RESUME GENETIKA

TRANSLATION

Disusun untuk memenuhi tugas mata kuliah Genetika 1

Yang dibimbing oleh Prof. Dr. Siti Zubaidah, M.pd.

Disusun oleh :

Off G

Nama kelompok 13

Indah Nur Fadhlina (130342603488)

Nindya Ulfa Wardhani (130342603493)

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

JURUSAN BIOLOGI

Februari 2015

TRANSLATION: Sintesis polipeptida

MENGGUNAKAN mRNA TEMPLATES

Molekul mRNA menyediakan kation spesifik untuk sekuens asam amino dari produk gen polipeptida. Ribosom menyediakan banyak komponen makromolekul diperlukan untuk proses penerjemahan. TRNA menyediakan molekul adaptor dibutuhkan untuk menggabungkan asam amino dalam polipeptida dalam menanggapi kodon di mRNA. Selain itu, beberapa protein larut berpartisipasi dalam proses tersebut. Terjemahan dari urutan nukleotida dalam sebuah molekul mRNA ke dalam urutan asam amino dalam produk polipeptida dapat dibagi menjadi tiga tahap: (1) rantai polipeptida inisiasi, (2) rantai perpanjangan, dan (3) terminasi rantai.

Translasi : polipeptida rantai Inisiasi

Inisiasi terjemahan mencakup semua peristiwa yang mendahului pembentukan peptida ikatan antara pertama dua asam amino rantai polipeptida baru. Dalam E. coli, proses inisiasi melibatkan 30S subunit ribosom, khusus inisiator tRNA, sebuah molekul mRNA, tiga faktor inisiasi protein terlarut: IF-1, IF-2, dan IF-3, dan satu molekul GTP Sintesis polipeptida dimulai oleh tRNA khusus. Inisiasi rantai polipeptida dimulai dengan pembentukan dua kompleks: (1) satu berisi inisiasi faktor IF-2 dan methionyl-tRNAf Met, dan (2) yang lain berisi molekul mRNA, sebuah 30S subunit ribosom dan faktor inisiasi IF-3. Subunit 30S / kompleks mRNA akan membentuk hanya di hadapan IF-3; dengan demikian, IF-3 mengontrol kemampuan dari 30S subunit untuk memulai proses inisiasi.

Inisiasi terjemahan yang lebih kompleks pada eukariota, yang melibatkan beberapa faktor inisiasi. Namun demikian, proses keseluruhan mirip kecuali dua fitur. (1) Kelompok amino dari metionin pada tRNA inisiator tidak formylated seperti pada prokariota. (2) Bentuk inisiasi kompleks pada 5 terminus dari mRNA, tidak di Shine-Dalgarno / Agustus situs terjemahan mulai seperti di E. coli. Pada eukariota, inisiasi kompleks scan mRNA, mulai pada 5, mencari kodon terjemahan-inisiasi. Dengan demikian, pada eukariota, terjemahan sering dimulai pada paling dekat dengan 5 terminus dari molekul mRNA, meskipun efisiensi dengan mana Agustus yang diberikan digunakan untuk memulai penerjemahan tergantung pada nukleotida bersebelahan

