If you can't read please download the document
Upload
july
View
45
Download
3
Embed Size (px)
DESCRIPTION
SYSTEMS BIOLOGY IN DRUG DISCOVERY. ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΘΕΜΑ ΣΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΕΜΒΙΟΜΗΧΑΝΙΚΗ-ΕΜΒΙΟΙΑΤΡΙΚΗ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ ΟΝΟΜΑ : ΚΑΡΑΓΙΑΝΝΟΠΟΥΛΟΣ ΦΑΕΘΟΝΤΑΣ. ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗΣ. ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΙ ΣΤΗ ΣΥΣΤΗΜΙΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΜΟΝΤΕΛΑ GAUSS-BAYES ΓΙΑ ΑΝΑΛΥΣΗ ΔΙΚΤΥΩΝ ΠΡΩΤΕΙΝΩΝ ΚΑΙ ΓΟΝΙΔΙΩΝ - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
SYSTEMS BIOLOGY IN DRUG DISCOVERY
SYSTEMS BIOLOGY IN DRUG DISCOVERY -
: GAUSS-BAYES 4. ( . ). . .
:. . . .
. . . . i i (microarrays) Microarray .
. Microarrays :
Microarrays .
DNA . .
YEAST 2 HYBRID (2) - , (transcription gene ) (reporter gene)
transcription gene , (binding domain) reporter gene (UAS) (activation domain) reporter gene.
reporter gene .
transcription gene Bait-Prey ( )
:AP (Affinity purification) .
TAP (Tandem affinity purification) AP .
( ) ( ) . in vitro in vivo. : TAP
. ( , , - ). . 3 = =7
(REGULATORY NETWORKS)REVEAL (REVerse Engineering Algorithm): . . REVEAL .
DBN (Dynamic Bayesian Network).
(hidden factors) GAUSS-BAYES
BAYES BAYES (SBN) BAYES (DBN). 1,2 . G ( i) . . BAYES DAG (directed acyclic graph) .
Bayes (-) q. .. :
DAG . DAG DAG. CPDAG (completed partially directed acyclic graphs). ( ) ( ) DAG . DAG v . .BAYES GAUSSIAN ANALYSIS , (). O AUC .
(TP/FP=5) RAF (RAF signaling pathway)
RAF . 11 1200 (cytometry).
11 6 .
( ) ( ). AUC TF/FP . . .