TP)
Aspergillus fumigatus
• Un des 3 principaux agents responsables de mycoses profondes (avec Candida albicans et Cryptococcus neoformans)
• Responsable de 95 % des aspergilloses, notamment de l’aspergillose pulmonaire invasive (API), mais également d’aspergilloses allergiques (ABPA, AAE)
Fusarium oxysporum
Les Fusarium
• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
• 50 à 70 espèces de Fusarium
• Phytopathogènes
• Mycotoxines : trichothécènes, toxine T-2, zéaralénone (= toxine F-2), vomitoxine, déoxynivalénol, fumonisine, …
• Mycoses graves (kératites, endophthalmies, onychomycoses, mycétomes), notamment chez les patients immunodéprimés (fusariose profonde, résistante aux antifongiques) et chez les grands brûlés
• Allergies de type I
• Intérêt vétérinaire : zéaralénone (stimulant de croissance animale, anabolisant, contraception)
Alternaria alternata
Les Alternaria
• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs
• 40 à 50 espèces d’Alternaria
• Phytopathogènes
• Allergies de type I et III
• Mycoses (rares) : lésions sous-cutanées, onychomycoses
• Mycotoxines : alternariol, alternariol monométhylether (AME), acide tenuazonic, altertoxines (mutagénique)
Stemphylium botryosum
Les Stemphylium
• Cosmopolites et ubiquitaires
• 6 espèces de Stemphylium
• Phytopathogènes
• Allergies de type I
• Mycoses (très rares) : sinusites
Cladosporium herbarum
Les Cladosporium• Cosmopolites et ubiquitaires, extrêmement
communs
• 28 à 40 espèces de Cladosporium
• Phytopathogènes
• Allergies de type I et III
• Mycoses tropicales : chromoblastomycoses ( Cladiophialophora carrionii, C. bantiana)
• Mycotoxines : cladosporine, émodine (toxicité ?)
• Intérêt pharmaceutique : bioconversion de précurseurs stéroïdiens en progestérone et pregnenolone
Aureobasidium pullulans
Les Aureobasidium
• Cosmopolites et ubiquitaires
• 15 espèces d’Aureobasidium
• Phytopathogènes
• Allergies de types I et III
• Mycoses (rares) : lésions cutanées, kératites, abcès splénique
• Intérêt industriel (préparation de textiles) et agro-alimentaire (pullulane : polysaccharide biodégradable, utilisé pour la protection d’aliments)
Anthracnose
Scopulariopsis brevicaulis
Les Scopulariopsis
• Mycoses (rares) : onychomycoses, lésions cutanées, mycétomes, sinusites, kératites, …
• Arsine (gaz mortel) à partir de l’arsenate des colorants de papiers muraux (historique)
Trichothecium roseum
Les Trichothecium
• 2 ou 3 espèces de Trichothecium ?
• Phytopathogène
• Mycotoxines : trichothécine (toxicité ?)
• Parasite de macromycètes
Nodule noirdu prunier