Urutan inisiasi optimal adalah 5 -gcc (A atau G) CCAUGG-3. Itu purin (A atau G) tiga basis hulu dari Agustus inisiator kodon dan G Berikut ini adalah yang paling penting-influencing inisiasi efisiensi dengan sepuluh kali lipat atau lebih. Perubahan basa lainnya dalam urutan menyebabkan penurunan kecil dalam inisiasi efisiensi. Persyaratan urutan ini untuk inisiasi penerjemahan optimal pada eukariota disebut aturan Kozak itu, setelah Marilyn Kozak, yang pertama-tama mengusulkan mereka. Seperti prokariota, eukariota mengandung tRNA inisiator khusus, tRNAi Met ("i" untuk inisiator), tetapi kelompok amino dari methionyl-tRNAi Met tidak formylated. Inisiator methionyl-tRNAi Met berinteraksi dengan faktor inisiasi larut dan memasuki situs P langsung selama proses inisiasi, seperti dalam E. coli. Pada eukariota, protein cap-binding (CBP) berikatan dengan guanosin topi 7-metil di 5 terminus dari mRNA. Kemudian, faktor inisiasi lainnya mengikat CBP-mRNA kompleks, diikuti oleh kecil (40S) subunit ribosom. Seluruh inisiasi bergerak kompleks 5? 3? sepanjang molekul mRNA, mencari kodon Agustus. 5 ' 3 ' 16S rRNA mRNA Wilayah dasar-pasangan Bersinar-Dalgarno urutan Batasan AACACAGGAGGAUUAUCCAUGUCGACUCGTAU 3 ' 5 ' Terjemahan kodon inisiasi AUGAU UUCCUCC ACUAGG UUGGCGUCCAAGGGGGAUGCCAA GAMBAR 12.17 Base-pairing antara Bersinar-Dalgarno urutan dalam prokariotik mRNA dan urutan komplementer dekat 3 terminus dari 16S rRNA terlibat dalam pembentukan mRNA / 30S ribosom subunit kompleks inisiasi

Translasi : polipeptida rantai Pemanjangan

Proses rantai polipeptida perpanjangan pada dasarnya sama di kedua prokariota dan eukariota. Penambahan masing-masing asam amino polipeptida tumbuh terjadi dalam tiga langkah: (1) mengikat suatu aminoasil-tRNA ke situs A ribosom, (2) transfer rantai polipeptida yang tumbuh dari tRNA di situs P ke tRNA dalam Sebuah situs dengan pembentukan ikatan peptida baru, dan (3) translokasi ribosom sepanjang mRNA ke posisi kodon berikutnya dalam situs A Selama langkah 3, yang baru lahir polipeptida-tRNA dan bermuatan tRNA translokasi dari situs A dan P ke P dan E situs masing-masing. Ketiga langkah tersebut diulang dengan cara siklik selama proses perpanjangan. Faktor yang terlibat dalam rantai perpanjangan di E. coli yang dijelaskan di sini. Faktor serupa berpartisipasi dalam rantai perpanjangan pada eukariota. Pada langkah pertama, sebuah aminoasil-tRNA masuk dan menjadi terikat situs A ribosom.

Tiga nukleotida dalam antikodon yang masuk aminoasil-tRNA harus memasangkan dengan nukleotida yang hadir kodon mRNA di lokasi A. Faktor elongasi Tu membawa molekul GTP (EF-Tu.GTP). GTP diperlukan untuk aminoasil-tRNA mengikat di lokasi A, tapi tidak dibelah sampai ikatan peptida terbentuk. Setelah pembelahan GTP, EF-Tu.GDP dilepaskan dari ribosom. EF-Tu.GDP tidak aktif dan tidak akan mengikat untuk aminoasil- tRNA. EF-Tu.GDP diubah menjadi aktif EF-Tu.GTP Bentuk dengan faktor elongasi Ts (EF-Ts), yang menghidrolisis satu molekul GTP dalam proses. EF-Tu berinteraksi dengan semua aminoasil-tRNA kecuali methionyl-tRNA. Langkah kedua dalam rantai perpanjangan adalah pembentukan peptida ikatan antara gugus amino dari aminoasil-tRNA di situs A dan ujung karboksil rantai polipeptida yang sedang tumbuh melekat dengan tRNA di situs P. Ini Memisahkan rantai tumbuh dari tRNA di situs P dan kovalen bergabung dengan rantai ke tRNA disitus A. Reaksi ini dikatalisis oleh peptidil transferase, sebuah aktivitas enzimatik dibangun ke subunit 50S dari ribosom. Kita harus mencatat bahwa aktivitas transferase peptidil berada dalam molekul 23S rRNA bukan di ribosom suatu protein, mungkin peninggalan lain dari dunia berbasis RNA awal. Peptida pembentukan ikatan membutuhkan hidrolisis molekul GTP dibawa ke ribosom oleh EF-Tu pada langkah 1. Selama langkah ketiga dalam rantai perpanjangan, peptidil-tRNA hadir dalam Sebuah situs ribosom translokasi ke situs P, dan tRNA bermuatan di situs P translokasi ke situs E, sebagai ribosom bergerak tiga nukleotida menuju 3 akhir molekul mRNA. Langkah translokasi membutuhkan GTP dan perpanjangan faktor G (EF-G). Ribosom mengalami perubahan konformasi selama proses translokasi, menyarankan bahwa mungkin shuttle sepanjang molekul mRNA. Energi untuk gerakan ribosom disediakan oleh hidrolisis GTP. Translokasi peptidil-tRNA dari situs A ke situs P meninggalkan situs A kosong dan ribosom siap untuk memulai siklus berikutnya rantai perpanjangan.

Translasi : polipeptida

Rantai Pemutusan

Rantai polipeptida perpanjangan mengalami pemutusan ketika salah satu dari tiga rantai-terminasi kodon (UAA, UAG, atau UGA) memasuki situs A pada ribosom. E. coli, ada dua faktor rilis, RF-1 dan RF-2. RF-1 mengakui pemutusan kodon UAA dan UAG; RF-2 mengakui UAA dan UGA. Pada eukariota, satu release factor (eRF) mengakui ketiga kodon terminasi. Kehadiran rilis Faktor dalam situs A mengubah aktivitas peptidil transferase sehingga hal itu menambah molekul ke ujung karboksil dari polipeptida baru lahir. Reaksi rilis polipeptida dari molekul tRNA di situs P dan memicu translokasi yang dari tRNA ke situs E. Pemutusan dilengkapi dengan pelepasan mRNA yang merupakan molekul dari ribosom dan disosiasi ribosom ke subunitnya. Subunit ribosom kemudian siap untuk memulai putaran lain sintesis protein, seperti yang dijelaskan sebelumnya.

Pertanyaan :

1. Bagaimana mekanisme translasi pada saat pemutusan rantai polipeptida ?

Jawaban : Rantai polipeptida perpanjangan mengalami pemutusan ketika salah satu dari tiga rantai-terminasi kodon (UAA, UAG, atau UGA) memasuki situs A pada ribosom. E. coli, ada dua faktor rilis, RF-1 dan RF-2. RF-1 mengakui pemutusan kodon UAA dan UAG; RF-2 mengakui UAA dan UGA. Pada eukariota, satu release factor (eRF) mengakui ketiga kodon terminasi. Kehadiran rilis Faktor dalam situs A mengubah aktivitas peptidil transferase sehingga hal itu menambah molekul ke ujung karboksil dari polipeptida baru lahir. Reaksi rilis ini polipeptida dari molekul tRNA di situs P dan memicu translokasi yang dari tRNA ke situs E. Pemutusan dilengkapi dengan pelepasan mRNA yang merupakan molekul dari ribosom dan disosiasi ribosom ke subunit nya. Subunit ribosom kemudian siap untuk memulai putaran lain sintesis protein

2. Bagaimanakah mekanisme perpanjangan rantai polipeptida ?

Jawaban : Proses perpanjangan rantai polipeptida pada dasarnya sama di kedua prokariota dan eukariota. Penambahan masing-masing asam amino polipeptida tumbuh terjadi dalam tiga langkah: (1) mengikat suatu aminoasil-tRNA ke situs A ribosom, (2) transfer rantai polipeptida yang tumbuh dari tRNA di situs P ke tRNA dalam Sebuah situs dengan pembentukan ikatan peptida baru, dan (3) translokasi ribosom sepanjang mRNA ke posisi kodon berikutnya dalam situs A Selama langkah 3, yang baru lahir polipeptida-tRNA dan bermuatan tRNA translokasi dari situs A dan P ke P dan E situs masing-masing. Ketiga langkah tersebut diulang dengan cara siklik selama proses perpanjangan.